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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000144_pilon:568422..577897- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037818 ID=XLOC_037818|Name=XLOC_037818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9476bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000144_pilon:568422..577897- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGTTCTATCAGTGAACTCCCTTGCTATACGCTCATCAACCATCCATC
TGAAAGTGAAAGCTCTTCAGAGAACCAACTGAAAGCTGATTTGGGTAAGT
GCATTTTTATGCATTTGTATTTTTGGCAAGTAATATCATTGTCTTTTCTC
TTCAAAGTTTTTACAATTTTGACATACTTCATACTGGGAACCTGAATACC
TTTGATTACCTTTGATGTGTTTCAGCAAATTCTCTGCTCACTTAACCCGT
GGGGTCCGGTGTTTGACCATTTCAACAATTGAATTCGAGTCAGCCATCCT
GTAAAAGGGAGATAGGCAAGGAGCAGTGGCTTGTCGGGAACATCTTGGCC
AGTCTGGAAAGGAGGGAAATGTTACGCTGGAGCTGCGCCAACTTAACTGG
GAAAAGTTGAAGGCAGCAGATCTCAAACCTCAAATCTATGCCGGAGATAT
CCGGCAGACTGGCATCTTGGAGAAATTAAATTGATCAAGTTGTTTTTTGA
AGGAATTTTTGGAACATTTGGTCATGTCACGTATTTTTCTTGGTAACACA
TTGAATAGTCTTGGGCAGTTAGTCACACTAGCGTCCCGCCAAAACAGTTA
GTCACACTAGCGTCCCGCCAAAATGCATACCAAAGATTAATGCTGCGAAA
GTGCTATATCGTTTACTTGACTCTCGAGCAAAAATATGCACCGCAAAACT
TCTAAAGAGATTCATGAAAAAATAAACCGGCACTTTTTAATGAAATTAAC
ATTTTCAAAAACTTTGAGAAATTGCCTAAAATTTGAGCCATAGATGAAAA
AGTTTGAGCCAAGCCAACCTTGAAAACTAATTTGAAGATCAACTTCACAA
GAAAAAGATCTACGGGGGAGGCAGAACCCACCTAGATCCGCGCACCGCCG
GATAGGCTATTTCCCAGAAATTTTGCCGGACCTCAAACAATGACCCATTT
ACATGTTCGAAATTATTTTTACTTTAGCGTATAAACAAGGCCTTAAAAAT
CGAAGCGCTGTCTCGGGAATTGAATGACAAAATTTGGTTGGTTGATAATT
TGGCTGCTGCACGTTTTATTTTGTTTCAAACTTTCAAGTTTTGATTACCA
TAATTGTCTTGCGAACTTGATTCAGGTAACTCTCATCCTTGTTGTGCAAA
TACATCCTGTAGATGACTGATGTTGTTTTTTCTGAAAGCTAGATTTCTTA
GTGTGACTAACTGTTGGGCCGGTGTCTGAAAGGCAGCTCTTCCAAATGTT
CTTGTTCGTTGTATTCACTGGTTTGAGGTGGCATTTTCTTCCCAGACGTT
GGTTTGTATATGAATAAATACCGCCTTCCCCTTCACACAAGTGTTACGCG
TAAGCCAAATCGCGTATTACAAACAACCTCTAAATTGCCGAGTACAGGAG
AGAAAAAAATCGAAATTCAAAATGGTGGCCAAGCCCACGCTCAATAATTT
TGCAGCTCAATAAATCAATGAAATAATTTGAAATAAAAAGTAAACAAACC
TTGAACCTTTCATGAATCCAAATAAATAAAAGTATTCATCTAAAGTGAAG
ATTACATTTAAAAATAAAACGATTTCCAAACCAATCTAAAGTCGGTGTCT
GGGGTGACTGGCAAGGAGTTACGACTTCAGACTTTAGATTCCAATTCTTG
TATAGGCTGCAACTACACTACCAAATAATCTGTATTACAAATACTTCCAA
ATGGGTCCATAAGTTAAGAAAATGAAATTATCATCTAGCACGGGGGTTTT
GTTTTTAAAAACAAACTTCAAAATAAAATTGTTAATGAACTTATATATTA
CTTAAAATATCACTTACTTACATAATTTATTTATGATATAACACCCCTTT
CTTAAATAAATGGGCTCTTAAAGTCTTTTATGTTTGCAAAAAGAAGGGAG
AAACATTTAATTTGACCCCCGGTTTTTTCTCTCTTTTTCTAGCTAGTTCC
CGCGTGTCAGTGTAGACACAACTTTAATCCGGGGAAATAAAGCGTTTTCA
TTGGTCTAAAATCACGGATGGTCACGTGACCAGAATTTTTATCCAGGGAA
ATGCCGTGGCGGCAATGATTTGCTTTAGTGAGTTTGACCATTTTATTGTT
TTGATTTGAGCGGGCGAAATTTCTGTACAAACCACAATATGGCTTCGTTG
GAAACACTTGTGTTCACCATAGTTAAAATTTGGCACCAGTTGTTCGATTA
TACACCATGTATATATAATTTGGTATCTTTCGCGTCTTCTCTCGAGACTG
TACATATTGAGGTGTTTGAGGTTCTCCCAATAATTCAAATTGGGTGGAAG
TTGGATCCCTTTTATAAAGGATTTTTGCAGATACTCCAGTTCTTGCATTA
GGGATCGCTTTGTAGGAGACCATAGCTGGGAGCAGTATTCCAGATGTTGA
AGTACCAATGTCTTCCAAAGAGTGATCATTACTGATTTATCTCTGGACTT
GAAGGTTCTGTATATCTAGGCACTTATACCCTTGACCCTGTCAGTGATCG
TTTGAATGTGCATTTTATATGACAGGTTGTTTGAGAGTAGGATACCCAGG
TCTTTCACTGCACTTTTTATTTCGATTGGCTGCTGTACATCTGATTTGTA
GACTGAGTGTACTTTCAGTTGTTCATTTTTTCCGTATGCAATGTGTTCAA
ACTTTTTTCCATTGAGCTCCATATTGTTGATAGATGTCCAGTCATAGACA
ATGTCTATAGATCATCTTGAAGCAGACTCACATCTGCAGCACAAGATATT
GCCTTCATAAGTCTTGTGTCGTCAGTAAAAGATGAGAGGACGGAATGTTT
AATCTTTTCGTTTATGTCACTAATCATTACCAGAAACAAGAGGGGCCTTG
TGGAACTCCGCTTGTAACTTTCGCTTCATCTGACAGGAACGTGTTTATGG
AAACTTTTTGGTATCTCTCAGTAAGGAAGGATTGTATCCAGTTCAATAGT
TGTCCTTTGATTCCATTGATTTTTAGCTTATGTAGCAAGATTTGATGGTC
CACCTTGTCAAAGGCCTTGCTGAAGTCAAGGTAGATTACATCAACATTTT
CATTGTTTTGTAGGTGAGATATCAGTCTTTCTACATGAGCCAATAGTTGA
CTCGCCCTGGTCTGAAACCGTGTTGTGTTGGATTGTATAGGTTATTTTCT
TCAAGGTGGGTTTGCAATTTCTCTCTGACTATTTTCTCAAATATTTTAGT
GGTAATTGATGTCAGGGCAACAGGTCGATAATTCTCTGGTAAACCTTGAT
CTCCTTTCTTGAAGATTGGTGTAATGTGGCTTGTTTTGAGAATTTCAGGT
GTGATTCCTTTGTCAAAGTTGTTTTGCCATATCATCTTAAGTGGCTTAGA
AAGTGATTTCTTGCACATTTTGAAAAACTTTGCTGGCAAGCCATCTGGTC
CAGCTGACGAGTTGGCTGGAATTATGGAGGTATAAAGAAACAGGAGAAGT
ATGCTATTGTAACCATGCTCGCCCTACGATTAAAAAAATTACGAGGTATG
CATGCTCATAATCTCATATATCGTGCATTTTTAATGAGCTCTTTTGTTGA
TAGGTGAAATCTTATTGGCTAACTTAAGTGTTGGAAATAAGATGAGACGA
GATTCATTGTTTCTCACATTGGTGTAAGAAAATATTTGGATTAAAAAAAG
GCCTGTAAACTTTGCAATCCTTCATCAAATGACAAGATTTTTCGATCAAT
GTTTTCTTTAAGGTGAACTCTATTGCTTGATACTTTCCTCCAAAATTCTC
CAGCGACTTTTTGTCTACAAATTGGATCTGAAATTGTGTGTGCTTATATA
TAAAGAACTTTTTATTTTCTGGCTGGAGAAAATATCTTTTTCAAAAAAAA
ATTTAATTGATGCAGATTGATGACAAAATTGAACGCAAAATCATTTCGTG
GAGCTAAATTTTATTTTATTCTCGTATATTAGAAGGCTAGAAATCCTCGA
TGCTGATAGTAAGAATATTCAGAGCAAATTTGAGTTCTACTAAAAAGTCG
TATTTCATCGGGCGAGCCTAGAATTTCTTTTGATTTATTACATAAAAGAA
ATCAAAAGACTTTAACGACCAATTACCGACAAATTCATCTCCTGTCTTTC
TTTATACCTCTATGCTGGAATAGTGTCAATTTGTTGGATGAAATCATCTT
CTGTGAAAGTAATGTTCTCAAGGGTCGAGGAGTCTTTTGTCTCATTTGAA
TTCAGAAAACTGTTTTGGAGTGGTAAATACTGAACAGTAGTGCCTTTGTA
AGATGTTTGCCATCTCTTGCGAGTCAGATGTTAATTGGTTGGTGGTTGGA
TTTTTCAGTGGGCCAACTTTAGGTTTAGTTTTTGAGAATCTTTTTGCATA
GGAGTAGAAGTATTTAGGATTGCTTTTGATTTTCAGTGAGGCATCCAGCT
CTGCTTTATCACGTTCATTTTTGTGGGATTGCTGTAGCATCAGTTCAATG
TCAATTAGTTTCTGATTTGTTTTATTGGTTTTGAAATTCTTTTTGGAGAG
TCTTTTACGTTTTCTCATAAGAATACGACCATCTCTTGGAATCTTTGAAA
ATTTTTTTGGAGGTTTTCTCTTTGGCAAATGCTTTTTCACAATCAGAAGA
CATTTTTCAAGGAAGTTGGGATATTGACGATTTGGGTCATATAGATTTGT
GTCCAGCTCTTGAGACCAATTAATGTCTGTTAATTCTTTGTTAATAATTT
CCCAGTCAATTTTATCACTTTGGAAGTTGTAGAGGTCAAATTTGCTTATT
AAGTTACGTTCTTCAGTTTCTCCGAATTGATTATCGAAATTCAAATGTGT
TGTAACATCTACAACAAGATGATCTGAATAGATAGTAGGTGAGCATGTGT
AGTTAAATATAGTGTCTGTGTTGTTTGTGAATAAAAAGTCTAAAATATTA
CCATCACTGTGTGTTGATTTGTGTATCATTTGATTAATGTGCAAGTCTGC
TTTAAAAACATTTAAAACGTCCAGAAGCTGTTTATTTCAATTTTGTGTTG
GGGTTGAAGTCTCGTCATTAAGAGGTGTGTGTGGTATGTTAAAATCCCCA
AGGATGTATGTGTCAGGTGTACAATCAGTAATACTATCAATTTTTGCTAT
CATTGCAGAAAGGAGTTCTTGTAATTCAGGTGCTTCAGATTTGTGGTCTG
GATTGTTGGGTTGTCTGTAGATAACACAGAGAAGAATATTAAATTTTTTT
GATAAAAGCATCAATGCTTCACTTACTCCATTCGAGAATTCGAAAATGGG
CTCGAAGAATGGTGCAATGTCATTACGCACATAAAATGCAACGCCTCCGC
TTGCTCTGCCATATTTCGATTTTACTCTGTCTCTGTTTTTCTTAAAAAAA
GTGTAATTTTCAATCTCAAGTTCTCCTTTTTTTGTGATTGTCCGTTAACC
AGGTTTCGGTTAAGCCTAAAAACAGTTGTTTTGAGCTGTTTGTAAGATCT
TTGAGGTAGGGTACAGATAAAGGTTTTGTTTGTGGGCAAAGTCCTTGTAT
ATTGACAAGCGAAAACATATTCAGTGTAGGTTTAGAAGTAGTTTTGGTTT
TCGGGTCAGCATCAGTAAGGGCAGTCACTGTCCCAGTAGATTCCTTGGAA
ATGTTGGCTCCATTGTTGGGTGCTGGGGTGGTAGATGATGTAGGGGATGT
TGACGATTGAATGTTTGTTGAGGTTGATGTGACAAATCGTGGTTCCTGAA
TTGTATTTGTTGGTTTTGGTTGCTGAAACAATTGTTCACAAGAGAGATTA
TTTCTGTGCGAAAGTTGTCCAGGATTGCGAGAAAATCCTGAGGTTCATCA
TTATGATTGTTTTGCTTTTTCTGATGTCGTTTGGTTCCCTTAACATGCGT
GAATTTGCAGTCAAGATTAAAGCATTCCCCTCTTGTAATAGATGATGAGC
ACATCCTCGGGTGGAAGCTTTGGCACTTGGTACCTAGGTTGCAGCCTCTT
GGTTGTTTGTTGCCATATTTGAGCAATTTTGTACAGGCTTTAGGATGGAT
AAATAAAACCTTATAGAATAATTAGATAGCTTAACCATCTGATCATCCCT
TTACACTGGCTAAGATTATTGTATAAGAGTAGAGAAGTGGCTTGATTTGC
AGGCTGCAAGCAAAGCAAAATTGTGAGACTATTTTTTGTGTTGCCTTTTT
TAGAAGATTTTATTGGTGAAATTCTACTTTTATTTTAATTTTTTCTTTGA
CCGACCCACCTTCTTTTTTTGGGTAGCTTGGCCAGTAAAACAACAAATTA
CATTGGCCTTGCCTAAGGGTTACAAAAAGAACAAAAACTCCCAAGTAGAC
CTTTTTGCCTTTCCATCCGTCATCTTGAATTGTACAGTATGCAAAAATAC
AGGAACGAAAAAGCCGTGGTTGGATTTAGTTGGACAATATGCAAAACATA
TGCAAGTTTACTCAAAGACTAAAAAGACAACAAAGCATCTTATAAAGAAA
TATTATAATCATTAGAACAATAAAAGATGGAATTTCTTAATCCAAAAAGA
AATATTTACAGAACAACAAAAGCCTTTTAGAAATTTGTTCTTAAAGACAT
TGCATATTCTGTTTTCATGCCATTAAAAAATTCCACCAAGACAGAGTATA
TACACACATCAAACTTTCAAAACACGTAAATTGAAAGCAGTAATTATGAC
GTCACACATTCAGCGGGTTCAGATCAATGTTTTGATTTGATCCTTTGGCT
GTTCTATTCCCAGGAGAATAATTTGTACCGTCAGCCAAATAAGGATTATT
TTTGTACCTTGGCAGGTGATTTTTCAACTTGAGTGTCTATGTTATGGTTT
TTTGAAGTGCTTGTTCTAAGAGATGAGTGAATTTGATTATTTCAAGTTAT
CAAAAGAAGCAAATTTAATCTTTCTTCTACAAGATTATATACACTTTAAT
ATATATAATGACAATTATGCATTTACGTTTTATATTAATACTTTCTTTTT
GCATATGTTTTGCATACTTTCTAAGAGAATTTCACCACGGCAATTCGGCC
ACCATAATTTTTGCATACAATTCAATATGGCGGATGGAAAGGCGAAAAAG
TCGCGAGTGACGTCAAACGCGAGTGACGTCAAACGCTCACATTCGCGCGT
GTTTCACTACAGATTTTTTTCATATTTCAATTTAAAAGCCTACTCGGTGC
GAAAGAGAAATCGTGTATTTTTTAATACCCGGAGGTACTGGAGGTCCCAT
AAATTAACCTTTGTCCATTTGTCTGTCCGTCTGTTACCAGCTTTTCTTGA
GATTGGCTCATAAGTTTTTTCTGATTTATGGCACAATGGTGCAAAATAGT
AATTATATTATATATAATGGCCAAAATGTGACTGACGAAGCCTAATTTTC
AAAAAAAATGGTAGAGTAGAGCTGTGAGTGGAGCTGCATAGTTCATTTCT
TTTGGAATTTTGCTGCTTTGATTGGTCAGTCATTTGATGGCTATGCAAGT
TTCCCTCCTCTGATGCAAGTTACCCGACTTCACGGTAGCTTTTACCCGAA
AAATTGGGAAACGGATCAGAATTTTTAGGAAGGATGATTTTCTTACAATC
ATTTGTTTCCCCGCTCCAGCTGATGACTTCATTATTTCAAAACAGATCAA
AATTTCTGGTAGATGGCATAATAAATTGGTAAATAGATGTTTTCAAAAAG
TGAATTTTCTAAGGAAAAACAGATATCAATCACAAACAAGCGCGGGAAAA
CAGAAAAAGATTTATAGGATTCTAAGGGAGGGAAACAGATCAAATAAATT
GGAAAAACAGATCAAAATTCTAACTCGGGAATTTGTAGAAAAATATCAAA
TTTTCTAGGGAGGACAGTTTAAGATTAATAAAACTTTGGTTTTTGAGGAA
AAAGAGATCTTAATTTCTAAAAATAAGGTTTTGGAAAGCTTTATGTCTGG
GGAAACAGATGTTTAAAAAAAGGTCCTCGCTAGATGCTTTCGCAAATTAA
TTGAACACAATCGAACGCAATTGAATAATTTTAATTTGATTGTCCAACAC
AATGGAACCGTAATTGAATCCAAGGATTTGCTGTTCATTTGCTTCGATTA
CATTCAATTGTATTCGATTATGTTCAATTTATTCAATTACATTTACTCGC
TTTCATTGCTCTCATCCCGTGCTGTACTTATACGCTCATCCATTATCTGA
TTTTCCGATTGCCTATTACATTGGCCGTCGCCCGCACTAAAGCTCTAAGA
GAGTGGGATAATTTAATTACAATCGCAATCGAACTAATCGACATTACCAA
AACTCAATAATAATAATACCAATCAAACACAATCGAATATTCGATCGAAT
TTTTTTTTATTTATAGTCCGGCGGCGAAAAGGGCTTTTCTGCATCAACCC
TTACAAGTAGTAAATATGGGTTTTTATTTTATTTTCTCATTATATTGTCC
TTTGGGACCCCAAAACCGGTTTTTGCCAAGCTGGCAAAGCTGGGGAAAAT
TTTTAACGGGGGCTTGAAGGGGGTAGGGTCATTTTAGCCTGGGGTCCTTA
AAAAGTCGATTTTTGAAGTTCTCATTTAGCTAAAACTGATTGTGCCATCA
GATAGAGCTTGAAGAGTAGATCTCCAAAATGGGGTCATTTGTCATATTTG
ACGGACTTAGTCTCCCGGAATTGGCTGATACGTCTTCAAAAATGCAATAT
TTTATGCTGACGTCAGCATTTTTGAGAGAATTTCCAGCGAAAGATATCAG
TTTTAACAGATGCGTCTCGAAGTGTACTATCGATTAGAGGGGTCATTTAT
AGAGTTTCCTAGGCTAGATCATGAGATATTTGAGTTTGAAATTTTGCTGA
CTCAGCGTTTTTCAACGTTTTTTGCCCTTTTCTGCTGAGTATGTGTATTT
GATATGAATGACTGTAATGAATGCAACTTTGATTGAGCGCATAACTCTAG
ATTCTTTTCCAACACTAGAGACGTAGGTTGGTTGAGTCTTCAAATTAATC
TTCTCTATTTTCATTTTATATTTGCGTCTATCGATAGCTTTCTTTGGTCT
TCAATTTGTTCATCAATTTTGTCGCTTCGAAGTAGCTGGTTCATGCTGTT
TACGCTTAATTGATCTTTGATTTTAGTTGCTTCACAATTTTGCTCACAGA
CAGTTGCTTGTTTTTTTTTCTAAACTTAAAATTTTCTTACAATTAAATAC
AAAACCTCACACATCAACCTTGCTTTATAGAGAATGGAGATGTCAAAGTC
CGAACTGTTGCTCTTAAGAAAGTCATGTACCAAATTTTGAATGGTGAAAA
AATGCCTTCACTACTGATGACAATAATTCGGTTCATTCTACCCATGCAAG
ACCACCAAATCAAAAAGTTATTACTCATCTTCTGGGAAATTGTCCCAAAG
ACTGGAGCTGATGGTAAATTACTGCATGAAATGATTTTGGTGTGTGATGC
CTATCGTCGTGATTTGGAACATCCCAATGAGTTCATTCGAGGATCAACAC
TCAGATTCTTGTGCAAACTTAAAGTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000144_pilon:568422..577897- >XLOC_037818 ID=XLOC_037818|Name=XLOC_037818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=780bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000144_pilon:568422..577897- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGTTCTATCAGTGAACTCCCTTGCTATACGCTCATCAACCATCCATC TGAAAGTGAAAGCTCTTCAGAGAACCAACTGAAAGCTGATTTGGATGAGT TCTATCAGTGAACTCCCTTGCTATACGCTCATCAACCATCCATCTGAAAG TGAAAGCTCTTCAGAGAACCAACTGAAAGCTGATTTGGAGAATGGAGATG TCAAAGTCCGAACTGTTGCTCTTAAGAAAGTCATGTACCAAATTTTGAAT GGTGAAAAAATGCCTTCACTACTGATGACAATAATTCGGTTCATTCTACC CATGCAAGACCACCAAATCAAAAAGTTATTACTCATCTTCTGGGAAATTG TCCCAAAGACTGGAGCTGATGGTAAATTACTGCATGAAATGATTTTGGTG TGTGATGCCTATCGTCGTGATTTGGAACATCCCAATGAGTTCATTCGAGG ATCAACACTCAGATTCTTGTGCAAACTTAAAGTAAGAATGGAGATGTCAA AGTCCGAACTGTTGCTCTTAAGAAAGTCATGTACCAAATTTTGAATGGTG AAAAAATGCCTTCACTACTGATGACAATAATTCGGTTCATTCTACCCATG CAAGACCACCAAATCAAAAAGTTATTACTCATCTTCTGGGAAATTGTCCC AAAGACTGGAGCTGATGGTAAATTACTGCATGAAATGATTTTGGTGTGTG ATGCCTATCGTCGTGATTTGGAACATCCCAATGAGTTCATTCGAGGATCA ACACTCAGATTCTTGTGCAAACTTAAAGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000144_pilon | genome | sc0000144_pilon:568422..577897 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 97-390:295 |
| Aaloc | 1-93:9477 |
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