XLOC_032978 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_032978
Unique NameXLOC_032978
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:139679..147586+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_032978 ID=XLOC_032978|Name=XLOC_032978|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:139679..147586+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGCCGAAAAGTAAAACCTCGGCAACGATTCCACTCGCTCAGTACGTC TCTACCAGACGTCGATGGGAATAAAGGATTTGAATTACCGTTTAACTGTT TGTCATCGTTTGATCCCACAGATGAATTCGATGAAAATGGTGAATCAAAA GATATGgcagaaattcttgaaaaagttgccaaagaaaatgaaagcaggTA AGGTCTTTATACCGTAAAATTAATAGCGGCTATCTACAAGTTGTAAAGGT AACCTTTTCGTATCTTGAAATCTATCTAAGGGTTAGAAAAACCAGCTCAA CctctaaaaatgttttgaaatttacgAAAGTATTTTATGAACgggacaaa atttcaaaaaaaaatttggacaaatacTTGAAGAAAATCCCctttaaggg tcgattttcgattttagaCATTATAAACCCTACTTTTTTGGATGATTACT ATATACCTTTGAAACATACCTTTAAATTTTCCTTACAGATCTCCTTCACC ACCAGCATACACTGGCCCTTTGGATcgctttcggcgattggttaaAGCGA TCATTGTACAAAACCGATGGACcagttttcaaaacaaagtggcTGATGAA TACCAAATGAATCGACTACATCTGCAGGAGGATCCAGATAACGCTGATAT TTTAACCTTCAACCCGGGTGGTACGTATTGCGCTATCGACTATTTGAGGT TTGAAGacaaactcgaacccagccCCTTTGCTTGCTTTTTTAATGACTAC GATTGTATCGCGTCCattagtaaaatcaaaaagtagttGAAGTAGCTCTG GGTACGAAATTGGTTTGAGAATCTaatgcaaaaaagtgaaacattaaTCT TGCAAAGATATTTCCAGCGAATGTAACCTACTTTTCTTTAGCCAAATCAT TGTCAATTTGATTTTCCTCGGTATTTTGAGCAGGCAAGAAATTTCTCTTA 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AGCTTCTACTTTGTCTATCTTGACTGACCGAGGACGATGGTAAATCAACA CTTTTATCGTCATCGATTTTGCAGATCAGAAATatgggtttttccaaatc actCGTTATttccgagtttatgtatgtgtgtttttctgcgacggagtcGG TAAAGTTcgaatttgactagatcctaacCAGCTGAGGacaacggtaaatc agcacttttaccgtcctcaattttACGGGTTAGAGCTGCCGGTTTTTCCG TTGTCactccgccgtcctcaaaagtgtaaatacataaactcgctattatc gAGGTAAGATTCTCACCGATCGATATCAACAGATTATGTAGACTGGCATC GTTTATAATAAATGATTTTCAGTAACATAGATGTGATAACTGTCACGTGA TAATCTTTATTTGTATAAAACTGTATTGTATGTCTTTCAGCTTTCCTTAC CACGCCCTACTTTAGTCCTCCTGCTTGCTAGGCTATATAATGAGAGATAA GTTTTTCGCAAAATGATgataaaattttcccaaaaattcatctttttgaa aaactatTTTGCATAATTTTCGTTTCGGTAGTTGGAGATAACGCTAGCGC TAAGTAACTAAATACCTATCGTTTTGGGTTGTACCGGCGGCTAgttcttt taagaaaaaagaTTATGAAATTGGGGTTTTAAACACAGAGATAGTTTACT ATAACATTAGTTCTAAGACTGGATTACGCAAGAAAGTCACTTTACCGGAC TAtgaaaggtttttaaaaagCAAAGTTTAGTCAGTAGTAGACTCCAGTCT ACTATCATGACTGGCCGCTGCCCACTTAACTTATATCACTAACTTTGACA CCTGAATTTTCTTCTAGATCGTGAACGAGATAATGGCGGGTGGATCGTTC GGTGAGATGGCCTTAATGAGTGGTATGAATCGTGCTGCTACTGTTATTTG 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tttgaccaTGATCTTCATTTCTAtattgaaatcaaagtaaattcccagtg gagctgaaatttTAAGATGTATTTTCCCAacagagacaaaattttgacca tttggTTTGGGGGTACTTATTGATTTAATCTCTTTTTTCTCCTAGGTTAT TCAGGATAGCCAACCCAGCTTTTAATTctaatatttctttaatttaggTA TTGATGCGATCATTTCAAAAGGAATGGGAACGTAAAACACTCTTTATGAA GGATTGTATTTTGTTCAAAGAATGGACTTTCAAAGAGATCAGAGGAGCTG GAGCCGCATCTTCAATTAAAGAATACCAAAATAACAAGGTCAGTTTAATT AGTTTCAAAGTTACCAGATTTTGTTTGACTGAAAGCAGTGTAGAGGGAAA AAGTTTTAAGCATAGACAGTTTATTCTCCAACAAAATAATATTCTAAAGT TctctatttttttgttcatattaTCGCTTCTTATTGTCATGTCATTTTCA AGGACCGGAAAAAGCACAAAGGAATAATGCCATCATGTCAGTCTTTCTTG cttaacagaaaaaaaagacCGGTGTGTCGAGACCAGCCTTTCTTTTAAtc ctgaaaaacaaaacattataaTGTTCTATTTATTTGCAACCTTCACCACA ACTTTCAGGTAATTGTTAAGGATCTATCCACACATAAGGGAACAGTTTAC GTCGTCATGTTTGGCACCTGTttggtggtcagtaaaataaacGTCATCAA AGAATCATTACCATACGGTAAAGAATATATTCGAATGATCACACCTGAGC AAGTCAAGACAGCGCCTATCACTAGGTATGACTTTTAGGTTAAGAATACG TTATGGTTCCAGTGGTGGGAAGGCCCTACCAATTATTATCATTGCAGATC TTGCTTTATTTCTAGTGTATTTCAATAAAATCTAATTTAGCCCTCATTTC ACTACTGTTCTCATCCAGGCCTGTAGCAACCggggggggCACAGGGGCAT TTGCCCCaccaaaaatttttccaaaagttggTAGCTTTaaaaaaaCCTTG TAttaatggcttcattttgaGCACAATCCTTTAATTAGATACGTTTTCCA GCAgtctagacaccttaaattgcaaatttttttccctcgggccaaaccat ggctGGCCCTCGGTTTATATTTCTCACTTTGccccctcaaaatgaaaatg cttcctacgggccTGCTCTACCAATACAAAAGGATGGGGCATTTCATTTG ATGAACATTTAAGTTAGACGTGATATAAGCGAATAATTCATACACTCGAT ATATATAACGCATTTACTTTCGGCAAATTATCGAACCACAACTTACGATT ACAGTGTCATATAGTAGTGTAGTATAGTAGTTAGCAATTCCCTAATGGAA AATTTAGAGATAAATAAGGAACTACTAATTCTAAAAACTTACAAAATTTT ACTATTATCAAGATTAAACAggggatgaaaaaaaaaatctacttgtAGTC AGAGCAACTCACTCTTTTGCTTTACTGACAGTCCTTTCGTGAGCGCCATC ACAGAAGTATAAAAATGCGAACTAAGGAACTGGAAACGAGATTCGTTGGA ACGAGAAAGCCAATGAAATCAAACGCCCATTTAgtattttgtttgattgt taACAGGTATCAACGAAAGGAGAGTATCTTCTTAGTAATCAGGAGATTAA AACAAGGTGATTGTTTCGGTATTGGTGAGCAGTTGCCACAAACCAGTGTC ATCAGTCAACACAAGGTACGTTTCTTTACTTGACCTAAGTTTCTAGTTTC TTAGTGCTAACCAATCTATAGGTAAGACAAAAGTTCCAAGAGATGATTTC TCGGAAGATTTTACAAAATACATCAAAATCAAGAGAAGAAGGTATCGAGT AGACATAATTCGCTTCAAGCGAACGCTACGCTACGCTACGTTTCTCATAG GAAGTAAATCTATAGAGGTCTGTTAATcagacttaagggctctgaccata gtcggaaaattgattttagtatttgaacataaaagttatgttttaggttc tttaacacttttaacaaagaattgcctttataaattgctttttaatcaaa tcccttcagagtaattaaaaatttaattgcagaaatgacgttatgaactt taaaaagacgttaataatatgttgcatcaccttcttttataaaaagcgct aagttttaatgggtaattaacctttttgcttcaaaatttctattttaaat tttgcggaaaacttttctaaaaagatgtgtcaaaagttatgactgttttt ttaagcaaaatccagatgaaaaattgatgaaaaccactattttgaagatt tcgagacaaagaagcatttacaaaaattttccgcaaaaatttttattgtt tggtaaaagatacaccatctactacgaaaaatttttcaaaatgttttttc ttcgccgaaactaagctcttcaaagttgaaatattcttcctcgcaaaagt cttcattttcttcttcatcaaattttttcattgcaatttttgaattttca gattcaggaatagtttttttaacagaaaatgtataacatgccatagtttt gttggttacatcagtcagaaaacacattttaaacacggcaattatgaaaa attcactatggccagagcccttaaagcaCTAAAAGCTCATGTTCTAGATT gctttttgcttggaaagttTATAGATTTAGTTTTGTTACCAAAGCGAAAT AGGCTACAGGAGTAAATACGCCCATAGAGTATCTCACTTGTCTCTCAAAG CGTGCTTTTAATGCATTCCTAACGCTGACGAAATGTTAAGGAGGTTAAGG ACCTCGGACAAacgttttctttattttgttcaGCGGATGAATGTGTAAGA AAAGAACAAAACCAAGCATATAAAATCACTTGATTACATCAAATATTTAT CATCTTCCTTTATGCATAGGTTGAAGTATTGGCAGTGCCCACCATCCATA TATTGAGACACGGTCGTGATCAATCGTTAGAAAAGATACAAGCCATTGAA ATCAAGAAATATCCCACACTCAGAAACGCTTTCAAAAACTTCCAAACTCA TCGTGAATGGAAAATGTATAAGAAAGATTTAAAAGATTCGATTATTGgtc gaaagaaa

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:139679..147586+

>XLOC_032978 ID=XLOC_032978|Name=XLOC_032978|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2868bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:139679..147586+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGCCGAAAAGTAAAACCTCGGCAACGATTCCACTCGCTCAGTACGTC
TCTACCAGACGTCGATGGGAATAAAGGATTTGAATTACCGTTTAACTGTT
TGTCATCGTTTGATCCCACAGATGAATTCGATGAAAATGGTGAATCAAAA
GATATGgcagaaattcttgaaaaagttgccaaagaaaatgaaagcagATG
AGCCGAAAAGTAAAACCTCGGCAACGATTCCACTCGCTCAGTACGTCTCT
ACCAGACGTCGATGGGAATAAAGGATTTGAATTACCGTTTAACTGTTTGT
CATCGTTTGATCCCACAGATGAATTCGATGAAAATGGTGAATCAAAAGAT
ATGgcagaaattcttgaaaaagttgccaaagaaaatgaaagcagATCTCC
TTCACCACCAGCATACACTGGCCCTTTGGATcgctttcggcgattggtta
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GATGAATACCAAATGAATCGACTACATCTGCAGGAGGATCCAGATAACGC
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TGGCCCTTTGGATcgctttcggcgattggttaaAGCGATCATTGTACAAA
ACCGATGGACcagttttcaaaacaaagtggcTGATGAATACCAAATGAAT
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TTCACCTATCATTAAGAGGGAATTAGCGAAATCGTTaaatttcgaatgtt
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GCTGAGCAAATCTtatcaaaagaagcaaaacttTTATTATGTCATGCACC
ATGGAAAAGATCAGAAAAGGATATCAAATTTATTTACAAAGCTCTCGACG
GATTAACATTATTCAAGAAATTTTCACCTATCATTAAGAGGGAATTAGCG
AAATCGTTaaatttcgaatgtttcgaAGATGGTAGAATCATTATCCAGCA
AGGTCATCCTGGAATCTCTTTATACTTCGTGGTCAAAGGTTCGGTTGCCG
TTCAAGTGGCCACAACAGATAAAGCAAATGGAAATGTTTATAAACAGGTC
ATCCTGGAATCTCTTTATACTTCGTGGTCAAAGGTTCGGTTGCCGTTCAA
GTGGCCACAACAGATAAAGCAAATGGAAATGTTTATAAACAGATCGTGAA
CGAGATAATGGCGGGTGGATCGTTCGGTGAGATGGCCTTAATGAGTGGTA
TGAATCGTGCTGCTACTGTTATTTGCATTGGAACATCAGAATTCCTCAGA
ATCGACAAAGGTGACTTTAGAGAGATCGTGAACGAGATAATGGCGGGTGG
ATCGTTCGGTGAGATGGCCTTAATGAGTGGTATGAATCGTGCTGCTACTG
TTATTTGCATTGGAACATCAGAATTCCTCAGAATCGACAAAGGTGACTTT
AGAGAGgTATTGATGCGATCATTTCAAAAGGAATGGGAACGTAAAACACT
CTTTATGAAGGATTGTATTTTGTTCAAAGAATGGACTTTCAAAGAGATCA
GAGGAGCTGGAGCCGCATCTTCAATTAAAGAATACCAAAATAACAAGgTA
TTGATGCGATCATTTCAAAAGGAATGGGAACGTAAAACACTCTTTATGAA
GGATTGTATTTTGTTCAAAGAATGGACTTTCAAAGAGATCAGAGGAGCTG
GAGCCGCATCTTCAATTAAAGAATACCAAAATAACAAGGTAATTGTTAAG
GATCTATCCACACATAAGGGAACAGTTTACGTCGTCATGTTTGGCACCTG
TttggtggtcagtaaaataaacGTCATCAAAGAATCATTACCATACGGTA
AAGAATATATTCGAATGATCACACCTGAGCAAGTCAAGACAGCGCCTATC
ACTAGGTAATTGTTAAGGATCTATCCACACATAAGGGAACAGTTTACGTC
GTCATGTTTGGCACCTGTttggtggtcagtaaaataaacGTCATCAAAGA
ATCATTACCATACGGTAAAGAATATATTCGAATGATCACACCTGAGCAAG
TCAAGACAGCGCCTATCACTAGGTATCAACGAAAGGAGAGTATCTTCTTA
GTAATCAGGAGATTAAAACAAGGTGATTGTTTCGGTATTGGTGAGCAGTT
GCCACAAACCAGTGTCATCAGTCAACACAAGGTATCAACGAAAGGAGAGT
ATCTTCTTAGTAATCAGGAGATTAAAACAAGGTGATTGTTTCGGTATTGG
TGAGCAGTTGCCACAAACCAGTGTCATCAGTCAACACAAGGTTGAAGTAT
TGGCAGTGCCCACCATCCATATATTGAGACACGGTCGTGATCAATCGTTA
GAAAAGATACAAGCCATTGAAATCAAGAAATATCCCACACTCAGAAACGC
TTTCAAAAACTTCCAAACTCATCGTGAATGGAAAATGTATAAGAAAGATT
TAAAAGATTCGATTATTGgtcgaaagaaaGTTGAAGTATTGGCAGTGCCC
ACCATCCATATATTGAGACACGGTCGTGATCAATCGTTAGAAAAGATACA
AGCCATTGAAATCAAGAAATATCCCACACTCAGAAACGCTTTCAAAAACT
TCCAAACTCATCGTGAATGGAAAATGTATAAGAAAGATTTAAAAGATTCG
ATTATTGgtcgaaagaaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_032978XLOC_032978-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:139679..147586 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1246-1434:7720
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