|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000057_pilon:1188570..1191174+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031666 ID=XLOC_031666|Name=XLOC_031666|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2605bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:1188570..1191174+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGTTAACAATTGGAATCATTCTCTTCGCTTTATATACAGTGAATGC
TGTTGATCTAAAAATGTGTGAAAGACGTAAGTTACAATATAATCTAACAA
AATCTATAGACgggaggcgtttattcgaaggggcgtttaaaagaagggga
tTTTTTAAGAAGagggtgtttattcgaagtaatacaaTATGTGATAATGC
TGAAGTGTTTTATCCACTAAAAGTTAATTTTCCCTTTTCTATTCACTTTT
CTGCTGATAAATTGACTCAATAACTGATTACTCCAATATGAAAGATAGAT
TTCCAAACGCTTTGATCGTTACTTCATTATATTCTATTTTTCAATTCTCT
TATAGAACATGGAGGACTCGGCAACTGGATGGACTGGGGTCCTTGCAAAA
ACAAAATGGGCTACGAATGCAGACATCGATACTGTGATAGTCCCGTCCCC
AAATATGGTGGATACCCTTGCTCAGGAGAAACAACACAATacagaaaaat
cgaaaaagtcgATGGAGGCTATGGGCCATGGATGAAATGGGGTGCCTGCA
AAGAAGTGGGTTACCAATGTCGATTCAGATTCTGTGACAGTCCTAAACCT
ATGTATGGTGGAGCTCCTTGTGAAGGTGATATGATGGAAAAACGAATGAC
GCCCGCTGTAAATGGCGGATTTGGTAAATGGATGGCGTGGGGACCATGCA
GTAAAACTTGCGGGGAGGGCGGTGTTCAAACTCGACATCGATTCTGTAAT
TACCCTAAACCAATGTATGGAGGTATGGACTGTGACGCTAAAGCCAGTAT
GGAAACTAGAGCCTGCCCAGCTATGTACATGGAGGCTTGCCCACGTAAGT
ATTTTCACCATATAATGGCACAGTCATCTTTTTCTGTTCTATAATTATTT
TCACAGATCTTATACAGCTTGCAGTATATCAATGTTTCGTTGAGAAACTT
TAATGAAGCTATATCGAAATTTTGATGGAGTGATTTCCAATCAACTTTGA
CTTATTCAACCAAGAAGGTCTACCAGCCgactaatttaaatttttcttca
attcaTCATGACAACTTTGAAGTTTCTTTTTGCCGATCTTCAACCTGTGA
AAACGTAAATGCTCAAAACTTATTTATACAACTACTTTAGAACAATAAAA
TCAGAACACTGTTTTATTAAGTACACTTCTACTTTCTATATTATAGCACC
AGGAGTTTTGGGAACCAAAGGAACTTATGGTAAATGTAGCCGTGGATGTG
GAGGACAACGTCAAGTTACTTACCCTTGCAACATGCCAGAGGTTTACTCT
GCTGATGCCAAATGCTACATGGGATGTGCCAACACTATGCAATATGAGAA
ATGCAAATGTGAAagtatgtttctctttttcGGTTATATTGTTCTTTACA
CTTTCTACTGTTGTGTAAAATCTTCAATGGCGATTGGCTTTCAGTTTCCC
CTATttatgaaacttttttaataataatgtTTAAGAGTGGAGAAATGCGG
TaaaaaaaGCTAAACTAATACACTGCAAAGCTCTCTATAACTGATCATAA
TGCGAATAGTTTTTAAGCACAATTGTTACCTGCATTGATGAAATCCATAC
CGAATCATATCTTTTTCCACCAGGTGATGGACGAAATGTTTGCCGATCTT
GTAAATCACAAACCGATCGAATGATCCAAAAATACCGACTTAGTAAGTGT
GATACCAAAATTGTTTTAACTTTATTCTCTAACTCCCAATCAGCCTCTGT
GGTTGCGTATTCTTCTAAGAGAGTGATGTATTTTGACCTGGAATAATCGT
ATATTTCTTCTAGCTCTTATATTGCattaagtttaagtttaagttttGTG
AATGGATAAAATGCTTTCAACCAGAACCAGAATGCTCTACAATAATTGAT
AATCACTAATGCAAGACTCTCTATTTCAATGCAATAGAAATCTCTAAATA
ATCGAAATTCTTCTTTCACTGTTTAGATGTTACCGATGTTGGGCTTGCCT
GCAAATTAGAGAACGATTTAGCTACCAAGATCTGTGGTCGTCTCTCAGGT
GGCATCCGTGATATGTACCCTTCCAACGATTTCTACTTTCTTCATTGTTC
TGATGATGGACCTTGGTGTAAACCATGTGCCACTCGTGATTTAGTTTACA
ACCCAAAATGCGGACAATGTGAAAAGACCAGAACTTCGCCATGCACTGGA
CCAAGTAAGATATTTTGTATTATTCCCGCCATTTTCAAAAACCGGATTGg
tcaaattgtaaacaaagttttttgtataagagcaaactatataagaacat
aaggcttcgatgaccaaattgataagaacaattaagaacattttaaggct
tcacggactcaaaaacacccgatttcttaaacAAAACAATACTCACAGAA
AACAGaatggtgaaaatgagaatATAGAAGTTTctcttcttcatcatcat
ctCCAACGACATAAGTTTACTCAGAATATTTTTAACAACCACAGTAtctt
aaatttatttcaattttttattccttaggaaaatgggtcaAGAAAGATGC
TCCATCCTCAAATGACCAAGTTGCTGATATTTTGAACGATGCTGACCTTT
GGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000057_pilon:1188570..1191174+ >XLOC_031666 ID=XLOC_031666|Name=XLOC_031666|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2214bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:1188570..1191174+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGTTAACAATTGGAATCATTCTCTTCGCTTTATATACAGTGAATGC
TGTTGATCTAAAAATGTGTGAAAGACATGAAGTTAACAATTGGAATCATT
CTCTTCGCTTTATATACAGTGAATGCTGTTGATCTAAAAATGTGTGAAAG
ACAACATGGAGGACTCGGCAACTGGATGGACTGGGGTCCTTGCAAAAACA
AAATGGGCTACGAATGCAGACATCGATACTGTGATAGTCCCGTCCCCAAA
TATGGTGGATACCCTTGCTCAGGAGAAACAACACAATacagaaaaatcga
aaaagtcgATGGAGGCTATGGGCCATGGATGAAATGGGGTGCCTGCAAAG
AAGTGGGTTACCAATGTCGATTCAGATTCTGTGACAGTCCTAAACCTATG
TATGGTGGAGCTCCTTGTGAAGGTGATATGATGGAAAAACGAATGACGCC
CGCTGTAAATGGCGGATTTGGTAAATGGATGGCGTGGGGACCATGCAGTA
AAACTTGCGGGGAGGGCGGTGTTCAAACTCGACATCGATTCTGTAATTAC
CCTAAACCAATGTATGGAGGTATGGACTGTGACGCTAAAGCCAGTATGGA
AACTAGAGCCTGCCCAGCTATGTACATGGAGGCTTGCCCACAACATGGAG
GACTCGGCAACTGGATGGACTGGGGTCCTTGCAAAAACAAAATGGGCTAC
GAATGCAGACATCGATACTGTGATAGTCCCGTCCCCAAATATGGTGGATA
CCCTTGCTCAGGAGAAACAACACAATacagaaaaatcgaaaaagtcgATG
GAGGCTATGGGCCATGGATGAAATGGGGTGCCTGCAAAGAAGTGGGTTAC
CAATGTCGATTCAGATTCTGTGACAGTCCTAAACCTATGTATGGTGGAGC
TCCTTGTGAAGGTGATATGATGGAAAAACGAATGACGCCCGCTGTAAATG
GCGGATTTGGTAAATGGATGGCGTGGGGACCATGCAGTAAAACTTGCGGG
GAGGGCGGTGTTCAAACTCGACATCGATTCTGTAATTACCCTAAACCAAT
GTATGGAGGTATGGACTGTGACGCTAAAGCCAGTATGGAAACTAGAGCCT
GCCCAGCTATGTACATGGAGGCTTGCCCACCACCAGGAGTTTTGGGAACC
AAAGGAACTTATGGTAAATGTAGCCGTGGATGTGGAGGACAACGTCAAGT
TACTTACCCTTGCAACATGCCAGAGGTTTACTCTGCTGATGCCAAATGCT
ACATGGGATGTGCCAACACTATGCAATATGAGAAATGCAAATGTGAAaCA
CCAGGAGTTTTGGGAACCAAAGGAACTTATGGTAAATGTAGCCGTGGATG
TGGAGGACAACGTCAAGTTACTTACCCTTGCAACATGCCAGAGGTTTACT
CTGCTGATGCCAAATGCTACATGGGATGTGCCAACACTATGCAATATGAG
AAATGCAAATGTGAAaGTGATGGACGAAATGTTTGCCGATCTTGTAAATC
ACAAACCGATCGAATGATCCAAAAATACCGACTTAGTGATGGACGAAATG
TTTGCCGATCTTGTAAATCACAAACCGATCGAATGATCCAAAAATACCGA
CTTAATGTTACCGATGTTGGGCTTGCCTGCAAATTAGAGAACGATTTAGC
TACCAAGATCTGTGGTCGTCTCTCAGGTGGCATCCGTGATATGTACCCTT
CCAACGATTTCTACTTTCTTCATTGTTCTGATGATGGACCTTGGTGTAAA
CCATGTGCCACTCGTGATTTAGTTTACAACCCAAAATGCGGACAATGTGA
AAAGACCAGAACTTCGCCATGCACTGGACCAAATGTTACCGATGTTGGGC
TTGCCTGCAAATTAGAGAACGATTTAGCTACCAAGATCTGTGGTCGTCTC
TCAGGTGGCATCCGTGATATGTACCCTTCCAACGATTTCTACTTTCTTCA
TTGTTCTGATGATGGACCTTGGTGTAAACCATGTGCCACTCGTGATTTAG
TTTACAACCCAAAATGCGGACAATGTGAAAAGACCAGAACTTCGCCATGC
ACTGGACCAAgaaaatgggtcaAGAAAGATGCTCCATCCTCAAATGACCA
AGTTGCTGATATTTTGAACGATGCTGACCTTTGGTAAgaaaatgggtcaA
GAAAGATGCTCCATCCTCAAATGACCAAGTTGCTGATATTTTGAACGATG
CTGACCTTTGGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000057_pilon | genome | sc0000057_pilon:1188570..1191174 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1033-1107:2531 |
| Aaloc | 805-1029:1979 |
| Aaloc | 736-801:1626 |
| Aaloc | 568-732:1199 |
| Aaloc | 79-564:358 |
| Aaloc | 1-75:1 |
|
