XLOC_039014 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039014
Unique NameXLOC_039014
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000019_pilon:1063784..1071335-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039014 ID=XLOC_039014|Name=XLOC_039014|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7552bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:1063784..1071335- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGCACAATAACGTTTTGCCAAATTCCCACTACCATAAACATTGGCA AAATTACGTCAGGACATGGTTCAACCAACCAGGCCGTAAGAAGAGAAGAA GAGTTGCCCGTCAAAAGAGGGCCTTAGCCATTGCACCTCGACCAGTTGCT GGTGACCTCAGACCAGTTGTTAGATGCCCAACATTCAAATACAATACCAA AGTTAGAATGGGACGTGGATTTACTTTGGAAGAATTAAAAGCTGCTGGTA TTGCAGCCAACAAAGCTAGAACCATTGGCATTTGTGTCGATCATCGAAGA AAGAACAAGTGCACTGAATCCCTTCAAGCCAATGTTCAAAGATTGAAGGA ATATCAAAGCAAATTGATTGTGTTCCCACGCAAACAAAGTAAACCACGAA AGACTGATAGTGAGGTAAGAAATTACTTTGATGGCTTCATTGATTAAGTT TGTTTTACTTGGTTATGGATTTGGTTGGTTTACATGTGTGGAGTGCTTGT TAATTTGGGTGCATGTCGCTAGTCCGACACTTTCTAGTCCGACAGTAAAA TAGTCCGAATCTATAAAATAAATTTACAATTTGGAAGTCTTTTTATCCGA CGTCACTTTTGTTCGAAAAAACGAAAGATTTTAGAGTGCCGAATGTTGAA TAAGGGTTTTTCACTGAGATAATAATAATATAATAAAAGTTCATTTTGGC GGCATTTTGACATAATGAGAAATAAAGGACCAACCAAGTTTGCGTAAAGA TAATTTATAGCAAAAAGAATGCACCGCCTTTAAGGGTCCCTTTTTGCGTG CTCAGAATTATGCTATTATATAGGTTGTAAATCACAAAAGAAGGGTCGTA AAAACAGCTAAATCCAATTTCTTGACTCTTGAAAGCCTAATATTTATAAG CTTCCCGAAACTTAAGAAAAGTCGGCTTTAAGGGCCTAACCTCAAAGTCG GAACTTTGAATTTTTATAAAAGATGTGCCTCCTCTTCCGCGATTCATATT TCGTTTTTTATATGTTCTTTTTTTACTCGTTGTAGGACAAAATTTTTGTC GAAATACTGACGCATTCGTCAAATCCAACGTCGGACATTTTTACTGTCGG ACTAGAAAATGTCGGACTACTGACGACCTCCCGTTAATTTTGTTGGTTGT TGGATTTTATAAAGAGTTTCCGATAGATTAAGGCCATAATAACAATATAG CTTGTGATTGAGCAGTTCTTAGGTGAGTTGGTTAACGAAAAATCGTCAGA AAAATGAATACACCTTTCCCTTAATTCGTAAAACTAATGCACCCGCATTA TTTTGATGCTCTCCATCATTTAGACTCTGGAGGTAAACAAACCTGTTTAA ATTTCTGTTGAACAAAATCCCTGCAAATTTTAGTATGTTCAATCTATTCA TACAGTAAATCCTCAGGCGCTTATTTAATTTTTCAGGCTCTAAGGGGGCG CTTATTTTTTTATTTTAGAAATTCGCATATAAACAAATTCGGAAGCTATT TAAACTCAACTGTTTCAAAGAGTTGGATTTTCAAAAAAGGATGAATAAAA GAAAAATTGGAAAAATCCAATTGACAATTTCTATCATTTTATTCTTAATT GCTTTCTTTCTTTTGAAGACATAAGTATCTGCTTAATATCTTATTCAATC AATAACAATATTCGAATAAGTTTGAGCGGGGCGCTTATTCAAGGATTTAT GGTAATATTATACCACCCTGAAAATATTTTGCCAAAAGAAGATCGCTATC AAAAGTATAAAGCTGAAAACCCACTTTCCCTAACACCTTGCAGGCCAAAA CGCATTCATTTACCTCCCAAACAGTTTTATACACACAGTGGAGCGCACAT TTTCCCAGGCCACTTCTGCAAAGTTTACGGGAAAGGTGTATTTAAGTCGG TGCCGTGGTATAGTGGTAGTCGACCTTGGCTTCTGTGCTGGAGGCCAGGG TTCGATTCCCACTCACGACAGTTCACTTGGCAAGTGAACATTCCTTCGCC CGGGTCAACCCATGCCATGTGAGGGGAATTGGGTAGTCAGTTCAAGGTCC TGACGGGACGCTCATTAGTAAGCGTCTATAGTTGCGAGAATAGGCCTCTA AAGCCTCCTGCAACTCAACCAAATAGAAATAGAAAAATAGAAGTATGAGT CTGGGTGAAATCTCAAAATTGTTAGGTTTTTATCCAAATACTTCCTATGC TTCACCACCATCTTTTGCTTAAATTATTGATCGCACTGGATTTAAATTTC AAAATATAATGGAGGTATATCCAACCCTTTCCTTTGAGTTCCGGGAGTGT ATTATTATCTCCCTAGTCTTAAAAGCAGATTTCGCATTTGAAAAGATGGG TCCTATCATAAAATCATAGAGGGCACCCCCCCCTGGATTATGGGGGGTTG AAGATTTTCAGATTTTTAAAAATAGGTGTGTGTTGGGTTGATGAGAAATT TCAGGTGGGGGTAACCCTATGTAGGTGGGGGTAACATTTTTCAGGTGGGG GTTGTCAAGTTTTCTGTATTTAACTTCATTTGATTTTGTACTTGTTTGTC TTTTTCAACTTTCAACATACTATACTAGATAAAAATATAAACAAATGACT GTCATAAGTTCTGAAGGTTAAAAAGAGTTCATTTTTTCTCCATTCTTTTC CTTTCCAGTTTGTAGTCCTCAGGACTTTTAACTGGGATCTTTAGTGTTCC TAAAAGGAACAAGACCTCCAAATTCGAAGGTGTGATTCGATTGCGCCATT TTGCGCATATGAGTTGGAGTATGGTGTAGCCCCTTTCTACCAGCGAGGTG TTGCTGAAAAAGGTGGGGGTTGGGCTGATATGAGATTTCAGGTGGGGGTA ACCCTACGTAGGTGGGGGTTGGAGGGGTGTTGCCCACTATGAAAATCCAA AAGTGAAGATAAACAGCTGACTGATTTGCTGTGTCTGGATTTCAATGATA AGGGCCCTCTATTTTCTTTTTCTAATGCGGTATCTTATCTATACCTATCT AATAGCTTTTATGGCTAGGGAGATAATAATACATTCCCGCAACCTATAGG AAAGGGTTCGATATCATCTTCGTTATATTTTGAAAATCAATTCTTGTGCG ATCAATAATTAAGCAAAAGATGTGGGGTGAAGCAACAGAAATAATTGGAT ATAAATCTAAAAATTTAGTGACCTGTCTCAAAAGATTCATCAAAGTAAGA GATTATCAGTTTGCAGGAAGACAAGAACATTGATTGATACATACCACTTG ATACCTTTTTTGTTTGTTAAATAAAATTCAGCAAATTGAGTTGGCTGGCT TTGGTTTTTGATTTTGTCTAATTAAAAAATCATAATTTTTTAGCGATAGC AACTCTGATTGGACTCGAGTACAACCCACTTGTTATTGTTAGTGGATTAT TTTTGTCCATTTTCCATAAAATTAGTCCTCACAAAAAATTGTAATATTTT GGCTAAAAACCCTAGGGAAGTAATAGTACGGTCTAGTTGTGCAAATATTG TGCACAAAGGCGTAAAAGCATGAAACTTTGCACAATGGTAGTTTAGGGGT CAAAAATGGATTTAAATCTCAGACCCAAAAAATTGACACCTGTTTGTGTA TTTTACAGACCAGAATAGGTTTCCAGGCTAAAATGAAAATCTTTTTCTCC AAAGTATGTCATGTTACATATCGTTGGAAAGCATGTTTCATGCCCGTTCA GAAAAACATTACAACCTATATCTGAAAATGAAGCCAATAAAAGTTATTGG GGAAGGTTGTTTGAAAAATGACCGAAAATGACATAATTGCTGACGTCAGC AAAAATTCCAGGACCACGCAGACACGTTTATTTTTGTGAAATTCAATAGA GGATCTTTCAATGACCAAATGGATAGCTTTGCTTGAGAGTTAACCTCACT TGACATAGAATATGGCGTTTTCATGACCGGTCGAAAGCCTTAGGCTAAAG GGTTTGCACCGGGCATGCCCATGGTAGAGCATTACTAAGGCAAAATTTGT CAACCTAACAATACTCAAAAAAACTATTGTAAAATAAGCTTGCAGCTGAT CTAACTAATAGTATTTAGTACCTTAGAGGTACTCTATTGAATTTCACAAA AATAAACACGTTTGGGTGGTCCTGGAGTTTTTGCTGACATCAGCAATTAC GTCATTTTCGGTCATTTTTCAAACAACCTTCCCCAATAACTTTTATTGGC TTGATTTTCAGATATGGGTTGTAATGTTTTTCTGAACGGGCATGAAACAT GCTTTCCAACGGTATGTAACATGACATACTTTGGAGAAAAGAATTTTCAT TTTAGCCTGGAAACCTATTCTGGTCTGTAAAATACACAAACAGGTGCCAT TTTTTTGGGTCTGAGATTTAAATCCATTTTTGACCCCTAAACTACCATTG TGCAAAGTTTCATGCTTTTACGCCCTTGTGCACAATGTTTATGACTTTTG GCACATTTAGACTGCACTATAAAAGTAATTGGGTGAAAAAGAGACAAATT TGAAAATTAGTCTTGATTTACAATAAAAATCGTCCACTCGAAAATGAATT CACTTAATGTAATAGGATTGTCAGCCTTGATAACACAGTATCCTAGATTG ATCTCTTATATCAATCACATCTGATTGAGTGCCTGGTCAATTTGATGGAT TTGTGGCTGAATTCAAATTTATTGTTGCCAAGCTATAAATACCCTCCAGT CTTCAGTTCTTTGCAGCATTTTTTGTTTTGTATAATGAAGAAATCGTTTT TCTCTCACCCTGACTTTTAAATAGTAGGTTGTTTCAGATTTATTCTGCGC ACATCCCCAGAATTGATTTTGGTATAGAGCTGTATTTTGTGTATGAAATT CCTGTCTGAGAGTTTTGGTTTGGTAAAAGAAGGTGATAAGCCTGGATTTT AGAAGGAAATTGGATCTTGAATTGAAAGGTACAGCACTGTTTGGTCTGAA AAATTTAATGTATTTATAATGCAGAAAATGTCTTCCTTTGTTGTTTAATT GTTGTAGCCATATGCTTTGCTCGAAACATAAATCAGAACAAAAGTCTATT GGGAAAAGTACACATTTTGATGCCTCGGTAATAATACTGTTGTGTTGTTC TTTGATTCAGTGTCTTACTGAAACATAGAATATTCACCAGTGTACTATTC CCTAAATATAACTGGAGTATCATAGTGCGGTTAGCTGATCCAAGCCAGCT CTCAGTCTCCATAAGCTCCAACAGACATCACAATTGTTTAATATTGTTAA AAAATATTTTCACATGTTTTTTGAATCATGATTTCAATATGATCAGTCTT GAACATCTTGAGGAAGATAAACTTCATGTTGGGGTAGGATGGTTCACTCA ATGATTCATTCTTCATTGATAACATGAAGATAATGCTTATCTTTCAGTAC AGTATATGGCCCCCAAAACGGAGACTGACCCGAAACGAAATAAAGAAAGA TGTTGAAGTTTAGCGTGCAGCAAAAATTTTTATAAAACCTCTTCCTCTAG ATTTGAGAGAAATTTTAAATTTGATCAACGTTTTCGGGGCCACATACTGT AGATACTTTAAGAATTTCTGTCTGAAATGGAATATCTTGACTTTAAAGTT TGGGTTCGATACTTGTTTTAATTCCTTGGTCCACTCTCGGTATTGATACA ATGATGATAGCATGTCTCGTTCGTATGATATATTTGATTATAAAACAAAC GGAACACTGAGTATCAATGTTAATTCGTATCATTGCTTGATTATTTGTAA AGTTGTTAAGATGTGAGCATGCTGAAGATTCATTGAGTTTACTTAGAATC ATTTACAAGTGACGTCTGTTTGTTTAGAAATAGGTTGGTTTGAATAAACT CGATGCAAAGATGACAACATGTCTCGTTCGTATGATCAACTTGATTATAA ACCAAACGGAACACTGAGTATCAAAAACTCTCTTAACTGCATTCAGAATA AAGCCCAACCCTAAGTTGATTTTGACTCCTTTGTAGGCTTTATGTAAAAG TTGTCCCGGTCAGAGTCATTGCTTTGGAGTTTTCTGTCCAGATTTTCTAT GAATATTAGGAACAAATCTCCTGTCAGAACTTACAGTTCAAATAAACTTG ATGCAAGGATGACAACATGTCTCGTTCGTATGATCTACTTGATTATAAAC CAAACGGAACACTGAGTATCAAAAACTGTCTTAACTGCATTCAGAATAAA GCCTAACCCTAAGTTGATTTTGACTCCTTTGTAGGCTTTATGTAAAAGTT GTCCCGGTCAGAGTCATTGCTTTGGAGTTTTCTGTCCAGATTTTCTATGA ATATTAGGAACAAATCTCCTGTCAGAACTTACAGTTCAAATAAACTTGAT GCAAAGATGACAACATGTCTCGTTCGTATGATTTAATTGATTATAAACCA AACGGAACACTGAGCATCATAAAACGTCTTAACTACATTCAGAATAAAGG CTGAGTAGATTCTTATTCCTAGATAGGCTTTGTAACGGTCTGTCCTGGTT AAGAGCTATTTCTTTGAAGTATTCAGACCAGTTTTTCAACGAATATTAGG AACAAATCTCCTGTCAGAACTTACAGTTCAAATAAACTTGATGCAAAGAT GACAACATGTCTCGTTCGTATGATTTAATTGATTATAAAACTAACGGAAC ACTGAGCATCATCGGTTGGTGAATCGTCATTGTAAATAGTACGAGTTAAG ATTTTAAACATTGGTATTTAATTTAAAAAGGGGGTTTGAGACCCCTTCGC ACGGTATGCGTCCATCTCTTTTTTTGTGTTGTACCTAAAGGGAACTTTTT TTGGCGGGCAGCAAATATCCATTAAAAAAAATTATTTTGGCAAATAGTGA ATTTTTTTAATTTTGGCGGGAACTAATTTTGGCGAATGACAGCGTAAATT TGTTCAATTTTGCCTTATTTTGAGATATTTTGAATTTCAGGGGTAATTTA GGTAAGGAAAAAAAATTACCTAAATTCGCCAAATCCGCCAAAATTAGTTC CCTTAAGGTAGTCAGTCACAAGTGTAGAGCTTGAATATTTGATTGTATGT AAAGCAGAATCTAGGATAGTTTTGAAGTTTTCTACATTTTCTGTAGTGCT TTATTTGAGTTTGACTTGAACATTTATGAAACGTTTTATTTTCTCCATGC AATGATGATCATCCCCGTCACATGAAACTCTCTGTTCTGTGTTGCAATAT TTTCAAAAATTTGCGACTGAACAAGGATAGTTTGTGATTTAGAAAGAGCG TGATCTGAGCTTAAATGAATATGCTTCTTACATGTTGAGCAAATTTACGA TTGCTATTGAAAATTTTATCATTTACTTTACAGGAAGCTGAACTTGCTGT TGCGGCCCAACTCCAAGGACCAGTTCTTCCCATCATCCAAAGCAAACCAG TCAACAAAGCTCGTGTTATCACCGACGAAGAGAAGAAATTATCCGTCTTC CGTACCATGCGTGTTGCTCGTGCTAATGCTCGTCTTATCGGTATCCGTGC TAAACGTGCACGTGAAGCTGAAGCCGAGGCTGCAATGAAAGCTAAGAAAT AA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:1063784..1071335-

>XLOC_039014 ID=XLOC_039014|Name=XLOC_039014|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1266bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:1063784..1071335- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGCACAATAACGTTTTGCCAAATTCCCACTACCATAAACATTGGCA
AAATTACGTCAGGACATGGTTCAACCAACCAGGCCGTAAGAAGAGAAGAA
GAGTTGCCCGTCAAAAGAGGGCCTTAGCCATTGCACCTCGACCAGTTGCT
GGTGACCTCAGACCAGTTGTTAGATGCCCAACATTCAAATACAATACCAA
AGTTAGAATGGGACGTGGATTTACTTTGGAAGAATTAAAAGCTGCTGGTA
TTGCAGCCAACAAAGCTAGAACCATTGGCATTTGTGTCGATCATCGAAGA
AAGAACAAGTGCACTGAATCCCTTCAAGCCAATGTTCAAAGATTGAAGGA
ATATCAAAGCAAATTGATTGTGTTCCCACGCAAACAAAGTAAACCACGAA
AGACTGATAGTGAGATGAAGCACAATAACGTTTTGCCAAATTCCCACTAC
CATAAACATTGGCAAAATTACGTCAGGACATGGTTCAACCAACCAGGCCG
TAAGAAGAGAAGAAGAGTTGCCCGTCAAAAGAGGGCCTTAGCCATTGCAC
CTCGACCAGTTGCTGGTGACCTCAGACCAGTTGTTAGATGCCCAACATTC
AAATACAATACCAAAGTTAGAATGGGACGTGGATTTACTTTGGAAGAATT
AAAAGCTGCTGGTATTGCAGCCAACAAAGCTAGAACCATTGGCATTTGTG
TCGATCATCGAAGAAAGAACAAGTGCACTGAATCCCTTCAAGCCAATGTT
CAAAGATTGAAGGAATATCAAAGCAAATTGATTGTGTTCCCACGCAAACA
AAGTAAACCACGAAAGACTGATAGTGAGGAAGCTGAACTTGCTGTTGCGG
CCCAACTCCAAGGACCAGTTCTTCCCATCATCCAAAGCAAACCAGTCAAC
AAAGCTCGTGTTATCACCGACGAAGAGAAGAAATTATCCGTCTTCCGTAC
CATGCGTGTTGCTCGTGCTAATGCTCGTCTTATCGGTATCCGTGCTAAAC
GTGCACGTGAAGCTGAAGCCGAGGCTGCAATGAAAGCTAAGAAATAAGAA
GCTGAACTTGCTGTTGCGGCCCAACTCCAAGGACCAGTTCTTCCCATCAT
CCAAAGCAAACCAGTCAACAAAGCTCGTGTTATCACCGACGAAGAGAAGA
AATTATCCGTCTTCCGTACCATGCGTGTTGCTCGTGCTAATGCTCGTCTT
ATCGGTATCCGTGCTAAACGTGCACGTGAAGCTGAAGCCGAGGCTGCAAT
GAAAGCTAAGAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039014XLOC_039014-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000019_pilongenomesc0000019_pilon:1063784..1071335 -
Properties
Property NameValue
Aaloc415-633:220
Aaloc1-414:7553