XLOC_036880 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036880
Unique NameXLOC_036880
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000007_pilon:2250711..2261222-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036880 ID=XLOC_036880|Name=XLOC_036880|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10512bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:2250711..2261222- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTCGGGGTATCAACATTGAAGAAAGTTGCAATTTATGGTGGTGTATT TACTGTTGCTTCCTGTTCATTCTTCTACTACAAAATACAAAGTAAGTTTA TTTCAATACATTTTGCTTGATGATGCTTGGTTTCGTACTTAGTCTCCTTT ATATCCTGCATTAGTAAGATTCTAGCAATTTCATTGGTCAAAAGACATCA CGTGGAGGTGGGTTATATACTGTGTCTATCTTCCTCGCATTCGATTGAAA AAAAGAAGACATTGCATATTGACGAATGCTCTTTCGAATGTTTTGTTTTG AAAAGACAGAAAACTCGGCAAGCCTCACCAATACGGTTTTCGATGACCCT GTATATCCCGTATCCCATCTCGAGAAGACTGTGTAACTAATATTATTCTC AACTTCAGGGGCAGGCTGGAGACTTCAAAAATGATCGGGTTTGGCTGAAA TTTGGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGGGTGTTTTTTTTCATT TTTTGAAAATTTTCATTTTTAAGGGCGTGGTCACAAGTTTTCGCCAAAAC GAGGCTAAAACTTTGGGCCCGGGGGGGGCACTGGGTTTGCGGACTGACGG TATGTGCGGGCCAAAAATTGGCTTTTAAAATTGCACCCTTACAGTGCAGC AAAAATCAGTGAAAATCATACCCTTAGAGTGCATTTTCCCCCAAATTTTC GATCCCTTTCGTGCAAAAAATGGTCAAAATTCTAGCATTTTTGGTCAAAA TATCTAGATTTTTCAAGAATTTTCTGAAATTTCTACCCTTACAGTGCATC TCTAGTTTTTCCGACCCTTACAGTGCATTTGAGGTGCCTTGAAAAAGACA CCCTTAGTGCCCGCACATACCCGTCAGTCATTTTGCTTGGCTGCCCCCCC CCCGGGACTTTGGGGCATGATGAAGACTTCAAAAATAGTCGGATTTGGTT 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GGGTGAACTCACATATAATTCACTTTAAAAAGTTGCAATTGTGAAAATGA AATCTGGTAAATTCACCCAAAATATCATGGTGATTCAAAAAAAATTTGCT ATGTGTGACTAGTAGTATAGTGACTAGTAGACTACAGCTTTATTCAAAAT TTTAAAAGCTTTCTCAAGTTTTTCAATAAAACTGCAATTCACCAATAATC TTTAATTTCACAAGTTTGGTATAATTACTGATTTTTGCTGTGTATAGACT GCAGATGTTTTCACGGGTATAATCATTTACAATATCATTTTTTATATATG AGTATGATTCATTCTTTTTTTTGCAAACCACACTGATCCTCTTTTTTCGT TAGCTCGCGGCCTGTAAGAAAATGACAAATTAAAAAAATTTTGATAAAGA AAAATAATGCATCACACGTACACTTGTAAAACTTGTAAAAAAGCTGTGAT TGAAAAATGCGGCTCTAATAAAATTTTCCAATGAGCAATCAGACAAAATA ATCTGCATACACTGGAGAGTGTTACAAAAAGATTAGTCTTTCAAAATAAA AGAGCCGTACTGCTTACCTCTTCTCTCTTTTATTCTTGAAAAAATATATA TGATACTTGCTTGAATCTGAGTTCTGCTTGTTAAAAATAAATTCAAAACA AACCATTTACATAAAACACCTTGTTGCAAAGAAGTTACAAACTAAAGTAC TAACTAATAGGAGGCTAAGAGACTAAAATGCCAACGAATTGCATAAAACA TTTCCACACATTTAGATCAACTTTCTGTCGCCCTGTTTTGGTATCAAATT CCAGTCGGGTCAATTTGTATTCACAGCAAGAACTGCCCCGGGATTTACCA GTCAGACCCGACTGTTTGTTTACATTTGTTCGAACCGGGCCGGCCGATCA CACCCCTAACCAAAATCCAAAATTTCCGCTTTTCGACCAAATTGATATAG 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GGTGAAAACTTCCGAAGTATTGATCCTTGCTTCAATCAAACCTTCAAATT GTTGGAATACTGAAATAAAACTTCTAAAAACTCCGATCAGAGTATATCAT GGTTTAAAGGGGATGGAAGGTTTTCACATAATCCTTAAAGTTATTCTTCT GCTCTCTTTTTTAGGTCGTTTTGCATCTGGTGACTATTATCGTTTGTCCA TTGAAGCATTACGTAACGATTCTCGATTAGCCAATGGGCTTGGACCACCT GTTCGCTCTTTGTTCTTGAACCTTGGGGATAGTAATAATCGATTATCGCC CACAGAAGCACATGTAAGAAAATAGGGGTATTATTGTTATTAAAGGGGTC GCCAATTTTCTTACAAGTTTATCTGGTTAGGTAGTTTTTAGAGTAGTTTA AGTAAGTTACATGTTAGTTTAGGTATTTTACACAGGAAAAAATATTCGAA TTCCATGCCTGGAAAAATACTATTTTCAGGTGGAATTTATTTTCACCCTG GAATTTTTTTGCTTCATTTTCTAAGAAGGCTGGAATTTTATAAAAACCGG TGTGAAAATTGTTCCTTTCCAGCCTTTCAACACAAAAACTCTTGTCTGGA ATTTCATAATTTTCCAGGTGGAAATTTTCCAGGCTGGAAAATATTAAAAT TCAGGTATTTTGCCATTATTTTCAAAAAAAATAGTGACTTGGAAAATCCA CCCCTAATTTGATTACTTTCCAGGGTGGTAAATTTCCGGGTTGGTAAACA GCCATATTCAGGTCTGATTTTTCTTGCCATTATTTCCCAGGCCTGGGATT TCTTGCCATTATTTCCCAGGCCTGGGATTTCTCGGGTTGTAAAATGATCA TTTTCGGGGTGGGATTTATTTTCCAAAATCAGAGATTTGAAAACCCACCC CAAAAATGGGCAATTCCCTGGGATTTCTCGGGATGTAAAATGTACGCATG TGCAAAGTTAAAACCACAAGTGATTTTTCAGTCAAAAGTGTTCGAGTCGT ATGTAAACCAAACCATTTTTAGGGTGTTTTCGATCAGTGTGTAACACAAC GCTAAAGGTGAGGCGTCCCGCAAGCCAAGGGCGGCCTCATTCGTTCGCAA TGGACTTGCGTCGCAAGGGCTCAGTGGATCGGTGAGACGGGTTTGAGGTC ATTAAGTTGGCTCTCTAGTGCAGCTCCACTGTTGTAATAAAAGTGCCGGG ATTCTCAAAGTAGATGTCAGAACGGATGAGAGCTATCGAACCAATGCTCA CAGAAAGATCGAATACATTTAAACACCCCTGTCTCTGTGACCCAGTGGGA TCCACCCCACTGCCCACCAAAAATGGCTCATTTTTCAGCCCCACTGGACA AATCACTCACCCCACTGGAATGTTGTAGTAAAAAAACACCCCATTGAAAA TGATAAAAAGTTTACACATACCCCACTCGAAATGCCCTCATTTTAACGTA CCCCAGTAGAACTTTTCTTTCAAAAAATCACCCCACTAGAATTTTCTCCT TCCCCTTCTTTAAAGTTGAAATATCCAAAAGAGCCAAAATAATCTGCTCG CTTCGCTCCCTCGCCGTCAAATGTTCCACTTCAATATATTAACTGTATTT AACCCGATTTCTAATGTCATTGTCATGGTCATTTTAAAACGTAGAAAATG CCTAACGAGAGGGGTTGAAAATCAAAAATTTCTGTCAGCGCAAACCACAG TTGTACTTGTACCTTTCTTTCTTTAAAGCTAGGTTATAGCCTGAAAGATT TTCGATAGAGGCTTTCTCACTTGCGTAGATACTGAAAGAAAGACCTCTAC TTAAATCATGTTGACTAAACATTACTAGGTTCCAGATTTCATAAAATTTG ATGTAACGTACTGCTCCCAGACCTCATTACATTTCCTGTTACAGTGTAAG AGTAAATCTACCTGATCAAGATGATATTTCTAGTGATATTTAGTAGCATG TAAGAAGCAGATTTTTACTAGCACTAAACCAAAAGTTAGCCAACACCTTC TATCTTTAAAACGCGACAAAATTAAGCGGTCTACCCAGTCTAACTCACAG GCTAACTAAAATTTAGCCCTTGCAAAAAATTCTTTCTCACCCCAGTGAAT ATCAAGGGAAATTTTCGCCACCCCACTCAATATTTGAAAGAATATTTTTC ACCCCAGTGAATTTCAGGTCTTTTGATTCTCACCCACTGGGTAATCAACA CCCACTGGGGCACAGAGACAGGGGTGTATTTAACAATTTATTAAACGTAA TTCATTTTCGGCATTTTCGCCCCCGAATATGTAAATATCCAAATTTCCAA CCTGGAAATAAGCTCTTTTCAAACCTGAAAATACTGTTTTATGAATTATA TCGAGGCTGGAAAGTTATTTTCTCTGGAGTGAATAAAGCACTTTTCCTAC CCTGGAAAAAGTCACTTTTCCAAGGCTGGAAAAAGTCACTTTTCCAAGGC TGGAAGAGGCATCAACATTCCAGGGCTGGACCAGCCCAGGAATTTAGCAA TTTTCCAGGTGGGAAAGAGGTCAATTTCCAACCCTGGAATTCGATAGTTT TTTCATGTCTTAGGGGGTCGTAAAGCCTGCTTCCCAAAAATGCATTCAGA ACCCGGATGTTGAGCAAAAAGCTGGTCTTTAAATCCTACTCCTGCTCTTT TAAAGCGATTCTAAATCCAGATTGACACTAAATACTGAATAGCTAGGGGG GGAACTAAGCTCTCGAAAACATTGCAGTTGATTGTTCTTTTTATTTTTGA CAATAGAATCTCTACTTCTATACAGACCATCAATTTTCAGTTCGAAGTTA AATAAGTTGAATAAGTATTGAAACGAATGGTTTAAATTTTTATTGGATCA ACTGAATATTTAGCATTGATGATTTAGCAAAAATAACATCTTCATTCAAT CATGGAGGTAGAAATTCTACCTCCATGATTCAATGTAGAAGATCGGCTTT AAGCTGTAAATTTTTCACTTTTTTTTTACAGTTGTCAATTCCAGTTAAAG GAACAAAGCACAAAGGATTTCTGCACACCAAATGTTCCACAGACGTCCAA GGGGAATGGAAGATCAATTCCCTTGAATTAGAAGTCAATTCAAAAAGGTT TGAAGTGAATTATTCCAAGAGTATAATTGCAAAGGACGAAATTGACAACG AAATTCTAAGAGATTGATGAAATTGGCCAAGTTCAATCTTGTAAAATGAC TATATAATGGAATAGCTTGTCGCGGCTTTTGCAAGTTGTTTTGGAAACAG GACTTAGAGGAATGAACTCAAGGCAATCTTCTCACCAAATTACCAATTTT TATGAACTTCCTAAGAAGGAATTCTGTCTCCTTGAATAGGTAAATAGGAA ATCGGTGCTAGAACGATCCACATAAAATTATTTTTTTGAATGGTGTGACA CAGAGAACCAACAATAATATTGATTTTACTCTAACTTTGGACGAGGTATA TCATTCGATTTACATTAGTTTCAGGAATCAGAGCTTATGGAACAAATAAA AAGACGTACAAATTATCTGGAAATTCCCTTGCATAATCTTCTTTTAAGCT ATACAAAACTATTTGGAGTCTTGCTTTAGGTGAAATGCCTTTTATTTCTC CGCTCGAAAAGCTTTTATGAATTTTCTATTAAGGCGTCCAGCTATTAGAA CATAGGGTTTCAGAATATTAAGAATAAGTTAAGAACTTCTTAAGGCTTCA CAGACTCAAAAACGTCAAATTTCTTAGGAAATCGCTCAAAACACTAATTT TAGAATATTTAAAGAACGTCCGAAGTGTTAATTTTATTTTGGATGCTCTT ATCGCAAAAATGTGTAAGTGCGTCTAAGTGTATAAGTAAGGACATTTTTG AAAAATGTTCCATTAAATTGAACCTGAGATTGTTCTTACATTTCTTTTAT TAGGGTCTGAATTTGAGGCTGGTGTTCTTATAAAATTGTCCTTATAAATA AAAAAGGTGCATGACATAAGTTTAGACTTCCTTAAACTTTACGAAACTAA AACCCCTGAAAATAAGTTTCTCCTCTTTGCACTACCATTATGCTTTTGCT TGAGTCGGCCTCGTATATTATCTATAGATCTCATTAAATTTCTTACGTCG TTCGCCGAAATAGATTTTATTATGTCCATTGTTTTAAACTAAAAGCTAGA CTATGCTACTTACATGGTGACATTTCAAAGTAATGCTAATTAAACTGGCT TTTATTTTAATTGATGGAGTACAGGTTTATGTTTTAAAAGTTGAGAAAAC TAAAACTTGAAGTTATAGGTTTATGGTCATATTATTGTATGCTGTCGATG CCGTTTATTTTCAAATCATGAATCAACAAATATACGTCCGCACTCTGTAT CAGTACGAGGCTAAAAATGAGAACGAGATATCGTTTGAAAAAGGAGTTTT TCTCAAAATTCTTAGTAGACCTGAAGGTGACTGGTGGTGGCTTGCTTTAA ACGAAGCAAACTCTCAAAAAGGCTGGGTACCACGAAACTACGTGCAAGAA ATTGTCGACTTGCCTGAACACAACAATAATGGTCAGATAGGAAGAAAGCA AGCTGAAACAAAATCGAATCGAAAACCAAACAAGTCAGACACACTTAGAT ACAACCAGAAAAATAAGAAAGAAAATGATGGCTATGAGACAATGGGTTCC CTACAAAGAGGATCAGGAGCTCAAGACGAGAGTGATTATGTTCTGATGAA TACAGCAAATGAATTCCCACCAGATGACGGATACGATCGTGTGAAAAGTC AATCTGATGGATATTCGCTGGTCAGAAGCATCTCTTACGGAGGCTACAAA CATGTAGGAACG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000007_pilon:2250711..2261222-

>XLOC_036880 ID=XLOC_036880|Name=XLOC_036880|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1800bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000007_pilon:2250711..2261222- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTCGGGGTATCAACATTGAAGAAAGTTGCAATTTATGGTGGTGTATT
TACTGTTGCTTCCTGTTCATTCTTCTACTACAAAATACAAAATGGTCGGG
GTATCAACATTGAAGAAAGTTGCAATTTATGGTGGTGTATTTACTGTTGC
TTCCTGTTCATTCTTCTACTACAAAATACAAAGTCGTTTTGCATCTGGTG
ACTATTATCGTTTGTCCATTGAAGCATTACGTAACGATTCTCGATTAGCC
AATGGGCTTGGACCACCTGTTCGCTCTTTGTTCTTGAACCTTGGGGATAG
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CTATTATCGTTTGTCCATTGAAGCATTACGTAACGATTCTCGATTAGCCA
ATGGGCTTGGACCACCTGTTCGCTCTTTGTTCTTGAACCTTGGGGATAGT
AATAATCGATTATCGCCCACAGAAGCACATTTGTCAATTCCAGTTAAAGG
AACAAAGCACAAAGGATTTCTGCACACCAAATGTTCCACAGACGTCCAAG
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CAATTCCAGTTAAAGGAACAAAGCACAAAGGATTTCTGCACACCAAATGT
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CAATTCAAAAAGGTTTATGGTCATATTATTGTATGCTGTCGATGCCGTTT
ATTTTCAAATCATGAATCAACAAATATACGTCCGCACTCTGTATCAGTAC
GAGGCTAAAAATGAGAACGAGATATCGTTTGAAAAAGGAGTTTTTCTCAA
AATTCTTAGTAGACCTGAAGGTGACTGGTGGTGGCTTGCTTTAAACGAAG
CAAACTCTCAAAAAGGCTGGGTACCACGAAACTACGTGCAAGAAATTGTC
GACTTGCCTGAACACAACAATAATGGTCAGATAGGAAGAAAGCAAGCTGA
AACAAAATCGAATCGAAAACCAAACAAGTCAGACACACTTAGATACAACC
AGAAAAATAAGAAAGAAAATGATGGCTATGAGACAATGGGTTCCCTACAA
AGAGGATCAGGAGCTCAAGACGAGAGTGATTATGTTCTGATGAATACAGC
AAATGAATTCCCACCAGATGACGGATACGATCGTGTGAAAAGTCAATCTG
ATGGATATTCGCTGGTCAGAAGCATCTCTTACGGAGGCTACAAACATGTA
GGAACGGTTTATGGTCATATTATTGTATGCTGTCGATGCCGTTTATTTTC
AAATCATGAATCAACAAATATACGTCCGCACTCTGTATCAGTACGAGGCT
AAAAATGAGAACGAGATATCGTTTGAAAAAGGAGTTTTTCTCAAAATTCT
TAGTAGACCTGAAGGTGACTGGTGGTGGCTTGCTTTAAACGAAGCAAACT
CTCAAAAAGGCTGGGTACCACGAAACTACGTGCAAGAAATTGTCGACTTG
CCTGAACACAACAATAATGGTCAGATAGGAAGAAAGCAAGCTGAAACAAA
ATCGAATCGAAAACCAAACAAGTCAGACACACTTAGATACAACCAGAAAA
ATAAGAAAGAAAATGATGGCTATGAGACAATGGGTTCCCTACAAAGAGGA
TCAGGAGCTCAAGACGAGAGTGATTATGTTCTGATGAATACAGCAAATGA
ATTCCCACCAGATGACGGATACGATCGTGTGAAAAGTCAATCTGATGGAT
ATTCGCTGGTCAGAAGCATCTCTTACGGAGGCTACAAACATGTAGGAACG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036880XLOC_036880-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000007_pilongenomesc0000007_pilon:2250711..2261222 -
Properties
Property NameValue
Aaloc358-900:544
Aaloc241-354:1832
Aaloc94-240:4647
Aaloc1-90:10513