XLOC_037359 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037359
Unique NameXLOC_037359
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000333_pilon:131894..141779+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037359 ID=XLOC_037359|Name=XLOC_037359|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000333_pilon:131894..141779+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTTTTTGCAGTCATTAGGGACGCGTGCGcctaacaggggggggggggggt cctaataaggtccgggggggttggaaaattttcgaaaaattaacaagcgg gggggcccgtttatttggaacatAAGAGTAAGGTGAAAGtcttggctgaa attttgggaaGATGTCTTAGGGTcgtttttcgaattttggctagaacccg tcatctcgcaaacctagtaccctccTCCTCATGGGTTTTTAAAGTTTCAA GAGCCAGAGTGATAAATCAGCAGAAAACCTgttcatttcaatgttttttg cTTTCTAGGCAAAAACTCCAGAGCAGTGGGAATCGAATCCGAAAATATCA GAATCTCCTAATTGTATGGGTGGTAGTAAAAGGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000333_pilon:131894..141779+

>XLOC_037359 ID=XLOC_037359|Name=XLOC_037359|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=660bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000333_pilon:131894..141779+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggctacCCTTGCAGCAGGGCCTGTACGTCAAGCAGTTATCAAGAAACT
CACAGAGGCATTAAAGatggctacCCTTGCAGCAGGGCCTGTACGTCAAG
CAGTTATCAAGAAACTCACAGAGGCATTAAAGCCAGCTCATCTGGATGTA
ATCAATGAAAGTTTCATGCACAATGTTCCAGCAGCCAGCTCATCTGGATG
TAATCAATGAAAGTTTCATGCACAATGTTCCAGCAGGCTCGGAGACTCAT
TTCAAAGTGATTGTAGTTTCAGATGCTTTCAGCAAGAAGCCATTGATTCA
GGCTCGGAGACTCATTTCAAAGTGATTGTAGTTTCAGATGCTTTCAGCAA
GAAGCCATTGATTCAGAGGCATCGTTTAGTAAATGAGACACTAAAAGAAG
AACTGGCATCTGGGGTACATGCACTTTCTATCCAGAGGCATCGTTTAGTA
AATGAGACACTAAAAGAAGAACTGGCATCTGGGGTACATGCACTTTCTAT
CCAGGCAAAAACTCCAGAGCAGTGGGAATCGAATCCGAAAATATCAGAAT
CTCCTAATTGTATGGGTGGTAGTAAAAGGTAAGCAAAAACTCCAGAGCAG
TGGGAATCGAATCCGAAAATATCAGAATCTCCTAATTGTATGGGTGGTAG
TAAAAGGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037359XLOC_037359-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000333_pilongenomesc0000333_pilon:131894..141779 +
Properties
Property NameValue
Aaloc253-330:9809
Aaloc184-252:1574
Aaloc121-183:1270
Aaloc67-117:554
Aaloc1-66:1