|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000078_pilon:133364..136217- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_032988 ID=XLOC_032988|Name=XLOC_032988|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2854bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:133364..136217- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGGGTTTTGTGTGTAATTTTGATATTGGAATCTTATATCATTGGAGT
AGTTCTTGCAAATACCGGGGCTAGATTCACCGATACAAAAAATAACAAAA
AGATTGCCGCCGGTGAAGACGATAAATATGTCAGTTTGAAAGGTTTAACG
GAAGTGCAATGTGTTGGTCATTGCACATTAACTGATGATTGCCATTCTGT
GAATCACCATAGTGATGACCAGATCTGTCTGGTGATTGATGAACCATTGG
AAGGTGATTCTCATTTGATTGATGCTCATGGATGGAAATATTTCAAGAAG
ACAAGAATAACAAAAGAGGTATAGCTGATACTTTTTATGCTATAGTCAAA
TACAAATTACCAACTAAAACTAAAACCAAAGCCAACTGTTTTTTTTTGCC
GAAAATAGTTTACAGCCGGTAGAGTTTACCAGTCTTCTTCGGGACTCTAC
TGTTGATTTTTTCAGTATACCGCTATTACGGCTGTGAACTCTGCGCATAT
AATATTCTCCCGACTTTACTATCCCTGTAAACATCGTCTACTATTATTTT
AATATCATGGGACTTTGGAAACTATTCTCCTTCTTGAAATTGAATGAAGG
GGAAATGATTTTGGGAGGTTTGAAATATTAAAGTCCCCAGCGCTTACTTC
CCTTTCTCTTATCAAAGAGACCCGGAGTGCTGGGTATGTGCGGACGGAGA
GTTGCAAAAATTAGAAAATTTTTAGTTTTAAAGAAAGAATTGTGAAAAAT
CCCACCTATGGATAGGACGTTTTTCAAAAATAGAAGAGAATTTTCTAAGG
GTCATTTTTTCACTAGGATTTGGTCTCTCCTAAGCCTTTTCCTTAGTTAT
AGGAGGTCAAAGAGACGAATATGACCAAATCATCGATTCTCAATGCTCTT
AAAGTCTTAAATGAAATCTTTTTTTGATTCAGGATGAAATCTCAACAAAG
AATAACTTTGAAATAACAAATGGTAAGTCTACTGAATAAACTATGAGCAT
CTTAAATCTGTGTTACTATCCTCCTTTCTTAAGCTTTTGAAGCAATATTT
CTTAGGTTACGTGTATACCAAAATTGTAATTCCGTTTCAAACATTTTTGA
CTACATTGAGAATCTCCTATCCCGAGAGTCGCACTTCTACTTATCACACT
TGTTCGGCAGATAGTTGGTCAATGTGCATTATTCACTTGACTGTAAGTAA
CATTAGAGCTCGACTTAAGTTTACGCTAAGATAATTAAATTTTCTTCATT
AGCGTTCAAACCAAACCCAAACAAGATCGTCAACTTTCTACCTTACCTAA
AAGAAGAATGGGAATTAACTTTCAATATCATAATCTATGGAAAATCAGAT
CAAAATAAAAGTGGAATTTTCACAATGGCAAAAGAATTAACTGCTCAAAA
TAAATTGTTAAACATTTATGTTATCACTTCCACCGATCAAAAGATTCGAG
TTTACACAAAAGAGATGTCTTATTCTTTCAAGTTTGAATACAACAAATGG
CATACTATCAAATTTACCCAACGTTCAAGTCCGATAAATGATCCGCTACA
AACCCACGTAAGATCTCTGGTCGTTGATGGTATGTACGTCAACAAAATGC
TTATCAAACTACCAGAAGTCTCGGAGAACTTGATTTGTTTTGCTGGTTCA
CCTCATCACCTTGCGTTGAACGGTCGCGTCCGAAATTTGACGTTTAAACA
AGATGGCCTTCCGCATCGTAAGATTCTTTGTTTTTATTGGATGTTGAGAA
ATTTAGAATTGAACCAAAACCCCCTATAATACAACTTTTCGACCGTAGCC
ACCAATTGCCGCGCGGGCATTTTTTGTCCGCTTTATCTCACTAAAACCGT
CCCAGTCCTTTTTTCGCACCTATAGACGATAGAAAAATGTGTCAAAAAAG
GATTGGATCGATTTTAGGGGGTAATTAAATAATTTAGTGGCACGCGTCTG
ACCGCGCGACTACGGTCGAAAAGGTGTATCAATCAAGTATTTTACTTAGA
TTTTAAGAAGTTAATTTATATATAAATACTTAATAAATGACTAAATGACT
TTTTTAATAGAGAGCACGTTTTTGATTCCTGCGAGTTTGGTCTATGTAAT
CTTAAGTAGAAGTGTAGCCGCATAACTTGTAATCACTCAAAATTGTTCGT
TATAAGAAAACTTTGATTGCATGGTCAGGTGTATGTATAAAGGCTCTTTA
TTATTTTTTTAATTTATGTGTTGGTAAGTTTCACAAACTTTAGTGGCTTC
AGAAAGATTTTAGCTTCCAAGATTTTAAGCCTAAAGGACATTCTTTCACA
ACAATCCCTGTAAAAATAATAATTTCTTTATTTTATTGTTTCTAGGAAAC
ATTCGACCAAAGCAGTACTACATCTCAAACAACATCGATCCTTGGTACAG
AGAATGGTACGTGAGGTTCACTCTGGTGATACACTCAATAGATTTCACCG
ATTCTAGCAGTTATCAACGGAAAGGTTACCATAATGTCATTCATTTCACA
ACTGGAGTAAACGACGGGTCAATGGGCACAAGAATCGTTTCAGCATTTAT
CAAAGATACCGGGACAACCATTTTAGGTGCAGAATATATGGCTAATGGGC
AATGGAAACAAATATTCGTAAGTTACACGTTTGATCTTGATCGCGAATAT
CGTATTGAATTTAAAAGTTTTGAATCTCAAAATAACCCTGCAGCAAACAT
TATTCAGTTTTGGGTTGATGGATTAATGAACCCAAACACTGTTACTAATT
TCCAACCTATAATTCAAGGGACAGTGATAATATACGTCAGCGATCCTTGG
TATAAACCTGCTGATGCGACACTTTTTGGTCTTGAATATGGACCATTGGA
ATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:133364..136217- >XLOC_032988 ID=XLOC_032988|Name=XLOC_032988|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2664bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:133364..136217- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGGGTTTTGTGTGTAATTTTGATATTGGAATCTTATATCATTGGAGT
AGTTCTTGCAAATACCGGGGCTAGATTCACCGATACAAAAAATAACAAAA
AGATTGCCGCCGGTGAAGACGATAAATATGTCAGTTTGAAAGGTTTAACG
GAAGTGCAATGTGTTGGTCATTGCACATTAACTGATGATTGCCATTCTGT
GAATCACCATAGTGATGACCAGATCTGTCTGGTGATTGATGAACCATTGG
AAGGTGATTCTCATTTGATTGATGCTCATGGATGGAAATATTTCAAGAAG
ACAAGAATAACAAAAGAGATGAGGGTTTTGTGTGTAATTTTGATATTGGA
ATCTTATATCATTGGAGTAGTTCTTGCAAATACCGGGGCTAGATTCACCG
ATACAAAAAATAACAAAAAGATTGCCGCCGGTGAAGACGATAAATATGTC
AGTTTGAAAGGTTTAACGGAAGTGCAATGTGTTGGTCATTGCACATTAAC
TGATGATTGCCATTCTGTGAATCACCATAGTGATGACCAGATCTGTCTGG
TGATTGATGAACCATTGGAAGGTGATTCTCATTTGATTGATGCTCATGGA
TGGAAATATTTCAAGAAGACAAGAATAACAAAAGAGGATGAAATCTCAAC
AAAGAATAACTTTGAAATAACAAATGGATGAAATCTCAACAAAGAATAAC
TTTGAAATAACAAATGCGTTCAAACCAAACCCAAACAAGATCGTCAACTT
TCTACCTTACCTAAAAGAAGAATGGGAATTAACTTTCAATATCATAATCT
ATGGAAAATCAGATCAAAATAAAAGTGGAATTTTCACAATGGCAAAAGAA
TTAACTGCTCAAAATAAATTGTTAAACATTTATGTTATCACTTCCACCGA
TCAAAAGATTCGAGTTTACACAAAAGAGATGTCTTATTCTTTCAAGTTTG
AATACAACAAATGGCATACTATCAAATTTACCCAACGTTCAAGTCCGATA
AATGATCCGCTACAAACCCACGTAAGATCTCTGGTCGTTGATGGTATGTA
CGTCAACAAAATGCTTATCAAACTACCAGAAGTCTCGGAGAACTTGATTT
GTTTTGCTGGTTCACCTCATCACCTTGCGTTGAACGGTCGCGTCCGAAAT
TTGACGTTTAAACAAGATGGCCTTCCGCATCCGTTCAAACCAAACCCAAA
CAAGATCGTCAACTTTCTACCTTACCTAAAAGAAGAATGGGAATTAACTT
TCAATATCATAATCTATGGAAAATCAGATCAAAATAAAAGTGGAATTTTC
ACAATGGCAAAAGAATTAACTGCTCAAAATAAATTGTTAAACATTTATGT
TATCACTTCCACCGATCAAAAGATTCGAGTTTACACAAAAGAGATGTCTT
ATTCTTTCAAGTTTGAATACAACAAATGGCATACTATCAAATTTACCCAA
CGTTCAAGTCCGATAAATGATCCGCTACAAACCCACGTAAGATCTCTGGT
CGTTGATGGTATGTACGTCAACAAAATGCTTATCAAACTACCAGAAGTCT
CGGAGAACTTGATTTGTTTTGCTGGTTCACCTCATCACCTTGCGTTGAAC
GGTCGCGTCCGAAATTTGACGTTTAAACAAGATGGCCTTCCGCATCGAAA
CATTCGACCAAAGCAGTACTACATCTCAAACAACATCGATCCTTGGTACA
GAGAATGGTACGTGAGGTTCACTCTGGTGATACACTCAATAGATTTCACC
GATTCTAGCAGTTATCAACGGAAAGGTTACCATAATGTCATTCATTTCAC
AACTGGAGTAAACGACGGGTCAATGGGCACAAGAATCGTTTCAGCATTTA
TCAAAGATACCGGGACAACCATTTTAGGTGCAGAATATATGGCTAATGGG
CAATGGAAACAAATATTCGTAAGTTACACGTTTGATCTTGATCGCGAATA
TCGTATTGAATTTAAAAGTTTTGAATCTCAAAATAACCCTGCAGCAAACA
TTATTCAGTTTTGGGTTGATGGATTAATGAACCCAAACACTGTTACTAAT
TTCCAACCTATAATTCAAGGGACAGTGATAATATACGTCAGCGATCCTTG
GTATAAACCTGCTGATGCGACACTTTTTGGTCTTGAATATGGACCATTGG
AATAAGAAACATTCGACCAAAGCAGTACTACATCTCAAACAACATCGATC
CTTGGTACAGAGAATGGTACGTGAGGTTCACTCTGGTGATACACTCAATA
GATTTCACCGATTCTAGCAGTTATCAACGGAAAGGTTACCATAATGTCAT
TCATTTCACAACTGGAGTAAACGACGGGTCAATGGGCACAAGAATCGTTT
CAGCATTTATCAAAGATACCGGGACAACCATTTTAGGTGCAGAATATATG
GCTAATGGGCAATGGAAACAAATATTCGTAAGTTACACGTTTGATCTTGA
TCGCGAATATCGTATTGAATTTAAAAGTTTTGAATCTCAAAATAACCCTG
CAGCAAACATTATTCAGTTTTGGGTTGATGGATTAATGAACCCAAACACT
GTTACTAATTTCCAACCTATAATTCAAGGGACAGTGATAATATACGTCAG
CGATCCTTGGTATAAACCTGCTGATGCGACACTTTTTGGTCTTGAATATG
GACCATTGGAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000078_pilon | genome | sc0000078_pilon:133364..136217 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 826-1332:508 |
| Aaloc | 361-822:1601 |
| Aaloc | 319-357:1923 |
| Aaloc | 1-318:2855 |
|
