XLOC_036575 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_036575
Unique NameXLOC_036575
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000257_pilon:335222..348328-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036575 ID=XLOC_036575|Name=XLOC_036575|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13107bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000257_pilon:335222..348328- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGCCTAGCGCGGTCCGCTTGGCTTTTACACAAATGACAGATTGAAACTAA AATTTACATCAAAATTTTATTAAAAATATCACTCGAAAACAGAGAAATCA CTAGATTCAATCTGTCGTCAAAAATACGGTGCATATTTCAAGGTTCACCT TTTCTTGCTTGAGAAAGGTTAAAGATTTCATTCTAGCCCTTCGGGCTTAT ACTTCATTGGTTATACCCCTTCCAAATCGAAATATCAGATTAGGTAAAGT AGAAAGCCTAAAAATGTCATTTTCATCCGAACTTGAAATTCTGCAAAACA CTAAACTGCCAACATATTCTGACCATGATTCTATCACCTGCTGGTTACAT AATACACGTTTTTTTTTTATTAGAACACCTAAAATTTGGCTGAGCCTGGA TGTGCTTATTTTTTTAGCAATTTTCAGCCTAAAATGTTGTTAAATGCGTT CTTAATTTTTCAGACTACTCTAAATCGACAATTTGATGCAAAATAAAGAG CACTTAAATTTGGCAAAATTTGGACAATATTTGACTCTTGACTTTTTAAG GTCCACCCCTAAATTCGGTTAAAACTGCTTAAAAAGAGGAAAAAATTGTA GTTTCTTGTCATTTTTTTCCAAACTGAGGCTGGGCAGGTTCTTAAGATGT TCTTAATTTTTCGACGAATTTCAGCCTATATGTTCTTATAAACTAGGTTC TAATAAAAAAAAAACGTGTAAGGCACCACGCGAACAGTATTGCAGCACTT TCATGAAATGTTTTTAGTAAAATCTTGGAAGAAACTTTTTTAAATAAGAA ACTGATACAGTTGATGCTCTCTAATTCGACGTCCTACTACTCGACACGCT CCTTTACAGTATTCAATAAAACTTTAAGTCCAAGTCATCAAGAATCTCTC ATAAACGACGCTCTATTATTCGAATAAGGGATTCGATAAAAATCTAATTC 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GCTTACTCATCAATTTTAATTTACAAGCTTAATTTTCACTTTGGATTTGA CACGGATGTGGAGCAAGATTGGTCAGAAAGTGGAAAAGAAAAACAATATT TTTGTTTATTCAGCACACTAAAACAATAGGGAGACACTGTCCTCAAATGA AACGGAGCAACTAATTTAAAACCTTCTAAGCTTTTTATCAAACATCTATC TACACTGTACTTTGTCACCTTTTAATACAAAACCGGGTTTCCTCTATAAA AGACTTCCTCCTATAAGATATATTGGGCTTCTCCAGAAAAAACCGTATAC CCGCTGTTGAGGAGGTCCATTTCCGTTCCAAGGGGGTAAGGTTTGATATG TGGCGGGATTCCATAGGGAGATATAAAAATCTGTCAAAAATAACTGGAAT TCCATGGGGTAGCTTTTTAAATTCTACTAAACTCAGAATTCCAGAGGGGT TTAAACCTGAAAATGCCTAGAGTTCCAGGGGGTTACAGCATTTCCAGCCA CAGAGAGATGGACCTCTTCAACAGGGGGTATACGTTACCGAGTTTATGTA TGTGTGCTTTCAGCGACGGAGACGGTAAGGTTCTAATTTGACTAGATCAT GACCAACTGAGGACGACGGTAAATAAGCACTTTTACCATCCTCGATTTTG CTGGTCGGAAGTGCGGGTTTTTCCAAATCACTTCAGTCACTTTACCGTCA TCAAAAGTGCAAATACATAAACTCGCTATTATTTATAACACCCCCTTATC ACAGACCCGGTAGGATTTTTTCAGTCTATCGGGGGTAAAAATATCGGACT GAAACTCATTGGTGATTGATTTTTCTTCATTTTAATAGTACTGTTCTCCT TTTCTCTAGGTATATTTGATAAAGAGTCATGTTACGTTGCATCAAGTAGA GGTGTTGATTTTGACCATCGAAGCTTTATATTCTTATAAAGTGTGTTCTT ATAAGAGTTATAACAAAGGGGTACACTTTATATCTAAAATCTACACCTAC ACTGTTTTTTTCTAGGTATATTTGATAAAGAGTCGTGTTACGTTGCATCA AGTAGAGGTGTTGATCCGGAAAAAGGTTTTGCAACTTGTCGTGGAAACTT CACAAATTTTTATTACAATGATAAAGAAAAGGAATGTCAAAAATTCTTTT ACAACGGATGCGGTGGAAATGAAAATAACTTTCAAACAAAGAAAGATTGT GAAATGAGATGCAAAGGTACAGTCTCTTTAACTCGAACCTCTACAACTCG AATATCTCTTTAACTCGAATCTCTATAACTCGAATATCTCTTTAACTCAA ATCTCTATAACTCGAATATCTCTTTAACTCGAATCTCTATAACTCAAGGG CGAGAGTGGTTACAATAACATACATCTCCTGTTTTTCTTTATACCTCCAT GGTTTTACAAAGTGGGACATGTATTATTGTGGCGCTATTACAAAGGTCTC CACCTTTTCACCGGTTTTCAGTATTCATTTTGAAGTTTCTGAAATTACTC TATAACTCAAATATCTCCTTAATTCGAATAATTTCTATCATCACTTCAGC TAACTACCTCATAGGTAACTCGAATTTTCCTTAACTCGAATAAATTTGTG ATCCCCCTGTTTGTTCGAATTATGGAAACACTGCTTTAAATGTTCCACTG AAAAATCACGAATGAAAGAATCACGAGTGAAATCTTTCCCATGCCGGGGG CACTGGTAAATGTTGGATATGTGTGGACTAGACCAACTCCCACTTTGTAA GACACCCTGACGCACTTTTTAATACCTAACGTACTGACACTCTTTGTCAC CTATACGTCATAGAAGACTTTTATCACCTGGTGACGACTACTTAAGTTTT TAGATGTTTTAGCGTTTAGCCTATTTCATTGGATTCGTGTTTGAGTGCAT GATATTTTTCTACGTCACTGCAGTAATCAACTTTTTTTATGGTTTAGCAT TCTTTTGTGAAATGAGATTATAAGTTTTACGAAGCTACCAGCGATGGAAA AGAGTTCTTGAATTTCCAAACGAATACACCTGTCCATAAATTACGTCACG AACATCACTTAGCTCGTATTCAAACAGTTACCATGGTTGTTATGTCCCTT GAGAAAAATTTTTTTTATGAATAAAAAGTAGTTCTAGCTGGGAGTTAATC ACCATGGCAATAATTCCACATCAAGGCAAATGATGTTTGTGACCTAATTT ACGAAGAGGTCAATTAAATAATGACGAAATTCAATTTCTGGACGTCTATC TCGAAAGGAAATTTGCACAGATTTGCATTCCCCCTTTTAAATGAATAGAA AATAGCATGAACAGATGTACAAATCCTGTGAAATAGGCTAATTTCCCACT TTGTAACACATCCTGACGCATTTTGTGATACATGATATGCACCATTGCAA TATCTACCACAGACCCAACAGCTGATTAATTAATTAATAACCTTAATTAA GAAGGTTCCCAACCCTACCGGTGTCCCTACAAGGATCCCTACGGGATCCA AAGTTAAGTCACAGGGTACGATTGCCCCTAAGAAGGCCTTCGGCCTTATA ATGTGACTCCAGAGCTCCAACCCTAACCCTAACTATCACCGCGGATTGAA AAATTTCACTTGCATCCTGGAGTATGATATCGTTTGCCAACCTCATGGTG CATATCATGAATTCACCCTTTTGTCAATTTTCCAGGTTTATCTTACAAGA GTCCTAAAAAGCAGCCGATACATTACGGTAATCAGTGTGGAAACGAAGTA TGTCAATACTTTTCGGAATGCAAACAAAGTACATTTACAAATCAAAAGAA ATGTGTTTGCAATGATGTTTGCTCTCTCTTCCCGAACCCTGTATGCGGCT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000257_pilon:335222..348328-

>XLOC_036575 ID=XLOC_036575|Name=XLOC_036575|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3366bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000257_pilon:335222..348328- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCTGGCCGCTATTTTCTTCCTTTTGATAGCCACAAATGCTGGCCGCTA
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TCCAAAAGTATCGAACAGACATCCATCTTGTTTCAAACGACCAACATGTG
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ATGTCCTTCAACAACAAATCGGATTTCAAAAGAAGATTGCCCAAAAATAA
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ATGCTTCATTGATAAAGACAGCTTAAAACCATATTGCAAATGCAGTGATA
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AAAAATAACGTATAAAGTGTTATATGAACGGAAATGTGACCCAGACCCCA
AAGCAGTGAAACCTTACATGAAGCCATACACTAAACAAAATACAGAACAG
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AGCCATACACTAAACAAAATACAGAACAGTATGTACCTGGCAGTCTTGTA
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GATTCGACAACTTGGTCATGGAGGATACGGTGAATATGTTTGCAGGCAAT
CGTTCAAAGGAGACGATCATCAAACCATATTCAGAATCCTTCCACCAAAT
AACAGTATATTTGATAAAGAGTCGTGTTACGTTGCATCAAGTAGAGGTGT
TGATCCGGAAAAAGGTTTTGCAACTTGTCGTGGAAACTTCACAAATTTTT
ATTACAATGATAAAGAAAAGGAATGTCAAAAATTCTTTTACAACGGATGC
GGTGGAAATGAAAATAACTTTCAAACAAAGAAAGATTGTGAAATGAGATG
CAAAGGTATATTTGATAAAGAGTCGTGTTACGTTGCATCAAGTAGAGGTG
TTGATCCGGAAAAAGGTTTTGCAACTTGTCGTGGAAACTTCACAAATTTT
TATTACAATGATAAAGAAAAGGAATGTCAAAAATTCTTTTACAACGGATG
CGGTGGAAATGAAAATAACTTTCAAACAAAGAAAGATTGTGAAATGAGAT
GCAAAGGTTTATCTTACAAGAGTCCTAAAAAGCAGCCGATACATTACGGT
AATCAGTGTGGAAACGAAGTATGTCAATACTTTTCGGAATGCAAACAAAG
TACATTTACAAATCAAAAGAAATGTGTTTGCAATGATGTTTGCTCTCTCT
TCCCGAACCCTGTATGCGGCTCTGATGGACGATCATACATGTCGCTGTGT
ATTTTGAAATCGATCGCTTGTCGCTATCGCAAACCAATATATGCCATACA
TCGAGGACTTTGCGGTTTATCTTACAAGAGTCCTAAAAAGCAGCCGATAC
ATTACGGTAATCAGTGTGGAAACGAAGTATGTCAATACTTTTCGGAATGC
AAACAAAGTACATTTACAAATCAAAAGAAATGTGTTTGCAATGATGTTTG
CTCTCTCTTCCCGAACCCTGTATGCGGCTCTGATGGACGATCATACATGT
CGCTGTGTATTTTGAAATCGATCGCTTGTCGCTATCGCAAACCAATATAT
GCCATACATCGAGGACTTTGCGGTTCGTCTTCATTAAAGACAACACCAAA
ACCGAAAATCAAATCTCTTTGTGATATAGTAAGATGTCCACCGTATGCAA
CATGTCATATTGACAAAACTTCAAATGCCCCACAATGCATCTGCTCAAGA
AGATGCTCTCTTAAATATGACGTCATTTGTGCTACAAATATGAAAGAATA
TTTTAACCAGTGCTTTATGGAATTAGACTCTTGTCATTCGAATATGAAAT
TCGAAGTTTTCAAGAAAGGATTGTGCCCCTTTAAAAAGACTTGAGTTCGT
CTTCATTAAAGACAACACCAAAACCGAAAATCAAATCTCTTTGTGATATA
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GTGCTACAAATATGAAAGAATATTTTAACCAGTGCTTTATGGAATTAGAC
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CTTTAAAAAGACTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_036575XLOC_036575-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000257_pilongenomesc0000257_pilon:335222..348328 -
Properties
Property NameValue
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