XLOC_035301 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_035301
Unique NameXLOC_035301
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000446_pilon:149261..155073+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_035301 ID=XLOC_035301|Name=XLOC_035301|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5813bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000446_pilon:149261..155073+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAATCTCCATTTGAAAATCTTGTTGCTTGGTTCCatgaaaatctttc taaaaaacCTGATAATTTATTATCTCTTGATGAATTGGTGGAATCTTACT CAAAATATGCCTATTTAGATCATTTGGATAAATCCTCTTTTTTAATTGCT TTAAAAGATATGTTCAAATCTCTCAGCATTAACCCTGAGTTTGTGAGGAA AAAGAAGAGAGGTCTACGATTTACTGCCTTAGAAGGgtttgaatttgaga aagaaatgAGTTTACCTAGTGAAAAAGgcacaaaaaaatcatcaacaaTT TATAGCGGTagtgttgaaaattttaatgagGCAAACCAGCAATCACATCA CATTTCTGTTATTACTCACTCAAAATCTTTGGAGTTGTTTTCTGATTCAA TGGGTGTTGACATGCCAGTTGACCAGTCAATCACTTTAAATTCCAGTGTT TTATGTAGTGATGAACAAAACAATTCTAATATTGAAGTGCATGAAAATGA TAATAATAGTTCCAATGATTTTGAAGATGGCTTTGAAGACttgatacaaa atcaaaacagaacAAGTTCACCAACAACCAAGCAGGACGAAAAGTCCCTT gaagttttgacaaaaaatgaatcaaaatcaaaaaaaacgttgctggaatt ttttgaaaaaaaacaaacagaaaccAGTTACAATGATAAAAAAGCTGCTG TGACTTATTTGCCAAAGAACTTCAAATTCCGTGAAGAATCTAAAGAGTcg ccatattataataatttgattttttctcggCACTTTCAAAACTACAAAAG TGCTACAATTGTCAATTACAAGTCCTCATgattcatttgaaaaaatttta gaaaaaagttttgaagttacTCATGACCAGAGTAATGAAATAAAAGGTTT GGTTAACAGGGCGAGAAAAACTACCAATCTCTTTGAGCAAAAACTTAAAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000446_pilon:149261..155073+

>XLOC_035301 ID=XLOC_035301|Name=XLOC_035301|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=11626bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000446_pilon:149261..155073+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAATCTCCATTTGAAAATCTTGTTGCTTGGTTCCatgaaaatctttc
taaaaaacCTGATAATTTATTATCTCTTGATGAATTGGTGGAATCTTACT
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TATGGAACGATTTCCTCGGAATAACATAGACCATCTTGATAACATGAATT
TTAAGGCAGGGTCAAGTGTAACCATTCCTATATTTTGTGATTGTATGACC
CCGGGTACTGATGAAATGGTGAAATGCTActtttgtaatgaaaaataCCA
TACTAGATGCCTTGCAAAGATTGAAAATATTGATATTGAAGAAGAGATGT
TTGAATGTCACAACTGTaaaatgtaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_035301XLOC_035301-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000446_pilongenomesc0000446_pilon:149261..155073 +
Properties
Property NameValue
Aaloc4333-5817:4329
Aaloc4327-4329:4326
Aaloc4150-4326:4148
Aaloc3940-4149:3933
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Aaloc1-816:1