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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000368_pilon:208886..217776+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039287 ID=XLOC_039287|Name=XLOC_039287|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8891bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000368_pilon:208886..217776+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAGCTGATATTCTTGGCTGTATCACTTATAGTGGTTACACTTGATGC
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tgatattttcagatagcaagtcggttatggtctgattatggaaaaaattt
caagtcaattgaaacaatatttgtcaaaatatttacatccgaaattttta
aagagaaatcatgaaagcttctcaaattcataacacacgctgataaaatt
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aatactttgtctgcttaatttttcttataaaaacagagcACTttagggga
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AATGTTTTATAAAAAGGTCATACCCATTTCTTAACCATTTAAGTACCAAC
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GGCGTGTCATAAAGTCCaactaaaaccctgtaaaatctcaaatgttgaaa
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TCTCGTTAATTTTGCATTTAATTGCAGACTTTTTTGTGGTATTCTCAAAG
TGTTCtcataattcaaaatcaattttaatttattaatGATTTTGTGCCAA
GTGCTAATACTTTTTAACGCATTTCCATTTGTAATTTATTAATGATTTTG
TGCCAAGTGCTAATACTTTTTAACGCATTTCCATTGGCATCAGACTATAT
CAAGTTCTTGCTAACCCAATAAAAAACGGATATTCGAACATCTCGTTCTA
ACCAGGTTATTTTTTCCGCTTTAGATCTGACTATCCAAATAGACTTCGAC
CATACGTTGAGAAAGCCATAAAATCCATGAATCAACATTTGAGATGTGGT
TACGATGTTTGGGTACCTTACAGTAACCAAGCTCATCGTGTTGAGTTTAT
CAAGGATGGAGGGTTTGTTATTCGACTTACTATTATTTATTTCCGAGTAG
ATTCTGATTACTCTGCGTTGGCACGTATTCACTATAAAGGTTGGTACTCT
gggagaaaatccataaaatggggggtcaaTATTAAGTGATTTTGGGGTGA
CTTTCCCAAAAAACCCTAGGAAAATTTATGGTCATTATAAAATTCTATTG
GAGTGTGTTTTCCGACAAAAATGCAAAGTGACCCCctcccctacaattaa
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TGAAATTGTGATCAATGCTTAAGCAAATACTAGTGAAACTTCTCGGGATA
TTCATTTTTGAATGACGGGGGATTTTTCAATTGtcgaaacaaaaagtttt
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TTATCGTATTTTTCTGATTTACAGTCGAGAAGTAAGCTTGTTACTCTTCA
CTTTTtactcacagacccggtgggggTAAATATAACAGACCAAAACTAGA
TGCtttttttatggcttgggatttggatttgttttcgaatttagaatatg
attttgatattttgataccAATTTTCCAATCGGAGGAGTCGAATCTATGA
GAAAGGGGGTATAATTCTCTTGTGGTGATGGTGAAAGATGCATTGAAACG
GGATTGACACATTCACATTGTTTACTGGTTCAAAAGATTTACAGTCGACA
TTCAACAACTCGAACATGAAAGGGGAAAGAGGAAAAAATCATTCGAGTAA
GGAGGGTTATATCATAGTCACTAGAATTGACATTGGTTAAATTTATAGAT
AAACTAAATAGCCCTAAGACTTTTTTCATGAGTTCAGGTTCTTCTGTATA
AACGTCAAATGAacgttaaaaaaatattacgtACCAGCACGACTGCTATA
TCATCATAAAACTTCTTTTCTTTTGCTAGATATTGTTTTGCACGAAATGA
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TTCATCAAAATCAACTGGAACAATATTCAAGACGGTAAGTTTCTTATCTC
TAAATAACTTTTATCCCTGAGGTGATTATTCTGTCCAAAGAGCCTGTGCA
GGTTTATCTTTAGGGACATGTCGTAAATACATGGAGGACGAAAAAACTAG
TCTCTTGAGGTTGTATTTATGGAGAAATCATCAGGAAAACATGTAATTTT
AGTCCTATTCTCAGGGGTACCTTTGATCACTAATTTTTACAACAAACGAT
ACTATATTGGTTTTATGGATATTCAATACTGTTTTTTTCCCGGTAAACTC
AAAACCCATCAAAAATAGATAATTAAGAAAATTAGATATCTGAACTGGCT
GAGTTTTCTCTATTTAGGTATGGCAAGTCAGTTCGACAAAGCATCAAATA
ACAACATCTTCCAAACTAGCGTGGTAAGAGTTCTCTTTCTTATTGTTCTA
CGGTTAACTCAAATTCGTCGATTGGATTTCACTTCGCAAAtcttaaactt
taaaaatttcataTCTTCATATCGACTGTTTAGCGAATCAACTGAGCATG
AGTTCATCTCATCTCTTTGACTAGtgttattttaatttatttttgggaCT
GGAAAAGTTTTTCGCAAAAGGCGAAAATCGGCAAATCATAAGCAGATATT
ATACATTTTATacaattaaattcaaaataaatccGGGTTATGTTAAGGAA
CATTTCACATTATCATATATCACCTTTAGTAGTGTGTAGTAGCACTTATT
ATGTCCATCAGCTGACACGTGTTTTGTCCTATTCAGAACTGGCAATGCAG
CTTGGTGAATGAATATAGACTACTGACTAAACACTAAATATTAACTAATG
CCTTATCGCTTTTGGTGAATGAACTAGCGTAGCCTTGCTCCTCAACATAA
TCCAATAATACGcactatacatgttttttagaagcattgcacttataggc
atgtctaggctcagatatggcaaaaatttaagtcTAATTTAAGCATCACC
TGAAGCCTACGAATAAATgtattttccagatttttgctgtttttggctGA
GATTTTACGGATCTTCggaattttcctaaaattttgcttGTGATATTAGC
ATCCTTATAAGCtttttttAGCCTTGTCAAGccctcgacctaagcatctT
CGAGCCTGTTTTCGaatttatgcttattaaaaaaacatgttaatgcctct
tttttttgctatacaTTACAGCCATATGATTACATGAGTGTTATGCACTA
CTCTTTGTCATCATTctctaaaaatggtcaaaacacCATGACGATCTTGA
AAAATGCTCAGAGTGCAAAGTTAACGGCACAGGACTTACGAATCCTTGGA
GACGTTCCCGATTTATCTGCAGAGGATTTACAAGAAGTTAGAGCTTATTT
CAACTGTAAGTAtctaacacccctgtgtcacagacccgctgggaccccaa
cCTAATGAAACTTTCCCACAGCGAagataaaattttagaaatctttgaaa
agttaGAGCttacttcaaaaagtttgtctAATAGGCCCCGATCCCCGATG
AAACTTtcgaaaaatccagtggggatgggtttagagtgcaattttttata
tttgattttggATGGggttgaaatcaaagtcaatttcccagtggggccgG
GGTTTCAACacgtctgtgacacaggggtgttatctTTCAAAAGTTTGTCA
AATCTATTCATATTGATATGGAATACCCATGTTTCATTCTGTACTTCAAC
AAATGTGTTATAATCTCCGACTTTTCTCTCTCAtttttttCCGAAAGTAT
TCTTTATCATCCCTCTCTAAATCGATCTTTAAGTGGCCAAAAATTGTCTT
CGAAatagagaaagattcaaattacaaAGACTGTTTTATACTAATTTCAA
CCTGAGGTATCAATAtttcgaattacaaaaagatttgAATAGGAGAGAct
cgaataagagagagttgacagtatttcatttttgaaaacgatAACCATTA
GGTAATTCTGCCGGTGGCCGAACAACAGCACGACCAGCACCACGAACAAC
AGCACGACCAGCGCCACGAACAACCCGAAGACCTGCAACGAATCGTCCAC
GAACAACCCGAGGAACAACAGAAACAGGAGGTGAAGCTACATGGTCATGG
GTATCTGACGGATCAACAGAATCATATGGTACTGATGCTACAGAATCATA
TGGCACAGAATCATATGGTACGGAGGCTACAGAAATTTATGGTACAGAGG
CTACAGACATTTATGGTACTGAGGGTACAGAATTTTATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000368_pilon:208886..217776+ >XLOC_039287 ID=XLOC_039287|Name=XLOC_039287|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2502bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000368_pilon:208886..217776+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAGCTGATATTCTTGGCTGTATCACTTATAGTGGTTACACTTGATGC TTTACCAAAACACgATGAAGCTGATATTCTTGGCTGTATCACTTATAGTG GTTACACTTGATGCTTTACCAAAACACgGCGTCTTTCGACCCCCGACGGA AATTGAAGTCAACGAGAAATTTTATCGCGTCTTTCGACCCCCGACGGAAA TTGAAGTCAACGAGAAATTTTATCATCGACATGGAGATATTGAGCGAATC CAACATAATGATGATCGACATGGAGATATTGAGCGAATCCAACATAATGA TGTGTCCAACTTCAAACGCCTTGCAAAGAAATTGAAACACATCATTGGAG AGACGAAAGTGTTGAAACGAGTACTTGACTCAAGGAAGAAATTTGTGTCC AACTTCAAACGCCTTGCAAAGAAATTGAAACACATCATTGGAGAGACGAA AGTGTTGAAACGAGTACTTGACTCAAGGAAGAAATTTGGTCACTTGAAAA GCGTAGCTGACGTCAACTACCATAGATACGGTCACTTGAAAAGCGTAGCT GACGTCAACTACCATAGATACGGCCGAAAGAACGATATAATAGAAAGTGA AAACCGTAAACGAAACAGCGTCAAAATCAACCTTTGGAATCCAACACAAC CCGGAGAAAAATTAGTCATACCATACTCTTTCAGGCCGAAAGAACGATAT AATAGAAAGTGAAAACCGTAAACGAAACAGCGTCAAAATCAACCTTTGGA ATCCAACACAACCCGGAGAAAAATTAGTCATACCATACTCTTTCAGATCT GACTATCCAAATAGACTTCGACCATACGTTGAGAAAGCCATAAAATCCAT GAATCAACATTTGAGATGTGGTTACGATGTTTGGGTACCTTACAGTAACC AAGCTCATCGTGTTGAGTTTATCAAGGATGGAGGATCTGACTATCCAAAT AGACTTCGACCATACGTTGAGAAAGCCATAAAATCCATGAATCAACATTT GAGATGTGGTTACGATGTTTGGGTACCTTACAGTAACCAAGCTCATCGTG TTGAGTTTATCAAGGATGGAGGttGTTACAGTTTATTGGGCAAAGACACC AGTGAAGGGAATAAACAACCAATCAGTATCGATGATGGATGCGAAGCAAA ACttGTTACAGTTTATTGGGCAAAGACACCAGTGAAGGGAATAAACAACC AATCAGTATCGATGATGGATGCGAAGCAAAACATATTGTTTTGCACGAAA TGATGCATGCAATGGGATTCTATCATGAACAGAATCGCTTCGATCGTGAT CAATTCATCAAAATCAACTGGAACAATATTCAAGACGATATTGTTTTGCA CGAAATGATGCATGCAATGGGATTCTATCATGAACAGAATCGCTTCGATC GTGATCAATTCATCAAAATCAACTGGAACAATATTCAAGACGGTATGGCA AGTCAGTTCGACAAAGCATCAAATAACAACATCTTCCAAACTAGCGTGGT ATGGCAAGTCAGTTCGACAAAGCATCAAATAACAACATCTTCCAAACTAG CGTGCCATATGATTACATGAGTGTTATGCACTACTCTTTGTCATCATTct ctaaaaatggtcaaaacacCATGACGATCTTGAAAAATGCTCAGAGTGCA AAGTTAACGGCACAGGACTTACGAATCCTTGGAGACGTTCCCGATTTATC TGCAGAGGATTTACAAGAAGTTAGAGCTTATTTCAACTCCATATGATTAC ATGAGTGTTATGCACTACTCTTTGTCATCATTctctaaaaatggtcaaaa cacCATGACGATCTTGAAAAATGCTCAGAGTGCAAAGTTAACGGCACAGG ACTTACGAATCCTTGGAGACGTTCCCGATTTATCTGCAGAGGATTTACAA GAAGTTAGAGCTTATTTCAACTGTAATTCTGCCGGTGGCCGAACAACAGC ACGACCAGCACCACGAACAACAGCACGACCAGCGCCACGAACAACCCGAA GACCTGCAACGAATCGTCCACGAACAACCCGAGGAACAACAGAAACAGGA GGTGAAGCTACATGGTCATGGGTATCTGACGGATCAACAGAATCATATGG TACTGATGCTACAGAATCATATGGCACAGAATCATATGGTACGGAGGCTA CAGAAATTTATGGTACAGAGGCTACAGACATTTATGGTACTGAGGGTACA GAATTTTATTGAGTAATTCTGCCGGTGGCCGAACAACAGCACGACCAGCA CCACGAACAACAGCACGACCAGCGCCACGAACAACCCGAAGACCTGCAAC GAATCGTCCACGAACAACCCGAGGAACAACAGAAACAGGAGGTGAAGCTA CATGGTCATGGGTATCTGACGGATCAACAGAATCATATGGTACTGATGCT ACAGAATCATATGGCACAGAATCATATGGTACGGAGGCTACAGAAATTTA TGGTACAGAGGCTACAGACATTTATGGTACTGAGGGTACAGAATTTTATT GA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000368_pilon | genome | sc0000368_pilon:208886..217776 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 964-1251:8604 |
| Aaloc | 778-960:7822 |
| Aaloc | 724-777:6970 |
| Aaloc | 619-720:6532 |
| Aaloc | 538-615:5414 |
| Aaloc | 400-534:4826 |
| Aaloc | 289-396:4426 |
| Aaloc | 247-285:4103 |
| Aaloc | 154-243:3719 |
| Aaloc | 115-150:3370 |
| Aaloc | 67-111:2628 |
| Aaloc | 1-63:1 |
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