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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000043_pilon:1325761..1331267- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039539 ID=XLOC_039539|Name=XLOC_039539|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5507bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:1325761..1331267- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTGTGATGCTTGTTAAGAAACTATTGGCATGCATAGCCATTCCTTT
TGTTTTCACAATTCCTGTGGATGATCCAAGTAATTGGCCAGGTCACTTAG
AACCATTTGGATCAAAACAAAACGTAGTCCAGATTCAAGATATTGAATAT
GCTTGGCCTTCAGCTGCAGGTATAATATTTTAGTTTATTTTTGTGATAGG
TTCGAACAAACGACGGGGTTGCATCCGTCGTTGTGGGAATTTCTTCTTTT
CTAATAACTGGCCAATGACAAAATTTATATTCTTCTTCTTTTCAATGTCT
AATGATTGATTCACAAAGATTAGCTTAATAAAAAACTCTATTCTTTTATG
GTATCTTCACCAATCCTTTTTATTTCATTACGAAATAATCATTGGTAGAA
AGTCTCTTTTTGGTGGCATTATCGGGTTGATTATTAAGTTTCTAGAATCT
TAATAAAAAACATTAGCTTTTAGCAAGTTTATCGTTGTCTCATTCAAAAA
TATATAAAGCTTACCATAACGAGCACAACAAAAATTTTCACAAAAATGTG
TTGGTTCCAATCAACCAAACGCCTCTTTTTGTTAAGTCATACTTTGAATC
TCTTTTTAACCCATGATAGTATATGAGAGAAAGCTGCGCTCTCCTTCCAT
TACCATAAAATAATTCTTGTAAATTTATGTTTTTCAACCCTTTTTCAGAG
TTTTACAGCAAGTACGTGGACAAAGTGAAACCTGTTCATGTACGTGGAGT
TTATAAACATTCAAAACCAGTCAGAAGTTGGAACGATGAATATCTTCTAC
AAAATGTTGAAGCTTCTAAACAAAATAAAGTCCTGGTAGAGCCTAACCTA
AAAGAGAACCGCTCTTCGACAGGAAAACGTGCGTCATTCTTCGAATTTAT
GAGTACTTACCACAAACAGCCAAGTCTTATATATTCCCCAATGCCTCAAT
ATCTCAGGTATATGTTTATTTTATGATTATTTATTCTTCTGTTATCTATA
CCTTGAGTATAAATGGTTGTATTTAGCTAGTATGTATTTCAAACCTTAAA
AATCTCGCTTCTAAGTCTAAGTCACGGTAAAGTCCTAATTTGATTTCTCT
TAGGTTTCTTTTTAAATCTTAAAATAAGATTTTTTTCATTTTAAGAAAGT
GAAATTTAAATTGACCAGTCATTTTACCGTACATACATCATTACATCGTT
CATTACTTAAATTCTATTCTTTAGGAAAGATTTGACACTTCCAGAACCTT
TGAGGTGCAATGTTTCATCAGAAGATTTAGTGGCTGCTGTAAGTAAAACT
ACACCTTGCATCTCACCCATCTCAGTGTACCCCCAGTGTACACAAGAATA
TTTCCAAATAAAACACCTTTTCGATATGTATTTTTGTATAAAAACCATCA
TGGTGGTCCTTTACTCCTCTCAATACAGAAAGACTATTCTCATTTTCCTT
CACTTCACTACGTGAAAGATCAATGGTTTTATAAATGATGACATCTTTTT
GCTTTTTCAATTCGTATTAAATAAGCTCGTTTTTCAATGGCCTCTACAAA
TGAACGCCCCTTTAAAAAGAAAAAGAAACATTCGTTAAAAACCAAAAGAT
ATGAGAAATTGACTGAATGGGCCCCCCTGCGGTTTGCGTGAATGCGTGAA
TGGGCATTTTCGGTTACGCGGATGCGTGAAAATTGGAGAAAAAAAATGCG
TGAATGCGTGAATTGAAAAAACTTGCGTGAACGTGATAATTCACTTTTTG
ATTGCGCGAATGCGTGAATCTGGGCTATTTTGTGCGTATATACGCGAATT
TTTCCTTTTTTTCCACCGGTCATGTGCAGTTTTCCCGATTTTTCCCGAAA
TTTTTCCGATTTCCTGAAAAATCGGGTTATTCCGTGAAACTCGAGGAAAA
TTTGCGTGAATGCGTAAATTTCGAAAAAAAATTGCGTGATTGCGTGAATT
GAATGTCCGCTGGGGGGGGGGCCTCCTTAATATTAAACTTTGGGTCTTGA
AACTTGGTGTTAAAGCTAATCTTTACATATGAAGCTGCTTGCTGATCTTG
AAAAAGCAATGCAAATTATTTACCATAGTGTCCTAGTAGGTTGGTTCCCC
TCCCTTGAAAATTGAAAAAAATCCCTCTGCCCCCCCCCCCTTTTAGTTCC
CCTCCCTAAGTTTTTTAAAATAATTTCCCCTCCCCCCTTGGAAATGTTTT
TAGATTTTTTGCTCATAACATAATACTGCTTCTATTTATGTTATGTCGCC
CCTATATACAAAGAAAAAATGTTAATTGTCACCGCCTCGAATATAAAACA
CTATTACATGTTTTTAGCTTGAAGTTGAACAGATATATTTTATGTTTTAT
GTTTGACACAAGAGAACAGAAATTTTTTTTCCTCAGATATTTTCTCCCCA
CCCTTGAGTTTTTGGAGCTATTTTTTTCTCCCCCTCCTTTTGATTGCCCT
CCCCCCTAGAATTTTGAAAACGATTTTGCCTACCCTTTTCCAATTTTCTG
AAAAAGATACTCCCCCCTCCCTTTTAAAGAAAAATTAAAAAATGAAGGTT
TTTCATAGTTTTTTCATAGCGTTTGCGACCTCCTCTTAAATAACGTTTAG
CTAGCTTTTATAAGAAAATATTTTTTTATATTGCTAGAATCTTGTGATGA
GTCAGGGAGGTTCCAAATCACACGTGTACAACGATGATGTTGAGTCCATA
TTCTGTGCTCTCCGTGGATCTGTTGATTACCTCTTAATCGAATACACCAA
AAACAAAGGATATGTGATCGATATGCCACAAGGTGGATACTCAACTGTGG
ACGTTGACCGAGTGGATTATGTTAAATATCCATATTTACGAAAGATTGAT
AAGTATATCAAAGTTCAATTGGAGCCTGGTGATTGCTTATATGTGCCTTA
TAGATGGTATGAGCGTTTTTAACTTTATAAAGCTTTTGATTATTAAATGT
TGACACCAACTATTGTTCAATTTCAAGAAGTTATTCTTCTAAACTATTAT
TGTATCATACTCCATACAGGGTGTCCCGGAAAAAAGTCGAAATACAACTA
TGAGTAGAAAGTTTAACGTGCGTATTCACAAAATTGTATTTTGAGCTCTC
CCTCTTTTTTCTTTGTCATTACGTAACAAATGGAATAATAAAAAGGGCTA
TCGATTACTCTTTGAAAACTAATTTTTGTAATAAGCCTGTACAATGGAGT
ACGTTCTCATATTTTACCGATAATATAAACAAACCTTTCTGCGCAATGGC
TTGTTCAAATTCGATAATTATTTTCAAGGTACAAACAGTTTAACAGCTAC
GCGAACAATCAAGGTCAGAGTATTGCATTCAACATTTGGTTTAAGCATAC
CCACAGACAGAATCCTCCACAATGTCAACCTACCAGTGATGCCATCTCTA
CACTTGACCGTTATGGATATTCTGACGATCGGGAAGAAAAGGAGATTGAA
GAGGAAGAAGGAGTAGTAGGTGAAGGGAATGAAATCGAAAAAGAAGATGG
TAAAGAAATCACGCAGAAACAGAATGAGAATATCTTGTAAGAATCTTTTT
CTGTCACAAAGAAATTTTTTAAAACGTATGATATATTTTTGAACAAAAAT
TCGTTTGACTCTGGTGTCTATGTTACGAATCAAACTAGCTGGATAAGTCG
GTGTGAATTACATTGCAATCTCGAATAACATGAGGAAAGGGCTTTTTTCC
CTAAAATAATCATCTAGTCGCAAGTAATTCATAACGATTATTTAACGTGT
TTGCTCAGGGTGACATGAATTTGATATTCAGTGGCATCTTTTCAAATTGA
TACGAAGGAAATAAATAGTTTTTGGGGAAGAGTACCCTCAATAGGGCGTT
AACGAATGTGTCTATGCAGGTAGTTTTCTGTAGTTTTTACAACACTGTAA
ATTTCCAAAGGTCAAATTACACAAATTTTGTTATTTTCATACAGGTATCA
TTTCAAAAGATATGTCGAAGTTTTTACGAAGAAAAACATTACTGTTACAA
GATTTTATCACATCATTAAAAGGGTATGATATTTTGTATATAAGTATCTT
GATATAGCGAGCCGCTGTAGTGTTTAGGTAAGGTATTCAGTTCCGGTGCG
CAAGATGGGTCTATCCCAAGCAGGGTCATATCAAAATTTCGCACTTAGTA
CAATGTGGTACTTTCTGCTTGATGTTCAGCAGTTAAAAAGAATTATCAAG
GGTTGTGAAACAATCCAGGGAGAAAGAATGAGGCCCTCCTTTACCTTCGG
GTAGATAGCTGTGGAAAAAGAGACTAATGGATCTTCCGGCTGTGGTTGGG
AGATCTTTTCAACTCCTATAAGATCTTTAAAAAACAGTATGGGACGTTTC
ATCTGAATTACAATTCCTTTTCCTCGTTTTAGGACCCTTTGATAAACCAT
GAGGAATATAAATCGAAATTTCCAAAATCTTTTAATATACTCATAGAAGA
GGTAAGTATACTTTATTATATTGGGACATTCATAATTTAATTTTGCTTTA
AATTAATAGCATTCAAAGTTTACGTTGATCTTTAGCGGCTATGGAATTGA
ACATAACCTTCCGATTATTCAAAGTGTTTCCCAGGTATTATGGAATGTTA
AATTGCCGAAGTCACCACGATTAGTAGAGTCATCTTCCTTAGTTGCCAAT
GATGATCAAGCTTGGCCCTAAAATATATAATATCTTAAAAAGCCCTTAAC
AAAATTTACACAATGCTAATAATTTCTTAATTTGAGAACACCTTAAATAC
TAAATGCCCTGTTATCGTAAGCCCTATTGTCCACGGCAGTACGAGTCCGT
AGTAAGTAAATCTATATGCAAGCAAGTTTAACTTTAAAACATCTTCTCAG
CTTTTGGATGCAGATAGAGATCATATATTAACATTGCACGACTTCCAAAT
GATTGAGAAGGATAAAGGATCACCAAGATACCTAAAGATGATTCAGTACC
TTGAATATCAAACGGCTCGCATCGAAGACTATATTGAAGATTTGGACGAG
TCACAACACCGTAAGTTTTATGCGATGGGAAACTATATAAGGGACATTTG
ATTTATTATACTTTTCTAAAAGACTTTGAAGTTTTTAAGTCTATGAAGAT
AATTTCAAGATGATTTCCGTATGAGTTTTAAAGAATCACGATTTGTCTTC
GGAACATTTGATTTTTATATTTTCAAAGTCCTTGAGGCTTTAACGTGGAA
GATCATTTCAAGATATTTCCTTCTAATTTTTAATTAAAGTTTCTTTTGAG
ACGTACTCAAAGTGATGATCAGAAGGATCTTTCATTGTTTCGGAAATTTG
AACAATGCAAAATTGGTCTTACCTACTATGTTTCTGTTCCGTAAATAAGG
ATTAAGAAAAAAAATTTAATATTTTGAACAGAGGCGGACGAAACTATTCA
TGATACAAAGGATATTTGTCTTCATTCTTTTAGACGAAACGATTCATGAA
TTTGACCGGAGGAAAATGGAAGAATTTAAATCAGCAAGAGCATTTGATGA
GCTGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000043_pilon:1325761..1331267- >XLOC_039539 ID=XLOC_039539|Name=XLOC_039539|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2802bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000043_pilon:1325761..1331267- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTGTGATGCTTGTTAAGAAACTATTGGCATGCATAGCCATTCCTTT
TGTTTTCACAATTCCTGTGGATGATCCAAGTAATTGGCCAGGTCACTTAG
AACCATTTGGATCAAAACAAAACGTAGTCCAGATTCAAGATATTGAATAT
GCTTGGCCTTCAGCTGCAGATGGTTGTGATGCTTGTTAAGAAACTATTGG
CATGCATAGCCATTCCTTTTGTTTTCACAATTCCTGTGGATGATCCAAGT
AATTGGCCAGGTCACTTAGAACCATTTGGATCAAAACAAAACGTAGTCCA
GATTCAAGATATTGAATATGCTTGGCCTTCAGCTGCAGAGTTTTACAGCA
AGTACGTGGACAAAGTGAAACCTGTTCATGTACGTGGAGTTTATAAACAT
TCAAAACCAGTCAGAAGTTGGAACGATGAATATCTTCTACAAAATGTTGA
AGCTTCTAAACAAAATAAAGTCCTGGTAGAGCCTAACCTAAAAGAGAACC
GCTCTTCGACAGGAAAACGTGCGTCATTCTTCGAATTTATGAGTACTTAC
CACAAACAGCCAAGTCTTATATATTCCCCAATGCCTCAATATCTCAGAGT
TTTACAGCAAGTACGTGGACAAAGTGAAACCTGTTCATGTACGTGGAGTT
TATAAACATTCAAAACCAGTCAGAAGTTGGAACGATGAATATCTTCTACA
AAATGTTGAAGCTTCTAAACAAAATAAAGTCCTGGTAGAGCCTAACCTAA
AAGAGAACCGCTCTTCGACAGGAAAACGTGCGTCATTCTTCGAATTTATG
AGTACTTACCACAAACAGCCAAGTCTTATATATTCCCCAATGCCTCAATA
TCTCAGGAAAGATTTGACACTTCCAGAACCTTTGAGGTGCAATGTTTCAT
CAGAAGATTTAGTGGCTGCTGAAAGATTTGACACTTCCAGAACCTTTGAG
GTGCAATGTTTCATCAGAAGATTTAGTGGCTGCTAATCTTGTGATGAGTC
AGGGAGGTTCCAAATCACACGTGTACAACGATGATGTTGAGTCCATATTC
TGTGCTCTCCGTGGATCTGTTGATTACCTCTTAATCGAATACACCAAAAA
CAAAGGATATGTGATCGATATGCCACAAGGTGGATACTCAACTGTGGACG
TTGACCGAGTGGATTATGTTAAATATCCATATTTACGAAAGATTGATAAG
TATATCAAAGTTCAATTGGAGCCTGGTGATTGCTTATATGTGCCTTATAG
ATGAATCTTGTGATGAGTCAGGGAGGTTCCAAATCACACGTGTACAACGA
TGATGTTGAGTCCATATTCTGTGCTCTCCGTGGATCTGTTGATTACCTCT
TAATCGAATACACCAAAAACAAAGGATATGTGATCGATATGCCACAAGGT
GGATACTCAACTGTGGACGTTGACCGAGTGGATTATGTTAAATATCCATA
TTTACGAAAGATTGATAAGTATATCAAAGTTCAATTGGAGCCTGGTGATT
GCTTATATGTGCCTTATAGATGGTACAAACAGTTTAACAGCTACGCGAAC
AATCAAGGTCAGAGTATTGCATTCAACATTTGGTTTAAGCATACCCACAG
ACAGAATCCTCCACAATGTCAACCTACCAGTGATGCCATCTCTACACTTG
ACCGTTATGGATATTCTGACGATCGGGAAGAAAAGGAGATTGAAGAGGAA
GAAGGAGTAGTAGGTGAAGGGAATGAAATCGAAAAAGAAGATGGTAAAGA
AATCACGCAGAAACAGAATGAGAATATCTTGTACAAACAGTTTAACAGCT
ACGCGAACAATCAAGGTCAGAGTATTGCATTCAACATTTGGTTTAAGCAT
ACCCACAGACAGAATCCTCCACAATGTCAACCTACCAGTGATGCCATCTC
TACACTTGACCGTTATGGATATTCTGACGATCGGGAAGAAAAGGAGATTG
AAGAGGAAGAAGGAGTAGTAGGTGAAGGGAATGAAATCGAAAAAGAAGAT
GGTAAAGAAATCACGCAGAAACAGAATGAGAATATCTTGTATCATTTCAA
AAGATATGTCGAAGTTTTTACGAAGAAAAACATTACTGTTACAAGATTTT
ATCACATCATTAAAAGGGTATCATTTCAAAAGATATGTCGAAGTTTTTAC
GAAGAAAAACATTACTGTTACAAGATTTTATCACATCATTAAAAGGGACC
CTTTGATAAACCATGAGGAATATAAATCGAAATTTCCAAAATCTTTTAAT
ATACTCATAGAAGAGGACCCTTTGATAAACCATGAGGAATATAAATCGAA
ATTTCCAAAATCTTTTAATATACTCATAGAAGAGCTTTTGGATGCAGATA
GAGATCATATATTAACATTGCACGACTTCCAAATGATTGAGAAGGATAAA
GGATCACCAAGATACCTAAAGATGATTCAGTACCTTGAATATCAAACGGC
TCGCATCGAAGACTATATTGAAGATTTGGACGAGTCACAACACCCTTTTG
GATGCAGATAGAGATCATATATTAACATTGCACGACTTCCAAATGATTGA
GAAGGATAAAGGATCACCAAGATACCTAAAGATGATTCAGTACCTTGAAT
ATCAAACGGCTCGCATCGAAGACTATATTGAAGATTTGGACGAGTCACAA
CACCACGAAACGATTCATGAATTTGACCGGAGGAAAATGGAAGAATTTAA
ATCAGCAAGAGCATTTGATGAGCTGTGAACGAAACGATTCATGAATTTGA
CCGGAGGAAAATGGAAGAATTTAAATCAGCAAGAGCATTTGATGAGCTGT
GA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000043_pilon | genome | sc0000043_pilon:1325761..1331267 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1330-1401:73 |
| Aaloc | 1168-1326:658 |
| Aaloc | 1099-1167:1126 |
| Aaloc | 1021-1098:1563 |
| Aaloc | 763-1017:2229 |
| Aaloc | 493-759:2871 |
| Aaloc | 430-492:4283 |
| Aaloc | 172-426:4808 |
| Aaloc | 1-168:5508 |
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