|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000086_pilon:394314..399551+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039302 ID=XLOC_039302|Name=XLOC_039302|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5238bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:394314..399551+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCAATCGAAGATTATGCAGAGGAAGGCCTGAAAAAGATCCCTAACTT
AGAATTGGCTCAAGCACTGTTTACACTACAGACCAAACATACttcagaag
aagaaaaaagtgagGCTAAAACATTATTGGAAAAAGAAATCACAGATAAT
AGTAAGTAAATTATTAAATTACCTTTCTAATTGTAATGGAGTGTACAGAA
TTATCAATCAGATCTCTACTACTGtttacaacaaaaacaaaacagtacTG
ATAACAAGtcttatttcatttgaaatactcAAAAACATAACCATGATTAT
AAGTAAGGGATGTAAAATTTAAAGGGTGCAGTATCGGCATTTTTAAGGAG
TGtataaaaatatgaaacaaGAAAGTATaaggcttgaaaattaaatgaGT
GCAAAAATGCTAAAACTATTTTACATAGAGTGGCCATTGACTTTAATTGC
TGTGAGGGATAGAATCTACCATTATAACTTGATGCCTTTCATTTTTCAGA
CATGACCTCTTTCTACGAGGAAGTTTGTAAACAATTAAACTGGAAAATTG
ACCAATCACGTCTCACCAcgatgaaaagtgaaaatgagaAGAAGTTAAAA
GAACTTGAAGACAAGATTAAAGATGCAGAGGAGAATTTAGGGGAAATCGA
GATCAGAGATGCACATTTAGATAAAGCTGAATTTTATGTTACTATTGGAG
ATAAGGTTTGGAACAGTTTGGAAGGGttaattttaaaaaagattttcagc
tGTTGAGTAAATGAATGAGTTCACGTCaaatcttccttcgtttcgagtgt
aaaaatcctACCCTTCAAGATAAGCGCACTAATCtagttttgaatattga
atttttgaaacagTGAAACAATAGAACATATTCAAAGtggattttcttca
aattttcataggATAACTCATTGACATCATTACGAAAAGCATACGAAAAG
ACGACTACACTTGGACACAAATTGGACAACATATTCTTACAGATTCGTGT
TGGTTTCTTTTTCCTGGATAATGATCTGATCActcgaaatattgaaaaag
cAGCCAGGTATTTTTGTCCCCATGTTCTCCTCCATTTTTCTAGACATTTC
ATTTATGTGAGTGTTAGGGcttttattttaagccaattttaattcttgtg
attttttcaaattctttattactttaGGCGTTCAAACATTTGCCAGCAGA
AACCTTCGTGAttttcacgagttttggccttttttgcgaaagttttaatg
tcttttttttgaaaattctttctaTGGCCATTCCCTAAAGTTttcacaaa
atagaaaaatctgtGAAACTGTAAGATGTATGGCACTTTTTAGTTTTAGG
CACTTTCACAAGTTAACCGATTCACGAAGAATAAAAGGTCCTTCATAAAC
CTTAGAGTTAAGTAATTGACTTGtgaggctaaaaagtgccataaatcttt
cagttttacagatttttctattttgtcaagaatttctCGCGAAATTAAAA
GATTAATCTCATTTTCACTCTTCTTCTCATTTAGCCTTATCGAAGAGGGC
GGTGACTGGGACAGACGAAACCGCCTAAAAGTTTACAAAGGATATTACGC
CCTCACATCACGTGACTTTAAGGGCGCCGCCACCAACTTCTTAGAGAGTA
TCTCTACTTTCACGTCATACGAGTTGATGAATTACTCCAAGTTGGTCGAG
TACACCATACTGGTGTCTATCATCTCACTAAAACGTGCTGAATTGGGTGA
AAAGGTAAtaacttttcaattttgtattCTGTGTGAGGCTAGTGAAgtta
gagagtctatcaccatatttcacACCCTGCCTGGAAatgcttgggattcg
aacacagttcATTGCGGAGCAAGTCTATGATCGAAACCATCACACAacca
atcggcagaatgttagttAGACGCTAGCCTATTAGTTTAAGTTTGAAAGG
ATTTCCAGGCTATTTCCTGACTGTTTTAAGAGGCTTATTGTTGATATTGT
TGATTTTCTCTACTAATGTCTTCTGTGTGAGACTgtgtgcgccacaaaaa
agtttctctataTCAAGTTATTTTCGTAAAGAtctaagaattttaaaaga
aacctatcaatttttgttttgattttgcaattGCAATTTTCGGTTCTAGT
Aggttctacaatcatggacaaagatttgagacaaaagggagttcccggtg
aaattttaaacaccacaaatgacttttaagcgccttaaactacagttgga
aagtagagttttaactctgagttttaacatgagacttaagacttaggacc
ttaggatcttaggatttaaaagctcaaatttgctcgaataaggcttggaa
tacaGCCTGGAAGCCACCAAACctctctaaaatcgaaatattcaatgaaa
gaaagtggaagtgctaaaatagcaattctcgcccgaactttaaattctga
aaaacgttaaaatacactaaaatctcgaTATATTTCGACCACGATTGTAT
ACTGGTTAGTCAATATGTAAAGCTGGATTCATCTCGGAACCCatatttaa
tgtatttttatGGACTTTTTGGAATTTCTGAATCAtttcttctttcattg
aaattaaattttccttCACATAGCGAAAATCACTTAATGGCTGGTTCtct
tttaatttgataggtcgatttttaacgttttcgagcactttctgaaagta
agttttgatctaatgaaccaaattaataaattaacccatcaaaattaagt
ttatctttcttctttctaatggATTGGTTgaactttttaaacatttagAC
CTTGAGAAAATTTACTTGAAAAGGAGAAATTTTTTCTGTGGCACTTCCTG
GAAAGGGTCAACTTTGTAATAACTGAAAAGATAATTACATATCAACATGA
AATTCATAGGTTGTTAAAGGATCAGAAATTTTGGAATGTCTGCACACCTT
ACCTAAACTTCGACAATACTTGCAATCCTTATACGATTGTCAATACAAAG
ACTTCTTCCTGGCATTAGGTAAGTTCTTtagggaaaaaataattaattcg
tgAAGCATTCAGTTTGAAGGAAAATCTTCCATattagaccttttcataaa
ttacgtgacgaacatcacttgcctcgttttgaaattattgccatggtgat
aaACTCCtagtggattttattaaaactacttcctaaaTAATCATtcaatg
tctcaagagacataatcaccatggtaattgtttgaatacgaggcaagtga
tgttcgtgatgtGATTTATGAAAACCCAATTCAAGGGTTGTGGATGTCAG
CTACTTTCAAATTTGCAAGCTCAGCTTTCAAGGTCCTCTGCTCAATcacg
tttcaaaaaatttagataTGGTTGtaaattttgatatctttttctCCAGC
GGATATCGAACGTTCGTTACACTGCGACCGCCTGTTCGCCCGTCACACCA
CGTATTACGTACGTGAGATGCGCATCATGGCTTACGCACAACTGTTGGAA
TCTTATCGTAGTTTGACTTTGGAATATATGGCAAATGCTTTTGGTGTATC
CGTTGAATTTATTGATCGGTGAGTGCATTTTCATGAAAAGGTTTTTCGAA
TTCAATTGTATTGTCACTTCTGTTCCTTGTGGCTCTTCTCATCAAGGAAT
GGATACGAAAGATACTTCACTGACAAGTCATTTGAAGTAAAGAGATGGCG
TGTTCTtgagaaaaagtaacaaaactgTTTTATTACATGTTAACGactaa
ccaaatcaaaaaagagcTTGCAGGAACTCCAACTTGCCCCAAATAAAAGG
CGACAACGCTACTGTAGCCAAAGCTTTTTCCCTTAATATAATAGAGGGAC
GCCAAAATATTAACTTGGGGAAGTCGCTTACCCATTTAGTTTGCCCAAAA
TTTGGTCGGCCCGCCACGCTACTGAATGTTGACAGTGTGATGCTGGAGAC
TCTACTTGGTTTGTTAATTCTTCAATTGAATAATTTATTCCGTAGGGAGC
TATCACGTTTCATTGCTGCAGGTCGATTGAATTGTAAGATTGATAAAGTT
GGAGGAATTGTTGAAACGAATAGGTAAGAGGATTTTTAAAGTACTAGAGA
GGGAAGAGTTgaacattttgacattttgagcttttgtttttaaataagaa
tgatataacataatataacaaaaggcagacactgtcctgatatgaaatat
gtgtttgatatgaaacgggaacacttatgtaaaaataaaacctttaaagc
atttttgcaagaagaaaaatttcttgttaaAGTAAGTACAGCGCGtacta
aaaaatttgaataaacttTAATTATTTTGCACATTACAGTGTGCATATCC
AGGCttatatcttaaaaaaaacttaagcATTGCATTGGCTAAGCATTTGC
CAATTCAGTTTACGAAATCGCAAAGATTAAAGTTACTgttaaagctaaaa
aaaagaattttgcttAGCATAATGAGGTTAACCATAATTTACCCTGtgct
aataaaaaacgtgtaaccttTTCCTTTGAATCATGTGTCCATTGAAGAGA
TTTCACAGGGCGCCAACtctataatttattttttaactttctttttagAC
CGGATTCCAAGAATTATCAATACCAGGTAagctgattgattgattgattg
attgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgat
tgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattg
attgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgat
agattgattgattgattgattgattgatttttttataaggcttgaggtct
caaatttgccaatttttttcgacatCTCGtgaagtaaaagctttttagat
aatctaaccatggCAGCAATCTTTGACCTAATAAGCATTAATATGGTGTA
ATATTGAATTTTGCAGAAAATAATCTAGAAATCTGGTCAGACCCAAAAGT
TGGAGTCTGCAAAGCCTCGTCCGATATCTTTTTTCGCACGCCcaattttt
gcatattggattcgactttgtccaatttATGTTTAATATTCAACTTGTTT
TGTGAAAGAGTGTTAGGACCTCACTTTACATGTTCAGATtgatttttatt
atttccttCTTTACGACAGGCTGTCATCAAACAAGGAGATACTTTGTTGA
ATCGCATCCAAAAATTGAGTCGAGTTATCAACTTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086_pilon:394314..399551+ >XLOC_039302 ID=XLOC_039302|Name=XLOC_039302|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2352bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086_pilon:394314..399551+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCCAATCGAAGATTATGCAGAGGAAGGCCTGAAAAAGATCCCTAACTT
AGAATTGGCTCAAGCACTGTTTACACTACAGACCAAACATACttcagaag
aagaaaaaagtgagGCTAAAACATTATTGGAAAAAGAAATCACAGATAAT
AATGCCAATCGAAGATTATGCAGAGGAAGGCCTGAAAAAGATCCCTAACT
TAGAATTGGCTCAAGCACTGTTTACACTACAGACCAAACATACttcagaa
gaagaaaaaagtgagGCTAAAACATTATTGGAAAAAGAAATCACAGATAA
TAACATGACCTCTTTCTACGAGGAAGTTTGTAAACAATTAAACTGGAAAA
TTGACCAATCACGTCTCACCAcgatgaaaagtgaaaatgagaAGAAGTTA
AAAGAACTTGAAGACAAGATTAAAGATGCAGAGGAGAATTTAGGGGAAAT
CGAGATCAGAGATGCACATTTAGATAAAGCTGAATTTTATGTTACTATTG
GAGATAAGACATGACCTCTTTCTACGAGGAAGTTTGTAAACAATTAAACT
GGAAAATTGACCAATCACGTCTCACCAcgatgaaaagtgaaaatgagaAG
AAGTTAAAAGAACTTGAAGACAAGATTAAAGATGCAGAGGAGAATTTAGG
GGAAATCGAGATCAGAGATGCACATTTAGATAAAGCTGAATTTTATGTTA
CTATTGGAGATAAGgATAACTCATTGACATCATTACGAAAAGCATACGAA
AAGACGACTACACTTGGACACAAATTGGACAACATATTCTTACAGATTCG
TGTTGGTTTCTTTTTCCTGGATAATGATCTGATCActcgaaatattgaaa
aagcAGCCAGgATAACTCATTGACATCATTACGAAAAGCATACGAAAAGA
CGACTACACTTGGACACAAATTGGACAACATATTCTTACAGATTCGTGTT
GGTTTCTTTTTCCTGGATAATGATCTGATCActcgaaatattgaaaaagc
AGCCAGCCTTATCGAAGAGGGCGGTGACTGGGACAGACGAAACCGCCTAA
AAGTTTACAAAGGATATTACGCCCTCACATCACGTGACTTTAAGGGCGCC
GCCACCAACTTCTTAGAGAGTATCTCTACTTTCACGTCATACGAGTTGAT
GAATTACTCCAAGTTGGTCGAGTACACCATACTGGTGTCTATCATCTCAC
TAAAACGTGCTGAATTGGGTGAAAAGCCTTATCGAAGAGGGCGGTGACTG
GGACAGACGAAACCGCCTAAAAGTTTACAAAGGATATTACGCCCTCACAT
CACGTGACTTTAAGGGCGCCGCCACCAACTTCTTAGAGAGTATCTCTACT
TTCACGTCATACGAGTTGATGAATTACTCCAAGTTGGTCGAGTACACCAT
ACTGGTGTCTATCATCTCACTAAAACGTGCTGAATTGGGTGAAAAGGTTG
TTAAAGGATCAGAAATTTTGGAATGTCTGCACACCTTACCTAAACTTCGA
CAATACTTGCAATCCTTATACGATTGTCAATACAAAGACTTCTTCCTGGC
ATTAGGTTGTTAAAGGATCAGAAATTTTGGAATGTCTGCACACCTTACCT
AAACTTCGACAATACTTGCAATCCTTATACGATTGTCAATACAAAGACTT
CTTCCTGGCATTAGCGGATATCGAACGTTCGTTACACTGCGACCGCCTGT
TCGCCCGTCACACCACGTATTACGTACGTGAGATGCGCATCATGGCTTAC
GCACAACTGTTGGAATCTTATCGTAGTTTGACTTTGGAATATATGGCAAA
TGCTTTTGGTGTATCCGTTGAATTTATTGATCGCGGATATCGAACGTTCG
TTACACTGCGACCGCCTGTTCGCCCGTCACACCACGTATTACGTACGTGA
GATGCGCATCATGGCTTACGCACAACTGTTGGAATCTTATCGTAGTTTGA
CTTTGGAATATATGGCAAATGCTTTTGGTGTATCCGTTGAATTTATTGAT
CGGGAGCTATCACGTTTCATTGCTGCAGGTCGATTGAATTGTAAGATTGA
TAAAGTTGGAGGAATTGTTGAAACGAATAGGGAGCTATCACGTTTCATTG
CTGCAGGTCGATTGAATTGTAAGATTGATAAAGTTGGAGGAATTGTTGAA
ACGAATAGACCGGATTCCAAGAATTATCAATACCAGACCGGATTCCAAGA
ATTATCAATACCAGGCTGTCATCAAACAAGGAGATACTTTGTTGAATCGC
ATCCAAAAATTGAGTCGAGTTATCAACTTGTAAGCTGTCATCAAACAAGG
AGATACTTTGTTGAATCGCATCCAAAAATTGAGTCGAGTTATCAACTTGT
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000086_pilon | genome | sc0000086_pilon:394314..399551 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1108-1176:5170 |
| Aaloc | 1081-1107:4600 |
| Aaloc | 1003-1077:3997 |
| Aaloc | 835-999:3402 |
| Aaloc | 724-831:2910 |
| Aaloc | 505-723:1536 |
| Aaloc | 358-501:912 |
| Aaloc | 154-357:502 |
| Aaloc | 1-150:1 |
|
