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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000066_pilon:786789..797504- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_030337 ID=XLOC_030337|Name=XLOC_030337|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10716bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:786789..797504- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCTGCACATTGTTCAACTTGAAAATGTAAGGTTATTTAGATTAACACA
ACTATTGTATAAACTAACTGTAAAAAATGTAGATTTCTCTGCTTATCACT
ATGTTTCTTTGTTTCAGTTACTCTGTAGTCATGGTATTGACAAATGCAGA
TTAAGTCAAAAATACCCCTTTAGATAAAAGTTGCAAATCTGTAGATCAAT
TTGTATTATTCTTGAAAAGAGCAGAACAAACATGTACCAAAAGGAGCATT
CATAGAGAGTTGTCAAATAAACTGCTTTTGTTACTTTTTGATACAGATAA
ACATATATGATGGAAGTAATTACAAAGAATGGACCATTCATATCCGGTTA
ATTGAAGGTGTGAATTTCAATGGCTCCACAGAATTCTTTATTGCATTCCC
AGTAAGATTTTCAGTATATTTGTATGTTATTATTTTAAACTATGATCTTT
ATTTTAACATATTTCTTCAGCCAAAATTTTATGACTTTCATCTGTTTTGA
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TATTGAATAATTGATGCATTTTTACGTACTGATATTCATTTTATTGAGCC
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AAGATTACTGGTATAAGAAGGAGAATATGCCTGATTTGGTATGATTTTGT
TTCGATAATGCAGTGTTGATAGTTCTTTCATATTAGACAGATCTGTTTCA
GGATGGTTTTTATATAGAGGCTTTACTATCTTTTATACTTGGCTAAATTT
TGATAAAAATTCAAGAATTGCAAAATCTATTTGGTATAGTTTTATTAAAA
AATCAAAAGGCTATGTCATCGTTAGTACAAACATAGAATTGTGCTTTCAT
ATAATAGTTTGTATTGACCACTGTTTCAAAGTGTTGTTGTGATCACTTTT
TCTAAGACCACTGATAATGTATTTGATTTCGGTTTCTTTTTCAGAGCAAA
AAGGTCGTCAGCAGGTGAACAATTTTGATTCATTGATTTTTATATTTGGT
ATCTTAAAGGGGCTAATCTTAGTGGGAACTAATTTTCACTGTTTGCCCGA
ACCGAAAAAATGTTTGGAAGCTCAAAACCGCAAAAATTAATTGTCACAAA
AAATTTAAGAAAATTTCATAACTGAAAATAATTGTTTGATTTTTTGAATA
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AGTGAAACTTGAACAGGGCTTTTCTGATATCACTTATTAATTGAATAGTT
CCCTTAACCCTTTAAGTGTCAATGTCGTGTATATCAGACATGGGCTATGT
AGGAGGGCAAAGCCCTCCTGTACTGCCTGCCCAATTTGAGTTAGAATTCG
TCATTTTTGGTCTCGTAGGAATTGGATTGGGCTTTATGGTCAAGCAAAAA
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TTTTGGTCAACAAGTGATCCAAGAACCTCCAAATTTGACCCTGATTTACT
TGATTCTGTCCTCCAGCGAGGAGCCTGACTGCTTTAATTCCCTTACCTAC
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TAGATCCGGAGATATAAGCCTCCAAAGTTTGAACTAGCCATTTTCTTTAA
AAGACTTAGAAAAAAATGACCGTGGCACTTAAAGGGTTAACTCATTTTCC
AACAATAATTTGTGAAATCTATGAAGTTCAAGTTCAAGAGAAAAAACATT
CTGATTCATTATCTTTTGCATGTATTTTTTTAGTAATGATAATGACTACT
TCAAAGCAAGTTTGACATTGTACAACAATATTTCTGCTGGAGTTATAATA
CATAAGAATTCAACACTGAAAGAATTGGCACGAGAAGTCAATATGTTTTG
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GTCCTGAAAAAAGAACAGGTTCTATATAAATCAAAATCATTTATCTTACT
CCATTGTGAATTATTACCTTAGAAGAAAACTCTTTGCTCAATCAAAATTT
AATCAATTCCCAAGGAAAATAAAATGCTTACGAAAAAAAAGAAATCAATT
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TTTAGATACTCTGTATAAATTTCTGCTGAAGAAAATTAATTTTGTATGAC
TTCCCTCCAAATTTTCTTTGATCATATTTGTTGATCAGATCTATTGAACC
GAATTGAAAGCTTTTTGAAACATACTTTTGGAACATACTCAAACTAAAAA
ATGTTTCATTTTGGTTTTGCAATTAAATTTAAAATTTGATTGACTTTCAC
TTCCTTTTATGTGACATTGTCTGCTCTTCTATATATTGTACAATAATTAT
TCATTTTTTTCATTGCCTGTGTGCAGTCCAGTTGTTGAAAGAGGAGGAAA
AGATTAATGGTTATGTGAATTCTGGTTGTGAGCTATTTTTGATGGAAAAA
ACAAAAGAATCAAGAGTAAGATTTGTCACTTTGATGATTTTCAAATGAAT
CGTCTTTTTGGACCTACCCCGGTGGGGTGGAGGTCCTATAAATTAACCCG
TGTTCGTTAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTAGTTACCAACTTTTCTCG
AGATTGGCTCATTCAATTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGGTGCATTACTA
TAAACCCTCGAATGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAATTTTTCCG
GCCGGTAGAACCGGAAATGTCCCGAAAAAAGCGGTTTTTTGAGATTTTCT
CGAGATTTTATCATTAGTTTTTTGCGATTTTTTGCACATAGATGCACATT
AGTACTGCCGAAAAGGTGTCGAAAACCGTTTGCCGAAAAAAAATTTTTTC
CGGTTGTAGAACGGAAATTGCCGGAAATGTCGTTGTTTTTTCACATTTCC
GTCACATTTTTTCAACTATTTAATTGTTTCTTTACAGAAAATGTCTTTAT
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AATCCGGAACTCCTTAAAAATCGCCGGAACAGGCGAAAACCGGCTAAAAC
GGTTTTCCTTCATTTTTTCAACTTATACTCGACAGATTTTCATGATTTTT
TGCACAATGATGTAAAATGGCAATGCCCAAAATTGACAGAGCCCAATTTT
CGAAAAAAATTTCCGGCCGGTAGAACCGGAAATTCCCGAAAGCGGTTTTT
TGAGATTTTCTCGAGATTTTATCATTAGTTTTTTGCGATTTTTTGCACAT
AGAGCACATTAGTACTGCCGAAAAGTGTCGAAACCGTTTGCCGAAAAAAA
AAATTTTCCGGTCTGTAGAACCGGAAAATGTGCCGAAATCGTCGTTTTTT
CACATTTCCGTCACATTTTTTCAACTTATTTAATTGTTTACTTTCTTTAC
AGAAAAATGTTCTTTATGATGATGCCCAAACTTAGCATCGTTTGATTTCA
AAAAAATCATCCTTTGAATCCGGAACCTTAAAAATCGCCGGAACAAGCCG
AAAACCGGCGTAAAACGGTTTTCCTTCATTTTTCAACTATACTGACAGAT
TTCATGATTTTTTGCACATGATGTAAAATGCAATGCCCAAAATGTGACGA
GCCCAATTTCGAAAAAGAAATTTTTCGGCCGCTAGAACCGGAAATGTCCC
GAAAAAAGTGGTTTTTTGAGATTTTCTCAGTTTTAATTTTCTCTGAATAA
TTGATTAAAGTGTCGATATTATTTTTCTTTCACCGTTAAACATCGATGCG
TTTCTTAATTGCTTTCTCCGTTCCAATAGATATATAAATCGAAATTTAAA
ATTATACATTACTTCCATTATAAATTCTAATTATTCGTTTTATAAATAGG
TAGGTCCATTAAAGTATTACTTGTTTTTAACTGCATCAACTGAAAATTGA
TGCAAAAGGAAAACTGCATATAAATTTTATTGAAATTGATTATGTATTTT
GAAACCCAGCTTTCTCATTTACTATTTATGCTATAAAACTTGATTTGAAT
AAAGCCAAAAGCTTCCGTCTTTTTTACACTTTCAAATAAGATTTTAAAAA
TCTTGATAACTATTTTTGGTCACATTTTACCTAAAACTTTGAATTTAAGG
CTTTCTACTAAAATTAACTTTGAGCTTTACTAAAATATTGTTCCGTTTAA
TTCAATTTCAAATTCAGTTTTTCTCAGTTAAGCCTGACTTATTATGTGTT
TCAATTCATTTCCACAGTTATTGGTGATTTTCTTTGAAGAAGAGGACGGA
AAAGAATCATTTGTTTGTGGAACTGTTTATCATAACACAAAAGCAAAAGA
TATTTGTCAAGTAAGATTTAATTTCATGATGGATTGAACTTTACGCCAAA
CTAAAATTATCATTTTGAATGTTATGCGAGACCAAAACCGAGCAAGTTGA
AAAGTACGGTCCCCTTGGGAGAAGAATAATCAAAATAAGAGTTTTTAAGG
CGTTGGAGCAATGCAACATGCTCCATCCCACTAACACAAGAGAAAAAGTT
TGTGTCCCATGGCTTCTTTTAATGTTTCATGGGACAAAAAGCGAGGGAAA
TACCCGAAGGACATGCTGATTTTGTCCCTGGGAAAAAAGTGAGACACACA
AATGTTATTAAATCGATTTCACTTTTATTGATAGAAACAAAAATGGGATG
GGACACAAGAAAGCGTTTCAGGTTGGTGGGATGGAGCATGTTGCATTGCA
CCAACGCAAAAAGAATTCTCGTGTTCCTAAGCCTTCAGGGGGGGGTGACG
TTCGTAAAATAAATTATGCATCAGACAAAATACAAATAAGATTTTATCTT
GGTAAATCTTTTGGTATTTGGGTAAACAATAGTTGTAACAAGTTGTAATT
GCATCGTTTTCTCTGTTGCTTCTTGTTTGTTATAGCAATAGTACGTATGG
TCCTTTTTTCATTGATAACCTTTTTTTTATTTTAGAATCCTAAGAATAAT
GAAATTCCTTTCATTCGTGGCAAAATGCGATCATATGACCCACAGGGTGA
TGTTACTTTGAACTATGTCAATCGTGAAAAAGGTACACTCGAAATGATGC
TTTTTATTAAGTATTTTTGCCTGTAGAAAACATAATGATATAATAAAACT
TATGCACCATATCCTTGCTGGCATAATTAAACTAAATATTTTATTATATC
AAACTAAATCACTCTTAATCTGGTTGGCTAATTATGTTTTCCAGTCTCCA
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TGAAAAAGAAAAACCAACTACGTTCTTCTACGGTAAAAAAATTTAACTAA
ATTTTACCACAACATAATTTATTTAGTCAAAGGTTTTCTGCATTTCATCA
TCACTGAGAAAGCACATAACAATGCTAATGTGTTTCACCAATAAACTTTG
GTTCAGAATTGGCTGTTCTTAATTTTTTGGACTTTTCTTGCTTAAAATGT
TCTTACAATGTTCTTTAACATGATTTAAATCTGTTAAGTTCAGTGTTAAA
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ATTAAAAAAAAGCATATATCTCGTATAAACTTTTTTTACCTTTATACCTT
TAGATGGGAAAGGGAACTGGAAGGATTCTACAGGTACACATTTTCAACTG
CAAAGTTATCATTATTTTTAGTAAAATCCAGCCAGAATTTACTCGTTTTA
TACTTTACAGTAGAGTTATTTATAAATTATGTCTGCATAACTGGAACCTC
TGCAATTGAAAGTCTACTTAACCTACAGGTTTTCTGGTCCCTTCAGTTAA
TAATGCCTTATAAACCAGACTCCATAAGTCGAACAAATTTACGTTCGTGT
TATGTATGTTCAAGTAATAACGACTTCACTACATTAGAAAATGTTTGTAC
TATTTTTAGTCGTCTAAAGGGGCTGTGTCCAGAATAACACATGTCTATAT
TGTTTTTTGGACCTACCGGGAGGTCCTTTAATTTGACCGTTGTCCGTTCG
TCTGTTACAAGCTTTTCTCGGGATTGGCTCATTAGTTTTTTTTAATTTTT
TGCACAATGATACAAAATGGCAATGCCTGAAAAGTGACGGAGCCCGATTT
TTGAAAAAAATTTTTGGGGGGCAAATTTGGGCCAAAAACTACCTAAAAAT
AAGGTTTTTTGGACTTTGTGCAAAATTGCTTCATTAGTTTTTCCTGATTT
TTGGCAGAAAGATAGAGTGCAAGGGGACCCTAAAATGTGGCTGAAGTAAC
TTTTTTTCTCGGAAAATTTTTTTTTTCGTCGTCAAATACGGATTTTCGCA
AATTTGGGCCAAAAACTACCTAAAAATAAGGTTTTTTGGACTTGGTGCAA
AATTACTTCATTAGTTTTTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATAGAGTGCAAG
GTACCCTAAAATGTGGCTGAAGTAATTTTCTCGGAAAATTTTTTTTCGTC
GTCAAATACGGATTTTCGCTTTTTTGGGGAAATTCCCTTTTACCATTTTC
CTGTTAGCAGCTTTTCTCGGGATTGGCTCATTAGTTTTTTTTAATTTTTT
GCACAATGATACAAAATAGCAATGCCTGAAAAGTGACGGAGCCCGATTTT
TGAAAAAAAATTTTGGGGGCCAATTTGGGCCAAAAACTACCTAAAAATAA
GGTTTTTTGGACTTTGTGCAAAATTGCTTCATTAGTTTTTCCTGATTTTT
GGCAGAAAGATGGAGTGCAGGGTACCCTAAAATTTGGCTTAAGTAATTTT
TCTCGGAAAATTTTTTTTCGTCGTAAAATACGAATTTTCTTTTTGGGGGG
AATTCTGTTTTTTTTAAAACCATTTTCCTGTTAGCAGCTTTTCTCGGGAT
CGGCTTTTTATTTTATTTTTTTTTCATTTTTTGAACAATGATACAAAATA
GCAATGCCTATAAGTGACGGAGCCCGATTTTGAAAAAAAAAATTGGGGTA
AATTTGGGCCAAAAACTACCTAAAAATAAGGTTTTTTGGACTTGGTGTAA
AATTGCTTCATTAGTTTTTCCTGATTTTTGGCAGAAAGATAGAGTGCAAG
GTACCCTAAAATGTGGCTGAAGTAATTTTTCTAAGGAAAATTTTTTTTTG
TCATAAAATTTTCAAAAAAAGACGACCAAGTTACACAATGATAAAAGAAA
ATAAATCAGACGTTTTTGCATTGTTCTAAAACTTATTGTGTTTGCTCAAT
ACCAATAGTAAAATATGTAGAGTAAGTAAGTAAGTATTTATTTACCATTT
AACACTACAGAAAAGATACAAGAATACCTACTTTTATCTGATATTGATCA
AGGTAGGTCCATTCAGCATGTTGCTTGTTATACATCTCTTGATCTAAAAA
TCAAGATTGATTTAAAAATTTATTGTATCTATTTAGGAATATTGCTGATC
AGAAAAAACAAACAATTTATTGAGGATAGATCAAGAACACATTCTATGAC
ATCACAAGAGTTTAATATATATCAAGAAGGCCGTGAAAAGGTTTGTTTTT
TATTGCAATATTCATGATACCTTATCCTATAATATTTTTGTCAGACAAGG
GAAATTTGAAATTAACTCAATCCGACCCAAGAAGTAAAAAATTAAATCTT
CTGGGATTTTGTCAAAAAAGCTTCAAAATTCATTGAAATTGTTTAAATTT
AGACAAAATAGAAGAGCCTATCCCCAAAATTAGCTCTCGCTAAAACTATA
AAACTTAAAATCCCCCAAAATGAGATTGTACCAAAAGTCTTCAAGATTAA
TTCTGCTCACCAAATTAAGTAAAGTAAATAAACTGGAGTCAAGTTCTTAT
TATTTGAATTTTCTTTTCAAATTCACCCTTCTCAATTTCTTTTGCTTAAG
ATATATAACATTTTTAAGGACCTATTAGTGACAGGCGTGGTTACAGAAAA
TATTCAAAAGTAATGACGGACGGAGAATTTTTCTTTTGCTAATTATCATC
TTATTTATACTTTTTACTTTTCATTTGGGAGTAATATTGTGCTTAAAAAA
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GTGAGATATAGATGGCCTGCCCTACTGTGTGACATTATAATATAAAAATA
ATATAATATTATATTATAATTATGAAGTGTATTTACCTGTGTACTGTCTG
TTATTTCGTTCTAGGCACAAAAAGTGATCAATTCTCAAAGGATCAAAGAC
GCACAAGAAGCTCTGTCTAAAAAAGAAGATATCTCACCATCTCCAAGTAT
GGGCTCAATCAGTGAAGCAAAGGAAGATACATCAATATGTTGGGGAGCTT
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TTATTTCGGAGATGACAATGATTCGCATGATCTGCCAGCTGACACCAACG
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AATTCGCCAGAAGCTTTAATCAAACAGTACCAAGATGTGGTACTGACTTC
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AATCAAAACCACAAAATATTTCATCTCATTATGTTTTAGATGCTATCACA
AACACATCCCAAGATAGTTACATTTGCTTAAGTGGTGTACACCTGTTGAA
AAGAGGTCAGCAATACAGTCTACAAGATGGTTGTGAAGTTAAAGCAGGAA
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CGTAAATTAGGCCCTTTTACATGTTTATTTGTACCAAGCGTTCGGGGTAA
AGGCTATTGGCTGATCAGACAAACGGAGGATCTGGAAGATTCAAAACATC
AACCAGAGCTGAAAGAACCATCTTTTCCACCCCCTAAGGAAGTTCTTATT
ACGGAACCGAGTGACCAGGTTGTGCATGTATCAAGCCTCCCTCAGAATAA
TTCATCAAGTGAAGACGAAATCAATACAGACGAAAATCAAAATCAAACGC
AAGCAGCAGTTGACTCTCAGAGAATGTTTCAATCCACAGCTACTGAAATG
TTTAAAGGTGCACTTGTTAGTGCTTCTGATGCCTTTAAGAACGGTGAAAA
ATATTTCAATAATGTTTTGGAAGGCCGACGACAAAGTACTGTGTCACTTT
TGCAAGAAGATAAGAACATTCTGAGAGATGAGTTTGTTTTGGTTGGCGAA
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GGAAAATGTTAATGTATGTCAACAGAAGAAGCTTGGTGACGACTTTGAGA
ATCAACCAATTGGATGGCTCGTTCGGGGAGAATTTTGTACCCTTATCGCA
GAATTTCTTAAAATTGGTCTCAAAGAACAAACCAACGTTTTCAAACGGTT
TTTCGCAGAACAGAAACCAATATCACTCTGGGATGTTGCTCGTGAATTTG
CATCTGCTTTTAAAATATACGAGTTTGATTGTGTTTTGAGAAGTATCAAG
GATGCTAATTTGAGATCTGATGATGAGCGATTCCGAGCTTTCTTTTGTCA
GTTGTTAAATCGTAGCAATTCTGATGGTACCGATAAATTGATTGTCAGCT
TTTTCCAAATGTTACCACTTATGACTAACAAGTTGGAGAAATTTTATCAC
GAAGATTCTTTTTGGAGAATGAGTTATTCATCTGGGTTTAGTACCTTACA
AGATGAGATTATTTTGTCTATGAGACACTTCAATGGTTGGCCATTTGAAT
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TCTAATGATGGAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066_pilon:786789..797504- >XLOC_030337 ID=XLOC_030337|Name=XLOC_030337|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=5886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066_pilon:786789..797504- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGCTGCACATTGTTCAACTTGAAAATATGCTGCACATTGTTCAACTTGA AAATATAAACATATATGATGGAAGTAATTACAAAGAATGGACCATTCATA TCCGGTTAATTGAAGGTGTGAATTTCAATGGCTCCACAGAATTCTTTATT GCATTCCCAATAAACATATATGATGGAAGTAATTACAAAGAATGGACCAT TCATATCCGGTTAATTGAAGGTGTGAATTTCAATGGCTCCACAGAATTCT TTATTGCATTCCCAAGTGAGAAGTTGTTCAAAGATTGGATGAAAAATCTT CAATACTCCAAAGATTACTGGTATAAGAAGGAGAATATGCCTGATTTGGT ATGATTAGTGAGAAGTTGTTCAAAGATTGGATGAAAAATCTTCAATACTC CAAAGATTACTGGTATAAGAAGGAGAATATGCCTGATTTGGTATGATTGT ATTTTTTTAGTAATGATAATGACTACTTCAAAGCAAGTTTGACATTGTAC AACAATATTTCTGCTGGAGTTATAATACATAAGAATTCAACACTGAAAGA ATTGGCACGAGAAGTCAATATGTTTTGTCACTGTAAAATTTGTATTGTGG ACAGACGAGAAGCGCAATTGTTTGCTGTTGACAAAAATGGCAAAGGTATT 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GTTTTAGATGCTATCACAAACACATCCCAAGATAGTTACATTTGCTTAAG TGGTGTACACCTGTTGAAAAGAGGTCAGCAATACAGTCTACAAGATGGTT GTGAAGTTAAAGCAGGAATCAAGGATACAGAATGGATAGATGCCGTCAAA ATCAAAAATTCTGTTAAACGTAAATTAGGCCCTTTTACATGTTTATTTGT ACCAAGCGTTCGGGGTAAAGGCTATTGGCTGATCAGACAAACGGAGGATC TGGAAGATTCAAAACATCAACCAGAGCTGAAAGAACCATCTTTTCCACCC CCTAAGGAAGTTCTTATTACGGAACCGAGTGACCAGGTTGTGCATGTATC AAGCCTCCCTCAGAATAATTCATCAAGTGAAGACGAAATCAATACAGACG AAAATCAAAATCAAACGCAAGCAGCAGTTGACTCTCAGAGAATGTTTCAA TCCACAGCTACTGAAATGTTTAAAGGTGCACTTGTTAGTGCTTCTGATGC CTTTAAGAACGGTGAAAAATATTTCAATAATGTTTTGGAAGGCCGACGAC AAAGTACTGTGTCACTTTTGCAAGAAGATAAGAACATTCTGAGAGATGAG TTTGTTTTGGTTGGCGAAAGATTCGTTAAACCTTTAAAGAACACTGTCTT CACTATTTGCACTCAAATGGAAAATGTTAATGTATGTCAACAGAAGAAGC TTGGTGACGACTTTGAGAATCAACCAATTGGATGGCTCGTTCGGGGAGAA TTTTGTACCCTTATCGCAGAATTTCTTAAAATTGGTCTCAAAGAACAAAC CAACGTTTTCAAACGGTTTTTCGCAGAACAGAAACCAATATCACTCTGGG ATGTTGCTCGTGAATTTGCATCTGCTTTTAAAATATACGAGTTTGATTGT GTTTTGAGAAGTATCAAGGATGCTAATTTGAGATCTGATGATGAGCGATT 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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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Properties
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|