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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000059_pilon:468683..475952- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035794 ID=XLOC_035794|Name=XLOC_035794|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7270bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000059_pilon:468683..475952- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGGTCAAGAAAATAGAACAGAATACTTGAAAGATGCTTTTAAAAG
GCGAACACTATCAACTGCCAAAACGGTCCTGGAGTATCACAGTAAAATCA
ACATTGATGAAACTGCACCGGTTATTAGAAGTGTCGGTATCATTTGTACC
ATTGGTAAGTTTTATTTTCACTTTTTCTACCGGGTGCACCAAAAAAAAGT
ATACAAGTTTGTTGAGATATTGTGAGTTTCAGGATTTAAATTTTTTGTTC
ATTCTTTTTTTATTGTATAGAGGATGCTCTAACTTGAATTTTGAGCTATC
ATACATTAGAAGTAGTAAGCACACACATAACATCAAAACCTTTCTTCGAG
ATTTCAAAAAAAAATTTTCAGCCTTTCCAAAAATATTATCCCACGTGGGA
ATAGCTTATTTTACCATATTCTTAAATTCTGTAACGAGTTTTGATGAACA
CAGTTGCATTTTTTTGGTATTTTAATGTGTAAAGAAGGTAAGTGTCAAGA
GAAAAGCTTGCTCGTTGTTTTTGATAATTTTTTGAAATTTCGACATGGAA
AAAAGTCAGTGTTTTGGAAATAACTTTCGAACTACTTTTTAAAATTTATA
GTATATAGTTTTAGTTCCTTTTTTTCTGTCTTTTAATAAAAGTACATTTT
AAAAGATCGTCAATGCACAATAAACCAGGGACGTACCTGGACGTACCCAC
TTAATATCGCTTTGCTTTCTTAGGCTCTTTTTAGGCTTTTTTTAGCTCAA
AAGTCTTTTAATGTGTAATTTGTGTAATTGTTTTGGACAACCTATACACA
AAAAACTTAAACGAGTAAGTACTGACGTCGAATTTATCAGGGTCATCAAT
AAAACCATAATATGAGTTAGTGCATAACGGGTTCACAGATTTCAATGAAT
TATTTTTGTCATCTGCTTTTCAGGGCCCACATCACAAAAAGTAGAGCAGT
TGGAAGCACTGATTTCTGCTGGTATGAACATCGCTCGAATGAACTTTTCT
CATGGGACACACGAGGTATTGTTAAAATATACATTCTACCAGATTAAAAC
GATTCTTTCTATAAAATGTTTTATGTAGGACCAAAAATCTGACAATTTCA
AGTCTTAAAATAATTGAAAATTATACTTGTATAATTCTGTAATTTAAAAA
TGCTTTTAAAGACAGAAATTTTACAAATTGCAGACTAAGAACAGAACCCA
GAATCACAGAGGAAATACCCTCCCTCAATTTCATATTCTTTCATTCAATA
TCTCTTTTGGACATTTTAATGACATTTCATCCGTCCAGATTTAGATTACC
TACAATTTATAACTAGCTCAAATCGTCTATTATCTTTGTTTGACTAATCA
TTTATATTATTATCCTAATAATAGCTATTTGCAATTTAACATTTAACCAA
TTTAGAAAGTAACCACTCTAGTTTTCATTTTTTTGTGAATGTTGGTTTAT
TTGCTTGGTTTTTATATCAATGAAAACGAGGGCGGTCTCATCATTACTAA
AGGCTGCAGAAATCCTATCGTCGTCGCCTTTTTATTTGATCTGGAACCTT
GATAAACCCCAAGCGAAACATAGCCTTCGGCCTTTAAAGTGGAGAGACTA
GTCTGCCCGTTCATTAAGCCAGGATTTTCTTAGCTCCTTTTGTTTTGTCT
GGTGCACGTGCATAGAAAACTAGCAAAATTATGTCTGCTCTGCAACGGGA
AAAGTTCGTTTTGATTTGCTTAAATCCAGATTTACTCTATAAGGCTATTG
GTAAACCAGCGCCTATACCGTCTTCTACTTTGTGGATCAAAACTGTAGTT
CAAACAAATGCTCGAAATGGTTTCAGTTACCCCTTTTCATCCTCGTATGG
GTGGATACGTTAACTCGTTATTACTAGGTAGTAATAGTCTAGCATGTGCT
AGACGACCATTTCAGTAGAAAATGAACAAAAATAATGGAAGGAACAATGT
AGTCTACATACAAACTGATATTACCCTGTAATAATTAGATCATATTTTTC
TACAACACCCATATCTTCATGTTACACGAATTATGAATGATTCAAGTTTA
TATTGGTTATCGAAGATTTTTTACATAATTTTGTAACTGAGACCATGTTC
ACACGTTACTGTTCCGTTTCGCTCCGGTATGATATTCGTTTCGGATCGAG
TGTGTTCATATTGGTTTCGGAACGTTTCGGAGCAAGAAAACGGACCGATC
CCGTTTCGATGAAAAAAGTGGAGCGAAACCGTTTCGATCTGTTTTGCTTT
GTAACGTCTTCTTTTTTGACGTTTCGAATTTTGACGTTCACACTTGTTTC
GGAACCGTTTTGTTTCGGAACGGAACTGTAACCTATGAACATGGTCTGAT
GTGATCCCTCATTATTTTTAGTACCATGGATCTACCATTGAGAACGTGCG
TGCTGCTGCAGCCAAGGTTTACCCTCACCCAATCGCTATCGCGTTGGATA
CCAAAGGACCTGAAATCAGAACTGGGATGATGAAAAGTGTAAGTCACCTT
TTGTTTTAATACTCCTATCAAACCTCATGTTTCAAAAAGATTTCGTTCGA
CGTGGCCATGGTCGAATAGCACACCGCTATGCAAGCGTCATAATTATTAC
TTTTAACATTTGACCGAAATTCAATCCCACAATCCTTTTCATCTTGATTT
GTAATGCGTGCAAGTTATTAAAACTTCAGAAGCCATTTAACAAATCGGAA
CTCTCCTTTAAAAGTTTGTCAATTTCTTGATGTAACACTGTAACAGACTT
TTATATGACCTCGAAATGATTGAAAAACCCTGCAGCCTGCAGCCTGTCTA
ACGAAAATATTTTCCATAACCTTAATCTAATTCATTTCCATTCTTCATCA
GGGTAAAGATGTTACTTACAAGAAGGGACAAGCCTTAAAGATCTCTTGTA
ACCCAGCCATGCGTGAACAGTGCGATGAAAATCAACAATATCTGGAATAC
CCAAGTCTCTGCAAATCTTTAAAAGCAGGTCAGAAAGTCTTTACATTGCA
TGTAGGATGTTGTTTTTGTTGTTTTTGCATGTTGAATGCAATGACTCCAG
ATATTCTCTAAATTTAGGCTAGGCCCCTTTCGTATAGCTTTAAGAGTTGG
GATTTGTGTGTGTAACATTACTCATTAATAGTGCTTTTTGAACCTTTTTT
GATTACGATTGCTGGACTATTTTTCATATTACAGGAAGTACAGTTGACGC
TCTCTAATTCGACGTTCTACTATTCGATACCCTCCATTATTTGATAATAT
TGAAACTCTCATAAACGCCGCTCTACTATTCGCTACACTCTCTTATCCGA
TGAAAATTCTATTTCCCTTGGAAATCGAATAAGAGAGCGTCAACTGTATT
AAGAAAAGCAATGTTGAAAGTTTGTGTCTCAGACGGATTTCTGTGGTATT
GAGCTATAATAAAAAGGAAGCTTGTCGTACTACTAGGTCCACTTTCTCAA
TTTTGAACGAAAAGCTTTCTGTTGAACATTGAAGGTTTTAGTTTTACATA
AGTGTTCCCGTTTCATATCAAACACATATCTTATATCAGGCCAGTGTCAC
CTATTGTTGTATTGCATTCGATTTTGTGCTGAATAAGCAAAAATTGTTTT
TGTTTGCTATTTCCGACCAATCTTGCTCCACATCCGTGCGAATTCAATGT
GAAAAAGCTTGTGAATTAAAATTGATGAGTAAGCAAACGATATCACTCTT
ATTTAAAAACAAAACTTTTAAAGGGACATAAAAGTAGTAAAATGTAAACA
TTGCGCGAACCATGTGTCATTAAAGAGAACAATTAAAATCACGTATCCAA
AACAAACTTGTAAAAAAATTGAAACAATCAAAATCAGCCATATTTGTTTT
TATTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCCATG
TTCGTTCGTTCGTTAGTTAGTGTGTTAGTTACCAGCTTTTCTCGAGATTG
GTTCATTAGTTTTTTCTGATTTTTGGCACAAAGGTGCATGACCATAAACC
CTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAAATTTTTGGGCAAAT
TTGGGCCAAAAAACGGCTTAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAAT
TGGATCATTAATTTTTTCTGGTTTTTAGCATAAAAGTAGGGTACAATCAT
AGTTAAAGCTTGGCTCAAGCAGATTTTTGCAAAAAAATTTTTTTGGCTCA
AAAATCGCATTTTTATCTATAAGAACCACTTTTAATAAAAAACATCAATG
TTCTTAGCCATATTATTATTATTATTTTTATTAGTTTTTTTACGATGAAA
ATGTCACGGTGGAGGGTAATGATTTGAGTTTTCTGTAAACACTTATTATT
TTTTGGCTGAAAAACGAATCTTTATCTATAAGAATCACTATTTATGAGCA
TATATCAATGTTATCAGCCAAATTGTTTTATTATTATTTTTTCTAACAGA
AGAAAATGTCACGGTAGAGTGCGACGGTTTGAGTTTTCTGGAAACCTTAT
TTATTAAGCTGTGCATTTTTCTGATAGTGGTTTTTATAAAGAAAAGCGCT
TAATAGCTTTTTTATTTCTTTTTCAAAATCTTTTTCAATAGTGTTGATAG
TTTCTCTCAATAGATATGCTTTCATTTTCTTTATTTTTTTTGTATTTTGA
CCAGTTATGTCTTATGTGTTTCAATGTTCACTGATTAGTTTGATAACCAG
GTAGGTCCATAAAAGTATCGCTTGTTTATTTTGACATGTGACATTTGTTT
TGATTTTGTATCCCGCTGCATACGGTTTGTTTACAAATTTCGTCAGTACT
TTTATGTCCCTTTAACTGGTTTGAATTCTTCTTTTTCTTTCAGGCAGTAA
GATTTTTATTGCTGACGGCATGTTGATTTTGGAAGTGCGCGAAGTTTTGA
ATGACGACATGCTGATGGCTGAAGTTAAGTGCGATGCCACTATCGGTAGC
CGGAAGAATTGCAATCTGCCGGGCGCCATAATTGATTTACCTGCCGTGTC
CGAGAAAGATCGCTCCGATTTGCTATTCGGTGTGGAACAGAAGGTATGCG
CCCAGCTGGCACACAACGTTATTTCAACGTTCATCTAACGTTATATGGAC
GTCGTGAATATTTGAAACAACGTTGGGTGTCGGAGTCAAATAAAATAGAT
TAAAGGAAAAAATTTTGACGGGAAGAAAATTTGGCGGATTTGGTGGATTT
AGTCAAAATCCGCCAAATTAAGTTCCCGCCAAATTTAATTTTTTCCGTCA
TCCGCCAAATTTAAGTTGCTATATTTATTCCCCCAAATGTACGCTATTTC
AGGCTTTAAAACAGGTTTTTCTTTTTTAATGGCGGCATTTTTTGGACAAA
AATGTCCTTCGTCCGCCAAATTAAATTCCCGCCAAATTTAATTTTTCAAG
TTAACCGCCAAATCAAATTCACACTGAAAAAACTTTTTTGACCATCCGCC
AAATTAAATTCCCGCCAAAATTTCTTCCATTAATGTAGATTTTTTTTTAA
CTTCGACTGGGTTATAGACATCGATAGTACACTACGAAGGGTGAACTTTC
CAATAATGCAGTGGTCGGAAACGTTTAGATTTTTTAGAGAGAAAATGCTT
GGCGTCAGCAGCCAGGGTAAAATTCAACTTTGTCGAGCGTAACGCTGAGT
TGTAATGCCTAATGGTTAGATTGGATACGTGATTTTAATTGTTAGATTAT
CTAATGTCACCTCACAACACATTTTATTCTAGAAATGTTGCATCTAAAAA
TCAATGTCTTAAATAAAACTTAAGTTTACAAAATAATAAACACAAAACAT
ACCTCTAAATCCCGTTTTTAAACCATCTTATGTTATAATTGTATTACAAA
ACTACGAGGAGACTGGGTGAAAAATAGTTTTCTAGAAAAACTTCTCATTT
CGATCAATAAACGTTTACTAATGACTATAATACTTTGATATCTTTATCTC
CCAGGTTGACATGGTTTTTGCCTCGTTTATCCGAAAGAAAGAAGACATTT
TTGATATCCGTAAAGTTTTGGGTGAAGAAGGCAAAAGCATTAAAATCATT
GCCAAAGTTGAGAACCATGAAGGTGAGAGTAGTTTCTTTCTTCTTCTGAT
AGGTCATACCGTATTTTGAGCTTATGCAGCAATCCCTTCTAATCCCGGCA
CCCTTCCCTTGTAGATAAGAAAGAAAGATAGAAAATAGAGAGGGTGGAAT
GACCAATTGGACTTTTTTACTTTATCTTTCTGGGTAAAGTCTCGAACAGT
GATTCCAACCTTCATAATATAAGTTACCAACACGCTAAAGCTCTGAAGGT
TGGGAAACTTTTCAACATCTGGAACATTACGGAATTTCGCAAGCCTTCGT
TTTTGGGGATTGGCGGGTCTAACCGAAATATTTTCAGGTTTACCACCGCC
CAAGGGTAGTTTCACCTGACTGAGTATGCGGCGCATCAAAGGCCGACTTT
CGTTCCTCTCCAATGTTAACTTGGACTGCTTCTCTAGAGCTTTAGCCTGG
ACGGTCGCCAATCTGCCATTGGAATATCAGATTACGCTAATTGAAAGTCT
GAAAACTTTCGTCTCGCCTTTATTAGAGTAGTACAATCAGGTACGTTACA
AATACTACTAGGAAAGATTCAATCTGAAACTTTCCTTAAAACATATCTAT
CTTTAATACACAAGGAATCACCAACATAGATGAGATTGTGGAGCACTCAG
ATGGTGTGATGGTAGCACGTGGTGACATGGGTATGGAAATCCCCCTGGAA
AAAGTCTTCTTAGCTCAGAAACTCATCATCTCCAAATGTAACAAGAATAA
AAAGCCTGTCATCTGTGCTACACAGGTTAGTCAACGAATGCTAATTCCAG
CCTACTTCACATTCCTTGTCTCGTCTTTCTTGGCTTCACTGGTTTTCTTC
CATCGTCTGCCATGTAAAGAAACACCAATTTGTTTACCGTATAACTACGA
ATGTAGTCGACCCCTATATTACGAGTATACTACGAAGTTAGATTTTATAG
TTATAATCACTGATCGGATTAATACCCCTTCCCTTCTGTCTCAGATGGAG
AAAAAAACACTTCTAAAACTGGGTATTGCAATTTCTTTGACAGAACATCC
ACCTTACATTAAATCAAATGTTTTTGTTTGTTTAGATGTTGGAGTCGATG
ATCAAAAACCCACGTCCGACGCGTGCAGAGATTACGGACGTCGGAAATGC
AGTGACGGATGGTTGTGATTGCGTCATGTTGTCTGGTGAATCAGCCAACG
GTGCTTATCCTGTGGAAGCC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000059_pilon:468683..475952- >XLOC_035794 ID=XLOC_035794|Name=XLOC_035794|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2208bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000059_pilon:468683..475952- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTGGTCAAGAAAATAGAACAGAATACTTGAAAGATGCTTTTAAAAG
GCGAACACTATCAACTGCCAAAACGGTCCTGGAGTATCACAGTAAAATCA
ACATTGATGAAACTGCACCGGTTATTAGAAGTGTCGGTATCATTTGTACC
ATTGATGTCTGGTCAAGAAAATAGAACAGAATACTTGAAAGATGCTTTTA
AAAGGCGAACACTATCAACTGCCAAAACGGTCCTGGAGTATCACAGTAAA
ATCAACATTGATGAAACTGCACCGGTTATTAGAAGTGTCGGTATCATTTG
TACCATTGGGCCCACATCACAAAAAGTAGAGCAGTTGGAAGCACTGATTT
CTGCTGGTATGAACATCGCTCGAATGAACTTTTCTCATGGGACACACGAG
GGCCCACATCACAAAAAGTAGAGCAGTTGGAAGCACTGATTTCTGCTGGT
ATGAACATCGCTCGAATGAACTTTTCTCATGGGACACACGAGTACCATGG
ATCTACCATTGAGAACGTGCGTGCTGCTGCAGCCAAGGTTTACCCTCACC
CAATCGCTATCGCGTTGGATACCAAAGGACCTGAAATCAGAACTGGGATG
ATGAAAAGTTACCATGGATCTACCATTGAGAACGTGCGTGCTGCTGCAGC
CAAGGTTTACCCTCACCCAATCGCTATCGCGTTGGATACCAAAGGACCTG
AAATCAGAACTGGGATGATGAAAAGTGGTAAAGATGTTACTTACAAGAAG
GGACAAGCCTTAAAGATCTCTTGTAACCCAGCCATGCGTGAACAGTGCGA
TGAAAATCAACAATATCTGGAATACCCAAGTCTCTGCAAATCTTTAAAAG
CAGGGTAAAGATGTTACTTACAAGAAGGGACAAGCCTTAAAGATCTCTTG
TAACCCAGCCATGCGTGAACAGTGCGATGAAAATCAACAATATCTGGAAT
ACCCAAGTCTCTGCAAATCTTTAAAAGCAGGCAGTAAGATTTTTATTGCT
GACGGCATGTTGATTTTGGAAGTGCGCGAAGTTTTGAATGACGACATGCT
GATGGCTGAAGTTAAGTGCGATGCCACTATCGGTAGCCGGAAGAATTGCA
ATCTGCCGGGCGCCATAATTGATTTACCTGCCGTGTCCGAGAAAGATCGC
TCCGATTTGCTATTCGGTGTGGAACAGAAGGCAGTAAGATTTTTATTGCT
GACGGCATGTTGATTTTGGAAGTGCGCGAAGTTTTGAATGACGACATGCT
GATGGCTGAAGTTAAGTGCGATGCCACTATCGGTAGCCGGAAGAATTGCA
ATCTGCCGGGCGCCATAATTGATTTACCTGCCGTGTCCGAGAAAGATCGC
TCCGATTTGCTATTCGGTGTGGAACAGAAGGTTGACATGGTTTTTGCCTC
GTTTATCCGAAAGAAAGAAGACATTTTTGATATCCGTAAAGTTTTGGGTG
AAGAAGGCAAAAGCATTAAAATCATTGCCAAAGTTGAGAACCATGAAGGT
TGACATGGTTTTTGCCTCGTTTATCCGAAAGAAAGAAGACATTTTTGATA
TCCGTAAAGTTTTGGGTGAAGAAGGCAAAAGCATTAAAATCATTGCCAAA
GTTGAGAACCATGAAGGAATCACCAACATAGATGAGATTGTGGAGCACTC
AGATGGTGTGATGGTAGCACGTGGTGACATGGGTATGGAAATCCCCCTGG
AAAAAGTCTTCTTAGCTCAGAAACTCATCATCTCCAAATGTAACAAGAAT
AAAAAGCCTGTCATCTGTGCTACACAGGAATCACCAACATAGATGAGATT
GTGGAGCACTCAGATGGTGTGATGGTAGCACGTGGTGACATGGGTATGGA
AATCCCCCTGGAAAAAGTCTTCTTAGCTCAGAAACTCATCATCTCCAAAT
GTAACAAGAATAAAAAGCCTGTCATCTGTGCTACACAGATGTTGGAGTCG
ATGATCAAAAACCCACGTCCGACGCGTGCAGAGATTACGGACGTCGGAAA
TGCAGTGACGGATGGTTGTGATTGCGTCATGTTGTCTGGTGAATCAGCCA
ACGGTGCTTATCCTGTGGAAGCCATGTTGGAGTCGATGATCAAAAACCCA
CGTCCGACGCGTGCAGAGATTACGGACGTCGGAAATGCAGTGACGGATGG
TTGTGATTGCGTCATGTTGTCTGGTGAATCAGCCAACGGTGCTTATCCTG
TGGAAGCC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000059_pilon | genome | sc0000059_pilon:468683..475952 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 970-1104:136 |
| Aaloc | 811-969:605 |
| Aaloc | 691-807:1317 |
| Aaloc | 493-690:2426 |
| Aaloc | 364-489:4420 |
| Aaloc | 247-363:4900 |
| Aaloc | 157-246:6346 |
| Aaloc | 1-153:7271 |
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