|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000333_pilon:131894..141779+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037359 ID=XLOC_037359|Name=XLOC_037359|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000333_pilon:131894..141779+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atggctacCCTTGCAGCAGGGCCTGTACGTCAAGCAGTTATCAAGAAACT
CACAGAGGCATTAAAGGTTTGTTTGTTGCAATATGTTTTCATGTTCCTCG
TTTTTCTGAATTTAAAGCCATACATATGAAGCTGTGTGCTAATGTTGCAA
AACCAAtgcaaagttgttttttttaatcagaaATGTAGGTCATTTGTCGG
ACGTCACTCAAAACACTTTATACTTTACTTTTATACTTTAGCCCAACAAG
TAATGAAAAACAatcttagttttaccagcttcattttgtgtttaaatgaa
atgaattttaattctttatctctggttcatggtacaTTGGGCTTTAAAGG
TGGCTAATCTAATTTAAagggtcgaaattcaaaaaatttctgttCCGTCG
TGCTCGTCGTGGGCCCCTCCTTTTTAGTGCTTTAGTCAGCTTTAGTTTAG
ACACTATGTagctgaaacttttttttgcctcAGGGTGTCCTAAAAATCCT
AGATACGCCCCTGATCTTGcatcattttttattgtttttttaattatata
cAGCCAGCTCATCTGGATGTAATCAATGAAAGTTTCATGCACAATGTTCC
AGCAGGTTAGCATGTGTATTTTAATTATCGATTGTTTATGAAACATGTGT
AAACGTTGTAAACACGTTGACTTTACCTTGACACTTGACATGTTATTTTC
AAGTACTTTTTCATCACTGTTATTTGGTGGCAAAAACTCACTTTGAAATC
AATTCTTAAACTCGGTTTTGCGGAGAAAGTAGAGAAATGACGGTACAAAA
ATGAAGGAAGGAATCTGCTAAGATAAGGATTAACACCATTCACTTTAAAA
TCCTCCAAAACGTTTCAATtaaaggttgttttttcataAACAAGTTAgaa
tttttaggctgaaaatgaaaacatctaTTTAGGGACATTTAGAGGAAAAA
TTACCTGCTTGATTTATgggagactgttcatctaacgtttccagaccatc
taagaagaacgacaaataactattaaaaagtgacaaaaaaaaacgacaaa
ccctaaccctaactatcaaagaacgaatTATAAAGTGACTGTGTCACTCC
TACAGATTCATTCTTCTTTGTttgtcacgggaattaactacatgtggttt
aaaagaacgcaaaatTATGCATGCGTATAAgatctatttgggtgagctag
aaacattagatgaactaactcaTAGTGTTTAGTCACATAACCAGTATTTC
TTATTCATCATCTTTAGGCTCGGAGACTCATTTCAAAGTGATTGTAGTTT
CAGATGCTTTCAGCAAGAAGCCATTGATTCAGGTAATGTAATAATAAGTt
acctttaagggaagaaatttttgagtaacaaatttttgcaaaatttaatt
tggttgttttttACAAAcccgtgaaattaaattccacgaaacaCCAAAAA
TAACTATTTACTTCTTACTCCTTTTGAAAACTGAAAGACCCAAAAAGTGA
CAAAACAAATCCTGACAGATAGACAGGTCGTTGTAAATTGTTATAAAAGT
TGGTCCCACTCCTGTTATTTCAGAGGCATCGTTTAGTAAATGAGACACTA
AAAGAAGAACTGGCATCTGGGGTACATGCACTTTCTATCCAGGTCTGTAT
TTTTACACCTATAGTTCTTTAGGTTTATTGTACAGCAAAAATTACTTACC
AAAGCAGTGAAAAcgggataaatttttttgtttcatgaatGTAATGACAG
AAGCTTTGGGGTTAGTAACTCATGCTGGAGTAATCAgttattcaaattat
ttggaattttacaatcgcgaaaataaaagtTCGCGAAATCAAAGAACATA
TTATTACGAGTTCAACTGTAATTCAATTATAAACTCTAGTAACCTCCTAA
AAgtactttctttgaagtttttcgaaagtttttgaGTGACTTTGTATGCC
TTTGTTATAGATTAAAAAACACATCTCTTTTCTATTTACAATTTATAtag
tcgcgaaattaaataaagaaggtcattttcgcgaaatttaatccacgcga
aatatttattaaattcTCGTCTCGCATAAAttagtacacgcgaaaattta
tccacatactcttaggttccaaataaacgggggggttcgaataaacgggg
gggttggaaaattttctagattttaataaacgggggggacctaattgccg
gggggttggaaattgtacttctgaaacccaaaaataaggtaaaaataggc
taaaatcaggctatttagagcaaaataaggggccttctctttgacagctg
aaaatattcttagagattaataaacggggggggggtgtagTCGGACAGAA
AATGAATTGACACAAGTGTTCGTAACTTTTGTGATAGAGTTCAaactgaa
tgaataaaaaaatgacaagatttaATCTAGGTAACAAagtgagaaaaatg
aagaataatgaaaatattgacaaagtattttagaggaaaataaaagaaat
ctaagttaataaattaaataaattcttaCCAACTTGCCAGAAATAAATGT
GGTGTAAATTCTGTccaataaattaaaattgaaaattgatgttgaaagtt
tgaagacgtgaatttgaatgtttactTTGAAAGTTTGATTATTTGACTTG
AGTTCACATTTTTCCTCGTATGATGCCTCAACAGACACTTAATtgattat
gaaaaattgaactgaTACGAAAAAATCTGAGTGTAATTTGAAATGCTAGA
AAAATCGCTAAGGTATAAATGATATAAATGATACaaagaaatgaataaat
atttttaattgttttgtgcGTTTAAATAAAATGACGTATGCAATTAAAAT
GGGATGACTTTTTGCAGTCATTAGGGACGCGTGCGCCTAACACTGCCCCA
ACTGAGATGCAAAAAGTCACCCTAAGTGAAAGGTGTGtgtgttttctatt
tttttttatacaCTAATGAATCAGCATTGATCTGCCATATCGTTCAATTG
TTCAACAATTGACTTCTCATTAACGTAATGAATAACAATTAGCTCCCGAA
CATGTCGGACGGTAGTCCTGTTACAGTTCTCAGAGTGATTTCGATAACAT
ACTTTAACTTGACGAATTTTGTTATCCTTGCTCATAACAGTATCTTCAAC
CATACCATACTGGTATGTTAATTTCAATGGACTATTTTTCAAGAACAAAA
CAACATCTCCAATACGAATATCAGTATCAGATTTAAACCACTTTGGTTGA
TTGATGAGCTTAGGCACATGATTGATAAGCCAACTATCAAACCAAGATTG
ATAGATTAACGAGTTGGTTTGGATGATTCTTGAAGAGTCATTGGACAATT
CAAATGGACCTACAGGACTTCGTTCGTTATTGCGCCCAAGTTTCAGTCTA
TTCGGGGTTATCAAGTCCATTGATTCAAAATCAGAAACATAATTACCGAG
TGAGATTGGAAGGTCGTTGATACAATTCGATATCTCTGATGCAACTGTCT
CCCACTGGAGAACAGATAAACGTTGATCGTTATAACTTTTCGTCAGTGAT
TGCTTGATTTCACGAATTCGTCGTTCGACTTTACCATTGTAGTTATGTCC
ATCGACTGGACACAATTCGAATTCTACATCAACATGGTAGTGGAGCTTGT
ACTTTGTGTCGTGAAAGTTGATCGTTGTGTTGTTGTAGGTTTTGAGAATC
TGCGAACCACGGTCTACGAATACTGATTTCGGATAGCCAGTGTCGCAGGC
GAAGCGTGTGAATGCTTGGAAGAAAGCTGGGCTGCTGTAATCGTCCATTA
TTTTGATTGAGGTTGTTGATGTTGTGGAGCAGACGAAAACGACTAGCCAG
ATTTTGATCGTCTTGCGTTTGTTGTGATTGGTGTAAGACAGAAATGGTCC
TGCCAAATCCACTTGACTGTTGTAGAAGGCAGGTGCAATGGTGAGTGATC
TGTTAGATGTCTTCCCCATTTCGACTtcgacttttttctttaagatgTAA
CGACAGAGCTGACAAGATCGACGTACCATCTTCACGATGTCTCGTCCTTC
AATGATGAATGCTCGTTTGAGTACATAACGCCAAGTTGATTCGACGCCGC
TGTGTTTGACCACGTTGTTATCCCAATGAACTTCGTTGACGATTGCGTAG
GAGATAGGTGAGTGCTTGTCGAGGATAGGCACACAGAAGGTTGTTGATTG
GAGATCTATCATAGCTTTCGTCATTGGTGTGGTGATTTGAACTTCGTCGC
TGTCGAGTATTCGTCCAGTGTAGGTGAGTATGCCGTTGATGTCTTTGGTG
AAACGTTTGTACTTCACAGTTTTGATGAAATGACGAACTTCTGCTGAACC
TTTCCACCAGTAGTAGTGTTCAGCACGTTTGATCTCGTCACTCGATAGGA
TGATCATTGATTTGTCGACCATTGAAATGTTGGGGAACTTCTTTGGACCT
TTAACCTTTGCTAAAGACTTGAGTGCATAGTAATATTTATAAACAATTGC
TAGGATCCTAACCACTTTCTTGAATGGAAACTTGTTCGGATCCAATAGAT
AAGAAGAGAACAGATATCTCTTCTTCACTTTGTCTGGAAGACTAGTTCCT
TGCCTTGATGCAAAATTGCAACTTGTTGATACCACAGTTGAAGTCTCTTT
CTTGATTTCGTTGATTTCAGTAAGGTTAAGAATAATATCTCTTACCGATT
TAATGGGAAGATCCTTTTGAGTCATCCACTTGTCTCCATTGATCCATCTT
GATTGGCTGTCAACATCTTGCAGTGAAGCTCCTCTTCTTGTTGCGATGTC
GGCTAGCATTTGATCTGTCTTGATGTAGAACCAATCGTTTGGGTTTGTAA
ATCGTTGGACTTCAATCACTCGATTGTGGACGAATGGTTTCAGTTTGATT
TCATCGTTGTGAATCCAGTGAAGGACGATTTGGCTGTCTGTGAGATTTGT
CCAACCATCATGTTTTGATTGCAGAGCTTGCTTGACAACTTCTCCAGTGT
GAGTGTTCAGGACGGCTGCCGAAAGCTCTCCTCTTGGCTGTGATGAAgga
ttttggatgattttcgagCGAGCAAAGATCAATTGACATGAGTAGAGCCC
GTTTTTACGAAGAACTCTTCCATAGATGGCTGAAGCTGCGATCGATTTGC
TGGCATCTCCAAAATTGAGGGTAGAAATTTTGACGTCGACGGCGTCCTCA
GGAATGATGCATCGGTTGAATGTTACATTTTTGATTTCCTCCATCATCTC
GAAGTGTGATTGCCATATTGGACGAAATGAATCTGGAATGATATCATCCC
AACCTAGCTTACGTTCAACTAAGTCATGGAGGTCGAGCTTCAATGCTGCT
GTAAATGGGGTCAACTTCCCAGTGATGTCGAAGATTTCCGCTGCTTTCGA
TACACAGTGTCGACGAGTGAGTTTAGCTGGGATTTCCTTTTGAGTAGTTG
GCTTCTTTCCTCTGACCTTCTTCGCGAAGTTGAGTTCAGCGAAATCGATT
GAAATAACGTCATCTTTGGAGAACCATTGAATACCTCCAACGTGGATACT
TTTACCGTCAGCAGAAAGTTTGTCGATTGGATCTTTTCCTGAAAAGGTGA
ATCCTTTAAGTCCAAATCCTCCTTTTGAGCAGACAATCTCCATTTCATCG
GCTCTTTGCATGGCAAGGTCGATGGATTCCTCACCGGTGACGCAGTCATC
GACATACACATCTCTTTCGATTATCTTGGATACGTCTGGATATTGCTCTT
TCATAAGGTGGGCGGTTTGGCGGAGTCCACGTTCCGATTGATTCCCTGAC
GATTTAACACCGTAGATTagtgtttttataatcttttcTTCGGGAGATGA
TCCAACGTTGAGGGAATCGTTCCAGAGATAGCGTTGGTAACACCAGTCGG
ATTTGGCAAGCTTAATCGAGTTGTACATCTTTGCAATGTCTGTGTGGAAG
GCGATTCTTTGAGTGAACCAACGAATGAAGATGTCGACGAGTCTATTCAT
GCCGTTGGAGCCTTTGGCGAGGATTGAATTGAGTGAGTGACCACTTCCAG
TTGGCTGCGAGGCGTCGAAGACTATACGACACGGAGTTGATAACGAATTC
GGTTTCTACACCGCCCTCCAGGGGATGTAGTTCTTTGTGACGTTGGCTTG
AAGTGCTTGATGTGATTTGATTGGGAGATTGCGAGCAAAGTCAACGTGAC
CGAGGTCTTGGAGTTTGCGTTCAGACTTGATAACATCTTGCTTGTCTTGT
TCGTACTTGTTGAGTCGGTTGACTTGTTGAAGGTAAACTTTCATCGCCTT
GTTTCGATTTGGTTCAAGACGAATTGTTGGGTCTTTCGTGAATGGTAGAG
TAGCAGTCGTGATTTTATTTTCGATGTCGACGTGAACTGATTTGTTGATG
AGGTGCTGTTCGACTTCTTCACGAATGCTGCTGGTCTGGTTGAAGTCGTG
ATCTTTGCAGTCGGAGCATGATCGACATTTGATGCAACGGTATGAGATGT
CACTTCCTGCGTCCTCTGCCATGTTGAAGATGCTTTCACGTTTGACATGT
GATTCGACGTTGACGTGGTTGGAGCTGTATCCCAATAATCGAACATCAGG
ATTGACTTGATATCCTACTTGATAAGATCGAAGTTGGTTAGAAAAGAACG
AAGTGAAGTGTATACCTTGCTTGTTGATTGATGAGAAGATTTGATGAGGT
CCACCAATAACACCCCGACTTCCATCTGGATTCTTGAATGCAGATTTATA
AATCGTCAATCCAGAAGGCATTTTGAAGATTGGTTCGGGATGGTAACGTA
GAAATCTGATGCCGATCATCAGGTCGACTTCACCACCAATTGATGTTGGG
ATTGTTGGAAGGTTGGCTATACTCCTCccatctttcaaaaaagatgATTT
CAGATCGTTGTAAGCCTCTTGAAGTGGGTACGTGGGAAATTTGCGGGTGA
TTCGATCCAGGGATGGTCCAAAGAAAGTTGCTGGTGGGCCATCGGCTGTT
GGAATGCGTACAGTGTAATCTCCACGTGTTTTGGCTGACACACCACCGAC
TCCACCAATATTGATTGATTCGTTGGATTCGAGTGTTGCGTTGTCTTTAA
GGCGTTTGGCTGCCTCTGAGCGGATGACGAAGTCGCTGCACCCTGTATCG
TAGAAGACGAGATATGTTTGATTGTTGATTGATATTTGTTGTAGCATGTA
GATGGCTATCTCAGATTGATTGTTGGCGTTTGCATGGTAGTCACCAGGTT
GAATGTCGACGTGATGGACCAGTTGGATATTCTTTGCACAGTCTGGAAGA
TTGGGGTTTCGAATGAACCTTGCCTTGAAGTCAGTGAGAAGTTGTTCGTT
TTGAGGATTCGTCTTGTGTTCCTCGCACACCAAAACGTGTTTCTTGATTG
GATATTGATCATGACTTTCGTGTGGGCATACAAAGTCGTGTTGGCAACGT
CCATCACGGTGTCGTCCTGTGTTGGCAAGTGCTCCCGGAAATAAGCATTG
AAAACATAAGTTATTACTGGATAGGTGCTTAAATCTTTGACGAGGAgaca
tttttgagaatttctCGCAGACATAGTATTGAGTGAGTTTGGAGTTACTA
GGACCAGTAGTTGAGAAATGATCAGTGGCACCACAGATTTGACAGGCGTT
aggtttattgaaaaaattggaacgACCAACCTTTCCTCCCTTTGGTGGGT
TGTCCTGTTGATTCTGTTGGCCATTGGCGAAGTTGATAAGCTCTTTCTGT
TGGTAGATTTTGATTTCTCGTTCCAGGAAGGTGAGAAGTTTAGTCCACAA
CTCTTTACCATCAGGTGTCTCGTCTTCTTCTGCACACGAGGTCAGCCACT
TCATGGTGATTTGATTGCCCATCACATTGTAAATTTGATTGATACCGTCA
CCATAGTAGAGATGTGGTTCGATTTGATGCTCACTTGCCAGACTCATCAA
TTCTTTCATTAGATTGATAATCTTTCCAAGAGCTTCGACGAATTTGGTTG
GCTCTCTAATTTTCGACAATTTATCTAATTGGGTAAGCTCAAAATGTTTG
TTAGACAATAAACGTTTGACGTCACCAAAGCTTTTCTTAAGAATGCTCCA
GATTTCGTTGATGTCTGACTCATGTTTCACAATAGATAATGCTGTACCCT
caaggaaattatttttcagaaaGTCTGGCATCATATGCTTTGGAACGGTA
GTTGAATAGAGTTTATCAAAGTCACTTTTAAACTTGTAGAAGTTGATGGA
TGAAGAGTAGCCACTGAATTGAGGAAGTTTGATTGAAAGCTGGGATTTGT
TAAAGGTCTTGACTTTATTGAGGTCACGCCCTTTGATCTCGGCATcgata
aatttctcaaatgagATAAATGTTTGAAAGTAAGTTCATACCCTTCTTTG
AGCttagtgacgtcatcaagtttTCCGGTAGGGCATTTCGAGATGAGAGT
AGCAGTGCGAGTagaaagtctctcaaagtcCTTCGACATTGACGTGATGC
ATTTTTTCATCTCTTCGAGTTCCTCATTAGTTGATTCAGTGATGTTTGTT
TTAACTTCCTCAAGGTTCGTACCGTTGGGTTCCTGGATGTTTGGTTGGAT
TTTCGATTTCAACTCTTTGAGTTTTCCTTGTACGTCTGTGAGCTCGAAGC
TGAACCATTGTTGATCTGCGACAATGTGGCGGGAAGATGCGACACTCTGA
CGTGCGGACATGACGGTTTGAGCATTGAGAAGATACGTACTGATAGATGT
CATGACTGCTTTGTATCTGGGGGCTTCTCTGCCAAATTTTGTTCGGTAGA
ATGATCGAAGATATTCTGCATGCTTGCGGTTATTCTCGATAACATTGTTG
GGTGTGCTTGCGATGATCGGATGCTCTGCGATGAAATCGTCAATCTCATC
AATCATGCAATCTGCACTGATTTCGTCAATTAATTGAGGTTTGGTATCCA
TGACGTTGTGAATTTCTCGTTGTTTGAATGTAGTCGGACAGAAAATGAAT
TGACACAAGTGTTCGTAACTTTTGTGATAGAGTTCAaactgaatgaataa
aaaaatgacaagatttaATCTAGGTAACAAagtgagaaaaatgaagaata
atgaaaatattgacaaagtattttagaggaaaataaaagaaatctaagtt
aataaattaaataaattcttaCCAACTTGCCAGAAATAACTGTGGTGTAA
ATTCTGTccaataaattaaaattgaaaattgatgttgaaagtttgaagac
gtgaatttgaatgtttactTTGAAAGTTTGATTATTTGACTTGAGTTCAC
ATTTTTCCTCGTATGATGCCTCAACAGACACTTAATtgattatgaaaaat
tgaactgaTACGAAAAAATCTGAGTGTAATTTGAAATGCTAGAAAAATCG
CTAAGGTATAAATGATATAAATGATACaaagaaatgaataaatattttta
attgttttgtgcGTTTAAATAAAATGACGTATGCAATTAAAATGGGATGA
CTTTTTGCAGTCATTAGGGACGCGTGCGcctaacaggggggggggggggt
cctaataaggtccgggggggttggaaaattttcgaaaaattaacaagcgg
gggggcccgtttatttggaacatAAGAGTAAGGTGAAAGtcttggctgaa
attttgggaaGATGTCTTAGGGTcgtttttcgaattttggctagaacccg
tcatctcgcaaacctagtaccctccTCCTCATGGGTTTTTAAAGTTTCAA
GAGCCAGAGTGATAAATCAGCAGAAAACCTgttcatttcaatgttttttg
cTTTCTAGGCAAAAACTCCAGAGCAGTGGGAATCGAATCCGAAAATATCA
GAATCTCCTAATTGTATGGGTGGTAGTAAAAGGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000333_pilon:131894..141779+ >XLOC_037359 ID=XLOC_037359|Name=XLOC_037359|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=660bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000333_pilon:131894..141779+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atggctacCCTTGCAGCAGGGCCTGTACGTCAAGCAGTTATCAAGAAACT CACAGAGGCATTAAAGatggctacCCTTGCAGCAGGGCCTGTACGTCAAG CAGTTATCAAGAAACTCACAGAGGCATTAAAGCCAGCTCATCTGGATGTA ATCAATGAAAGTTTCATGCACAATGTTCCAGCAGCCAGCTCATCTGGATG TAATCAATGAAAGTTTCATGCACAATGTTCCAGCAGGCTCGGAGACTCAT TTCAAAGTGATTGTAGTTTCAGATGCTTTCAGCAAGAAGCCATTGATTCA GGCTCGGAGACTCATTTCAAAGTGATTGTAGTTTCAGATGCTTTCAGCAA GAAGCCATTGATTCAGAGGCATCGTTTAGTAAATGAGACACTAAAAGAAG AACTGGCATCTGGGGTACATGCACTTTCTATCCAGAGGCATCGTTTAGTA AATGAGACACTAAAAGAAGAACTGGCATCTGGGGTACATGCACTTTCTAT CCAGGCAAAAACTCCAGAGCAGTGGGAATCGAATCCGAAAATATCAGAAT CTCCTAATTGTATGGGTGGTAGTAAAAGGTAAGCAAAAACTCCAGAGCAG TGGGAATCGAATCCGAAAATATCAGAATCTCCTAATTGTATGGGTGGTAG TAAAAGGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000333_pilon | genome | sc0000333_pilon:131894..141779 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 253-330:9809 |
| Aaloc | 184-252:1574 |
| Aaloc | 121-183:1270 |
| Aaloc | 67-117:554 |
| Aaloc | 1-66:1 |
|