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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000005_pilon:675247..680587+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038894 ID=XLOC_038894|Name=XLOC_038894|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5341bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:675247..680587+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttatttatttatttagaaaattaaaaaaaattgtaataaaatggattt
gaatttgaatgtgtTGGAAGGCTTGAAACTTGTTGGAGACATTGTAAATG
TTCCTGATAAACCGTTTGAATCACTTGTTAACTTGACATACTCATGTCTA
TCGAACAAAGAACCAATAGAGCCCAATGAGTTTAGTAAGCACAacttttg
ttttagttcttaaCAATTATCATATGATCAACTATGAAACTGTCAAAAAT
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ttcctcagtttTCCCAGACCCCCTTTCCCTTTGAGATGATGAAATGATCC
ATTTTCATACTTTACTTGCAGATTCTCTACAGGGAGTAGACTCGTCTGTT
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AATAGTTACTCTCtttgaacttcattttttctttgtacTCTAAAAGGGTG
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TGGATTTCTCACACCCCCATTAGGGTCTGCTTAAAACGGCCATTTTCTTT
TGGTGATATGGATTACGCGAATTGTTATATAGTGGACTCTCGCTAACCTT
CATTAATCAaaatacactcatttttttataagcataacgtttataagcat
aactgaagctcaaatttccagaaaaattaagcatatgctaagcatacctt
gaggctcagccaaagaaatatttagaatcataatttccaaaagttcataa
aaaaaaaagaagaatgaagaagagaattggtgattttattctgtttaatc
tcttataaataacacaacttataataacaacaacattcgaaaacaattaa
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tttacccccccccccttccttcataatttttttatcaagcatagggttaa
gcataagtcgaggctcaaaattgagctttacttaagcatagtgagcttca
gccgaaatttaccgtatgcttataaaacaaaatgagtgtagaCAAAAATA
CAATAAAGAACAAAGATATATTGTTCGATAAGATATCTTGCCATAAATGC
AAGGGAAAGCTGTTGATTTAAAAAGTACGCATAATTAGTAAATCCATgta
aatccttttttgaaataaaacatgATATTTCATATATATCTTTAGTGTAG
TGCCAAGAAAATGCTATTAGCTACTCTTTCCgcagaaaattgataaattg
tttATACATTTTTTAGGTGATTCGTAGAGAACTTCAAATGAATTTGGTTA
GGTAATTATTATCATTTGTTCCTTCTCTGAATAATTTTCGGTCATTTTAA
AAAATCCCTAATTTAGCAGTAATGAATGTGTTTTTCGCCCAAAAGAGGCT
AAAATTATTGGTTAGCCTAGAGGTAATTTATGCGTATTTGCTAATATGCA
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TTGTATGTTTGATATAAAGATTAAAAGCTTGTGGTCaaaaaaaaCGACAA
GTCACGCATGCGTGTTTCAATGCTTTCGGGCAAATTTTGCTAACAGCAAT
AATTTAAGCATCGTCGAGGCGAGATAAGACTTTGAggggggggAGTCGGG
TAAACCTCCTAATTATGCTTTTTTAGAATACAAAGTCAACGAGAAGAGAT
GCAAATCTAGTGAACATTTTTTAATAGAGGGCTAGAAACGTTTATATAGC
TTCGTTTTCTGTTTCCTTTTTGTTCGAACCACCTACTCGTAGGTTAGAAG
TCTGACGCGCCACCGACTGAActatttaaaaaacattataCAATATAGGC
ACTGGAAATagtgctttttatttttaaaacaccCTTGTCTCACACAACTT
TTTCCTCGGTGGGGGTAaagattcctattgaaatcctaatggcgatagaa
attctattgttccaaggttataAAGtcccagtgggatggttttggagtgt
aatttttaaacatggagtTTCGAGTGGGGTtgaaatcaaaaacaatttcc
cagtggggctgaaattcaagggcaTATTCCCACCAGGGATgtaatttttg
cttattttccagtggggctggggtcccagagggtttgtgacacaggggtg
ttttaaataTGGTCTCgatgtcgaaaaaaaaaacacattttttaaaCATG
TATACCTTTATTCGACAATACTGTTTCCTAAATTTTTCTATGGCTCTATT
TTTCAGATCAACAGAACATAGGTCCCCCGTGAGTTTTAAGCCCCCTCCCC
AATGATTCATGCAAATTTTGGTAGCCCCCAGAGCTTTTGACCCTCGacac
ttttaaaagtttgttccACaaaaaaaGGGCTATTTTATTTAATGTAAATT
GTGTTGCAGTTCGAAggttaagataaaatatttttcaccttCGTGAGCTT
TAATTTGAGGCCAACCATTAAGATAGATAAAGCATTCAGCCCCCAGGTTG
AATGATGAGATTTCAGCTCccccaaatatttgaaacattttaagcatttt
tgggctttttagagggtgtaaccccccccctAACTAGCAGGGGGCCTGAC
GCCATGACGGAAGCAgcctctttctttcttttttttttttattactttcg
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TTATATTTACTGTCGTCAACTATCCATTTCTTTATCCATTCTCTTGTGAC
TGCTGCTTACAGTCAAGATTCAATCAGCATCAAAAGATTTGCTTGAAGAG
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CTTATATTTTTGATGTGGATTGGCGAGTGGACTATTGTATCAAGGTGTGA
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TTGTCCGtaataatgtgatcaaaaagaGCGGTATTGGATGAACGCAATTC
TTTACAGTGTCGAGATTTCACTATTTCAATGACTTTAACGGCCAATTAAT
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GTCAACAAACTTGAGTGAAAATGCTAGAAAACCAAAAATTCTCGAATAAA
TACCACGTTTTTCTGGCCTCTGgattgaaaaaacaaattttacaaaaact
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AATCATGATCAACTTGTTCAACTTGATAATGCGATACTCCAGGATTCTCT
AAATCGAATAAAACTTTACATATTTTCTTCAGAGTAATCAAGTGGAAAAA
TTGAACGACTCAAGCTACATGGTATCATTAAAAACACAGGTAACACGTAA
CAATGGTTGTGTTGGAAACGTTtcattttctatattttaaaATGAAGGAA
TCCAGATTTTCAGGGACTGACTTATCTCTTTACTAAGAAAATATTCGGCC
TTGCATTCAAGTGCTATCATTATTAGTGGTGATTCCACTCAGTGACATCT
TTTCAATGTGATTCCATAGGCTTGGTTCACTAAAGGTTTGACATTACAAC
AGCCGTATAACAACTACGTCTTGCTTTTCTTGCAGGAACCAAATAACAAA
GAAGGAAATGTCGAATTCTTTTGCTCTGTCGACCAGCTACAGGTATTCCA
TTGCTTTTTGGTGTCAGATATTGGTATTATATAGTGATTCTTTGTTGACA
TTTTTCACTGTAAGACTGTAGAAATGCACAGTGCAAGGGGTATAGttttc
aacttcagttgagctacaatctgacaatatctgtgtgtctgtgtgtctgt
ctgtcacaaaaactttagggcagcctggagacttcaaaaatgcttggatt
tggctaaaatttggcacacttgttccttgggtgactATCTCggggtgttt
ttttattttttgaaaattttgatttttagggcctggggacaagtttttcg
ccaaaacgaggctaaaactttggggcagcctggagacttcaaaaatgttc
ggatttggctgaaatttagcacacttattccttgggtgaatatctggggg
tctacaattgggcctatgaataatttgaagccactgaagttgagcccagt
gcgttgcacacgttcgactattttgcacataaaaatcataataatCGAGA
TTGTAAGGAGATAAGCGAGCTCCCCGGAAAAATTCTCACCAAGGAAGTAG
CCTACCAGAAGTTTGCCTGTTGgaatcccccccccccgattGAATACGTT
TAATAAGTGTCAATGCTTCCAAACACTTGAACAGCTTCCACAAAGGCCca
caaaaatataattattatattatattataatattaACTGATACAAGAACG
GCGAGAAACAGAAACTAAGTGCTCAGGCTGTGGGCGGAAATTCGTCAAGT
TGAGACTTTTCTGTTAGATTTTTCTGTTAGATTTTCGTTCAATTTCGTAA
ACATTTTAGAATTATTACGTATTGAATAAAATAGATTCACCTTTGGGTTT
GAAGAGATTGATAGGATATTTTTGTGAATAAAGTCTTAAATTTTTAGtca
caaaaaaataacactTGGTTAAAACCTTTAGGATTTAGTTTCAAAGCTGA
AAGATGCGAGTAAAACTTTGGAAAAAGCAAgccaaggttaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000005_pilon:675247..680587+ >XLOC_038894 ID=XLOC_038894|Name=XLOC_038894|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1248bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005_pilon:675247..680587+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttttatttatttatttagaaaattaaaaaaaattgtaataaaatggattt
gaatttgaatgtgtTGGAAGGCTTGAAACTTGTTGGAGACATTGTAAATG
TTCCTGATAAACCGTTTGAATCACTTGTTAACTTGACATACTCATGTCTA
TCGAACAAAGAACCAATAGAGCCCAATGAGTTTAttttatttatttattt
agaaaattaaaaaaaattgtaataaaatggatttgaatttgaatgtgtTG
GAAGGCTTGAAACTTGTTGGAGACATTGTAAATGTTCCTGATAAACCGTT
TGAATCACTTGTTAACTTGACATACTCATGTCTATCGAACAAAGAACCAA
TAGAGCCCAATGAGTTTAATTCTCTACAGGGAGTAGACTCGTCTGTTGCA
AAACAAGCTTTCTATGGATTGAACACATTGATTGTTGAGGCAGCCAGAAA
GAACATAGAAGAAGCTGAAATAAGATTCTCTACAGGGAGTAGACTCGTCT
GTTGCAAAACAAGCTTTCTATGGATTGAACACATTGATTGTTGAGGCAGC
CAGAAAGAACATAGAAGAAGCTGAAATAAGGTCACTGTTAGAAGAATGTA
AGTGGCCTAATGATAGACAAGACCCACTTTTAGACAAAATCAAGGTCACT
GTTAGAAGAATGTAAGTGGCCTAATGATAGACAAGACCCACTTTTAGACA
AAATCAAGGTGATTCGTAGAGAACTTCAAATGAATTTGGTTAGGTGATTC
GTAGAGAACTTCAAATGAATTTGGTTAGgaCCGATTCTTCGTACCCTTAT
ATTTTTGATGTGGATTGGCGAGTGGACTATTGTATCAAGgaCCGATTCTT
CGTACCCTTATATTTTTGATGTGGATTGGCGAGTGGACTATTGTATCAAG
AGTAATCAAGTGGAAAAATTGAACGACTCAAGCTACATGGTATCATTAAA
AACACAGAGTAATCAAGTGGAAAAATTGAACGACTCAAGCTACATGGTAT
CATTAAAAACACAGGAACCAAATAACAAAGAAGGAAATGTCGAATTCTTT
TGCTCTGTCGACCAGCTACAGGAACCAAATAACAAAGAAGGAAATGTCGA
ATTCTTTTGCTCTGTCGACCAGCTACAGGATTTAGTTTCAAAGCTGAAAG
ATGCGAGTAAAACTTTGGAAAAAGCAAgccaaggttaaGATTTAGTTTCA
AAGCTGAAAGATGCGAGTAAAACTTTGGAAAAAGCAAgccaaggttaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000005_pilon | genome | sc0000005_pilon:675247..680587 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 565-624:5282 |
| Aaloc | 508-564:4286 |
| Aaloc | 451-507:3983 |
| Aaloc | 391-450:3435 |
| Aaloc | 355-387:1867 |
| Aaloc | 292-354:1023 |
| Aaloc | 187-288:374 |
| Aaloc | 1-183:1 |
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