XLOC_038328 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038328
Unique NameXLOC_038328
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000134_pilon:284824..292246+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038328 ID=XLOC_038328|Name=XLOC_038328|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7423bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134_pilon:284824..292246+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000134_pilon:284824..292246+

>XLOC_038328 ID=XLOC_038328|Name=XLOC_038328|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2556bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000134_pilon:284824..292246+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAAAGTCACCACAAACCATGGCCATTGAAATTTCAACATTGTTTAA
TAAAACAAGATGGCAAAGTCACCACAAACCATGGCCATTGAAATTTCAAC
ATTGTTTAATAAAACAAGGTTCAAGCCTTCATCAGCAGCTTCTTATCTCG
TGTTTTTCTTTTACATGCCGCTTGGTATTGTGTTGTTCCTTCTACGTATA
TTGCTATCCTTCCAATTTGTAATAGTGTTAGCAATTTTACCTAAAGAATG
GTTTATTAGAAGGTTCAAGCCTTCATCAGCAGCTTCTTATCTCGTGTTTT
TCTTTTACATGCCGCTTGGTATTGTGTTGTTCCTTCTACGTATATTGCTA
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AGAGATACCAAATGAAGAAGGTTTGGATGATTTTGCCAAGTCGCTTCAAA
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AATCAACGAAGAATGTCGATCTGACCATAGCACATTTATTGGATGGTTCC
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CGATCTGACCATAGCACATTTATTGGATGGTTCCATTCAATATACACCTC
TCTCTGATGAAgatcaacaaaaagaaaataaagatattGAACTCAAACGA
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CACCACACCCACTTCATGGAAAGATCGACAATTATCTTttcaagaaaaga
agaaaattatgatTGAGAATGCAAGAGTGCTAATGATGCAGCCAAGAAAG
CGGCAAGTGCCACCACACCCACTTCATGGAAAGATCGACAATTATCTTtt
caagaaaagaagaaaattatgatTGAGAATGCAAGAGTAAAATATCTTGA
GCTGCATCCAGAATATGCTTGAAAAATATCTTGAGCTGCATCCAGAATAT
GCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038328XLOC_038328-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000134_pilongenomesc0000134_pilon:284824..292246 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1246-1278:7391
Aaloc1135-1242:6911
Aaloc1003-1134:6537
Aaloc826-999:5972
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Aaloc1-57:1