|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000245_pilon:14839..23272- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033176 ID=XLOC_033176|Name=XLOC_033176|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8434bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000245_pilon:14839..23272- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAATATATTATGCTTTGGTAGCAAGAGGACCAATTATTTTGGTCGA
TTTTACAGAACATCATGGGAATTTTGAACAAATAACAACCAAAATATTAC
AAAGTATAGATACAAGTCAAGACTCGAAATGCTCTTACACTTCAGAAAGG
TAAGATTTTATGGATAAATGAAATGTAGCATAATTAGAAAAATCCCTGTC
TGCATCTGACAGGGTCCTTTAGCAAAATGTCACCCCCTCTTTACATTCTC
GAAAAACAGGCTTTTTTCATCCCTGAAAATTGACAAGCTTTAAAAATCAC
AAAATTTTAAGACGTGGTTTTAACAGTGTTAATTTTCAAACGCTATCTGA
CAGGGTCCTCTAGCAAAATGTCGTCCCTCTTTGCATGCTGATAATTTTTT
GTCATAAATAAATTATGTTCTTTAAAAATATCATTACAAAGTGTTACGTT
CATTGCAATTTTCTTTCAGCTATGTCTTCCATGTGATGATCAGCCAAGGA
CTTGTTTTTCTATGCATGGCAGATGAATCAATGGGCAAAACAATGCCATA
TGGTTATCTGACAGAGGTATTGTATTATTTGAATGCACAATTCGTGTTTA
GTTCGTTTTGCTCACTGAATACTTACTAGATTCACTCATTTTGAAATAGA
GTTATTGAACATTCTCAGGTGCCAAATAAAGTTAATTTAAAGGAAAAATT
ATCAAATGCGGGCCAAATTATCAGGGTTCCAAACTTTCTAACCTCAAAAA
GGCAATTTAAAGTATGTAGAAAATTTAGCCAAGATATATTTTTTTGATTC
TGATAATTTAAGAAATCCGAAAAAAAAACGAAAAAAGAGGTGAATGTTGA
TTTAAATTATCTCATTATCTTTCTAAGTAAGAGGTCGAAATATCTTTTTA
AAAAAATATTTATTCTCATTATCTTTTTACATACAGATCAAGAACAAGTT
CATGGGTGGTACACTACGTGAACGTGCTTTCCATTGTAATGCATACGAAT
TAAAACATGATTTTAGTCCAGTACTTATGCAGCAAATGGTAATACTGTTT
CCAAATTTCTCTTTGCATGAAATAAAAAACTCCTGTTAAAGTAGAGGCTA
CTATTTGTTCCTATACATTTTCGTGCTCTTTCAAATACACTCATTTTTTT
ATAAGCATACGGGAAAATAAGGTCGGGGCTCAATCTCGAATAATTTCCAC
CCTTACAGTGCATTTATCAAAAGTCCACCCTTACAGTGCATTTCTGCTAT
TTTGAAAACATACCTTTAACCGCTGCACATTCCCGTCGGTCAATTTGCCT
GACTGCCCCCCCCCCCGGGTATCTTTGTAATTTGGAGCAGCAGGCGAAAA
TCTTTGGTCTAAGAAAGCTCAAACAGCTTTAATGAAAGTAACCCTAGAAA
GGTCAGTTAGCGTCGTTTTAGAAAAGAAGCACAAATTTTTTTACATTTCA
GCTTGGAGATATACTTAGCATTATGCTTATTTTTTACCGAATTTGAGCCT
AAGTATATGCGTTTAAACGTTATGCTTATATATATAAAAAGAGTGTAGTA
GTAGTAAAATCTTTAAATACTGTTATACTGTTAAATACGGCTATCCATGA
CGTATTTCCATGAAAATGAGCATTCGAACGGTCGCACCATTCGAGTTCAA
AATCAAAAGGCTAGAGAAGAATCTCTTGAATCAAAAATTATTCCCACTTT
CCCATCTAAATGTATGACTCTTGTGGTATTTAGACAAAGGCTGGATTAAA
AGTAAAACTAATCATTAAGAAAAATAAAGAAAGCGCTATATTTAATTCGA
TATCCCAATTGCAGCACTAATCACACCTGTGGATAATTTCAATAATCATT
TCATGAGTCAAACTTCTTATCCATCCTAAAACAATTGAATATATTATAGA
GACGTTTCAACAAAGGTGACGTGGAAACAAACAGCAAAGTAAAGAACCTA
CAAAAAGATGTGGATACAGTCAAATCGGTCATGACAGAAAACATTGGTAA
GTGAGAGAATAGAGATGTTTATCCTTTTGTGTGTCTCCTTCTAAAGAGTT
GGTATTTGTAGCTAAAATATATTGCCTTAGAGCCTTATCACCTTCGCCAA
AATCCTTTTTTACTTCCTAATCAATTTGGTAATCTGTAGCCACACGATTG
GCTGTGAAAATAGCATGTCATAGATTCGATACGTTAAAGATAAATTGGTA
CTTGTATTTAAAAGCTTCTTGATGATTTCTATTTTCAAAGGTGAAAACTT
TTTCAGCTATGATTGTGATATAATAAGCAGATATTCAATGGGTAAAAGTT
GGTTATTGAGATTAATTCACCCGAGGTGATGTAATATTCAACGAGGCGAA
GCCGAGTTGAATATACATCACCGAGGGTGAATAAATCCAATAACCAACGA
AAACCTATTGAATATATGTTTTATTATATACCTAGAGGCAAAAATAAAAC
ATTAATTATGTCAATAGCTAAACGTTTCACTTAAAACACTCCTATAATCG
AACGTTCGAATGTTTTTCTTTCTTAATGATTTCCTTAATTACTTTAAGTC
ATAAAATTTGTTTATGAAATTGACAATAAATTTATTTTAATGAATTTCTT
TGATAACAACCAAAGCAACAAAAAACTCAAAATTTGAAAACAAAATTCTA
CCGTGGTATAATAGCCATGGTATATCAGGAATTATTCAATGGCTGTTTTT
GCCTACAGATATATAATAATATATTTTAATACGTACATATGAATTTGAAT
AAGTATTTCCGAATAAGAGAAGGTCATTAATGAGTAAAATTTGCGGAAAT
GGTGACACATGTACGTTGAAAGGCTCAAAGTTCCAGAAAATAGTTATACT
AATACTCTTTTGTTTTTGATGATTTGTGATTCTGACTTTGGAGGTCACCA
AGGTGTTGATGCTTCATCTTCTTTCGAACTCAAGAGTAAACCATAGAATT
TCGAATTGACATTTCTGTTGGGCTGACGCTATTGTTTCTTTTGAATAAGG
ATTTACGAATTTTGGTGAAACTGAACATGTAGATGATTGGGTTTGATATT
GTATGAACGGCATTCAAATAAATGTTTATTTTGCTGAATAACTCTTCTTG
ATCGCCTACTTTGAGTGGTATTAGGGAAGATACTATACATATGGGTGATA
AACAGACACAAGTCCAAAAATTCAAGTGTAAAACATCTTTTATGCTTCTC
TTCAACCCTTTCCAAAAATAAAGTTTTTCTGCTTCGATTCCGTTTGACTT
CATGGACTCTCGGAGTGCATTTTCACTTTTGTTACGCTCTTTTAAAGTGA
TTTTTCCCAAAATGAAAATGTTAATACACGTAGCGATACGTATGATATTA
CTAGTAATAATAAGATCATAGCTTGAATGATTCAATTTGTTCACTGTCGC
ATCACTGAAGAATTGGATACAACAAAACCCACTAGCCGTGATTACACCAA
ATGTGAATAAGACCAAATGAATTTTGTTGCGCGTTACAAGTCTGTAGTAT
GACAAACAATAGACGACGGCTAGGTAACGGTCTATAACCACCAAATTAGT
GACGTATAGGGACATAGTGTGTGTAAGCATCCCACCTGCTGATAATAATT
TGAACACTAATACGTTCTCCACATCCATGATCATCAGGGAGGCGAATACC
ACTACTTTGACAGTGAATATAGCATCAAATAGTGATAACAATTTGATTAA
ATGATATTGATTGTCTTGGAGTTTGGCACGGTAAATGACTAGCTGGAGAA
TTATATGCATGACCATAATGGCGCACTGTGACGCCAAAAGAATATCCCAT
CTTGGTGTTTGTTCGCCATAAGTTGGCGTTCTTGTTGTTGAATTCATTTA
CTTGGTTTTCTTCTTATTTTCTTCTTATTCTGTTAGCCATATATTCTGTA
AGGAAAAAAAATAACTTGTGTCATTATAATCACTGTAGTTTGAATGGAAT
TCTGTTCTGACATTAAAAACTATCCATTTCAATTGTATTTGAAACTAATC
AGATCTATATTATAATCAATAAGTCGGTTGTTATTCTCTTTGTAAACAGA
GAAAGAAATCATATTAGATTATTGTATCTCTCAAGTTGGGAATATCTCTG
TGTACGAGCTCATTCGAAATTGAAACTAGACAATTTGGAAGACTAGCTCC
CAGTGGTTTGCTAGGAGAGTAATCACCTCCAAAATAAACTAACAATTTTA
CTAAAATTTAAGTTAACTATAGTTAAAGAAATTAAAACTATCAAATTGTT
TGCAAGACGAATAAAAGCTGAAACATTCGAAAACTCAACTTGTATACTTT
TTCAACAGCCACTGAAAGCCATCATCGACGCCTTATGGTCACAATTCCAA
CTGTTTTAGAAACCTTCACCACAGAGCTTGTATTTTTAGTTTAAATCAGA
AAGTAGGTGTACTGATTATCGTTTCAGCCAGTTTCAGAAAAGGGCGAATG
TCAATGTTGTAAAATATTATTTTTATAATAGTTACACCTACCTTTGTGGA
CTCTAACTTTTTAATGTTCCAGTGCTCAGATTGTTAACTGTTCCTCACTA
CAAGATGTTTCAACTGCCAATTAAGTTGTAATTATACGGCTTAATTACTC
TTATTGTCCCTTAGGGGATTACCATAATTCTGCACTAATAAGCTCGGCTT
TATGACAATCAAACCGTTTGCCTTCCGAATTTTTGTCGATTCCACATTAC
ATAAATCTGCTGGGTGGCCGAACTCTCTTTATCAAGAATTTAATTGAAAG
GGTCGCTATGGCTTCACATGAGAACTGAGAAGGTTGTTTTCACAGAGTGA
AAAAAAATTATGGTGAACATGGCCTACCACTTCTTAATTGTAAGAGTGAA
GATATATGTTTAACCCCATCCCCCATTAATTAATGCTGGACACTAATGTA
AATTCGTTAATTAACCTCTCGACATGGTTGCCAGCTACTAAATGCAACTA
AAACTGAAGTATTGTTCCGTAATTCCTACTTATTGTTAAGTAGGAATATT
ACACATGCTTTTAAACTTTTTAAAAATCGATTATCATGGCCTGACTTTCT
CTTCCCATGTTAAATATTTGGGAGTTCTTCTCGGTGATTTTCTTTCGTGG
AATTACTATTTTGAACTACTGGCATCTAAGTTAAGTAGAGCAAATGGTAT
ACTAGCAAAACTAAGACACTTTATATCATTTAGGGGCGGTCCAAACCTAG
GGGGGGGGGCTTTTCCTGTACCACCCCTTAACTTTTGATCTAGTGGTTCT
TTTTGGATGAAATTGCCCAAAGTGAGCAAAAACCGAAAATTTCCTTTGTT
CTTATAAATAGCTATTCTATTCTAACAAAGGCTTTAGAAAAAAGTTGCCT
GAGTTTAATCTTCAATATAAAAAAGAACAAAGAAATTTTACGTTACAATA
GCTTCTTTTAATTGAAAATAAAGAAAAATTACACTGCAATGTTTTCTTTT
TAAACAAAAGAAAAGAAGGAGGTTTTTCGAATGTTTACAAAAATATAAAA
GTTAGAAAAAGATTCTTTTTCAAAACTATGATTTACTAATGATTATTTAC
TGACGATTACCTCGGAATCGTATGTTTTGTCGTGTAATTAACGATTAATC
ACTCGTAACAAAGGAGAAAATACCGTAATTACTATTTTCTCCTTTGTTAC
TCGTGATTAATCGTTAATTGCACTCCAAACCATACGATTACTAGTACAAA
TAGAAACCTGAAACTCTTGGCTTGGTCTAAAAAGCAGGGTAGCCATTAGG
CTACGTCATATCTTCCTTCGTTTCGAGCGTAAAACTCCTACTCTTCAAGA
GTACGGCCTAAAAGCCTGGATCTGTCTATTGTGTAGACTAGGTAGCCATG
TATTTCACGGACCAGAGCAAATACAATAAAAACTTTTAAAATGATAATCC
TCATTGAAGCCAGGGGGTAAAAATTTAAAAAATATTTTAATTATTTAATT
ATGATGCAGAAGATATTGAAAGATTTAATTCAACTCAGAGCTTATTTTCT
TCACTATTTGAACTCAGACCTTCTCATTACATTTTTGATTACCAAATGTA
ATTTCTTTTACAGGGTACCGGCTAGTTTTCTTTACTTTATTCCCATGTTC
TATGTTTTTGTATCCTTTCCTTAATGCAGGCGAATAAACTTCTTTCAATT
CAACCCCCCCTCCCAAACCTTATCTGGTAATTTTTCGATCACAAAAAAAA
AGGGTTTGGACTCTACTGCACGTTTAAAGCGTGCGAAAGAAGAGATTTGA
AAGATCAATACATGCGAGATAAACCTGCCTCCCTCTCTTACCAGATGTCT
TTTAATGGTGCTCAATTGAAACTAATTAAACAGTCAAAGCATATCCCTAT
TTCAAAATACTGCTTTTTGAATCTTTCAGTTATCAGAGCTAAAACCTTGT
ACCCTTTACTTTGGAAAGTCTTAAAAATGCTTCGAATTTTCTCGTGTCAA
GCTAGATATTATAACCTCCAACCTGTGGCAAAATCTTTACAAGTTTGTTT
GAGGCCAAGCCATTGGGCTCTTCCAGAAAAAAATCCGTTCATAGGGGATG
GAGGATGAATTGTCCAGGGGTCCCAAAAAAAAGTCTTAAAAATTGCATTG
TCCAGGGGGTAAATCTGCGATGTCCAGGGGTAAATTTTGGTGTTCAAGGG
GTAAAAAATTAAAATGTCCTGAGAGGTAATTCATTGAAAAAATAAGATAT
CCTCCACACCCAATGAACGCATTTTTTCTGGAAGAGCCCAATGTAAATTT
ATTTCTAAAATAACGCTTAGCTTAGAACCTTGGTTGCTTCAAATTCTAAA
AATAAAACAATTGGCCTTTTAAAGGTCTAAAGTCAGTTACACTCAATGAT
GCGCCTTGAAGACCACCTCTGTTGAAATGAAAGTGAAGAAGAATGAAGAG
GAAGAAATTTTTTCTTCCTATGTTCAAGTATTCCTGTTTGTTTTCTATTG
GAATGAGTTGCAATAAAATAATCCACCTAGGAGTAAAAAAACTCCCAACA
AGAAATTACGTTTATTTTGAACTTAATATAACTGATAACAGACATGGTTT
TATTTAAGGCTCTTTAATACCCTACTGCGATTTCTTTCGTAACACAGGTC
CTTATCTTTTGATATAGTTTAAATGGAAACCTCGAAAACTGGTGCGTTCA
CTTGAGATAAGGGAAGGCCGGAAATATTCGGGCTATTCCAGAAAACATTT
TGCCCCCTTTTATCGAGGTAGTCGATTTTTTGGAAGGTTAACCCTCTGAT
TTTCGGCTAACTTTCGAGGTTCATTTCTTGGATTTTAGTAGATCTTTGTC
TATTTTGAAGAGAACCTCTCCGCTGGTTTTCTCTTTTTCTGATGCTCTTA
AAATATTGCTTACTGAAAAAAAATTATTACACAGAGCTGTTCTATTGCAG
CAGCTACAGCCACTTAATTAAGTGGATAGATTTTACCGGGAATTAAATTT
GGCGAATTCGTCAAAAATCGCCAAATTAAATCCCTGCCAAAATTTCAAAA
CTCGGCCATAATCCACTAAAGGTATTTAAAAAGCCAAAACTTCAGTAAAA
TTTCACCCAGATTTACCGGTAAAGTGTCCGTGCAACTTAACAATTTCACT
GTGTGTTTTTTCCACTTAAAAGTCTAAGAAAAAACAGATTGTCCATGGTA
TTCAACTAGAATTCTTTTCTTTTTTGCGATTTCAGGGAAACTTCTTGAAC
GTGGTGAAAAGCTAGATGTGTTGGTTGACAAGACAGAAGATCTATCGAAA
TCGGTACGTCTCTTCTTAATTTCACCGGCGGCTCTGGACAATATTTCTTT
CCTCTCCTGATTGTTACTTACGAAATGGATAACTCGTTTGTGTCAAATCA
ATACCTCGGACTGCTTGTGTTACTGCTTGTATTAATCAACCACAACTTTT
TCCCCTACCTTATTCTTTTAAGTTTTTCAAAAATGGTTAAGACGAAATGG
AATTTTCTACACTGTTATTTTAGCCCCGCACTACTTACTGCGAACAACAG
GTGGGTAGAAATGAGTGAAATGGAGTGCACTCTGAGCAGTATAGGGAAAT
ATCATTTACGAGTTTCTTTCTGTCTTTCTTCAGTCGGAGTCGTTCGCTCG
TTCAGCAAAGAAAGTTCGGCGGAAGATGTGGTGGCAAAACAAAAAGATGT
GCTTGATCCTGTCCTGTGTTCTCTTTGTCATCCTCGCTATCATCACACTC
GTCATTCTCTATGAAGTGGGCGTCTTCTCACCTTCTAATTCATCATCAAG
TGGCGGAGGCGGTAAGACGACTTCTCCACCGACAACAACCACAACAACGA
TAACGACAAAAATAATGACGACCATTAAGACGACAATTCAAACAACTTTT
AAAACGACTGCTTCTACACCAGTTAAAAACGGGACGACTATTCTACCACC
GACAAACTCTACGACAACGCCATCAAAGATTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000245_pilon:14839..23272- >XLOC_033176 ID=XLOC_033176|Name=XLOC_033176|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1728bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000245_pilon:14839..23272- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCAATATATTATGCTTTGGTAGCAAGAGGACCAATTATTTTGGTCGA
TTTTACAGAACATCATGGGAATTTTGAACAAATAACAACCAAAATATTAC
AAAGTATAGATACAAGTCAAGACTCGAAATGCTCTTACACTTCAGAAAGA
TGTCAATATATTATGCTTTGGTAGCAAGAGGACCAATTATTTTGGTCGAT
TTTACAGAACATCATGGGAATTTTGAACAAATAACAACCAAAATATTACA
AAGTATAGATACAAGTCAAGACTCGAAATGCTCTTACACTTCAGAAAGCT
ATGTCTTCCATGTGATGATCAGCCAAGGACTTGTTTTTCTATGCATGGCA
GATGAATCAATGGGCAAAACAATGCCATATGGTTATCTGACAGAGCTATG
TCTTCCATGTGATGATCAGCCAAGGACTTGTTTTTCTATGCATGGCAGAT
GAATCAATGGGCAAAACAATGCCATATGGTTATCTGACAGAGATCAAGAA
CAAGTTCATGGGTGGTACACTACGTGAACGTGCTTTCCATTGTAATGCAT
ACGAATTAAAACATGATTTTAGTCCAGTACTTATGCAGCAAATGATCAAG
AACAAGTTCATGGGTGGTACACTACGTGAACGTGCTTTCCATTGTAATGC
ATACGAATTAAAACATGATTTTAGTCCAGTACTTATGCAGCAAATGAGAC
GTTTCAACAAAGGTGACGTGGAAACAAACAGCAAAGTAAAGAACCTACAA
AAAGATGTGGATACAGTCAAATCGGTCATGACAGAAAACATTGAGACGTT
TCAACAAAGGTGACGTGGAAACAAACAGCAAAGTAAAGAACCTACAAAAA
GATGTGGATACAGTCAAATCGGTCATGACAGAAAACATTGGGAAACTTCT
TGAACGTGGTGAAAAGCTAGATGTGTTGGTTGACAAGACAGAAGATCTAT
CGAAATCGGGAAACTTCTTGAACGTGGTGAAAAGCTAGATGTGTTGGTTG
ACAAGACAGAAGATCTATCGAAATCGTCGGAGTCGTTCGCTCGTTCAGCA
AAGAAAGTTCGGCGGAAGATGTGGTGGCAAAACAAAAAGATGTGCTTGAT
CCTGTCCTGTGTTCTCTTTGTCATCCTCGCTATCATCACACTCGTCATTC
TCTATGAAGTGGGCGTCTTCTCACCTTCTAATTCATCATCAAGTGGCGGA
GGCGGTAAGACGACTTCTCCACCGACAACAACCACAACAACGATAACGAC
AAAAATAATGACGACCATTAAGACGACAATTCAAACAACTTTTAAAACGA
CTGCTTCTACACCAGTTAAAAACGGGACGACTATTCTACCACCGACAAAC
TCTACGACAACGCCATCAAAGATTTAATCGGAGTCGTTCGCTCGTTCAGC
AAAGAAAGTTCGGCGGAAGATGTGGTGGCAAAACAAAAAGATGTGCTTGA
TCCTGTCCTGTGTTCTCTTTGTCATCCTCGCTATCATCACACTCGTCATT
CTCTATGAAGTGGGCGTCTTCTCACCTTCTAATTCATCATCAAGTGGCGG
AGGCGGTAAGACGACTTCTCCACCGACAACAACCACAACAACGATAACGA
CAAAAATAATGACGACCATTAAGACGACAATTCAAACAACTTTTAAAACG
ACTGCTTCTACACCAGTTAAAAACGGGACGACTATTCTACCACCGACAAA
CTCTACGACAACGCCATCAAAGATTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000245_pilon | genome | sc0000245_pilon:14839..23272 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 514-864:352 |
| Aaloc | 448-513:748 |
| Aaloc | 349-444:6536 |
| Aaloc | 247-348:7499 |
| Aaloc | 151-246:7965 |
| Aaloc | 1-147:8435 |
|
