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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000009_pilon:322183..325743+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_035155 ID=XLOC_035155|Name=XLOC_035155|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3561bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000009_pilon:322183..325743+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTAATGTTGAACAAATTGTTGGTACTTTTTGTGGAGATGATAACAAGCC
ACATGATATTTACACTCATTCTAAATGTGCTACCTTAAAATTGGTCAATG
GATATAAATATGCGAGTTATTTTCGAGTCTTGGCTGAATTCATAGATCAA
GCGTCTATCCCGCACTCTGATTGCTCCTGGTATGAGAGGTAAGATTTAGC
CTACAATGTCATTTTAAAGTTCATGAAATGTCGTAAAAAGTAATTTTATG
TGCATTTTATTGGGTGGAAATTACTTCCGCACGATACAGGTTCTTGAAAA
AATCCATAAAGAGCGCTAGAAAGATGAAAAGACTTGATGAAAATGAGTTC
ctcaaaaatctttaatttgaTAAACTCACACAACAAAAATTGTTGGGTAT
TCTTCCAATGTTCTTAAGGTATTCTTCCGATGTTTTTAAGGTATTCTTTC
GATGTTCTTAAGGTATTCTTTCGATGTTCTTAAGGTATTCTTTCGATGTT
CTTAAGGTATTCTTTCGATGTTCTTAAGGTATTCTTTCGATGTTCTTAAG
GTATTCTTTCGATGGTCTTAAGGTATTCCTTCGATGTTCTTAAGGTATTC
TTTCGAtgttcttagggtattctttcGGGTAAAAACAGCTCATTGACCTC
AATGAGCTATTTTTACCCGAAAGTAACATCGATTGATATGGCACAATTCT
TGTTTATTTACTCTTTAGGGTGTTAACAGAGCCAAGCGGTGTGATTATTT
CACCAGGGTGGCCACACGGTACCGGCAAAAACAAAGTGGAATGTAATTGG
AGAATTAAAACACAAAATGACAAAAGCATTACTCTAAACATAATGGATGA
CGATTTTCAATCGAATGATTATTTCCCCTCGTGCAAATCACATCTCAAAC
TCGAAGGTTAGTTTCATTTAGCGTGATCTTTTTGCGTATTTTTCGTTCAA
CTCAAGGATTGCCGAGTCCTGATAAATTTTAATTACTTAAggactctgac
catagtccCGGCGGGGAGGGGAGGTACTTAGCCatatggagggtacggta
tgtgccgcccttaagggctctgaccatagtcgaaaaattgattttagtat
ttgaacataaaagttatgttttagattctttaacacttttaacaaagaat
tgcctttataaattgctttttaatcaaatccctcaCGAgtgattaagaat
ttaattgcaaaaatgacgctatgaactttaaaaagacgttgataatatgt
tgcattactttcttttataaaaagtctaaattttaataggtaattaacct
ttttatttcaaagctttttcaaactgtccgcaaaaaaatgaactgtttta
aatttttcgaaaaatttttctaaattaatgcatcaaaaattatggttgtt
tttctatataagcactattttcaagattttgagacaaataagctttcaga
aaaatgttttgaaaatcttttttagttcggtaaaagatacaccatctacg
gcaaaaatattttcaaaatgttttttcttcgcccaAAGTAAACTCTTCAA
AGTTAAAATACtattcttcgcaaaagtcttcattttcttcttcatcaaat
tttttcattgcgattcctAAATTTTTAGACTCAAGTATAATTGGCCTAGC
AGAAAATGTACAACATGCCACAATTTTGTGTGCTACAttaagtagaaatt
tataTtttgtacgtggtaaatatcaaaaattcactacggtcagagccctt
aataatGAAGTGAGAAATACCGAGTGGGCAAAAAGTATATGGGTGTATTC
TCACTGTTGCTTGAAAGTTGATTGAAAATATGGGAACAAAGAATTGCACG
ATCTTCTCCTTTGCTCTTATTATCTAAGTTTGCACGATCGAGTGATTATA
TTTCAGGCAAGCTTCAAGCCaaaaaaaaCTATGAATAAATGATTTTGTGG
AGCAGATATCAACGACACAGTAACTTATGTTTTTATAGCACGAATAGAGC
TTTGtcgtaaaaatctgctctccaacGCAGCTCGTTCTTCGCCCCTTTCT
ACGCTACTGTCCAATGTAGGATTTGAAGCTAATTATTTCCTCAATATATA
TCctcctctagccttcggcttgaaacttaTGAAATATGAATGAAAATCTA
GAACTTTGTTTATCCAGTGTTTCCATTATTTTCATGGTATAAGCTACTAT
AAACCAAGTCATTAATTTTGCCGATTTCAACGGTATCTTAGAATGCATCC
TTTTCAATTTGCATAACGGGAtagttaaatttatttttcgacTGCAACAT
ATTTCTCATAAGTTAAGCCTGCCGTCCACTAGGCTATTTTAAGCTATCGC
GAAATAATCATCTATAAATAACAATGTCTATCGCGGAATAAACCTGTCTA
TCGCGTTATTTTAATTCACGATAGggagttttcaaaaatcattgtCCGAT
AAAAACATCTTCACCACATGAGAgcatttttgacttttggtGTGTGCTCT
AGTGTAGTGTTAGCGTATTGTATCCTATTTAATAGTGGAcatgtaaaatc
taaaaataacttCAGACATGAGATAACATTTCGCAATAACCAAAAATAGC
ACTAGTGGACGGCAGGCTTTAGGATTCTTTTGAGGTTTCATTAATTTTAA
ATTACTGAGGTATTTAATCTGTCATACTTTCTTCCCTCAAAAAGTTCTTT
CTGCAGAATTAAAACCAGATTATAAGAAATCTATGGGGTAGACGGGGGTA
Gttgggacagaaatattttagacgatacgcatcccctatatcaaatcata
tcagaggggatgcgtgcagcctataCAAGTGCTTGAGAAATTGCGCAATA
CAGCACGTCGAATCTTTCTGTCATTACTCTGCGATgcaatataaaaatat
tgccgAACAAACTGCAAGCGCTTGCAATTTCTCCTTGCAATTTGACGTTT
TTCtcataaaacatttttatttgtatAATTTCAGACTCTTTCTAAGGAGG
TTACGCTTCAAGAATCTCCAGACGGAAGCAATGAAACAATTGCAATGAAG
CCGCATTAAAAAAGcttaaaggttttgattttaaataagagtgataccgt
ttgcttactcatcaattttaatttacaagctttttcgcatttttcgcaca
cagatgtggagcagaTTGGCaagaaagaggagaagaaaaacatttttttg
cttatatcagcataacataacaataggaagacactgccccgatatgaaat
atgtgtctgatttGAAACGGGAtcacttatttaaaaacaaaacctttaag
agacTGAAAACGCTAATCCGAAAGGTTTTGAttaccttaatttttttttc
aggcaagCAATCAAATCCGTACATCTTTTTCTACAAGTACATTTGCGACA
ACGGAAAtcatatctcgagatctagcaacacatataatacgtataaCTAT
GATGTCAACGTTGAATACGTATTCAAGAAAGTCTTTAACAACAAAAACTA
CAGAGGTTTAGCACTGGGATGGACAACTTATGACAACCCAAAACATCACA
CTCGTCAAAGT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000009_pilon:322183..325743+ >XLOC_035155 ID=XLOC_035155|Name=XLOC_035155|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1170bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000009_pilon:322183..325743+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TGTAATGTTGAACAAATTGTTGGTACTTTTTGTGGAGATGATAACAAGCC
ACATGATATTTACACTCATTCTAAATGTGCTACCTTAAAATTGGTCAATG
GATATAAATATGCGAGTTATTTTCGAGTCTTGGCTGAATTCATAGATCAA
GCGTCTATCCCGCACTCTGATTGCTCCTGGTATGAGAGTGTAATGTTGAA
CAAATTGTTGGTACTTTTTGTGGAGATGATAACAAGCCACATGATATTTA
CACTCATTCTAAATGTGCTACCTTAAAATTGGTCAATGGATATAAATATG
CGAGTTATTTTCGAGTCTTGGCTGAATTCATAGATCAAGCGTCTATCCCG
CACTCTGATTGCTCCTGGTATGAGAGGGTGTTAACAGAGCCAAGCGGTGT
GATTATTTCACCAGGGTGGCCACACGGTACCGGCAAAAACAAAGTGGAAT
GTAATTGGAGAATTAAAACACAAAATGACAAAAGCATTACTCTAAACATA
ATGGATGACGATTTTCAATCGAATGATTATTTCCCCTCGTGCAAATCACA
TCTCAAACTCGAAGGGTGTTAACAGAGCCAAGCGGTGTGATTATTTCACC
AGGGTGGCCACACGGTACCGGCAAAAACAAAGTGGAATGTAATTGGAGAA
TTAAAACACAAAATGACAAAAGCATTACTCTAAACATAATGGATGACGAT
TTTCAATCGAATGATTATTTCCCCTCGTGCAAATCACATCTCAAACTCGA
AGgcaagCAATCAAATCCGTACATCTTTTTCTACAAGTACATTTGCGACA
ACGGAAAtcatatctcgagatctagcaacacatataatacgtataaCTAT
GATGTCAACGTTGAATACGTATTCAAGAAAGTCTTTAACAACAAAAACTA
CAGAGGTTTAGCACTGGGATGGACAACTTATGACAACCCAAAACATCACA
CTCGTCAAAGTgcaagCAATCAAATCCGTACATCTTTTTCTACAAGTACA
TTTGCGACAACGGAAAtcatatctcgagatctagcaacacatataatacg
tataaCTATGATGTCAACGTTGAATACGTATTCAAGAAAGTCTTTAACAA
CAAAAACTACAGAGGTTTAGCACTGGGATGGACAACTTATGACAACCCAA
AACATCACACTCGTCAAAGT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000009_pilon | genome | sc0000009_pilon:322183..325743 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 379-585:3355 |
| Aaloc | 190-375:720 |
| Aaloc | 1-186:1 |
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