|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000299_pilon:421441..428926- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_025489 ID=XLOC_025489|Name=XLOC_025489|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7486bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000299_pilon:421441..428926- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAATTTGCAAGAAAAAATTCAAACTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAGGA
GTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGATG
ATATTGAAGATGCATTACACAGGTACATCATTCTACAAGTAAGTTGTTTT
AAGCTTTTTTTTGTCTCAACATTTCAATTTATTTTTATTTGACTCGGTTT
TTTAGTGTTAAATTTTATTAAAGTTTTGTACTTGAACACTGATAATTCCG
TCAAAAGGTTATTAAAGAATTATATTTTCCTAATTTAGATACCAAGAGAT
AGTCACATGGTGTCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAAAA
ACAAGAAATGGAAACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGTCT
TAGCGTGCGTGACTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCTCT
GGAAAGAATGCAATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATGGC
AGAAGCTATCGAAGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGTGC
CAGCTGACGTAAAATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCAAA
GCCAATGCATTGCGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGGTACTTGACTTGAT
ATTTAATGTTTTTATAACTAAATTTATGAATTGGACTTGCTTCAATGCAT
CTTTCAATTAACTTTCTTTAGTGATGAGCCGCTGTGGCAAACTTCACTGA
TGTCCTTTGTAGCCCGTAGCCCATTCAAATATCGCAAAAATATATTTTTT
GAGTGACGTAATACTAGAAATAGGGGAATGGAATCGAGTATATAAGAAGG
AGACATATCTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTTTTCTATTTTTTATGT
CATTCAGAATTTTTAGTTTGCCATATTTGAACGGGCTACTGGCTTCTAAG
CAATTTCAAGCTAAAAATGATGGGCTACAAGTTGGCTGCAAGTAGGCTAC
TATCAAAGTAGCCCATTAACAAAAAACAATGAAAAATTACATTTTTTGAT
GTGACGACATACTAAAAATAGAAGAATTTAACGAGAATTTAAGAACGGGA
CATGGGCACTTTATTGAAACTTGGACTTTTTTGGTGAAGAATTTCAAATT
TGGCTACTTTGATTTAAATAAGAAAGATTTTGAGTTTCTAATTTGTTGCA
TTTAAGAATAAAAAACAAGGGTTTCTGAGCTTTCAGTATGATATTTCATT
TATCTTTCAGTACTCTTTGTACGACAATTCGATAACGATATAAAGAAAAT
TATTCTGAATAAAAATTAAAATCATTCTAAAATTGCCAAGATTCAAATGT
TTATTTCTGTTTTGCTTGTTCGTTTTTCTTTAGTTCCTTCATTTCGGCTT
TTGCTTCTTCCTTTTTCTTTACCTCCTTCAATTCCTCTTTTGCTTCATTT
TCTGTTGTGACGAGCCACTGTGGCAAAGTTCGCTGGTACCGCACTTTGTA
AAGTCTTTTCCTCTTTAGGCAAGGCATGCCATCAATTGTGTACACGGTTG
TCTCGTATTCTGTTTCAACTCCGCTGGAATCAGCGGAGTCAAGATATATA
ACATCGTCAATCTTGCGTTTTGGCATGTTCTGTTCTTTCTGAACACCAAA
TTAAAAGAAAGGTGACAGAATAACTGTAAGACACTATTTAAGTAGTAACA
AAATCAAAATGAGGTAAATTCACCACAACGAGGCAGACTTTTTTAATTAA
CGCATGCGCACACATTTACACTTTGTAATTTTTCATTGTTTTTTACAAAT
ATGGCTACTTTGAGAGTAGCCCTTGGGGAGCCCTTTGGTAGCCATCCCAT
TTTAGCTTGAAGTTACTTGGTAGCCCGTAGCCCATTCAAATATGGCAAAA
TATCTTTCTTAGAGTGACGTCACATTGAAAATAGTAGAATGGAAACTAGT
ATCTAAGATCGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTGATT
TTTATTGAATTCTTTCTAAGATGGGCTACTTTGAATGTAGCCCGCTTGTA
GCCCACTCGAAGCCCATCAGTTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTA
GCCCGGTGAAATATGGTAAAATATTTTTTTTAGAGTGACGTCATGTTAAA
AATAGGAGAATGGAATAGAATACTAAGACGAGACATGCGCACTTCATTAA
AATGTCGACTTTGTTGATTTTCATCGATTTTTTCTTAGATGGGCTACATT
GATTGTAGCCCGCTGGTAGCCTACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAA
AGTTTTTGGTAGCCAGTAGCCCGGTGAAATATGGTAAAATATCTTTTTTA
GAGTGACGTCATGTTAAAAATAGGAGAATGGAATAGAATATCTAAGACGA
GACATGCGCACTTCATTAAAATGTCGACTTTGTTGATTTTCATCGATTTT
TTCTTAGATGGGCTACATTGATTGTAGCCCGCTGGTAGCCTACTGGTAGC
CCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCGGTGAAATA
TGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGACGTCATGTTAAAAATAGGAGAATGG
AATAGAGTATCTAGGAACGAGACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTT
TGTTTATTTTCATCGATTTTTTCTAATATGGGCTACTTTGATTGTAGCCC
GCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTA
GCCAATAGCCCGGTGAAATATGGCAAAATATCTTTCTTAGAGTGACGTCA
TGTTAAAAATAGGAGAATGGAAACGAATATCTAGGAACGAGACATGCGCA
CTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCGTCGATTTTTTCTAATATG
GGCTACTTTGATTGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTT
TAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCCGGTGAAATATGGCAAAATA
TCTTTCTTAGAGTGACGTCATGTTAAAAATAGGAGAATGGAATAGAATAT
CTAAGACGAGACATGCGCACTTCATTAAAATGTCGACTTTGTTGATTTTC
ATCGATTTTTTCTTAGATGGGCTACATTGATTGTAGCCCGCTGGTAGCCT
ACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAGTGTTTGGTAGCCAGTAGCCC
GGTGAAATATGGTAAAATATCTTTTTTAAAGTGACGTCATGTTAAGAATA
GGAGAATGGAATAGAGTATCTAGGAACGAGACATGCGCACTTCATGAAAA
TGTGGACTTTGTTTATTTTCATCGATTTTTTCTAATATGGGCTACTTTGA
TTGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAGCTTGAAAG
TGTTTGGTAGCCAATAGCCCGGTGAAATATGGCAAAATATCTTTCTTAGA
GTGACGTCATGTTAAAAATAGGAGAATGGAAACAAATATCTAGGAACGAG
ACATGCGCACTTCATGAAAATGTGGACTTTGTTTATTTTCATGGAATTCT
TTCTAATATGGGCTACTTTGATTGTAGCCCGCTAGTAGCCCACTGGTAGC
CCGTCAATTTTAGCTTGAAGTTGTTTGGTAGCCCGTAGCCCGATGAAATA
TGGTAAAATATCTTTTTTAGAGTGACGTCATGTTAAAAATAGGAGAATGG
AATAGAGTATCTAAGAATGAGGCATGACTCCTTATTAAATTATCCATCCC
ATTCTCCTCTTATTGATATGACGTCACCAGTAAATTAATATTTTGGCATA
TTTGAACGGGCTACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATGGTGGGC
TACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACC
TTTTGCTAAAAAATTACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCACATGTCTC
GTTCTCTAATTGTCGAACCCATTCCCTTATTATGGATATGACGTCATGTT
AAAATTAGGAGAATGGAAGCGAGTATCTATGAACAAGACATGCGCACTTC
ATGAAAATGTGGACTTTGTTGATTTTCATCGACTTTTTTCTAAGATGGGC
TACTTTGATTGTAGCCCGCTGGTAGCCCACTGGTAGCCCGTCAATTTTAG
CTTGAAAGTCTTTGGTAGCCTGTAGCCCATTCCAATATGGCAAAACATCT
GTTTTGGTTGACGTCATACTTGAAATAGGAGAATGGAATCGAATATTCAA
GAAGAAGACATGTCTCCCTTTTAAATTTTCGATCTCATTCTCCTATCATT
GATATGACGTCATCCCAAAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGCTAC
TGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAAGTTGGGGCTACCGGCTGGCTAC
GAGTGGGCTACTCTCAATGTAGCCCATTTAAAAACCTTTTGCTAAAAAAT
GACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTACGCATGTCTCCCTTTTAAATTTTC
GATCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGATATTAATATTTT
GGCATATTTTAACGGGCTACTGGCTACCAAGCAATGTTAAGCTAAAGATT
GTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTCTCAAAGTAGCCCATTTA
AAAACCTTTTGCTAAAAAGTTACAAAGTCGAAATTTCAATTAAGTGCGCA
TGTGTCATTCTCCAATATTCGTTCCCATTCTCCTCTTATTGATATAATGA
CGTCACCCGTGAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACGGGCTAC
CAAGCAATCTTAAGCTAAAAATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGG
CTACTGTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAG
TCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTTCCGTTCTTAAATTCTTGATCCCA
TTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATAT
TTGAATGGGCTACTGGCTACCAAGCAATGTTAAGCTAAAAATTGTGGGCT
ACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTCTCAAAGTAGCCCATTTAAAAACCT
TTTGCTAAAAAGTTACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCA
TTCTCCAATATTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGT
GAATTAATATTTTGGCATATTTGAACGGGCTACGAGCTACCAAGCAATCT
TAAGCTAAAAATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGTCAA
AGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTC
AATTAAGTGCGCATGTTCCGTTCTTAAATTCTTGATCCCATTCTCCTATT
ATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATATTTGAATGGGC
TACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATTGTGGGCTACCAGATGGC
TACGAGTGGGCTACCTTTAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTACTCAAA
AACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTGTCATTCTCCAATA
TTCGTTCCCATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACCCGTGAATTAATAT
TTTGGCATATTTGAACGGGCTACGGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAA
ATGGTGGGCTACCAGCTGGCTACGAGTGGGCTACTGGTCAAAGTAGCCCA
TTTAAAAACGTTTTATTCAAAAACGACAAAGTCCAAATTTCAATTAAGTG
CGCATGTTCCGTTCTTAAATTCTTGATCCCATTCTCCTATTATTGATATG
ACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATATTTGAATGGGCTACTGGCTA
CCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATTGTGGGCTACCAGATGGCTACGAGTGG
GCTACCTTTAAAGTAGCCCATTTAAAAACGTTTTACTCAAAAACGACAAA
GTCCAAATTTCAATTAAGTGCGCATGTTCCGTTCTTAAATTCTTGATCCC
ATTCTCCTATTATTGATATGACGTCACTCGGAAATTTATATTTTTGCATA
TTTGAATGGGCTACTGGCTACCAAGCAATCTTAAGCTAAAAATTGTGGGC
TACCAGATGGCTACGAGTGGGCTACCTTTAAAGTAGCCGTTTTAAATATT
TTTCAGTAATAACCCACATTTCTATCAAGTGAAAAATATGAGTCACTGTA
GCAGTTGTTGAGCAATGCTTTGCAATTTGGTCTTATTTGGCATAACATTA
TTCGATTCTCATTTAGGACCACAACAATCAATTTAGCACCGACCTTCTTG
CAGAAACTGATATTGATGCATGCTCGCTGCTATCTTTCTGCCCTGAATTC
CATAAAATGGTCAGTGATGCCAAACCAGCCTTACAATCATCTGGTCTGAA
TTGTAGTGTTAATTGTGGAGTTATTTCGAAAGTGGATGCCATAATTCGGG
AGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGCACTTGAAGAAGTTCGAAAAGCAGTG
CGCAATGCGAAACATGCCTTTTACAAAGGATCATTTTATGTCATGAGTGC
TGGTGGTAAGTGTAATTTTGACTTATTAGCTTATAAAAATCCAATTTTCC
GGCCGCTTTCAATGCTGAATTCATTGGTAGCAGCCTAGGTTCATAGTTTT
ATTTTGTATTTTTACAGCTACATATGCTTATGAACATATGTGCACTGCAG
ACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATATTACAAGTCATATGGGGAAGTTT
GCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGGATGTTTTCAAAATCAGACTGCAT
GGTAAGTATGTCAAATTTAAACAGACATGTATAGTGATGTATAAATAAAA
ATCTCTTTTCGATATCCTCTTTATAACGGCACAATCTTTAATTTATTTTC
ATTTAAATAATACCGTGCTAAATATTTTGTTATTTGGAGCTTTATTATCT
TCTTTATTTTAGTTGATTCCCCAATTGTATTTCGACTCTGACATCATCGA
GACAACGGGTGGTAAATTTTTCAAATTATCTAGCATGCAGTTCATTCCTT
GCCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAGTTCTCACCAAGAATCTACAAA
GAATACAACCGAAACATGGAAGATAATTATTTTGGTGAATGCGTCTCAAA
CAGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAACATTCTTAATCAAGTTCTACC
AGTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATGAAAACGGAAAAGCCCCTTTTG
GTTGGAGAGAAAAATTCCGGGAAGACCTCTATGGTTAAAATCATCACTGC
CCTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTCTTTCGAAGGAAAAGGTTTTTG
GTCTTAGTCAAATCAACGACGATACTCAATTTGTATTCATTGACGAAATG
ACGGAAGAACTGATATCTGCTGACATGGCAAAAATT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000299_pilon:421441..428926- >XLOC_025489 ID=XLOC_025489|Name=XLOC_025489|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2766bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000299_pilon:421441..428926- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AAATTTGCAAGAAAAAATTCAAACTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAGGA
GTGTGTTGGTGGGATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGATG
ATATTGAAGATGCATTACACAGGTACATCATTCTACAAAAATTTGCAAGA
AAAAATTCAAACTGTGTGACTTCCTTCTTGCGTAAGGAGTGTGTTGGTGG
GATGTTTTCGAATCCAGCAAAATCTTTGACAAGTGATGATATTGAAGATG
CATTACACAGGTACATCATTCTACAAATACCAAGAGATAGTCACATGGTG
TCATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAAAAACAAGAAATGGA
AACCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGTCTTAGCGTGCGTGA
CTGGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCTCTGGAAAGAATGCA
ATCAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATGGCAGAAGCTATCGA
AGACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGTGCCAGCTGACGTAA
AATACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCAAAGCCAATGCATTG
CGAGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGATACCAAGAGATAGTCACATGGTGTC
ATGTCGGGCAATGGGTCCAGAAGTTGTCGAAAAAAAACAAGAAATGGAAA
CCAAGATAGCCAAGATCCCTGGTATTGAGTTGGTCTTAGCGTGCGTGACT
GGTACCAAAAGCAACTCTAAAAAGAAAGGCGTCTCTGGAAAGAATGCAAT
CAAAACGGGTGTGGCGTTTTTTGTGGTGATGATGGCAGAAGCTATCGAAG
ACGAAATCCTGAAAGCAATATATGAAAGTGGTGTGCCAGCTGACGTAAAA
TACATAAGGCCGAGATGCAAAAGTCGGGATTCCAAAGCCAATGCATTGCG
AGCAGTATGCCAAGTTGTTAAGGACCACAACAATCAATTTAGCACCGACC
TTCTTGCAGAAACTGATATTGATGCATGCTCGCTGCTATCTTTCTGCCCT
GAATTCCATAAAATGGTCAGTGATGCCAAACCAGCCTTACAATCATCTGG
TCTGAATTGTAGTGTTAATTGTGGAGTTATTTCGAAAGTGGATGCCATAA
TTCGGGAGCCAGACTGTGATTTCGGAAGAGCACTTGAAGAAGTTCGAAAA
GCAGTGCGCAATGCGAAACATGCCTTTTACAAAGGATCATTTTATGTCAT
GAGTGCTGGTGGACCACAACAATCAATTTAGCACCGACCTTCTTGCAGAA
ACTGATATTGATGCATGCTCGCTGCTATCTTTCTGCCCTGAATTCCATAA
AATGGTCAGTGATGCCAAACCAGCCTTACAATCATCTGGTCTGAATTGTA
GTGTTAATTGTGGAGTTATTTCGAAAGTGGATGCCATAATTCGGGAGCCA
GACTGTGATTTCGGAAGAGCACTTGAAGAAGTTCGAAAAGCAGTGCGCAA
TGCGAAACATGCCTTTTACAAAGGATCATTTTATGTCATGAGTGCTGGTG
CTACATATGCTTATGAACATATGTGCACTGCAGACGCCTACATTGAAACC
GTCCTTGATATTACAAGTCATATGGGGAAGTTTGCAAGACACACATTCCA
GTTATCTCGGATGTTTTCAAAATCAGACTGCATGCTACATATGCTTATGA
ACATATGTGCACTGCAGACGCCTACATTGAAACCGTCCTTGATATTACAA
GTCATATGGGGAAGTTTGCAAGACACACATTCCAGTTATCTCGGATGTTT
TCAAAATCAGACTGCATGTTGATTCCCCAATTGTATTTCGACTCTGACAT
CATCGAGACAACGGGTGGTAAATTTTTCAAATTATCTAGCATGCAGTTCA
TTCCTTGCCCATATAAGCCAGACGAATTGGGAAAGTTCTCACCAAGAATC
TACAAAGAATACAACCGAAACATGGAAGATAATTATTTTGGTGAATGCGT
CTCAAACAGTATTAATACTCGACTAAAACGTACAACATTCTTAATCAAGT
TCTACCAGTGCTTATTGCCCGGCCAGCTACCAATGAAAACGGAAAAGCCC
CTTTTGGTTGGAGAGAAAAATTCCGGGAAGACCTCTATGGTTAAAATCAT
CACTGCCCTTACCCATCCACAATTTTGGTGCACTCTTTCGAAGGAAAAGG
TTTTTGGTCTTAGTCAAATCAACGACGATACTCAATTTGTATTCATTGAC
GAAATGACGGAAGAACTGATATCTGCTGACATGGCAAAAATTTTGATTCC
CCAATTGTATTTCGACTCTGACATCATCGAGACAACGGGTGGTAAATTTT
TCAAATTATCTAGCATGCAGTTCATTCCTTGCCCATATAAGCCAGACGAA
TTGGGAAAGTTCTCACCAAGAATCTACAAAGAATACAACCGAAACATGGA
AGATAATTATTTTGGTGAATGCGTCTCAAACAGTATTAATACTCGACTAA
AACGTACAACATTCTTAATCAAGTTCTACCAGTGCTTATTGCCCGGCCAG
CTACCAATGAAAACGGAAAAGCCCCTTTTGGTTGGAGAGAAAAATTCCGG
GAAGACCTCTATGGTTAAAATCATCACTGCCCTTACCCATCCACAATTTT
GGTGCACTCTTTCGAAGGAAAAGGTTTTTGGTCTTAGTCAAATCAACGAC
GATACTCAATTTGTATTCATTGACGAAATGACGGAAGAACTGATATCTGC
TGACATGGCAAAAATT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000299_pilon | genome | sc0000299_pilon:421441..428926 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 910-1383:475 |
| Aaloc | 778-909:768 |
| Aaloc | 487-774:1171 |
| Aaloc | 139-486:7199 |
| Aaloc | 1-138:7487 |
|
