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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000179_pilon:121365..125371- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_019923 ID=XLOC_019923|Name=XLOC_019923|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4007bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:121365..125371- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGCCTAAAGCGAAGTGGAGAAGAACTGACATAAGAAAGTGCAATTG
CCCAGCTTTGACAAAAGAACATGTTCATTGTCCTTGTATTGGATGCCAAC
ATACTGCAGTAAGTAGAAGAACGGAATTAAGGCATTGGCAACAACATGAG
AAAATATTTCAAGATGATCATGACCAAGACGCGCAGATTGTTGAAACCGA
CAATGATGTTGATGATAGTGACAGTGACAATTTATTAAATAAGACTGCAT
CTGCCAACTCCTCTCCCAGCAGTGTTATTAGCAGCAGTGTCTCAACAGCA
TCAGCCGAGAGTTTCAGTATAAACCACCAGCTGCAAGGCGATGATGAGCC
CCATCATAAAACCTCCAGTAGTAGTATTATTAGTGATGGTGATGTTGATA
ATAATGGACCTAATAATGATGAAAATGACCACAGTAATCAAGACTTTGAC
CCAGAAACGGAAATAGATGCAAATGATGGTGATAACGATAACATGTATGT
ATAAAGAGGCGGTGGGCCATATATTTAAAAATTGTTCTGTTTTTTAATAA
AAATACTTGTGCACATTTTAATAATGTTCTCTAAGATTTCATTGAAGAAG
TTGATTTTCTTCTTATTCATTGGTACTTCATCTTCATTTTCCAATATTTT
TTGAGTTTTTTTTTTTATGATGATATTGGGCCATTCCAGAAAATTTTTGT
TGCCCCCCCCCTGCGTCGGACAACATGCATTTTTAATTCTTTTATAGCCT
CAAAAATAATTTTTCTTTTCCAGTGGTGGTCGGAAATTCCCATAAAAATC
CATGTACTTTTGCAAAATGCATCGGAAATACCACTCTTTTTTTGCCTTTT
TTAATTCGATTGCCTTGGAAATTCATACATTTTCTTCTCTCGCCTTGGAA
ATTTCGAATTTTGGTGAAAACTTTTGCCCTCGGAAATCCTGTGTTGTCCG
CCCCCCCCCCCTATTACAGACAAATTCTGGAATGGTCCATTCCACTCTTG
TTTATTTTTTCAACAAGCACAAAACTGCTATCTAATTCGAATTATATGTC
AAAAGTTTTTTAATTAATGTTAACGTCATATAATTGATCCGTCTTTTACA
AAGGTACAAGATAATTTATCTCGTTTGTACAGACTGTACTTCACCACTTT
CTCCCAAACGAATTTTTTTGATTTCATTTTTTAGAAATGGAATGATTTTG
AAATATTTGATCTTGATCATGGACTTAGCAATGAAGATGAATGCCTCTAA
TGCTCAGACAGAAGACCTGCTTGCTTTTGTTAACCAAATGTTTGGAGATT
TCAGCCCAGATTTACAGTCAAAATAGCCACTCTCATATTATAAAGCTATA
CATGCAATGAAATCCTCTAGTTTATATTCTGATCCAGTTGAACACGCTAT
ATGTTTCAATGAAAAGGAGCACCAGATACATTGGTACCAGATGAATCCAG
ATGAATCCTGTCCAGATTGTGATGAAACTCCACCTATTAAACGTTACTAT
CTCCCATTAAAAGAAAAATTAATGCGCTGGTTTCAATCTGAAGAAATGTG
CACAGCCATGCTTGGTCATTGGAAGAATCGAGACAGGTGGCTTGGAAAGG
AAGGGCCAACTTTTCCCCTAAAAGAGATATGGGACGGAACAAGGTTCAAA
GAGATCCAGTGTTTTTTTGATCCACTGTCAAAGTGGCCTTTGCCTCACAC
TTGTAAAAAATGTGAGCATAAAACTATTCTCCAGAATGTCGTGGATGAGG
ATGAGGTTGAAGTAACGTGTCCTAACTGTGGATTGTTTGCTGTCATTCAA
CCAGAATTTTGTCATGGAGATCCTCGTAACATTGTTTTTATTGGACACTG
GGATGGCTGGCAACCAAAGGTTGGAAGAAGAAGGGCCAAAAGCTCTGGTG
AGAATTGATATTTTAACTTATGCTTAGCATATGCTTTTAAATGTTTCTCA
TATCCAAGCCTAGATATGATTTTAGGTGCAATGTTTATAAAGAAAAAAGC
ACTTAATTTGCAGATTTTTGTTGTATTTGTCTAATTCATTTGATCCAGAA
TTTATCTCTCCTTAACCCTATTTTTATCAGGGGGGGGGGTGTTTTCCACC
AGGCTTGCACTCTTTTGCTAATAGCTCACTGAAAAAAAAATTTAACACTC
TGAAAAATTTTAACTTTTAATATAATTCTATTAGCACCATGTATACCAAG
TTTTACAATTATACACCGACCAGATCAGGTTTTATGTCTTTTTTGTGCAC
GCATATCATAAAATCCAGCTAAAACCCTGTAAAATCCCAAAATCTTAAAT
TTAGCATAACTTTTGATCTAGGCATCCAACTGACTTCAAATTTTGACAGG
TTTTAGGTATCAATAATATATTTTAAAAAATATTTAAAATTTTTTCAAAA
ACTGCTGACGTCATCACAAATGACGTCATTGTTTTTTGAAAAGATTTACT
CATTTTCTGCATAGATTTTAAACCTCAATTTTATTAGTATGTTAAAAACC
GGCAAACATGTTAAAGATATTCGTTTTGGCTTTTAGAAATTCAAAACAGA
ATGAAAAAATCTTCATTCGTTCAACTTTAATTGCTATTTTATTGAATAGT
TCTTTTTCATTGGTCAGCGATAATTGTGAAACTTTGTGATGACGTCATCA
CCTTTATGATGACGTCATCACCTTTATAATGACGTCATCACCTTTATAAT
GACGTCATCAACCTAAATTTTTTTCTATGAACTCCTTTTATGGTAGAGAA
CATCTCTGCCAAATTTCAAGTCCATATCTTTTCTAGATCAAAAGTTATGC
AATGCTGGTGGAAAACACCCCCCCCCCCTTGAGAATACAAAATCCGAAAA
AGCCTGATAATAATAGGGTTAAATGATGAATATTAATATTGATGAATTTT
CAAAAATCTAATAATTCAAATACTTTCTTCCTATTAAATTTCTACAAAAG
GGTTAAGTTAAACACTTCTTCTGATTTGGTCTCCCTAATCCTCTGATTAG
TATTGAATAAAAAAGTCGTTCTTTTTTCGTTTCTTTTTAAGGAACTATTG
ATTTGACAATCGCAAACATTGAAAAAGAAGAGAGATGTAAAACAAAACAC
ATGTATGTGTCACCTTTTGTGCCTGAGCACAAACTACCCAAGAAACAGCC
ACTTGTCCTGGATCCTTTTCTACAGCCAATATTGGATGAACTTGAAGACT
TGTTCATAAATGGTTAGTTTAAAATTCTGAATATTCGCCATAAAACTGTA
ATTTTTACCCTGACTATTATTTTTTTTGACAGTGTCCTTTACAATAAACT
TACTGTTACTGTAAACACTTTAATTTTTCTTGAATAATACAAACCAGAAG
AAAAGGTTCAAAATTAGAGAAATTTAAAACATAAGTATTTTTAATGAATG
ATTGCAGGTTAGGTTACAATTCGAAACCCTTTTTTATTTAGGTATTGAGA
TTATGTATCCTTTTGAAGTATATGATAATGTTGTGCCACCAGGAAGGTGT
GTCATTAGATGCATGCTGTTATGTTGGACTGGAGATTATCCAGCCCAGTG
TCAGGTTGGAAAATTCTCCAAGATGGGAATTTCTGGTTGCACAGTTGATC
ATTGTAAAGGTAAAAGATTTTTATAATTTTTTTTTCATGCCTCGTCAAGA
TTATGAAACTATATTGGAACTGGAGAGCTCTGTAATTTTAGGTTACTAAA
ATAATAGTTTTTAATTATTATTTTTTTCAATTTTCATTTAACGAGGCGTT
GCTATTATTAACCAAATTTGCAAATTTTGAACTGTTTAATTTTATTTTTA
CTTCATTCTATTTTAGGAATTTCTCTTACTGATGGTGGGACTACCAAGTA
TTATGTAAACAATCGGGAACATCATACAAACCCATGGCCAAAGCGAGAAA
TAACCACTGAAATCAAAGTAATGGAAAGAGTTGAATTTCAACCAAGTACC
CAAGCAAAATTACGATTAGTTACAACCACTGGTTATTCTGGCATGACACT
TTTAACA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000179_pilon:121365..125371- >XLOC_019923 ID=XLOC_019923|Name=XLOC_019923|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3474bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000179_pilon:121365..125371- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGCCTAAAGCGAAGTGGAGAAGAACTGACATAAGAAAGTGCAATTG
CCCAGCTTTGACAAAAGAACATGTTCATTGTCCTTGTATTGGATGCCAAC
ATACTGCAGTAAGTAGAAGAACGGAATTAAGGCATTGGCAACAACATGAG
AAAATATTTCAAGATGATCATGACCAAGACGCGCAGATTGTTGAAACCGA
CAATGATGTTGATGATAGTGACAGTGACAATTTATTAAATAAGACTGCAT
CTGCCAACTCCTCTCCCAGCAGTGTTATTAGCAGCAGTGTCTCAACAGCA
TCAGCCGAGAGTTTCAGTATAAACCACCAGCTGCAAGGCGATGATGAGCC
CCATCATAAAACCTCCAGTAGTAGTATTATTAGTGATGGTGATGTTGATA
ATAATGGACCTAATAATGATGAAAATGACCACAGTAATCAAGACTTTGAC
CCAGAAACGGAAATAGATGCAAATGATGGTGATAACGATAACATATGGAG
CCTAAAGCGAAGTGGAGAAGAACTGACATAAGAAAGTGCAATTGCCCAGC
TTTGACAAAAGAACATGTTCATTGTCCTTGTATTGGATGCCAACATACTG
CAGTAAGTAGAAGAACGGAATTAAGGCATTGGCAACAACATGAGAAAATA
TTTCAAGATGATCATGACCAAGACGCGCAGATTGTTGAAACCGACAATGA
TGTTGATGATAGTGACAGTGACAATTTATTAAATAAGACTGCATCTGCCA
ACTCCTCTCCCAGCAGTGTTATTAGCAGCAGTGTCTCAACAGCATCAGCC
GAGAGTTTCAGTATAAACCACCAGCTGCAAGGCGATGATGAGCCCCATCA
TAAAACCTCCAGTAGTAGTATTATTAGTGATGGTGATGTTGATAATAATG
GACCTAATAATGATGAAAATGACCACAGTAATCAAGACTTTGACCCAGAA
ACGGAAATAGATGCAAATGATGGTGATAACGATAACATAAATGGAATGAT
TTTGAAATATTTGATCTTGATCATGGACTTAGCAATGAAGATGAATGCCT
CTAATGCTCAGACAGAAGACCTGCTTGCTTTTGTTAACCAAATGTTTGGA
GATTTCAGCCCAGATTTACAGTCAAAATAGCCACTCTCATATTATAAAGC
TATACATGCAATGAAATCCTCTAGTTTATATTCTGATCCAGTTGAACACG
CTATATGTTTCAATGAAAAGGAGCACCAGATACATTGGTACCAGATGAAT
CCAGATGAATCCTGTCCAGATTGTGATGAAACTCCACCTATTAAACGTTA
CTATCTCCCATTAAAAGAAAAATTAATGCGCTGGTTTCAATCTGAAGAAA
TGTGCACAGCCATGCTTGGTCATTGGAAGAATCGAGACAGGTGGCTTGGA
AAGGAAGGGCCAACTTTTCCCCTAAAAGAGATATGGGACGGAACAAGGTT
CAAAGAGATCCAGTGTTTTTTTGATCCACTGTCAAAGTGGCCTTTGCCTC
ACACTTGTAAAAAATGTGAGCATAAAACTATTCTCCAGAATGTCGTGGAT
GAGGATGAGGTTGAAGTAACGTGTCCTAACTGTGGATTGTTTGCTGTCAT
TCAACCAGAATTTTGTCATGGAGATCCTCGTAACATTGTTTTTATTGGAC
ACTGGGATGGCTGGCAACCAAAGGTTGGAAGAAGAAGGGCCAAAAGCTCT
GAAATGGAATGATTTTGAAATATTTGATCTTGATCATGGACTTAGCAATG
AAGATGAATGCCTCTAATGCTCAGACAGAAGACCTGCTTGCTTTTGTTAA
CCAAATGTTTGGAGATTTCAGCCCAGATTTACAGTCAAAATAGCCACTCT
CATATTATAAAGCTATACATGCAATGAAATCCTCTAGTTTATATTCTGAT
CCAGTTGAACACGCTATATGTTTCAATGAAAAGGAGCACCAGATACATTG
GTACCAGATGAATCCAGATGAATCCTGTCCAGATTGTGATGAAACTCCAC
CTATTAAACGTTACTATCTCCCATTAAAAGAAAAATTAATGCGCTGGTTT
CAATCTGAAGAAATGTGCACAGCCATGCTTGGTCATTGGAAGAATCGAGA
CAGGTGGCTTGGAAAGGAAGGGCCAACTTTTCCCCTAAAAGAGATATGGG
ACGGAACAAGGTTCAAAGAGATCCAGTGTTTTTTTGATCCACTGTCAAAG
TGGCCTTTGCCTCACACTTGTAAAAAATGTGAGCATAAAACTATTCTCCA
GAATGTCGTGGATGAGGATGAGGTTGAAGTAACGTGTCCTAACTGTGGAT
TGTTTGCTGTCATTCAACCAGAATTTTGTCATGGAGATCCTCGTAACATT
GTTTTTATTGGACACTGGGATGGCTGGCAACCAAAGGTTGGAAGAAGAAG
GGCCAAAAGCTCTGGAACTATTGATTTGACAATCGCAAACATTGAAAAAG
AAGAGAGATGTAAAACAAAACACATGTATGTGTCACCTTTTGTGCCTGAG
CACAAACTACCCAAGAAACAGCCACTTGTCCTGGATCCTTTTCTACAGCC
AATATTGGATGAACTTGAAGACTTGTTCATAAATGGAACTATTGATTTGA
CAATCGCAAACATTGAAAAAGAAGAGAGATGTAAAACAAAACACATGTAT
GTGTCACCTTTTGTGCCTGAGCACAAACTACCCAAGAAACAGCCACTTGT
CCTGGATCCTTTTCTACAGCCAATATTGGATGAACTTGAAGACTTGTTCA
TAAATGGTATTGAGATTATGTATCCTTTTGAAGTATATGATAATGTTGTG
CCACCAGGAAGGTGTGTCATTAGATGCATGCTGTTATGTTGGACTGGAGA
TTATCCAGCCCAGTGTCAGGTTGGAAAATTCTCCAAGATGGGAATTTCTG
GTTGCACAGTTGATCATTGTAAAGGTATTGAGATTATGTATCCTTTTGAA
GTATATGATAATGTTGTGCCACCAGGAAGGTGTGTCATTAGATGCATGCT
GTTATGTTGGACTGGAGATTATCCAGCCCAGTGTCAGGTTGGAAAATTCT
CCAAGATGGGAATTTCTGGTTGCACAGTTGATCATTGTAAAGGAATTTCT
CTTACTGATGGTGGGACTACCAAGTATTATGTAAACAATCGGGAACATCA
TACAAACCCATGGCCAAAGCGAGAAATAACCACTGAAATCAAAGTAATGG
AAAGAGTTGAATTTCAACCAAGTACCCAAGCAAAATTACGATTAGTTACA
ACCACTGGTTATTCTGGCATGACACTTTTAACAGAATTTCTCTTACTGAT
GGTGGGACTACCAAGTATTATGTAAACAATCGGGAACATCATACAAACCC
ATGGCCAAAGCGAGAAATAACCACTGAAATCAAAGTAATGGAAAGAGTTG
AATTTCAACCAAGTACCCAAGCAAAATTACGATTAGTTACAACCACTGGT
TATTCTGGCATGACACTTTTAACA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000179_pilon | genome | sc0000179_pilon:121365..125371 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1549-1737:190 |
| Aaloc | 1381-1545:565 |
| Aaloc | 1210-1377:965 |
| Aaloc | 496-1206:2823 |
| Aaloc | 1-492:4008 |
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