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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000285_pilon:406402..413731- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_037301 ID=XLOC_037301|Name=XLOC_037301|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7330bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000285_pilon:406402..413731- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGGCTGGAGCTGATATCCTTGCTACTCTCCAACCTTTTTACACTTTG
TAATTCTTACACTTTTATGGACAAAAACAAATCATTTCTTCAATATAAAC
AATGGAATATGGATCAAACGGGAACACTGAGTTTCAAGTTCAAAACATTA
AACACATATGGACTTATCTTATACAGTGATACAAGTGAGACGTCCGAATA
CACGGAAAGTTATATCGCTATGAAATTAATTTACGGACAGCTAGAAGTCA
CCATACAAATGGGCGCTGATGATTATCGATCTAATAGAAGAGTTAAACTC
GGATCAAATCTAAATGATTTAGAATGGCATACTGTAGAAATACAACGCGA
CGCTGACCATCGTCAAGTGACACACGTGCGGCTTGATTCGGAAGCGCAAA
GTCTTTTTAACGATGGTGAACATGATCGTATGTTTTTAAATTCTGGTCTC
TTTTTTGGTGGATTACCGCAGAAAATTGATAACATTGTGGATGGGAGTTG
GGAACTAGAGCCAAGGTAATACCTGTTCAGCGTTTAGCTGTTTTTACCTT
TTTTTCTGTTTCATCTGACTTGATTTTAAGGAAATTTCAACTTATTATTT
CTCAATAAGTCAGCAATTTCAGTCAGTTTTTACTTATTTATTAGCCTATA
GAAATCTAAGCTAGTTTGATTCAGTCACTAGGATAAATTTGATGGCAAGT
TGTGAGTGAATAACATTATTCCAAGGAAAACTCCGTAAATATAAAAAATC
TTTAAAGCGCCGAAAATGCTCTATCGCCATAGGCCGTTTGTTTTAGCATT
GTGAATACGGGCTTAGTTAACCAGACTACTCATTTATAGTCAATAAATTA
AAATTATTAAAATGAAAATCCATAATAGTAATTGATTCGTAAATTTATAG
CAAGCACAGGATGAATTATGCGATATTTTCGTCTCTCTAACGATGCATTT
TAGTCTCGAAATCCTAGTTTCAAAAGGGATCAATTTATCCTATACGTCCT
CCTTTGATGAACCGCTATCGGATCAGTTTAAAATCATAAGAAGCTCTTGA
TGAAATCAAGTCCTGACATTACTTGATAACATCTTGTAGGACAGATAAAG
CTAAGAGGACTTTAAACTCTTATTCTAATTATTACTATTGTTCTTCAGGT
TCTAATTAGTGACATGGAAGTTTAGTAGCTCTGCAAAAATATCAAAATTC
AATTTGTCTTTAGTTAAAATACTATATTTGGGTAAATTTTCCATGTGAAA
AGGCTATATTATTTTACCATCCGATAAAGTAAAATAATCAAACAGCTTTT
CTAGATATTTTTAAGACTGTAAATACACCCTTTTTATACAAGAACAATTT
TATAAGAATATCGAGGCCCAAAAAAATTCAAAAATAAGAACAATCTAAGA
ATACCTGGAATTGAATGGATTTAGGGGTCAAACAAGTAAAAATAAAGGTA
TTAGATAGAAATTCAAAAATTTGTCATCGAAAGGAGGGGAGGTCGGAAAA
CATGAAAAGAAATCATAACAGGATAACAAGATAATTATATACAACATCTA
TTACATCATAACATACAATCATATTACATCATAATATACAAAAGCCTAAT
ATCTGATAATCTTGTAACAAGGAAACGCTATAAAATAAGATTAATTCAAA
AGCCTTTGTTTATGTAGACTCCGCCAAGCAATTTTTGATAGCTAATTTTT
AATAGCCCAAATAAAATTAAACTGGATTTGTAGGAAAATCTATTCAGGAT
ATTATGTAGGTAATGTAATCTATTTTGAGACTATTACCTACTTTGGATAA
TAGAATATTCGCAGAATTATGTTCTCAGAAAAAAATGCATCACAAGAATG
TTGACTCATTTTTTTCGAATTCTCATTTCGAGATTTCAATTTCAAAATTT
CAAAAACTTTAAAATAGATCATGATCATTCAATTTTGTTGATAAATATAA
TCTTAAATGGTATAAGGTAAAAGGCTGCTAATATTTCTTTAGATGAAACA
TAAATTTTAACTTGTCACCCTTTTTTCTCTATTTTTAGCAAACTTTAAGA
ATGCCGCATTTCAAAATTTTAACAAACTTTTAAATTCATTTTCGTTGGTT
TATTTTTTTTCTCGTTATTTTATTCAACAATTTTCATTTCATTATTAAAT
TAACAACCTACTAAAACTCGACTAATTATTAACCCCTTGGTCATCAAGAA
TCATATGACTATCCTTGGACCAATCAGAAGCCAAGAAAACCACTTAAAGA
ACCAATGAAAACCAGGTATTAACAAACACGACTAACATTATTGCAAGATT
TCTATATGCTCATTTTGCTTTTTCTATTCAAATAAAGCAGGCTAGTGGGT
TGCATTGAAGAAGTGAAATACAAATCAGGGGCTAATGAGACTTTCACAGA
AGGTGAACTTTTAGCCTCTGATGAAGTGAAACCAGGCTGTATGAATGCTT
GTCAGGAAAATGTTTGTCCGAATGGAGGGAAATGTATCAATTATTTCACG
GAATACCGATGTGATTGTATTGGAACTGGATTTACAGGACCTTCTTGTCA
AAAAGGTACCTCCTTGTCATACATATATTCATATGCTACTGTTATGCAAC
TTTTCTGTAGGAGGGGATGCAACTAGGATTTAACCAGGATTTGAGAATAT
CGGGTATGTGTGGACTCAAAAAAATTCCTGAGCTCAAAGAGTATTTTTTT
TACTTTTCATGGTTTTCGTACCTTTAGATACAAAAAGGGAAAATATCGTA
CCTTAGAGAAATAATTTTAACTTTTTTGTTGTTTTTATAGCCCTTAGTAT
AGAGAGACTTTAAGAAGGTAAAAAACCCATACCGTCCGCACATACTAAGC
ACCTATTTTTTCCTAAGTACCTTATCGGGGAAAACTTCGTCGGGGAAAAG
TCACGAAATTTTGGACAAGTGACGAATATTTTCCCCGACGAAAATTTTCC
CCGGCCTTAATGCGTTTACCAACTACCAGCAAGTGACGAATTTTTCCCTG
ACGAAAATTTTCCCCGACAAAGTTTTCCCCGCTAAGGTACCCTCTCTCCC
CTGAGAGCAAGCTTTTCTAAAACACGTTCGTTCGTTCGTTCACTCATTCT
ATATTCAATACTTCAATTCTATTCTCATGGTATAAAAAATGTTCTTTCCA
ATTCGTACAGAGGCTGACATCATCTCATTCGACGGTAACACTAGGCTGGA
AATTAATGTTCCACCTAGCCTACGATCGACAACGAACAATCAGATCGCGT
TGCGTTTCAAGACACGAGAATCAAATGGTCTTATCATGGCAGCGTGGTCG
AAGAATGATCACCTTATGATTGAATTGAAAAACACCATCATTCAATTGAG
TATTGATCTAGGAGGAGGTTGGTCTTTTTTTGTCAAGCCATATATTTTGC
AGATAGATACAGATTTTACGTAGATAACCCAGTAAGCTAGGACTTTTAGA
CTTCTATAGTTCTGTTGGAACTATAGTCTATACTCATTATCAACATCCTC
CGATCTAGGTCTAGGTCCCTATGTCGGGAAACAAACAAACCCCCCTCCAC
AAATCGCGATCAGCCATTGTAATACCCATTTCATCGAAAATCGCTGTTTC
CCATTTCTCCAAGGGATGTTAGTTTTCTCGAGTTTCTTGGGACAGGACAC
CAAAGTAAAATATCGGAAAAAATTTCATTTTTGCATGCATAATACAATTA
TAGTTTCCATGGAATTTCATCCTCAGTTGTTTTTGCTATTAAAACACCCA
AAGTTACATTACTTGATCGAAACTTCGATTCTGTGCCTCAAAATTCTGTG
CCTCAAAATTGTTACAAACTGACATTGTTATTTACTTTGCAGGTTATCAC
GTGTTCCGAGTAAACGATCAATCATTCAGCGATGGGTTGTGGCATTTGAT
TGAGATCACACGAAAAGGACGAGATGTCTATTTAGTCGTTGATAGAAAGT
AAGTGTTTGATGCTGGAGCATAACAAGTGTTCTCCGCTTACGTAAAAATC
TTTCATTCCTTGCAGAATTCAAATTCCAAACAGCCATAACGGAGGCGAAA
CCACTTTTGGACTGCGTGATTTTTCGATTCAATTTGTAAGTTTCTACATC
TTTACATCTTAAACATTTGATCGTTTCTGATAGCAAAAGCACATATCATC
ATATACACCTTTTCGACTGTAGTCGCGCGGTCAGGCGTGTGCCACTTTTT
TTTATCTAATTACCCCCTAAACTCGATTCAATCCTTTTTTTGCACCTTTT
TCTATTGTCTGTGGGCGCGAAAAAAAGACAGGGACGGTTTTAGGGTGGTA
AAATGGACAAAAAAATGCCCGCACGGCAATTGTTGGCTACGGTCGAAAAG
GTGTATTGCATCGGCCAGACTACTTGTAACGTGGTGGGTATTTTATTATA
TTGTTGTTTTATACGGGTAACACTGCACTGCAATACAATTCCTAGTTTTC
AAATTCCGACTCTTGATTTCTTTTACTGCAGATATTTCATGGACCGTTCG
ACGAGTGGTCAATTCAGTAAATTCGATCTACGAGAGAAATTATACATTGG
TGGCCACCCAGATGTCAAAGGTTTGGGTGATATCAACAGTAATAGTGGAA
CTAACTTCAAAGGATGTATACAACAAGTCTATTTCAATGAAGTAAGTTAG
GTCACTGTTAATATGAATGCAGGAAGGCGTCCCGGCTCGTCTTCCAAATC
GCAAATGTTCTGCCCAGTTAAAAGATTGGCTTTGTTGCCTCACTGTTTTC
CAAAAGTCATAGTTTCAAAAAAATTAGCGTCTCTATCAACTAACGATTGT
AAACCGCAGATTTATAAAGCCCAAAGGGCTAGATGTCTTAAGCCATCGCA
GGCAAAAAAAGATTTAACATCGGAAAAAATATTTTTGCTATCATTTTCGA
AAACCCGCGAAGCTTCTGGTTCGAGCGCTGAAATTCTATTGTAATGTCAC
GTGACCTAGGTAGGATTTCCTACCTAACCACGGCACACTTTTCGGCCGAA
GTACAACATCTAGCCCTTCGGGCTTTATAAATCTATGTTGTAAACTCCAC
CCATATATAATTCCATGTTTACAATCCCTTTAACGAACGATACATACAGT
ACCCAGCTGGCACACAACGTCGTTTCAACGTCCATCTAATGCTTCCAACG
TCCATATAACGTTAGATGGACGTTGAAACAACGTTGTCTACATTTACAAC
TTCCGGATTAGATGAATCTTTAACCTTTTATCTTTATCTTTCATAGCTGA
ACATCATTTACAAAGTATTACACACAACAAATCAAGCTTATTATTTGAAC
GGTACAAAAATCACTAATTGTAGTGTGACCAAGGCCAAGAAGATTGTGGT
GAGAGGAAATAAAGGTAAGTGAAACCAGGGAGTTTGAGATTCATTTTTAT
CGATTATTTAATGTAGGATGGCTTGTAAACGTTTTCATTCCCGGAGAAAC
ATTCCTGGCGCATTTCCGGGATCTTTCCGCTGTTTTTTTTTCACACCAGC
AAAAATAGTATTTTTTCGTGCGACAGCGTATGGAAAAAACTTCAAATTCG
CCTAACAAATTTAAGTAATTTTTCACCTACCCAGAGTCTCAGTCTCTTTC
CGTTGTAAATTGGTTTTAAAAAATGTTTTTGAATGTAAAAAAGAATTTGC
AAGTGTTCAATAGCGAGGTTAAGCACGGCTTTATTTTGACCGTAAAGTGC
GATACCGTAGGCCTGTACATAACTTGCCAAAGCAAACCATGCAAGTGAAA
TCTTATGTACAGGCTCTACGATATCGCATTGAGCGGTCTAAATAAACACT
TGCCTAACCTCGCTAATTAGTTTTTAAGACACGTGAGATTTGCTTATAAA
ACACGTGTATCTAGCCGTAATTCTTGGTGGAGAATTTCTCTAATGATAGA
AAATCTTAATTATAGTTATTAAAGGGGCAATTTACGCTTTGAAATAATGC
ACTTGATTCGAATCTAATGTAATGAAATTTATAATTGATGAAACCATCAT
CTTATTTTATTGGCCCTCCTAAATGAAAAAACCCTTAAAACTTGAGAAGT
TGGTAAAAAGTTATCAGAAATGTCAAATGATGTCAAAAGTCATTGCCTGT
GAGAAAATTAACACAACGGCTTTGACGAAAATCCTTCGTGGTAAACTCCT
GACTCCTGTTATATAGGCTTAAATAGGTGCTGAGTATATGCAGCCAGTCA
GGGCCTATACTTTAACCTTCCCCGACTCACTCTAAACAATAAACCCCTCC
CCTAAGGTTCTGGATCCCCCCTTTTTGGTTCTCATCTAGGGCACGAATGC
CATGTATTTAAAGCCAGCCCTGGTACATCTCAGGTATATCGGGGCACTCT
ACAAATAGTTTGTTCAGTTATTCAGCAATTTTTTTATATTTCCAGACAAT
AAAATCAGCGAGAGTGCCAAACCAAGTGAAGAAAAATCTCCAACTGCTTC
TTCAAATTCCAAGGTAATTAAATTTTTTTCTTATCCTAAAGTATCCTAGA
AACCTAAGCTAGTTTGATTCAGTCGCTATGATAAATCTGATGGTAAGTTG
TGACTGAATAACAGTATTCCAAGGCAAACTTAAAATCCGTAAATATAAAA
AATCTTTAAAACGCCGAAAATGCTATATTGCCATTAGCTATCCTAACAGC
GTTTCTTCCATAAATTGATATCATTTCATTAAGTGCTCCTGGTATCATAT
GAGATCACTCAATTTTTACAGTCTTATACCGCCCAGTATTTTTAACACCG
CCAGGTTAATAACATTGTTTTTATGATACATACAGGGGCCTCGGCTCCAC
TTTAAAAGTGATAGGACCATGATATACCGACGAAGAAGGCGCCATGGTTG
GCGCCGACGGGGGGAGCAAAATTTGGCTTGATTAGTAAATTTTTTTTTTT
ACTTTGAAAAAATGTGGTCGGACCAAGGCCCGACTGGCCCACTGATGCTA
CGGCGCCTGACATAATTTAAAAAAGAGCCGAATATTTAGTTTTCCAAAAT
AAGAAGGAATATGAATTTGTAACTGACAGTTAATGGTTTACTTTCTAATT
TGTTTTTCAGGTATCTAAAAAGCACGTCGATGACGAAAGCAAAACGTTAA
GTAAAAATTCAGTCACGTGGATAGTTGTTGGGTTAGTGTGCGGAACGCTT
GTCTTAATCGTAACCGTTATCGTGATAGTACACAATGTCAAGCACCGATA
TAGCGGAGTGTTTTTATCCTCCCACGTTAAAGAACAATATCAAAAACAAT
TGACGCCCGATGGCGCAGGAACTTTATTGTTTCAACCAAGAAATGGAGGG
CGGATTGTTATAGAACCACATCTGGTGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000285_pilon:406402..413731- >XLOC_037301 ID=XLOC_037301|Name=XLOC_037301|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3324bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000285_pilon:406402..413731- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAGGCTGGAGCTGATATCCTTGCTACTCTCCAACCTTTTTACACTTTG TAATTCTTACACTTTTATGGACAAAAACAAATCATTTCTTCAATATAAAC AATGGAATATGGATCAAACGGGAACACTGAGTTTCAAGTTCAAAACATTA AACACATATGGACTTATCTTATACAGTGATACAAGTGAGACGTCCGAATA CACGGAAAGTTATATCGCTATGAAATTAATTTACGGACAGCTAGAAGTCA CCATACAAATGGGCGCTGATGATTATCGATCTAATAGAAGAGTTAAACTC GGATCAAATCTAAATGATTTAGAATGGCATACTGTAGAAATACAACGCGA CGCTGACCATCGTCAAGTGACACACGTGCGGCTTGATTCGGAAGCGCAAA GTCTTTTTAACGATGGTGAACATGATCGTATGTTTTTAAATTCTGGTCTC TTTTTTGGTGGATTACCGCAGAAAATTGATAACATTGTGGATGGGAGTTG GGAACTAGAGCCAAGATGAGGCTGGAGCTGATATCCTTGCTACTCTCCAA CCTTTTTACACTTTGTAATTCTTACACTTTTATGGACAAAAACAAATCAT TTCTTCAATATAAACAATGGAATATGGATCAAACGGGAACACTGAGTTTC AAGTTCAAAACATTAAACACATATGGACTTATCTTATACAGTGATACAAG TGAGACGTCCGAATACACGGAAAGTTATATCGCTATGAAATTAATTTACG GACAGCTAGAAGTCACCATACAAATGGGCGCTGATGATTATCGATCTAAT AGAAGAGTTAAACTCGGATCAAATCTAAATGATTTAGAATGGCATACTGT AGAAATACAACGCGACGCTGACCATCGTCAAGTGACACACGTGCGGCTTG ATTCGGAAGCGCAAAGTCTTTTTAACGATGGTGAACATGATCGTATGTTT TTAAATTCTGGTCTCTTTTTTGGTGGATTACCGCAGAAAATTGATAACAT TGTGGATGGGAGTTGGGAACTAGAGCCAAGCAGGCTAGTGGGTTGCATTG AAGAAGTGAAATACAAATCAGGGGCTAATGAGACTTTCACAGAAGGTGAA CTTTTAGCCTCTGATGAAGTGAAACCAGGCTGTATGAATGCTTGTCAGGA AAATGTTTGTCCGAATGGAGGGAAATGTATCAATTATTTCACGGAATACC GATGTGATTGTATTGGAACTGGATTTACAGGACCTTCTTGTCAAAAAGCA GGCTAGTGGGTTGCATTGAAGAAGTGAAATACAAATCAGGGGCTAATGAG ACTTTCACAGAAGGTGAACTTTTAGCCTCTGATGAAGTGAAACCAGGCTG TATGAATGCTTGTCAGGAAAATGTTTGTCCGAATGGAGGGAAATGTATCA ATTATTTCACGGAATACCGATGTGATTGTATTGGAACTGGATTTACAGGA CCTTCTTGTCAAAAAGAGGCTGACATCATCTCATTCGACGGTAACACTAG GCTGGAAATTAATGTTCCACCTAGCCTACGATCGACAACGAACAATCAGA TCGCGTTGCGTTTCAAGACACGAGAATCAAATGGTCTTATCATGGCAGCG TGGTCGAAGAATGATCACCTTATGATTGAATTGAAAAACACCATCATTCA ATTGAGTATTGATCTAGGAGGAGAGGCTGACATCATCTCATTCGACGGTA ACACTAGGCTGGAAATTAATGTTCCACCTAGCCTACGATCGACAACGAAC AATCAGATCGCGTTGCGTTTCAAGACACGAGAATCAAATGGTCTTATCAT GGCAGCGTGGTCGAAGAATGATCACCTTATGATTGAATTGAAAAACACCA TCATTCAATTGAGTATTGATCTAGGAGGAGGTTATCACGTGTTCCGAGTA AACGATCAATCATTCAGCGATGGGTTGTGGCATTTGATTGAGATCACACG AAAAGGACGAGATGTCTATTTAGTCGTTGATAGAAAGTTATCACGTGTTC CGAGTAAACGATCAATCATTCAGCGATGGGTTGTGGCATTTGATTGAGAT CACACGAAAAGGACGAGATGTCTATTTAGTCGTTGATAGAAAATATTTCA TGGACCGTTCGACGAGTGGTCAATTCAGTAAATTCGATCTACGAGAGAAA TTATACATTGGTGGCCACCCAGATGTCAAAGGTTTGGGTGATATCAACAG TAATAGTGGAACTAACTTCAAAGGATGTATACAACAAGTCTATTTCAATG AAATATTTCATGGACCGTTCGACGAGTGGTCAATTCAGTAAATTCGATCT ACGAGAGAAATTATACATTGGTGGCCACCCAGATGTCAAAGGTTTGGGTG ATATCAACAGTAATAGTGGAACTAACTTCAAAGGATGTATACAACAAGTC TATTTCAATGAACTGAACATCATTTACAAAGTATTACACACAACAAATCA AGCTTATTATTTGAACGGTACAAAAATCACTAATTGTAGTGTGACCAAGG CCAAGAAGATTGTGGTGAGAGGAAATAAAGCTGAACATCATTTACAAAGT ATTACACACAACAAATCAAGCTTATTATTTGAACGGTACAAAAATCACTA ATTGTAGTGTGACCAAGGCCAAGAAGATTGTGGTGAGAGGAAATAAAGAC AATAAAATCAGCGAGAGTGCCAAACCAAGTGAAGAAAAATCTCCAACTGC TTCTTCAAATTCCAAGACAATAAAATCAGCGAGAGTGCCAAACCAAGTGA AGAAAAATCTCCAACTGCTTCTTCAAATTCCAAGGTATCTAAAAAGCACG TCGATGACGAAAGCAAAACGTTAAGTAAAAATTCAGTCACGTGGATAGTT GTTGGGTTAGTGTGCGGAACGCTTGTCTTAATCGTAACCGTTATCGTGAT AGTACACAATGTCAAGCACCGATATAGCGGAGTGTTTTTATCCTCCCACG TTAAAGAACAATATCAAAAACAATTGACGCCCGATGGCGCAGGAACTTTA TTGTTTCAACCAAGAAATGGAGGGCGGATTGTTATAGAACCACATCTGGT GTAAGTATCTAAAAAGCACGTCGATGACGAAAGCAAAACGTTAAGTAAAA ATTCAGTCACGTGGATAGTTGTTGGGTTAGTGTGCGGAACGCTTGTCTTA ATCGTAACCGTTATCGTGATAGTACACAATGTCAAGCACCGATATAGCGG AGTGTTTTTATCCTCCCACGTTAAAGAACAATATCAAAAACAATTGACGC CCGATGGCGCAGGAACTTTATTGTTTCAACCAAGAAATGGAGGGCGGATT GTTATAGAACCACATCTGGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000285_pilon | genome | sc0000285_pilon:406402..413731 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1393-1662:271 |
| Aaloc | 1327-1392:934 |
| Aaloc | 1207-1323:2085 |
| Aaloc | 1048-1206:2849 |
| Aaloc | 943-1044:3487 |
| Aaloc | 736-939:4169 |
| Aaloc | 517-732:4993 |
| Aaloc | 1-513:7331 |
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