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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000066_pilon:648711..652584+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_030354 ID=XLOC_030354|Name=XLOC_030354|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3874bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:648711..652584+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTGTTTTTGCTGTACTTTTTAATCATTGTGCATTCATGTCAATGACGAA
TAATCAGTATCTACTCGAACTAAatggtatttatttttaattaaaaatac
aTGTTAATGCATTTCAGTATCATTCACATTTCATCCAATTCAAAAGTAGA
CACACAAACatcaataattttttgattCTTGCTAGTACTACTAATTCTTC
ATGACTCATAGCATCTGTTtgcaatttttgacttttgcagAAGAAGATAC
AAGTATGCAACAAAGGGGAAATAGAAGGAACAAAGGTACCAagattaatc
atttttcatacATTCACACACTAATTAGTAAAttgcaaaatattctttaa
cTGTTAGGCTATACTTGtaaaatgaatttctttttacagGAAAATTGAGT
CCTTTAGATTCTTATTGATCTTTACTTTCAAAATTACTCACCCTAATGAC
ATTCGGAGAACACTCAATGACATCATTTTACGTCACATAACTCACACTCT
GTACAAAAACATAGAATTGATTATACATACAGTATTTTcatcagcaaatt
ttttttaggaAAGCAGCCACCGCAACAGCAACAGTTTTACCAACCTTCAC
AGCAACAAAATTCATATACTCCAGAACTATTCGATGATATGTCAGCCTac
aaccaacaaccacaacaaaccacaccaccaaGTAGTATGATGCAACCCAA
TCAGCCGATGCAACCAGCTCAAATGACATTCCCAGGACAAGAGCTTCTAC
AAGATCCAAACATGGCAAACATGGCAACTAATATGGCGATGCAATATGGA
CAGCAGTTTATGCCGGCTGGTAAAGAGTTTGTTGAAAAGAAGGTATCAAA
CTAATGTGGGTTTTTTACAATGTTTATTTAGAAAAGGTGTTATTCTGTTG
AATTAAATTTGCATCACTCAGAACAATTATAACAAAATACCTTCCGTTGT
AATTACTTAGTTTCAGTTCTAGCGTCTGTAAAACTCTTTgcattttcaaa
atcatttcgTGATTGCAATATATCCAAATAATAATAACTTTATAGTAACA
AATGTTTTGAGTGACAAACTCCGAAAAATTTAACAGATTTTAGACAACTG
AGAAATTGTTTCCAAGATGGCAGGTCTAtgaatatttctaggagatatCT
GATATTGATATTGACTACTTTTCCATTTTAGCTTGATCATTTCTTgtcag
tttcaaaattgaagTATTATTTTGCTGTTGACACTACTTACGTCCTCAAG
AAATTAGGATTACTTGTCTTCCCATTCGCACATAAGGTGAAAATCATTAT
TAATGTTATAATTCCAATGTGAAGTACATGGCAAGTTTCAAGATTTTTTG
GTATCAAAACGTCTTATCTTAGCTTCAGATGATGGTTTTTAGAAAGCATT
GAAGGATTATGGAAAGAATCTTTTGGTCTATATTTCATTTTTGCTATCCC
TTTAAATTCTGACTAGTACATTGACCTTAAGCATGCACTCTTTTTCGCTA
CTATGTAGAAACCACTCTTGAGAGCTGACATGGTTTCTACACAGTAGCAA
AGAAGAGTGCACACTAAAGAGAATGATTTTTATGTCTGGTACCTATTTTG
ACTTTCCAAATGTTACAATTTTGAATCTTTCAATCCTCAACTTTTGCTTT
AAATCATGaatattcttcttcttttttcaggaTTGGTCTTTGAAATATGA
TAATGCAGAACCAGTTGCTCCTCGCTTTGAGATCAATGCTCCTGACCTTT
ATATTCCATGTAAGTTAAAAATAAAAGCATCCTTGTTTCTTTAAAAGAGG
CCTCTTGTCATGCAGAGTTTGAGCTCTTAATTGAAGAGGTCTTGAATAAA
TGTAATCCGACATCGAAGTATTGATTCTGACCAAAAGTGTGTAAAGACCT
CAACTACAAAGGTGATATTGATTTAAGATAATACTGCTACGACCAAAGTT
ATGATAGATGACAATATGTCAAAATGTAGAATATTTTCAAGAGGTGTCTC
aactaaaaattaagaataagtCAGCTTGAATTTGCTGCATTTAAATTTTC
CTGTATTATTTCTAGCTATGGCTTTCGTTACATATGTATTGGTTTGCAGT
GTAATACTTGGTACACAGAATAGGTATGACTTTAAAAGGTTACCATTATC
CCTTAAATTTtaagggggaggggggttactagggttgtgagctgacgggt
atgttcCGCCCCACTTTCAACCCTCGCACCCTTAgcaggactaaaaagga
ggaaaataggagaaatttgtgaaatatttttaatatccCCTTATTGGgac
caaatttgaccaatttaagattttttacggggcaaataattcaaaaaatt
gaaatttccctatttttccgaccctaagTGGGACTgaattttcttcttaa
aaaacactaaaaatgcTTGAATAAGTGGACCTTgaagtgtattttgtttt
gtaaaaataGTTAAAAGTTTCCCTAAAGCCATTTAGACTCATTGTGAGAG
GATTATATTTAAATTTAACAAATACCATCAAGGGTTTTGCTTTGTGTTTG
GTAGGAttgcgaatgaaaaattaactcgcGATCTCTAGATTCTAGACCGG
CGAATTCTTAGGAGTGTGTTGAGTGTATTGATTAGCATAAATATGTACTT
GATGCGACGAACAGAACTTATCAAACGGCGaattggaatttttttcgaat
aagACCCCTGATGGGTGACCATTCATTTCCTTTCATTTAGATTCACTCCA
GAGCAGCTAGGAATGACAGCAAGTTCAGCATTTGTTTGGTTATGTATTGA
ATTAATTGTCATCGTAATGATTATGTATTTAATTGGTATCTCTGGTAATA
TCAAATATTTGGATATACTTTCTTTTTGTGGTTACAAATATGTTGGGTAG
GTAAATTGTTGAATTGAGAACGttcaaagtaaaaatttatatatatgtAT
TCTGAGGTAGCTAATTGTCATTTGtgcgtttttcaaaattcctttTTGTC
CACTACTTGAAATTATTGAATTATTGTCACATCGGGAAAAACTACATTAC
TCGGAAAAACCTTCATAACTCGTGAGGACTCCAATTACTCGAACGAGTCT
CGTCATTTAAAGAGAGttttagcttttttcgcttttgtacacattctatt
tctttgctatttttttcactatctcgtaaagtaaaagctttttagataat
ttaaCCATGtcaaacgatagcccttgacccaatatGCATTTGTGGTGTAA
TGTCAGtggtggtcaaagcaaatttttcaggaaattagCAATCCCAGGGC
TTGCCCGAAAATTAGCGTTGCTTGTAAAAAAGATGTGTATTACTCATGGG
ATTAAAATGTCAGGATTTAACCCATAAAATGGAATTATTGTATTGTCTTT
GCAGACctttctcaatattttgattctttttcacAGAATGATATTGACAT
CAGTATGCGGATTATTATTTGAAGCCACTGGATATTATGCTTCCTTATTA
TGGTGTAGTGTGGCTATCTCATTTTTCATAGTAAGTTTTATTGTTCATAT
ATAATTATTTAAACCTAGTTATACAGACACACAAACTCTTGAGTGTGTGT
CAAAGTAGGTGGGGTttgtactaaaatctcagacacaTAAATTTAATTCG
ATTTAGTTTCATTCACTTTCTTGTTCTCCACTTAGGCTCGATCACTTCGC
CTTGTCATTAATCCTGAGGATCATTCAGACAGCGTATCTCGATCAACCAG
TGGTAATAAACGACGTCTATACATTCTACTCACTGTCTCACTTATTCAAC
CAGTTTTCATGTACTTTTTAACGAAACATTTGATTCATTATACACCAccg
aaaattatgaaaatgtctGGATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:648711..652584+ >XLOC_030354 ID=XLOC_030354|Name=XLOC_030354|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2172bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:648711..652584+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTTGTTTTTGCTGTACTTTTTAATCATTGTGCATTCATGTCAATGACGAA
TAATCAGTATCTACTCGAACTAAatgCTTGTTTTTGCTGTACTTTTTAAT
CATTGTGCATTCATGTCAATGACGAATAATCAGTATCTACTCGAACTAAa
tgAAGAAGATACAAGTATGCAACAAAGGGGAAATAGAAGGAACAAAGAAG
AAGATACAAGTATGCAACAAAGGGGAAATAGAAGGAACAAAGgaAAGCAG
CCACCGCAACAGCAACAGTTTTACCAACCTTCACAGCAACAAAATTCATA
TACTCCAGAACTATTCGATGATATGTCAGCCTacaaccaacaaccacaac
aaaccacaccaccaaGTAGTATGATGCAACCCAATCAGCCGATGCAACCA
GCTCAAATGACATTCCCAGGACAAGAGCTTCTACAAGATCCAAACATGGC
AAACATGGCAACTAATATGGCGATGCAATATGGACAGCAGTTTATGCCGG
CTGGTAAAGAGTTTGTTGAAAAGAAGgaAAGCAGCCACCGCAACAGCAAC
AGTTTTACCAACCTTCACAGCAACAAAATTCATATACTCCAGAACTATTC
GATGATATGTCAGCCTacaaccaacaaccacaacaaaccacaccaccaaG
TAGTATGATGCAACCCAATCAGCCGATGCAACCAGCTCAAATGACATTCC
CAGGACAAGAGCTTCTACAAGATCCAAACATGGCAAACATGGCAACTAAT
ATGGCGATGCAATATGGACAGCAGTTTATGCCGGCTGGTAAAGAGTTTGT
TGAAAAGAAGCTTGATCATTTCTTgtcagtttcaaaattgaagTATTATT
TTGCTGTTGACACTACTTACGTCCTCAAGAAATTAGGATTACTTGTCTTC
CCATTCGCACATAAGCTTGATCATTTCTTgtcagtttcaaaattgaagTA
TTATTTTGCTGTTGACACTACTTACGTCCTCAAGAAATTAGGATTACTTG
TCTTCCCATTCGCACATAAGgaTTGGTCTTTGAAATATGATAATGCAGAA
CCAGTTGCTCCTCGCTTTGAGATCAATGCTCCTGACCTTTATATTCCATg
aTTGGTCTTTGAAATATGATAATGCAGAACCAGTTGCTCCTCGCTTTGAG
ATCAATGCTCCTGACCTTTATATTCCATCTATGGCTTTCGTTACATATGT
ATTGGTTTGCAGTGTAATACTTGGTACACAGAATAGCTATGGCTTTCGTT
ACATATGTATTGGTTTGCAGTGTAATACTTGGTACACAGAATAGATTCAC
TCCAGAGCAGCTAGGAATGACAGCAAGTTCAGCATTTGTTTGGTTATGTA
TTGAATTAATTGTCATCGTAATGATTATGTATTTAATTGGTATCTCTGGT
AATATCAAATATTTGGATATACTTTCTTTTTGTGGTTACAAATATGTTGG
ATTCACTCCAGAGCAGCTAGGAATGACAGCAAGTTCAGCATTTGTTTGGT
TATGTATTGAATTAATTGTCATCGTAATGATTATGTATTTAATTGGTATC
TCTGGTAATATCAAATATTTGGATATACTTTCTTTTTGTGGTTACAAATA
TGTTGGAATGATATTGACATCAGTATGCGGATTATTATTTGAAGCCACTG
GATATTATGCTTCCTTATTATGGTGTAGTGTGGCTATCTCATTTTTCATA
AATGATATTGACATCAGTATGCGGATTATTATTTGAAGCCACTGGATATT
ATGCTTCCTTATTATGGTGTAGTGTGGCTATCTCATTTTTCATAGCTCGA
TCACTTCGCCTTGTCATTAATCCTGAGGATCATTCAGACAGCGTATCTCG
ATCAACCAGTGGTAATAAACGACGTCTATACATTCTACTCACTGTCTCAC
TTATTCAACCAGTTTTCATGTACTTTTTAACGAAACATTTGATTCATTAT
ACACCAccgaaaattatgaaaatgtctGGATAAGCTCGATCACTTCGCCT
TGTCATTAATCCTGAGGATCATTCAGACAGCGTATCTCGATCAACCAGTG
GTAATAAACGACGTCTATACATTCTACTCACTGTCTCACTTATTCAACCA
GTTTTCATGTACTTTTTAACGAAACATTTGATTCATTATACACCAccgaa
aattatgaaaatgtctGGATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000066_pilon | genome | sc0000066_pilon:648711..652584 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 898-1086:3686 |
| Aaloc | 805-897:3438 |
| Aaloc | 649-801:2742 |
| Aaloc | 592-645:2068 |
| Aaloc | 511-588:1681 |
| Aaloc | 406-510:1182 |
| Aaloc | 124-405:561 |
| Aaloc | 79-120:243 |
| Aaloc | 1-75:1 |
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