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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000068_pilon:679753..685557- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038803 ID=XLOC_038803|Name=XLOC_038803|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5805bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000068_pilon:679753..685557- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACGATAAAAAAACTATTGGTATTGTTGATTATGTGATATTTGGAGC
TCTGCTTCTATCATCCAGTTTGGTTGGCATATATTTTGGTTACAAACACA
GGAAAAGAGTGACATCGGCAGAATATTTACTGGCTAACAAGAGTATGTCA
TGGTTCACAATTTGTATATCCTTGGTTGTGTCTTTTTTCTCTTCAGTTGG
TGTGATGGGAATCACCACTAACATATACATGACTGGTGTCACTTTTTCTC
TTCACATTTTGACCTTTCTGGTGCCTATTATTCTGAATGCAGAATTTTTC
GCACCTATTTTCAGAAGATTGGAGCTGATCAGTGTAAATCATGTAAGATA
TTATTAACTCTTAAACAAAATACCATGCATTTTGACCTACTTTTTTGTAA
GTTGAGATTATATTTAGTTTATTTCAATTTAAAAAATGTATGAGCAAATC
ACAAGGATGGGGTTAAACTTAAAACCTTAGAAAGTGCTAGGAATTCATCT
AGGTGGGAAATCATTCATTGCCAGGTGTGAATTCCCACCAGTGTTTGTTA
AATTTTTCCTGTGCTGAATGAGTTTAAATGTCCTAAATTTATGTTGTTTT
TTAAAGTTCTTGAGGCTAATTTACTAAGTTATTATTTTTTTCTTTTCAGT
ATTTGGAATTGAGGTTCTCTAGAGGAGTTCGCTTTATCGGATGTTTCCTG
TTCTTTCTGCAGTATGTAAGTGAAGTTCTTAATTAGACACAGACTTTGAG
TCTCCTGCTACACCAAATTAAAACTGACTAATTGCCAGCAAAAACGACCA
GCTTGTTGCTGGACAGACTTTGAAGTCCTTTTAAGTCCTTTTAAATCCTT
AGCTTTTGTCAGCTTCATTTTTTGTATGATTTTAATTTTATAGGTTATTT
ACCTGGCTATTGTGTTGTATGCTCCTAGTCTGGCATTAGAAACAGGTAAA
TTTGTTGCTAGACAATTGTAAGAACAATTTAGTGGGTCTCAAAAGGTCTC
CACCAGATATTTTGATACTTTCAAGCCAAGCATGCAAAATTTATAACCAA
AGAAAAAATTGAAAAACTGGCAGTAATAAGTTGTAGAAATAGAAATAGAA
ATAGAAATTAGCAAGAATTATATTCGTAAGTTGAATTTAGATTCAAAGTG
TAATATTTTGATGTCGTTTTGTTTACAGTCGCAGATGTGCCTTTGATGGC
AACCATCATCACCACTGGACTTGTTTGCACATTCTACACTACTCTGGTAA
GCTCATTTCATTTTTCAATCTACTGAATTATTTATTTACCACAAAAAAAT
ATCCTCTGCCATACACTTAACCAACTACTTTTTTAACTTTAATTTATTAA
CTGAAAAATTGCTTTCTTCAATTTACGATAACATAAGAAATTTGACCAAA
CAAATAATATTAAGCTAGATTAAAAATTATCAGGAAAAGATATCTTTCAA
TCCATCAAGCAAAACTGAAAAAATTTTAAAATGAGTACATAACTCAGAGT
TTCATGTTTCCACATTTATCAAATGGTGTGAGAATGTTGTTTTTTGTTAA
CGTCAATTTTTCAATTTTACAGTCATATATTTCTTGTTGTACATTTGATA
AATGTGGAAACATGAAATCTGAGTTATGTACTCATTTTAAAATTTTTAGT
TTTGTTTGATGGATTGAAAGATAACTTTTCCTGATAAATACATTGGCTCT
GGTTACCCATCGAGCAATCCAACATCATTGATTCGCCTAACCTAAATTAG
ATTAAAAATTATTAAAACCCGACACAATAAGAAATGATATTGCTATCTTA
CAGGGTGGAATGAGAGCGGTTATATGGACAGACGTCTTCCAATCAATGGT
CATGGTCATTGGGCTGGGAACTAGTTTGGTCATTGGTGTGATAAATATTG
GTTCATTTGAAAAGATTTATAATGTAACATCAGAATTCAAAAGATTTGAC
ATTGAGTAAGTACGGATTAAAAAAATCTTCCTTTTAGAATCGAAGGAGTA
TCTCTGATCTTTCTCATACACATGTGGTTATGTAAATTATGCAAATCAAA
ACGTGTGTGTATTCTCTGTCATAATATTTTGATTTATTTTATTACTTGCA
GTATTAATCCTGATCCAAGAGGTCATCAAACAGTATGGGGAGTCACCATT
GGAGGGACTTTCTCTATCATGGCTGCTTGGACGATTTCACAACCAACTAT
GCAGCGAGTCATTGCTGCCAGAAGCCTGGGCGATGCAAAAAAGTATGAAG
AATTTTTTTAAAGCGAAGTATTTTTTGCATGCTTTTTCTTATGGATTTAT
GTAAAAACAATCAAAACAACTATCTGCTGTTAAAATCAAAGTGACTTCTT
TCACTATTCTCTAGAGCTCTTTATGGTGCATATGTTGGACTCTTGTTGAT
TGGAGCATTCTTAACGACACTTGCTATTGTCATCTTTGCAACATATGCTG
AGTGTGATCTATTGAAATCTGGAAAAATCAAGAGCCCTGATCAGGTAGAT
ATATAGATTTTTAAATGTTGTTTGTCATAAAGTTGTTATATCCAAGAACC
GTGCCGTCCCTTAGAACTGCCAGTATAATATGAGATTCTTTTGTAAAAAT
TTTTTCCATCAAATTTGCTTCCAGCCCCTTTTTTCTACAAGTCAATATTT
TGCTATCTATTGATTTAGGTGCTTCCATATTACGTGGTTGATAATTTTTC
ACATATACCTGGTGTGACTGGGGTATTCATCGCCTGTTTGTTCAGTTTCT
CTATCAGGTAAAACTTACTATTGTTATAAAACTACATTAAAAAAAAATTT
ATAATCAGGCATAGAAACCATAGCGTCTGCCCACTGAAAAAGGAAAGGGT
TGAAAAATACCGGGTGACCCACGAAAAAGTTCAGACGTTTCCCGACATCT
TGAGGCCGAACAAATGTCCCAAAGTGCTTGGAGTTTTGATATTTAGAAAG
TAGATATCTTAACTTAAAATTTGAGCTATCACCTTTTAAATTTGACCAAC
TTGTTCTCTACTTATGAGCTTTTAAAGTCAAAATTCACTTTTCGGTAAGT
GTAAAAAACACGTAAAAAAGAGGTATTAAATTTTATGCAATCAATTAGAA
ATCCACTTACAAATTGACTTATTTAACGAGTTTTATGACATTAATAATTA
ATAAAAACGACTTTCAAAGTAATTTTTGTTTAAAACAAGACTAGTTTTTA
TAAAAATTGGCGCTTTTGTAGATTTTTCAGATTTTTTTCAAAAACTGTAT
ATCCAAAACGTCTAAAAATACCAAATTTTATACCCCTTTTTTACATGTTT
TTTACACTTTCCGAAAAGTGAATTTTGACTTTAACAGCTCATAAAAAGTA
GAGAACAAATTGGTCATAAGTTTAAAAATCAAATTTAATTTTAAACAAAA
CATTTTAGTTTAATCTTGTTGTCTTGTCATTCCATCAAGTTGGACTTTGA
TGATACTTTACTCCTGTATTATTTTTTTTAGTACACTTTCATCAGCTTTG
AATTCATTGGCTGCAGTTTTCTTGGAAGACATTGTGAAATCGTTCAACCC
TGTTCTCAGTGAAACTTTCCAAACAAGAGTTTCAAAGATTGTTGGTAAAA
CAAGCATTATTTTTTATTAATTTTGTATGTCTTTTTTACAATGAAACAAT
GGCCTTACTCAGGATGTCTACGGGACCTTGAAAACCTTGAAAACCTTGAA
ATTGGACTAAGCAACCTTGAAAACCTTGAAATTCAATGTAATGGGAAAGA
ATTCCTTGAAAACCTTGAAAATGCATGATTGTGACAGTATAGTTGTCTTG
TTTTGGCTTGGGTTCTCACTAAAGTTTCGGTCTATGCTAAAAACTCTAAG
AATTTTCTTGCTTGCTTCGCTCGCAATCATTGTTTCTAGACCAAATACTG
GTAGTAACATCTCTTGCACCTTGTCAACAAGTCATATCCTACTATTTAAG
TCGATTTGAGTTCTGAAAAACCTTCAAAATACTCAATAACTGGTCCAAAA
ACCTTGAAAAAACACTAAAATTTTGCCAAAAAAACCTTGAAAACCTTGAA
AATGGCGACAAAAATTCTGTAGAGACCCTGTACTTCTTACTCATTAAAAC
CATAATACAACTTGAGTATGTAATTTTTTGTTTCTTTTCAGCCTGTGTTC
TGGGTGTGGTAATAACAGGTCTTGCATTTGTTGTGCCATTGATTGGTAAC
AGTATCATCAAAGTAAGTATTGATGTTTTTAATAAGGTCTTCAAACTAAA
TGAAGGATATTTTAAATGAATGTCTCTCAACCTTAGTCGGGAATCTTAGT
TGCTTTGTCAGCAAAAATCTTCAATGCTTTTAATTTCAAAGACTTTATCT
ACCAAGGAAGTTATTTGCATTAAGGTTTCTTGAGATTTTAAGCACTTGAT
ATTATGTTATACCTTTAATGCCCAGCCATTATTTCTCTCATATTTTTCAG
CTTGTCATTCAACTCTTTGGTATCGTAAGCGGACCTTATTTCGGATTGTT
TGTCCTTGGCATATTCTTCAAGAAATCAAACTCAGTTGTAAGCTGCTGTG
GTTTTTTCTTCTAAATAGTTTTGTTCTACATATAGTTATTTAGCAATGCA
ACAGAATGCAATTTAAAAGAAAAGTTTAACAAAGCTTCCAGATTCGACCA
ACTTGTAGAAAGAAAGGGCTTGGTATCTATACTCTTAAATCAAACCAGTA
CAATGGTAATAAACGTTATTTTTAGCAGGTTGATAGGTAATCCAAACTCA
TATCGACTACATTTTACATTTGTTCAACTTTCTAAACAGGGAGCAGGAGT
TGGTTCTGTAATAGGACTCCTGGTAGGAATTGCAATGATGGTCGGTCAAT
GGTTCTATCCACCTGGCAAAAATCTACCACCTGTGTCAATGGCACAATGC
ACTAACGTCACCAAACCTGATTTGAAATTTATCTATCCAGCAGATCCTGT
TTATAAGGAGTAATTATTCGAACTGTTCCCTGAAAGTTTGTCAATGTTGA
AAATATTGCTTACACTGCCCAACTAGTGCTAGAATCTATAGTCTCTTTAG
TCATTGGTTGTGGTATACACGAGTGTTTTCTGAATTTTTTTCTAAATTCT
TGTTTATATTTTTCTCAAATTTCTAAAATGGTCTTTTACCTGTGATATTG
TGTTATATTTCAGCCTTTGTAGTTAAGGTCTTCTCTCAGTTTACTCTATC
AATGTAAATAATACCTAATTTTCTTCTTTTAAATTAATAGCAACATAATA
GCAGACATGGTCAGTTTCTCTTATATGTGGTTTGGCTTTATCACTGTCGT
CCTTACCGTCTTCATTGGATATTTGGTCAGCTTATGTCATGGACGTTGCA
ACAAGGAAGAGTTTGTTGACAAGATTCTGTTGTATCGATACAGTGGATGT
TGTGGATGTTGCGGAGGATGTTGCAGCTGTTGTGATGGGGATGGAGAAAC
AAGCTATGAACCTTATGTAAGTCTCGGTAAAAGAAACCGAAAATCAGAGT
TAAATTATTTTTTTTAAAGAAATTTCGTAGCAAAATCTTGACCTTATCTT
ATCTGCAATCTGCCAAATTAAATTGTCACTTTTTGGTCATCTAAAAGATT
CAATTCTCGCCAAAGTTAAATATATTATTCACTCAAAAATTTACGACGAA
GATATGAGGTTTCAATGTTTTGCCACAATGTTGTCACAGCAATTATTGTT
ACAGTTTTTTTTCATTTTCAGGATCGTGAAGTTCAACTCATGATGATGAA
AAAAGACCAAGAAATGGAAGCCGAAGACGACAGAAGAAACGATGTTGTCA
TGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000068_pilon:679753..685557- >XLOC_038803 ID=XLOC_038803|Name=XLOC_038803|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3582bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000068_pilon:679753..685557- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGACGATAAAAAAACTATTGGTATTGTTGATTATGTGATATTTGGAGC
TCTGCTTCTATCATCCAGTTTGGTTGGCATATATTTTGGTTACAAACACA
GGAAAAGAGTGACATCGGCAGAATATTTACTGGCTAACAAGAGTATGTCA
TGGTTCACAATTTGTATATCCTTGGTTGTGTCTTTTTTCTCTTCAGTTGG
TGTGATGGGAATCACCACTAACATATACATGACTGGTGTCACTTTTTCTC
TTCACATTTTGACCTTTCTGGTGCCTATTATTCTGAATGCAGAATTTTTC
GCACCTATTTTCAGAAGATTGGAGCTGATCAGTGTAAATCATATGGACGA
TAAAAAAACTATTGGTATTGTTGATTATGTGATATTTGGAGCTCTGCTTC
TATCATCCAGTTTGGTTGGCATATATTTTGGTTACAAACACAGGAAAAGA
GTGACATCGGCAGAATATTTACTGGCTAACAAGAGTATGTCATGGTTCAC
AATTTGTATATCCTTGGTTGTGTCTTTTTTCTCTTCAGTTGGTGTGATGG
GAATCACCACTAACATATACATGACTGGTGTCACTTTTTCTCTTCACATT
TTGACCTTTCTGGTGCCTATTATTCTGAATGCAGAATTTTTCGCACCTAT
TTTCAGAAGATTGGAGCTGATCAGTGTAAATCATTATTTGGAATTGAGGT
TCTCTAGAGGAGTTCGCTTTATCGGATGTTTCCTGTTCTTTCTGCAGTAT
TATTTGGAATTGAGGTTCTCTAGAGGAGTTCGCTTTATCGGATGTTTCCT
GTTCTTTCTGCAGTATGTTATTTACCTGGCTATTGTGTTGTATGCTCCTA
GTCTGGCATTAGAAACAGGTTATTTACCTGGCTATTGTGTTGTATGCTCC
TAGTCTGGCATTAGAAACAGTCGCAGATGTGCCTTTGATGGCAACCATCA
TCACCACTGGACTTGTTTGCACATTCTACACTACTCTGTCGCAGATGTGC
CTTTGATGGCAACCATCATCACCACTGGACTTGTTTGCACATTCTACACT
ACTCTGGGTGGAATGAGAGCGGTTATATGGACAGACGTCTTCCAATCAAT
GGTCATGGTCATTGGGCTGGGAACTAGTTTGGTCATTGGTGTGATAAATA
TTGGTTCATTTGAAAAGATTTATAATGTAACATCAGAATTCAAAAGATTT
GACATTGAGGTGGAATGAGAGCGGTTATATGGACAGACGTCTTCCAATCA
ATGGTCATGGTCATTGGGCTGGGAACTAGTTTGGTCATTGGTGTGATAAA
TATTGGTTCATTTGAAAAGATTTATAATGTAACATCAGAATTCAAAAGAT
TTGACATTGATATTAATCCTGATCCAAGAGGTCATCAAACAGTATGGGGA
GTCACCATTGGAGGGACTTTCTCTATCATGGCTGCTTGGACGATTTCACA
ACCAACTATGCAGCGAGTCATTGCTGCCAGAAGCCTGGGCGATGCAAAAA
ATATTAATCCTGATCCAAGAGGTCATCAAACAGTATGGGGAGTCACCATT
GGAGGGACTTTCTCTATCATGGCTGCTTGGACGATTTCACAACCAACTAT
GCAGCGAGTCATTGCTGCCAGAAGCCTGGGCGATGCAAAAAAAGCTCTTT
ATGGTGCATATGTTGGACTCTTGTTGATTGGAGCATTCTTAACGACACTT
GCTATTGTCATCTTTGCAACATATGCTGAGTGTGATCTATTGAAATCTGG
AAAAATCAAGAGCCCTGATCAGAGCTCTTTATGGTGCATATGTTGGACTC
TTGTTGATTGGAGCATTCTTAACGACACTTGCTATTGTCATCTTTGCAAC
ATATGCTGAGTGTGATCTATTGAAATCTGGAAAAATCAAGAGCCCTGATC
AGGTGCTTCCATATTACGTGGTTGATAATTTTTCACATATACCTGGTGTG
ACTGGGGTATTCATCGCCTGTTTGTTCAGTTTCTCTATCAGGTGCTTCCA
TATTACGTGGTTGATAATTTTTCACATATACCTGGTGTGACTGGGGTATT
CATCGCCTGTTTGTTCAGTTTCTCTATCAGTACACTTTCATCAGCTTTGA
ATTCATTGGCTGCAGTTTTCTTGGAAGACATTGTGAAATCGTTCAACCCT
GTTCTCAGTGAAACTTTCCAAACAAGAGTTTCAAAGATTGTTGTACACTT
TCATCAGCTTTGAATTCATTGGCTGCAGTTTTCTTGGAAGACATTGTGAA
ATCGTTCAACCCTGTTCTCAGTGAAACTTTCCAAACAAGAGTTTCAAAGA
TTGTTGCCTGTGTTCTGGGTGTGGTAATAACAGGTCTTGCATTTGTTGTG
CCATTGATTGGTAACAGTATCATCAAACCTGTGTTCTGGGTGTGGTAATA
ACAGGTCTTGCATTTGTTGTGCCATTGATTGGTAACAGTATCATCAAACT
TGTCATTCAACTCTTTGGTATCGTAAGCGGACCTTATTTCGGATTGTTTG
TCCTTGGCATATTCTTCAAGAAATCAAACTCAGTTCTTGTCATTCAACTC
TTTGGTATCGTAAGCGGACCTTATTTCGGATTGTTTGTCCTTGGCATATT
CTTCAAGAAATCAAACTCAGTTGGAGCAGGAGTTGGTTCTGTAATAGGAC
TCCTGGTAGGAATTGCAATGATGGTCGGTCAATGGTTCTATCCACCTGGC
AAAAATCTACCACCTGTGTCAATGGCACAATGCACTAACGTCACCAAACC
TGATTTGAAATTTATCTATCCAGCAGATCCTGTTTATAAGGAGGAGCAGG
AGTTGGTTCTGTAATAGGACTCCTGGTAGGAATTGCAATGATGGTCGGTC
AATGGTTCTATCCACCTGGCAAAAATCTACCACCTGTGTCAATGGCACAA
TGCACTAACGTCACCAAACCTGATTTGAAATTTATCTATCCAGCAGATCC
TGTTTATAAGGACAACATAATAGCAGACATGGTCAGTTTCTCTTATATGT
GGTTTGGCTTTATCACTGTCGTCCTTACCGTCTTCATTGGATATTTGGTC
AGCTTATGTCATGGACGTTGCAACAAGGAAGAGTTTGTTGACAAGATTCT
GTTGTATCGATACAGTGGATGTTGTGGATGTTGCGGAGGATGTTGCAGCT
GTTGTGATGGGGATGGAGAAACAAGCTATGAACCTTATCAACATAATAGC
AGACATGGTCAGTTTCTCTTATATGTGGTTTGGCTTTATCACTGTCGTCC
TTACCGTCTTCATTGGATATTTGGTCAGCTTATGTCATGGACGTTGCAAC
AAGGAAGAGTTTGTTGACAAGATTCTGTTGTATCGATACAGTGGATGTTG
TGGATGTTGCGGAGGATGTTGCAGCTGTTGTGATGGGGATGGAGAAACAA
GCTATGAACCTTATGATCGTGAAGTTCAACTCATGATGATGAAAAAAGAC
CAAGAAATGGAAGCCGAAGACGACAGAAGAAACGATGTTGTCATGTAAGA
TCGTGAAGTTCAACTCATGATGATGAAAAAAGACCAAGAAATGGAAGCCG
AAGACGACAGAAGAAACGATGTTGTCATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000068_pilon | genome | sc0000068_pilon:679753..685557 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1708-1791:85 |
| Aaloc | 1483-1707:565 |
| Aaloc | 1312-1479:1017 |
| Aaloc | 1225-1311:1356 |
| Aaloc | 1156-1224:1663 |
| Aaloc | 1042-1152:2324 |
| Aaloc | 952-1038:3138 |
| Aaloc | 823-951:3441 |
| Aaloc | 682-819:3704 |
| Aaloc | 529-678:4003 |
| Aaloc | 463-528:4626 |
| Aaloc | 409-459:4913 |
| Aaloc | 343-408:5157 |
| Aaloc | 1-342:5806 |
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