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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000168_pilon:676180..680777+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037660 ID=XLOC_037660|Name=XLOC_037660|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4598bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000168_pilon:676180..680777+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTTTTGAAATGGATCGTGTTGAGAAAGGGAAAGAGGTGAAAGGTGA
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ATGATCGTCCAAAAGCAGACCTTTGTTGTTGTGCATGTCTGCCAAAACGT
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ttttaatttttccctatTTCATTCAGTCTTCCCTCTTTGTAAgacatttt
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ATTGTgataattaattttCgttttttttcaaagtttttgacattGCTTTT
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GAGTTCtgtttaaaatttgaacaaaCATTTTTAGTTTACAACACGTCTAA
ACAAAGAAATGTACTAGCACATAATAAAAGAGAACTGGTCTAGAATAACC
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ATACGTCCATTTTAACTGTCGAATCGTTTTCATTATTTACAGGACCCTTT
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AAATATACCTTGGAAAGACTTTATAACCTCGTTGCCAGTATGGGCAATCA
TTATTGCACACATGACCGAAAACTGGGGATGGTACACATTATTGACACAA
CTTCCAACATATCTGAAAAGCGTGCTGGATTTTAATCTACAAGCTGTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000168_pilon:676180..680777+ >XLOC_037660 ID=XLOC_037660|Name=XLOC_037660|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1956bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000168_pilon:676180..680777+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTTTTGAAATGGATCGTGTTGAGAAAGGGAAAGAGGTGAAAGGTGA
AAATTCTGATCTTTACTCTTATGATGCAAGTAGTAATCACAAAGCCAATC
ATGATCGTCCAAAAGCAGACCTTTGTTGTTGTGCATGTCTGCCAAAACGT
TACCTGGTCGCTATCATGgctttttttggatttgttAATGTTTACGCATT
GAGAGTAAATCTTAGTGTAGCTATGGTGGCAATGGTATCCAATAGGACAG
CCAAATATGCAAATGGGACTGAGTATACTGTgATGTCTTTTGAAATGGAT
CGTGTTGAGAAAGGGAAAGAGGTGAAAGGTGAAAATTCTGATCTTTACTC
TTATGATGCAAGTAGTAATCACAAAGCCAATCATGATCGTCCAAAAGCAG
ACCTTTGTTGTTGTGCATGTCTGCCAAAACGTTACCTGGTCGCTATCATG
gctttttttggatttgttAATGTTTACGCATTGAGAGTAAATCTTAGTGT
AGCTATGGTGGCAATGGTATCCAATAGGACAGCCAAATATGCAAATGGGA
CTGAGTATACTGTgagTCCAGAACTTGACTGGAGTCCAAAACTTCAAGag
TCCAGAACTTGACTGGAGTCCAAAACTTCAAGGATTTGTTCTTAGTTCAT
TTTTCTATGGTTATATTATCACACAAATACCTGGTGGCTGGCTTGCTACA
AAATATGGTGGTAAAAACTTGTTTGGTTGTGGTGTCCTAATGACAGCTCT
TTTTACATTGATTACACCACCTGCAGCTAGATGTAATGTTTATTTACTGG
TGGCCGTAAGAATGGCGGAAGGATTATTCGAgGATTTGTTCTTAGTTCAT
TTTTCTATGGTTATATTATCACACAAATACCTGGTGGCTGGCTTGCTACA
AAATATGGTGGTAAAAACTTGTTTGGTTGTGGTGTCCTAATGACAGCTCT
TTTTACATTGATTACACCACCTGCAGCTAGATGTAATGTTTATTTACTGG
TGGCCGTAAGAATGGCGGAAGGATTATTCGAgGGTGTAACATTCCCAAGC
ATTTATGCAATCTGGAGAAAATGGGCTCCACCTTTAGAAAGAAGTAAACT
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TGGAGAAAATGGGCTCCACCTTTAGAAAGAAGTAAACTTGCAACAATCTC
ATTTTCAGGACCCTTTGCTGGGACAGTGCTAGGAATGCCACTATCAGGTG
TTATTGCTAATTCCTTTGGATGGCCATGGGTCTTTTATACTTTTGGACCC
TTTGCTGGGACAGTGCTAGGAATGCCACTATCAGGTGTTATTGCTAATTC
CTTTGGATGGCCATGGGTCTTTTATACTTTTGGATTGTTTGGTGTGATTT
GGAGTTTCTTTTGGTTTGCACTGGTGACAGACTCTCCTTGTGATCATCCG
AAAATCTCTAAAGAAGAATTAGATTACATTCAAAACTCTTTGAAGCAAGA
TAAACCGGAAAAACAGGATTGTTTGGTGTGATTTGGAGTTTCTTTTGGTT
TGCACTGGTGACAGACTCTCCTTGTGATCATCCGAAAATCTCTAAAGAAG
AATTAGATTACATTCAAAACTCTTTGAAGCAAGATAAACCGGAAAAACAG
GTTGAAAATATACCTTGGAAAGACTTTATAACCTCGTTGCCAGTATGGGC
AATCATTATTGCACACATGACCGAAAACTGGGGATGGTACACATTATTGA
CACAACTTCCAACATATCTGAAAAGCGTGCTGGATTTTAATCTACAAGCT
GTAGTTGAAAATATACCTTGGAAAGACTTTATAACCTCGTTGCCAGTATG
GGCAATCATTATTGCACACATGACCGAAAACTGGGGATGGTACACATTAT
TGACACAACTTCCAACATATCTGAAAAGCGTGCTGGATTTTAATCTACAA
GCTGTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000168_pilon | genome | sc0000168_pilon:676180..680777 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 823-975:4446 |
| Aaloc | 691-822:3251 |
| Aaloc | 604-687:2895 |
| Aaloc | 514-600:2507 |
| Aaloc | 316-513:1034 |
| Aaloc | 280-312:584 |
| Aaloc | 40-279:43 |
| Aaloc | 1-39:1 |
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