XLOC_037818 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037818
Unique NameXLOC_037818
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000144_pilon:568422..577897-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037818 ID=XLOC_037818|Name=XLOC_037818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9476bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000144_pilon:568422..577897- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTCTATCAGTGAACTCCCTTGCTATACGCTCATCAACCATCCATC TGAAAGTGAAAGCTCTTCAGAGAACCAACTGAAAGCTGATTTGGGTAAGT GCATTTTTATGCATTTGTATTTTTGGCAAGTAATATCATTGTCTTTTCTC TTCAAAGTTTTTACAATTTTGACATACTTCATACTGGGAACCTGAATACC TTTGATTACCTTTGATGTGTTTCAGCAAATTCTCTGCTCACTTAACCCGT GGGGTCCGGTGTTTGACCATTTCAACAATTGAATTCGAGTCAGCCATCCT GTAAAAGGGAGATAGGCAAGGAGCAGTGGCTTGTCGGGAACATCTTGGCC AGTCTGGAAAGGAGGGAAATGTTACGCTGGAGCTGCGCCAACTTAACTGG GAAAAGTTGAAGGCAGCAGATCTCAAACCTCAAATCTATGCCGGAGATAT CCGGCAGACTGGCATCTTGGAGAAATTAAATTGATCAAGTTGTTTTTTGA AGGAATTTTTGGAACATTTGGTCATGTCACGTATTTTTCTTGGTAACACA TTGAATAGTCTTGGGCAGTTAGTCACACTAGCGTCCCGCCAAAACAGTTA GTCACACTAGCGTCCCGCCAAAATGCATACCAAAGATTAATGCTGCGAAA GTGCTATATCGTTTACTTGACTCTCGAGCAAAAATATGCACCGCAAAACT TCTAAAGAGATTCATGAAAAAATAAACCGGCACTTTTTAATGAAATTAAC ATTTTCAAAAACTTTGAGAAATTGCCTAAAATTTGAGCCATAGATGAAAA AGTTTGAGCCAAGCCAACCTTGAAAACTAATTTGAAGATCAACTTCACAA GAAAAAGATCTACGGGGGAGGCAGAACCCACCTAGATCCGCGCACCGCCG GATAGGCTATTTCCCAGAAATTTTGCCGGACCTCAAACAATGACCCATTT 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AAACATTTAATTTGACCCCCGGTTTTTTCTCTCTTTTTCTAGCTAGTTCC CGCGTGTCAGTGTAGACACAACTTTAATCCGGGGAAATAAAGCGTTTTCA TTGGTCTAAAATCACGGATGGTCACGTGACCAGAATTTTTATCCAGGGAA ATGCCGTGGCGGCAATGATTTGCTTTAGTGAGTTTGACCATTTTATTGTT TTGATTTGAGCGGGCGAAATTTCTGTACAAACCACAATATGGCTTCGTTG GAAACACTTGTGTTCACCATAGTTAAAATTTGGCACCAGTTGTTCGATTA TACACCATGTATATATAATTTGGTATCTTTCGCGTCTTCTCTCGAGACTG TACATATTGAGGTGTTTGAGGTTCTCCCAATAATTCAAATTGGGTGGAAG TTGGATCCCTTTTATAAAGGATTTTTGCAGATACTCCAGTTCTTGCATTA GGGATCGCTTTGTAGGAGACCATAGCTGGGAGCAGTATTCCAGATGTTGA AGTACCAATGTCTTCCAAAGAGTGATCATTACTGATTTATCTCTGGACTT GAAGGTTCTGTATATCTAGGCACTTATACCCTTGACCCTGTCAGTGATCG TTTGAATGTGCATTTTATATGACAGGTTGTTTGAGAGTAGGATACCCAGG TCTTTCACTGCACTTTTTATTTCGATTGGCTGCTGTACATCTGATTTGTA GACTGAGTGTACTTTCAGTTGTTCATTTTTTCCGTATGCAATGTGTTCAA ACTTTTTTCCATTGAGCTCCATATTGTTGATAGATGTCCAGTCATAGACA ATGTCTATAGATCATCTTGAAGCAGACTCACATCTGCAGCACAAGATATT GCCTTCATAAGTCTTGTGTCGTCAGTAAAAGATGAGAGGACGGAATGTTT AATCTTTTCGTTTATGTCACTAATCATTACCAGAAACAAGAGGGGCCTTG TGGAACTCCGCTTGTAACTTTCGCTTCATCTGACAGGAACGTGTTTATGG AAACTTTTTGGTATCTCTCAGTAAGGAAGGATTGTATCCAGTTCAATAGT TGTCCTTTGATTCCATTGATTTTTAGCTTATGTAGCAAGATTTGATGGTC CACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCAAGGTAGATTACATCAACATTTT CATTGTTTTGTAGGTGAGATATCAGTCTTTCTACATGAGCCAATAGTTGA CTCGCCCTGGTCTGAAACCGTGTTGTGTTGGATTGTATAGGTTATTTTCT TCAAGGTGGGTTTGCAATTTCTCTCTGACTATTTTCTCAAATATTTTAGT GGTAATTGATGTCAGGGCAACAGGTCGATAATTCTCTGGTAAACCTTGAT CTCCTTTCTTGAAGATTGGTGTAATGTGGCTTGTTTTGAGAATTTCAGGT GTGATTCCTTTGTCAAAGTTGTTTTGCCATATCATCTTAAGTGGCTTAGA AAGTGATTTCTTGCACATTTTGAAAAACTTTGCTGGCAAGCCATCTGGTC CAGCTGACGAGTTGGCTGGAATTATGGAGGTATAAAGAAACAGGAGAAGT ATGCTATTGTAACCATGCTCGCCCTACGATTAAAAAAATTACGAGGTATG CATGCTCATAATCTCATATATCGTGCATTTTTAATGAGCTCTTTTGTTGA TAGGTGAAATCTTATTGGCTAACTTAAGTGTTGGAAATAAGATGAGACGA GATTCATTGTTTCTCACATTGGTGTAAGAAAATATTTGGATTAAAAAAAG GCCTGTAAACTTTGCAATCCTTCATCAAATGACAAGATTTTTCGATCAAT GTTTTCTTTAAGGTGAACTCTATTGCTTGATACTTTCCTCCAAAATTCTC CAGCGACTTTTTGTCTACAAATTGGATCTGAAATTGTGTGTGCTTATATA TAAAGAACTTTTTATTTTCTGGCTGGAGAAAATATCTTTTTCAAAAAAAA ATTTAATTGATGCAGATTGATGACAAAATTGAACGCAAAATCATTTCGTG GAGCTAAATTTTATTTTATTCTCGTATATTAGAAGGCTAGAAATCCTCGA TGCTGATAGTAAGAATATTCAGAGCAAATTTGAGTTCTACTAAAAAGTCG TATTTCATCGGGCGAGCCTAGAATTTCTTTTGATTTATTACATAAAAGAA ATCAAAAGACTTTAACGACCAATTACCGACAAATTCATCTCCTGTCTTTC TTTATACCTCTATGCTGGAATAGTGTCAATTTGTTGGATGAAATCATCTT CTGTGAAAGTAATGTTCTCAAGGGTCGAGGAGTCTTTTGTCTCATTTGAA TTCAGAAAACTGTTTTGGAGTGGTAAATACTGAACAGTAGTGCCTTTGTA AGATGTTTGCCATCTCTTGCGAGTCAGATGTTAATTGGTTGGTGGTTGGA TTTTTCAGTGGGCCAACTTTAGGTTTAGTTTTTGAGAATCTTTTTGCATA GGAGTAGAAGTATTTAGGATTGCTTTTGATTTTCAGTGAGGCATCCAGCT CTGCTTTATCACGTTCATTTTTGTGGGATTGCTGTAGCATCAGTTCAATG TCAATTAGTTTCTGATTTGTTTTATTGGTTTTGAAATTCTTTTTGGAGAG TCTTTTACGTTTTCTCATAAGAATACGACCATCTCTTGGAATCTTTGAAA ATTTTTTTGGAGGTTTTCTCTTTGGCAAATGCTTTTTCACAATCAGAAGA CATTTTTCAAGGAAGTTGGGATATTGACGATTTGGGTCATATAGATTTGT GTCCAGCTCTTGAGACCAATTAATGTCTGTTAATTCTTTGTTAATAATTT CCCAGTCAATTTTATCACTTTGGAAGTTGTAGAGGTCAAATTTGCTTATT AAGTTACGTTCTTCAGTTTCTCCGAATTGATTATCGAAATTCAAATGTGT TGTAACATCTACAACAAGATGATCTGAATAGATAGTAGGTGAGCATGTGT AGTTAAATATAGTGTCTGTGTTGTTTGTGAATAAAAAGTCTAAAATATTA CCATCACTGTGTGTTGATTTGTGTATCATTTGATTAATGTGCAAGTCTGC TTTAAAAACATTTAAAACGTCCAGAAGCTGTTTATTTCAATTTTGTGTTG GGGTTGAAGTCTCGTCATTAAGAGGTGTGTGTGGTATGTTAAAATCCCCA AGGATGTATGTGTCAGGTGTACAATCAGTAATACTATCAATTTTTGCTAT CATTGCAGAAAGGAGTTCTTGTAATTCAGGTGCTTCAGATTTGTGGTCTG GATTGTTGGGTTGTCTGTAGATAACACAGAGAAGAATATTAAATTTTTTT GATAAAAGCATCAATGCTTCACTTACTCCATTCGAGAATTCGAAAATGGG CTCGAAGAATGGTGCAATGTCATTACGCACATAAAATGCAACGCCTCCGC TTGCTCTGCCATATTTCGATTTTACTCTGTCTCTGTTTTTCTTAAAAAAA GTGTAATTTTCAATCTCAAGTTCTCCTTTTTTTGTGATTGTCCGTTAACC AGGTTTCGGTTAAGCCTAAAAACAGTTGTTTTGAGCTGTTTGTAAGATCT TTGAGGTAGGGTACAGATAAAGGTTTTGTTTGTGGGCAAAGTCCTTGTAT ATTGACAAGCGAAAACATATTCAGTGTAGGTTTAGAAGTAGTTTTGGTTT TCGGGTCAGCATCAGTAAGGGCAGTCACTGTCCCAGTAGATTCCTTGGAA ATGTTGGCTCCATTGTTGGGTGCTGGGGTGGTAGATGATGTAGGGGATGT TGACGATTGAATGTTTGTTGAGGTTGATGTGACAAATCGTGGTTCCTGAA TTGTATTTGTTGGTTTTGGTTGCTGAAACAATTGTTCACAAGAGAGATTA TTTCTGTGCGAAAGTTGTCCAGGATTGCGAGAAAATCCTGAGGTTCATCA TTATGATTGTTTTGCTTTTTCTGATGTCGTTTGGTTCCCTTAACATGCGT GAATTTGCAGTCAAGATTAAAGCATTCCCCTCTTGTAATAGATGATGAGC ACATCCTCGGGTGGAAGCTTTGGCACTTGGTACCTAGGTTGCAGCCTCTT GGTTGTTTGTTGCCATATTTGAGCAATTTTGTACAGGCTTTAGGATGGAT AAATAAAACCTTATAGAATAATTAGATAGCTTAACCATCTGATCATCCCT TTACACTGGCTAAGATTATTGTATAAGAGTAGAGAAGTGGCTTGATTTGC AGGCTGCAAGCAAAGCAAAATTGTGAGACTATTTTTTGTGTTGCCTTTTT TAGAAGATTTTATTGGTGAAATTCTACTTTTATTTTAATTTTTTCTTTGA CCGACCCACCTTCTTTTTTTGGGTAGCTTGGCCAGTAAAACAACAAATTA CATTGGCCTTGCCTAAGGGTTACAAAAAGAACAAAAACTCCCAAGTAGAC CTTTTTGCCTTTCCATCCGTCATCTTGAATTGTACAGTATGCAAAAATAC AGGAACGAAAAAGCCGTGGTTGGATTTAGTTGGACAATATGCAAAACATA TGCAAGTTTACTCAAAGACTAAAAAGACAACAAAGCATCTTATAAAGAAA TATTATAATCATTAGAACAATAAAAGATGGAATTTCTTAATCCAAAAAGA AATATTTACAGAACAACAAAAGCCTTTTAGAAATTTGTTCTTAAAGACAT TGCATATTCTGTTTTCATGCCATTAAAAAATTCCACCAAGACAGAGTATA TACACACATCAAACTTTCAAAACACGTAAATTGAAAGCAGTAATTATGAC GTCACACATTCAGCGGGTTCAGATCAATGTTTTGATTTGATCCTTTGGCT GTTCTATTCCCAGGAGAATAATTTGTACCGTCAGCCAAATAAGGATTATT TTTGTACCTTGGCAGGTGATTTTTCAACTTGAGTGTCTATGTTATGGTTT TTTGAAGTGCTTGTTCTAAGAGATGAGTGAATTTGATTATTTCAAGTTAT CAAAAGAAGCAAATTTAATCTTTCTTCTACAAGATTATATACACTTTAAT ATATATAATGACAATTATGCATTTACGTTTTATATTAATACTTTCTTTTT GCATATGTTTTGCATACTTTCTAAGAGAATTTCACCACGGCAATTCGGCC ACCATAATTTTTGCATACAATTCAATATGGCGGATGGAAAGGCGAAAAAG TCGCGAGTGACGTCAAACGCGAGTGACGTCAAACGCTCACATTCGCGCGT GTTTCACTACAGATTTTTTTCATATTTCAATTTAAAAGCCTACTCGGTGC GAAAGAGAAATCGTGTATTTTTTAATACCCGGAGGTACTGGAGGTCCCAT AAATTAACCTTTGTCCATTTGTCTGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTTGA GATTGGCTCATAAGTTTTTTCTGATTTATGGCACAATGGTGCAAAATAGT AATTATATTATATATAATGGCCAAAATGTGACTGACGAAGCCTAATTTTC AAAAAAAATGGTAGAGTAGAGCTGTGAGTGGAGCTGCATAGTTCATTTCT TTTGGAATTTTGCTGCTTTGATTGGTCAGTCATTTGATGGCTATGCAAGT TTCCCTCCTCTGATGCAAGTTACCCGACTTCACGGTAGCTTTTACCCGAA AAATTGGGAAACGGATCAGAATTTTTAGGAAGGATGATTTTCTTACAATC ATTTGTTTCCCCGCTCCAGCTGATGACTTCATTATTTCAAAACAGATCAA AATTTCTGGTAGATGGCATAATAAATTGGTAAATAGATGTTTTCAAAAAG TGAATTTTCTAAGGAAAAACAGATATCAATCACAAACAAGCGCGGGAAAA CAGAAAAAGATTTATAGGATTCTAAGGGAGGGAAACAGATCAAATAAATT GGAAAAACAGATCAAAATTCTAACTCGGGAATTTGTAGAAAAATATCAAA TTTTCTAGGGAGGACAGTTTAAGATTAATAAAACTTTGGTTTTTGAGGAA AAAGAGATCTTAATTTCTAAAAATAAGGTTTTGGAAAGCTTTATGTCTGG GGAAACAGATGTTTAAAAAAAGGTCCTCGCTAGATGCTTTCGCAAATTAA TTGAACACAATCGAACGCAATTGAATAATTTTAATTTGATTGTCCAACAC AATGGAACCGTAATTGAATCCAAGGATTTGCTGTTCATTTGCTTCGATTA CATTCAATTGTATTCGATTATGTTCAATTTATTCAATTACATTTACTCGC TTTCATTGCTCTCATCCCGTGCTGTACTTATACGCTCATCCATTATCTGA TTTTCCGATTGCCTATTACATTGGCCGTCGCCCGCACTAAAGCTCTAAGA GAGTGGGATAATTTAATTACAATCGCAATCGAACTAATCGACATTACCAA AACTCAATAATAATAATACCAATCAAACACAATCGAATATTCGATCGAAT TTTTTTTTATTTATAGTCCGGCGGCGAAAAGGGCTTTTCTGCATCAACCC TTACAAGTAGTAAATATGGGTTTTTATTTTATTTTCTCATTATATTGTCC TTTGGGACCCCAAAACCGGTTTTTGCCAAGCTGGCAAAGCTGGGGAAAAT TTTTAACGGGGGCTTGAAGGGGGTAGGGTCATTTTAGCCTGGGGTCCTTA AAAAGTCGATTTTTGAAGTTCTCATTTAGCTAAAACTGATTGTGCCATCA GATAGAGCTTGAAGAGTAGATCTCCAAAATGGGGTCATTTGTCATATTTG ACGGACTTAGTCTCCCGGAATTGGCTGATACGTCTTCAAAAATGCAATAT TTTATGCTGACGTCAGCATTTTTGAGAGAATTTCCAGCGAAAGATATCAG TTTTAACAGATGCGTCTCGAAGTGTACTATCGATTAGAGGGGTCATTTAT AGAGTTTCCTAGGCTAGATCATGAGATATTTGAGTTTGAAATTTTGCTGA CTCAGCGTTTTTCAACGTTTTTTGCCCTTTTCTGCTGAGTATGTGTATTT GATATGAATGACTGTAATGAATGCAACTTTGATTGAGCGCATAACTCTAG ATTCTTTTCCAACACTAGAGACGTAGGTTGGTTGAGTCTTCAAATTAATC TTCTCTATTTTCATTTTATATTTGCGTCTATCGATAGCTTTCTTTGGTCT TCAATTTGTTCATCAATTTTGTCGCTTCGAAGTAGCTGGTTCATGCTGTT TACGCTTAATTGATCTTTGATTTTAGTTGCTTCACAATTTTGCTCACAGA CAGTTGCTTGTTTTTTTTTCTAAACTTAAAATTTTCTTACAATTAAATAC AAAACCTCACACATCAACCTTGCTTTATAGAGAATGGAGATGTCAAAGTC CGAACTGTTGCTCTTAAGAAAGTCATGTACCAAATTTTGAATGGTGAAAA AATGCCTTCACTACTGATGACAATAATTCGGTTCATTCTACCCATGCAAG ACCACCAAATCAAAAAGTTATTACTCATCTTCTGGGAAATTGTCCCAAAG ACTGGAGCTGATGGTAAATTACTGCATGAAATGATTTTGGTGTGTGATGC CTATCGTCGTGATTTGGAACATCCCAATGAGTTCATTCGAGGATCAACAC TCAGATTCTTGTGCAAACTTAAAGTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000144_pilon:568422..577897-

>XLOC_037818 ID=XLOC_037818|Name=XLOC_037818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=780bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000144_pilon:568422..577897- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTCTATCAGTGAACTCCCTTGCTATACGCTCATCAACCATCCATC
TGAAAGTGAAAGCTCTTCAGAGAACCAACTGAAAGCTGATTTGGATGAGT
TCTATCAGTGAACTCCCTTGCTATACGCTCATCAACCATCCATCTGAAAG
TGAAAGCTCTTCAGAGAACCAACTGAAAGCTGATTTGGAGAATGGAGATG
TCAAAGTCCGAACTGTTGCTCTTAAGAAAGTCATGTACCAAATTTTGAAT
GGTGAAAAAATGCCTTCACTACTGATGACAATAATTCGGTTCATTCTACC
CATGCAAGACCACCAAATCAAAAAGTTATTACTCATCTTCTGGGAAATTG
TCCCAAAGACTGGAGCTGATGGTAAATTACTGCATGAAATGATTTTGGTG
TGTGATGCCTATCGTCGTGATTTGGAACATCCCAATGAGTTCATTCGAGG
ATCAACACTCAGATTCTTGTGCAAACTTAAAGTAAGAATGGAGATGTCAA
AGTCCGAACTGTTGCTCTTAAGAAAGTCATGTACCAAATTTTGAATGGTG
AAAAAATGCCTTCACTACTGATGACAATAATTCGGTTCATTCTACCCATG
CAAGACCACCAAATCAAAAAGTTATTACTCATCTTCTGGGAAATTGTCCC
AAAGACTGGAGCTGATGGTAAATTACTGCATGAAATGATTTTGGTGTGTG
ATGCCTATCGTCGTGATTTGGAACATCCCAATGAGTTCATTCGAGGATCA
ACACTCAGATTCTTGTGCAAACTTAAAGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037818XLOC_037818-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000144_pilongenomesc0000144_pilon:568422..577897 -
Properties
Property NameValue
Aaloc97-390:295
Aaloc1-93:9477