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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000025_pilon:1285922..1290702+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037628 ID=XLOC_037628|Name=XLOC_037628|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4781bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1285922..1290702+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGTCTGGGTTTAAAAAGCTTAATTCTAAAGAGGTAAGtctatttattat
aattttaattattttcaaaatattgtgaaattttattgattcattgatat
ttttttccttcctaGGCGGGTCAAGTGGTATATTTTGACATTTGTCTAAA
ATGttgtaaacttttttgttttgggatttttggagttttgACGGAACTAA
CTTCGGAACTAAATTTCggaatattttattatttgtgATTTTAATATGAA
AGAGAATCACGaaaaaaaaCTTAAGGTAAATAATGTTTATCTTACTTTAA
TATTCTTTGTATTCTATTTCTAAATCTGACATATTTTTCCTAAATTATAA
CATAATCGACATCTTAAGGCCTTAAGATTTGTTGATACAGTAGCGCTAAA
GATTTAACTGATATCAGATTTTTACCAATATCAAGAAGATTTTAACTTTC
TACGATAATGAAGTCGCAACAGATTAAAATAAGGCAAAACGTGAATTTAT
ATTGTGGCTGCCATTCTTACAGTGATTTAGAACGGTTTAATAAAGAGGTA
CCTTAAAGGCCGTTTTCCACTTTCGCGCAAAATGGACCGTTTTTTCCTCA
AccgtttttgcctgaagaaaagattacgtcatataaaAGTTTTGCGCGAA
CAAAAAATTTCACTCATTTCGCGCGATAGTGGAGACCGGCCTCACGTACA
AACCTTGTGAAAATCTTTCCTACAGTGGAAATGAAAATCCAGTGGTAATA
GTtttggagtgaatttttttaccattgaatttcaaatggagataaaatga
aattcaattttccagtggggctatTTCACATaggagatgaaattttgacc
gTATCTTTTCCAGGGGGGTCTGTGCAACGAGGGTGTTGATGAGCGTCAAA
ACAGAGTACTGTTTGACAAAGCCTATAGCATCGAAAAGACAATCGTTGTT
TGAGGATCGATGTATCAACACGTTCTATAACCTTTTCTTCAAAGTTTTCA
CTTTCAGAGCTCTTATAGCATTTGAATGTCAACTTGCATATGATAATTGA
ATAATTGATAATTAACTTCTAAtgttatgttttgttttcttcaattttag
agAGAGGTACTTATCAAGCAAATTCAAGCGTTTCTACAAGTGTTTCATTT
GATATTGTGTGTTGTCATTTTTGCACTTATTGTTGGAGCGATTTGTGGCA
ATGGATGGCTTTATAACATGACCGAGGTATCTTTTGTTTCCATTTTCTCC
GATTCAAATGTATTCCTCATTCCTTTATGGTTAAACCCTGTCATAATTTC
AGGGGGTACTGTAGGCTACACTCGTCGCCCTCTAGTATGTTTAGATGTAG
GGGAtgtgtatcgtgtataaaattcccgtgcGAGGGGATTTGTGGAAATG
GATGGCTTTATAACATGACCGAGGTATCTTTTGTTTCCATTTTCTCCGGT
TCAATATGTATTCCTTATTCCTTTATGGTTAAACCCTGTCATAGTTTCAG
GGGCTACTGTAGGCTACACTCGTCCCCTCTAATATTTTTAGATAAAGGGG
AtgtgtatcgtgtataaaattcccgtgcGAGGGTTACCCTCTTTATTACC
CACTTTgtgttttttagttttagaaacttgattatcTTTATTAGTCATCA
TCATCAAATTGGTTGATCCTCCTGAATGagttcaataaaaatttcaaaca
cagaagcgtcttcattttatttcataaaatcaaaatttatttaagacgtt
tcggtgtcatccgaccaccatcatcagtttaaaaacattgaaaggTTTAT
TAGTCAGCTTTATATGAGAGAtcattaaatttcattaaatttgaattgaa
tatttGATCGAATAGAAGTTAGcacaatcattggatttctaaacctcttt
aagaaaattgaaacagataAATTTGAGATAACGCTCGGGACAGGAATTTT
ATTACCCTTAataaaaacatatcagaggTGACGCATGCAGCTTAAGGGTA
ATGTCTATTTTAAAAAATGATTGCACTTCGTAATGATTCTCAAGAAACAC
TTCGAATTGGGGGCTACCCACATTTAGTAAGCACGGAggggggggTGCTA
GGTTTGCGAGGGTAACAGGTATGACAAgccaaaaagtgaaaatcgaccct
ttcaaagaaaagttattgaaatttttttgagacccttctagagaattttt
gtcaaaattttggacaattttttcaaaaaatagtgaCCCTTTGAGAAGGA
AATTTTCACTTTtagtgattttgggaccctttgagagactaacCTATGAA
TTTGTAACCCTTTTAGGGACTTTTGATGCATGAAAAAGGATACATATACA
CTGGCAAATAACCGCCACCTGTTTtttcctaagtaccccccccccccccc
ccccccccgggttaacAGGATAAGATCTTTTGCATCCTACAtagattatg
attttttgattttaatattacAGGTCACATTATATCAGGATACTGAAAAA
TTCATTGGATTATGGCAAACATGTACAAATGTGTATGATTATGGATGTCC
AACTGAGAGTTGTGTCAACTCTGGTAGTGATGTTGAAGGTAATTATTCGT
CATTTTCGGTCTCAAAAAAGCTTTATTATTGACAGCTGCACTTGTAAACA
CattgaattgaatttcaataatgGGGTGGAATGAAAGTTGATTTCCCAAT
GGGGCTTAAATTGTAGGGTTTTTTCCCCACTGGGGAacaaaatttgggcc
aaattttcAAGTGGGCTATGCTATGGGCACCGGGTTATGTGACACAATAG
ACCTTATCATAAATTACTTGCTTCGCATTCAAACAGATTCCAAATGATTT
TATTATGAATAGAAGGTAGTTGTGatagttgtaataaaatccactgggag
ttaGCCAGCatggaaataatttcaaaacgaggcagtggTATTCgggacgt
aatttatgaaaaggtctattcttgaATAGATAATTCATTCATCCTTAATC
AAATACAACCTTCTCCAGTCCTCAAATCTTAAAATTGAGAGTGTAGTAAA
ATTCCAATACAGTAGTTAGACGTTGGATAGAGCCTGCTATAAGTTAGTAG
ATTCTACTTTtggatttttgataatttttttatgacgctgagtccagtga
cgtagactaggagcatttggcgaggtcgcctttttcaaaaaaaaatgttg
aaaatccaaattcatgatatgcaccactggagagtcttccgagaattttc
aaaatattcaacccaatacgtcacttaaacaatagaaaaagtgacgtatt
gggttgaatATTTCGAAAGATGTAGGAATACTCTCcggtggtgcatatca
tgaataacaataaaactacttggagttgaaagatataatcaataattaga
aacaaacacgattaacagatttgcgatcccttattctcaaataaaaacat
tgctccatactgtttttaccttccaaaagcaactaaaatctggcggactg
ttttacattccgcctaagcaaaagaatattaccatatactaccggacCAC
TTAattgcgccatccagtctatcaaaaagatttaagtggaccccgggcta
gctATAAGTTGGattgaaatcaaaagaaaaatgaaattgaagtgGTTTTG
AGTGCAGAGTCAGCCACCTGGTTTCTACCATCAACCTCTTATTTTCCTCA
AACCATTACCTTAATGTTATAGATTACATTCAAGCAACACGAGCATTTCT
GATTCTGGCAACTCTACCATCAATTTTTGCTTTTATTGGTGGAATTGGTA
TGTTATGTTCAGATCGTGTCAAAGGTCAAGTATCCGCTATTTGCCACATC
ATCACAGGTAAATATCATTGTGAAACCTGATCTAACCATCAGACCCCTGT
AATCAGGGGATGATTCAGCAAATTCGTCCATTTACTTCATATAGGAGAAT
CAAGATTTTAACTAACTCTTTGCTCCTTTAAGATATTTGTCGCGTCTAGC
aagcagtggcgtggtggcaggggggccagggggccaggccccccccagcg
gagcccttttgagaaggggcgcccaaaaataagggacgccaagaaggatt
tttcaggcgcccatatcgaaaaattgacaaatgaaaaaacaaaaatggcg
tcctcatcacctcaaaaactcaaaattttctggctcgcttcgctcgcaca
ctcccttttttgtgttcataatgagcgtatagagaggggcgccaaaaaca
aaaaatcagagaaattttcccaccacgccactgctgGCAAGTTTAAAGGT
TTCTAAAATCGAATATGATTTCAGTTTCTCACATCACAtattaaaatgtg
ttttttcaGCCCTTAATATTGAAATGTCTATCTGACACCAAAAACCATTT
TCGCAACTGCAGGGAGTGTTAAAAGACTACTGGTAACAAAGCCTACATCG
TATTAagaaaaaccctatttttgttTATGGTAGTGGGCCTACGTTTGTGT
AACTTCTGTGTAAATCCTATCAGCCCGGACCCCCCTCTATATTACTGTGA
CCCCTGAGTTTATAACCTGGTTTAATTTCATATTTAGGTGTATTTTTACT
TATCGGGATGTCAGTGTACACCGCTAAGGTGAATGAAGAAGATTCATTCG
ATCTTTATAAATACAGTTGGTCATTTGCTTTCGGTTGGGTAGCATTCGTG
TTGACCCTCATTGCTGCTGTAATCACTTTCACATTTGGTGCTCCAAAATT
ACCGAGAATCATTATCGAGTTCAGAGAATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000025_pilon:1285922..1290702+ >XLOC_037628 ID=XLOC_037628|Name=XLOC_037628|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1206bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025_pilon:1285922..1290702+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aTGTCTGGGTTTAAAAAGCTTAATTCTAAAGAGaTGTCTGGGTTTAAAAA
GCTTAATTCTAAAGAGagAGAGGTACTTATCAAGCAAATTCAAGCGTTTC
TACAAGTGTTTCATTTGATATTGTGTGTTGTCATTTTTGCACTTATTGTT
GGAGCGATTTGTGGCAATGGATGGCTTTATAACATGACCGAGagAGAGGT
ACTTATCAAGCAAATTCAAGCGTTTCTACAAGTGTTTCATTTGATATTGT
GTGTTGTCATTTTTGCACTTATTGTTGGAGCGATTTGTGGCAATGGATGG
CTTTATAACATGACCGAGGTCACATTATATCAGGATACTGAAAAATTCAT
TGGATTATGGCAAACATGTACAAATGTGTATGATTATGGATGTCCAACTG
AGAGTTGTGTCAACTCTGGTAGTGATGTTGAAGGTCACATTATATCAGGA
TACTGAAAAATTCATTGGATTATGGCAAACATGTACAAATGTGTATGATT
ATGGATGTCCAACTGAGAGTTGTGTCAACTCTGGTAGTGATGTTGAAGAT
TACATTCAAGCAACACGAGCATTTCTGATTCTGGCAACTCTACCATCAAT
TTTTGCTTTTATTGGTGGAATTGGTATGTTATGTTCAGATCGTGTCAAAG
GTCAAGTATCCGCTATTTGCCACATCATCACAGATTACATTCAAGCAACA
CGAGCATTTCTGATTCTGGCAACTCTACCATCAATTTTTGCTTTTATTGG
TGGAATTGGTATGTTATGTTCAGATCGTGTCAAAGGTCAAGTATCCGCTA
TTTGCCACATCATCACAGGTGTATTTTTACTTATCGGGATGTCAGTGTAC
ACCGCTAAGGTGAATGAAGAAGATTCATTCGATCTTTATAAATACAGTTG
GTCATTTGCTTTCGGTTGGGTAGCATTCGTGTTGACCCTCATTGCTGCTG
TAATCACTTTCACATTTGGTGCTCCAAAATTACCGAGAATCATTATCGAG
TTCAGAGAATAAGTGTATTTTTACTTATCGGGATGTCAGTGTACACCGCT
AAGGTGAATGAAGAAGATTCATTCGATCTTTATAAATACAGTTGGTCATT
TGCTTTCGGTTGGGTAGCATTCGTGTTGACCCTCATTGCTGCTGTAATCA
CTTTCACATTTGGTGCTCCAAAATTACCGAGAATCATTATCGAGTTCAGA
GAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000025_pilon | genome | sc0000025_pilon:1285922..1290702 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 412-603:4590 |
| Aaloc | 277-408:3725 |
| Aaloc | 160-273:2474 |
| Aaloc | 34-159:1101 |
| Aaloc | 1-33:1 |
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