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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000175_pilon:93327..98491+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_032847 ID=XLOC_032847|Name=XLOC_032847|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5165bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000175_pilon:93327..98491+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCGAGACGGAGCTTCTCTTGGCTTCCTCTTCACCAACTTCGTCCAT
CCAACAAACAGAGGAATATGTTGTAATATCGTCCAATCAGAATCGTgata
agaaagaagaaaatagaATACTTGTACCATTATCGAAAGTCCCTTTACTG
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ATTAGAGAACTTTACAGACAGCAATACGAACACTAACAATGATGGTAGTC
CCAGTACTATCACTAAAAGTCGTAGTCGTAGTTGTGGTTTCATTTCTGAT
GTGAATTTCTATAATGAACCTTTGGAAATTTCAATCAATAATAAAGAGGG
TGGTGTTGTACAGGCAACAACAAATGCTCAAGCATCACCTTTGGATGCTT
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gcttataacttgacaactacttgaccaaacttaaaaagttataccgcaaa
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ATGAACTGAATAATAGTATTAACTTTTGGTGTCAGCATTGGATTGTGCTA
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CAACACATCgccgttgacaaatcaaaagggccaatcacaaaattagtgtc
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AATTTTGAGGTTGgaccttttgatttgtcaacggcGACATATAATTCAAG
TATAACTTTGtttatttaaaatgttttatggTACAAACTTGGTACTCTGT
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CGCTGGCAATAAAATTGCTACAATTTCATACCAATAGGTTTGTAGCACTT
CAAATGATAcagaaaataataattgatagCCAATTGATGTTCCCatttag
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TACAGGAAGTAGTTAGGAAATAAAGGCTCTATTGTTTTGACCTGAGAACG
CAAGTAAACTTCGCAAGTCGATTTCTAATAAATTTCCTTTTGTTGCATAC
Tcaggggggggtgaagcagttagtacaagacatcatgcctactaactgct
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CTCCAAAATTTGACAGtatttaacttttatttttttggtactGATTACAG
TATTGGTGAAGAGAAACTGATAGCACCATGCAAGTGTGCTGGTTCGACAC
GTTATGTGCATGCTTCATGTTTGGTCACGTGGTTTAAGAAAAGTGTCAAA
CACCAATGTGAACTATGCAAGTCAGACGTTAAAATACGGAAAATCAATCA
TCGTATACTACTAGTAAGATAATGGTCCCTTAATGTTTTTCCGTCAAGAC
AGAAATTACTTTGACTGTGTGTGAACTTGCATCTGGAATTCTTTCATAAA
TTTCTTGCCTCTATGGGACCTAATATACACATCACTTTCAGACATTGTTA
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AATTTATCGGGGCACTTTTCCATGATTTTACATTATAGGATGGTGGCTTT
CCATTCTTTAATATACGtttattctcaactttttggGGAAGATAATCCTT
GAATATTCTTACGGCATTCTTAGTTAATGATCCAAACCCAATCTAAGttt
aagcaaaaatatttattttaaaaaattatttaaagtctTGAGCATTGCTG
GGGGATAATTTAATTGACAATTTACAGATAAAGATGCTCTAAAATTAGCA
AGCTTAGTCCAAGTTGCCAAATTTCATGAATGTGATATTCGTATCATATT
ATCTTTATTGTTTTATGGAACAAACCATTTAAAAAGCGTAAAAGGAAgcc
aaaagaatttttgaatttattattttaaatcacaaatttcttcttttcct
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CGTATTCTTTATTGGTTTATTCTTGAACATTATCTCAATCTACGTGAACG
CTAGCGACTATTGTGAATCGACGGCGTGTTTAATATTCTACGTGGTCAAC
GGGTTTGGTATCGTTCTTGATGCTGCGTTTTTATGGTTTTGGTTTTTAAA
GTGTAAACATTACTGGAAGAAATGGTGTGCGTTGAACCAGGACTGGTTTA
TTGATGATGGGGAGGTGGAAGATGATCAACTGCATGTACGATACGTTCAA
GGATGTCCGGCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000175_pilon:93327..98491+ >XLOC_032847 ID=XLOC_032847|Name=XLOC_032847|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2262bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000175_pilon:93327..98491+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCCGAGACGGAGCTTCTCTTGGCTTCCTCTTCACCAACTTCGTCCAT
CCAACAAACAGAGGAATATGTTGTAATATCGTCCAATCAGAATCGTgata
agaaagaagaaaatagaATACTTGTACCATTATCGAAAGTCCCTTTACTG
AATGCTTGCTCGTTGAGGAAAGACAAAGGGACGAACAATATACAGAAATC
ATTAGAGAACTTTACAGACAGCAATACGAACACTAACAATGATGGTAGTC
CCAGTACTATCACTAAAAGTCGTAGTCGTAGTTGTGGTTTCATTTCTGAT
GTGAATTTCTATAATGAACCTTTGGAAATTTCAATCAATAATAAAGAGGG
TGGTGTTGTACAGGCAACAACAAATGCTCAAGCATCACCTTTGGATGCTT
CAAACACGAGGATATTCACTGCAAACAGATGGCCGAGACGGAGCTTCTCT
TGGCTTCCTCTTCACCAACTTCGTCCATCCAACAAACAGAGGAATATGTT
GTAATATCGTCCAATCAGAATCGTgataagaaagaagaaaatagaATACT
TGTACCATTATCGAAAGTCCCTTTACTGAATGCTTGCTCGTTGAGGAAAG
ACAAAGGGACGAACAATATACAGAAATCATTAGAGAACTTTACAGACAGC
AATACGAACACTAACAATGATGGTAGTCCCAGTACTATCACTAAAAGTCG
TAGTCGTAGTTGTGGTTTCATTTCTGATGTGAATTTCTATAATGAACCTT
TGGAAATTTCAATCAATAATAAAGAGGGTGGTGTTGTACAGGCAACAACA
AATGCTCAAGCATCACCTTTGGATGCTTCAAACACGAGGATATTCACTGC
AAACAGGATAATGCACTGTGATGATTCCAGTTGTTCTGGAGGTCAAGGTT
CTCCATTGGGCAATGCACCAAACATTGAACTACGAAATATCAATGGTCAA
ATTCTCATGATGCCCAAACGACCAAGCTTAGATGCTGATAATGCACTGTG
ATGATTCCAGTTGTTCTGGAGGTCAAGGTTCTCCATTGGGCAATGCACCA
AACATTGAACTACGAAATATCAATGGTCAAATTCTCATGATGCCCAAACG
ACCAAGCTTAGATGCTGGTGATTTGGAAATGCTAATCTACAACAGTCAGC
CGTCTTTCATGTTTCGTGCAGAAACTTCACAAAGTTCAGAATCAGTATTC
TGTAGGATATGCCATTGGGTGATTTGGAAATGCTAATCTACAACAGTCAG
CCGTCTTTCATGTTTCGTGCAGAAACTTCACAAAGTTCAGAATCAGTATT
CTGTAGGATATGCCATTGTATTGGTGAAGAGAAACTGATAGCACCATGCA
AGTGTGCTGGTTCGACACGTTATGTGCATGCTTCATGTTTGGTCACGTGG
TTTAAGAAAAGTGTCAAACACCAATGTGAACTATGCAAGTCAGACGTTAA
AATACGGAAAATCAATCATCGTATACTACTATATTGGTGAAGAGAAACTG
ATAGCACCATGCAAGTGTGCTGGTTCGACACGTTATGTGCATGCTTCATG
TTTGGTCACGTGGTTTAAGAAAAGTGTCAAACACCAATGTGAACTATGCA
AGTCAGACGTTAAAATACGGAAAATCAATCATCGTATACTACTATGGCGG
AAACCGGAAGACAGACCTGTTCCGTTGATATGGTTCACCGTATTCTTTAT
TGGTTTATTCTTGAACATTATCTCAATCTACGTGAACGCTAGCGACTATT
GTGAATCGACGGCGTGTTTAATATTCTACGTGGTCAACGGGTTTGGTATC
GTTCTTGATGCTGCGTTTTTATGGTTTTGGTTTTTAAAGTGTAAACATTA
CTGGAAGAAATGGTGTGCGTTGAACCAGGACTGGTTTATTGATGATGGGG
AGGTGGAAGATGATCAACTGCATGTACGATACGTTCAAGGATGTCCGGCT
TGATGGCGGAAACCGGAAGACAGACCTGTTCCGTTGATATGGTTCACCGT
ATTCTTTATTGGTTTATTCTTGAACATTATCTCAATCTACGTGAACGCTA
GCGACTATTGTGAATCGACGGCGTGTTTAATATTCTACGTGGTCAACGGG
TTTGGTATCGTTCTTGATGCTGCGTTTTTATGGTTTTGGTTTTTAAAGTG
TAAACATTACTGGAAGAAATGGTGTGCGTTGAACCAGGACTGGTTTATTG
ATGATGGGGAGGTGGAAGATGATCAACTGCATGTACGATACGTTCAAGGA
TGTCCGGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000175_pilon | genome | sc0000175_pilon:93327..98491 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 823-1131:4857 |
| Aaloc | 661-822:4102 |
| Aaloc | 559-657:3169 |
| Aaloc | 430-558:2482 |
| Aaloc | 1-426:1 |
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