XLOC_037301 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037301
Unique NameXLOC_037301
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000285_pilon:406402..413731-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037301 ID=XLOC_037301|Name=XLOC_037301|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7330bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000285_pilon:406402..413731- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGGCTGGAGCTGATATCCTTGCTACTCTCCAACCTTTTTACACTTTG TAATTCTTACACTTTTATGGACAAAAACAAATCATTTCTTCAATATAAAC AATGGAATATGGATCAAACGGGAACACTGAGTTTCAAGTTCAAAACATTA AACACATATGGACTTATCTTATACAGTGATACAAGTGAGACGTCCGAATA CACGGAAAGTTATATCGCTATGAAATTAATTTACGGACAGCTAGAAGTCA CCATACAAATGGGCGCTGATGATTATCGATCTAATAGAAGAGTTAAACTC GGATCAAATCTAAATGATTTAGAATGGCATACTGTAGAAATACAACGCGA CGCTGACCATCGTCAAGTGACACACGTGCGGCTTGATTCGGAAGCGCAAA GTCTTTTTAACGATGGTGAACATGATCGTATGTTTTTAAATTCTGGTCTC TTTTTTGGTGGATTACCGCAGAAAATTGATAACATTGTGGATGGGAGTTG GGAACTAGAGCCAAGGTAATACCTGTTCAGCGTTTAGCTGTTTTTACCTT TTTTTCTGTTTCATCTGACTTGATTTTAAGGAAATTTCAACTTATTATTT CTCAATAAGTCAGCAATTTCAGTCAGTTTTTACTTATTTATTAGCCTATA GAAATCTAAGCTAGTTTGATTCAGTCACTAGGATAAATTTGATGGCAAGT TGTGAGTGAATAACATTATTCCAAGGAAAACTCCGTAAATATAAAAAATC TTTAAAGCGCCGAAAATGCTCTATCGCCATAGGCCGTTTGTTTTAGCATT GTGAATACGGGCTTAGTTAACCAGACTACTCATTTATAGTCAATAAATTA AAATTATTAAAATGAAAATCCATAATAGTAATTGATTCGTAAATTTATAG CAAGCACAGGATGAATTATGCGATATTTTCGTCTCTCTAACGATGCATTT TAGTCTCGAAATCCTAGTTTCAAAAGGGATCAATTTATCCTATACGTCCT CCTTTGATGAACCGCTATCGGATCAGTTTAAAATCATAAGAAGCTCTTGA TGAAATCAAGTCCTGACATTACTTGATAACATCTTGTAGGACAGATAAAG CTAAGAGGACTTTAAACTCTTATTCTAATTATTACTATTGTTCTTCAGGT TCTAATTAGTGACATGGAAGTTTAGTAGCTCTGCAAAAATATCAAAATTC AATTTGTCTTTAGTTAAAATACTATATTTGGGTAAATTTTCCATGTGAAA AGGCTATATTATTTTACCATCCGATAAAGTAAAATAATCAAACAGCTTTT CTAGATATTTTTAAGACTGTAAATACACCCTTTTTATACAAGAACAATTT TATAAGAATATCGAGGCCCAAAAAAATTCAAAAATAAGAACAATCTAAGA ATACCTGGAATTGAATGGATTTAGGGGTCAAACAAGTAAAAATAAAGGTA TTAGATAGAAATTCAAAAATTTGTCATCGAAAGGAGGGGAGGTCGGAAAA CATGAAAAGAAATCATAACAGGATAACAAGATAATTATATACAACATCTA TTACATCATAACATACAATCATATTACATCATAATATACAAAAGCCTAAT ATCTGATAATCTTGTAACAAGGAAACGCTATAAAATAAGATTAATTCAAA AGCCTTTGTTTATGTAGACTCCGCCAAGCAATTTTTGATAGCTAATTTTT AATAGCCCAAATAAAATTAAACTGGATTTGTAGGAAAATCTATTCAGGAT ATTATGTAGGTAATGTAATCTATTTTGAGACTATTACCTACTTTGGATAA TAGAATATTCGCAGAATTATGTTCTCAGAAAAAAATGCATCACAAGAATG TTGACTCATTTTTTTCGAATTCTCATTTCGAGATTTCAATTTCAAAATTT CAAAAACTTTAAAATAGATCATGATCATTCAATTTTGTTGATAAATATAA TCTTAAATGGTATAAGGTAAAAGGCTGCTAATATTTCTTTAGATGAAACA TAAATTTTAACTTGTCACCCTTTTTTCTCTATTTTTAGCAAACTTTAAGA ATGCCGCATTTCAAAATTTTAACAAACTTTTAAATTCATTTTCGTTGGTT TATTTTTTTTCTCGTTATTTTATTCAACAATTTTCATTTCATTATTAAAT TAACAACCTACTAAAACTCGACTAATTATTAACCCCTTGGTCATCAAGAA TCATATGACTATCCTTGGACCAATCAGAAGCCAAGAAAACCACTTAAAGA ACCAATGAAAACCAGGTATTAACAAACACGACTAACATTATTGCAAGATT TCTATATGCTCATTTTGCTTTTTCTATTCAAATAAAGCAGGCTAGTGGGT TGCATTGAAGAAGTGAAATACAAATCAGGGGCTAATGAGACTTTCACAGA AGGTGAACTTTTAGCCTCTGATGAAGTGAAACCAGGCTGTATGAATGCTT GTCAGGAAAATGTTTGTCCGAATGGAGGGAAATGTATCAATTATTTCACG GAATACCGATGTGATTGTATTGGAACTGGATTTACAGGACCTTCTTGTCA AAAAGGTACCTCCTTGTCATACATATATTCATATGCTACTGTTATGCAAC TTTTCTGTAGGAGGGGATGCAACTAGGATTTAACCAGGATTTGAGAATAT CGGGTATGTGTGGACTCAAAAAAATTCCTGAGCTCAAAGAGTATTTTTTT TACTTTTCATGGTTTTCGTACCTTTAGATACAAAAAGGGAAAATATCGTA CCTTAGAGAAATAATTTTAACTTTTTTGTTGTTTTTATAGCCCTTAGTAT AGAGAGACTTTAAGAAGGTAAAAAACCCATACCGTCCGCACATACTAAGC ACCTATTTTTTCCTAAGTACCTTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGGAAAAG TCACGAAATTTTGGACAAGTGACGAATATTTTCCCCGACGAAAATTTTCC CCGGCCTTAATGCGTTTACCAACTACCAGCAAGTGACGAATTTTTCCCTG ACGAAAATTTTCCCCGACAAAGTTTTCCCCGCTAAGGTACCCTCTCTCCC CTGAGAGCAAGCTTTTCTAAAACACGTTCGTTCGTTCGTTCACTCATTCT ATATTCAATACTTCAATTCTATTCTCATGGTATAAAAAATGTTCTTTCCA ATTCGTACAGAGGCTGACATCATCTCATTCGACGGTAACACTAGGCTGGA AATTAATGTTCCACCTAGCCTACGATCGACAACGAACAATCAGATCGCGT TGCGTTTCAAGACACGAGAATCAAATGGTCTTATCATGGCAGCGTGGTCG AAGAATGATCACCTTATGATTGAATTGAAAAACACCATCATTCAATTGAG TATTGATCTAGGAGGAGGTTGGTCTTTTTTTGTCAAGCCATATATTTTGC AGATAGATACAGATTTTACGTAGATAACCCAGTAAGCTAGGACTTTTAGA CTTCTATAGTTCTGTTGGAACTATAGTCTATACTCATTATCAACATCCTC CGATCTAGGTCTAGGTCCCTATGTCGGGAAACAAACAAACCCCCCTCCAC AAATCGCGATCAGCCATTGTAATACCCATTTCATCGAAAATCGCTGTTTC CCATTTCTCCAAGGGATGTTAGTTTTCTCGAGTTTCTTGGGACAGGACAC CAAAGTAAAATATCGGAAAAAATTTCATTTTTGCATGCATAATACAATTA TAGTTTCCATGGAATTTCATCCTCAGTTGTTTTTGCTATTAAAACACCCA AAGTTACATTACTTGATCGAAACTTCGATTCTGTGCCTCAAAATTCTGTG CCTCAAAATTGTTACAAACTGACATTGTTATTTACTTTGCAGGTTATCAC GTGTTCCGAGTAAACGATCAATCATTCAGCGATGGGTTGTGGCATTTGAT TGAGATCACACGAAAAGGACGAGATGTCTATTTAGTCGTTGATAGAAAGT AAGTGTTTGATGCTGGAGCATAACAAGTGTTCTCCGCTTACGTAAAAATC TTTCATTCCTTGCAGAATTCAAATTCCAAACAGCCATAACGGAGGCGAAA CCACTTTTGGACTGCGTGATTTTTCGATTCAATTTGTAAGTTTCTACATC TTTACATCTTAAACATTTGATCGTTTCTGATAGCAAAAGCACATATCATC ATATACACCTTTTCGACTGTAGTCGCGCGGTCAGGCGTGTGCCACTTTTT TTTATCTAATTACCCCCTAAACTCGATTCAATCCTTTTTTTGCACCTTTT TCTATTGTCTGTGGGCGCGAAAAAAAGACAGGGACGGTTTTAGGGTGGTA AAATGGACAAAAAAATGCCCGCACGGCAATTGTTGGCTACGGTCGAAAAG GTGTATTGCATCGGCCAGACTACTTGTAACGTGGTGGGTATTTTATTATA TTGTTGTTTTATACGGGTAACACTGCACTGCAATACAATTCCTAGTTTTC AAATTCCGACTCTTGATTTCTTTTACTGCAGATATTTCATGGACCGTTCG ACGAGTGGTCAATTCAGTAAATTCGATCTACGAGAGAAATTATACATTGG TGGCCACCCAGATGTCAAAGGTTTGGGTGATATCAACAGTAATAGTGGAA CTAACTTCAAAGGATGTATACAACAAGTCTATTTCAATGAAGTAAGTTAG GTCACTGTTAATATGAATGCAGGAAGGCGTCCCGGCTCGTCTTCCAAATC GCAAATGTTCTGCCCAGTTAAAAGATTGGCTTTGTTGCCTCACTGTTTTC CAAAAGTCATAGTTTCAAAAAAATTAGCGTCTCTATCAACTAACGATTGT AAACCGCAGATTTATAAAGCCCAAAGGGCTAGATGTCTTAAGCCATCGCA GGCAAAAAAAGATTTAACATCGGAAAAAATATTTTTGCTATCATTTTCGA AAACCCGCGAAGCTTCTGGTTCGAGCGCTGAAATTCTATTGTAATGTCAC GTGACCTAGGTAGGATTTCCTACCTAACCACGGCACACTTTTCGGCCGAA GTACAACATCTAGCCCTTCGGGCTTTATAAATCTATGTTGTAAACTCCAC CCATATATAATTCCATGTTTACAATCCCTTTAACGAACGATACATACAGT ACCCAGCTGGCACACAACGTCGTTTCAACGTCCATCTAATGCTTCCAACG TCCATATAACGTTAGATGGACGTTGAAACAACGTTGTCTACATTTACAAC TTCCGGATTAGATGAATCTTTAACCTTTTATCTTTATCTTTCATAGCTGA ACATCATTTACAAAGTATTACACACAACAAATCAAGCTTATTATTTGAAC GGTACAAAAATCACTAATTGTAGTGTGACCAAGGCCAAGAAGATTGTGGT GAGAGGAAATAAAGGTAAGTGAAACCAGGGAGTTTGAGATTCATTTTTAT CGATTATTTAATGTAGGATGGCTTGTAAACGTTTTCATTCCCGGAGAAAC ATTCCTGGCGCATTTCCGGGATCTTTCCGCTGTTTTTTTTTCACACCAGC AAAAATAGTATTTTTTCGTGCGACAGCGTATGGAAAAAACTTCAAATTCG CCTAACAAATTTAAGTAATTTTTCACCTACCCAGAGTCTCAGTCTCTTTC CGTTGTAAATTGGTTTTAAAAAATGTTTTTGAATGTAAAAAAGAATTTGC AAGTGTTCAATAGCGAGGTTAAGCACGGCTTTATTTTGACCGTAAAGTGC GATACCGTAGGCCTGTACATAACTTGCCAAAGCAAACCATGCAAGTGAAA TCTTATGTACAGGCTCTACGATATCGCATTGAGCGGTCTAAATAAACACT TGCCTAACCTCGCTAATTAGTTTTTAAGACACGTGAGATTTGCTTATAAA ACACGTGTATCTAGCCGTAATTCTTGGTGGAGAATTTCTCTAATGATAGA AAATCTTAATTATAGTTATTAAAGGGGCAATTTACGCTTTGAAATAATGC ACTTGATTCGAATCTAATGTAATGAAATTTATAATTGATGAAACCATCAT CTTATTTTATTGGCCCTCCTAAATGAAAAAACCCTTAAAACTTGAGAAGT TGGTAAAAAGTTATCAGAAATGTCAAATGATGTCAAAAGTCATTGCCTGT GAGAAAATTAACACAACGGCTTTGACGAAAATCCTTCGTGGTAAACTCCT GACTCCTGTTATATAGGCTTAAATAGGTGCTGAGTATATGCAGCCAGTCA GGGCCTATACTTTAACCTTCCCCGACTCACTCTAAACAATAAACCCCTCC CCTAAGGTTCTGGATCCCCCCTTTTTGGTTCTCATCTAGGGCACGAATGC CATGTATTTAAAGCCAGCCCTGGTACATCTCAGGTATATCGGGGCACTCT ACAAATAGTTTGTTCAGTTATTCAGCAATTTTTTTATATTTCCAGACAAT AAAATCAGCGAGAGTGCCAAACCAAGTGAAGAAAAATCTCCAACTGCTTC TTCAAATTCCAAGGTAATTAAATTTTTTTCTTATCCTAAAGTATCCTAGA AACCTAAGCTAGTTTGATTCAGTCGCTATGATAAATCTGATGGTAAGTTG TGACTGAATAACAGTATTCCAAGGCAAACTTAAAATCCGTAAATATAAAA AATCTTTAAAACGCCGAAAATGCTATATTGCCATTAGCTATCCTAACAGC GTTTCTTCCATAAATTGATATCATTTCATTAAGTGCTCCTGGTATCATAT GAGATCACTCAATTTTTACAGTCTTATACCGCCCAGTATTTTTAACACCG CCAGGTTAATAACATTGTTTTTATGATACATACAGGGGCCTCGGCTCCAC TTTAAAAGTGATAGGACCATGATATACCGACGAAGAAGGCGCCATGGTTG GCGCCGACGGGGGGAGCAAAATTTGGCTTGATTAGTAAATTTTTTTTTTT ACTTTGAAAAAATGTGGTCGGACCAAGGCCCGACTGGCCCACTGATGCTA CGGCGCCTGACATAATTTAAAAAAGAGCCGAATATTTAGTTTTCCAAAAT AAGAAGGAATATGAATTTGTAACTGACAGTTAATGGTTTACTTTCTAATT TGTTTTTCAGGTATCTAAAAAGCACGTCGATGACGAAAGCAAAACGTTAA GTAAAAATTCAGTCACGTGGATAGTTGTTGGGTTAGTGTGCGGAACGCTT GTCTTAATCGTAACCGTTATCGTGATAGTACACAATGTCAAGCACCGATA TAGCGGAGTGTTTTTATCCTCCCACGTTAAAGAACAATATCAAAAACAAT TGACGCCCGATGGCGCAGGAACTTTATTGTTTCAACCAAGAAATGGAGGG CGGATTGTTATAGAACCACATCTGGTGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000285_pilon:406402..413731-

>XLOC_037301 ID=XLOC_037301|Name=XLOC_037301|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3324bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000285_pilon:406402..413731- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGGCTGGAGCTGATATCCTTGCTACTCTCCAACCTTTTTACACTTTG
TAATTCTTACACTTTTATGGACAAAAACAAATCATTTCTTCAATATAAAC
AATGGAATATGGATCAAACGGGAACACTGAGTTTCAAGTTCAAAACATTA
AACACATATGGACTTATCTTATACAGTGATACAAGTGAGACGTCCGAATA
CACGGAAAGTTATATCGCTATGAAATTAATTTACGGACAGCTAGAAGTCA
CCATACAAATGGGCGCTGATGATTATCGATCTAATAGAAGAGTTAAACTC
GGATCAAATCTAAATGATTTAGAATGGCATACTGTAGAAATACAACGCGA
CGCTGACCATCGTCAAGTGACACACGTGCGGCTTGATTCGGAAGCGCAAA
GTCTTTTTAACGATGGTGAACATGATCGTATGTTTTTAAATTCTGGTCTC
TTTTTTGGTGGATTACCGCAGAAAATTGATAACATTGTGGATGGGAGTTG
GGAACTAGAGCCAAGATGAGGCTGGAGCTGATATCCTTGCTACTCTCCAA
CCTTTTTACACTTTGTAATTCTTACACTTTTATGGACAAAAACAAATCAT
TTCTTCAATATAAACAATGGAATATGGATCAAACGGGAACACTGAGTTTC
AAGTTCAAAACATTAAACACATATGGACTTATCTTATACAGTGATACAAG
TGAGACGTCCGAATACACGGAAAGTTATATCGCTATGAAATTAATTTACG
GACAGCTAGAAGTCACCATACAAATGGGCGCTGATGATTATCGATCTAAT
AGAAGAGTTAAACTCGGATCAAATCTAAATGATTTAGAATGGCATACTGT
AGAAATACAACGCGACGCTGACCATCGTCAAGTGACACACGTGCGGCTTG
ATTCGGAAGCGCAAAGTCTTTTTAACGATGGTGAACATGATCGTATGTTT
TTAAATTCTGGTCTCTTTTTTGGTGGATTACCGCAGAAAATTGATAACAT
TGTGGATGGGAGTTGGGAACTAGAGCCAAGCAGGCTAGTGGGTTGCATTG
AAGAAGTGAAATACAAATCAGGGGCTAATGAGACTTTCACAGAAGGTGAA
CTTTTAGCCTCTGATGAAGTGAAACCAGGCTGTATGAATGCTTGTCAGGA
AAATGTTTGTCCGAATGGAGGGAAATGTATCAATTATTTCACGGAATACC
GATGTGATTGTATTGGAACTGGATTTACAGGACCTTCTTGTCAAAAAGCA
GGCTAGTGGGTTGCATTGAAGAAGTGAAATACAAATCAGGGGCTAATGAG
ACTTTCACAGAAGGTGAACTTTTAGCCTCTGATGAAGTGAAACCAGGCTG
TATGAATGCTTGTCAGGAAAATGTTTGTCCGAATGGAGGGAAATGTATCA
ATTATTTCACGGAATACCGATGTGATTGTATTGGAACTGGATTTACAGGA
CCTTCTTGTCAAAAAGAGGCTGACATCATCTCATTCGACGGTAACACTAG
GCTGGAAATTAATGTTCCACCTAGCCTACGATCGACAACGAACAATCAGA
TCGCGTTGCGTTTCAAGACACGAGAATCAAATGGTCTTATCATGGCAGCG
TGGTCGAAGAATGATCACCTTATGATTGAATTGAAAAACACCATCATTCA
ATTGAGTATTGATCTAGGAGGAGAGGCTGACATCATCTCATTCGACGGTA
ACACTAGGCTGGAAATTAATGTTCCACCTAGCCTACGATCGACAACGAAC
AATCAGATCGCGTTGCGTTTCAAGACACGAGAATCAAATGGTCTTATCAT
GGCAGCGTGGTCGAAGAATGATCACCTTATGATTGAATTGAAAAACACCA
TCATTCAATTGAGTATTGATCTAGGAGGAGGTTATCACGTGTTCCGAGTA
AACGATCAATCATTCAGCGATGGGTTGTGGCATTTGATTGAGATCACACG
AAAAGGACGAGATGTCTATTTAGTCGTTGATAGAAAGTTATCACGTGTTC
CGAGTAAACGATCAATCATTCAGCGATGGGTTGTGGCATTTGATTGAGAT
CACACGAAAAGGACGAGATGTCTATTTAGTCGTTGATAGAAAATATTTCA
TGGACCGTTCGACGAGTGGTCAATTCAGTAAATTCGATCTACGAGAGAAA
TTATACATTGGTGGCCACCCAGATGTCAAAGGTTTGGGTGATATCAACAG
TAATAGTGGAACTAACTTCAAAGGATGTATACAACAAGTCTATTTCAATG
AAATATTTCATGGACCGTTCGACGAGTGGTCAATTCAGTAAATTCGATCT
ACGAGAGAAATTATACATTGGTGGCCACCCAGATGTCAAAGGTTTGGGTG
ATATCAACAGTAATAGTGGAACTAACTTCAAAGGATGTATACAACAAGTC
TATTTCAATGAACTGAACATCATTTACAAAGTATTACACACAACAAATCA
AGCTTATTATTTGAACGGTACAAAAATCACTAATTGTAGTGTGACCAAGG
CCAAGAAGATTGTGGTGAGAGGAAATAAAGCTGAACATCATTTACAAAGT
ATTACACACAACAAATCAAGCTTATTATTTGAACGGTACAAAAATCACTA
ATTGTAGTGTGACCAAGGCCAAGAAGATTGTGGTGAGAGGAAATAAAGAC
AATAAAATCAGCGAGAGTGCCAAACCAAGTGAAGAAAAATCTCCAACTGC
TTCTTCAAATTCCAAGACAATAAAATCAGCGAGAGTGCCAAACCAAGTGA
AGAAAAATCTCCAACTGCTTCTTCAAATTCCAAGGTATCTAAAAAGCACG
TCGATGACGAAAGCAAAACGTTAAGTAAAAATTCAGTCACGTGGATAGTT
GTTGGGTTAGTGTGCGGAACGCTTGTCTTAATCGTAACCGTTATCGTGAT
AGTACACAATGTCAAGCACCGATATAGCGGAGTGTTTTTATCCTCCCACG
TTAAAGAACAATATCAAAAACAATTGACGCCCGATGGCGCAGGAACTTTA
TTGTTTCAACCAAGAAATGGAGGGCGGATTGTTATAGAACCACATCTGGT
GTAAGTATCTAAAAAGCACGTCGATGACGAAAGCAAAACGTTAAGTAAAA
ATTCAGTCACGTGGATAGTTGTTGGGTTAGTGTGCGGAACGCTTGTCTTA
ATCGTAACCGTTATCGTGATAGTACACAATGTCAAGCACCGATATAGCGG
AGTGTTTTTATCCTCCCACGTTAAAGAACAATATCAAAAACAATTGACGC
CCGATGGCGCAGGAACTTTATTGTTTCAACCAAGAAATGGAGGGCGGATT
GTTATAGAACCACATCTGGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037301XLOC_037301-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000285_pilongenomesc0000285_pilon:406402..413731 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1393-1662:271
Aaloc1327-1392:934
Aaloc1207-1323:2085
Aaloc1048-1206:2849
Aaloc943-1044:3487
Aaloc736-939:4169
Aaloc517-732:4993
Aaloc1-513:7331