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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000299_pilon:378765..384729+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034933 ID=XLOC_034933|Name=XLOC_034933|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5965bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000299_pilon:378765..384729+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGGTGTTCCAGCAGGTTTTGAAGATGATGATTCTGATGGTGATTT
TGGTGCTTATGATTATAATGAAGAAGATTATCAAAATGATCTCAATAATG
ACCCTTCTTCTCAAAGTACACAGCAACAAATCTATGATGAAAATCCACCA
AAACATTCGTAAGTTTGTCATGACTTTcatcctacacgttttttttttta
agaaacacacttttaagaaacatgaggctcagaatgcctaaaaactaaga
aacatctaagaaacatgctgaggctgagaatgagaaaataactatTTCAA
TtcggtttttcttaagaaccttccaattcAGCCTTcaatgaggctgatta
tgtcaaaaagtttagaaacatgtaagaaacatttaaggctcaaaaggccg
atttcttaagaaacattgaggctgcttggtaaaactagtttcttaaaaaa
aaaacgtgtattgcatcaaggtttatttactttaaaaaatattactactG
GAAAGTCTGAATTTCTTGACTCTTAACCAAACATCCTTGGCATGTCCGTA
ACTCTTACCTTTAACAGATAAAtttgatgaatgaaatttttttctagcaG
CATCCTATAACAATAAATTtaatagcaatattttttgttccctAGAAGGT
CGTTTTCttattaacaaaacaaaaaaatagtcGATACAGTAGCTCTTCTT
ATattaagtaatttttgtttatcaaTACAAATctcaattaaaagaaaatt
tttaggacTTTAGTAACATTGTTTACTAAAGATTTTGTGCAATAATGAAT
TACTTTTAGTGTGTTTAATCAATTCAAAGCTGCACCGCAACATCTTACTG
ATGAGTTGAGTCTTGACagtgaaaacattcgaatcgcaaTATCAGAGGGA
AATGTTGAGTATCTCAAATCTGCTCTGGAAAAAGGTAGGTCAAAGTAAAA
AGCAATTATTTCATTTAAGATAGGTTTTGCAGTTCTGCATTGAATAATGT
GAAAGAAGTCATTTTCGTAGGAATTCTTGTTCTCGAAAATGATTTGAAAG
ACTTTACCATGAAGACGAGCTCCACAACTATGATAAGTTCTTCAAAACAC
ACGCTAGTGAAAATTGAAGAACTTAGGCAAAAATTTCTAGGAATTGGAGC
AGCAAAGCACAAATTTTCAATGAATATAACCATAATATACTTTTCCATTT
TACCTGTCATTGTGTCAATATTATCTCTAAAGATTGTCAGACTATACTAT
GTAATCTTTAGGGTTCAAACCTGATACAACACTAAGATCTGGATGGCCTG
CATTGATGTATGCATCAAGCTATGGCATGGTGGATATCATTGAGTTATTA
CTCTCAAATAATGTGCCAGTGAATCAAAAATCAGGTACGACTACCGTTTT
GATTTTCTGTATAATGTATTAATAAGGAATAgaacaaataatttctttaa
gaAGGCTTAAAAGGTTATTATTTGCTAAGAATGTTTAGAAAGAGAATGGA
ACACTCAAAGTATAATTTAAGACGAGTGTAATGATCTCCTATTCTGATTT
CAGATTCTTTAACAACACTGATGGTTGTAACACAGTCGGCCTCCACTAGT
GGAGAAGACAATGTTGTCACTTGTGCTGAACTACTGATCAAGTCGGGCGC
CAATGTCAATGATCACGATAAGTAATCAATTATTAGGCTTatttttgata
agattttgaggctttctttaattttgtaaattatgatgattttttgcttt
tgttttcttCTGATATTCCGAACCTATAATAACAATATTTGtccgaaatg
aaaaaaatcacagaatCATATAATCTTTCAGACACATAATGACACCACTT
ATGTATGCAGCACAACAAGGACTTTCAAAGCTTGTCAAACTGTTGTGTGA
AAATAACGCAGCTGTGGATATGCAGGATGAAAGAGGTTGGACTGTAAGAA
CATAAAAatttgtattatttcttatttatttattttttgaattttcattt
gtatAAATACAACTGAATCTCAAAATGACATTATTTTATACAAGACAGGG
GAGGTTAGGCTTTGTTAGTTGTGTATAGTGAATTGTTTGGTCAAGCGAAA
TATTCTTTAAATTGGGGCTCTCAATGGAAACCTTTAGTTTGGGAAGAGCC
GTGCCTAGGTAGGTCGCGTCGCTTACATTAAGTCCCCTCCGGAATTAACT
TCATGTTCTGCTTCTTCCTTTGTTTCAGGCTTTGTGTTTCGCAGCTATCA
ATGGTTATAATCATGTGGTGAAAGTTTTGCTCGAGTCCAATGCTAACATA
CATTTAACTACTTCTGAAGGCCAATCACCTGCTGATCTTGCATTCTCCAA
TGGTTTCTCCATGGTAACACTCACTTATTACAACCTTGTTCCGTtctact
ttgaaataaaaataaaaggagGCAGTGTATCGCGGCTAAAATGTGTATAA
TCCACGAGAGAAgccaaaagttttgattttttttaagaaccgaTAAGAAG
TTCAAAGTATATGAGcgttttccaaaattttatttcCATTCATAATCATA
CATGTATAATGTAAAAGGATGCTTTACTCATTCAATTTGGAAATGATTCC
AGAAGATTACCTTATCAGGGCATCCCTTCAACGCCAGCACAAAAAACACC
GATGCCTAGTTCTAGTTTGTTTATCCTGATCAAGGCCataaataaactga
aacttGTAACAATTAGGAGGCCACTCGAacctcaaaaaaataaatattga
ctAATAACCCTTAGCTCTGTTTTAAGCAGGCTGGTGGCCACTGGTCTGAT
AATAGACTAACCAAGAGGTAACTGCGTGCTTCATTCATCTCTCATTCCAA
TATCCTTTTCTGTACAGTTAGCTGACTTACTTGAGAAGTACGATGGAAGT
AATGATTCTTTGGATAAAATACCTCAAATGTGGTGAGTAGAGTGCAATCA
TTTCCTTTAATCTGTAGCATTATCGGAGTACGTTTGTCAGAGCaagattt
gttttttgattCTACGTCAACTACACTTCTAAAAGGGTATTAAGATTAAG
ATTGTGTCATTGCGCTCGTGAATTACTGATTTTTTACCAACTGAGACGAA
ACAAGTCGAAATTGTGAAAAGTATGTAAGAACCATGAAGAACCATGAAGA
AGTacatttttgctttcttttagTTCTTCACTaaaaaaaGATGGGTCAGC
AAAGTAAGTGTTTTTACTTTCTGGAGAAagagtactttaggcgtacaaac
cttcgcgagcagaaactttcgcgaggacgaaaaagcgcgaaattcacgac
atttactttcgcgaatttaacggaaaaatgtttttcccgAGCATAAACcc
tcgcgaatcaagacgtaaaattgagaattttcacatgaaagaATGGCTTA
CAgaaacaaatacttcttggattggcttgaaacattttgtcctttgacaa
attattagtcttttagcaggctaaaaagtgtcATCAAAGCAGAtcaaagt
tacattttattcaaagtttgaagttttacagattttctattttatcaagt
atttttcgcgagcataaacttttgcgaatggcccttcctagaatttttta
agacatttactttcgcgaaaagggccaaaatcgcgaaagtttctgctcgc
gaaagtttgtacgcctaaagtaaggTGTTTGATGCAATTTTGTCAGGGAA
GAGTGATGGACTGGGGACTGGACTGAAGTTTTCATGTTGTGGCGTTTGAA
ACTTTCCATTTCAATGTCATagtcttttcacttttttctctttctagATA
CGTCAATTATGGGGACCTTGAATTATTTTTGTTCGGCCAAGAACTTGGAC
ACCTTGTGCCAGTGATGCAAGTTAGTTTAATCTTATATTCTTGTAAAGTC
AAGGTTTTAAGAATTCTCTTTGTAGAAAGTAttgtttaaattttgaattt
tgtcttGAAAAAGACGTTATCTTGTAAAGGGAAGTGATAAAAAAGACGGT
TAAGAATGATTCAATACGGAATACAGTTGTTCTTTCTTTCTTGAATCTCA
AATATTGTCTTGTTTTCGTTTTAGGATCAACATTTGAGTTTCTTACAACT
GCTGAAGCTGGATGAACAGGAATTGATTGaggtatatttaaaaaaaaggg
tttttaagttttgcaaAAGTTATTATAAGGTTGCATACTTTTTAATCTTC
ATAACCATAAAAGCCAAACTTGAATGGTTTGTTTGACTACTCCAAAAAGC
TATTACATTGCTAATCCAACTCCAACATCTTCCTACCTCTCgactaccat
tttgaatttgcaAAATCAACCTGTGTGCTGGGTTGCCATTATGGTTTACC
AAAACAAAAACCGAATGGTGCATCCTATTGGGTAAGTCTTTGGTTTATTT
TACCCCTCCATTTATAATTAATTATGGAAGCCAAAActattttctcttct
tttctcgGACAGGCTGGTGTTACTAAGCTTGGAGATCGGAAGAAATTGTT
TACAGCCCTTCAAAATGTTCGTACTAACGAATGGGATACGAGCAACTTGG
CAATGCAGTCCATGGCTAAATTAACGTAAGAAAACTCTATTCTCTTTAGT
GAAGAAAATTATGTTAATCAATTTCGTTGGACCTacctaattttttgttt
tatagatGGAATTATTAAGtttttttGAAGGGATAAATGATAGAGGGTTT
TTGCATGATCATGATGCGCAATTCAGCTGTTTTGAGAAAGATTTTATGAA
TATTTCTAGGACGTTGGAAACAGCAGCAGTTATTGCTAACATCACAAAGC
ATTTGAGTTGTATTGAAAGCTGTGTTACGTTTGCAAGAAAATCCATCGAT
AAAATGAAAGAGGATTTGAGTAATGTAAGTTACCATTAAACATATCCTAA
TGTACAGTGTTGCTCTATACTGGCTTGAAACAGGTAGAAGGGAATCATTC
TTGTATATTTGACACAACTTTATTACCCGTTCAATAGATGTGTATTTTAC
TTTAAATTCtgctttcatacaaaaattcaggtcattttagaaaattatta
aaaaagctAAATATGGCCCTTGCTTGCTTTTGCGAGCAGTTTGATAAAAA
TTATCGATGTTTTTGACAACAGCTAAATATTTTTATGCTTTTCTTCTTCA
AGGAAAATTCGACACTTCAGAAGACACTTCTCGAACAGTGTGAGGAAGCT
CGTCGTGTTTCGAATACATTGAATGACAAAGTCTATTCTCTACATGGTGA
AATTACTCAGGTATTTCGTTTTAACAAGTTTCAATTTCGACTTAAAATtc
attaaaactatttttgacatattcattaacatataaacgactggacatct
acaATCGTGGTGAAAATTCATCGGACAACAAGTTCAAACATCCCCCTATC
CCCATGGTAATGTTGGAGACCGCTGGAGGTCAAACACCCACCCAATCAAC
ACTACTCTGGGGCCTGGGGGTTCCAGACAACAATTGGAAGGTTGTCCAAT
ACATTTTTTACCTTGATTGTATCTTTTattctctttgaagcgagctatTT
TAAATAGCAAACAAAACTTGTCgatttttccttaaatttcgcatttaaaa
agttttgagacAGCTTGAAAATTACttgtatttcacaaaaaaagctacCC
AAACTTTCTCATAAGTTTGCAAgagattttatcaacattttatgACGTTC
AACTGCAGAATCTCTACTGTGTGTATAATTATCCTTCATAGGTCATAACA
AGTTATTTATTAATTTCTTAGACTCAATTCTTATCATTTTTTAGGTATTA
CCAAAACATTTTAAGCCAGAGGTAGACAACATCACATCGCAcaaaaacca
aagtaaaaacaaattgcaaaagagctctactaagaaaaagTTGATCGGTT
TTCTTGGATTTACACTGCTTGGAATTGGAGTCGTCGGCGCCTATAAGTGG
GTGGACAAAAGGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000299_pilon:378765..384729+ >XLOC_034933 ID=XLOC_034933|Name=XLOC_034933|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3006bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000299_pilon:378765..384729+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGGTGTTCCAGCAGGTTTTGAAGATGATGATTCTGATGGTGATTT
TGGTGCTTATGATTATAATGAAGAAGATTATCAAAATGATCTCAATAATG
ACCCTTCTTCTCAAAGTACACAGCAACAAATCTATGATGAAAATCCACCA
AAACATTCATGGCAGGTGTTCCAGCAGGTTTTGAAGATGATGATTCTGAT
GGTGATTTTGGTGCTTATGATTATAATGAAGAAGATTATCAAAATGATCT
CAATAATGACCCTTCTTCTCAAAGTACACAGCAACAAATCTATGATGAAA
ATCCACCAAAACATTCTGTGTTTAATCAATTCAAAGCTGCACCGCAACAT
CTTACTGATGAGTTGAGTCTTGACagtgaaaacattcgaatcgcaaTATC
AGAGGGAAATGTTGAGTATCTCAAATCTGCTCTGGAAAAAGTGTGTTTAA
TCAATTCAAAGCTGCACCGCAACATCTTACTGATGAGTTGAGTCTTGACa
gtgaaaacattcgaatcgcaaTATCAGAGGGAAATGTTGAGTATCTCAAA
TCTGCTCTGGAAAAAGGGTTCAAACCTGATACAACACTAAGATCTGGATG
GCCTGCATTGATGTATGCATCAAGCTATGGCATGGTGGATATCATTGAGT
TATTACTCTCAAATAATGTGCCAGTGAATCAAAAATCAGGGTTCAAACCT
GATACAACACTAAGATCTGGATGGCCTGCATTGATGTATGCATCAAGCTA
TGGCATGGTGGATATCATTGAGTTATTACTCTCAAATAATGTGCCAGTGA
ATCAAAAATCAGATTCTTTAACAACACTGATGGTTGTAACACAGTCGGCC
TCCACTAGTGGAGAAGACAATGTTGTCACTTGTGCTGAACTACTGATCAA
GTCGGGCGCCAATGTCAATGATCACGATAAATTCTTTAACAACACTGATG
GTTGTAACACAGTCGGCCTCCACTAGTGGAGAAGACAATGTTGTCACTTG
TGCTGAACTACTGATCAAGTCGGGCGCCAATGTCAATGATCACGATAAAC
ACATAATGACACCACTTATGTATGCAGCACAACAAGGACTTTCAAAGCTT
GTCAAACTGTTGTGTGAAAATAACGCAGCTGTGGATATGCAGGATGAAAG
AGGTTGGACTACACATAATGACACCACTTATGTATGCAGCACAACAAGGA
CTTTCAAAGCTTGTCAAACTGTTGTGTGAAAATAACGCAGCTGTGGATAT
GCAGGATGAAAGAGGTTGGACTGCTTTGTGTTTCGCAGCTATCAATGGTT
ATAATCATGTGGTGAAAGTTTTGCTCGAGTCCAATGCTAACATACATTTA
ACTACTTCTGAAGGCCAATCACCTGCTGATCTTGCATTCTCCAATGGTTT
CTCCATGGCTTTGTGTTTCGCAGCTATCAATGGTTATAATCATGTGGTGA
AAGTTTTGCTCGAGTCCAATGCTAACATACATTTAACTACTTCTGAAGGC
CAATCACCTGCTGATCTTGCATTCTCCAATGGTTTCTCCATGTTAGCTGA
CTTACTTGAGAAGTACGATGGAAGTAATGATTCTTTGGATAAAATACCTC
AAATGTGTTAGCTGACTTACTTGAGAAGTACGATGGAAGTAATGATTCTT
TGGATAAAATACCTCAAATGTGTTCTTCACTaaaaaaaGATGGGTCAGCA
AATTCTTCACTaaaaaaaGATGGGTCAGCAAAATACGTCAATTATGGGGA
CCTTGAATTATTTTTGTTCGGCCAAGAACTTGGACACCTTGTGCCAGTGA
TGCAAATACGTCAATTATGGGGACCTTGAATTATTTTTGTTCGGCCAAGA
ACTTGGACACCTTGTGCCAGTGATGCAAGATCAACATTTGAGTTTCTTAC
AACTGCTGAAGCTGGATGAACAGGAATTGATTGagGATCAACATTTGAGT
TTCTTACAACTGCTGAAGCTGGATGAACAGGAATTGATTGagGCTGGTGT
TACTAAGCTTGGAGATCGGAAGAAATTGTTTACAGCCCTTCAAAATGTTC
GTACTAACGAATGGGATACGAGCAACTTGGCAATGCAGTCCATGGCTAAA
TTAACGCTGGTGTTACTAAGCTTGGAGATCGGAAGAAATTGTTTACAGCC
CTTCAAAATGTTCGTACTAACGAATGGGATACGAGCAACTTGGCAATGCA
GTCCATGGCTAAATTAACGACGTTGGAAACAGCAGCAGTTATTGCTAACA
TCACAAAGCATTTGAGTTGTATTGAAAGCTGTGTTACGTTTGCAAGAAAA
TCCATCGATAAAATGAAAGAGGATTTGAGTAATGACGTTGGAAACAGCAG
CAGTTATTGCTAACATCACAAAGCATTTGAGTTGTATTGAAAGCTGTGTT
ACGTTTGCAAGAAAATCCATCGATAAAATGAAAGAGGATTTGAGTAATGA
AAATTCGACACTTCAGAAGACACTTCTCGAACAGTGTGAGGAAGCTCGTC
GTGTTTCGAATACATTGAATGACAAAGTCTATTCTCTACATGGTGAAATT
ACTCAGGAAAATTCGACACTTCAGAAGACACTTCTCGAACAGTGTGAGGA
AGCTCGTCGTGTTTCGAATACATTGAATGACAAAGTCTATTCTCTACATG
GTGAAATTACTCAGGTATTACCAAAACATTTTAAGCCAGAGGTAGACAAC
ATCACATCGCAcaaaaaccaaagtaaaaacaaattgcaaaagagctctac
taagaaaaagTTGATCGGTTTTCTTGGATTTACACTGCTTGGAATTGGAG
TCGTCGGCGCCTATAAGTGGGTGGACAAAAGGTGAGTATTACCAAAACAT
TTTAAGCCAGAGGTAGACAACATCACATCGCAcaaaaaccaaagtaaaaa
caaattgcaaaagagctctactaagaaaaagTTGATCGGTTTTCTTGGAT
TTACACTGCTTGGAATTGGAGTCGTCGGCGCCTATAAGTGGGTGGACAAA
AGGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000299_pilon | genome | sc0000299_pilon:378765..384729 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1333-1503:5795 |
| Aaloc | 1225-1332:5153 |
| Aaloc | 1111-1224:4761 |
| Aaloc | 997-1107:4463 |
| Aaloc | 940-996:4075 |
| Aaloc | 868-939:3799 |
| Aaloc | 838-864:3175 |
| Aaloc | 772-834:2868 |
| Aaloc | 637-771:2229 |
| Aaloc | 526-636:1833 |
| Aaloc | 409-522:1556 |
| Aaloc | 286-405:1264 |
| Aaloc | 160-282:811 |
| Aaloc | 1-156:1 |
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