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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000057_pilon:615153..619862+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_031646 ID=XLOC_031646|Name=XLOC_031646|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4710bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:615153..619862+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAAAAGACATTCAAAGAGCAGCTGAAGTCATTCAAAAAGCTCATGC
TTTGCTTATAACTTCTGGCGCTGGTATGGGAGTTGATTCAGGCTTGCCTG
ATTTTCGAGGAGATGAAGGCCTTTGGAAAGCCTATCCACCTTTAAAAAAG
AGAGGGCTTTCTCTCCCCAGTAtggtaagtttttttaaagacgATGATTA
GAATAAAATGTGTTTGAGTTCAGAagtttttttctagaaatttttttgac
agcCGTTTAATCAGTTTAGTAGGTAGGCAATCATGAGGGTTATTTAACCA
GTTATTAAAAGACCATATCATTATCAGTCAggcagtcagggaaatccctc
aatacaccgtttaggagtcttgCCTCCTCCACCATGTTCCACCGTGAata
cggtaggtaaaaatgtgcactttagtactgtggaatgTTAGacagtatag
accttttttcaaagaggccaccctgttgaataattatgtagtccagcaga
aaaacaatgataaaaccatgcataattattacaatatgcatgatacagta
attatgcatggctctattattgtttttatggctggactacataattattc
aacaggacgtcctctttgaaaaaaggtctatagacctaactcttcacccA
AAAATTATGGGAAGCGCATGTTttgactttgtaccctatgctgcactcaa
gcacttaagccaaagtcccgcaaaggcgggacaaaaatcagttttttgaa
gtttgcaaaaaaacgccacatagaagatctttcaaattcagtatgtgaat
agagcagtaaaaaatacaacttttctatttttccttttttttgcaaaagt
tctaggaatgaaaataaagggataatgataattgaatactatccattgat
gacccgcggcactatcgtaaagctagaatcgctttgcgtactcttcgctt
gagaaaatgattgacagattgaagtttttcacccgcgcaggagtttgcga
agcattctcggctcaatcccactgacctttatataaccctggaccaagca
atacctgccatctttgattggagtttttttagaattggtacccaaggaga
agccaatACGTTTTTAAGTTAgagttcaaaaaaaaaaagagttcaaaaaa
aaattgcagtgctaaaaattaacatctaacgccgctacatcatcaaaaga
atttgggggaaagtagacctagcgctctcgatgcatttacaccgttatcg
agtagtgccgacattagggtaccaattttcaaaaaactttgatcaaagat
tttgctttgctgggattgagaagctttgtccagggtatataaaggtcagt
gctcaatcctcggaccgcgctaaaaatggtagactgagctgtgatagatc
atatcgatggaagttgttggaatgtttacaaggctcttgacagaaaatcg
tttgttttattgtcaatgatgacagtgcggttattaattttgttagatct
gacaaattgatgtttgtaagtgcactttatagttttgattcccattgaag
aatcatattctggttttcatgttattagatgctgttttagagctttaggt
ctacactgttagaggaatgtaaacattgtcaattttttctttccttcaaa
aagaatgatttatatatttgaacatgatatcaatgataatcttatggatc
tctcctgaaaatttcacaaaaattcatctagaggaaaagaagttatgatt
aaaaggagttctttacctaccgtttttctgctgggtttccttatgaaaac
caaatttttacctaccatttttttacGCTCTCCCCCGTAGTTTCCCGCGa
tcactaaaatcaaaacaatggaaaattgtttggacgcatgcgcagtcgac
actactaaacggtgtattgcgATATACTGCAAATTTTCATTTGTGGTTAT
TCTACAATAGActgcaatcacaaatatcttcatttcgtgTCCTTGGTCAA
TTGGTCGGTTGGTCAGTCGGTTATGGTCGGTCAGTCGCTCGGTCAAAATG
gcacatgtaatgataaacaaagtcaaaatgctgcgaatgcgctagaaatc
acTTGCAAAAAGTCGgcaataataaattttttgaacgaaggaaaggtcat
tgacataaaaagtctgacaaatttaccgactcgcCGACTctattctactc
aattttcgagagttggtcgggcgacgcgaaacgaagatatttctGATTGT
CGCCATATGAAAAATGTTAAAGTGACGTTTATACCCCAAcagtaaaaaat
tactaccgcaattgaaggatttccctgactgattATTATAgcatagacct
tttgctagatACAAAATGTCATGCAAGTTGgttaattaaaaactccagca
ctAAAAAATCACACATAATTGCATAATCTTTATAAGCCTGCACTAAATTT
TCTTATTGTTGTTCTAATgctagagtttttaattatccAACATGTCATCA
CGTCTAGCAAATGATAAAAGGTACATAGTAAGGGTATTTCGTtacaattc
ttttgtttttaaaaattgagtATTCGGTGGTTGACAGTGATGATTCTGTC
TTCTAACTGCTTCTAATGGtcctaaaaatagttttcatgCATGATGCATC
ATAACAGCCTAGACACTAGCAGGGTTGCTACGTCTGCCAGAAATGTCTGG
AATTAGGTTAAAGTCTTGGAATATCTGGAATAAGCGCACCGGTCTAGAAA
AGTCTGGAATTGTCATTCATGTCTGAAAAAATATGGAATTTGAAGGAAAT
AGTCCTGAATGAAGTCTAGTAAACTTCCCGAGGAAACTTTTATCCTGGCA
TttgaaattcgcaaaaatttctGCTCGCAGAGGTAAAAACATCTGGAAAA
ACATGGCTTTTGAGACTAAAAGTCTAGAATTTTGAACTTGACGAACCTGT
AGCAACCCTGACTAGAGACATTCTAACTAGATTgtgaaaagttatttttt
atttacagaGTACCCCTCACTGGTTTAAGACAGATCCAAAATTTGCATGG
GGTTTCTTTGGTCACCGTATCATGTTATACCAAAAAACAGTTCCACACAA
TGGCTTCAGGATTCTCCAGAAATGGTGCAAGAATCGTAAAAAAGGACATT
TTGTGATGACCAGTAATGTTGATAACCAATTTCAAATTTCTGGATTTGAC
GAAAACGAAATTGTCGAATGCCATGGAAGTCTTTCCTATTTTCAAAACTT
GGAAGGAAGTGGTAGTATATGGCCCTGCCCTAAAGATTTCTCATTGGAAA
TAGACACTGAAACATTTAATGCTGTTTCCCCACTACCGACTGGTCCTCCA
GGTACGTATTACTTTAGCTAAGGAATGAAATCTTTAGCCATTGAGATATT
AAATTTATTGATAGAGAAtggatttttctcaaaaatttaaaaaaatacac
cttttcgatcgtagccgccaatttccgcgcaggcatttttttatccgctt
tatcccactaaaaccgtcccagtccttttttcgcacctatagacaatata
TGTATTTGCCTTTCTTTTTAAACACCCACGTCTTTTTAACCACAGGCCAA
GGGACCttgaaaatcatgaattttaacCGGAAGCCTTGAAAAATCACAAA
TAAAATGGGGGCTTGGCTTTTAGGGAAggtcaaactgaaaatttgacact
ttttgaatggttactagGTTGTCACTGTAAGATGAATTGGAGGTTCAGAC
CTCTCTATACACTATGTAAGCATTATCTTTGCTATTAAGATCGTGTGTTT
GTCTTGTTTTGGCTCAAGCTATTAttaaggccggcgcaaatgaatccaac
atttgatccaacaataatgctggatcaaatgttggattcatttgcgccgg
cctttacTGCTttttggcagttacatcaatatgccaaaaacattttatat
ggttcgtcctataaaaggaagttcattctatggtggcctatcttgaagtg
aagggggttgaacaaaatgtttttggcatattgatgtaactgtttggTCT
GTGTTTTTTCTGTCAAGTTTTTCGAGCTCGCTTTGCCCCCAATTATCTTA
TTCTTTGAGTTAAGTAAAGAATAACTTTATTGATAGTTATTAATAAAGTA
AAAACTTTTCTATAGTAATAAAGCTGCGAAGAATCTGACAACTGAGGTAT
TTAAaccattttgataaatttgaataAACGGCCCATTGCACGAGCAAAAA
CTTAGACATCGATTAAATATTGACTTAGAAAACTTTGAACCAGAACATAG
AAAAAAGTAGTTAATAGTGAAAGTTTTTTGATCACCTAAAATTTGTTATT
TCAGATGCAGATCCTGGACAACAAACACTAAGCAGACCAAACGTCTTGAT
GTTTAACGATCATTTCTGGGTTGATGAACGCACTGAACAACAATTCAAGC
GATTTTCTGAGTGGCAATACCGTATAATGCCATCCGAATCACTTGTGGTC
ATCGAGATTGGCGCTGGACTCGCTGTCCCAACTATACGATACCAGAGCGA
ACGATCGAGTTCTATGAATCAGAACAGTTATTTAGTACGTATTAATCCAC
GAGATACGGAGATACCACGTTCAAAAGATATTAGTATACCACTGGGTGGT
TTGGAAGCATTGACTTTGATTGATGAATGTTTGAATGAAATGAATAATAA
TGAAACCTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000057_pilon:615153..619862+ >XLOC_031646 ID=XLOC_031646|Name=XLOC_031646|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1746bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000057_pilon:615153..619862+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAAAAGACATTCAAAGAGCAGCTGAAGTCATTCAAAAAGCTCATGC
TTTGCTTATAACTTCTGGCGCTGGTATGGGAGTTGATTCAGGCTTGCCTG
ATTTTCGAGGAGATGAAGGCCTTTGGAAAGCCTATCCACCTTTAAAAAAG
AGAGGGCTTTCTCTCCCCAGTAtgATGAGAAAAGACATTCAAAGAGCAGC
TGAAGTCATTCAAAAAGCTCATGCTTTGCTTATAACTTCTGGCGCTGGTA
TGGGAGTTGATTCAGGCTTGCCTGATTTTCGAGGAGATGAAGGCCTTTGG
AAAGCCTATCCACCTTTAAAAAAGAGAGGGCTTTCTCTCCCCAGTAtgaG
TACCCCTCACTGGTTTAAGACAGATCCAAAATTTGCATGGGGTTTCTTTG
GTCACCGTATCATGTTATACCAAAAAACAGTTCCACACAATGGCTTCAGG
ATTCTCCAGAAATGGTGCAAGAATCGTAAAAAAGGACATTTTGTGATGAC
CAGTAATGTTGATAACCAATTTCAAATTTCTGGATTTGACGAAAACGAAA
TTGTCGAATGCCATGGAAGTCTTTCCTATTTTCAAAACTTGGAAGGAAGT
GGTAGTATATGGCCCTGCCCTAAAGATTTCTCATTGGAAATAGACACTGA
AACATTTAATGCTGTTTCCCCACTACCGACTGGTCCTCCAGaGTACCCCT
CACTGGTTTAAGACAGATCCAAAATTTGCATGGGGTTTCTTTGGTCACCG
TATCATGTTATACCAAAAAACAGTTCCACACAATGGCTTCAGGATTCTCC
AGAAATGGTGCAAGAATCGTAAAAAAGGACATTTTGTGATGACCAGTAAT
GTTGATAACCAATTTCAAATTTCTGGATTTGACGAAAACGAAATTGTCGA
ATGCCATGGAAGTCTTTCCTATTTTCAAAACTTGGAAGGAAGTGGTAGTA
TATGGCCCTGCCCTAAAGATTTCTCATTGGAAATAGACACTGAAACATTT
AATGCTGTTTCCCCACTACCGACTGGTCCTCCAGATGCAGATCCTGGACA
ACAAACACTAAGCAGACCAAACGTCTTGATGTTTAACGATCATTTCTGGG
TTGATGAACGCACTGAACAACAATTCAAGCGATTTTCTGAGTGGCAATAC
CGTATAATGCCATCCGAATCACTTGTGGTCATCGAGATTGGCGCTGGACT
CGCTGTCCCAACTATACGATACCAGAGCGAACGATCGAGTTCTATGAATC
AGAACAGTTATTTAGTACGTATTAATCCACGAGATACGGAGATACCACGT
TCAAAAGATATTAGTATACCACTGGGTGGTTTGGAAGCATTGACTTTGAT
TGATGAATGTTTGAATGAAATGAATAATAATGAAACCTGAATGCAGATCC
TGGACAACAAACACTAAGCAGACCAAACGTCTTGATGTTTAACGATCATT
TCTGGGTTGATGAACGCACTGAACAACAATTCAAGCGATTTTCTGAGTGG
CAATACCGTATAATGCCATCCGAATCACTTGTGGTCATCGAGATTGGCGC
TGGACTCGCTGTCCCAACTATACGATACCAGAGCGAACGATCGAGTTCTA
TGAATCAGAACAGTTATTTAGTACGTATTAATCCACGAGATACGGAGATA
CCACGTTCAAAAGATATTAGTATACCACTGGGTGGTTTGGAAGCATTGAC
TTTGATTGATGAATGTTTGAATGAAATGAATAATAATGAAACCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000057_pilon | genome | sc0000057_pilon:615153..619862 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 520-873:4357 |
| Aaloc | 175-516:3009 |
| Aaloc | 1-174:1 |
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