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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000057_pilon:622066..625746- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031711 ID=XLOC_031711|Name=XLOC_031711|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3681bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:622066..625746- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTTGTGGCTCCTCAAAAGTTGCTGTTAGTACAGTACTCGTAAATGG
CACACAGGATGGCGCCATACTTAAAGATGCTAACGGAAATATCACACAAT
CAAAACCTATTGGTTCTAATGAAAAAGAGAGACTTGGCTCTCAGCTAGGA
TCAAGTAATCGATTAGGTCCTGTTGAAAGTCTTGGTATTTTTCGAAAACG
CAAGAAGAATTTGTATCAATCTCTGGATGTCTTTGAACAAATCGATCAAC
GTTCTGTCACGGTTGGTTTCTTTCGGCTTTCCATTCTAGAACGATTGAAT
TTTCATAAAAACGCCCTGTTCAGTTTTGCTACCTTAAGGGATCTTATTTT
GGCGGGAACTAATTTTGGCGAATTTGGCGAATTTAGACAAAATTCGCCAA
ATTTAGTTCCCGCCAAAATTAAATATTTTGCTCACTCGCCAAAATAAGTT
CCCGCCAAAATTAGATTTTTTGTTTCCTTGCCTAAATAACCCCTGAAATT
CATCAAAATTGCTCAAAATAAGGCAATATAGAACAGATTTACGCTGTCAT
TCGCCAAAATTAGTTCCCGCCAAAATTTAAAAAATTCACTATTCGCCAAA
ATTAGTTCTCGCCAAAATTAAAATGTTTTAAGATTTTCGCTGCTCGCCAA
AATTAGTTCCGGCCAAAATAAGTTCCCTTAAAGTATATATTTTTTAGGAA
ATGTTTTATTCGTGTAAAAATCTGCTTGGAGAATCACAACAAATGTGCTT
ATAAGCACGCAAGCACGTCTTAGATACCTTTAACCACCACGGACTTATTC
ATTTTTTTCTATGTTCAACTCTGTAACCATTGAGCAATCCAATCTAATAG
CGCACCGCAACGCATACGTCATAATTATTACTTTTCACTTTTTTTGACAT
TTGTACGAGTTGCAATCCCACAATTCAACGCGGCTCAATTAAAGATACGT
GCAAGCTGTTATATATCTTTTGTCAAACGATGCAATTAACGTGCAAAAGA
GGTTAGCGCAAAGGTTGATGGGATTGGAACTCGTACAAACACATCGAGAG
TAATGATTATGTCAAAAATAAAATCTATTTTTAGATTCAGCACGGTGCGC
TATTTAAAGTCGGCATTCAGCAGTGTTGACCCAAAAACCGACTTAAGTAT
GAGTAGAGTCATCATCAATTCTCTCGAAAACCGAAAATAAATTGCCCAAA
AAGTCAATCATCTCTTAATGTGTATAGTAGGAGAAAGCGACAAGCAACCA
TCCATATAGCCTTAATAAATAAAATTCCGACCTAAAACTCAGACAGAGAT
CGAAAAAGTTTTGCCGGCCTTCACGTACGTGTCGACGCACTTTTATTGAT
TTACACATCATTTCTGTGTCTAGCTATGCAATCACTGGTTTATTGGCGCT
ACTACTGCTAAAATATTTTTGATTTATTTGGTTTGTGCTTTATTGTAGGT
GCCATCTACTGTTTCAAGGACTGCTCAATCTTTAGTTCAATATTTGACTG
AACCTTACGAAGCACCCCTATTCAAACTACGTGCAATCTGGATATGGGTC
ACTCATAATATCTCCTATGACGTCAATTCTTTTTTCAATCCAAGTGAAAA
GAAAAGCTCCCAGTTAGATGCATCGGACGTGCTATCAAGCGGAAAAGCTA
TTTGCTCAGGTTATGCTAATCTGATAAATGTTTTAGCAGAGTAAGTTGCT
TTTATTTTGTTTTGTTAATTGTACCTTTTGGTTGTGTTTCATAATGAGTA
TCAACAAAAAGCTTCCTTTTGGTTTCTGAAATTCTGCCCCTCTGCAACAA
TAGTACCGTGGTTACGCCCCAATAATTTTTTTAAGGATAAGTTTTTTCCT
CATTTTGTCATTTAAAGACTTTTTAATATGTGCTGTTTTTTAGTCAATTG
TTGCTTTTTGAGTGTATTTTACTATTATAGGGAATAAGGGGCTGTAAATT
TGTAGTTTGGTTGAACTATTATGAAAAAACATTTAAGTAGGAGATCCGCC
TCTAGACGTCGGCTAAATTTTATTGTTTTGACACCCCTGTCTCAAAGAAC
TTACTAATTTTTCAGTTGTTTTAACTTTTAACGTGAATAATAATGCTTTT
TCATTAAATTTCCTTTTTTAATGAATTGGGGTTTTCAAAAAAATGTCATT
CCAGTGAGAATAAGAACCCAGTGTACTTCCCAAAGATGTTGAAAATATAA
TTATCTCACCGAAAACAAGTGTTTGGTCGAATTTTCCTCTGGTGTAATAA
AGGTAAAAAATTGGTTTCTATTATTTTACAGATCAGCTGGAATTAAAACT
GAGCGCGTGGATGGTTGGTCTAAAGGCTACAATTATCAATATGGTCAAAA
GTTTGGAGACATGAGTCCGAATCATGCATGGAATGTCGTAAAACTGAACA
ATGATTGGTGGCTGCTAGATTCAACATGGGGCGCTGGCTACGTAGACAAA
GAGAAGAATTTCGTACGACAGTATAGTGAACATTATTTTTTAACGGATCC
TAAACAATTCATTTTCGATCATTGTCCGACAGACATGCATTGGCAACTGT
TGGAAGAAATGATTGCCGTTGAACGGTTCGAAAATTACGCTCGAGTTACG
AAACATTTCTTTCGCCTCAAAATGAAATTATTTTCACATCAAAACGGAAT
TGTTGTATGCGAAACTGGCCGTTTACATCTTAAGTTCCGTATTGATAAAG
ATATTCCGATAAAATGTACCGGAAAATTATCGGAAGTTGACGGAGATGTG
GATACGGATCAATACATTCATGTTTATTCGACAGAAAAGACGCTTCACGT
TTTAGTCGATGTTCCTCGCGTTGGACAATTTGATTTGAAAATATTCGCAC
GAGAACTGAACTCAGAGCAGAGCAATTTGAATTTAGTATGCAGGTACGCG
ATCACGTGTACTAATAAATTGGGACCGAGCTCAAGTTTTCCTAGACAATT
CAAAAGATGGAGTCCAGGCTTTTATTTACATTCTCCAACTGATGGTGTTT
TGTATAACGGTGAAACGTACAAGTTCCGAATTAGTTTACCGAATGTTACG
GAAATGGCAGTATGTTTGGGTAAGAAGTATTTCTGCTATATCGGCCTTTT
CATCACTTACATCACGGATAACATCTGTCTCATCTTCAAACAGTGTCCAA
TCTTTCATTAATGAAAAGAATGTACCTCCTAGAAACTTTGATGGTTGTCA
TAGCATTGACAAACGCAGCCCTTTATTTAGAAAAGAAAATTTCAATCGAC
CTTTCGGAAATTGAAAAAACCAGCGATGTGAAATAAATTTATGGCAATCT
TGCTTCTAGCGCCAGATTAGGAGTGGTTCTGTCCTGAATTTTGAGTTGGT
CAAAATTCATGGCAAAGAACTAAAATCCTCGACATTTTAATTTCGGGAAA
ACCGATCAAAGAATACCTTAGAGTGTGTTTTATAATATACATGCCATTAT
TTTATTTCGTTTGCATTTATTTTCTTGACAGGTGGAAAGAATTCTACATG
GGAACGCATTCCAAACAGTCGAGGTGCATTATGGGAAGGTGAAATCACGC
TTCCTGATTGGGTGGAACGAGTGAACGTGGTGGCACGTTTTGAAGAAAAA
ACTCCTTTCTCCAGTCTTTTGGAATACAAAGTCGCTGAAAAGGATTGGGC
TATTGAAAATTGTGAAAATGAACATTCATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000057_pilon:622066..625746- >XLOC_031711 ID=XLOC_031711|Name=XLOC_031711|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2982bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:622066..625746- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGGTTGTGGCTCCTCAAAAGTTGCTGTTAGTACAGTACTCGTAAATGG
CACACAGGATGGCGCCATACTTAAAGATGCTAACGGAAATATCACACAAT
CAAAACCTATTGGTTCTAATGAAAAAGAGAGACTTGGCTCTCAGCTAGGA
TCAAGTAATCGATTAGGTCCTGTTGAAAGTCTTGGTATTTTTCGAAAACG
CAAGAAGAATTTGTATCAATCTCTGGATGTCTTTGAACAAATCGATCAAC
GTTCTGTCACGATGGGTTGTGGCTCCTCAAAAGTTGCTGTTAGTACAGTA
CTCGTAAATGGCACACAGGATGGCGCCATACTTAAAGATGCTAACGGAAA
TATCACACAATCAAAACCTATTGGTTCTAATGAAAAAGAGAGACTTGGCT
CTCAGCTAGGATCAAGTAATCGATTAGGTCCTGTTGAAAGTCTTGGTATT
TTTCGAAAACGCAAGAAGAATTTGTATCAATCTCTGGATGTCTTTGAACA
AATCGATCAACGTTCTGTCACGGTGCCATCTACTGTTTCAAGGACTGCTC
AATCTTTAGTTCAATATTTGACTGAACCTTACGAAGCACCCCTATTCAAA
CTACGTGCAATCTGGATATGGGTCACTCATAATATCTCCTATGACGTCAA
TTCTTTTTTCAATCCAAGTGAAAAGAAAAGCTCCCAGTTAGATGCATCGG
ACGTGCTATCAAGCGGAAAAGCTATTTGCTCAGGTTATGCTAATCTGATA
AATGTTTTAGCAGAGTGCCATCTACTGTTTCAAGGACTGCTCAATCTTTA
GTTCAATATTTGACTGAACCTTACGAAGCACCCCTATTCAAACTACGTGC
AATCTGGATATGGGTCACTCATAATATCTCCTATGACGTCAATTCTTTTT
TCAATCCAAGTGAAAAGAAAAGCTCCCAGTTAGATGCATCGGACGTGCTA
TCAAGCGGAAAAGCTATTTGCTCAGGTTATGCTAATCTGATAAATGTTTT
AGCAGAATCAGCTGGAATTAAAACTGAGCGCGTGGATGGTTGGTCTAAAG
GCTACAATTATCAATATGGTCAAAAGTTTGGAGACATGAGTCCGAATCAT
GCATGGAATGTCGTAAAACTGAACAATGATTGGTGGCTGCTAGATTCAAC
ATGGGGCGCTGGCTACGTAGACAAAGAGAAGAATTTCGTACGACAGTATA
GTGAACATTATTTTTTAACGGATCCTAAACAATTCATTTTCGATCATTGT
CCGACAGACATGCATTGGCAACTGTTGGAAGAAATGATTGCCGTTGAACG
GTTCGAAAATTACGCTCGAGTTACGAAACATTTCTTTCGCCTCAAAATGA
AATTATTTTCACATCAAAACGGAATTGTTGTATGCGAAACTGGCCGTTTA
CATCTTAAGTTCCGTATTGATAAAGATATTCCGATAAAATGTACCGGAAA
ATTATCGGAAGTTGACGGAGATGTGGATACGGATCAATACATTCATGTTT
ATTCGACAGAAAAGACGCTTCACGTTTTAGTCGATGTTCCTCGCGTTGGA
CAATTTGATTTGAAAATATTCGCACGAGAACTGAACTCAGAGCAGAGCAA
TTTGAATTTAGTATGCAGGTACGCGATCACGTGTACTAATAAATTGGGAC
CGAGCTCAAGTTTTCCTAGACAATTCAAAAGATGGAGTCCAGGCTTTTAT
TTACATTCTCCAACTGATGGTGTTTTGTATAACGGTGAAACGTACAAGTT
CCGAATTAGTTTACCGAATGTTACGGAAATGGCAGTATGTTTGGATCAGC
TGGAATTAAAACTGAGCGCGTGGATGGTTGGTCTAAAGGCTACAATTATC
AATATGGTCAAAAGTTTGGAGACATGAGTCCGAATCATGCATGGAATGTC
GTAAAACTGAACAATGATTGGTGGCTGCTAGATTCAACATGGGGCGCTGG
CTACGTAGACAAAGAGAAGAATTTCGTACGACAGTATAGTGAACATTATT
TTTTAACGGATCCTAAACAATTCATTTTCGATCATTGTCCGACAGACATG
CATTGGCAACTGTTGGAAGAAATGATTGCCGTTGAACGGTTCGAAAATTA
CGCTCGAGTTACGAAACATTTCTTTCGCCTCAAAATGAAATTATTTTCAC
ATCAAAACGGAATTGTTGTATGCGAAACTGGCCGTTTACATCTTAAGTTC
CGTATTGATAAAGATATTCCGATAAAATGTACCGGAAAATTATCGGAAGT
TGACGGAGATGTGGATACGGATCAATACATTCATGTTTATTCGACAGAAA
AGACGCTTCACGTTTTAGTCGATGTTCCTCGCGTTGGACAATTTGATTTG
AAAATATTCGCACGAGAACTGAACTCAGAGCAGAGCAATTTGAATTTAGT
ATGCAGGTACGCGATCACGTGTACTAATAAATTGGGACCGAGCTCAAGTT
TTCCTAGACAATTCAAAAGATGGAGTCCAGGCTTTTATTTACATTCTCCA
ACTGATGGTGTTTTGTATAACGGTGAAACGTACAAGTTCCGAATTAGTTT
ACCGAATGTTACGGAAATGGCAGTATGTTTGGGTGGAAAGAATTCTACAT
GGGAACGCATTCCAAACAGTCGAGGTGCATTATGGGAAGGTGAAATCACG
CTTCCTGATTGGGTGGAACGAGTGAACGTGGTGGCACGTTTTGAAGAAAA
AACTCCTTTCTCCAGTCTTTTGGAATACAAAGTCGCTGAAAAGGATTGGG
CTATTGAAAATTGTGAAAATGAACATTCATAAGTGGAAAGAATTCTACAT
GGGAACGCATTCCAAACAGTCGAGGTGCATTATGGGAAGGTGAAATCACG
CTTCCTGATTGGGTGGAACGAGTGAACGTGGTGGCACGTTTTGAAGAAAA
AACTCCTTTCTCCAGTCTTTTGGAATACAAAGTCGCTGAAAAGGATTGGG
CTATTGAAAATTGTGAAAATGAACATTCATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000057_pilon | genome | sc0000057_pilon:622066..625746 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1294-1491:199 |
| Aaloc | 505-1290:1400 |
| Aaloc | 262-501:2234 |
| Aaloc | 1-261:3682 |
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