XLOC_038686 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038686
Unique NameXLOC_038686
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:165616..186192+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038686 ID=XLOC_038686|Name=XLOC_038686|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=20577bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:165616..186192+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TCGAGGTTTTAAAATCTCTCATCTACGCTTTTTATACTGATCATATAATC TTGATTTTCGGATGACTTAGTTTGGCAAAAATGTTCAACATTAGCCTAAT TCGCAGAAATAAGTTCTCACCATAAAtttttttCCCTTGAAGGTAGATTT TTCTGTTGGAATTACAATATCAATGGTATACAAGTAGTCTAAAGCAAATG GAGAGCTTACCATACGATCTACGATTATATTTGATTTATCTCTTCTTAGG AATCCTTATGGGCGCACTGGCGTGATTGGGCGTGGAAATCTTGGACGTTT TGGTCCTAATCATGCTGCTGATCCTATTGCTACaaggtaaatctattttt ttttgccttttaaaCTGAATTGTGTTTATATAGTTCTTAACAATTATTTG ATTTCTTTGTCAAATGTTTTGTTTGCACCCTTTTTAATCAAAGAGCTTAC TTCTTTCCACCCTCATTTTTTATTCTTACACTTTGTCGGGAAAGCTAAAG TCGAAGCAAATCaacttacacccctgtctcacagccccggtgaaactttt gtcctcagtagggacaaaaatccctattgaaatcctaatggggaaaggaa ttatattgttccaaggttaaaaaatttagtggggatggttttggagtgca atttttaaacattgaatttcgaataggGATGACATTCCAAGGTATTATCT CACCGGTGACGaatttttaaccaaattttctagtggggctggggtccctg cgggtctgtgacacagaggtgtTAACTTATTTTAGGGtaatgattcaaaa ttttctcaataaGATACACCGGTTAGTTTGAATAAAGTCAGGGTGTATAC AAAATTTTAGGATTTCCCCGACTAAATTATAGGCTTGGCTCTTTTGATTC GAATTCTCTTTGATATGATTGACAGGTGGCGACGTACGAGCGCCGGGATA GAGATTGATAATGGGAAACGCGTCTTGGAATTCATTGCTATTCAACGAAG AGATAATCAACAATGGGCCATCCCTGGTGTAAGTGGAATTATTCGTGAAA AAACTCGGGAGATTGTTCAAATCCTAAATATACAGATTTGAAAATAGAAA CATTGACTGTATGGTTCTCTGAAAATTGCCATTTAGCGTATTGGTTGACC CTCCAGCCTTTCATTTTTGACTGTTCTTTTTATGATATTCCCATGGATAT ATAATGTATTAACATACGATTTATggttctttttttcaaaataaataatc cATTTGCTTTAAATGTGCACTAGTTTTTTCTTACAGCGTTATCATAGTAA GAGTGGGTTCAACATGATGACAAAACTCAAAACAAATGGACTTTAATATG TGGTTCTGTGTGGTTTGTTAAATAGGAATCTATCAGCTACAACAATCTTA TCctttaaataattttgttttcagGGTATGGTGGAGCCTGGGGAGAACGT GTCCGAAACATTACGTAAAGAATTCACGGAAGAAGCGCTCGCTAAATTAG ACATGGAGAAAAGGAAACGTGATCAATTGTCAGCAAGAATCGACCATTTG TTTAGCAACGGTGTCGAGGTATAAATTCATAGCATTCTTTTCGTCTCGAT GTAGCCTGTATCACACGGACACGGCGTTTTCCAAGAAGTACTGCGGCTGT AACCTTTTTTACTCGTATTCCTCCAGAAACCATACAAGTTTTAACAGTTA CCGTCGTCTTAATTCGAATGATCCTTTCCAAGTTAATGATAGCGATATTC AACGATCGACGAAGATAGCACTAAACATCAGTTGCAGTGATACAAAACCC CCGAAAGTTGTGAGCTTGCATTTCATCTTAGTGGTTGTGCACCAATTCAC TTCTGAACTATTGTTTATTTACTATTTCCATGCCGAAACTTTAAGGTGAA AGTGAATATTGTTAGGGTTACAATGTTTAATTGACCCGCTAAGATGttat tatttattatctattacctcttattaccttgttcttatctttgttatatA GGTGTACAAGGGTTATGTGGACGATCCTCGAAATACAGACAATGCATGGA TGGAAACCGTAGCCTGTAATTTCCATGATGACACTGGTGAAGTCTTTGGT GAATTCCAATTAAAGGTAAGTGAAATATTTAAGTGTTATAAACAGAATCC AAACACCAATAGCGTGTATTGAAGAATCTTCTTGCTTATACAGTAGTAAC ATCTTCACTCTATCCCCTCAACTGATGGATTGTCAATAAATGCTTATCGA TTGTCACTCTATGAttttgctatttcaataggccttttttgaaggctttt cttttttctacatttttaaaTCTCTAAATTAAAGACCCTACCATAGcatt caaaatatttaaccTATGCtgttgaaaatgaagataaaattcAATTCTTT TCAATAGGCTGGCGACGACGCCCAAGCAGTTCGTTGGCAACGCGTTAGTG GAAACATACCCTTATTTGCAAGCCACGTTGGCATACTCGAGCAAGTCGCT AAAATGCATAACGCTGCCTTCTATTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:165616..186192+

>XLOC_038686 ID=XLOC_038686|Name=XLOC_038686|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1962bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:165616..186192+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACCAAAGACAAGATGAACCAAAGACAAGGCTTGATTATGGATGCAG
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TTAAAGTACCAGATGATAAAGTTTTATGGCAGGCTTGATTATGGATGCAG
CAAACCAAGCACGACAAGATAATAACGGACCAAGAAAGTCACGTGGTGTT
TCTTTTGGTTCAAACGGCGCCTCATCAACACCTCAAATTACGACTATACA
TACTAAAGCTCGCCTACCAAACTACCCTGGGAACAGTATTGTTAAAAGAT
TTAAAGTACCAGATGATAAAGTTTTATGGCAGGAGAGTTTTGTAGAGTAT
GACCCAACTCTCTACACAGCATCATTTGTTCTCGATGGACCTTATTGGGC
TGACGAAGATCTCATGAATTTGAGAGTTTTGTAGAGTATGACCCAACTCT
CTACACAGCATCATTTGTTCTCGATGGACCTTATTGGGCTGACGAAGATC
TCATGAATTTAACACCAGACAGAAGGCCATTGCTGGCATTCAACAAGTAT
GACACAGAATGCAAAGTCAACCGTAAAAGTCACATGGGACAATATGAAGT
GGTTAATAAATTACCACGAACACCAGACAGAAGGCCATTGCTGGCATTCA
ACAAGTATGACACAGAATGCAAAGTCAACCGTAAAAGTCACATGGGACAA
TATGAAGTGGTTAATAAATTACCACGGAATCCTTATGGGCGCACTGGCGT
GATTGGGCGTGGAAATCTTGGACGTTTTGGTCCTAATCATGCTGCTGACC
CTATTGCTACAAGGAATCCTTATGGGCGCACTGGCGTGATTGGGCGTGGA
AATCTTGGACGTTTTGGTCCTAATCATGCTGCTGACCCTATTGCTACAAG
GTGGCGACGTACGAGCGCCGGAATAGAGATTGATAATGGGAAACGCGTCT
TGGAATTCATTGCTATCCAACGAAGAGATAATCAACAATGGGCCATCCCT
GGTGTGGCGACGTACGAGCGCCGGAATAGAGATTGATAATGGGAAACGCG
TCTTGGAATTCATTGCTATCCAACGAAGAGATAATCAACAATGGGCCATC
CCTGGTGGTATGGTGGAGCCTGGGGAGAACGTGTCCGAAACATTACGTAA
AGAATTCACGGAAGAAGCGCTCGCCAAATTAGACATGGAGAAAAGGAAAC
GTGATCAATTGTCAGCAAGAATCGACCATTTGTTCAGCAACGGTGTCGAG
GGTATGGTGGAGCCTGGGGAGAACGTGTCCGAAACATTACGTAAAGAATT
CACGGAAGAAGCGCTCGCCAAATTAGACATGGAGAAAAGGAAACGTGATC
AATTGTCAGCAAGAATCGACCATTTGTTCAGCAACGGTGTCGAGGTGTAC
AAGGGTTATGTGGACGATCCTCGAAATACAGACAATGCATGGATGGAAAC
CGTAGCCTGTAATTTCCATGATGACACTGGTGAAGTCTTTGGTGAATTCC
AATTAAAGGTGTACAAGGGTTATGTGGACGATCCTCGAAATACAGACAAT
GCATGGATGGAAACCGTAGCCTGTAATTTCCATGATGACACTGGTGAAGT
CTTTGGTGAATTCCAATTAAAGGCTGGCGACGACGCCCAAGCAGTTCGTT
GGCAACGCGTTAGTGGAAACATACCCTTATTTGCAAGCCACGTTGGCATA
CTCGAGCAAGTCGCTAAAATGCATAACGCTGCCTTCTATTGAGCTGGCGA
CGACGCCCAAGCAGTTCGTTGGCAACGCGTTAGTGGAAACATACCCTTAT
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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Position
The following features are aligned
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Properties
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