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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000269_pilon:270350..279308+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_029283 ID=XLOC_029283|Name=XLOC_029283|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8959bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000269_pilon:270350..279308+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGCCTTACAAAATGCATACAATGCAGTCAAGAGCAAAGCATTGGG
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aaaaatcaattttaaatagtgaaaaaatattgtttactATAGTATAAAAC
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AGTACTGTGTACTACCAACATGAATAAACACTAGAATATGGGGATAACTC
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CGGTTGCCTACTTTTCACTCAAActattttgcttaaaatttttgtctcct
ttgtctggttttatttttgttatttttaattgaaaaaataagtgCAAATT
ATCTACCTATCAAAATACCATaatttaaataaaatgtaacacgaattaca
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AATGGTAGGCTTATTCTAAATTCCTTAAAAAATGAAAgctttgaaatatc
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TTGTTGGCTTTATAGCTTGGCTATAAAAAAGACCATTATCTTGTACCTTC
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AATACTCTTGACGCTCTCCAATAATTCGATTTTCCAGAGGagttggattt
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AGCTGTATCTTTTGTCcctgtatttttaaaaatagtaataaaaaaaatcc
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Tttactctcgctaattcgaagtcgaacggggaatctagtttgttcgaatt
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GTTGACGTCAGCAATTTAAATGAACCAGCATCCACTGATGACCAAGAAAT
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TATTGGTCTTTAAATGAAATTCCTCAAATCTACAAGGACTGTCACATCAA
TACGTGGTAACTAAACTACCCTTTTCCCccttatagtagggggaaatttg
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tttttttcggacactttggtgtgattttcggacaaatacgacggtctcag
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gagacctattgtatattttttggaagctctaaaaaaattgagattagtga
tatattgcgaatataggtgatttctttacctaactcgagatattaatcct
taaaaacagtgtttttcagtgcttttcagccagaaacagctgttttgttc
agtttttgcgctttcggaagctcaatatctcgagttaggtactgaaatca
cctatactcgcaatatatcactaatcttaaTtttttgagagctttccaaa
aatatacaacaggtctccgttttctcaagctaaaatttttattaattttt
caccctatgatttttgcctgagaccgtcgtatttgtccgaaaatcacacc
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ttcaaatatttcttgattcTCGCTGGCTGATCGAGGCATATGCGAAAAAT
TTCTCATCAAATCTTGATTAATTCTGTCTGGTTGGTTGGTTGATCAAGCA
GTCGAGGAGAAGGTTTCTCGTCCTGTCTTGTCTAATGTTTATTAAAACTT
GCTCGTCCGAGCTTTCGGTCAAACTGTATTGGTTGGCGAAGACAACGGTT
TTTATGCAGTCAAATGCTTCTTTCAGGATTACAGTAATGTGTGtggtcaa
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TTCATTAAAACCGCTTGAGACTTTAAAAATGccctatttttatttcaagt
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agccaatcaaattttgcttttatttcaCTGGTCACACACAAAAACTGGAC
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TAATGCAAAAATCTGCCTCATAGGTCAAACCCGTTCTGTTTATATcatat
tataaaaatacatgacgggtctcctgtctaaaGTCCGTTCAAAAAGATAT
TGAAATTTTTAGTAAGAGTTTATTTTAGGAATTGACGACGGTTTATAAAC
GGTTCTTTCCTTTTCACACCAGGCAACTTTATCCACAACGAATACGACGA
AAGACACTATGCAAGAAGCAGCTGCAAGTACAAAAgatggtattttacag
accagaacgtACGATTTGAACGTCACATACGACAAATATTATCAGACGCC
ACGACTATGGCTTTTCGGATACAACGAAGTACGtttttattgatttcata
ttttagagcatcaaattgctttttatttcctttgtttttcgATACGAACA
CTTTTTGATACTAACCACCTAGAGCAAAATACTTCAACCTAGCTGACGTT
TACAATATGATATATAATATTTAATTGTATGAGGAACTAAGTGAAATATG
CGAGGGTAATTATCGGCTTGTAAGCTTGGGTATTCGACGGCTTTCTTTCG
CGCCTTAGCAGTGTTCTAGAAATACCGGGAACAAAGCAGGTGTGCCTGCC
CAAAATATCCccattagcgaggttaagcacgggtttattttgaccgtaaa
gtgcgataccgtaggcctgttcataacttgccaaagcaaaccatgcaagt
gaaatcttatgtacaggcctacgatatcgcattgaccggtctaaataaac
acttgcttaacctcgctattgtaTCTAAGACGAAAACTGAAGAATATTTT
CTCCGGAAGCAAAGCTGATATCTTAAAGCAGGCTTTGTTACCAATAGCCT
GTTGAATGTAGGCTACAAAAGCTATCATAGGTTGGCTTCAAGTTTACCCA
TTTCGAATGACTTCAAATGTTAAAATACATCTGAGATTATTTTGAcgtaa
aatgtttttagatGTATTGGCTTCTTGTTTTATAATCATTGCTTTCCCTA
ATCATCCATTCGTAAGTGTTCACACTCGCATGACCATCACTGAAAAATAA
GTACAGCAAAACAATCGATAGTGTAGACCTCTATAGTTCACATATACAAT
GAAACTTTCTCGTTAGAGGATGCGAAGAAATCTAGACAGTCGAAACACTA
CGACTTTAAATTCCCTCGCACTTTAAGTATCTTCCCTAATTTGATATTTC
TGTTTTCATTTAGACTAGAAAGCCACTCACCATAGATCAAATGTATGACG
ATATCAGCCAGGTGAGAAAAGGATTCTAATTTTGAACATGtttttttGTA
TAGGAATACCGGTTGACGTTCTTCAAAATGGTCGTCAGCTACCAATATGA
AATGACCAATTATCATTAAGAAATTGATAAATTCTTCCGATGATTACGAA
AACaatacttttttgtttacacTTTCTTTGGGGTGTAGGCGTAatagaaa
acaattttatagAAAGAtacgaataagcgagagttgaCTGTAACAGGTAA
AATCAGGACTCGTATATACATATCTCCTGTTACCTTTAATATTTCATTTC
TTCTCCAGGACCACGTGAATAAAACAGTGACGATCGAAGCCCACCCTCAT
TTACCACCACCACCCATGGCGTCTATTCATCCTTGCAAGTATGCAGTTTT
TCACACCCTCGCTTGTAATCTTTTTCTTAGACTGAATCTAGTGATTCTGG
TTAAAAATAAATTAATCGCACGACCATGAAATTTCCACAGATATCGAGTT
TGAAATTCATGGTCCTGGCAGAAGAAAAATTCAAAAGCGGAATTTTTAAT
ACCGTGATTTTTTAATTAAGAATTCAAGGTGGCTCCTAGAGTCACCTTGG
TTTCGAAAATTTTGTACAATTAATAGGCGGTAAAACGTTTAGAAACTAAG
AATTTTGTGTAAGAATTTTCGTTTTCGGTTAGCCCTCCCTCCCTCCCTAT
CTGTCGGCGTGGaaaaaaaCTAATATagcagatcatccattctgcgcaat
gacaggctcgaaggactctggttttgaaaaatgattaatactcttatttt
taaaaagttctctaacttATTCTATTTGTACTTTTgctggccaaaagttt
gaaaataaatgctagaatacaaagcggatacatttatgaaatctggtgtg
agtaaaacatcatcagacgagaaaaatcaaacaaaatgcttattgggctc
ttccagaaaaaatccattcatggggggtggaggatatattatttttttca
tgaatttcccctggacattttgattttaaacacgggttatacccctggac
aaacatcaaatcaaccccatggacacaaaaaattatccctggacattgga
atttaccccctggacaattcatcctccaccccccatgaatggattttttc
tggaaaagcccaatgacacgaaattttaaattgggaatatctttctaatg
attctccgagaagagctgagattgaccTATATTAGACGGgagtctcatag
ctccactgtggtatgaaaatcttttggtggcacgtggtggcacggtgggT
TTTTTAagcttgaagtttgaaaatttctggtgtcaatattcaatttctta
tacaaaacgtgtttttgcatctttctcgcaatataaaacgtcataacgat
atatcattagcaattaagtagctgagtttgaatctcagaggaaagcttaa
agtctcttttgggaattgggtAAGTGCTCTTTGATGAGAAACTGCAATAA
AAATactacgaaaaatcatttaatggtggaaggagggtgaacaataatgt
cattactgcggacaaggccttgtacatgagaaattggcaaaaatccgcca
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CGTacctttttgcttgaaaacgaaagtgaaagcgcTTTTAAGCGCGTTTA
ATGTTTTATGATTAAGATTATGATTAAGATTatgattggttgattttggt
GCGACTGTTTTGCTTTAGCCAGTCACCGCACTCAAAAGCTCATTCAATAT
TCATCCTAAGTCTGgataaaaaagatcaaagcggtgCGCCAACTTGGGTA
TATTATCTTAAGGAGCCATGGCCTTTTGAGTGAATCTGTGTCGGAATAAT
CAGACTCTCCTTGGAGTTTAAACGGAAGCATTCCAATGGATTTTTCCTTT
CTTTGCATTCTGATTAGCATGGCAACATCTATATAAGCCTGGCaaaaaaa
GGTCGACACGGAACAAAGTGCAATTTATGGTCTTAATATTTCAATCGCAT
ACGTGGGATTTGCCGGCGTAGAATATGTAATTGGCAAGAATAAGATTTTT
GTTTAGTCATTCGCCGgtgtaaaaaaaagttaaacccCTAATGAAACATA
TCTAAATTTCAgcttttgtttgtatttttagaCACGCGGAGGTAATGAAG
AAGATTATTTCCACAGTCCAAGATGGCGGCGGTGATATTGGTGTTCATAT
GtgagttttgttttaaattttatactCGCACAGTCGGCCATACCTtaccc
tttaactgccgatgACGGCACATATGCCGATATGGAcgctttcgatttct
ttgcaaATGTCGGCATTTGCCGGCATGagcactttccatttctttgccgc
cgttttttttaagttgaatttgaactactgtagatttcattaaatagaac
agttgaataattaaaatatatttcaaagatgtttttcataattatacatt
tttcaactcaaagtcAACACATATCActtatatttctgatatttctcagg
aaataaagaattatttgTACAGCATTCTGCTGTTGTTTTTGCTGAAACAC
TAATTCTTTCTAtcactcgttgtcggacaaaatctGTTTTGGAAAACTAA
TGCAACCGTCAAATGTATTGTCCGACTTTTTTGAGGTCGGACTAGACAGT
GTCGGACTTCTGAAAACTCCCCGATTTGATATCCTGGAAagttacttttt
ttatataattttttaattcttatgGTCTCTTATGTAGACTGCCTCTGACC
AGACGAAAAAGGTTTTCTGTTTTaggtttttcgaaaattattattttgaa
aggTCAAAGAGCTCagaaaaaactccaaatattaagaaatcgtaaaaatt
caaactaaaccagaatgctcagaaaaaacataaaacGCCTTCGCCTCCTC
AgtctttttaatgtttttttttggggggcgggggAGCAACTGCCAATCTG
ACGCCATGTGACACATTAATTTACGTTTTGTATTTCAATTGAAATCTGAA
ACCGCtctcctgttttttttttcacaggtacattcttgtatttttgaaat
tcgTACAAGCAGTAATTCCAACGATCGAGTATGACTATACTCGACATTTT
GCTATGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000269_pilon:270350..279308+ >XLOC_029283 ID=XLOC_029283|Name=XLOC_029283|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000269_pilon:270350..279308+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTGCCTTACAAAATGCATACAATGCAGTCAAGAGCAAAGCATTGGG
AGTGGCAGAATACATGACTCCCGTTCTAAAGATGGCTGCCTTACAAAATG
CATACAATGCAGTCAAGAGCAAAGCATTGGGAGTGGCAGAATACATGACT
CCCGTTCTAAAGgaaTCAAAGTTTCGTGAAACAGGAGTCATAACACCAGA
AGAGgaaTCAAAGTTTCGTGAAACAGGAGTCATAACACCAGAAGAGTTTG
TTGCGGCTGGTGATTATCTTGTTCATCATTGTCCAACTTGGCATTGTTTG
TTGCGGCTGGTGATTATCTTGTTCATCATTGTCCAACTTGGCATTGGGCC
GCTGGTGAAGAATCGAAACGAAAATCATATTTACCTGCTGATAAGCAATT
CTTAACAACTAAAAATGGGCCGCTGGTGAAGAATCGAAACGAAAATCATA
TTTACCTGCTGATAAGCAATTCTTAACAACTAAAAATGTTCCTTGTTACA
AGCGATGCCACCAGATGGAATATGTGttggaaaatgagaaaattatcGAG
GAAGGAGACGGTGATGGTGGTTGGGTGGATACGCATCATAATGTTGACGT
CAGCAATTTAAATGAACCAGCATCCACTGATGACCAAGAAATGAAGTTCC
TTGTTACAAGCGATGCCACCAGATGGAATATGTGttggaaaatgagaaaa
ttatcGAGGAAGGAGACGGTGATGGTGGTTGGGTGGATACGCATCATAAT
GTTGACGTCAGCAATTTAAATGAACCAGCATCCACTGATGACCAAGAAAT
GAAGCCAGCGCCACCAGCAGCGGCGGCACCATCCaatgatgatgacgatg
acgaagatgaagatgacgatgatgCAATGGACATGGAAGCCAGCGCCACC
AGCAGCGGCGGCACCATCCaatgatgatgacgatgacgaagatgaagatg
acgatgatgCAATGGACATGGAAGcttttgaagAAGCTGGCATGTTAGAA
GACGCTcttttgaagAAGCTGGCATGTTAGAAGACGCTGCAACTTTATCC
ACAACGAATACGACGAAAGACACTATGCAAGAAGCAGCTGCAAGTACAAA
AgatggtattttacagaccagaacgtACGATTTGAACGTCACATACGACA
AATATTATCAGACGCCACGACTATGGCTTTTCGGATACAACGAAGCAACT
TTATCCACAACGAATACGACGAAAGACACTATGCAAGAAGCAGCTGCAAG
TACAAAAgatggtattttacagaccagaacgtACGATTTGAACGTCACAT
ACGACAAATATTATCAGACGCCACGACTATGGCTTTTCGGATACAACGAA
ACTAGAAAGCCACTCACCATAGATCAAATGTATGACGATATCAGCCAGAC
TAGAAAGCCACTCACCATAGATCAAATGTATGACGATATCAGCCAGGACC
ACGTGAATAAAACAGTGACGATCGAAGCCCACCCTCATTTACCACCACCA
CCCATGGCGTCTATTCATCCTTGCAAGACCACGTGAATAAAACAGTGACG
ATCGAAGCCCACCCTCATTTACCACCACCACCCATGGCGTCTATTCATCC
TTGCAAaCACGCGGAGGTAATGAAGAAGATTATTTCCACAGTCCAAGATG
GCGGCGGTGATATTGGTGTTCATATaCACGCGGAGGTAATGAAGAAGATT
ATTTCCACAGTCCAAGATGGCGGCGGTGATATTGGTGTTCATATgtacat
tcttgtatttttgaaattcgTACAAGCAGTAATTCCAACGATCGAGTATG
ACTATACTCGACATTTTGCTATGTAAgtacattcttgtatttttgaaatt
cgTACAAGCAGTAATTCCAACGATCGAGTATGACTATACTCGACATTTTG
CTATGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000269_pilon | genome | sc0000269_pilon:270350..279308 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 874-954:8879 |
| Aaloc | 805-870:7983 |
| Aaloc | 724-801:6109 |
| Aaloc | 676-723:5764 |
| Aaloc | 520-675:4723 |
| Aaloc | 490-519:4018 |
| Aaloc | 403-486:3497 |
| Aaloc | 247-402:2399 |
| Aaloc | 175-243:1635 |
| Aaloc | 124-171:1010 |
| Aaloc | 82-123:278 |
| Aaloc | 1-81:1 |
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