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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000019_pilon:1063784..1071335- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039014 ID=XLOC_039014|Name=XLOC_039014|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7552bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:1063784..1071335- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAGCACAATAACGTTTTGCCAAATTCCCACTACCATAAACATTGGCA
AAATTACGTCAGGACATGGTTCAACCAACCAGGCCGTAAGAAGAGAAGAA
GAGTTGCCCGTCAAAAGAGGGCCTTAGCCATTGCACCTCGACCAGTTGCT
GGTGACCTCAGACCAGTTGTTAGATGCCCAACATTCAAATACAATACCAA
AGTTAGAATGGGACGTGGATTTACTTTGGAAGAATTAAAAGCTGCTGGTA
TTGCAGCCAACAAAGCTAGAACCATTGGCATTTGTGTCGATCATCGAAGA
AAGAACAAGTGCACTGAATCCCTTCAAGCCAATGTTCAAAGATTGAAGGA
ATATCAAAGCAAATTGATTGTGTTCCCACGCAAACAAAGTAAACCACGAA
AGACTGATAGTGAGGTAAGAAATTACTTTGATGGCTTCATTGATTAAGTT
TGTTTTACTTGGTTATGGATTTGGTTGGTTTACATGTGTGGAGTGCTTGT
TAATTTGGGTGCATGTCGCTAGTCCGACACTTTCTAGTCCGACAGTAAAA
TAGTCCGAATCTATAAAATAAATTTACAATTTGGAAGTCTTTTTATCCGA
CGTCACTTTTGTTCGAAAAAACGAAAGATTTTAGAGTGCCGAATGTTGAA
TAAGGGTTTTTCACTGAGATAATAATAATATAATAAAAGTTCATTTTGGC
GGCATTTTGACATAATGAGAAATAAAGGACCAACCAAGTTTGCGTAAAGA
TAATTTATAGCAAAAAGAATGCACCGCCTTTAAGGGTCCCTTTTTGCGTG
CTCAGAATTATGCTATTATATAGGTTGTAAATCACAAAAGAAGGGTCGTA
AAAACAGCTAAATCCAATTTCTTGACTCTTGAAAGCCTAATATTTATAAG
CTTCCCGAAACTTAAGAAAAGTCGGCTTTAAGGGCCTAACCTCAAAGTCG
GAACTTTGAATTTTTATAAAAGATGTGCCTCCTCTTCCGCGATTCATATT
TCGTTTTTTATATGTTCTTTTTTTACTCGTTGTAGGACAAAATTTTTGTC
GAAATACTGACGCATTCGTCAAATCCAACGTCGGACATTTTTACTGTCGG
ACTAGAAAATGTCGGACTACTGACGACCTCCCGTTAATTTTGTTGGTTGT
TGGATTTTATAAAGAGTTTCCGATAGATTAAGGCCATAATAACAATATAG
CTTGTGATTGAGCAGTTCTTAGGTGAGTTGGTTAACGAAAAATCGTCAGA
AAAATGAATACACCTTTCCCTTAATTCGTAAAACTAATGCACCCGCATTA
TTTTGATGCTCTCCATCATTTAGACTCTGGAGGTAAACAAACCTGTTTAA
ATTTCTGTTGAACAAAATCCCTGCAAATTTTAGTATGTTCAATCTATTCA
TACAGTAAATCCTCAGGCGCTTATTTAATTTTTCAGGCTCTAAGGGGGCG
CTTATTTTTTTATTTTAGAAATTCGCATATAAACAAATTCGGAAGCTATT
TAAACTCAACTGTTTCAAAGAGTTGGATTTTCAAAAAAGGATGAATAAAA
GAAAAATTGGAAAAATCCAATTGACAATTTCTATCATTTTATTCTTAATT
GCTTTCTTTCTTTTGAAGACATAAGTATCTGCTTAATATCTTATTCAATC
AATAACAATATTCGAATAAGTTTGAGCGGGGCGCTTATTCAAGGATTTAT
GGTAATATTATACCACCCTGAAAATATTTTGCCAAAAGAAGATCGCTATC
AAAAGTATAAAGCTGAAAACCCACTTTCCCTAACACCTTGCAGGCCAAAA
CGCATTCATTTACCTCCCAAACAGTTTTATACACACAGTGGAGCGCACAT
TTTCCCAGGCCACTTCTGCAAAGTTTACGGGAAAGGTGTATTTAAGTCGG
TGCCGTGGTATAGTGGTAGTCGACCTTGGCTTCTGTGCTGGAGGCCAGGG
TTCGATTCCCACTCACGACAGTTCACTTGGCAAGTGAACATTCCTTCGCC
CGGGTCAACCCATGCCATGTGAGGGGAATTGGGTAGTCAGTTCAAGGTCC
TGACGGGACGCTCATTAGTAAGCGTCTATAGTTGCGAGAATAGGCCTCTA
AAGCCTCCTGCAACTCAACCAAATAGAAATAGAAAAATAGAAGTATGAGT
CTGGGTGAAATCTCAAAATTGTTAGGTTTTTATCCAAATACTTCCTATGC
TTCACCACCATCTTTTGCTTAAATTATTGATCGCACTGGATTTAAATTTC
AAAATATAATGGAGGTATATCCAACCCTTTCCTTTGAGTTCCGGGAGTGT
ATTATTATCTCCCTAGTCTTAAAAGCAGATTTCGCATTTGAAAAGATGGG
TCCTATCATAAAATCATAGAGGGCACCCCCCCCTGGATTATGGGGGGTTG
AAGATTTTCAGATTTTTAAAAATAGGTGTGTGTTGGGTTGATGAGAAATT
TCAGGTGGGGGTAACCCTATGTAGGTGGGGGTAACATTTTTCAGGTGGGG
GTTGTCAAGTTTTCTGTATTTAACTTCATTTGATTTTGTACTTGTTTGTC
TTTTTCAACTTTCAACATACTATACTAGATAAAAATATAAACAAATGACT
GTCATAAGTTCTGAAGGTTAAAAAGAGTTCATTTTTTCTCCATTCTTTTC
CTTTCCAGTTTGTAGTCCTCAGGACTTTTAACTGGGATCTTTAGTGTTCC
TAAAAGGAACAAGACCTCCAAATTCGAAGGTGTGATTCGATTGCGCCATT
TTGCGCATATGAGTTGGAGTATGGTGTAGCCCCTTTCTACCAGCGAGGTG
TTGCTGAAAAAGGTGGGGGTTGGGCTGATATGAGATTTCAGGTGGGGGTA
ACCCTACGTAGGTGGGGGTTGGAGGGGTGTTGCCCACTATGAAAATCCAA
AAGTGAAGATAAACAGCTGACTGATTTGCTGTGTCTGGATTTCAATGATA
AGGGCCCTCTATTTTCTTTTTCTAATGCGGTATCTTATCTATACCTATCT
AATAGCTTTTATGGCTAGGGAGATAATAATACATTCCCGCAACCTATAGG
AAAGGGTTCGATATCATCTTCGTTATATTTTGAAAATCAATTCTTGTGCG
ATCAATAATTAAGCAAAAGATGTGGGGTGAAGCAACAGAAATAATTGGAT
ATAAATCTAAAAATTTAGTGACCTGTCTCAAAAGATTCATCAAAGTAAGA
GATTATCAGTTTGCAGGAAGACAAGAACATTGATTGATACATACCACTTG
ATACCTTTTTTGTTTGTTAAATAAAATTCAGCAAATTGAGTTGGCTGGCT
TTGGTTTTTGATTTTGTCTAATTAAAAAATCATAATTTTTTAGCGATAGC
AACTCTGATTGGACTCGAGTACAACCCACTTGTTATTGTTAGTGGATTAT
TTTTGTCCATTTTCCATAAAATTAGTCCTCACAAAAAATTGTAATATTTT
GGCTAAAAACCCTAGGGAAGTAATAGTACGGTCTAGTTGTGCAAATATTG
TGCACAAAGGCGTAAAAGCATGAAACTTTGCACAATGGTAGTTTAGGGGT
CAAAAATGGATTTAAATCTCAGACCCAAAAAATTGACACCTGTTTGTGTA
TTTTACAGACCAGAATAGGTTTCCAGGCTAAAATGAAAATCTTTTTCTCC
AAAGTATGTCATGTTACATATCGTTGGAAAGCATGTTTCATGCCCGTTCA
GAAAAACATTACAACCTATATCTGAAAATGAAGCCAATAAAAGTTATTGG
GGAAGGTTGTTTGAAAAATGACCGAAAATGACATAATTGCTGACGTCAGC
AAAAATTCCAGGACCACGCAGACACGTTTATTTTTGTGAAATTCAATAGA
GGATCTTTCAATGACCAAATGGATAGCTTTGCTTGAGAGTTAACCTCACT
TGACATAGAATATGGCGTTTTCATGACCGGTCGAAAGCCTTAGGCTAAAG
GGTTTGCACCGGGCATGCCCATGGTAGAGCATTACTAAGGCAAAATTTGT
CAACCTAACAATACTCAAAAAAACTATTGTAAAATAAGCTTGCAGCTGAT
CTAACTAATAGTATTTAGTACCTTAGAGGTACTCTATTGAATTTCACAAA
AATAAACACGTTTGGGTGGTCCTGGAGTTTTTGCTGACATCAGCAATTAC
GTCATTTTCGGTCATTTTTCAAACAACCTTCCCCAATAACTTTTATTGGC
TTGATTTTCAGATATGGGTTGTAATGTTTTTCTGAACGGGCATGAAACAT
GCTTTCCAACGGTATGTAACATGACATACTTTGGAGAAAAGAATTTTCAT
TTTAGCCTGGAAACCTATTCTGGTCTGTAAAATACACAAACAGGTGCCAT
TTTTTTGGGTCTGAGATTTAAATCCATTTTTGACCCCTAAACTACCATTG
TGCAAAGTTTCATGCTTTTACGCCCTTGTGCACAATGTTTATGACTTTTG
GCACATTTAGACTGCACTATAAAAGTAATTGGGTGAAAAAGAGACAAATT
TGAAAATTAGTCTTGATTTACAATAAAAATCGTCCACTCGAAAATGAATT
CACTTAATGTAATAGGATTGTCAGCCTTGATAACACAGTATCCTAGATTG
ATCTCTTATATCAATCACATCTGATTGAGTGCCTGGTCAATTTGATGGAT
TTGTGGCTGAATTCAAATTTATTGTTGCCAAGCTATAAATACCCTCCAGT
CTTCAGTTCTTTGCAGCATTTTTTGTTTTGTATAATGAAGAAATCGTTTT
TCTCTCACCCTGACTTTTAAATAGTAGGTTGTTTCAGATTTATTCTGCGC
ACATCCCCAGAATTGATTTTGGTATAGAGCTGTATTTTGTGTATGAAATT
CCTGTCTGAGAGTTTTGGTTTGGTAAAAGAAGGTGATAAGCCTGGATTTT
AGAAGGAAATTGGATCTTGAATTGAAAGGTACAGCACTGTTTGGTCTGAA
AAATTTAATGTATTTATAATGCAGAAAATGTCTTCCTTTGTTGTTTAATT
GTTGTAGCCATATGCTTTGCTCGAAACATAAATCAGAACAAAAGTCTATT
GGGAAAAGTACACATTTTGATGCCTCGGTAATAATACTGTTGTGTTGTTC
TTTGATTCAGTGTCTTACTGAAACATAGAATATTCACCAGTGTACTATTC
CCTAAATATAACTGGAGTATCATAGTGCGGTTAGCTGATCCAAGCCAGCT
CTCAGTCTCCATAAGCTCCAACAGACATCACAATTGTTTAATATTGTTAA
AAAATATTTTCACATGTTTTTTGAATCATGATTTCAATATGATCAGTCTT
GAACATCTTGAGGAAGATAAACTTCATGTTGGGGTAGGATGGTTCACTCA
ATGATTCATTCTTCATTGATAACATGAAGATAATGCTTATCTTTCAGTAC
AGTATATGGCCCCCAAAACGGAGACTGACCCGAAACGAAATAAAGAAAGA
TGTTGAAGTTTAGCGTGCAGCAAAAATTTTTATAAAACCTCTTCCTCTAG
ATTTGAGAGAAATTTTAAATTTGATCAACGTTTTCGGGGCCACATACTGT
AGATACTTTAAGAATTTCTGTCTGAAATGGAATATCTTGACTTTAAAGTT
TGGGTTCGATACTTGTTTTAATTCCTTGGTCCACTCTCGGTATTGATACA
ATGATGATAGCATGTCTCGTTCGTATGATATATTTGATTATAAAACAAAC
GGAACACTGAGTATCAATGTTAATTCGTATCATTGCTTGATTATTTGTAA
AGTTGTTAAGATGTGAGCATGCTGAAGATTCATTGAGTTTACTTAGAATC
ATTTACAAGTGACGTCTGTTTGTTTAGAAATAGGTTGGTTTGAATAAACT
CGATGCAAAGATGACAACATGTCTCGTTCGTATGATCAACTTGATTATAA
ACCAAACGGAACACTGAGTATCAAAAACTCTCTTAACTGCATTCAGAATA
AAGCCCAACCCTAAGTTGATTTTGACTCCTTTGTAGGCTTTATGTAAAAG
TTGTCCCGGTCAGAGTCATTGCTTTGGAGTTTTCTGTCCAGATTTTCTAT
GAATATTAGGAACAAATCTCCTGTCAGAACTTACAGTTCAAATAAACTTG
ATGCAAGGATGACAACATGTCTCGTTCGTATGATCTACTTGATTATAAAC
CAAACGGAACACTGAGTATCAAAAACTGTCTTAACTGCATTCAGAATAAA
GCCTAACCCTAAGTTGATTTTGACTCCTTTGTAGGCTTTATGTAAAAGTT
GTCCCGGTCAGAGTCATTGCTTTGGAGTTTTCTGTCCAGATTTTCTATGA
ATATTAGGAACAAATCTCCTGTCAGAACTTACAGTTCAAATAAACTTGAT
GCAAAGATGACAACATGTCTCGTTCGTATGATTTAATTGATTATAAACCA
AACGGAACACTGAGCATCATAAAACGTCTTAACTACATTCAGAATAAAGG
CTGAGTAGATTCTTATTCCTAGATAGGCTTTGTAACGGTCTGTCCTGGTT
AAGAGCTATTTCTTTGAAGTATTCAGACCAGTTTTTCAACGAATATTAGG
AACAAATCTCCTGTCAGAACTTACAGTTCAAATAAACTTGATGCAAAGAT
GACAACATGTCTCGTTCGTATGATTTAATTGATTATAAAACTAACGGAAC
ACTGAGCATCATCGGTTGGTGAATCGTCATTGTAAATAGTACGAGTTAAG
ATTTTAAACATTGGTATTTAATTTAAAAAGGGGGTTTGAGACCCCTTCGC
ACGGTATGCGTCCATCTCTTTTTTTGTGTTGTACCTAAAGGGAACTTTTT
TTGGCGGGCAGCAAATATCCATTAAAAAAAATTATTTTGGCAAATAGTGA
ATTTTTTTAATTTTGGCGGGAACTAATTTTGGCGAATGACAGCGTAAATT
TGTTCAATTTTGCCTTATTTTGAGATATTTTGAATTTCAGGGGTAATTTA
GGTAAGGAAAAAAAATTACCTAAATTCGCCAAATCCGCCAAAATTAGTTC
CCTTAAGGTAGTCAGTCACAAGTGTAGAGCTTGAATATTTGATTGTATGT
AAAGCAGAATCTAGGATAGTTTTGAAGTTTTCTACATTTTCTGTAGTGCT
TTATTTGAGTTTGACTTGAACATTTATGAAACGTTTTATTTTCTCCATGC
AATGATGATCATCCCCGTCACATGAAACTCTCTGTTCTGTGTTGCAATAT
TTTCAAAAATTTGCGACTGAACAAGGATAGTTTGTGATTTAGAAAGAGCG
TGATCTGAGCTTAAATGAATATGCTTCTTACATGTTGAGCAAATTTACGA
TTGCTATTGAAAATTTTATCATTTACTTTACAGGAAGCTGAACTTGCTGT
TGCGGCCCAACTCCAAGGACCAGTTCTTCCCATCATCCAAAGCAAACCAG
TCAACAAAGCTCGTGTTATCACCGACGAAGAGAAGAAATTATCCGTCTTC
CGTACCATGCGTGTTGCTCGTGCTAATGCTCGTCTTATCGGTATCCGTGC
TAAACGTGCACGTGAAGCTGAAGCCGAGGCTGCAATGAAAGCTAAGAAAT
AA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:1063784..1071335- >XLOC_039014 ID=XLOC_039014|Name=XLOC_039014|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1266bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:1063784..1071335- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAGCACAATAACGTTTTGCCAAATTCCCACTACCATAAACATTGGCA AAATTACGTCAGGACATGGTTCAACCAACCAGGCCGTAAGAAGAGAAGAA GAGTTGCCCGTCAAAAGAGGGCCTTAGCCATTGCACCTCGACCAGTTGCT GGTGACCTCAGACCAGTTGTTAGATGCCCAACATTCAAATACAATACCAA AGTTAGAATGGGACGTGGATTTACTTTGGAAGAATTAAAAGCTGCTGGTA TTGCAGCCAACAAAGCTAGAACCATTGGCATTTGTGTCGATCATCGAAGA AAGAACAAGTGCACTGAATCCCTTCAAGCCAATGTTCAAAGATTGAAGGA ATATCAAAGCAAATTGATTGTGTTCCCACGCAAACAAAGTAAACCACGAA AGACTGATAGTGAGATGAAGCACAATAACGTTTTGCCAAATTCCCACTAC CATAAACATTGGCAAAATTACGTCAGGACATGGTTCAACCAACCAGGCCG TAAGAAGAGAAGAAGAGTTGCCCGTCAAAAGAGGGCCTTAGCCATTGCAC CTCGACCAGTTGCTGGTGACCTCAGACCAGTTGTTAGATGCCCAACATTC AAATACAATACCAAAGTTAGAATGGGACGTGGATTTACTTTGGAAGAATT AAAAGCTGCTGGTATTGCAGCCAACAAAGCTAGAACCATTGGCATTTGTG TCGATCATCGAAGAAAGAACAAGTGCACTGAATCCCTTCAAGCCAATGTT CAAAGATTGAAGGAATATCAAAGCAAATTGATTGTGTTCCCACGCAAACA AAGTAAACCACGAAAGACTGATAGTGAGGAAGCTGAACTTGCTGTTGCGG CCCAACTCCAAGGACCAGTTCTTCCCATCATCCAAAGCAAACCAGTCAAC AAAGCTCGTGTTATCACCGACGAAGAGAAGAAATTATCCGTCTTCCGTAC CATGCGTGTTGCTCGTGCTAATGCTCGTCTTATCGGTATCCGTGCTAAAC GTGCACGTGAAGCTGAAGCCGAGGCTGCAATGAAAGCTAAGAAATAAGAA GCTGAACTTGCTGTTGCGGCCCAACTCCAAGGACCAGTTCTTCCCATCAT CCAAAGCAAACCAGTCAACAAAGCTCGTGTTATCACCGACGAAGAGAAGA AATTATCCGTCTTCCGTACCATGCGTGTTGCTCGTGCTAATGCTCGTCTT ATCGGTATCCGTGCTAAACGTGCACGTGAAGCTGAAGCCGAGGCTGCAAT GAAAGCTAAGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000019_pilon | genome | sc0000019_pilon:1063784..1071335 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 415-633:220 |
| Aaloc | 1-414:7553 |
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