XLOC_038104 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038104
Unique NameXLOC_038104
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000121_pilon:957359..966073-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038104 ID=XLOC_038104|Name=XLOC_038104|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8715bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:957359..966073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGACGGTCAATTTATTGGTACTGGCTGGTTTAGCTTTTGTCAAGAC ACAAGAAATAGTAAGTAGTATTATTATTCGCTTATTCGTTATTCGAATCT TTCTATAATTCTATAACTTGTCTGCAGTCCTCGTCAAGGAGAAACCTTCT TGAAATAAATTCTATAATTCGAATCTCTCTGTTATTCAAACAAATTAGAC TCCCCGTTCGAGTTCGAATCAGCGAGAGTCAACTGTATATATTTAATTCA TATCATTGAATCGAGTCCGAGTCTGAGCCCTATGTTGCCTGGGGGGGGGG CATGATTTAAAAACGACCGTATGTGTGGCCTATAACTTCCCATAAAAAAA AAAAAAAATGTTTTCATAAGGGAAGGGGTGAAAAACAAAGTCTGTGTAAG TAAATCTGCGACCGCAGTCGGAGGCCCGAAGGCTCCTCTTTCGATAGCTA TCTACCCGAAGATAGGAGATGCGACTCTTTCTCCCTGGATTTCTCCACTT ACCCTTATTCCTTCTCTTAGGGGCTCTGACCATAGTGAATTTTTCATAAT TGCCGTGTTTAAAATGTGTTTTCTGACTGATGTAACCAACAAAACTATGG CATGTTATAAATTTCCTGTTAGACAAACTATTCCTGAATCTGAAAATTCA AAAATTGCATTGAAAAAATTTGATGAAGAAGAAAATGAAGACTTTTGTGA GGAAGAGTATTTCAACTTTGAAGAGCTTAGTTTCGGCGAAGAAAAAACAT TTTGAAAACATTTTCGAAGTAGATGGTGTATCTTTTACCGAACAATAAAA ATTTTTGTGGAAAATTTTTATAAATGCTTCTTTGTCTCGAAATCTTCAAA ATAGTGGTTTTTCATCAATTTTTTATCTGGATTTTCCTTAAAAAGTCATA ACTTTTGACATATCTTTCTAGAAAAATTTTCCGAAAAATTTAAAATAGTT CAATTCTTTGCGGACAGTGTATATTAAAACTAAGCATTTTTTGTAAAAGA GGGTGATGCAACATATTATTAACATATTTTTAAAGTTCATAACGTCATTT TTGCAATTAAATTCTTAATTACTCTTAAGGGATTCGATTAAAAAGCAATT TATAAAGGCAATTCTTTGTTAAAAGTGTTAAGGAACCTGAAATATAACTT TTATGTTCAAATACCAAAATCAATTTTTGGACTATGGTCAGAGCCCTTAA TTGCTGAGCATCAAGCAGAGAGGCATCATGTACCATTTTGAGATTCTGGT ATGACCCGGCTAGGAGTTGAACCCACAACATTACGAACCGTAGCTGGATG CTCTACCGCTGCACTACGGCCGCTTTTACTGATAAGTTATATTTGTTAGT TTGAATGGTTCCGTAACAATGACTTTTATTAATTTATCAACTTGGCTAGC CCCAATCTGAAGGTGGAAGCGAGGGTGGCAGCGAGGCACTAGCACCCGAT ACTAACGCAATCGAGTTAGCTTTTAATGCAGACTTCGATACTGTAACGGC TAACTATCCTGAAGCAGAAACAGAATTCTGTTATCAAACACGTATTATGC TCGGTGTTTCATCCGAAGACTTCAGAGACTGTAGCATCCGTGCTGGAAGC ATCATTGTCTCTTTCACTCTCTACCAATCAGACGCTGATGGAAACAATAC GTTGGATACTCTCAAAGCTAAAGTATTGGCCGGTGAAATGACAATCACTA TTGGTTCAGAAACATACAAGGCTAAACAAAATTCCACGGTTCTTCCCTTT TTTTACCAGAGTTTTGAGAGCTGCAACAAGACATCAGTATGCGTCAAAGC ACCTGGTTGCGAAACGCCACAAAACTGTCCAGCGTTAGCCATGTACCATC ACAACACAACCACTGACAGACTACATTTCACATTGTTCTTCAAATCGAAA TGGGCAGCTTTTGCACAAAATACGTTTGTTAAGAAGGATAACAGAATGGT ATGTGTATACACGTTTTTCTAATAAAAACATCCAAAAATATTTTGTAGCC TCGTTCGTAACGTTTTGGATTTTAAACCTAAAAATGTTCTAAAAACGTTT TATTTTCAACGTTTTGTGAATATTTTTACCCATTTTCCTAAGAGAACAGG TGTTTTTGAGTTCACAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTTGTTCTTAACA TTTTGGCCATCGAAGCATTATGTTCTGATATAGTTTGTTTTTTATATAAA AAAACATGTACTCGATTGGTTTTTTAAAACTTCTAAGTTAAGTTTCTTAA GGTGTAAATTCAATGTTCACCAATGACACGTCTAAACAAAGTCCTCCTCG AACTTTTTTATAGCCATCTTATTAGATGTTTTGTTTCTTGCAATAGTTTA TCGTTCAACTTGGAGAGGGAATATTTGTAAACATAGGATTTTTTCTTCAA CTTTTCTCAAGCAAGAAAAAATTAAACCTTCCTTAAAATTTCCGCCACTT TTGTAACGCTGGATTAAAATCAGTACTTTCTTTATTTTCATGCGTTATAT TTTTCGAAACCCGGTAGATTTTATTATCAATCCGGTATTTGCAAAAAAAC TACACGGGTCACGCGTTTTGGTTGGAAATAAGTGGCTTCATTTCCCACCC AAAAAATTCCACTCTAAAGCCTCTTTGGGGGTTTCAATAGACGATGTTTT TTCGTTTGTTTTTTTTTTACCTTTCCGGTTTTTTTTTTGTTTTTCACATA GTAACTTTACACAAGGAAGTATACATTTAAAATGGTAGCTCGCTATAGCA ACGGAAAAATAATAGGCTCGTTAGATTTACGCACTTTTGGTTGATTTCCA GTAAATGCATTCCATAATTAAAAATTAATGTACAATTAATAGGGTCATTA AAAATATAGGAGCGCCAATAATAAGGTCGTCCAGGAAATTAAAACCTGGT CTTTCCGCCATGAAAAATTAATTGCAGCAACAAACTTTTTTCATAAGAAC TTTCGATTGTCTATTGTGTAAGCCGCCCGGCTCTTCTTACTTTTGAAGCT CTGTTTAGCGTCCAGTCATTCCTGAATTCATGTCTAAACGTATCGAAAAA TTTGAATCCACGGGTTGCATAATTATAGCAAATAGCAGTGCAGTCATTCG ATTACTCGAAAATGTTCACGTGATTTTATTCCCATGTTACTTGCTTTACA ACTTACAGCTGATAACTTTATTAGTGTCAATAAATTCGAATTAATCAGAA ATAAATGTCATGTAACTAGCACATAAAAAATTCGAGTAAAAGCGTGATTT GTCTTCAAACTTTAATTGTGCAGCCTATGCATTAACATATCCAGGGCGAA AGAAACGGCTATTCACGCGTCACCCAGAACTCCGGGGAGCCCCAGTAAAC AAAGATATTGACATATCACGTTTTTGCAATCTCAGTTCAAACCTTTGATC TTGTGTGCCAGTTGGCGTGGGATGAGCTGGAGTTTTTATAAGATGTTTTA TTCATTGGTTATTTGAAATAATAGAGATGACGCGTTCTTTAGAAAAAGCA ATAAAATCCTTTGTCTCAAGATTCAACGACCAACCGAATCATAGAAAACC TTGTAAAAACTCCAGCCTGACCCGTTGGCGTTGGTATCTTCTGTCAAAAC TTTGGTCGAAATAGAGAAATTTTATATCAATAAAAAGGAAATTGAACCTA ACCTTTTAACCTTCTTAAAAGAAAATCTTCAACTTTTGCCGGTCCATTAT AAAGTTATTCAAGCTCTTCCTTTTCACTGAAAAGCCGTAAGGATATGAAT TATTTCCTACTGGATTAATAAAAAATGAACTCTCCTAATTTTCAAAGTAA TCGAGAATCGATATTTCATTAAAGATTTTCGATTGACATTGAAAATGGAC TCGTGGATCCCCTCTCAAAAAAGCCTCAAAATCCTATCTTCTGTCGAACC AAGCACATGTAGTTGCGCCCTAAAAAAGATGCTAAGGACCCCAAGAGTTT CATTTTTTCGGTATAGAAATTTCGCCAGGTCTCAAACAGAACCGTTGATA TCACAGTGTACGAATATTAAACTGTGAAAAGAAACAACGGCTTTATTCTG CACCATCAGCAGAAACAAAAGTGAAGACAAATTACAGAAAAATAAATACG TGTTTTTTTTATAAGCATAACGCTTATAAGCATACGAAGGCTCTGATTTG CAGAATTCCTACGCATAACATAAGCATAAATGTCAGCCTGGAATATTTTT CAAGTTGTCATTTTTTATCTGTTTAAAAAGGTTTGATAGAGGTTAAGTGA AAAAGACATTCCAAGGCTAGCTACATTCAAATGCTTCCAAAATCTGAATA AATCTTTACAAAATTTCTGAAATTTCACTAAAAACTTGGCTCGAGGTGAA TCATAAGCATGATTCATAAGCATATAATAAGCATAAGCTATGGCTGGATG CTTTAAGAACTTAAGCATACACGAGCCTGACCAAGGGGCATACACTTGCT TATAAAAAAAACATGTATGATACAATCTACTTAAGGTTTACACGAGGATA TACGCTCTCCATCTCTGCTTTTTTAATGCGATTGAGACATGCGCGATAAA ATTCTTATAGACCGTCGCCACAGGTTAAATTTCATTAACTATTTGATGTT AAATTTCAGGTCAACGCCAAAGGATTTACATGCACCCATCCCATCCCTTT ATCAGAAACAAAAGTGGAGCCATTGAATCTACGTTTTATGTTGAGCAAAG GATTTGATGCACCTGAAATGGTTAAAGCTGACCAGGTGAGTTTTTACTTT TCGGGTTCATGTACCAGGGAGAATCTTGATAAACCTTTTCTTTACAGAAG ATACACACTTTGAAAAAAAATAGTATAATAATTTTCCCTAAAACGTCTTC CCATCGCGAGATGTTTGAATTGAACTTTTTTCGTTCAATATCAGAGACAG CCAAGATCGACAGAACGTGAGCAGCTCAAATCTTTACTTGGCAAAATATT GAAAGACTGTATCATGTCAAGGAGGTCCTCATACTCTCCTTCCTGGTGCC AAGTTTGAAGCATGTTAGAATATTCGTAGATTCTCATGATGCTCAAATTT CAAATATCTTGATTTGTATATAATTTGTTAATTTATCTTTTCAGATCTCT GAAGTTTCGGATGTCGAATTAGCAACAGTCGACGGGGTCCATATGTGCAG GTAATAATATGTCATCGATATGTCATGTATCTTATCATGTCATGTACTAA GACTAAATTGGGTTATTCCCAATTTGTGTCTTTCCGGAGGGACCCTGCAA CCCAATTTTAGCTGCAAAATATCGTATACTATTTTCCCTGGGGCTATTTG TTACGTTGTTGAAAACTTAAAATCCTGGCACAATTTACGTCCACCCTTTT TACGTTTGCCTTAATTATGCCACTGGCCAAAAATAATAACACCGATAAAA GCCAGCCGATTAAGTATTTCCAATTTATATCTGTATAGCTTCAGCCGGCC AATCAGCTTGAACTCTATCGAAGGATTCAAATATCTTTACAATCTGGACT TATCAACAGATTTATTGAACATCATTGTTTTTGGCAACAAAGTTGGTAAG TATAAAACTTACTTTAATGTCTGGAAAATTTCGCGAGGCAGGCTATTCGC GAAATTTCGTATTTTTCGGGAATTTAATTTCTCAATTTGACTTAAAAGGT TTTATTTTTACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGGCACATATTTCATAT CAGGACAGTGTCCCCCTATTGTTTTTTTTATCATAAAGCGGACACAGTGA AGGTATTTGTTTTGATGACTGTTAAAGTCCCTCTGCTGTAATGTATAAAA ACTTTGTAAATGAAAGTTTGCGTCTTTTTGAGCATTTGAGCATTCTTGAA AATCGCGAGTTTCTGGCCGCGAAAATATCTGACATTAAAGTATTTTCTTT ATTATGATACGTCCTCTATTTTAATTCACATGGATAATTTGTTTTTGCTA TATAAGAACAAATTTTTTTCCATTTAGTACGGGAAGATGTTCGTGTATTT CCATTTTCTCCTAATTATAGCGTACTGTAGTCAATTAGGCCTATCTGCAC CAATGGGTGCCTGCCAGAAAAATAACAAACAAATTTCCAAATTCGGAATC TCTTAGTTTTATAGTTTTCCATTTATAAAGTGCTAATAAGTGTCATAAAG TGTTAGTATTACCCAGATTCAGATTTTATAGAAAACAAGCAGAAAACCCA TACTACTTACCCTAAGTATCAGAGGCCGAGTTTTCAAAGTAAATATCAAC CCTCTGACGACGAAGTGTTGAAATATTATCATGGATGTGTCAATCTAATC ATTGTGGAAAGAATCAAAGAAGAAGAGCAATAGTTACTTTTCTTTGCGTT GATTGCGCTGAATAGAATCGTGATTGGTTGTCACAGGTCGGAAAATGATT TCAGCATGTGATTTTAACGGTGCATAATACTATATATTATACGGATTATA AACGACTCCAGTCTAGTATTATTATACCCTTTATTTCATCATTTATAGAT GGTACTGGCTTGGCTTATCACGGACCGGACAATTATTTTGTCGACAAATC AAAACCTGCTGTTGATTGGAAAACATTTACTGGTAGGTATTCTGTTTTGA TTATATCATTCGAGAGGCCCCAATAGGAGTCTCTAAGTACGTCATCACGT CGAAAGAGTAGAGGCCACTATGTCTTCCTGAAGCTTTTTCTCTACTACGG CTATTCCAAAAAAGGGACGCTTTGTGTAAAATTTCAGAACGTTAGGATCT TTTCCAGTCAAGGAAAGAGATTTCATTGTACAGTTCATTGTACATATAAT CTAGATTTGGCATGGATCGCTTTTGTATTCGTTGTTGCTTTCCACTGGAC AAGATCGTCATGCTTTCTGATTCACTTCAGAGAAGCACATGTATACCTGC TTGATGGATAATCTTATCAAGTCTTCTAATTCAAGCTATTTGACATTTGG TTTTTTATGTAATCTAATCTAAAACTTCAGTTTGGAAAGTCATATAAAAT ATAGTTTTTCTCTAATTCGATGAAATTTTTAGTTCCCTTCTTAAAAATCG AAATAGAGAGAGTCTAGCCAGGATGTTATCATTAATAATGTTCTCTGTAT ATTTTCATAGGTGTTGTTGCCGAAGAGATCGAACCATCTGCTGAAGTCAT GCCAAGTTCATCTCAAATGGCCAGTATCTATGATACCAGTAGCATGATGA TGATGATGTCATCAAAATCCATAATGGCATCCATGTCTGTGAGTGATAGT GTTGGTATGACAACTGATGCTATGATGTCTGTCAGTGACAGCGTGATGAT GGAAATGTCTAGCATGGTTTCTACTACGCCTGATGTTGCAATGTCAAGTA AATCAATGGTAAGACCTTTCCCAGCTGGCATACAACGTTGTTTCAACGTT CATTTAACGTTACATGGACGTTGTGAACGTTAGATAAACGTTGAAACAAT GTTATGTGCCAGCTGGGTTCGCTTTTCTATCTTCGACCATATTCGATATC TGTTATTAAATCTCAGGTGAGTCTTTTTGCAGTGAAAAGGTTCCTCTGAG AAGAAATTTTTTGAAAAGGAGGCTAATACAGCAGAATTAGGACAAAAGAG GGAACTGTCAAAGATATAATAATAAGCGGGGGGGGGTTGGAATAAGAATG TCCTGTGTGGAAAATTTTCGAAAAATTAATTTTTTGTTTCGCAACCATAA CTTTTCGCAATTGTAATAAGCTAAAACACACGATAAGTTAGTAGTCTATG TATATTGCAATAAAGAGCATACATTGATGAAGTAAAGAACGCCTACTCCC GCCATAATGGAAACAAACGTTCGATTTGCGCAAAGGATCGCCTCTATAGA TTCGAATGTTTGCTTACATAATGGCGGAAATTACGTAACTGGACTAAACA TAAGCTCACGAGATTCCTAATGATTATCTCACTATTCCAGGATGCTTCGA CAACACCATCAGAAGAAACACCGATGGTCAAACCTTCATCTTCATCCACC ATCATTGATGTCATCTCATCTAAAGCCCCATCCACACCAACAACGACCAC ACGTCCAACAGTCAAACGAACCACAAAATTTAATTTGTCACACGCAACAA CATGTACAGGTAACTTAAAGAAGTTTACACCTCGAAGTAAAAGGAAACAG CATTACTATACCCCTGTTTCACAGACCCGCTGGGATTTGGCAAAAATTTC GTCCCCGGCGGAAAACTTTAGAACTTTTCCCCTAATTTCTCTCTCTCCAT TTTGGTTTAAATTTCATCAGAACAGAACTATTCTCAAGTGAATCTGAATC TACCTTAAGTGGATTAATTTTGGCGAATTTGGTGAATTTTGTTAAAATCC CGCCAAATTAAATCCCCGCCAAAATTTCAAAAACCGACCATTCGCCAAAT TAAATCCCCGTCAAATTTAACAAAAAGAATATTATGTAAAAAAGAACAAC TTTTCAGTATATTTTATAGTAATTTTTACCCATTTTAGTGTCTCAAAATT TCCAATTCGCCAAATTAAATCTTCGCAAAATTTTATGAAATTGATCTATC ACCTAATTAAATACCCGTCAAAAATCGTATTTTGGCCGATCGCCAAATTA AATCCACGCCAAAATTTATCCACTTAAATAAGTTTTTTTTCTTCTTTCTA TTTCTGCAGCTTCAATCAGTGTATTGGTGATAGCTATTTCAGCATTGGTG ACCATGTTGATGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000121_pilon:957359..966073-

>XLOC_038104 ID=XLOC_038104|Name=XLOC_038104|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2190bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:957359..966073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGACGGTCAATTTATTGGTACTGGCTGGTTTAGCTTTTGTCAAGAC
ACAAGAAATAATGTTGACGGTCAATTTATTGGTACTGGCTGGTTTAGCTT
TTGTCAAGACACAAGAAATAAGTTTTGAGAGCTGCAACAAGACATCAGTA
TGCGTCAAAGCACCTGGTTGCGAAACGCCACAAAACTGTCCAGCGTTAGC
CATGTACCATCACAACACAACCACTGACAGACTACATTTCACATTGTTCT
TCAAATCGAAATGGGCAGCTTTTGCACAAAATACGTTTGTTAAGAAGGAT
AACAGAATGAGTTTTGAGAGCTGCAACAAGACATCAGTATGCGTCAAAGC
ACCTGGTTGCGAAACGCCACAAAACTGTCCAGCGTTAGCCATGTACCATC
ACAACACAACCACTGACAGACTACATTTCACATTGTTCTTCAAATCGAAA
TGGGCAGCTTTTGCACAAAATACGTTTGTTAAGAAGGATAACAGAATGGT
CAACGCCAAAGGATTTACATGCACCCATCCCATCCCTTTATCAGAAACAA
AAGTGGAGCCATTGAATCTACGTTTTATGTTGAGCAAAGGATTTGATGCA
CCTGAAATGGTTAAAGCTGACCAGGTCAACGCCAAAGGATTTACATGCAC
CCATCCCATCCCTTTATCAGAAACAAAAGTGGAGCCATTGAATCTACGTT
TTATGTTGAGCAAAGGATTTGATGCACCTGAAATGGTTAAAGCTGACCAG
ATCTCTGAAGTTTCGGATGTCGAATTAGCAACAGTCGACGGGGTCCATAT
GTGCAGATCTCTGAAGTTTCGGATGTCGAATTAGCAACAGTCGACGGGGT
CCATATGTGCAGCTTCAGCCGGCCAATCAGCTTGAACTCTATCGAAGGAT
TCAAATATCTTTACAATCTGGACTTATCAACAGATTTATTGAACATCATT
GTTTTTGGCAACAAAGTTGCTTCAGCCGGCCAATCAGCTTGAACTCTATC
GAAGGATTCAAATATCTTTACAATCTGGACTTATCAACAGATTTATTGAA
CATCATTGTTTTTGGCAACAAAGTTGATGGTACTGGCTTGGCTTATCACG
GACCGGACAATTATTTTGTCGACAAATCAAAACCTGCTGTTGATTGGAAA
ACATTTACTGATGGTACTGGCTTGGCTTATCACGGACCGGACAATTATTT
TGTCGACAAATCAAAACCTGCTGTTGATTGGAAAACATTTACTGGTGTTG
TTGCCGAAGAGATCGAACCATCTGCTGAAGTCATGCCAAGTTCATCTCAA
ATGGCCAGTATCTATGATACCAGTAGCATGATGATGATGATGTCATCAAA
ATCCATAATGGCATCCATGTCTGTGAGTGATAGTGTTGGTATGACAACTG
ATGCTATGATGTCTGTCAGTGACAGCGTGATGATGGAAATGTCTAGCATG
GTTTCTACTACGCCTGATGTTGCAATGTCAAGTAAATCAATGGTGTTGTT
GCCGAAGAGATCGAACCATCTGCTGAAGTCATGCCAAGTTCATCTCAAAT
GGCCAGTATCTATGATACCAGTAGCATGATGATGATGATGTCATCAAAAT
CCATAATGGCATCCATGTCTGTGAGTGATAGTGTTGGTATGACAACTGAT
GCTATGATGTCTGTCAGTGACAGCGTGATGATGGAAATGTCTAGCATGGT
TTCTACTACGCCTGATGTTGCAATGTCAAGTAAATCAATGGATGCTTCGA
CAACACCATCAGAAGAAACACCGATGGTCAAACCTTCATCTTCATCCACC
ATCATTGATGTCATCTCATCTAAAGCCCCATCCACACCAACAACGACCAC
ACGTCCAACAGTCAAACGAACCACAAAATTTAATTTGTCACACGCAACAA
CATGTACAGGATGCTTCGACAACACCATCAGAAGAAACACCGATGGTCAA
ACCTTCATCTTCATCCACCATCATTGATGTCATCTCATCTAAAGCCCCAT
CCACACCAACAACGACCACACGTCCAACAGTCAAACGAACCACAAAATTT
AATTTGTCACACGCAACAACATGTACAGCTTCAATCAGTGTATTGGTGAT
AGCTATTTCAGCATTGGTGACCATGTTGATGTAACTTCAATCAGTGTATT
GGTGATAGCTATTTCAGCATTGGTGACCATGTTGATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038104XLOC_038104-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000121_pilongenomesc0000121_pilon:957359..966073 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1042-1095:55
Aaloc871-1038:776
Aaloc625-870:1604
Aaloc541-621:2216
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Aaloc376-429:3622
Aaloc250-375:4107
Aaloc61-249:6957
Aaloc1-60:8716