XLOC_037006 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_037006
Unique NameXLOC_037006
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000077_pilon:1326055..1332349+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_037006 ID=XLOC_037006|Name=XLOC_037006|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6295bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:1326055..1332349+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTATCCACCTGCAGGGGGTTATGGGTACCCTCCACAACCTGCGGG
CTATCCTCAACAACAACCAGCTCCATATGGTCAGTCAGCTCCCTATGGAC
AATCAGCTCCCTATGGACAATCAGCTCCCTATGGACAATCAGCTCCTTAT
GGGCAGTCAGCAGGGTTTCCCCAACAGCCTTCTGCTGTTCCACCACAGCC
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ACCACAGTCAACTGGGGCATATCCTCAATCAAATCCCTACCCACAAGCTC
AACcaccaccacaacaacaacagcctTATGGTCAACAACCTGGGTATTCA
GCTCCCCCAAGTCAACCTCAACCTCAAGCATCTTCTCCTTACCCAACACA
AACACAGGTAGAATCTATATTTATTTTACTTGATTGCAACTacaactact
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aattttgcaaaatcgaGGTAGCAAACAGAACTTCTCTCCAAATTTTGATA
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CAAGATGCTGAAATTCTCAGAAAAGCTATGAAAGGATTTGGTAACAAGTT
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ttttggcacaaaggtgcatgacgataaaccctcgaatgtgacgaagcccg
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gtagagtgcgacggtttgagttttctggaaaccttatttattaagctgtg
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CATGGACTTGTTTTATAGGTACCGATGAAAAGGCTATCGTACATATCATC
AGTTCAAGATCGAACTCCCAGCGTCAAAGAATCAAATTGGAATTCGCAAC
TATGTATGGTAAAGACTTGATAAAGGAGTTAAAGAGTGAATTAAGTGGAA
ACTTTGAAAAAGCAGTTTTATGTTTTCTGATGCCACCTGCTGAACACGAT
GCTTATCAAATGCATATTGCAATGGAGGTTTGTCTATTCGTCTTATTCAA
TAGTATCTTACTTAAGTAAGCTGAAAAGTGTATTGAATTTTGATATAAAT
GACCATTTTTCATCTACATCGGATTATAATGTCACTCACAGCTGTGGAAA
ATTGTGCATTTTATTGTCCCAGGTACATTTATCGAATGCTGCCCTGAAAA
ACTTTGAATGCTGCCATGAAAAACTTTGAATGCTCCCATGAAAAACTTTG
AATGCTGCTCTGAAAAACTTAATGTTTATTCTGAGATCAGCCTTTGGGAA
AGCCTTCGTTCACAGTAGTTTTAtctctttcttttccttttgattttagG
GGCTTGGTACAGATGAAAAAGCATTGATTGAAATTCTTTGTTCGAGGACG
AATTTAGAAATCAAAGCAGCTGCAGATGCATATAAAAAACGTATGTTTAA
TTTCCAACGACCTTGATTAATTTTATTGTGTGTGTATTTATGTACTGTAT
TTATGTCTTGCAGCCactttatttatttagaaatattttgttggCACATC
CTTATAACAGTTTCCTccccccccTCACCAAACAATCTTTGCCCTCACAt
ttttttAATCTATAGTATACAAGAACGATTTGGAGAAAGAACTGAAAAGT
GAAACTTCTGGTCATTTCAAAAGGTTACTTGTCTCTCTGGTTCAGGTGCG
TTTCTTCTTCATTTGAAAGATTCTGAATAAGATTCGTACTACACAGCAAG
TGAAGCCACCAAAGAGGATAGGCCCTTATTTTCCCAATTTGATGGTGGTC
CTTGAAGAAATGTGAATTTTTGGGAAGAAATCCACACTCATCATGAGCCC
CATCCAACTTAATAAAGCTTCTCTTGACTTTACTAGTTTTATTTTTGGAC
CAGAAACCTTTATGGCTTTATAATAATAACTTTTATTCAGGTGCACCTCG
CCTTTCCCATCGACTGTGAACTCCTACAATTAAACCCAAATATTATTGAT
CCActgaaaaatctgcataatAAACTGACCATAAATGTTTTCTCTATGTA
GGGATCACGGCTTGAGAACGAACCAATAAATCAACAAAAAGCTAAAGAAG
ACGCAAATGTAAGCATACAACACTCGATCTCCACCATGTGAGGATCTGAA
AATAGTTTATTTCGAAACTTCGGCAACCACTGTAATTTTCTCATTAATTT
GTCAAGCGGCTTTGACTCATTGTGCCATTAGAAAACGATAGTTTTACTAA
GCTCTCCACCTAGACTAGTCTCCTAAGATATCATGGCATATCTACTGCAT
ATATTAGTTAGgtatttttccttttgtttCCAGGCTCTTTATATGGCAGG
TGAAGCACGATGGGGTACAGATGAATCAAGGTATTATTATTTTGAACGGC
TTCAAACGgcttgcctaaataacttcttgagttcacaaaaaaaagcttca
aataaggAAaaatagaacagatttacgctgccattcgccaaaattagttc
ccgccaaaattaaaaaaattcgtcaaatttttttgccgctcgtcaaaatt
agttcccgccaaaataagttcccttaaggtagtaaaGGGGTGTTCAAATG
ACCAACTTAAGGTTGTAATCTTAAGGTTTCCGTCCATATTCACAAAACGT
AGTCACAAGACTGGTTTATGGTATATGTTGATGTTGTCAATGAGGAGAGT
TCTTCtgtgtgaaaatttaaaaaatattaaatatttcttcttaAGGTTTA
ATGCAATTATGGCTCTGCGAAGTAATGCTCAATTGAGATTGACCTTCGAG
CAGTATACACACGTAAGCAAATCTAGTATTACAGCTTTACATATTGACCC
TGGATTACTTTTGTGTACAGAAGTTACTAAGAAATTAAGAGTTAAAAATg
aactaaaattttcattaaattttgtgCCCGAGCCTGTtatcttttcttca
ttttctagttttcaaagaGGACAATCGAAAAAGCTATTAAAAGTGAAATG
TCGGGTGATCTAAAAGATGGAATGATGGCAATAGGTAGAACGTTTGagta
tttaaagttttttcaattcaaaacaatttaaaagcatTTAATTCTCTCTT
AATCACTTGTATCGATCTTTTACACTGCTATGTTGCTTATAAATTTACTT
AAACCACACTCATAAAGTGCTGATATTTTGAGCTTCAACTTTCACTCTTC
TTTATTTCAGTGAAAATGTGCAAAAGATAAATCTGCATTCTTTGCCGAAA
AGTTGTATTATTCTATGAAGGTATGAAGATTGCTATCCTTACTTGATACT
GTTTTATTTAAGAAATCGAGTGAATAATTCAGGCTGACTTATCGTTGATT
ACAACCTGACCTGGATATCAAATTCAGGTGTTTTACTTTGTAAACctatt
ttttttgttgacagGGCTTGGGTACAGACGACACAACTTTAATTAGAATT
ATGGTTTCAAGATCAGAAGTTGATAtggttcaaataaaaaacgctTTCAA
AAACATGTACGGAAAAACGCTAGCAAGTTTTATCAACGTAAGTGCGATAg
taatttgtttttcaattaaTATGAATGCTCGTCAAAAGTTACTTGCCAAA
AGGTATTGATTGGATTCTTATATTATTTTAGTTTGTTTGTCTTATTCGAT
CAGAATTTGTTTACTCGAAAACTCGCAAATGTCAATCACATCTTGATTGA
AATTTCTGGATTTTAAAACTCTTTCTTTATTCATTCAGGATGATTGTTCT
GGTGATTATAAACGTTTATTGGTTGGAATCTGTGGTGGACATTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000077_pilon:1326055..1332349+

>XLOC_037006 ID=XLOC_037006|Name=XLOC_037006|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3182bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000077_pilon:1326055..1332349+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTATCCACCTGCAGGGGGTTATGGGTACCCTCCACAACCTGCGGG
CTATCCTCAACAACAACCAGCTCCATATGGTCAGTCAGCTCCCTATGGAC
AATCAGCTCCCTATGGACAATCAGCTCCCTATGGACAATCAGCTCCTTAT
GGGCAGTCAGCAGGGTTTCCCCAACAGCCTTCTGCTGTTCCACCACAGCC
ACTTGGTTTTGATGGTCTTGGCAACAGCAATCCACCAATGAGTTATCCAC
CTGCAGGGGGTTATGGGTACCCTCCACAACCTGCGGGCTATCCTCAACAA
CAACCAGCTCCATATGGTCAGTCAGCTCCCTATGGACAATCAGCTCCCTA
TGGACAATCAGCTCCCTATGGACAATCAGCTCCTTATGGGCAGTCAGCAG
GGTTTCCCCAACAGCCTTCTGCTGTTCCACCACAGCCACTTGGTTTTGAT
GGTCTTGGCAACAGCAATCCACCACCTGGTGGGAATGCCAATGCCTGGCG
GAGGACCATCTTATCCACAAGCACAACCTCAAATGGGTGGATATCCCTCT
CAAGGGCCACCGTCTGCAACCCCTGGATATCCCCAACCTGCCTGGTGGGA
ATGCCAATGCCTGGCGGAGGACCATCTTATCCACAAGCACAACCTCAAAT
GGGTGGATATCCCTCTCAAGGGCCACCGTCTGCAACCCCTGGATATCCCC
AACCTGgGCAACAATACGGTGGAGCAAACTCATCCTTTGGGgGCAACAAT
ACGGTGGAGCAAACTCATCCTTTGGGGGAATGGCATATGCCGCCTCTGCT
GCCATGAATTTCCGTCCACCACAGTCAACTGGGGCATATCCTCAATCAAA
TCCCTACCCACAAGCTCAACcaccaccacaacaacaacagcctTATGGTC
AACAACCTGGGTATTCAGCTCCCCCAAGTCAACCTCAACCTCAAGCATCT
TCTCCTTACCCAACACAAACACAGGGAATGGCATATGCCGCCTCTGCTGC
CATGAATTTCCGTCCACCACAGTCAACTGGGGCATATCCTCAATCAAATC
CCTACCCACAAGCTCAACcaccaccacaacaacaacagcctTATGGTCAA
CAACCTGGGTATTCAGCTCCCCCAAGTCAACCTCAACCTCAAGCATCTTC
TCCTTACCCAACACAAACACAGAATAAACCACAACGTCCAGCTCCACCAG
CTCAGCAAGTTGCACCAAAGGAACCATCAACGCAAGGAACTGTCAAAGAT
CATTCTCCTTTCAATGCTCAACAAGATGCTGAAATTCTCAGAAAAGCTAT
GAAAGGATTTGAATAAACCACAACGTCCAGCTCCACCAGCTCAGCAAGTT
GCACCAAAGGAACCATCAACGCAAGGAACTGTCAAAGATCATTCTCCTTT
CAATGCTCAACAAGATGCTGAAATTCTCAGAAAAGCTATGAAAGGATTTG
GTACCGATGAAAAGGCTATCGTACATATCATCAGTTCAAGATCGAACTCC
CAGCGTCAAAGAATCAAATTGGAATTCGCAACTATGTATGGTAAAGACTT
GATAAAGGAGTTAAAGAGTGAATTAAGTGGAAACTTTGAAAAAGCAGTTT
TATGTTTTCTGATGCCACCTGCTGAACACGATGCTTATCAAATGCATATT
GCAATGGAGGTACCGATGAAAAGGCTATCGTACATATCATCAGTTCAAGA
TCGAACTCCCAGCGTCAAAGAATCAAATTGGAATTCGCAACTATGTATGG
TAAAGACTTGATAAAGGAGTTAAAGAGTGAATTAAGTGGAAACTTTGAAA
AAGCAGTTTTATGTTTTCTGATGCCACCTGCTGAACACGATGCTTATCAA
ATGCATATTGCAATGGAGGGGCTTGGTACAGATGAAAAAGCATTGATTGA
AATTCTTTGTTCGAGGACGAATTTAGAAATCAAAGCAGCTGCAGATGCAT
ATAAAAAACGGGCTTGGTACAGATGAAAAAGCATTGATTGAAATTCTTTG
TTCGAGGACGAATTTAGAAATCAAAGCAGCTGCAGATGCATATAAAAAAC
TATACAAGAACGATTTGGAGAAAGAACTGAAAAGTGAAACTTCTGGTCAT
TTCAAAAGGTTACTTGTCTCTCTGGTTCAGTATACAAGAACGATTTGGAG
AAAGAACTGAAAAGTGAAACTTCTGGTCATTTCAAAAGGTTACTTGTCTC
TCTGGTTCAGGGATCACGGCTTGAGAACGAACCAATAAATCAACAAAAAG
CTAAAGAAGACGCAAATGGATCACGGCTTGAGAACGAACCAATAAATCAA
CAAAAAGCTAAAGAAGACGCAAATGCTCTTTATATGGCAGGTGAAGCACG
ATGGGGTACAGATGAATCAAGGCTCTTTATATGGCAGGTGAAGCACGATG
GGGTACAGATGAATCAAGGTTTAATGCAATTATGGCTCTGCGAAGTAATG
CTCAATTGAGATTGACCTTCGAGCAGTATACACACGTTTAATGCAATTAT
GGCTCTGCGAAGTAATGCTCAATTGAGATTGACCTTCGAGCAGTATACAC
ACttttcaaagaGGACAATCGAAAAAGCTATTAAAAGTGAAATGTCGGGT
GATCTAAAAGATGGAATGATGGCAATAttttcaaagaGGACAATCGAAAA
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TATGAAAATGTGCAAAAGATAAATCTGCATTCTTTGCCGAAAAGTTGTAT
TATTCTATGAAGTGAAAATGTGCAAAAGATAAATCTGCATTCTTTGCCGA
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TTAGAATTATGGTTTCAAGATCAGAAGTTGATAtggttcaaataaaaaac
gctTTCAAAAACATGTACGGAAAAACGCTAGCAAGTTTTATCAACGGCTT
GGGTACAGACGACACAACTTTAATTAGAATTATGGTTTCAAGATCAGAAG
TTGATAtggttcaaataaaaaacgctTTCAAAAACATGTACGGAAAAACG
CTAGCAAGTTTTATCAACGATGATTGTTCTGGTGATTATAAACGTTTATT
GGTTGGAATCTGTGGTGGACATTGAGATGATTGTTCTGGTGATTATAAAC
GTTTATTGGTTGGAATCTGTGGTGGACATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_037006XLOC_037006-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000077_pilongenomesc0000077_pilon:1326055..1332349 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1534-1590:6239
Aaloc1411-1533:5915
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Aaloc1-237:1