XLOC_039498 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039498
Unique NameXLOC_039498
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000014_pilon:399477..408653-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039498 ID=XLOC_039498|Name=XLOC_039498|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9177bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000014_pilon:399477..408653- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGGATGCAGATGGTGCTACCAAATTCTCTGATCTTCAACATGTAGA CAAAGCCTTAGATGAGTTGAAAGGAGGTAAAAATGGGATGGCATTGTGTG TTGGATCGAGAGCACATCTTCAGGATGATGCAGTTGCACAGGTACTACCA GTGGTTTGTTAAATTAATTTTGAATGAGTCATTTCATGCACCAAATTATC CCGCTTCAGGCACGACGGAAGCTTTTTGGACCTACCCCGGTAAGGGTCCC ATAAAATTAACCTCTATCTGTTCGACCGTCCGTCCGTTCGTTACCAACTT TTCTCGAGATTGGTTAATTAGTTTTTTCTGATTTTTTGCACAACAATGTG TAATTATAAACCCTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCAAAAAAAAAATT TTGGCCCAAAAAACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAAT TGAATCATTAATTTTTTCTGATTTTTTGCATGAAAGTAGGGTAACATCAC AGGTAAAAGATGGCTCAAGCATATTTTTGCAAAAAACATTTGTTGGCTCA CAAAACGCATGTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATATATCAAT GTTCTTAGTCAACTTACTCAATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTTTG CTTAATTTTGAAGAATATATGTGTGTTGCTTGGCGTGTTTTTATAGAAAA ACTGGCCAAATTCGATATTTTTTTATAAGCACATTATCAATTACTTAAGT ATTAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTTTCATTCTTGATGATTTTTTGCATA AAGATGCATAACTATAAACCCTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAA AAAAAAATTTTTTGGGCAAATTTGGGTAAACTTGGGCAAAAAAAACGGCT AAAAAACGGGTTTTTTGGGCTTTGTGAAAATTGAATCATTAGTTTTTTCT AATTTTTCGCATGAAAGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCAGATTTTTGTAA AAAAAGAATTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTATCTATAAGAATCACT ATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATTTTTTGAT GAGATAGATGTTTTTTTTACTCACGAAGTCTTGAATATGAAAGAATATTT CAAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTAAACGTTTTTTTTATAAGAAACAAAC GACTAATTTTAATAGATCGTCACTATTTGTGTTCTGAATGATTGTTTAAT GGTCACGTCACGTAGATATCAATTACTAGGTCACAGTGTGGATGTAAACC ACACTGAAACAACTGCCTTCCATCACGCATATCACGCTCGCTAAAAAAGC GCGCGCACATTATTAACGCCTACATGTCATCTCCAGTACATTTTAGATTA TTCATTGAAAACAAATTACAATATAGTCAATTTTCATGTCTCGATTATTC AATTCCGAATAAAAGACATTCAGGGAAGAAAAAAGAGAAACACCTGGGTA ATCTAGTTAAAAAAACCAAAAGTAAATGGTAGACAAAGTAATGAGCCAAG GCAAAATGAGATTAGCGTACCACTATGAAAGAAACCGCCTCCGGCGGTCG ATAAATGTGTTAAATGCATAACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATTACTTGT TATATCTGGTACGGCGAATGAGGAAATTTAAGTGATTTTATAGCGATTTT ACCGACGAAGAGGAAAATTTCGGTTTTTTTTTGTGAAAATCTTGTACGGC AGTCGCTGTACCTGCCGTACCCGTCGCGTCGTGCCTACGCTTGGTGAATT ATTTCCAGTCATGTGCAAATCGAAAATTTCTATCATACTAGGAAGTTAAG TTGGGTCTGTGACAACGATTTCTTCATAAATTTATTCGTGACTTTTTTCT TTGTTTCAGAGATCCTTCTTCAGGAACATTTTGATGTTTGGGTTTCATTT CTTAGTTTCATTTCTTTGCGTCAAAGATATAAAAGACACACAGGTAATCA ATTCATGATATTCATGACGTAATGTTTTCTACGGAAATACCCCGGTTTTA GCCAGTTGTGATAAATTTAGACTAGACAAAAGTTGTATAAAATTTACCAC TACTGGCAAAGACCGGGGTCTTTTTCCGTAGATAACATTACATCATGAAC ATCATGAATTAGCTTCATAATAAATATAACAGGGTTTTTATGGATCCTGA AAATGTTTGGAGATGAATCTTCAAACCCTTGAAAACTTTGAAACCTAAAA CTTTTCAAGAGAAAGCTTTGAAAAGGTTGGTTAATTTCATGTATTCGAAT AAACTAATAATCCACAAACAAGTGGTAAGTAAAACCTTGAATACCATGAA ATAAGATTTAAGACAAAGTTCATAGACAAAACAGACTGTATACATATTGG TTTCGATTCAATCCGATATTTGTTTCCATAAAAAGTTTCACTACTTTCAA TTCACTACGGCAAAGTCAAGAAAAATTTACAAAAAAATACGAATTTAAAT CGCCTTTCTCAATTTTCCTTTATTTTGTATTAAATTAAAAACAGAAGATA AGTTTTATCCTTGAAGTAATCTTTTAAACGTGAGGTTTTCTTGGAATTTG GTTATTTTATTTATCACTACGCTTCATTCAGACTAAGAAAAATCGCTAAA AAGGGGAAATTTTTGACATATCTTTAGTAGAAGATTAGAAAGACGGGCTT TTTTTTGTTTAAATCAGATTAAAATACACAATGTGGGTGATTATGTAGAC CCTGTTTTCATAGAGATTAAAGAAACGTTGTATTTGACCCTGTTTTCTGT ATATGTCAAAAATATATTTTTGTTCTGTACTTTTTTTGTCCCGTGTTATT GTCCATATTTGATTGTCAGAAATTTCCCATGAGCTCCTCATTTTAATCAG TTTCAATTAAAAAAAGAAATTCAAACCTCATCAGAATTTGCTGATATAGC AAATAAAAAATGGTAGCCAATATGAAATAAAAATCCTATAGAACAGTCAA CTAAAAGTTGTATTGGTCGATTTTTATGTCTGACATCGAAATCAAACTTA TAGCTTACTCAATGATAACCGTTAAAATGAAGGCCTTGGGTTTTCCCCTC AACGGTATTTAAACCTTTTATTTTTCAGGAGGGTAAATAAAGTCTTCCAA AAAATGACATTCCGTACTTTTTGAGGGGTAAAAGAAATACCTCGTTGTAA AGGTAATTTTGAGTGGCTTGATGTAATAGAATTGGCACCACGTTGTCACC GCAAGTAAACTTCAATCCTTTTAATTCTCCTCTTATTATTTAGTGTGGTT TCAAATTGTTCACACGAAAAGCTGCACTGACATTATTCTCAAGCTTGCAT GTGGAACGCTGGTAAGTCCAGCTTTCTTCTTTATTCTAACATCTGACCCT TCCCTAGTCTTGATGAAGATTTTTCTTTGCTCAAAGCTCCAGATCAGGTA TGGCTTATTCTATTGACATTCATTCCAAAAAGAAAAGAATTCATGTAATG CTTTGCTAGTTGCTACCTTTGAAAGTAAGTTTTCAATCTATATTCTTAAA GAGACATCATGATTAGTAGTGTTCGGTGTACAGTATATCAATTATCAAAT CATCAGATAAAAAAGTTTACTTTGTAATTCTGACGAAACTAGAAATTGAC ACTCTTACATAGACCTTGCATTGGTTTATGCGGGAGCTCAATTATTTCGC TACTTAACTTAAACGTTAAAAGTTCTTTCTTCGAAACTGAATTTACACAA ATTAATGTTCATACCGTTTTTATTTTTTCACTTCTCTATTGCAAGGAAGC AATTCAAGAAGTTCATTTCATATTTTGAGTTTTGAGAGATGAAAAATTAA TGTTTTCAAAAATTAACGACTATTGGAGCCAACCAGTTTGGCGCTGTAGT TGTAGAAAAGAAAAACAAAATTTTAAAAATGAAAATCACTTGTATTAAGT GCTGATAACACTGGCAACCCACTAACTTTATAAGGAAGAATCATTCCTAA TAACTTCACAGAAAAAGTGTTTTGATTTACACTTTAGAAGAAGAATTTTG TTCTGACGTACCCATAAAACAGTCGGAGGCGACCCGAAGGCTTCTCTTTC GATAGCTATCTATCCGAAGGTATAGAAGAGCGCCACTCTTTCTCCCTGGA TTACTCCACTTACCCTTGATCCTTCTCTTAATTGTTGAGTATCAGCAGAG AGGCAGCAAGTACCATTTTCGGAATCTTTGTTATGACCTACAACCTTGCC CACCGTAGCCGGATGCTCTACCACTGAACTACGGTCGCTTAAAAAAATAT AAAACCTACCCTAAAAACATAAGCGGAACAAATTCAAAAACCAATCTTGT CTAAAATAATATTGCGAAAGTAAAAATAACCTTATTTTGTTTTTTGAAAA GAAAGCTGGTACTACTGTAGAGGATCGAGGAAAATAAAATCAAGAAGGTT GTTTTTGTTTTTTTCTCAACGCTTGAAAATATTTTTGAAGTGAATGTGGA CCGACACACCTTGTGGAATACTGGCACATAAACTTTTTATAAAATCAATA TCAACATAAAAAGAGAGATAAATAGAAATGTTTCTTTCTAGCCTTCTGGT GTCCAGTAACTTAGCCTGGACCCAATTCTTGAATCTGAATTTGAAGTAAA AATCAATCGATTTCGATTGGTGCATCCAAAATTGTTACATAAAAATACTT AAGTTACATAAATATTTTGATAAATTTTACTCTTATGCTCTCGAACCTAT ACAGCTGTTTTTTTCTTCAAAATTCCTAATTTTAGGTGTGAAGGAGGAAA AATAAGATACGAATTTTTGGAAACCTTCGTTTTATTTTCCCCCAAAAAAT TTGTGTCGGCGAAACACGAATTATAAACTTCTGGCGAAATCACAGAAAGG CGTCATGTATTTTATGCTTGAAAATTTTTTCTTTACAATCAACTAATATT ACTTGGCTATTCGCAGCCTAACGAGAATCTTCAACCCACTATTGATCCTC GTGATCGAAGTATAGACATAATTGGGCTATTCCAGAAATACTATGTACCC CCTATGTTGAGGAGTTGTGACGTCCAGGGTGACCTTGGAAATATAAAATC CAGGGGTCTGGTTTTTGTTGTGTAAAAATGAGAAGCTCTCAAAAAATGAA AACAATAATCCAAGTTGGTCCTGAAAAATCGAGAAAAAAAATAAATGGGA GTCACCTTTCCCAGGCCTCTTTTGACGCTCCTTAAAATTCGACGCTCTTC TATTAGATATGTTCTATTATTCGATAATATTGAAAGTCACCATCAACAAG AAACTCTCATAAACGACGCTCTACTATTGGTCCCTTAATTGATGAAAATC CAATTCCCTTTGAAAATATAATTATGGATCGTCCACTTGCTTATGATTTT CTATTGATTTGGTAGTTTATAACTTCTTTTATTCTAAAAGGCTTTTACGG ACCTATTCTGTTTCATAAAAAAGACTAGCAGAGAACGTCAAAGTCTCCTT ATCATCATCGTTCTGACGTCAGTGACGTTAAATTGACATACGAGCCGCAC GTCGGGCAACACGAGTTCCGTTCTAAAAGCGGACTATTCGATCTAGAATT TAAAAATTGATCAGCTGGAATCAGTGAGCTCTCAGCATCAAGCATCAAAC TGTCATGGCTGTTCGTTTCTTTTGGGTAAACCCCTTTCTTAAGATTGTAA TCAACCACTGATTTAGAGATTGACGCATACAACTCTTTAATGTTATGCGA TGAATTGCCTCCACCACCGCTTGAAGAATCTTGTGTGATCCTATAGAAAA ACAACAGTTTTCTTTTCACCTTTTTGTTCACACGGTTTACTAAATATTGA GTCGGTTGGAACGAACATGGACCCACTCCAGCTAAGATGATGATAACAGG CTCGTCACTCAAGTCTGATAAATATTTCTCAAATTCACTTTCATCGTTAC TGACCCCGTCTGTTACGATCAACATCACATAAAATACATCACTCGAACTT TCTCGAACCTCTCCAATTTCAACCAAGTTGGATTTATCATAAAGTTTCGA CATAATCTGTTTAAAGTATGTTGGACCACCTGGTTCTACCATGGGGATAA TATCTTTATAGCTTAGAATAATGGCGTCTAGATCCGCATTATTTTTATTG ATTTCAAAACAATAGTCGTCAATTTCACCCTTTGTTAAAATATTGTCGTT ATTGTTGTTGTTGTTACCCACGAGTTGAAATTCGTTATTACCATCTATCG CCTTTAGATTATTCAATGTGCTTTCTATGAAGCATTGACTTGATCTGTTA TTGGGTTGACTTTCCAATACTTTCGAATATAATTTCCCACCGAACCCATA CAAAGGGATTCGCTTGCAATAATATGATAACCATGTTCCTACTTGCTTCA GAGCGGTGATGTAATCATTGCTACCATTTTGTTTTTGAAGATGATGTAAC GAACGCTCATTGGTCAATGGGCAACCGTTGGAGAGAGTGAAATCGATGCC GATGCTACATTTGATTTGAGTTCCACTGCGAATGTAATCGACCAATGAGA ATTGTTCATCCACTGACACGTGATACAGTTTCAAATAGCCTGCATTCGAT TCCTTGTTTTTAGCACGGCCTAACGAACGTTTTGAGCTTGACATTCTACG CAAGTTGATCTCCTTTACCAGTCCCTTATAGCTTTGCAATTGGTGTAATG TTGTCACAAGCTGACCTTTAATCTCTGGTTCACCTTTTGCGTTGTGTGCT AAAATTTGAAAGAGTAAATTTCCATCCCTGTCTCCATTACAAAGCTTCTG TATGTTAATACTGAATAGTTTCCAACGCGGATAGTTTGCTTTGAAAATGA CTTCACTCCGATAGACAGGATGGTAGGTATCCTCGAAAATCTCTCGATTA ATTTGAAGAAATACACTTGCTCGATTAAAGAAATGTTTCTTGGCCAGTTT ACCAGCACCTAGACTTAAGCGTACTTCTTTTTTGCTTTCAATTGAGTTCC GAACCGGTATAGCACACATTGACAGTGTCCCAGTCTTCTTACCGCTTTCA TGTTTAAAATGAAAATCTTTGAAATCTAGGTCACCTCGAAGTAAATTCTC AACCTCTAAATCATCTGTTGTACCTAGAAGTTTACATTTTTGTAAATCTC TAGAACTCAAATTATCACCATCATACAAAGACGCCTTTAAACGTCTATTG TCCGTATTGTTTGTATCGACATAAAAGGTTTCAGTGAACAAGGGTCTGTG ACAATTCGCTATAGTTTCCGTTCTGCCGTACTCAAACCATTTCCCGTAAC GGCGGACGTGTAGTACGACAAATGGATCAGTTTTGCTGAACATATCAACA GATATGATGTCACGGCACTTGATAAATAACTCGACGTACATCTTATCTCT CTTACTAGCCTCTTTGGCGATGTTTTCAACGCGCGTTTTCGTTGGTGATT TTGGCAGGTAGATTGTTGGTGACTGTGGAAGACTCGTTGTTGAAGCAATC ATTAAGTCTGGCATCACTTGTGATCTTTTCTTTTTGAACATTGTTCAAAT TTATTCTGAAAATTCGATTATATGTTAAAGTCACTCTTCTTCACATTCAA AACGTATCTCTAGTAAAAACAGGTTTCTACATAAACGAACCAGTTAGTTA TGAAGGTTCTTCTTTCAAATGTGCGAATTCTTTTTTCAATACTACACAGT AATGCTCGTTTCTTTTTTTCCAACCGTTTCATTAATTGCTCGTGAACGTC TGGTACCAAAACTTTCATGTACATTTTGATGAAAGCTCTATTGTAAAGAA AAGTAAAAGAATAAGTTAATTATGACAGTTTTCTCAAAATTGTTTTCATC GCGTTACCATAGTAACTACAATTATTATTATGGTACAAGATTTTTCACAA AATGTAATAATTTCTAATGTCATTATTTGATAATTTGCACCAGGGAATTT ACATAATAATGTGAATTTTCTTTGTGTTATTCCTCTTTGAAGTTTCGAAA TCGTTATATTACTTGCAAATTTTCGAGGGCCGCCCCTTTCAAAAGATATA TGGGATGTTAAAGGCTTTTTCTTGAAAGGGTACTGCTGGACCCAAGGGGC TTCTTGTGCATAGTTTTACCAAGGCACTAATGGACCTTGTATGTAAACCG ACCCGATATCTACTAAAATTTAGAAATTTATTGCCGTAAGGGCAATATTA TACGTGAAATACACACTGCTGTATGGACCTTATAATGCAAACCCTGCAAA GAATATAGAATTTCAATGCAGAATTTGATATGTTTAATTAGAAAAGTAAG AAAAATCTAGCTTTTCACCTAGTTTTCCAAGTACCAAGTTTTCTATCTAT CCGCCTATACTACACCCACTTTTGCATTTTAATGTCATCCTATAAGACTA GACAGTCATGGTTTCGATAAAAGAGGAGGAATACGCAAGGACTCATTGGG AGCGTCCATATTCTACATCAAATGTTTCAGTTTATATTGTATATTGTAAA AGGATCTGGTTAATAGCGGTTGTTTAAAAGGATATTTTTTCAGAAAGGAG CCACGAATTATGCCAGGCAAAAGTTTTTATGACCAAAAAACTGAAGTTCA GGCAAAACCCCTCAGCCCCCAAAATATGTAAGGGTTGGCCCCTTACTATA TAAGGGGAATTTGAAAATGGTCGTCAGAACTTTACATATTCTCCTCTTGT ATCAATTTTATCAGGGCATTTGATGTCGAACTTCTGTACATAGCGCAAAG ACTAGGAATACCAATCGAAGAAAAAGCTGTCAATTGGCAAGAAATTGATG GTAAGAAACCTTTTACGGCATATTTGGTTAGATTTATCAGGTCTTATCCC TGTTTACTTTATTTTTTTCATATAGAGTTTCATGGAGTTTCGATCGGATG ATTCTATCCACAAGAAACTACATCATTCGTTTTTTTACTCAGTTTCCCTT ATGATTTTTCTAATTGGGTATTTAATGCCTCATATGACCAACTAATCCAT TGTTACCATCATAATCTTTTTTTTCATTCACGATTTTTAGGTTCCAAGAT GGTACCTATTTTTAGTTGGATTCAAATGGGCAAAGATTTGTTATTGATCC GAGCACGTTATGTGATAGGGGCATGGGCACTACAGCCATCTGGTCAACCC AATTTAGTTGATGTTGATGAGGATTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000014_pilon:399477..408653-

>XLOC_039498 ID=XLOC_039498|Name=XLOC_039498|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1032bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000014_pilon:399477..408653- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTGGATGCAGATGGTGCTACCAAATTCTCTGATCTTCAACATGTAGA
CAAAGCCTTAGATGAGTTGAAAGGAGGTAAAAATGGGATGGCATTGTGTG
TTGGATCGAGAGCACATCTTCAGGATGATGCAGTTGCACAGATGGTGGAT
GCAGATGGTGCTACCAAATTCTCTGATCTTCAACATGTAGACAAAGCCTT
AGATGAGTTGAAAGGAGGTAAAAATGGGATGGCATTGTGTGTTGGATCGA
GAGCACATCTTCAGGATGATGCAGTTGCACAGAGATCCTTCTTCAGGAAC
ATTTTGATGTTTGGGTTTCATTTCTTAGTTTCATTTCTTTGCGTCAAAGA
TATAAAAGACACACAGAGATCCTTCTTCAGGAACATTTTGATGTTTGGGT
TTCATTTCTTAGTTTCATTTCTTTGCGTCAAAGATATAAAAGACACACAG
TGTGGTTTCAAATTGTTCACACGAAAAGCTGCACTGACATTATTCTCAAG
CTTGCATGTGGAACGCTGTGTGGTTTCAAATTGTTCACACGAAAAGCTGC
ACTGACATTATTCTCAAGCTTGCATGTGGAACGCTGGGCATTTGATGTCG
AACTTCTGTACATAGCGCAAAGACTAGGAATACCAATCGAAGAAAAAGCT
GTCAATTGGCAAGAAATTGATGGGCATTTGATGTCGAACTTCTGTACATA
GCGCAAAGACTAGGAATACCAATCGAAGAAAAAGCTGTCAATTGGCAAGA
AATTGATGGTTCCAAGATGGTACCTATTTTTAGTTGGATTCAAATGGGCA
AAGATTTGTTATTGATCCGAGCACGTTATGTGATAGGGGCATGGGCACTA
CAGCCATCTGGTCAACCCAATTTAGTTGATGTTGATGAGGATTAGGTTCC
AAGATGGTACCTATTTTTAGTTGGATTCAAATGGGCAAAGATTTGTTATT
GATCCGAGCACGTTATGTGATAGGGGCATGGGCACTACAGCCATCTGGTC
AACCCAATTTAGTTGATGTTGATGAGGATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039498XLOC_039498-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000014_pilongenomesc0000014_pilon:399477..408653 -
Properties
Property NameValue
Aaloc382-516:136
Aaloc295-378:463
Aaloc226-291:5885
Aaloc142-225:7269
Aaloc1-141:9178