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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000121_pilon:957359..966073- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038104 ID=XLOC_038104|Name=XLOC_038104|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8715bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:957359..966073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTGACGGTCAATTTATTGGTACTGGCTGGTTTAGCTTTTGTCAAGAC
ACAAGAAATAGTAAGTAGTATTATTATTCGCTTATTCGTTATTCGAATCT
TTCTATAATTCTATAACTTGTCTGCAGTCCTCGTCAAGGAGAAACCTTCT
TGAAATAAATTCTATAATTCGAATCTCTCTGTTATTCAAACAAATTAGAC
TCCCCGTTCGAGTTCGAATCAGCGAGAGTCAACTGTATATATTTAATTCA
TATCATTGAATCGAGTCCGAGTCTGAGCCCTATGTTGCCTGGGGGGGGGG
CATGATTTAAAAACGACCGTATGTGTGGCCTATAACTTCCCATAAAAAAA
AAAAAAAATGTTTTCATAAGGGAAGGGGTGAAAAACAAAGTCTGTGTAAG
TAAATCTGCGACCGCAGTCGGAGGCCCGAAGGCTCCTCTTTCGATAGCTA
TCTACCCGAAGATAGGAGATGCGACTCTTTCTCCCTGGATTTCTCCACTT
ACCCTTATTCCTTCTCTTAGGGGCTCTGACCATAGTGAATTTTTCATAAT
TGCCGTGTTTAAAATGTGTTTTCTGACTGATGTAACCAACAAAACTATGG
CATGTTATAAATTTCCTGTTAGACAAACTATTCCTGAATCTGAAAATTCA
AAAATTGCATTGAAAAAATTTGATGAAGAAGAAAATGAAGACTTTTGTGA
GGAAGAGTATTTCAACTTTGAAGAGCTTAGTTTCGGCGAAGAAAAAACAT
TTTGAAAACATTTTCGAAGTAGATGGTGTATCTTTTACCGAACAATAAAA
ATTTTTGTGGAAAATTTTTATAAATGCTTCTTTGTCTCGAAATCTTCAAA
ATAGTGGTTTTTCATCAATTTTTTATCTGGATTTTCCTTAAAAAGTCATA
ACTTTTGACATATCTTTCTAGAAAAATTTTCCGAAAAATTTAAAATAGTT
CAATTCTTTGCGGACAGTGTATATTAAAACTAAGCATTTTTTGTAAAAGA
GGGTGATGCAACATATTATTAACATATTTTTAAAGTTCATAACGTCATTT
TTGCAATTAAATTCTTAATTACTCTTAAGGGATTCGATTAAAAAGCAATT
TATAAAGGCAATTCTTTGTTAAAAGTGTTAAGGAACCTGAAATATAACTT
TTATGTTCAAATACCAAAATCAATTTTTGGACTATGGTCAGAGCCCTTAA
TTGCTGAGCATCAAGCAGAGAGGCATCATGTACCATTTTGAGATTCTGGT
ATGACCCGGCTAGGAGTTGAACCCACAACATTACGAACCGTAGCTGGATG
CTCTACCGCTGCACTACGGCCGCTTTTACTGATAAGTTATATTTGTTAGT
TTGAATGGTTCCGTAACAATGACTTTTATTAATTTATCAACTTGGCTAGC
CCCAATCTGAAGGTGGAAGCGAGGGTGGCAGCGAGGCACTAGCACCCGAT
ACTAACGCAATCGAGTTAGCTTTTAATGCAGACTTCGATACTGTAACGGC
TAACTATCCTGAAGCAGAAACAGAATTCTGTTATCAAACACGTATTATGC
TCGGTGTTTCATCCGAAGACTTCAGAGACTGTAGCATCCGTGCTGGAAGC
ATCATTGTCTCTTTCACTCTCTACCAATCAGACGCTGATGGAAACAATAC
GTTGGATACTCTCAAAGCTAAAGTATTGGCCGGTGAAATGACAATCACTA
TTGGTTCAGAAACATACAAGGCTAAACAAAATTCCACGGTTCTTCCCTTT
TTTTACCAGAGTTTTGAGAGCTGCAACAAGACATCAGTATGCGTCAAAGC
ACCTGGTTGCGAAACGCCACAAAACTGTCCAGCGTTAGCCATGTACCATC
ACAACACAACCACTGACAGACTACATTTCACATTGTTCTTCAAATCGAAA
TGGGCAGCTTTTGCACAAAATACGTTTGTTAAGAAGGATAACAGAATGGT
ATGTGTATACACGTTTTTCTAATAAAAACATCCAAAAATATTTTGTAGCC
TCGTTCGTAACGTTTTGGATTTTAAACCTAAAAATGTTCTAAAAACGTTT
TATTTTCAACGTTTTGTGAATATTTTTACCCATTTTCCTAAGAGAACAGG
TGTTTTTGAGTTCACAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTTGTTCTTAACA
TTTTGGCCATCGAAGCATTATGTTCTGATATAGTTTGTTTTTTATATAAA
AAAACATGTACTCGATTGGTTTTTTAAAACTTCTAAGTTAAGTTTCTTAA
GGTGTAAATTCAATGTTCACCAATGACACGTCTAAACAAAGTCCTCCTCG
AACTTTTTTATAGCCATCTTATTAGATGTTTTGTTTCTTGCAATAGTTTA
TCGTTCAACTTGGAGAGGGAATATTTGTAAACATAGGATTTTTTCTTCAA
CTTTTCTCAAGCAAGAAAAAATTAAACCTTCCTTAAAATTTCCGCCACTT
TTGTAACGCTGGATTAAAATCAGTACTTTCTTTATTTTCATGCGTTATAT
TTTTCGAAACCCGGTAGATTTTATTATCAATCCGGTATTTGCAAAAAAAC
TACACGGGTCACGCGTTTTGGTTGGAAATAAGTGGCTTCATTTCCCACCC
AAAAAATTCCACTCTAAAGCCTCTTTGGGGGTTTCAATAGACGATGTTTT
TTCGTTTGTTTTTTTTTTACCTTTCCGGTTTTTTTTTTGTTTTTCACATA
GTAACTTTACACAAGGAAGTATACATTTAAAATGGTAGCTCGCTATAGCA
ACGGAAAAATAATAGGCTCGTTAGATTTACGCACTTTTGGTTGATTTCCA
GTAAATGCATTCCATAATTAAAAATTAATGTACAATTAATAGGGTCATTA
AAAATATAGGAGCGCCAATAATAAGGTCGTCCAGGAAATTAAAACCTGGT
CTTTCCGCCATGAAAAATTAATTGCAGCAACAAACTTTTTTCATAAGAAC
TTTCGATTGTCTATTGTGTAAGCCGCCCGGCTCTTCTTACTTTTGAAGCT
CTGTTTAGCGTCCAGTCATTCCTGAATTCATGTCTAAACGTATCGAAAAA
TTTGAATCCACGGGTTGCATAATTATAGCAAATAGCAGTGCAGTCATTCG
ATTACTCGAAAATGTTCACGTGATTTTATTCCCATGTTACTTGCTTTACA
ACTTACAGCTGATAACTTTATTAGTGTCAATAAATTCGAATTAATCAGAA
ATAAATGTCATGTAACTAGCACATAAAAAATTCGAGTAAAAGCGTGATTT
GTCTTCAAACTTTAATTGTGCAGCCTATGCATTAACATATCCAGGGCGAA
AGAAACGGCTATTCACGCGTCACCCAGAACTCCGGGGAGCCCCAGTAAAC
AAAGATATTGACATATCACGTTTTTGCAATCTCAGTTCAAACCTTTGATC
TTGTGTGCCAGTTGGCGTGGGATGAGCTGGAGTTTTTATAAGATGTTTTA
TTCATTGGTTATTTGAAATAATAGAGATGACGCGTTCTTTAGAAAAAGCA
ATAAAATCCTTTGTCTCAAGATTCAACGACCAACCGAATCATAGAAAACC
TTGTAAAAACTCCAGCCTGACCCGTTGGCGTTGGTATCTTCTGTCAAAAC
TTTGGTCGAAATAGAGAAATTTTATATCAATAAAAAGGAAATTGAACCTA
ACCTTTTAACCTTCTTAAAAGAAAATCTTCAACTTTTGCCGGTCCATTAT
AAAGTTATTCAAGCTCTTCCTTTTCACTGAAAAGCCGTAAGGATATGAAT
TATTTCCTACTGGATTAATAAAAAATGAACTCTCCTAATTTTCAAAGTAA
TCGAGAATCGATATTTCATTAAAGATTTTCGATTGACATTGAAAATGGAC
TCGTGGATCCCCTCTCAAAAAAGCCTCAAAATCCTATCTTCTGTCGAACC
AAGCACATGTAGTTGCGCCCTAAAAAAGATGCTAAGGACCCCAAGAGTTT
CATTTTTTCGGTATAGAAATTTCGCCAGGTCTCAAACAGAACCGTTGATA
TCACAGTGTACGAATATTAAACTGTGAAAAGAAACAACGGCTTTATTCTG
CACCATCAGCAGAAACAAAAGTGAAGACAAATTACAGAAAAATAAATACG
TGTTTTTTTTATAAGCATAACGCTTATAAGCATACGAAGGCTCTGATTTG
CAGAATTCCTACGCATAACATAAGCATAAATGTCAGCCTGGAATATTTTT
CAAGTTGTCATTTTTTATCTGTTTAAAAAGGTTTGATAGAGGTTAAGTGA
AAAAGACATTCCAAGGCTAGCTACATTCAAATGCTTCCAAAATCTGAATA
AATCTTTACAAAATTTCTGAAATTTCACTAAAAACTTGGCTCGAGGTGAA
TCATAAGCATGATTCATAAGCATATAATAAGCATAAGCTATGGCTGGATG
CTTTAAGAACTTAAGCATACACGAGCCTGACCAAGGGGCATACACTTGCT
TATAAAAAAAACATGTATGATACAATCTACTTAAGGTTTACACGAGGATA
TACGCTCTCCATCTCTGCTTTTTTAATGCGATTGAGACATGCGCGATAAA
ATTCTTATAGACCGTCGCCACAGGTTAAATTTCATTAACTATTTGATGTT
AAATTTCAGGTCAACGCCAAAGGATTTACATGCACCCATCCCATCCCTTT
ATCAGAAACAAAAGTGGAGCCATTGAATCTACGTTTTATGTTGAGCAAAG
GATTTGATGCACCTGAAATGGTTAAAGCTGACCAGGTGAGTTTTTACTTT
TCGGGTTCATGTACCAGGGAGAATCTTGATAAACCTTTTCTTTACAGAAG
ATACACACTTTGAAAAAAAATAGTATAATAATTTTCCCTAAAACGTCTTC
CCATCGCGAGATGTTTGAATTGAACTTTTTTCGTTCAATATCAGAGACAG
CCAAGATCGACAGAACGTGAGCAGCTCAAATCTTTACTTGGCAAAATATT
GAAAGACTGTATCATGTCAAGGAGGTCCTCATACTCTCCTTCCTGGTGCC
AAGTTTGAAGCATGTTAGAATATTCGTAGATTCTCATGATGCTCAAATTT
CAAATATCTTGATTTGTATATAATTTGTTAATTTATCTTTTCAGATCTCT
GAAGTTTCGGATGTCGAATTAGCAACAGTCGACGGGGTCCATATGTGCAG
GTAATAATATGTCATCGATATGTCATGTATCTTATCATGTCATGTACTAA
GACTAAATTGGGTTATTCCCAATTTGTGTCTTTCCGGAGGGACCCTGCAA
CCCAATTTTAGCTGCAAAATATCGTATACTATTTTCCCTGGGGCTATTTG
TTACGTTGTTGAAAACTTAAAATCCTGGCACAATTTACGTCCACCCTTTT
TACGTTTGCCTTAATTATGCCACTGGCCAAAAATAATAACACCGATAAAA
GCCAGCCGATTAAGTATTTCCAATTTATATCTGTATAGCTTCAGCCGGCC
AATCAGCTTGAACTCTATCGAAGGATTCAAATATCTTTACAATCTGGACT
TATCAACAGATTTATTGAACATCATTGTTTTTGGCAACAAAGTTGGTAAG
TATAAAACTTACTTTAATGTCTGGAAAATTTCGCGAGGCAGGCTATTCGC
GAAATTTCGTATTTTTCGGGAATTTAATTTCTCAATTTGACTTAAAAGGT
TTTATTTTTACATAAGTGTTCCCGTTTCATATCAGGCACATATTTCATAT
CAGGACAGTGTCCCCCTATTGTTTTTTTTATCATAAAGCGGACACAGTGA
AGGTATTTGTTTTGATGACTGTTAAAGTCCCTCTGCTGTAATGTATAAAA
ACTTTGTAAATGAAAGTTTGCGTCTTTTTGAGCATTTGAGCATTCTTGAA
AATCGCGAGTTTCTGGCCGCGAAAATATCTGACATTAAAGTATTTTCTTT
ATTATGATACGTCCTCTATTTTAATTCACATGGATAATTTGTTTTTGCTA
TATAAGAACAAATTTTTTTCCATTTAGTACGGGAAGATGTTCGTGTATTT
CCATTTTCTCCTAATTATAGCGTACTGTAGTCAATTAGGCCTATCTGCAC
CAATGGGTGCCTGCCAGAAAAATAACAAACAAATTTCCAAATTCGGAATC
TCTTAGTTTTATAGTTTTCCATTTATAAAGTGCTAATAAGTGTCATAAAG
TGTTAGTATTACCCAGATTCAGATTTTATAGAAAACAAGCAGAAAACCCA
TACTACTTACCCTAAGTATCAGAGGCCGAGTTTTCAAAGTAAATATCAAC
CCTCTGACGACGAAGTGTTGAAATATTATCATGGATGTGTCAATCTAATC
ATTGTGGAAAGAATCAAAGAAGAAGAGCAATAGTTACTTTTCTTTGCGTT
GATTGCGCTGAATAGAATCGTGATTGGTTGTCACAGGTCGGAAAATGATT
TCAGCATGTGATTTTAACGGTGCATAATACTATATATTATACGGATTATA
AACGACTCCAGTCTAGTATTATTATACCCTTTATTTCATCATTTATAGAT
GGTACTGGCTTGGCTTATCACGGACCGGACAATTATTTTGTCGACAAATC
AAAACCTGCTGTTGATTGGAAAACATTTACTGGTAGGTATTCTGTTTTGA
TTATATCATTCGAGAGGCCCCAATAGGAGTCTCTAAGTACGTCATCACGT
CGAAAGAGTAGAGGCCACTATGTCTTCCTGAAGCTTTTTCTCTACTACGG
CTATTCCAAAAAAGGGACGCTTTGTGTAAAATTTCAGAACGTTAGGATCT
TTTCCAGTCAAGGAAAGAGATTTCATTGTACAGTTCATTGTACATATAAT
CTAGATTTGGCATGGATCGCTTTTGTATTCGTTGTTGCTTTCCACTGGAC
AAGATCGTCATGCTTTCTGATTCACTTCAGAGAAGCACATGTATACCTGC
TTGATGGATAATCTTATCAAGTCTTCTAATTCAAGCTATTTGACATTTGG
TTTTTTATGTAATCTAATCTAAAACTTCAGTTTGGAAAGTCATATAAAAT
ATAGTTTTTCTCTAATTCGATGAAATTTTTAGTTCCCTTCTTAAAAATCG
AAATAGAGAGAGTCTAGCCAGGATGTTATCATTAATAATGTTCTCTGTAT
ATTTTCATAGGTGTTGTTGCCGAAGAGATCGAACCATCTGCTGAAGTCAT
GCCAAGTTCATCTCAAATGGCCAGTATCTATGATACCAGTAGCATGATGA
TGATGATGTCATCAAAATCCATAATGGCATCCATGTCTGTGAGTGATAGT
GTTGGTATGACAACTGATGCTATGATGTCTGTCAGTGACAGCGTGATGAT
GGAAATGTCTAGCATGGTTTCTACTACGCCTGATGTTGCAATGTCAAGTA
AATCAATGGTAAGACCTTTCCCAGCTGGCATACAACGTTGTTTCAACGTT
CATTTAACGTTACATGGACGTTGTGAACGTTAGATAAACGTTGAAACAAT
GTTATGTGCCAGCTGGGTTCGCTTTTCTATCTTCGACCATATTCGATATC
TGTTATTAAATCTCAGGTGAGTCTTTTTGCAGTGAAAAGGTTCCTCTGAG
AAGAAATTTTTTGAAAAGGAGGCTAATACAGCAGAATTAGGACAAAAGAG
GGAACTGTCAAAGATATAATAATAAGCGGGGGGGGGTTGGAATAAGAATG
TCCTGTGTGGAAAATTTTCGAAAAATTAATTTTTTGTTTCGCAACCATAA
CTTTTCGCAATTGTAATAAGCTAAAACACACGATAAGTTAGTAGTCTATG
TATATTGCAATAAAGAGCATACATTGATGAAGTAAAGAACGCCTACTCCC
GCCATAATGGAAACAAACGTTCGATTTGCGCAAAGGATCGCCTCTATAGA
TTCGAATGTTTGCTTACATAATGGCGGAAATTACGTAACTGGACTAAACA
TAAGCTCACGAGATTCCTAATGATTATCTCACTATTCCAGGATGCTTCGA
CAACACCATCAGAAGAAACACCGATGGTCAAACCTTCATCTTCATCCACC
ATCATTGATGTCATCTCATCTAAAGCCCCATCCACACCAACAACGACCAC
ACGTCCAACAGTCAAACGAACCACAAAATTTAATTTGTCACACGCAACAA
CATGTACAGGTAACTTAAAGAAGTTTACACCTCGAAGTAAAAGGAAACAG
CATTACTATACCCCTGTTTCACAGACCCGCTGGGATTTGGCAAAAATTTC
GTCCCCGGCGGAAAACTTTAGAACTTTTCCCCTAATTTCTCTCTCTCCAT
TTTGGTTTAAATTTCATCAGAACAGAACTATTCTCAAGTGAATCTGAATC
TACCTTAAGTGGATTAATTTTGGCGAATTTGGTGAATTTTGTTAAAATCC
CGCCAAATTAAATCCCCGCCAAAATTTCAAAAACCGACCATTCGCCAAAT
TAAATCCCCGTCAAATTTAACAAAAAGAATATTATGTAAAAAAGAACAAC
TTTTCAGTATATTTTATAGTAATTTTTACCCATTTTAGTGTCTCAAAATT
TCCAATTCGCCAAATTAAATCTTCGCAAAATTTTATGAAATTGATCTATC
ACCTAATTAAATACCCGTCAAAAATCGTATTTTGGCCGATCGCCAAATTA
AATCCACGCCAAAATTTATCCACTTAAATAAGTTTTTTTTCTTCTTTCTA
TTTCTGCAGCTTCAATCAGTGTATTGGTGATAGCTATTTCAGCATTGGTG
ACCATGTTGATGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000121_pilon:957359..966073- >XLOC_038104 ID=XLOC_038104|Name=XLOC_038104|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2190bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000121_pilon:957359..966073- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTTGACGGTCAATTTATTGGTACTGGCTGGTTTAGCTTTTGTCAAGAC ACAAGAAATAATGTTGACGGTCAATTTATTGGTACTGGCTGGTTTAGCTT TTGTCAAGACACAAGAAATAAGTTTTGAGAGCTGCAACAAGACATCAGTA TGCGTCAAAGCACCTGGTTGCGAAACGCCACAAAACTGTCCAGCGTTAGC CATGTACCATCACAACACAACCACTGACAGACTACATTTCACATTGTTCT TCAAATCGAAATGGGCAGCTTTTGCACAAAATACGTTTGTTAAGAAGGAT AACAGAATGAGTTTTGAGAGCTGCAACAAGACATCAGTATGCGTCAAAGC ACCTGGTTGCGAAACGCCACAAAACTGTCCAGCGTTAGCCATGTACCATC ACAACACAACCACTGACAGACTACATTTCACATTGTTCTTCAAATCGAAA TGGGCAGCTTTTGCACAAAATACGTTTGTTAAGAAGGATAACAGAATGGT CAACGCCAAAGGATTTACATGCACCCATCCCATCCCTTTATCAGAAACAA AAGTGGAGCCATTGAATCTACGTTTTATGTTGAGCAAAGGATTTGATGCA CCTGAAATGGTTAAAGCTGACCAGGTCAACGCCAAAGGATTTACATGCAC CCATCCCATCCCTTTATCAGAAACAAAAGTGGAGCCATTGAATCTACGTT TTATGTTGAGCAAAGGATTTGATGCACCTGAAATGGTTAAAGCTGACCAG ATCTCTGAAGTTTCGGATGTCGAATTAGCAACAGTCGACGGGGTCCATAT GTGCAGATCTCTGAAGTTTCGGATGTCGAATTAGCAACAGTCGACGGGGT CCATATGTGCAGCTTCAGCCGGCCAATCAGCTTGAACTCTATCGAAGGAT TCAAATATCTTTACAATCTGGACTTATCAACAGATTTATTGAACATCATT GTTTTTGGCAACAAAGTTGCTTCAGCCGGCCAATCAGCTTGAACTCTATC GAAGGATTCAAATATCTTTACAATCTGGACTTATCAACAGATTTATTGAA CATCATTGTTTTTGGCAACAAAGTTGATGGTACTGGCTTGGCTTATCACG GACCGGACAATTATTTTGTCGACAAATCAAAACCTGCTGTTGATTGGAAA ACATTTACTGATGGTACTGGCTTGGCTTATCACGGACCGGACAATTATTT TGTCGACAAATCAAAACCTGCTGTTGATTGGAAAACATTTACTGGTGTTG TTGCCGAAGAGATCGAACCATCTGCTGAAGTCATGCCAAGTTCATCTCAA ATGGCCAGTATCTATGATACCAGTAGCATGATGATGATGATGTCATCAAA ATCCATAATGGCATCCATGTCTGTGAGTGATAGTGTTGGTATGACAACTG ATGCTATGATGTCTGTCAGTGACAGCGTGATGATGGAAATGTCTAGCATG GTTTCTACTACGCCTGATGTTGCAATGTCAAGTAAATCAATGGTGTTGTT GCCGAAGAGATCGAACCATCTGCTGAAGTCATGCCAAGTTCATCTCAAAT GGCCAGTATCTATGATACCAGTAGCATGATGATGATGATGTCATCAAAAT CCATAATGGCATCCATGTCTGTGAGTGATAGTGTTGGTATGACAACTGAT GCTATGATGTCTGTCAGTGACAGCGTGATGATGGAAATGTCTAGCATGGT TTCTACTACGCCTGATGTTGCAATGTCAAGTAAATCAATGGATGCTTCGA CAACACCATCAGAAGAAACACCGATGGTCAAACCTTCATCTTCATCCACC ATCATTGATGTCATCTCATCTAAAGCCCCATCCACACCAACAACGACCAC ACGTCCAACAGTCAAACGAACCACAAAATTTAATTTGTCACACGCAACAA CATGTACAGGATGCTTCGACAACACCATCAGAAGAAACACCGATGGTCAA ACCTTCATCTTCATCCACCATCATTGATGTCATCTCATCTAAAGCCCCAT CCACACCAACAACGACCACACGTCCAACAGTCAAACGAACCACAAAATTT AATTTGTCACACGCAACAACATGTACAGCTTCAATCAGTGTATTGGTGAT AGCTATTTCAGCATTGGTGACCATGTTGATGTAACTTCAATCAGTGTATT GGTGATAGCTATTTCAGCATTGGTGACCATGTTGATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000121_pilon | genome | sc0000121_pilon:957359..966073 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1042-1095:55 |
| Aaloc | 871-1038:776 |
| Aaloc | 625-870:1604 |
| Aaloc | 541-621:2216 |
| Aaloc | 433-537:3277 |
| Aaloc | 376-429:3622 |
| Aaloc | 250-375:4107 |
| Aaloc | 61-249:6957 |
| Aaloc | 1-60:8716 |
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