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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000078_pilon:179508..184334- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_032989 ID=XLOC_032989|Name=XLOC_032989|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4827bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:179508..184334- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTATTCAAATTCAAAGAGCCAATTGTGGACAAAGGATTATGTTGGTT
AATGTTAGCTATGGTCTTTACCATATACTTCGTTCTGATTGGGACATTTT
TTTCCTATGGTGTTTGGCTGCCAAGAGTTATGGAAGAATTTAATTGTAAT
CAAGAACAAGCTGGTAAGAATGATATCTCTTTATTGTTAGAAAGATATTT
CAGATATTTGGTCTATAAAGTAAGTAGTAAGTTTGTGAGCGCAGTCGAGG
GCGAAGGCTCCCTTTTCTCTAGCTGTCTACGCAAATCTAGGGGAGGGTGC
TACTCCTTCCCTTGTATTACTCCACTTACCTTTGATCCGTCTCCTTAATT
GTTGAACATCAAGCAGAGAGGCATCACGAGTACTACTTTGGGAATCTTTG
GTATGACCCGGCTGGGGGTTGAACCCAATGAAGTATAAGCCCGAAGGGCT
AGAAGTCAATCTCTTTGGTAGGATTTGAAGCCAACAAATCCTACCAAAGT
TGCGCGGCCTTGAGCCTCCCGCCTGGTTTTTACACAAATGATTGAAACTA
AAATTTACCGCTTAATTTCGAAAAATATATCACTCAAAAACAAAGGAATT
GCTAGATTCAATCCGTCATCAAAAATACGGCGCATATTTTAAGGCTTCAA
TTTTTCTTGTCTGAGAAAGGTTAGAGATTGACCTCTAGCCCTTCGGGCTT
GAAACTCAATGGTTGAACCCACAACCTTGCACACCGTAGCTCAACCTTCA
TGCTACGGCCGCTAGCATGAAAGATATAAAGGTTATTCAAAAATCTTAAG
CAAAATCCACCCCCTCCTTTATAGATGTCCCTCCTTTGTAGATGCACTTT
CTCTTTAATGCACTCATCTTTTTAGAAATCTAACCCTCCTTGGATGAACT
AGCGTAAATCTGTGAAGGGTTCAGTAATTTAAAACCACAGTTTCCATAAT
AATTAATAAACGCAACTGGAAAATCCTCAGTTTAGTATAATCACCATTTG
TCATTAAAGTTGAGAGGCATTCTTAGTTACTCTCGGGTACCTAATAGCCG
CCCCCCCCCCCCCCGCGCTTATTAATTTTTGGGAAAATGTTTTTGAAAGT
TCCCTTTTTTGTCTTAATTCTGCTGTATTAGCCTCCTTTTCAAACATTTT
CCACCCAGGACATTTTTATTCCAAACCCCCCGCTTATTAAATTTTGAGAT
TTTTTTCAACCCCCCGGCTATTAGGTACCCGAGAGTACAAGATTACTTCC
ATTTTACAATTAATTTATGTGGTAAGGATAGCACTTAGTCAGTCAATTTC
TATTTCTACATCCTCGCAAGAGCCCCCATAGATATCATGCATATCTTTGA
AAAATTCCAAATCACGCATCACGACTCAAATCACGATCACGTTTTGACCC
CTGATCACGCAAAAAAATTCCAAATCACGTAATCACGCTAGAAAAGAGTC
CCTAACACGTCATCACGCAAACGGCTTGGGGGGCCTTTCGCAACACAAGA
AAGGGTTGGATTAGCAAAAGAAAATCCTTATACTTAGCTGACCTTTCAAA
ATGAAAGTCCTAAATTTTCTAAGATAAAGAAATTCATTCATTTTATTAAG
CTTTCACTGAAAGATTTTAAAGCTGCTATTTTACGTTTGTAAAAAGTGTG
AACATACCATGCAGGGGGCGGGGTACAGAGGCAGGGTACTAACCCATAGG
GTACTAACTTGATTTTTTACGAAAATTTTGTTTAGTACCACCCACCCATA
TTTAGTACCGGGTACTACTTCATTTTTGCTGTAAAAAATAGAGACACCAA
CCCTAAAATCTTAAATTTTACAGATTAGACCAAGAGAGGGGTACTATTGT
TCGTTTTTCAGACTGAAAATTGACAGATAATTCAAGCAAACTATCAATGA
TGGAGTCAGAAGCTTTTGTCCTTTGATTTTCATCGCACACTTCTTAACCA
TTTTGGAAGTTTTGTCTTCAAAAAAATCAAAAAATTTCTCAAAAGAGTAA
AAAGAATTGTCGATTAAAAAAGATTTCAAATAAAAAAAATCAATATTTGG
AAAAAGTCAAAATATTTCAACAAACTACTTTTTTTATTGAAAAACAGCAA
AATTCTGTGAAAAAGTACCCAAATAGTATCCTGTACTTGCTTGAAGAGTG
AAAAATATACACCCCCACCCCCAAAGTAGTACCGGGTACTAACTTTTTTG
AAATGCAAAAATAGACACCACCACCTGGCTATGGGTCAGTACCCTGTGTC
TGTAACCCCACCCTGTACCATGAGGTTTCAAAGAATATTAAAGCTAACAA
GTGACTTATATGGACATACCTGACATATCAACAGAAAACATGAAATTTAT
AATAAACAAGACGTCAAACAATCTCGGAAAACCACTTTTTATTACCGGAT
CGGTCGACCGGAAAAAATGTTTTTCTTGTTATCATGAAAATTTGACCCCA
TTACATTTTGGAATTACTATTTTGCTTCATTGTGCAAAAAATCTACATAA
TCCTATTAGCTAATATCGAGAAAAGCTAATAACGAACGAATGAACGAACA
AGCACTGGTTAATTTATTGGTAGGTCCAAAAACTATTTCAAAATCAGACA
GAAGATTTCCATACGGATTAGCGATACAACCCTGTATATCATCAACCTCA
ACCAAGTGTAACAGTGAACTCTCCAGAAAATACAATGACTCTCTCGACAA
TTTGGCAAGGGATAAGAATTTTCTTTAAATTAGAGAAGGTTCGAATTACA
GAGAGTAATTCAAACCACTTTCCACCTGAGGGGACCAATTTTTTAGTTCG
AGTTACAGAAATACTTAAATAATAGAGTTTCGAATTAGAGAGGGTAATCC
TACAATTAGAAAAGAAGATCTGATGTAAGTCTAACTCTCTTTATTAACCC
AAGTAAAAATTCTGTATGTAGACTTTGAGTATCAGTGCACCAATAAGCCA
AAACAAAACAACAAGCCTGTAAACCTTTGTGTTCAATTTTTAGCCTGGGT
TGCTTCGATTGCAACTGGTCTACTTGTACTATTGGCACTACCTTCAGACC
TGGCATGTCATTACTTTGGTGTATTCAACATGTCAATATGCGGATCATTG
TTGTGTGGCATTGGCATGATCATATCATCTTATCTCCAGAACATTTATCA
TCTCTATTTATCATTTGGGGTTTTGATGGGGATTGGCTCCTCATTATTGT
ATACACCAACCTTGGTGATGATGGGTAGATGGTTCCACAAATATCAAGCT
CTGTCAACAACTATTGTAATGGTTGGAGCACCATCAGGATCTTTAGTATT
CAATATCATCACAGAGAAAATCATGCAGAATTTCAAACTACGTTCGGTTA
TGGTTGTCTATGGGATATGTTTGATGTGTATTACACTTGTCTGTTCGTTC
GGATATATGCCGTTTAGTCCAACTTTCATAGAAAAGAGGTCAAATATTGA
GAACAAAGAAGAGGCAAAAGGACAAGACTCATTGGAAATTGGCAGTGGAT
TTGAATTCAGAGCGTCGCTGTTAAAGAATGAAGCATATTGGCTTTACAAT
GTATCTCGATTCTTCTCAGTTCTCGCCCACTACGTTCCAATGTTTCACCT
TGTAAGTTTTTAACACAATTTTTCTACAGTGAAATTCCCATAACTCCAAC
ACGCAGATAGGCCACATTTCCAACGGGATTGTTTTATTTAAAGGCTTGTA
TGGGATATATAGTAATGGGCCAGTGTTAGTAATCCTCTATACAAGTTGAA
AAAGATAAGTAAGCGTCAAAATAAGGTTAGCAAAAATGTATTTATTTAAA
AGTTTTATTTTAATTTGGTTACATATCCTTTTTAGGTTTTCCAAAATATT
GATTCAGGGTTTTATCTGCGATTTCCTCTAAAATTTAACCTTGAAAATTA
TTTACTTTCACTTTAAGATCAAATATGCGATGACGATGGGGATTAGTAGT
TCAACAGCCAGTATCATGTTAGCTGTTTGGTCTGGAAGTAATTTCATTGG
TCGATTAGGATTTGGTATTTTTGCTTCCAAATACCGCTCAAAGGTCCCTA
TCACCTATCAGATAGTGCTATTTATGACGAGCTTGGTGTGCGCTGCGGCC
TTTTTCGCTGAAACCGCCTGGAGTCTTTTCCTCTATTGCTTCATATATGG
GGTATGCGAGGGCGCTATAGTTGGTATAGCCAGTATTCTAACCATTGATT
TAACTTGTTTACGAGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTATACAACAAACTATC
AATGGCATTCCAACCATTGCTGGCCCTGTTCTGATTGGTAAGTGATTGTG
TTATTATACTGTGTTGTGCGAAGTGAGAAGGGGTTGTGGGTAGTAGGTTT
TTGAGGTGATTGGGTATGCCTGAGCTAAAAAATCGAAAATTGACTCTTTA
AGAGAAATAAAATAGAACCTTAGTGTGCTTAAGTATGACTTTCTGAGAGA
TTTTTCTCAAAGTTTGTTTAACAATAAATCTTGGTCTAAAAATTACTGAA
ATCGTAGCCAGAGTGTCAGGCATGATGTATAACCTCCGTTCAACAGGTTT
TCGCTACACCTATATAAACATGAATAAATACCATAACACATATTTTTCAT
TCTCTCAAGAACTTTATATCAAAGACCACATACGGCATTAATAAAATATT
TTTCTCTTTTAAATAGGTGCAATGAACGATGCCAATTTGTTCCGTCCAAA
TTTCATGTTTATCTTTACCGGTGGTACGTTTCTTGTCAGTACTGTATTCA
TGCATTTAGCAAGAACTATTCACAATAGAAGAAATAAAATATCTAAAGAA
GAAGAACATCAATCACAAATCGAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:179508..184334- >XLOC_032989 ID=XLOC_032989|Name=XLOC_032989|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2604bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:179508..184334- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTATTCAAATTCAAAGAGCCAATTGTGGACAAAGGATTATGTTGGTT
AATGTTAGCTATGGTCTTTACCATATACTTCGTTCTGATTGGGACATTTT
TTTCCTATGGTGTTTGGCTGCCAAGAGTTATGGAAGAATTTAATTGTAAT
CAAGAACAAGCTGATGGTATTCAAATTCAAAGAGCCAATTGTGGACAAAG
GATTATGTTGGTTAATGTTAGCTATGGTCTTTACCATATACTTCGTTCTG
ATTGGGACATTTTTTTCCTATGGTGTTTGGCTGCCAAGAGTTATGGAAGA
ATTTAATTGTAATCAAGAACAAGCTGCCTGGGTTGCTTCGATTGCAACTG
GTCTACTTGTACTATTGGCACTACCTTCAGACCTGGCATGTCATTACTTT
GGTGTATTCAACATGTCAATATGCGGATCATTGTTGTGTGGCATTGGCAT
GATCATATCATCTTATCTCCAGAACATTTATCATCTCTATTTATCATTTG
GGGTTTTGATGGGGATTGGCTCCTCATTATTGTATACACCAACCTTGGTG
ATGATGGGTAGATGGTTCCACAAATATCAAGCTCTGTCAACAACTATTGT
AATGGTTGGAGCACCATCAGGATCTTTAGTATTCAATATCATCACAGAGA
AAATCATGCAGAATTTCAAACTACGTTCGGTTATGGTTGTCTATGGGATA
TGTTTGATGTGTATTACACTTGTCTGTTCGTTCGGATATATGCCGTTTAG
TCCAACTTTCATAGAAAAGAGGTCAAATATTGAGAACAAAGAAGAGGCAA
AAGGACAAGACTCATTGGAAATTGGCAGTGGATTTGAATTCAGAGCGTCG
CTGTTAAAGAATGAAGCATATTGGCTTTACAATGTATCTCGATTCTTCTC
AGTTCTCGCCCACTACGTTCCAATGTTTCACCTTCCTGGGTTGCTTCGAT
TGCAACTGGTCTACTTGTACTATTGGCACTACCTTCAGACCTGGCATGTC
ATTACTTTGGTGTATTCAACATGTCAATATGCGGATCATTGTTGTGTGGC
ATTGGCATGATCATATCATCTTATCTCCAGAACATTTATCATCTCTATTT
ATCATTTGGGGTTTTGATGGGGATTGGCTCCTCATTATTGTATACACCAA
CCTTGGTGATGATGGGTAGATGGTTCCACAAATATCAAGCTCTGTCAACA
ACTATTGTAATGGTTGGAGCACCATCAGGATCTTTAGTATTCAATATCAT
CACAGAGAAAATCATGCAGAATTTCAAACTACGTTCGGTTATGGTTGTCT
ATGGGATATGTTTGATGTGTATTACACTTGTCTGTTCGTTCGGATATATG
CCGTTTAGTCCAACTTTCATAGAAAAGAGGTCAAATATTGAGAACAAAGA
AGAGGCAAAAGGACAAGACTCATTGGAAATTGGCAGTGGATTTGAATTCA
GAGCGTCGCTGTTAAAGAATGAAGCATATTGGCTTTACAATGTATCTCGA
TTCTTCTCAGTTCTCGCCCACTACGTTCCAATGTTTCACCTTATCAAATA
TGCGATGACGATGGGGATTAGTAGTTCAACAGCCAGTATCATGTTAGCTG
TTTGGTCTGGAAGTAATTTCATTGGTCGATTAGGATTTGGTATTTTTGCT
TCCAAATACCGCTCAAAGGTCCCTATCACCTATCAGATAGTGCTATTTAT
GACGAGCTTGGTGTGCGCTGCGGCCTTTTTCGCTGAAACCGCCTGGAGTC
TTTTCCTCTATTGCTTCATATATGGGGTATGCGAGGGCGCTATAGTTGGT
ATAGCCAGTATTCTAACCATTGATTTAACTTGTTTACGAGATTTGGGAGC
AGCTTGGGGTATACAACAAACTATCAATGGCATTCCAACCATTGCTGGCC
CTGTTCTGATTGATCAAATATGCGATGACGATGGGGATTAGTAGTTCAAC
AGCCAGTATCATGTTAGCTGTTTGGTCTGGAAGTAATTTCATTGGTCGAT
TAGGATTTGGTATTTTTGCTTCCAAATACCGCTCAAAGGTCCCTATCACC
TATCAGATAGTGCTATTTATGACGAGCTTGGTGTGCGCTGCGGCCTTTTT
CGCTGAAACCGCCTGGAGTCTTTTCCTCTATTGCTTCATATATGGGGTAT
GCGAGGGCGCTATAGTTGGTATAGCCAGTATTCTAACCATTGATTTAACT
TGTTTACGAGATTTGGGAGCAGCTTGGGGTATACAACAAACTATCAATGG
CATTCCAACCATTGCTGGCCCTGTTCTGATTGGTGCAATGAACGATGCCA
ATTTGTTCCGTCCAAATTTCATGTTTATCTTTACCGGTGGTACGTTTCTT
GTCAGTACTGTATTCATGCATTTAGCAAGAACTATTCACAATAGAAGAAA
TAAAATATCTAAAGAAGAAGAACATCAATCACAAATCGAATGAGTGCAAT
GAACGATGCCAATTTGTTCCGTCCAAATTTCATGTTTATCTTTACCGGTG
GTACGTTTCTTGTCAGTACTGTATTCATGCATTTAGCAAGAACTATTCAC
AATAGAAGAAATAAAATATCTAAAGAAGAAGAACATCAATCACAAATCGA
ATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:179508..184334 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1144-1302:160 |
| Aaloc | 772-1140:911 |
| Aaloc | 166-771:1833 |
| Aaloc | 1-162:4828 |
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