XLOC_034853 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_034853
Unique NameXLOC_034853
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000102_pilon:671783..684893-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034853 ID=XLOC_034853|Name=XLOC_034853|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13111bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:671783..684893- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACTGGGGATAAAGCCTAAAATACCTCAATTTCACCCTTTTGATAAGAAC AGGATAAGAACAATTTGAGGTTCAAAATGTCAAAAAAATGATAGCCTCGA AGCCTTGTCAAAAATCTACTAGTTCTTATAAAAATAGTTATCATGTTTTT AATAACAAAACACAGTCTAAACAAACTAATCTAATTACCTCCACCAACCA AGAAGTGAAAGTAGTGATAACAATTTATAGAAACTAATAATACTACCTTC TCAAAATAGATACAGTAAAAGCTTTATGCATGTTTCAAACTAATCAAAAT CTTGATAATAATGTCATGCAGAAAACAAAAATTTAAAAATGGTTTTGTAT TATTTTCCTTTTCCTTTATTAGGTAACAGAAGCAGGAGGCATGAACATTT TCGTTCATTGGATTAATGACAATGGAGGTGTGTGGTTTTAGACTATAGAA TCAAAACTAAGATCATTCATTCTCTGAATAGCAATAGCCGAGCGGTCAAG GTGCCATCAATCAAAATTAGGGGCTCTCCTCGCTCCTTCCAATGTTTCGT TCTGTTCATAGAAAACGGAACCCGTGTGATCCGTGGACCCTGTAAAAACA ATTGAAAGATTGTCTAAAAGTCCTAAATTTCTGGGTTATCCACGTTAAAC ATCGACTCTGCCTATCTACCCTGATTCGCACATTAGTGAGGTTAAGTAAA TCGGTAAAATCACGACGACGAACGAAAATTTAACAGGCTAGTGAGTTTCA ACCAATCAAATTTCGTATTTTCATTAGCCTTATACATTTTTCGTCCGTCG TCGTGATTATCCCTGTATGCTAAACCTCAGTATTATCGGGGATTCTGGAT GTGCACGCATCAGGCTACTCTAGAAGCGTAGAAAACAGATTAGACAAGGG TCTATATAGTGATTTTAATCCATCACGGTGATTACAAGCCATACGAATTG GTTTCACGAAAAGAAAATTACGTATCATTTTCATACATGATGAATTTTGA ATGAAATTGAATCGAATGATGAAACAAACAAATCAAACATACAAAGAAAA TGATTTTATAAAACACTGGCGTGCATTTAATACCGGTATTAACAATAAAT TCTGCACCAAAATATCATTCGTTGAAAAAGTACCGCATCATATATAAAAA GAATCCCTGTTGACACCCATCAACAACCAGAACTTTGCGTTACCTGTATT ACAGGAGAGCATTCTTCTTAGAACTAATTGGTTGAAGATATTATATTTTG TATCATTTCTATTTTTAGACGAAGAATTACTAACGGCACCATTGAACTCG TTGATTTTGCCAGGAATCACCCGCCAATCATGCATAGAGATTGCTAAAGA ATGGGTAAAATTACATTTTATCTTCTGTTTTAAATTTTCTAGAGCTTGAC ATGTAGATTATGGAAGAAGCTGAAGTCTCTAATGTTTTGATTTTCAAAAA GATTTTCACTTACAGGTTCTGTACAGGGGTCTGATTAACTTATATATTTT AGGTGACCAGAAATGAGGCGTTTTCGTACCCTACATGGGTAAGCTTTAAG TTAAGACGGCCGACCTTCTACCCTGCCAACTTAGAAAGAAAGTTTGCAAA TAAATTCTTTGCTTGAAAAAGATTGAACGAAGTCATTGCATTGATGTCAA AAAAGATGCATTGACTTTAGACAGCCAATTTTTTTGCCCACTTAAATTCA TAATTTGAATAGGCAGCGCGAAAAATAGACCGTTTTAGAGCTAATTGAGT GAAATTCTTTTATCAGTAATTTAGTACTATAGTTCTGTCGATAGCAATAG ACCTTTTCATAAATTACGTCACGTTCTTCACTTGCCTTGTATTCAAAAAA TTACCATGGTGTAATAAAATCCGCTGGGAGTTAATCACCAATAATTGGCA ATAATTTCCAAACGAGGCGAGTGATGTTCGTAGCGTAATTTATGAAAAGG TCTATTGATGATAAAATTCTAGAATTCATTTTTTTTAGGGAAATGTTCTT GTTACGGAAAAAGAATTCACAATTCAAGAAGTCGTCAAAGCCAGTCATCA AAACAGGGTTAAAAACTTTTATTGTTAAACTCTGAAAATAATAACTATTT TGATTCAAACAAAACAGGCAAAAGATTGTGTAAACCAAGAAATTAAAGCG TAAAACACATTTTTCTTTTAACCATATTTCGATCTTTATAGATCTTTATG TAATTACTTATGTACTTATGTATATACCCAAAACATTTTATTACCCAGAG CATTTTAAAAATTATTCCAAAATTTCAGTGGACCACTTTGACTTTGTTCG CACGTGATGGTAAGCCATTCTATTGGTTGCATTCAAGTGTTACGTCACTT CTAACCAATAGAATGACTTCATTCTGTTTGGGAGCAAAACGGAACTATCA CGTGCGAACGTGGTCTTAAGTGAGGAATTTAGGACCGAATGAGACGCGAA CTCATCTCATAGTACTTATAGTAAATTTAATCATTATGCTAGAAACTCAT TCGAAAAAAATAATTTGGACTGTTTTACTCTAGTAAATTAAATAAAGGTA TCCTAACTTTTCATCTTCAGATCAAGCACATTTTTGCTTGTGGTACAGCA GCTGTGATATGTCCAGTCAATCGATTGGTGTACGAACCCCTTGATGGATC CAAAGAGGTTGGTTTAATGAATTATATACTTCGTTTAAAAGCTTCTTTTA CATGCGAGGCCGTAAACTTTTGAATTGAGATGAAAAAATATTTTGCATTT CTGATAATTGACTGAGGTATATTTTTCCAATGCCGATTGAGATCTTGTTA AGTGTTTGAATTGTTTGAATATTCTTTTTGGCAACTATAATTGCTCTTTT CCTAGATATCCAGAAAAATATTGAGGTTGGAATATCGGACATTTACGGCT TTTTTTCAAACTGAAAAAAAGTATCTACATCACCACTGACTGTGAATAGT TCAATTTATACTGAGAAGGAAAAATCGTCTGAGACGAGTAGTTTGTAAAA TGTGATCTGTGGAGGAGATCCTATTTATTGAAACATGAATGGAAAGTACA CATAATGTTCATTTTCTAAATTGCTCGTCTCAGACAAATTAGTCGTCTCA GTATAAATATAACTAATGCGCAGAGAGATAAAATAGCGATGATATTATTT GAATCATCTCCTCCTTATTCTACCGTCATATAATTAAATTAATTAAATTA AATTACCATACATAGGTGGTTTTAGACCATCTTCCTCTGATTGAAGAAAG TTTTTGGTCCCTTGAGGGTCAACTTGGAGTGGGTCAACTGTACTTTGAAA AATTCATAAATTTCTTTACATCCTGAGTTAGCGATCTACACTGATAGCGA AGTACAAGGAGCACCATCCCTGTACTTCGCTATCAGTGTAGATCGCTAAC CCAGTACAGTACAGTTGACTCAACCCTACTATAGAAAAAAATTGCAAGTG CTTTAAAAAAGAAATACTCTACTTACAATTTTGCCTAGAAATGATAACCT TTGCTATTAAATACTTTAATAATTCCATATAGAACAAAAGCAATGGTTTT GCATAAATGTAGTTTTAAATATAACCCTTTTTTTCAATAAGGATATTTAT GTTAACTATATCGCAACAAGGTCATATTTATCATCCATCTCTGAGAAGGA ACTTGTTTCGTGTAATTTCAACGTATCATTTTGTTTCCCTAACAGTCTAT CCAAAATTGCTTTTGGATGAGTATTTTCTCTCAGTGTACGTCGACTTCTC ATGAACTTTAAAACATCATAAAACAAACCCAGGGAAACTAAAACACCTAC CATACCAACAAACACCTTTACAGAGATGTTATTTTCGAATAGCTCTCCAA CCGTTCCGATATAGATGGTCTCCATATGACAATGTCTTTCATACTTCGTC TGCATGTAATCATAAATCTCCTCTCGATTCTTATGCATGCATCTGAGCAC TTTGATTAACTCTTGACTAGGCTTACTGCTCATGGTACATCGAATGAAAA GCTGTGCTGGTAATGTTTGAACAATATGTAAAGGTGGACTTTGACCATCG TGACCGTGGATCTCCTCTTGGTACCACGCAGCAATATCAGCGCTGATCAT CGCTCCAAACACTTTCTCTTCTCGCACTAAGTTCAATACTTCTTCGTAAG AGGGTGCGGGAACTATTTTGGCGGAATAATCTTTCGCCGCCACTTCTGCT TCGTACGAATCCTGTAAAATCATATTCGTGATATTCACCCACCTTTTCGA CCGTAGTCACGCAGTCCAGGCGCGTGTCACTTAATTATTTAATTAAAATC CTAAACTCCCTAATCTCGATTCAATCCTTTTTTGACACCTTTTTCTATTG TCTATAGGTGCGAAAAAAAGACTGGGAAGATTTTAGGGTCGTAAAAGGGA CAAAAAATTGCCCGCGCGGCAATTGCCGGCTACGGTCGAAAAGGTGTATG TATTAATGATGTAATGTTTCGTATGGAAGCATCCCAAAAAGACCAGGTGT TTGCCACTAATTTTAAATTTAAACAATAAAACTGATGGCAAACACCCAGG CTATATTTTAGGTGCTTCCGTATAAACATTACGTCGTGAAGGTCACCAAC TAGCAATGTAACACTTGGTTGATTTGACCTGACCTGATGCCGCAGGGCTT TTAGTTCCATATTTCTTAGTTAGCGATATTAAGTTGGGAGGCGGATCAAA GATAAAATTAGGAGGAAGATAGTCTTTTTCCCCTTTTTTCCTTTTCCGTT GGGGGTGTGTAGCTACAAGAAGAGGAGCCTTCAGCTCACCCGATGTGGTC GTAAACTAAGATATCAAAGAACTGACTAAGAATGAGGATTGGGAGAGCAG AGGCTTTTTAACTAGTATCGATAATTCTTTCATGGCGATTCAGGCCTCAA TTCAAATATTTTTAATTAGGCTCTAAGTGTTACTTTATTACCTGTAAAAC AGCCATAGATTGTCCGTAAACACCAAGGCTTTCAACACCGGACACCGCAT CTGTCATTGTGGCCGTGATCACACAAACCAATAATATTCCTACTATCAAC CAAAATAACGCTATAAAGCGGCCGAGTGGTGATTTGGGTGTGACGTCACC ATAACCAACGGTTGTCATAGAAACTACACTCCACCAGAATGTTGAACAAA TACCTAAGTGAAAAAATTGGGAATATTAGCCAAGATATTTGAGTTTAAAG ACTCAGCTAAAAAAATATCGTAGAATAAGAAAGATCATTGATCTTATAAA CCCGAATGTCTCTCCTATAAATCATACTTTTTTCAGTAAGTGCGTTTCAA TGCCCATCTTTCAAGCCTTATTTGAAAATATGAATCTGAATTTTGCTGAT TAGATTATGACGTTACCAGGAAATGACAGATTTTCCTCAATCGCAACCAA ATTTCAGCTTCATATGATTTATTTCAAGGTTTTGAGAATTTTCTTCCAAG CTGTATAAAGACGGAATTCTGCACGAATCAAAAATCATATTTTTAGTGTA GGCGAAAGAACTACCATCTTTTGGCACAGGGTTCCACTGCCACTTTTCTA GCAGAAAAAGACCAGGACTCTGGATATAGTGAAAAAATGAGCTTCGGAAA AATAAGCCATACATTTAGAAAAAAAAAACCTTTCCAAAATCATGCCGATA ATCCCGGAAATCTGGAAATTTTCTGGAAAGTTAAATGGATCTTAGTCTGC CAAATACAATGTTATGGTAAGCGACGATAAGTTCCTAAGCCTAATTAATA AAATAATACCAACCTAAAACAAACGATCGTTCAACATTCTCATTCCAAAT CCGTTCAACGAACCAGATGAGAATACTGAAAAAGATGGCCATAGGAATCA CAATGACAAAAATAATTTTAGTACTAGCTATTCCTCGTAAGATTTTATGT GGCAAATCGATCATTTTACGTGGGAGGATGACCACCATTTTGTTTGTTTT CATTAGGGAGAAGGATCGAAGTGTGTTTTCATTCTCCCATTCATCACCCA TCTCTTGCATCTGTGGCGAAAGAAAGATTTCACCTTCTTTGATCCCTGTC AGATAATCTTTGCCGTATGGGAACCCCTTCTTAATGTTTTGAATAAAGTC TTTCCTAGATTCGAATTTCTTCACAAAATCGATTATAGTGACGTTTGGGT TTGGATTACAAAAGGAGTTAGCTCTTGTGAATATCTTCGGAATGATTCCA TCGATTTCGCCACGGTCGTTTGTGAACATGTATGGTTTGACTTCCCAGAA TACACCTTTCATCAGTGATGATTTGGTGGTCGTAAGGTTTTCAGCTAGCG AAAGTGTGGTGGTCTTAGCGTTTTCAGCTAGTAATTGTGTGGCGCTCGTA GTGTTTTCAGCTTTTGATGACGTGGTGGTGTTCATAGTGTTTTCGGCTTG TGATGACGTGGTGGTCGTAGCGCTTTCAACCAGTAATGGTGTGGTGGTCG TAGCGTTTTCTGCTAGTAATGGTGTCGTGGTCGTAGCGTTTTCAGCTAGT GAAGGTGTGGTGGTTGTAGCGTTTTCTGCTTGTGATGGCGTGGTGGTCGT AGCGTTTTCTGCTAGTGAAGGTGTGGTGGTTGTAGCGTTTTCTGCTTGTG ATGGCGTGGTGGTCGTAGCGCTTACAGCTTGTTTTGATTTTAAAATCAAA 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TTCACAATTTTTCACGATTTTTGCCCTTTTTCGCGAAAGTTTCTGCCAAG TAAAAAATTGCATTAATTAAATTTGCGAAAGTTTTTTCGTTTTTTTGCTA TTTCATACATAATCACCATGGTAATTGTTTCAATACGAGGCAAGTGATGT TCGTGACGTAATTTATGAAAAGGTCTACTCTATTGTTTAAAAGTCCTAGA TTACTGAGCTATCCGCGTAAAATGTCGAACTCGTCACGATGTCAAAATGA GCAATTAACTCTATGTACCGGAGGTGGGTACAAGGGTTGGCAAATGAGGA GTGAGGGGGGTTTTACGAACCATAGAGGGACTACTTTAAATTTTTCTGAT TTTTGTAACCCTTAGAAAGACTTTGTAAGGTTAAAAAACCGAACCCTTAT TGTCAGCACATACCCAGTACCTCCTCCTCCCTTCACCAGGCTCTATGACT TCATGCTGGTTAATTTGACGAGAAAGAGATTACTTTCCTTTTTCTTCCTC TTCATTTTCCGTTCAGTTTATCAATACCCAAGTCGGCTGGCCGTGGCTCC GTACAAACTAACGAATAAGTCTCAGAATTTTGGGTTATCAACATAAAATC TAAACTCATCTCGATACCAAATTGAGTAAATTTCTGCCTTCATGTCGGTT AATTTGACGGGACAGAGATCCTGTATTTCTCTGAAAACCCAATTCAAAAT TTTCTTTTCATTTTTGTAGTTTGGTAAGAAGCCACACCCTTGGGTTTACA ATGTGAACTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000102_pilon:671783..684893-

>XLOC_034853 ID=XLOC_034853|Name=XLOC_034853|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2370bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102_pilon:671783..684893- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTACGTCTGCAAGCATATCGCAACTTTTCCAAACAAATAAGAAGATT
TGTCCAGCCAGCAGCCTCTTATGAAGAATTCAATGATATTAAGATGTTAC
GTCTGCAAGCATATCGCAACTTTTCCAAACAAATAAGAAGATTTGTCCAG
CCAGCAGCCTCTTATGAAGAATTCAATGATATTAAGAGTGAAAATCTTGA
AATCCACCATACAAAATATCCAAAAGAAAAGCCTGATCCTGAGAACTTAC
CCTTTGCTAAAATCATGTCTGATCATATGTTGGTGATTGAATGGTTTAAA
GGTTATGGTTGGAGTTCTCCTATTATCAAAACCCATGAGCCACTAATGTT
GCACCCTGGAGCAGGAGCTTTACAATATGGTAGTCAAAGTGAAAATCTTG
AAATCCACCATACAAAATATCCAAAAGAAAAGCCTGATCCTGAGAACTTA
CCCTTTGCTAAAATCATGTCTGATCATATGTTGGTGATTGAATGGTTTAA
AGGTTATGGTTGGAGTTCTCCTATTATCAAAACCCATGAGCCACTAATGT
TGCACCCTGGAGCAGGAGCTTTACAATATGGTAGTCAAATTTATGAAGGA
ATGAAAGCATATCATGGTGTTGATGGTCAGATACGGATGTTTCGTCCAGA
ATGTAACATGGATAGGTTTTGGAAATCAGCTCACAGGATGGCTTTACCAA
CGTTCAACCAAAAAGAATTGTTACAGTGTATTCACGCACTCGTCAATTTG
GAGAGAGACTGGGTTCCAAGACAAGAAGGGAAATCATTATACATTCGCCC
AACTTTGATAGGTTTGGATATTTATGAAGGAATGAAAGCATATCATGGTG
TTGATGGTCAGATACGGATGTTTCGTCCAGAATGTAACATGGATAGGTTT
TGGAAATCAGCTCACAGGATGGCTTTACCAACGTTCAACCAAAAAGAATT
GTTACAGTGTATTCACGCACTCGTCAATTTGGAGAGAGACTGGGTTCCAA
GACAAGAAGGGAAATCATTATACATTCGCCCAACTTTGATAGGTTTGGAT
CCTGCTTCAGACATTAATGATATCAAACGTGCCCTTTTGTTTGTAATCAC
CTCACCAAGCGGCCCTTACTTCCCTGGTGGTAAGATGCGACCTGTATCTT
TACTTGCGAACCCACAACATGTGCGATCATGGTATGGTGGTATTGGAGAG
GTCAAAGCTGGTGGCCTGCTTCAGACATTAATGATATCAAACGTGCCCTT
TTGTTTGTAATCACCTCACCAAGCGGCCCTTACTTCCCTGGTGGTAAGAT
GCGACCTGTATCTTTACTTGCGAACCCACAACATGTGCGATCATGGTATG
GTGGTATTGGAGAGGTCAAAGCTGGTGGAAACTATGGACCTACATTGTAT
TTACAAAGAGAAGCCATGAGTAAAGACTGTGATCAAGTGCTCTGGCTATA
TGAAGATCAGAAACTATGGACCTACATTGTATTTACAAAGAGAAGCCATG
AGTAAAGACTGTGATCAAGTGCTCTGGCTATATGAAGATCAGGTAACAGA
AGCAGGAGGCATGAACATTTTCGTTCATTGGATTAATGACAATGGAGGTA
ACAGAAGCAGGAGGCATGAACATTTTCGTTCATTGGATTAATGACAATGG
AGACGAAGAATTACTAACGGCACCATTGAACTCGTTGATTTTGCCAGGAA
TCACCCGCCAATCATGCATAGAGATTGCTAAAGAATGGACGAAGAATTAC
TAACGGCACCATTGAACTCGTTGATTTTGCCAGGAATCACCCGCCAATCA
TGCATAGAGATTGCTAAAGAATGGGGAAATGTTCTTGTTACGGAAAAAGA
ATTCACAATTCAAGAAGTCGTCAAAGCCAGTCATCAAAACAGGGGAAATG
TTCTTGTTACGGAAAAAGAATTCACAATTCAAGAAGTCGTCAAAGCCAGT
CATCAAAACAGGATCAAGCACATTTTTGCTTGTGGTACAGCAGCTGTGAT
ATGTCCAGTCAATCGATTGGTGTACGAACCCCTTGATGGATCCAAAGAGA
TCAAGCACATTTTTGCTTGTGGTACAGCAGCTGTGATATGTCCAGTCAAT
CGATTGGTGTACGAACCCCTTGATGGATCCAAAGAGGAGTTAACGATTCC
GTACGATATGACAGATGATTCGTTGATGATGAAACTTTACAATGAACTTT
TCAGTATACAGGAGTTAACGATTCCGTACGATATGACAGATGATTCGTTG
ATGATGAAACTTTACAATGAACTTTTCAGTATACAGTTTGGTAAGAAGCC
ACACCCTTGGGTTTACAATGTGAACTAATTTGGTAAGAAGCCACACCCTT
GGGTTTACAATGTGAACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_034853XLOC_034853-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000102_pilongenomesc0000102_pilon:671783..684893 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1144-1185:43
Aaloc1069-1143:977
Aaloc982-1068:5792
Aaloc913-981:6374
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Aaloc94-294:10073
Aaloc1-93:13112