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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000393_pilon:239693..241066+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_020277 ID=XLOC_020277|Name=XLOC_020277|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1374bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000393_pilon:239693..241066+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaaaaaagAAGTGTGGCTCCTATGGAAAAATTCGACAAGCTAACCGTTAT
AATTGGAATAACATGCTCGCTCCTGTATGCGTTATTCTTCCAAATTGGTG
ATGGTTTGTTTAAATATACATTCAACCATAGCGACGTTCGTGTTTTCGAG
GCTTTATTGATTCGATACATTATCAATTTAGTTATCGTTTCAAGCAATAT
GCTAATTGAAAAGATTTCACCCATTCAGAGCTTCACGAAAACATGTTATT
TAGTAGCTGCTGGCATTTTACGGTTATCTTGTGTCATCTTCCTTGGAATG
GCCTTGAAAAGGCTTGATATGGGCACCAATGCAGTCATTTTTGGTACACT
TCCTGCATTCTGTATTTTGTTTGGTTGGttattgttaaaagaaaaaacaa
aattatctgATATGATGTACGGTTTATTATCCTACGTTGGAGTCGTCTTG
GTAGTCTGGGAACGAATTGAGACACCAAAAAATGATTATTATTCATATAT
TTTGGGAATCGTTTTCAGTTTATGTTCGGTGTTATCTATATGCTTTTACT
GTGtcgtcataaaaaaaattacagagTCCACTTGCCTTCAAGTGACACTA
TTCTATATACACTTCACTGGACTACTAATCCTACCCTTTGCACCTTGGAT
ATTCGGCACAAGCTTCGTACTGATCAGATCGCCTCTGATTTTCACGTATC
TTCTACTGGGAGCTGGAGTTTCATATTTTCTATGTGTCATTTGTGAAGTG
ATCAGTTTGAGATGTTTAAATATTGCTTTGATTATGTTATTGAGGAATTC
AGAATTTGTTTGGGCATATTCCTATGACATGATTATCACGCATATATTTC
CGAATtgggtaagtttttttttatcattgtaTCTTTATTACCTCTGCAGA
TTTTTCTTCTTGAAGAGAATTTTAAACCTTCATATCACAAACCTGTtgaa
ccccttcccactggtATAAAGCATTGATAGGTATAGATAAAAGGATATAC
AAACCATCATAGGCAAAAGAACTACTCGATGATTAGAGATTCCTGAAAGT
TCCTTTTagtttttctcaacttttttattGAACGCACATCTGCTCAGATT
TGGGAAAATCTGCAAAGATTTGTGTATTTTTCCCCTgcaaattgaataga
aaattagTCATGTGGCAGGATACAccaatcctatgaaataggctaatcaT
GGGCTAATTTATGACAGTTTGTTTTCAGTTTGTTTGTTTACTTTACAGAT
TGTTATAATCGGCTTGTTGATTGTGATAGTGGCAACTTCAATGATTGCAG
TCAATATGATTTATGATATCCCTTATTTGGCTACAATCAAACGATGGGAA
TCTAAGATCTGCAAAACTGTTTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000393_pilon:239693..241066+ >XLOC_020277 ID=XLOC_020277|Name=XLOC_020277|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1968bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000393_pilon:239693..241066+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
aaaaaaagAAGTGTGGCTCCTATGGAAAAATTCGACAAGCTAACCGTTAT
AATTGGAATAACATGCTCGCTCCTGTATGCGTTATTCTTCCAAATTGGTG
ATGGTTTGTTTAAATATACATTCAACCATAGCGACGTTCGTGTTTTCGAG
GCTTTATTGATTCGATACATTATCAATTTAGTTATCGTTTCAAGCAATAT
GCTAATTGAAAAGATTTCACCCATTCAGAGCTTCACGAAAACATGTTATT
TAGTAGCTGCTGGCATTTTACGGTTATCTTGTGTCATCTTCCTTGGAATG
GCCTTGAAAAGGCTTGATATGGGCACCAATGCAGTCATTTTTGGTACACT
TCCTGCATTCTGTATTTTGTTTGGTTGGttattgttaaaagaaaaaacaa
aattatctgATATGATGTACGGTTTATTATCCTACGTTGGAGTCGTCTTG
GTAGTCTGGGAACGAATTGAGACACCAAAAAATGATTATTATTCATATAT
TTTGGGAATCGTTTTCAGTTTATGTTCGGTGTTATCTATATGCTTTTACT
GTGtcgtcataaaaaaaattacagagTCCACTTGCCTTCAAGTGACACTA
TTCTATATACACTTCACTGGACTACTAATCCTACCCTTTGCACCTTGGAT
ATTCGGCACAAGCTTCGTACTGATCAGATCGCCTCTGATTTTCACGTATC
TTCTACTGGGAGCTGGAGTTTCATATTTTCTATGTGTCATTTGTGAAGTG
ATCAGTTTGAGATGTTTAAATATTGCTTTGATTATGTTATTGAGGAATTC
AGAATTTGTTTGGGCATATTCCTATGACATGATTATCACGCATATATTTC
CGAATtggaaaaaaagAAGTGTGGCTCCTATGGAAAAATTCGACAAGCTA
ACCGTTATAATTGGAATAACATGCTCGCTCCTGTATGCGTTATTCTTCCA
AATTGGTGATGGTTTGTTTAAATATACATTCAACCATAGCGACGTTCGTG
TTTTCGAGGCTTTATTGATTCGATACATTATCAATTTAGTTATCGTTTCA
AGCAATATGCTAATTGAAAAGATTTCACCCATTCAGAGCTTCACGAAAAC
ATGTTATTTAGTAGCTGCTGGCATTTTACGGTTATCTTGTGTCATCTTCC
TTGGAATGGCCTTGAAAAGGCTTGATATGGGCACCAATGCAGTCATTTTT
GGTACACTTCCTGCATTCTGTATTTTGTTTGGTTGGttattgttaaaaga
aaaaacaaaattatctgATATGATGTACGGTTTATTATCCTACGTTGGAG
TCGTCTTGGTAGTCTGGGAACGAATTGAGACACCAAAAAATGATTATTAT
TCATATATTTTGGGAATCGTTTTCAGTTTATGTTCGGTGTTATCTATATG
CTTTTACTGTGtcgtcataaaaaaaattacagagTCCACTTGCCTTCAAG
TGACACTATTCTATATACACTTCACTGGACTACTAATCCTACCCTTTGCA
CCTTGGATATTCGGCACAAGCTTCGTACTGATCAGATCGCCTCTGATTTT
CACGTATCTTCTACTGGGAGCTGGAGTTTCATATTTTCTATGTGTCATTT
GTGAAGTGATCAGTTTGAGATGTTTAAATATTGCTTTGATTATGTTATTG
AGGAATTCAGAATTTGTTTGGGCATATTCCTATGACATGATTATCACGCA
TATATTTCCGAATtggATTGTTATAATCGGCTTGTTGATTGTGATAGTGG
CAACTTCAATGATTGCAGTCAATATGATTTATGATATCCCTTATTTGGCT
ACAATCAAACGATGGGAATCTAAGATCTGCAAAACTGTTTAGATTGTTAT
AATCGGCTTGTTGATTGTGATAGTGGCAACTTCAATGATTGCAGTCAATA
TGATTTATGATATCCCTTATTTGGCTACAATCAAACGATGGGAATCTAAG
ATCTGCAAAACTGTTTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000393_pilon | genome | sc0000393_pilon:239693..241066 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 862-987:1249 |
| Aaloc | 4-861:1 |
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