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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000404_pilon:23053..28856- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_021818 ID=XLOC_021818|Name=XLOC_021818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5804bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000404_pilon:23053..28856- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAATTCTGATTTGCGTTTTTTTGACGATTGGGGTGACATGGGCATG
GAACGAGCACATGGAAGGTATCAGTTTAATCCTTTGGGAATAAATAACAA
ATATTAACCAACCGTCAAAGTCCCCGTTTCCCAGTGGTCACAGGACGTCG
AGTCGACGTCGAAAATTAGTCTTCTTTAAATGATTAACTAACAAGCACCA
TAAGCAACACTTTTAGAGCCTGCAAATACATCTCAAGGCTCGCCCCATTC
TTCTGAACAATTTTCAATTGAGAATTTTTCACTTCTCTATGGTGACATAA
TTTAGATGTCTCGACAACGTCTATAAATAACGGGTGAATAGGAGTCTTAG
ATTTTCCTAAAAAAGCAAAGCATTGTGGGACTGTTTCGGGGGTATTACAA
TAGAAATCACTTAGGAATTTCTCGAAGGAATTCTATCGTAATACCCTCGA
AACAATCCCATAATACATCACTGTTTTAGAAAAATCAAAAACTCCGATAA
GGCCTATTGGCCAGACGTCTTCGGAAGACGATGACCAAACTTAGACAGGG
CGAGCCAAAACTGATGTCTCCACGACATCTACAGGGCGTTGTGTTCTACA
CTCTATTTAATAGATTCTAGAAAATTGGTTGAGATACAAATTCAAAAGAT
CAGAAGTGAAGGACTTTAAACCTTGATTCTTTTGTTTTCTAGATGGAAAC
TATTATGAAGGTGATATTAAATTATCTTACAAGCAACTTTTGTTTGGTTC
CATCAGAGGAAAACGTTGGACTAATGGCATTGTCCCATATGTTGTGCACT
CAAGTCTTGGTAAGTGTAATAAATAGCTGACAGAAATAAGTTACACGAGG
GTTTATATTGCGGTTAAGAAAAATCATTGATTAAAAAACTCACTTATCAT
ATCTAATGTGAAATACTTTTGCTTGTAGCCGGCGTTGAGAATGTGATCAA
TGATGCCATTGGTGTTTACCACAAAAAGACTTGTTTGAAATTCGTCAAAC
GCACCAATCAACGAAATTATATTGAATTCTTCAAAGAAACTGGGTAAGGG
ATTGTAGTGATTAAACAAAAAAGGCTACGCGTTTTTTTTAAGAATAAACT
ATATAAAAAATGAACCTTCAATGGCAAAAATATTTAGACAACAAGTCCCT
TGACTTGCAAAATTGAACCAGCAAAAGTACTCACAAAATGGCGAAAATAA
GAACATTTTTTAAGAACTTTTTTCTAGGCTAAAAACTAAAAGCTAAAGGA
GATTTGAGGGCTTCAAAGATTTCTTATATAAAATAAATATTTATAAATTT
GAATGTTTTGCACAGGTGTTGGTCTTACGTCGGTATGAGTGGAGGAAAAC
AACAACTCAGTCTTGGTACTGGATGCCACTGGACAGCTACAACTCAACAC
GAAATCGGACACGCTATTGGTAAAGCGATAAATTCACTATAAAAGACCTT
GCAACAGCAATAAGACCCCGGGGGGGGTTCTTAGGCAAATGGAGGGCACG
GTATGTGTCTTTTTCGGTTTTCCAAAGTCCCGCTAAAGGTCGAAAAAGGC
GGAGAAATAGGAAAATTTCAACTTTTTTACCCCGGGAATGATCGAAATTT
GGTCAAAATTGGTCAAATTTGTCCCAATAAGGGTCGTAAAATTCGAAAAA
TTTTCCATTTTTTTTTCTTCTTTTTAGTCCCAGTAGGGTCCAAGGGAATA
AGACTAATTCTCATCAGAGTGGTTTACACATAAAAAGTTTTACCAAGGGC
CTAAGGGAGAGAATACTATTTTAATCTTCAAGCTTTAATAATCTAAAAAG
TAAAAGCTCCACAAACGTTTTTTCTTATCAGGTCTTCAACATGAACAAAC
CAGACCAGACAGAAATCAATACGTCAAAATCCATCTCAACAACCTCAACA
ATCAAAGTAAGTTTTCAGAATTTGACTAAACAGCTGCACGAGCATTATTC
CTTATCAAATATACATCTTTCCGACCGTAGTTGCGCGGTCAGGCGCATAC
CACTTTATTATCTAAGTTAATTTACCACCCTAAACTCGAGCAAATTCTTA
TTTTACACTTTTTCTATCGTCTTTAGGTTCGGAAAAAGACTGGGACGGTT
TTAGGGTGGCAAAACGGACAACAAATGCCCGTTCGGCAACTGGCCGTTAC
GGTCGAAAAAGTGTAATCTGATATACACTTTTTACTTTTTTTTTTACTTA
GAATATGCTGGCAATTTTCATATCAATAGTGGTGTCGACTCTTTGGGTAC
TCCTTATGACTTCTATTCAATGATGCATTATGGGTGAGTGGTGGTTTACT
TGATCGGGAGAGAGGTCCATTCGTAATTAATTGTAGATCATATATATTTT
CCCCTAATTGTCGTCAAATTTTCGGCCCAAACCATGTACCCGCTTTTTGT
TGAGTAGTTTGTAGAGCAGGTATTCTAATCGTGTTGTGTAATAAAAGAAG
CATCAGAAATCAAAAACATAAATCACCACTTAACTTAAATTTGTTTAACG
AGTTTCATCAATTTTTGACTCTAAACACGATTGGAGTCTAGCCTATGTAG
TCTACCCCTTGGAGAAATAGGCTCAAATTGTATTTTCTTTAAAAAGACAT
CTAATTGCATAATCATCCAAACTTAGGTCAACAGCCTTTGCGAAGAGTGG
TACCAAAACCATCACAACTTTGGACAGATCTAAGCAACGAATCATTGACA
ATAACTACCATTATGGAATGAGTGATATCGATGCAAAACAAATTAATCTC
ATGTACAAGTGTGCAGGTTGGTTTGTTTGTTACTGAAAACACTTTTTTAT
AAGAACAAACTATATAAGACAGTTTGTCTATAGATTAAGAACAAGTTTAA
GAATATTTTATTGTTTTGTGAACTCTAAAACACCCAGCTTCTATAGGAGT
ATGGATAAAAATACTCATAAAATGGCGAAAATAAGAACATGCTAAGAACA
TCTTTAGGCTTAAATGTTAAGAACATCCGAAGCATTAAAAAACTTTGTAT
TTCGAGTTTTCCATTTTCTTTTTTGTTTTATTCTTCATAACAAAGGTGGT
GAATCCAGTTGAAAAAAAAGGAACATTAAAAAAAGGAGGTTTTGAAGACG
GCGGGGTTTATTTAGACTGAGCCATTGGAATCCAGGTATTCTCATTTAGA
AATTTGAAATAATCATAAATCACACGAACTTTTCTTTTAAGGAGGTGGTG
GTAGTGGTAGCAACAATGGTGATCTCAAAAATGACGGTAAATATTCTCAC
GACCTTTATATTAGCCTATTTCATAGGATTCGTGTTTTTAGTACATAATA
TTTTTCTACGCCATTACAGTGATAAACTTTTCTTTCGCGAATTTAGATTA
TATAAATTTAACAAAAGAAATGGAAAATAATTCCAAAGTCAGTTGAATGG
TGACAGAAAATCTATTTATTCAACATATTTCTCAAAGGTCTGCACAGATT
TGAGCATTTTGCTCCTTTGAATTGAATAGAAAATAGCATGGATGCACAAA
TCCTATAAAATAGGCTAGTAACCATCCAGGATCTTTGAATTAAATTTACC
AAAATCTTACAATGATTTACAGAACATCTTGTACCGGTTTTTTTCGAAAA
GAAAATGTTACATTTGCTTGAAATCTCGGTGGAGGCACTTAGGCAAGAAT
GGGTATGCGGACGTACCGCTTGGCAGGGTTCCTTTTTTCACCCCTGGAAA
TATGTGACAAAATCACGAAATTTTAAGAAATGGCTCTGGCAGGGCTGGAA
TTTTGTAATTTTTTACTCTGACAGGGTGAATTTTATGTCATTTTAGCACT
TTTTGCAAAACATTTGGAAATTCCTAACTTTTTGACACTGACAGGGCTCA
TTTTTTGTCAAAAATCATTCTCTGAAACTGACAGGGTCCACTTTTCAATC
TCCAGTGTCACGTCCCCGTCGGTCAGTGCCCCCGGGATCAAGATTATTAG
AAAAATAGAAATCTTAATTTTGTTGAAAGAGGACAGACTTTGTGAGAGTT
ACCTTCACTTTTTCGCGAATATTCGCTAGTACTGAAAGGTTTAGATTTTA
AAGTTTTAGACTTTAATGACACGTGGTTCATGCAATGTTTACATTTTACT
AGTTTTATGTTTCTTTAAATATCCTTCTATCCTGATCAGGTGAGGATTGC
TGGGGTCGTTGTTATGGCAAAGGAGGAGCATGTCCACAATTCTGTGGTCG
AACTGGATTGTGTTGTCGTACTGGATGGAATGATCCCGGTTGCGAAAGAG
CATCAAAACCTTGCAACTATCATTGTTGTACAGCGCCTAAGAAAGAAGTA
AAAAATGTTGGTAAGTATATTTTAAGTATTTAACAGACTATACTCCCCCT
TCTCACAGAGCCGTTAGGATTTTTTCAGCCAGTGGGGGTACAAATAACGG
TTTGGGTGCGATATTTTGGCCAATCGGAAAAAGGGCTAAATTTGGGAATT
TTGTTTTGTTTTGTTTTTGCGATGCATTTTAAGATCAGCAATATTTTAAG
CCATTCGCAATGAATATTCGGAACTCGGTTTTGATTAAATTTGGGTAATA
TCTTTCGATTGAATATAAATATTGTTAAATAGTTCCATACTGATTCAGTT
TTTATCATTATCCAAACCTTAATTAATTTAGATTTTTTAATATTATTCCA
CTCATTATCGTTTCAACAAGCACAAAAACTTTTATCCCACATTATAAAAC
CTATAACCATAGTATAAGAAAGCCCCGGCTGGAATATGTACCGCATTGTC
TTTTCAGTTAATTGCTGTTCCATCTCTGTCTCCGAGCTTTATAAGAACAT
CAAGATGATCAGTTTGTTATTGGTAGATAACTCTCTTATTTTCCTTCACA
AAAAGGTTTTTTATTGCTAGATATTTTTGAATCTGTACCCAATGCAATAG
AACACTTGAACTAATTTTCGACATATTTTAGGGGTATTTTGTGGAAACAA
TCGTTTTTCGCTAAAATTGAAATTATAAGAACTATATTCAAGATGACTTT
ATAATGCAAGTGTATTATCAAGAGCATATCATTAATGTCTAAAACGCACT
GAGAAGTAAGTATTAACGACAAACTAACAAAATTTACCATTGAAGATACT
ACATTACTGATTGCTTGATCAACAAATAGTCATCAAATACGACAGAGATA
GAATAACAGAAATTCAGATGTTATCATTCCAGCCGCGGCTTTCTTATACT
ATGCTATAACCTAATTGACACAGACTATAATTTAAATCTTTACCGAAGTT
ACTAAAGCCGATTCGTAAATGACACCTCTGTGTCACAGACTAACTGCGAC
CTCAGCCCCACTAGAAAATTTGGCAAAAATTTTGTCCCCGGTGGGAAGAT
ACCCCAAAATTTCAGCCCCACTGGAAAAAAGGCTTTGATTTCATTCCCAT
TCGAAATTAAATGTTTAAAAATTGTACTCCGAATACTATCCCCATTGAAT
TTTGTAACCTTTAAACAATAGAATTTTTATGCCAATTGGGATTTCAATAG
AAATCTTTATTTCTGCTGATGAAAAAAGTTCCATTCGGGCTGTCAGACAG
AGGTGTCATTTGGAAGCAATGTCGGTTGAGTCAAGGAACTTGATAGAAAG
AAACTTTAGCCACAAAACTCAGCAATTCTTTACAATCATATGTTTACCAT
AGGCAAGGATTGTTGGCACCATTGTTCAAACAAAGGAGGAAAATGCTCGT
CAGGATATTGTGGAAAAGATGGTCTTTGCTGCAGGAGAGGGTGGAATGAT
AGAGGCTGTGAAAAAGCAAAGGCTGCATGTGGATATCATTGCTGTACTGC
TTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000404_pilon:23053..28856- >XLOC_021818 ID=XLOC_021818|Name=XLOC_021818|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2136bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000404_pilon:23053..28856- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAAATTCTGATTTGCGTTTTTTTGACGATTGGGGTGACATGGGCATG
GAACGAGCACATGGAAGATGAAAATTCTGATTTGCGTTTTTTTGACGATT
GGGGTGACATGGGCATGGAACGAGCACATGGAAGATGGAAACTATTATGA
AGGTGATATTAAATTATCTTACAAGCAACTTTTGTTTGGTTCCATCAGAG
GAAAACGTTGGACTAATGGCATTGTCCCATATGTTGTGCACTCAAGTCTT
GATGGAAACTATTATGAAGGTGATATTAAATTATCTTACAAGCAACTTTT
GTTTGGTTCCATCAGAGGAAAACGTTGGACTAATGGCATTGTCCCATATG
TTGTGCACTCAAGTCTTGCCGGCGTTGAGAATGTGATCAATGATGCCATT
GGTGTTTACCACAAAAAGACTTGTTTGAAATTCGTCAAACGCACCAATCA
ACGAAATTATATTGAATTCTTCAAAGAAACTGGCCGGCGTTGAGAATGTG
ATCAATGATGCCATTGGTGTTTACCACAAAAAGACTTGTTTGAAATTCGT
CAAACGCACCAATCAACGAAATTATATTGAATTCTTCAAAGAAACTGGGT
GTTGGTCTTACGTCGGTATGAGTGGAGGAAAACAACAACTCAGTCTTGGT
ACTGGATGCCACTGGACAGCTACAACTCAACACGAAATCGGACACGCTAT
TGGTGTTGGTCTTACGTCGGTATGAGTGGAGGAAAACAACAACTCAGTCT
TGGTACTGGATGCCACTGGACAGCTACAACTCAACACGAAATCGGACACG
CTATTGGTCTTCAACATGAACAAACCAGACCAGACAGAAATCAATACGTC
AAAATCCATCTCAACAACCTCAACAATCAAAGTCTTCAACATGAACAAAC
CAGACCAGACAGAAATCAATACGTCAAAATCCATCTCAACAACCTCAACA
ATCAAAAATATGCTGGCAATTTTCATATCAATAGTGGTGTCGACTCTTTG
GGTACTCCTTATGACTTCTATTCAATGATGCATTATGGAATATGCTGGCA
ATTTTCATATCAATAGTGGTGTCGACTCTTTGGGTACTCCTTATGACTTC
TATTCAATGATGCATTATGGGTCAACAGCCTTTGCGAAGAGTGGTACCAA
AACCATCACAACTTTGGACAGATCTAAGCAACGAATCATTGACAATAACT
ACCATTATGGAATGAGTGATATCGATGCAAAACAAATTAATCTCATGTAC
AAGTGTGCAGGTCAACAGCCTTTGCGAAGAGTGGTACCAAAACCATCACA
ACTTTGGACAGATCTAAGCAACGAATCATTGACAATAACTACCATTATGG
AATGAGTGATATCGATGCAAAACAAATTAATCTCATGTACAAGTGTGCAG
GAGGTGGTGGTAGTGGTAGCAACAATGGTGATCTCAAAAATGACGGAGGT
GGTGGTAGTGGTAGCAACAATGGTGATCTCAAAAATGACGGTGAGGATTG
CTGGGGTCGTTGTTATGGCAAAGGAGGAGCATGTCCACAATTCTGTGGTC
GAACTGGATTGTGTTGTCGTACTGGATGGAATGATCCCGGTTGCGAAAGA
GCATCAAAACCTTGCAACTATCATTGTTGTACAGCGCCTAAGAAAGAAGT
AAAAAATGTTGGTGAGGATTGCTGGGGTCGTTGTTATGGCAAAGGAGGAG
CATGTCCACAATTCTGTGGTCGAACTGGATTGTGTTGTCGTACTGGATGG
AATGATCCCGGTTGCGAAAGAGCATCAAAACCTTGCAACTATCATTGTTG
TACAGCGCCTAAGAAAGAAGTAAAAAATGTTGGCAAGGATTGTTGGCACC
ATTGTTCAAACAAAGGAGGAAAATGCTCGTCAGGATATTGTGGAAAAGAT
GGTCTTTGCTGCAGGAGAGGGTGGAATGATAGAGGCTGTGAAAAAGCAAA
GGCTGCATGTGGATATCATTGCTGTACTGCTTAAGCAAGGATTGTTGGCA
CCATTGTTCAAACAAAGGAGGAAAATGCTCGTCAGGATATTGTGGAAAAG
ATGGTCTTTGCTGCAGGAGAGGGTGGAATGATAGAGGCTGTGAAAAAGCA
AAGGCTGCATGTGGATATCATTGCTGTACTGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000404_pilon | genome | sc0000404_pilon:23053..28856 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 919-1068:151 |
| Aaloc | 748-915:1664 |
| Aaloc | 703-744:2612 |
| Aaloc | 562-699:3178 |
| Aaloc | 481-558:3602 |
| Aaloc | 406-477:3972 |
| Aaloc | 301-402:4489 |
| Aaloc | 187-297:4875 |
| Aaloc | 70-183:5111 |
| Aaloc | 1-66:5805 |
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