XLOC_036725 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036725
Unique NameXLOC_036725
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000126_pilon:414390..425931-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036725 ID=XLOC_036725|Name=XLOC_036725|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11542bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:414390..425931- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TACCAGGATGGTAATTCATTGTTCGTCATGACAAATATGGTGATAACACC AAAACAATACCAAGGAAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCATATCAAGCAC TTTGTAAAACAGACAAAGATTGTCAACAAGAAACTTCCAATAAATATGGG CACGGTAAGATAACAGAATACGACTATCTCGAGCATCCCATTAAAGGTCC CTTAAAAGAGTTCATTTTTCTCTGCTCTAATATGGATTTCTTTATAAAAT TAGGATTCCACAAATTTCCGTACAGATGGGGGGGGGGGTGGATGAACCTT TTCAAGTCAAAAAGAGATTCTTAGGAGTCTGTGAAGACCCCCTGGAATAC GGAAAAATTTCCAAGAGAACCCTTGGAAAAATTATTTTAATACCTTAGAG TTACTTTGAACGAGCTAAAGTCAGTGTTTTACACCCCTGGAAATTTTAGA ATAACTTTTTACCCTGTGGAGAAATAAAAAAAAATACTCCTTTAGACCGC CTTGAAATTCTACTCGGATTACTCCCTGGAAATGTTCGTCTACCCCCTGT ATGGATATAAAATGGAATGGCCCAATGAACATCTGTAATTCCTACAGCAA GAAACACAGTTTAACAGTGATCTTTTATCTCCAGGAGAACGTACAGGACG TTGTGTACCATCATATCGTAATTCAACATTGACCGTATGTGAAATTCATG GCTGGTGTCCGACTGAAGATGATAGACTTCCCATGATTAAAAGCAATGTC AGGTAAGTATTTGATGTCGATGATTCTAACGTAGGCTACTATTGGTAAAA GCATTGATTTCAAAGTCCCGAAGTGGTTGGATCCGAAACTCCTGAATTGG AAATGAAGCCACTTATTTCCCATTCAGAACACGTGACCCGTGTGTTTTTC AAACAAAATTTCTAAATATTGGGCAAACTTAAGGCTTCACTTTCTTTTGC TTGAGAAAGGTTGAAGATTCGTCTCTAGACCATTCGGGGCTTCAAACTCA ATGGGTAAAAACACTTAATTAATTTTGACTTTTCAAAATGTTCTTAGCAC GAATATTCCATTGTTGGAGGGAACCAAGCATGCTACCGTGTTGATCAAAA ATCAAATTGATTTCATGAAGTTCGACGTTGCAACGTAAGAGTCATTTTTT CATTTATTTTTCTTTAAATAGGGGGCCAACCCTTGGATCCGTACCATCGT GGGACGCAACCGTGATTGGTCCGAAAGTTGATAGGATTTTGTGACATTTT TGAGAGGGGGACTCACGAATTAGGGGAATCCTATCTACTTTGAACCAATC ACGCGCGGTTGAGCCCCTAGAAAGATGCCACGAATCGTAAGGGTTGGTCG CTACTTTATGCTTTGTGTCGCTTTTAGACAACGTGGCTTCTTATCGTCCG ATATCTACCCTCTATTTTCCAACTCCCCCAGCCCCCAGGACCCCCGTTAA TTAATTTTTAAGACTATTTTCAGCTGTCAAAGAGAAGGCCCCTTATTTTT CTCTAAATAGGCTGATTTTAGTCTATATTTACCTTAATTTTTGGGTGTTC AGAAGTACAATTTTCAACCCCCCCGGCAGTTAGGTCCTCCCCCCGGTTTA TTGGAATCTCGAAAATTCTACCCCCCCCCCCCGTTTATTCGAACCCCTCG TTTACTGTTGGTACTACAGTTTTACACTATCATAATTATTTAATTTTTTA GTTACAATATTCCGAATACTAACAACAGAACATATATGAAAAAATGTCGT TATAATGCAAAAACGGATCCCTTGTGTCCAATCTTTCGTTTGCAAGACAT CGTTTCAAGTTGTGGCGACAATTATACTCAAGTCGCATTCAAGGTATCTC CTACTCTGTCATAGTTTCCTGTTTGGTTTAAACCCCCTGTTTAATCAAAC CCCCTTAACGGCCAATCCCCAAGGCCAAAACTTCGTCGGGGAAAATTTTT GTCGGGAAAAATTTTCGTCGGGGAAAAATTCGTCACTTGCCGGTAGTTGG TAAACGCATTAAGGCCGGGGGAAATTTTCGTCGGGAAAAATATTCGTCAC TTGTCCAAAATTTCGTCACTTTTCCCCGACGAAGTTTTCCCCGATAAGGT ATATATAAATTTCTCAGACCCATCTCAATAACCGAGGTCCTGAGCCCTGA GATAAATTTTTGACGGGAATGGTATCAAAATATAGCATGCTATATAAACT GAAAACTATTTTTCTTTTTAAAGAAGAAATCGCTGGAAACGAAAGAAGGA AACAAAAAATACATAAAAATGATGAATTTCATTGGTAAAAAAGTTCGAAA CCCTCTGTATAACCACCCTTCCCCCTAAATGCCGAACTCCCCCTAATACT TGAGACCTTTTCGAACCCCTTTACAGGGTAGTCTGGGGGATTTGAAGATC CCCCTAAACATAGGGGGATACAAGTATGTTACAAGTTTTCGGGCAGTACA CATACTGAATAAGTTTTAGTGGACGTCAAACTAAAAACCTACATTTTGGG GTTCACCTACATTTTGGGGGTGCAGACAGTGTAGTAAGGTTTTTGTTACA CAGGACAACTTCGTCAATACATTTTGTACAGAAAATATCCTTAACCAATT ATGTGTTTTTTCAGGGTGCAATTTATGGCATCATCATCGAATGGAAATGC AATTTAGATTACTCCATTGAAGAATGTCTTCCAAAGTATCGATTTAAAAG GTTTATTCTTTACATTTTATGATTTGGTCTTTTTTGTCATTGAAAAATTC TTCTCGCTTAATACATTCCGATCGGATGTAGCCAGGACAACACCCCTGTC CGCTTGACGGATATGTTTTCCCGACTTAGTTACCGTATTACTTCGAATAA 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TTTGCCGGGAGATTTTTATAATTTCATTATTTTTCAGGCGGGGAAGTTCA ACATCATCCCGTTACTAACAAACTTGGGTGCTGGTATTGGATTACTTGGT CTGGTAAAACACTTTCTCACTTAAGAGAAGTAAAGTCTGTCTCAACATAA TTTGCAGCGGAGGTTTGATAATAATCCACTTCTGTTTATCTTTTCAACAA GCACAAAACCGCTATCTAATTCAAATTCGTTCAAAAGTTATAGCCTTTTT TGTCTCCGCTGCAAATTATATTGAGACAAACTTTAATCCAAAAATCACAA AAATTGATGAATTTTTTATTTCAATCTTTTCCGATGGAACAGAAAAAAAA ACGGTTGTGTCAGAAAGATTTACACGTTTTTTATAAGAACAAACTATATA AAAACATAGGCTTCGATGGCTAAAATCTTAAGAAGAAGTTAAGAACATTC TAAAGGCCTTGCAGACTTTAAAATGGGTAATTTCTTAAGAAAATGAGCAA AAATGCTTACAAAATGGTGAAATTAAGAACATGATATAAACATTTTTAGG CTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAACACCCTAAGGCTTCAAAAATTTTAAAA TTTTGGATGTTCTTATAAAAAAACGTGTACACTACCGAGGTTGTAAGAAC TTAAAATTATTTTCATGCTTTCTGTCGGCAGGCGACGCTTTGTTGTGATT TCATCGTGTTGAACTTGGTGCCGAAAAGAAACGTATACCGCGACTACATC TGTGCAGACGTCACGCAGGAATATGAAGAACACGTAAGTTACTTTTTGTG TTTTCTTGGTTCCTTTGAACGAAAAGGGTTGCGAATGTCTTTGCTATTTG TTAATTTCAAAGGGATAATCAGATGGTTTGAGATATTTGGCAGGTGGGTT ACTTCTATTTCCAAGAACAAAACCTCAAAATATTTTTGCCTAACTATTTT CCAGATTCGAGTAATTTCACAATTTGAAATGACTGAAAATGGGTTCTTAC ATGGTTCTTTCGTTGTAATTCTTACTAAAAGTTAACAAACTTGTAACTAA TTTATCTCGACTTATGAAGATAGTTAGGCAAAAATATTTTGAGGTTTTGT TCTTGAAAATAGAAGGAGCCCACATATCAAATATCTCAAACCATCTGATT ATCCCTTTAAACATTTAAATTACAAAATTACAGTAGTCTTTGTAACTCGA ACCTCTATAACTCGAATGTCTCTTTAACTCGAACAAACAAGTTTTCTCGT TCCTTCACTTATTAATGCCTTATAAATCAATCTTTATAAGTCGAAGGCGT ACTGGTATAGTGGTTATCGTGCTTGACTTCTGTTCAGGAGGCCCGAGTTC GATACCCACTACTACGATTCACTTGGCAAGTAAATGCTCCTTCGCCCGGG TCAACCCGTGCCATGTGAGGGGAATTGGGTACTATAACTCTGATACAAGA ATATGGGTAGATATTTCAGACATAGTGGTGTGCTGAGACACTTAAGAGGT TCTACACCTGCGAGGACATCCGTTCTCCCGTGTAGTTCGAGTGTCGTGGT ATACACCATGGCTCGGCAGCTCGCATCTGCAGGGTTGCAATGTCTGCTTG CGCTGTGATTCCTACTCCATCGTGGGTAGGACCCATTCCGATGCATCGGA GGGCATATCTATCTATTAAGTCGAAATTTTCTTAGCTCGAACAAATTTGT GTTCCCATGAGGGTTCGAGTTATAGAGGTTCCACTACATACGCATTTTAT ATGAAAACAATGATATTCATAAGACTTTCTATTTCTAATAACAGACAGTT TCGAATTAGTGAGAGTACATTCTTTCCCAAACATTTTCTCAGTTCTTTCA AAGTTAACCCCTAAAATAAAAGTTCGTTCTTTGTTTTGAAATTCGACTTT TGTTATGTTGCTCAAAGGTTTTATTTTTACATAAGTATTCCCGTTTCATA TCAGACACATATTTCATATCAGGACAGTGTCTGCTTATTGTTATATTGTG CTGAGATAAGCACAAAAAAAATTTTTCTTTCTGCTCTCTGACCAAACTTG CTCCAAATCCGTGTCAATTCAATGCGATAAAGCTTGTGAATTAAAATTGA TGAGTAAGCAAAGGATATCACTCTTATTTAAAAACAAAAATAACTGGAGG ATCCCTTTAAGTCGTTGCCTTAACTTTATTACCTAGGTGTGTTCTGAGAA ATAGTTTTTCATCACACGATGACGTCATGAGTTTGTTTTCGACACCTAGA CTACAAAACATTTTTCGAGATTCTGCCATGCCTGTTTCTTTGGCGATACT TTTTGCTCGGATTGTTTTTTTGAACCTGACTAACTTCATTTATTTGGATA AGTAATCGATTGATTGTTTCAAAGGCTTTTGAAATTTTTATGAATTCAAA ATTTCTTTTGTGTGTGGTTGAAATGTTATGACATATTAGAAACGTTGAAA TTTTATGCAATGATAAATCATTGAGTGGGTCAATTTTCGAGAAGAAGATA AAATAAATATCTGTTTTTCATGAAGAAATTAATGACTCGTGAAAAGACTA TTTTCATTTGCATATAGTGTTCATATACTACTGAAGTTTTATTTTTGAAT TTGGAAAAATCGTTTTGCTAAAATTTGTCCTATTTTGGTGCTTGATTTTC TCTTTCCGATCTTAATTTGTTCTTTTTCAATTTTTTGGTTTTTTAAGGTT TTGTCAGTATTATTGAGGAGTGATATAGTGTATATCTTTCTTTGAACTTC AAATATGACAACTTTGTACTTCACTTTTATGTGATTTTCTGTAAAGAAGA CTTTTACAGATTTCAGAATTTTTGGTAGAGTTCGTTGTAGTTTGGTTTTT CATCTTTTTTTTTCTCCATAAGCAACATTTTTACTCCAAGCCTAGCATGT GCCTAAGATTACATTGTTCTTTAAATTAAAGGTTTGTTTTTAAATAAGAG TGATACCGTTTGCTTACTCATCAATTTTAATTCACAAGCTTTCTTATATA GAATTGACATGGGTGTGGAGCAGGATTGGTCAGAAAGAGGAAAAGAAAAT AATTTTTTGCTTATATCAGCATAATATAATAATAGGTAGACACTTGTGTT ATTGTTATGTGTCTGATATGAAACGGGAATGGTGCTGTTCATCCTCTAGC GAAAAGACTTTATCTATAGTTTCTATAGAAATTCAATTCGATTCAAACCA ATCAAACACCCCTGTCTCACAGCCTTGGTGGAACTTTTTTTAAATCCCAA TGGGGATAGAAATTCTATTGTTCCAAGGTTGAAAATCCAGTGGGGATGCT TTTGGAGTGCAATTTTTAAACATGTAATTTCGAGTGCGAGGATGAAATCA AAGTCAATTTCCCAGTTGGGCTCAAATTCTAGGGTATTTTTCCCATCGGG GATGAAATTTTTGCAAAATTTTCCAGTGGAGCCGGGGTCCCAACGGGTCT GTGACACAGTGGTGTAATTACACGCTTTTTTTATAAGAATGGTGTAAATC AATTTCATCATGGATATTTGGACTTTTTTGGGAAAATCATCTTTACAGCA TTCTTAGGTTATAGGATCAGACTAGATTTAATATTTAGTACATTTTGTGA AAGGAGTGAGCCTTACTTGGGGGTAATTGACAATTTATAATTGAAAATGC TCTGAAATGGCATTCTTAGCTTGAGTAGCAAAATTCCACGAAGGTGATAT TCTTAGCATTATTTTTATTTTTTTGGCCATTTTCATCATGGAGATTCTTA TAAAGTGTATTTTTATAAAAAAAGCGTGTAATACATACCTTTTTATTTTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000126_pilon:414390..425931-

>XLOC_036725 ID=XLOC_036725|Name=XLOC_036725|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2622bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000126_pilon:414390..425931- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAGGATGCGCTAAAGTGAAGAATTTTGGTTATGACTTCTTGTTTAA
CTACCAGACAGTGAAATTGGCAGAAATCAAAGACAAAAAGGTGGGCTTGT
CATTCCGTGTCATACAGTTGGCTATTGTTTGCTACATCATCTTATGACAG
GATGCGCTAAAGTGAAGAATTTTGGTTATGACTTCTTGTTTAACTACCAG
ACAGTGAAATTGGCAGAAATCAAAGACAAAAAGGTGGGCTTGTCATTCCG
TGTCATACAGTTGGCTATTGTTTGCTACATCATCTTCTATGCGATTATCT
ATGAAAAAGGTTACCAAGAGTTTGACACAGCTATCAGTACAATCTCTACC
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AGCTATGCGATTATCTATGAAAAAGGTTACCAAGAGTTTGACACAGCTAT
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TACGTCATCAAACCTAAGGATGGTAATTCATTGTTCGTCATGACAAATAT
GGTGATAACACCAAAACAATACCAAGGAAAATGTCCTGAAGATCCGGAAT
CATATCAAGCACTTTGTAAAACAGACAAAGATTGTCAACAAGAAACTTCC
AATAAATATGGGCACGGATGGTAATTCATTGTTCGTCATGACAAATATGG
TGATAACACCAAAACAATACCAAGGAAAATGTCCTGAAGATCCGGAATCA
TATCAAGCACTTTGTAAAACAGACAAAGATTGTCAACAAGAAACTTCCAA
TAAATATGGGCACGGAGAACGTACAGGACGTTGTGTACCATCATATCGTA
ATTCAACATTGACCGTATGTGAAATTCATGGCTGGTGTCCGACTGAAGAT
GATAGACTTCCCATGATTAAAAGCAATGTCAGGAGAACGTACAGGACGTT
GTGTACCATCATATCGTAATTCAACATTGACCGTATGTGAAATTCATGGC
TGGTGTCCGACTGAAGATGATAGACTTCCCATGATTAAAAGCAATGTCAG
CACGAATATTCCATTGTTGGAGGGAACCAAGCATGCTACCGTGTTGATCA
AAAATCAAATTGATTTCATGAAGTTCGACGTTGCAACCACGAATATTCCA
TTGTTGGAGGGAACCAAGCATGCTACCGTGTTGATCAAAAATCAAATTGA
TTTCATGAAGTTCGACGTTGCAACTTACAATATTCCGAATACTAACAACA
GAACATATATGAAAAAATGTCGTTATAATGCAAAAACGGATCCCTTGTGT
CCAATCTTTCGTTTGCAAGACATCGTTTCAAGTTGTGGCGACAATTATAC
TCAAGTCGCATTCAAGTTACAATATTCCGAATACTAACAACAGAACATAT
ATGAAAAAATGTCGTTATAATGCAAAAACGGATCCCTTGTGTCCAATCTT
TCGTTTGCAAGACATCGTTTCAAGTTGTGGCGACAATTATACTCAAGTCG
CATTCAAGGGTGCAATTTATGGCATCATCATCGAATGGAAATGCAATTTA
GATTACTCCATTGAAGAATGTCTTCCAAAGTATCGATTTAAAAGGGTGCA
ATTTATGGCATCATCATCGAATGGAAATGCAATTTAGATTACTCCATTGA
AGAATGTCTTCCAAAGTATCGATTTAAAAGGTTGGACAATAGTCGATCAT
CCATATCAAAAGGCTTCAATTTCAGGTTGGACAATAGTCGATCATCCATA
TCAAAAGGCTTCAATTTCAGATACGTCAATTATTACGTGGAGAAAGGGAA
ACGTTATCGAACGCTCACCAAAGCTTTCGGTATCAAATTCGAATTGCTCG
CCCATGGGAAGATACGTCAATTATTACGTGGAGAAAGGGAAACGTTATCG
AACGCTCACCAAAGCTTTCGGTATCAAATTCGAATTGCTCGCCCATGGGA
AGGCGGGGAAGTTCAACATCATCCCGTTACTAACAAACTTGGGTGCTGGT
ATTGGATTACTTGGTCTGGCGGGGAAGTTCAACATCATCCCGTTACTAAC
AAACTTGGGTGCTGGTATTGGATTACTTGGTCTGGCGACGCTTTGTTGTG
ATTTCATCGTGTTGAACTTGGTGCCGAAAAGAAACGTATACCGCGACTAC
ATCTGTGCAGACGTCACGCAGGAATATGAAGAACACGCGACGCTTTGTTG
TGATTTCATCGTGTTGAACTTGGTGCCGAAAAGAAACGTATACCGCGACT
ACATCTGTGCAGACGTCACGCAGGAATATGAAGAACACTTGAGAGAAGCA
GCGAAGGAAGAGAAAGAGGAAGCAACCCGTTTGAAATTGATGATGGTCAA
CAAGTGTGCTGTTCGATCGCCTCACACTGCACGCAAATTACTTGAAATGC
TTTGATTGAGAGAAGCAGCGAAGGAAGAGAAAGAGGAAGCAACCCGTTTG
AAATTGATGATGGTCAACAAGTGTGCTGTTCGATCGCCTCACACTGCACG
CAAATTACTTGAAATGCTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036725XLOC_036725-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000126_pilongenomesc0000126_pilon:414390..425931 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1195-1311:118
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