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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000299_pilon:278639..283970+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034938 ID=XLOC_034938|Name=XLOC_034938|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5332bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000299_pilon:278639..283970+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATACCCACCACCTGGACCTGGATACCCTGGCTATGGAGGACCTCC
AGGTGTAAGTTTCcatattccaatatttttatttcttatatgaaatttaa
tatcttaaataAAGGCTGTAGTATTCTTGTTTCATACCAGATATActtct
ttgttttttgattGATGAGTAAGCGAATAATATCAACTAAAACCTCTTAC
AAATTTCAGTTATTGTTGTAAGGAACCTTTACAATGAAACAATGATAATG
gtatcaatttagaaaattttgggtGTTGTTCTGTGAAATGAGTGTGATTG
TTtagaaaatgttcctattttttcAGTACCCTTCTGGAGTTGGTGGACCT
CCCGGTGGCCCAGGTTATCCAGGAGCAGCTCCCACTTACCCACCAGCTGG
AACCGGTTACCCTCCTGCTGGTCCTGGCTACCCACCAGCTGGAGCAGGCT
ACCCACCTGCAGGACCTGGCTATCCAGCTGGACCACCTGCAGGTCAAATG
CCTTATGGTGCACGTAAGTAACTTTTCAGTTACTCAACTTTTCAGTTATT
CAAAGTTATGTTTTACTTCTTTGCAGCATAATAACTTTTTAAAGATGTAA
CATTGCACAGTTATTTGTTTCATAAAGTAATTTTTGTCAACATATAAGCT
GTGGTAGTAAATATCTCAGACCTCGATTTCTAGCTCCAGCAGGCCAACCC
TATGGTGGCTACCCTCAACAGCCTCCAGCGCAACCAGGTTATGGTCAACC
TCCAGCTCCTGGATATGGTCAACCTCCAGCACCAGGGTACGGGCAGCCCC
AAGCACCAGGATATGGTCAACCACCAGCACAACCTGGTTATGGGCAACCT
CCAGCCCAACATGGCTATAGCCAGCCTCCAGCTCAGCAAGGTTATGGTCA
AGCACCTCCCCAGCCTGGATATGGACAACAGCCAGCACCACAACCAGGCT
ATGGACAACAGCCAGCACCACAACCAGGCTATGGACAACAGCCACCACAG
CAACAAGGTTATGGACAACAACCTGCTCCTGCAAAACCTGCACAACCTGC
CAGGCCAGGTCAACCAGCACAACCTCCAGCAGCTGCAGCTCCACCTGCAA
AACCTGCTCAACCTGCTGCTGTTgtaagggaactttcaaaagctTTTGTA
TTGCCAGATCTTAAAGTAGAAGCTTAAGAAAAGCTTTACTCATAGTATAA
GACTAAATCATAGAATTAACTCCAAAAAATATTAACTTTGAAATAAGCCA
AAAGTGGCTGAAATTTGACATAGAGGTTTCTTATTGGTCCAAGAACCCCC
CAAAATAACCTGCAAccaatttgaaaagttttggacCCTTTTTGGGGCAT
TTTATGATGATGTGAATTTTCAGTACAAACCCCTGCAAACAAGATATGTT
AAAAACGCATCAATTAAATAAGTTTTAACAGTTTATCTAAAAAGATCATG
TGAAGAGTACTTTAGACGTACAAACTTCCgtgaggacgaaaaatcgcgaa
attcacgacatttactttcgcgaatttaacggaaaaatatttttcgcgag
cataaactttcgcaaatcaagacgtaaaattgagaattttcacatgaaaa
aatgggtTGAAGGGACAAATACTGCTtagattggcttgaaacatttgtcc
tttgacttattagtcttttagcaggctaaaatgtgccataaaagttacat
tttattcaaagttttaagttttacagattttgtcaaattttttcgcgagc
ataaacttttgcgaatagCCCTTCCtgacatttacttttgcgaaagggct
aaaattcgcgaaaatcgcgaaagtttctgctcacgaaagtttgtacgccc
tAAAGTAACCAAAGTGGTGttgctttttaaattttgtcaattaGTCCCTT
GCCTGATCAACTTTTTTAACACTTCATATTTTAGCCTCCAACTACCCAAA
TGTCTGGAATGAACATCTCCCAGAAATATGGTCATGGTACTATTGTTCCT
AAATCACCATTTGATGCTGAAGCAGATTGTGAACTTTTGAGAAAGGCTAT
GCGCGGAGCTGGTAAGAATCTTCTAACTTTTACTTTATtcatctttgttc
aaaaaagaaCCAGTTAGGATTTACTGgttcaattttttacaaaaataatt
ttgttttgactCCCTGCAAAAGTAATTGCATGAATTGTCTCCAATcgtaa
aaatattataatgttGGCTACCATTGTTATTACTACTATTATTAAAATTT
CTCAGGAACTGATGAGCAACAACTGATTGACATTTTGGCTAACAGATCTA
ATGCACAAAGAGTTGAAGTTCGATTACGTTACAAAACCATGTTCGGAAAA
GTAAGTCCTGTAGACACCCTCAAACTACTTGTACTGGGATGTATTCGAGA
GCACATATTGTATTTCATTACCCCTGTTTTACCTGTTACCATTACCTGAA
AGGATTTGATAGTAAGTATCGGAGTTATATTCCAAAATGATCATATCTTT
TGGGAGGGGGCTCTTAGCAAaccatttataaaaaaaaaaaacataaactt
aTAAGTTCTTGGGACCTGGTAAAccaattattttaatttattttctttct
aattTTTAACTGTAAAGGATTTGATGAATGACTTGAAATCAGAACTGAGT
GGAAACTTGGAAGAAACTTTATTGGCATTGATGGAACCGTCTGTCTTGTT
TGATGCTAAATGTTTGAGAAGAGCTATGCGAGTAAGAAATATATCCTCTA
Tttatttaataaatttttttcatcagtcgttaaaataaaaaatcatcatc
ttccAAGTTAGACATTGAAATATCAGGTCTTTCAATTGAAAATCATTAAA
CAAATCAAAAGAGAATCACAATCTTGacattttcattctttgattatCAG
GGTGCTGGCACTGATGAGGAAACATTAATTGATATCTTATGTTCGCGATC
CAACGCTGTAAGTATCTTACATACTTTAAAGGaggaaattttgggaattt
aatttggtggatggccaaaaaagagggaatttaatttggcttttaacttg
aaaaatttaatttggcaggaatttaatttggcgaatgaagaacatttttg
tccAAaaaacgcctttaaaaaaggaaaaaatctgttttaaagcctgaaat
agcgcacatttgggggaataaatagagcaatttaaatttggcaggaattt
aatttggtggataacggaaaaaaatttaatttggcaggaacttaatttgg
cggattttcaCCAAGGTTCTTTTAGTCTGTACCAAGGCCTGAAatctaca
gctaatttcaaaaatcattgcCTCAGAGGTGTTACTATTTTGTAACAGAA
TGAAATTTATGAAATCTAGAACCAACAACATTGCATTTTATTCTGTTTTA
TTCTTTCTTTCTAGGAACTTAACAGGATCAAGGAAGAATACAGAACATGT
AATGATTAAttctttgatgtttttcattttttaagaaaataaagattatT
TATATTTAGCATTCTCTGAAATCAAATCTGTATTTTTGACATAAATCTTG
GCTTCTTGCAATGTTGACATGAATTTTTCTACATACTTAGGTCATAAAAA
CGTTTGTAATTCTTTTCATCAACGAATCACGCTGTAATGTACACAGTTTC
AAACAGACATAATAAACATCATCTGTTTTAAGATGTTGTTAAGCAGTTGG
TTTAAAAGCAATTTCCATAGTCCTGAATATTCTGCAAGTTTATGTACTAC
CTAAAGCCATTAAAATCTCGTTAAAATCCATTCAAAATTACATCaatatt
ctttttttccagattacaaaagagatttggaaaaagatTGTGTCAGTGAG
ACAAGTGGACATTTCAAACGTCTCTTGGTCTCCATGTGTCAGGTAAACCA
ATCTAAcgaaattatattattttactCCAGTGAAACCCTATCAAATTGAT
TCGATCAAATGCTAACCTTAGGATGCCTAACTAATGTGATCAACAAAGTA
AGATTTATTAGATagaaatttaaattctttttattcCACAGGCCAACCGA
GATGAATCAACCACAGTTGATATGGCAAAAGCACAGAAAGAAGCACAGGA
CCTCTTCCAGGTTTGctttttttcgttttacaaCATTTTAACTTTATAAC
TTCAACATCAAGTCAAGCCTAGGTACCAGgagaaattttataattttatt
tcttacaTGTGCAACATAACAACAGAGAATATAAATAATTTTATCGCAAT
ACCAACTCGTTAAACTTCTTAACCTTTGTTTCTTTTCGGATCACAGGCTG
GAGAGAAGAAGTGGGGTACAGACGAATCAAGATTCAATGTCATCCTTGCC
TCACGCAGTTTCAACCAACTTAAAGCTATCTTTGATGAATATGTCAAGGT
AACATTTGAGAAATGTTCTAGTATTATAATACAGTAAacttcaacatttt
ttaaagtttcaagaGGGATTTGGGTAAGAATTTAGTGTGCgaataaaaga
aaatatactTTTATAAATCGACTTTGACATTCTCAGCTTCATTAGAAAGC
AATACAGATAATTTTTGGAAACTCGTAAGCAATAAGTAATTTAAGAAGTC
TTTGTCTGCTTTGTAGATCTCACAGAGGGATATTATGAATAGTATTGACC
GTGAAATGTCTGGTGATATAAAAGCTGGTATGAAATGTATTGGTAAGTAT
CCAGTATTTCAATTCTTTCTTGATTGCTTGGAATAACAGGACACCGTGTC
TGAGAttggtttcttttatttttgtccccaattgaaaagcatatttgaca
atttatttcaatttcaattccaaCTTCAACTTTCCTACTTCAtttttttA
GTACAATGCTCAAGAAACCCAGCAGTGTATTTTGCAGAACGCTTATGGAA
ATCTATGAAGGGAGCTGGAACTGATGATAGTTTGTTGATCCGTATTGTCG
TCTCAAGATCTGAGGTAAATCAATATAGGttaatcattttattatttgag
aCTTCTTTAACGATTCATGAACATGTCACAAGATTAGATCGACGTATAAA
ATTTGACACCCCTGCTCTAATATCCAAAGGTTTTTAGAAATCTTCAGAAA
CTTTAAAATCgtctatttttgtaaaattaatGTTTCCTTGAGCATTCATC
TTAAGGTTGTGTCAAAGACCATCAATTTATCATTCTCTTTCATTTAAATT
CAGATCGATTTGAAGGAGATCAAGACAGAGTTTTTGAACCGTTATCACAA
GACATTGTACAAGATGATTGAGGGTGATTGCTCTGGCGATTACAAGAAAT
TATTGTTGGCTGTTGTCAAACCAGAAATCTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000299_pilon:278639..283970+ >XLOC_034938 ID=XLOC_034938|Name=XLOC_034938|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3294bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000299_pilon:278639..283970+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCATACCCACCACCTGGACCTGGATACCCTGGCTATGGAGGACCTCC
AGGTATGGCATACCCACCACCTGGACCTGGATACCCTGGCTATGGAGGAC
CTCCAGGTTACCCTTCTGGAGTTGGTGGACCTCCCGGTGGCCCAGGTTAT
CCAGGAGCAGCTCCCACTTACCCACCAGCTGGAACCGGTTACCCTCCTGC
TGGTCCTGGCTACCCACCAGCTGGAGCAGGCTACCCACCTGCAGGACCTG
GCTATCCAGCTGGACCACCTGCAGGTCAAATGCCTTATGGTGCACTACCC
TTCTGGAGTTGGTGGACCTCCCGGTGGCCCAGGTTATCCAGGAGCAGCTC
CCACTTACCCACCAGCTGGAACCGGTTACCCTCCTGCTGGTCCTGGCTAC
CCACCAGCTGGAGCAGGCTACCCACCTGCAGGACCTGGCTATCCAGCTGG
ACCACCTGCAGGTCAAATGCCTTATGGTGCACCTCCAGCAGGCCAACCCT
ATGGTGGCTACCCTCAACAGCCTCCAGCGCAACCAGGTTATGGTCAACCT
CCAGCTCCTGGATATGGTCAACCTCCAGCACCAGGGTACGGGCAGCCCCA
AGCACCAGGATATGGTCAACCACCAGCACAACCTGGTTATGGGCAACCTC
CAGCCCAACATGGCTATAGCCAGCCTCCAGCTCAGCAAGGTTATGGTCAA
GCACCTCCCCAGCCTGGATATGGACAACAGCCAGCACCACAACCAGCTCC
AGCAGGCCAACCCTATGGTGGCTACCCTCAACAGCCTCCAGCGCAACCAG
GTTATGGTCAACCTCCAGCTCCTGGATATGGTCAACCTCCAGCACCAGGG
TACGGGCAGCCCCAAGCACCAGGATATGGTCAACCACCAGCACAACCTGG
TTATGGGCAACCTCCAGCCCAACATGGCTATAGCCAGCCTCCAGCTCAGC
AAGGTTATGGTCAAGCACCTCCCCAGCCTGGATATGGACAACAGCCAGCA
CCACAACCAGGCTATGGACAACAGCCACCACAGCAACAAGGTTATGGACA
ACAACCTGCTCCTGCAAAACCTGCACAACCTGCCAGGCCAGGTCAACCAG
CACAACCTCCAGCAGCTGCAGCTCCACCTGCAAAACCTGCTCAACCTGCT
GCTGTTGCTATGGACAACAGCCACCACAGCAACAAGGTTATGGACAACAA
CCTGCTCCTGCAAAACCTGCACAACCTGCCAGGCCAGGTCAACCAGCACA
ACCTCCAGCAGCTGCAGCTCCACCTGCAAAACCTGCTCAACCTGCTGCTG
TTCCTCCAACTACCCAAATGTCTGGAATGAACATCTCCCAGAAATATGGT
CATGGTACTATTGTTCCTAAATCACCATTTGATGCTGAAGCAGATTGTGA
ACTTTTGAGAAAGGCTATGCGCGGAGCTGCCTCCAACTACCCAAATGTCT
GGAATGAACATCTCCCAGAAATATGGTCATGGTACTATTGTTCCTAAATC
ACCATTTGATGCTGAAGCAGATTGTGAACTTTTGAGAAAGGCTATGCGCG
GAGCTGGAACTGATGAGCAACAACTGATTGACATTTTGGCTAACAGATCT
AATGCACAAAGAGTTGAAGTTCGATTACGTTACAAAACCATGTTCGGAAA
AGAACTGATGAGCAACAACTGATTGACATTTTGGCTAACAGATCTAATGC
ACAAAGAGTTGAAGTTCGATTACGTTACAAAACCATGTTCGGAAAAGATT
TGATGAATGACTTGAAATCAGAACTGAGTGGAAACTTGGAAGAAACTTTA
TTGGCATTGATGGAACCGTCTGTCTTGTTTGATGCTAAATGTTTGAGAAG
AGCTATGCGAGATTTGATGAATGACTTGAAATCAGAACTGAGTGGAAACT
TGGAAGAAACTTTATTGGCATTGATGGAACCGTCTGTCTTGTTTGATGCT
AAATGTTTGAGAAGAGCTATGCGAGGTGCTGGCACTGATGAGGAAACATT
AATTGATATCTTATGTTCGCGATCCAACGCTGGTGCTGGCACTGATGAGG
AAACATTAATTGATATCTTATGTTCGCGATCCAACGCTGAACTTAACAGG
ATCAAGGAAGAATACAGAACATGAACTTAACAGGATCAAGGAAGAATACA
GAACATattacaaaagagatttggaaaaagatTGTGTCAGTGAGACAAGT
GGACATTTCAAACGTCTCTTGGTCTCCATGTGTCAGattacaaaagagat
ttggaaaaagatTGTGTCAGTGAGACAAGTGGACATTTCAAACGTCTCTT
GGTCTCCATGTGTCAGGCCAACCGAGATGAATCAACCACAGTTGATATGG
CAAAAGCACAGAAAGAAGCACAGGACCTCTTCCAGGCCAACCGAGATGAA
TCAACCACAGTTGATATGGCAAAAGCACAGAAAGAAGCACAGGACCTCTT
CCAGGCTGGAGAGAAGAAGTGGGGTACAGACGAATCAAGATTCAATGTCA
TCCTTGCCTCACGCAGTTTCAACCAACTTAAAGCTATCTTTGATGAATAT
GTCAAGGCTGGAGAGAAGAAGTGGGGTACAGACGAATCAAGATTCAATGT
CATCCTTGCCTCACGCAGTTTCAACCAACTTAAAGCTATCTTTGATGAAT
ATGTCAAGATCTCACAGAGGGATATTATGAATAGTATTGACCGTGAAATG
TCTGGTGATATAAAAGCTGGTATGAAATGTATTGATCTCACAGAGGGATA
TTATGAATAGTATTGACCGTGAAATGTCTGGTGATATAAAAGCTGGTATG
AAATGTATTGTACAATGCTCAAGAAACCCAGCAGTGTATTTTGCAGAACG
CTTATGGAAATCTATGAAGGGAGCTGGAACTGATGATAGTTTGTTGATCC
GTATTGTCGTCTCAAGATCTGAGTACAATGCTCAAGAAACCCAGCAGTGT
ATTTTGCAGAACGCTTATGGAAATCTATGAAGGGAGCTGGAACTGATGAT
AGTTTGTTGATCCGTATTGTCGTCTCAAGATCTGAGATCGATTTGAAGGA
GATCAAGACAGAGTTTTTGAACCGTTATCACAAGACATTGTACAAGATGA
TTGAGGGTGATTGCTCTGGCGATTACAAGAAATTATTGTTGGCTGTTGTC
AAACCAGAAATCTAAATCGATTTGAAGGAGATCAAGACAGAGTTTTTGAA
CCGTTATCACAAGACATTGTACAAGATGATTGAGGGTGATTGCTCTGGCG
ATTACAAGAAATTATTGTTGGCTGTTGTCAAACCAGAAATCTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000299_pilon | genome | sc0000299_pilon:278639..283970 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1519-1647:5204 |
| Aaloc | 1408-1518:4854 |
| Aaloc | 1330-1404:4617 |
| Aaloc | 1228-1329:4297 |
| Aaloc | 1159-1227:4042 |
| Aaloc | 1081-1158:3815 |
| Aaloc | 1045-1077:3415 |
| Aaloc | 988-1044:2901 |
| Aaloc | 874-987:2618 |
| Aaloc | 781-873:2258 |
| Aaloc | 652-777:1935 |
| Aaloc | 508-651:980 |
| Aaloc | 244-504:686 |
| Aaloc | 55-240:327 |
| Aaloc | 1-54:1 |
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