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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000066_pilon:1452156..1459828+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038451 ID=XLOC_038451|Name=XLOC_038451|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7673bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:1452156..1459828+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTGTAGTAGAGTTAACGTTGATTTTGTTAGGTATATTTCATACCAA
CTATTTTGCACATGGCTATCAGACTGTGGTCACAGTGCATGGTATAGACT
CAGATGAAGGCAGCTTTGACCCGATGGTTCGTCATATAAAGGATGTACAT
CCTGGGACAAGAGTTGTCAATTTGCCATATAGTCCAAATCAATACACATT
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TGTTAGATGATTTAGTTGGAAATTTTCACTTAATTTGTCATTCACAAGGT
AAGGCCTACTCTCAGAAACTAATACAGTCAACTTTTTCTAACTCGgactt
ctattattcaaatctttctgtaattctaACTAAAATAATATCCCCTCAGC
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AATAAGATTTTTAgttccttgaagatcgaattagggGAGTCAAATTTTAT
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CAGATTCACTTTGGATCCGATTACCGTACAATTAGAATGGTTTAATAAAG
CTATCGATCACGTTTTAAATAATACTTCTGATAATATTCAGTTGATTTGT
CATTCACAAGGTAAGGTCTGATTTGTTTGATGcaaccgtagcatgaaggt
agagcatccagctacggttcgcaaggttatgggttcgatccccagccggg
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TGAtactcagcaactaaagagacggatcaagggtaagtggagaaatccag
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gggagccttcggtcGCAAAATTACTATCTTACTTGCTTAAAGGACTGAAA
cagaaaggttaaaaaaactTACATTAGACTCTCGTTTATTcgaactttta
tttttccaatcttTGTTTAATTCGGACTTCAAGGAGAAACCCCtttcaaa
atactttctatagtTCAAATCTGGAACAAATAAAAtacccgttcgagttc
gaactAGCGAGAGACATCTCTACATCCCCGACGGAGGTACTCCGGCGAAA
TTCGGAACGGGGGCGtgtcgctggtcagggtcccttttttagagcctaat
atctgacagggtccctaattttctaattttcaacatttttacctaacagg
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GCATGGGTTATTTGATGCTCACCAAAAACCATCGAGTCGACAATTTTGTG
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TCTTGAACCCACTTGAATTTAAGGTGTTcctaaaagattttggaaactTA
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AAGAAGCGTATGAAAAAGTCGCAGTTTATTTGCCCCTTATTCACAACGAT
CCTCAATATCACCTCTACAATGAAACCGGTATcacaaatatttctttatt
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tttgaatttttctgcAATTCGAAATTAACGGCTTTGACATAAGCCTTAAA
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tggatgggaaataagtggcttaaTTTCCCATCCTGGAGTTTCggatctag
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CTTTAACAAAAAGTGCTTTAacttttaatgggtaattaacctttttgcta
agaagttttttctaactgtccgaaaagaattttttaaattttttgaaaac
attttctaaattgatctGATGCagcaaaagttatgactgtttttctatga
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CTTTGGTAAATGAAACACCGtcatactcttcttcgcaaaagacttcattt
tcttcttcgtcaaattttttcattgcaattctTAAATCTTCAGACTCAAG
GattagttggcctaacagaaaatgtataacatgtcaaagtTTTCTTAGCT
ACATCAGTCAGAAATTTAACTTTTGCACGTGTTAAGTACACTcgttaaat
attaaaaattcccTATGGTCGCAGAGCCCTTAAACTCTATGCTGGAAAAT
CATATAAATTATAGGGAGGgtttataattcgaatctctctcttattcgaa
aaCACTTTTCgaccccttgaaaatcgaagtAGGGTGGAGTCAACTGTAAT
TAGGGTGGGATGGCGTTAGACGCCTGATCGGAAGATAGAACGTTAGATTT
TCATGGCAATGAATCATGAACACCAAAGTGACAACTTGTGGGGCTAATCT
CCCTGGATAACATGTCCCTTCATAACATAGGGAAAACTTCAAAATACACT
CCTATTTCACAGACCTGCTAGAACCcagccctactggaaaatttggccaa
aattttgtccccggtggaaaaaaataccctggaatttcagccccctattg
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TTATCCTAAGTAAGATTATCGATCCAGTTTAACTAATGAAATGTGTTGTT
TTTAGAGGCGATACAACGTAAAGCgaattttcttgatttgaagAATTTGG
TTTTATTTGGAGGACCAACAGATGAAATTATCAAGCCCTGGCAATCACCG
TAAgtaatttgattctttttgaaGTTATTTATGTATTTTTAAGCTGAACA
GGATCATTAACTAAGGATCAGCTCTATAATTCCATGACAATTCAAACTAA
TTTTCAGCCCCCGTTAAAGAGAAACCTGCTTGATTGTTTATAATTCAAac
ctctctgtaattcgaacaaataaaattCCTCGTTtggttcgaattagcga
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CAGTGCCGTAGAAAACATTTTCatatggggggggggcttaAGATTAGTGA
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ATagcccccttgcccccccccccccagttgctacggcactacATTAGTAA
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GCTTTcacgatttctctttaaaaatttcgaatgtaaatattttgacaaat
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ttcaaatgtgcgttatccagctccgctataacatatccctgttcaaagca
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caagaaaaagtgaagccttaaaatatgcgccgtattttttatgacggatt
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GCTAAGTCGCGAAACTTTGGTAGGGTTTGGTAGGCTTCAAAGTCCTACGA
AGAAGATTCAATTCAAGCCCTTaagggcttatacttcattgattcAAAGG
TTTTTCTTTCATAGAGGTTATCTTAAGTCTTTCATCTGAAAAGAGCTCAA
CCTTTTTACAACAAAGTAAAAAGTCAAAAGGCGAGGTCAAAgaatgaaac
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GGTCTTCAAGCGCTCCACAAGACAGGACGTTTGCACTCGTATGTCGTTCC
AGGACTTTACCACGAGGATTGGGTGAATAGCGAATCATTCTTCATGAATT
ATGTTGCTCAATGGCTCACTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:1452156..1459828+ >XLOC_038451 ID=XLOC_038451|Name=XLOC_038451|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1842bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:1452156..1459828+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTTGTAGTAGAGTTAACGTTGATTTTGTTAGGTATATTTCATACCAA
CTATTTTGCACATGGCTATCAGACTGTGGTCACAGTGCATGGTATAGACT
CAGATGAAGGCAGCTTTGACCCGATGGTTCGTCATATAAAGGATGTACAT
CCTGGGACAAGAGTTGTCAATTTGCCATATAGTCCAAATCAATACACATT
GGATCCTTTATCTGTGCAATTGATATCATTTAGGCGTGCTATCGAGAAGG
TGTTAGATGATTTAGTTGGAAATTTTCACTTAATTTGTCATTCACAAGAT
GTTTGTAGTAGAGTTAACGTTGATTTTGTTAGGTATATTTCATACCAACT
ATTTTGCACATGGCTATCAGACTGTGGTCACAGTGCATGGTATAGACTCA
GATGAAGGCAGCTTTGACCCGATGGTTCGTCATATAAAGGATGTACATCC
TGGGACAAGAGTTGTCAATTTGCCATATAGTCCAAATCAATACACATTGG
ATCCTTTATCTGTGCAATTGATATCATTTAGGCGTGCTATCGAGAAGGTG
TTAGATGATTTAGTTGGAAATTTTCACTTAATTTGTCATTCACAAGGAGG
CGTGGTATGCATGGGTTATTTGATGCTCACCAAAAACCATCGAGTCGACA
ATTTTGTGGTGCTCTCTTCCCCAATCTTTGGACAATACGGATGAGGCGTG
GTATGCATGGGTTATTTGATGCTCACCAAAAACCATCGAGTCGACAATTT
TGTGGTGCTCTCTTCCCCAATCTTTGGACAATACGGATtaacTGGAGATA
TATTAAACGACATTCCAGCACTGCGTCCTTTCAAAGATCTTGCTGCCGAA
GCAATTACAGAtaacTGGAGATATATTAAACGACATTCCAGCACTGCGTC
CTTTCAAAGATCTTGCTGCCGAAGCAATTACAGAATTGGTGTACACACCT
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ACACCTTTACTTCAGAATTCTCTTTCCATCGCTAATTATTGGAGAGATCC
ACGACCATCGACAAAAGAAGCGTATGAAAAAGTCGCAGTTTATTTGCCCC
TTATTCACAACGATCCTCAATATCACCTCTACAATGAAACCGATCCACGA
CCATCGACAAAAGAAGCGTATGAAAAAGTCGCAGTTTATTTGCCCCTTAT
TCACAACGATCCTCAATATCACCTCTACAATGAAACCGAGGCGATACAAC
GTAAAGCgaattttcttgatttgaagAATTTGGTTTTATTTGGAGGACCA
ACAGATGAAATTATCAAGCCCTGGCAATCACCAGGCGATACAACGTAAAG
CgaattttcttgatttgaagAATTTGGTTTTATTTGGAGGACCAACAGAT
GAAATTATCAAGCCCTGGCAATCACCATTGTTTGGGTACTTTGATGAAGA
TCCATTATCAGGACACGTTGTCAACATGACCGACCAAAAGATTGTTTGGG
TACTTTGATGAAGATCCATTATCAGGACACGTTGTCAACATGACCGACCA
AAAGATCTATAAAGAAGATTGGATTGGTCTTCAAGCGCTCCACAAGACAG
GACGTTTGCACTCGTATGTCGTTCCAGGACTTTACCACGAGGATTGGGTG
AATAGCGAATCATTCTTCATGAATTATGTTGCTCAATGGCTCACTTAAAT
CTATAAAGAAGATTGGATTGGTCTTCAAGCGCTCCACAAGACAGGACGTT
TGCACTCGTATGTCGTTCCAGGACTTTACCACGAGGATTGGGTGAATAGC
GAATCATTCTTCATGAATTATGTTGCTCAATGGCTCACTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000066_pilon | genome | sc0000066_pilon:1452156..1459828 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 778-921:7530 |
| Aaloc | 715-777:5870 |
| Aaloc | 622-711:5058 |
| Aaloc | 526-618:3435 |
| Aaloc | 469-522:2975 |
| Aaloc | 397-465:2530 |
| Aaloc | 301-393:2291 |
| Aaloc | 1-297:1 |
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