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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000049_pilon:120973..125769- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033033 ID=XLOC_033033|Name=XLOC_033033|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4797bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:120973..125769- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATGGCTCAATAATCGAACCAACGCAAAGTTCGCCAAGAAATGCTGCTCT
GCATATCTTCAAATCAAACGAAACTTCAACTTCAAAATGGAGACTCGGCA
ATACGTTTTTCTATCGTCAAACAAACGATACAAGAATTTTAGAATCGATA
ACAGATTTCTTTAGAACGAACGCGTCTGTCGAGTTTAAGCCTAAAAGTGC
AGTTATTATCACAGCGGCGCCAGTGTTTTCAGACGTTTATCAGATAGTTT
TGGCGAGTAACGATTCAATGACATATGCTTTGATCAACTTCAATCATATT
GGAACAGACGATGCTGGCATGTAAGTGTAATACGCAGAGTTAATTACGAA
ATCGAAAATACAGTAGTTTCTTTAACTCAAGCCTCTATTACTCAAATGTA
TCCTCAACTCGAATAACTTTTATGGTCCCTTCAGTTAACAATGCCCTCTA
AACCTTACTCCATATTCCAAAATTTCCTTAACTCGAATAAATTTGTGTCA
TCCCCCGTGCGTGTTCGAGTAACGGAGACTCTATTGTACTTATTAGTGGA
ATTCAATTAACAATTCTAGAGCATTATTGCCATTTCTAATTCTGTTTTCA
GCCGATTTTTCGTTTTTTTTTCTCGCTTGTTGCAACATTGAATCAATTTA
TTTCACCCGCAGTTTAAAACACTGAATACGAAATATTACGATAAAGATTG
GGTGAAAAAATAAAATCCAGATCAGAATAATAGGATCTACTGTGATATTT
TATTATTTTAGGTTTGGTTTACATAATCCTTACTGTCAACAGAACAGATT
CCAAAGCATGTTCAAGACTTCCATTGAATTGACAAGAAACAACAGTCGGC
AGATCACAAATACTGAAGCAAGTGGTTTATGGTTATTTGTAATGGTTGAT
TCTTATTGCGAAAGAGGTAAACAATTTTCATTAATATTATCTCCAAATTA
AGTCCCTTGTTATTGACGAATCTTAGCAAGAATCATATTCAGGACCATTG
CCTTCCGAAGTCGATCAATACCTATCAGCATTTCAAGTAGATGTTTTTTA
TAAGCATATAAAAATTGAAAACTCTTGGAGGTGCTTAGGTCGAACGCTTG
ACAAGGCTGAAAAATGCTTATAAGGATGCTTATATCCCAAACAGAATTTT
CGGGAAATTCCGAAAATCCGTAAAATCTCAGCCAAAAACAAGCAAAGTCG
GAAAGTTTAGGCTCAAGGTAATGTTTAGCATATGCTTAAGTTATTGTCAT
ATCTGAGCCTAGTTATGCTTATAAATGAATTTCTTATAAAAAAAAGATGT
AATGATAAAGAAGGAGACATATTACATTTTCTTTTGCCAACTTAGACTTG
GTCTAACCTGAATCGTATTCAAAATCGAAAATTGAAAATTATAAATTCAA
ATAATAAAAATTGCCCCTTTTTCTTGGGGTATTACATTTTTAATTGTTCC
TTACGAGGTCCGCTGAATACGAAAAAAGTAACTATCATTTTTTAATCCGT
CCTTTTTTATAGCGAAGCAAAGTACGAGGGCGCCTGTCCCAACACACCCT
TCACGCCCACCTCACAGATCAACAACTCAAAGAGGTACTAATGGCTATTC
CGTGCCACCAAGAATTACAAAGATCACTCGACCTGGATTAACACGAGGAA
AGAAAATCGATGGAAAGCCACATGAAAATGAAGGCTCTAGCAAAGGTACA
CGCTATTTTTTATAAGAATGTTGTTTTTCTCCATTTCATTCATCATGAAT
ATTCATAACTTTTTGGAAAAAATCATCCTAAATTATTCTTACGGTATTCT
TAGGTTAAAATTCAAATTCAATAGACTTAAGGTATGTGTTCACCTTCCTT
GACACATTCTCTTTAATTGATCATCTATATTATAATACGCTTAAATCGGA
ACTCTCCCATTCTCGCATGAGGCTTTTTCGCTAGCGATTTTTAAATACAC
GGCAATTTTTTTCGCGCCTTTTTGATTGTATATTCAATTCTATTCGCCAA
GTGCACTTCCATTCAAGAGAGCACATTTCTCCTTGATGGAGAAACACAAC
TGACTGTGCAATAGCACTATCAGCATAATTTATAGTTTTTTTAAAAAAAG
TTTATGTCGGTTATGAAATAATTTTGATTCACATGTAATACGTCGAAGAT
AAAATTTGAGTTTTCAAAAAGACATCATATTTATGATTACCCTTGAGATT
AATAAAGCTCCGATGACATTTCCCTTCTATTTGATACTCTGATAAAAACA
TTTCAATTTAATGGACTTGCCAATATGAGAAAAGTTGATGATTTATTCCC
AATTCAATTATGAAATTTTTTAATCAATGTTTGCTATTTTTTGTTCTATT
GAGATAGCAAAATGAAAACGCTTTTACTTACGCATTGAGTTTAATTGTTA
AATAATTGTTGACTCTGTTAAGAGGTATTGAAAAAAGGCACTCTTTATAT
TCCACCGTAAAGCACTGTGGTCTTTGGAGTGATCGGTGTTGCCAAGTACC
TCTAATACTGAATTTGAATTTCTATTTGTTTTTTTATCTTCATCCTTGCG
TGAGGAAAATAATAGTCTTTCCTCTCCCAAAAACCCAAATAAAAGCACGT
TTAAAGTATGACCGATTTCTCGCGAGAAATTTTTAACTCAATTTTCACCA
ATATTTGCATGAGCATTATTTTTAGTGAGTCAAGAACATTATTGTTTGAA
GGTTTTCAACAAAAGAAATTATGACAAATTTATACAATTTAATAAGGAGA
AGAAAAATCAAAATTCAACTAAAAATACTTTCACCATGTTTTTTAATGTG
CATTAATTTTAGTGTCCCCTTAAAAATTTTAAACATCAATTTTTACGAAA
AAGGCCTAAATTTAAGAACATTTCTTCTCGCAAAATAAGTACATTTGTAT
ACAAATCCCTACAAGTTTCTGAAAAATAGAAAAGCGAGCGAAGCGAGCGT
ATTAAAAGGAGTAAGAAGTCGTCTCGGACGACGCCGGGACGGCTAGTATC
TTTAGAACAACAAATTTTTATACATCAAAAGTATATATTTTCTGAAAGCC
AATAATATTCTCTTTCTAATGGTAAAAGTTTCAGCTGAATTTAAAAAACT
TATTTGAGTAAATAATCCATCATAAGACGAACTTTGTTTTGAAATTTAAA
TGGTTATAACTCTGGATCTATAAAAGATTTTAAGATCGCGATTTTACCAA
AATGAAATCCAGTAACTTTTCTTCCACTTTGACTGAAAAAATTTTTTTTG
ACAAAAAATCAGAAAAAAGGTGTACACATCTTAACATGGAATACATACCT
AAAGCATAAAATGGCCTTTTTGTGTTTTGAGCCTTACTTGGGGATAATTG
GTAATTCACAGTTAAAAAGGTTTCAAAATTGGCACTCTTAGCATTAGCCT
GGATATCCAGGCTGTAAACTATTTCACAGTCTATTTCTTTATATTTTTAT
GTTCTGGTTTACAGCCTGGTCTCCCTAGAGCGATTTGCATTCTCTTTAAG
AGAATGCAGTCCGCTCGCTTGCGCTCACTTCGCTAAAGCCGTAAGGGCCA
ATCTACACAGCGCAGAGCAATTCTAAAGCAAAAATAGGGTAGTCCTCCAG
TTGCTAGTGAAGATAGGGCTTTCTGTTACATGAAAACATGAAAAAGAAGA
AAAAAGAGGCAGGTTCATTTTCCAAGAAAACATGGTTGGTCATGATAATG
CATGCAAACTTTTTTATGGACTTTGGTGTAATCTTTGGATGTTCTAAATA
GTTTTAGATCTTGTAAGACTGCTTTTTATCAATTTCTGTTTCGCTGCCCT
GGGTTGACTAGGAAACATGGGTTTGCACTTTCTTTCTCTAGGGAGACCAA
GCTCTATAATTTTAGAACTTTGTATGTTGAGGTAATTTTTGTTTTTTCTA
AAATTTTGAGCTTGGATATCCAGGCTATCTTAGCATATTCTTAATTTTTC
GGCCAATTTCATCAGGAATATTCTTACACGTTTTTTTTTTTTTATAAGAA
CGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCGGATGTTCTTAGTTTTTTGGATTTGAA
GCCTAAAAATGTTCTTAAAATGTTCTTATTTTCAGCATTTTGATGTAATT
TCTTAAGAAATTGCATGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCTTAGAATGTTCTTA
AATTTTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATAAAAAAAAAACGTGTAAC
AATTATTTAGGTGGTTAAAAGTTTTATTGCCTGTATTGCCAGCTTTTTTT
TGCTATAAAAACTTTTGCCATATGTCTAATTCGCGGGTCTCCTCTCAAAA
TTTTGTTTATATTTGAACTATTCACATGCGGTTGCGTCCCACGAAAGGTG
CTACGGATTGCAGTAGTGTAGACAAGATGGATGCAAAGTTGGTGAAGGAG
AACAGATTTTTATAACACAGGAATTATTCTTTGATATTTTGAATTGATAA
TTACTGTGTCATAAAATTATCTTCTTCTGTATTTTTATGACACAGTAACG
CTTCAGAATACAAAAAGATAATTACTGTTTCATGAAAATCTGCTCTCCTT
CACAAATTTTGCGCTCCTCCCCTTGTCTACGCTACTGGATTGTAAGTGTT
GCCCCATATTATTAAATTTATTTTGACTTTCTACAGTTAACAATATGGGA
ATAATCATCGGAGCGAGCGTTGGTATACCTACACTGTTTATCATATGTAT
TATGGTCTTTGTTATATACCTTCGACGTAAACAACCCAATCCCATGGCAA
CCAATGACGTGTCATTCAAGAATGGAAATGTTCATGTGCAAGCGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000049_pilon:120973..125769- >XLOC_033033 ID=XLOC_033033|Name=XLOC_033033|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1638bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000049_pilon:120973..125769- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CATGGCTCAATAATCGAACCAACGCAAAGTTCGCCAAGAAATGCTGCTCT
GCATATCTTCAAATCAAACGAAACTTCAACTTCAAAATGGAGACTCGGCA
ATACGTTTTTCTATCGTCAAACAAACGATACAAGAATTTTAGAATCGATA
ACAGATTTCTTTAGAACGAACGCGTCTGTCGAGTTTAAGCCTAAAAGTGC
AGTTATTATCACAGCGGCGCCAGTGTTTTCAGACGTTTATCAGATAGTTT
TGGCGAGTAACGATTCAATGACATATGCTTTGATCAACTTCAATCATATT
GGAACAGACGATGCTGGCATCATGGCTCAATAATCGAACCAACGCAAAGT
TCGCCAAGAAATGCTGCTCTGCATATCTTCAAATCAAACGAAACTTCAAC
TTCAAAATGGAGACTCGGCAATACGTTTTTCTATCGTCAAACAAACGATA
CAAGAATTTTAGAATCGATAACAGATTTCTTTAGAACGAACGCGTCTGTC
GAGTTTAAGCCTAAAAGTGCAGTTATTATCACAGCGGCGCCAGTGTTTTC
AGACGTTTATCAGATAGTTTTGGCGAGTAACGATTCAATGACATATGCTT
TGATCAACTTCAATCATATTGGAACAGACGATGCTGGCATGTTTGGTTTA
CATAATCCTTACTGTCAACAGAACAGATTCCAAAGCATGTTCAAGACTTC
CATTGAATTGACAAGAAACAACAGTCGGCAGATCACAAATACTGAAGCAA
GTGGTTTATGGTTATTTGTAATGGTTGATTCTTATTGCGAAAGAGGTTTG
GTTTACATAATCCTTACTGTCAACAGAACAGATTCCAAAGCATGTTCAAG
ACTTCCATTGAATTGACAAGAAACAACAGTCGGCAGATCACAAATACTGA
AGCAAGTGGTTTATGGTTATTTGTAATGGTTGATTCTTATTGCGAAAGAG
CGAAGCAAAGTACGAGGGCGCCTGTCCCAACACACCCTTCACGCCCACCT
CACAGATCAACAACTCAAAGAGGTACTAATGGCTATTCCGTGCCACCAAG
AATTACAAAGATCACTCGACCTGGATTAACACGAGGAAAGAAAATCGATG
GAAAGCCACATGAAAATGAAGGCTCTAGCAAAGCGAAGCAAAGTACGAGG
GCGCCTGTCCCAACACACCCTTCACGCCCACCTCACAGATCAACAACTCA
AAGAGGTACTAATGGCTATTCCGTGCCACCAAGAATTACAAAGATCACTC
GACCTGGATTAACACGAGGAAAGAAAATCGATGGAAAGCCACATGAAAAT
GAAGGCTCTAGCAAAGTTAACAATATGGGAATAATCATCGGAGCGAGCGT
TGGTATACCTACACTGTTTATCATATGTATTATGGTCTTTGTTATATACC
TTCGACGTAAACAACCCAATCCCATGGCAACCAATGACGTGTCATTCAAG
AATGGAAATGTTCATGTGCAAGCGTAATTAACAATATGGGAATAATCATC
GGAGCGAGCGTTGGTATACCTACACTGTTTATCATATGTATTATGGTCTT
TGTTATATACCTTCGACGTAAACAACCCAATCCCATGGCAACCAATGACG
TGTCATTCAAGAATGGAAATGTTCATGTGCAAGCGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000049_pilon | genome | sc0000049_pilon:120973..125769 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 661-819:160 |
| Aaloc | 478-657:3284 |
| Aaloc | 322-474:4036 |
| Aaloc | 1-318:4798 |
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