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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000515_pilon:7753..14816+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_019747 ID=XLOC_019747|Name=XLOC_019747|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7064bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000515_pilon:7753..14816+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGTTTTTCTTGtctttgttgatttttcatTCGATTTTATTAATTGA
AGCCTCTGGTCAAAAACAGAACACTAAttgtttgaaaacaagaaatgtGA
CCATAATTCTTGACTTCACCTTATTCGGATTCATCACAAAATATCGGTAC
GATATTGATCACTACGACCCGACCTACTTATACCAGCTTTCCTCACAGTT
GCTGCGAATACCATGTACAGATGTTTGGATGTATTCACGCCTCAGAAAAA
GATCGATTCAACTCAAAGAGAATGACCTTGTGTTAGATTTGGAAAATGAA
ATGGCTGCAATGACAGAAATCGAGACAAGTGATTTTCTTGCATTTATATC
AAGACTTCATTCAGGCAATGGGGCTATCAAACAAACTATCGTATATCTGC
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AAAAAGAGAGCAAATGCATTAGAAGAACtgcaaaatgaaaaacattacaa
GATTTTAATACATTGTAATGGGTTACATAATCCTGACAGTATATCTGAAA
GCTATTTTTGCTCACTTTTAAAAGCCTTTGtaccaaaacaacaatttttt
ttcacaccacggctacaaacaacaaacaagTACCTAATGAAAGTCATGCT
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ATGACAAGAGATAGTTCACGTTTACGAATGTTCACGACCATTCGGAGATC
ATTTCGATGGTATTTCAATGCTTTGGATTTGAACGGGTTGGTTACCTCTT
GGGCTTGGGCAGGCTGGTCATATGTGCCGAATGTGATGGTATCCATTTCA
AAAGCAAGTGCTAGGCGAACTAACACTTCAAAAAGTGTCAGACTTTCGGT
CATTGATTATGCGATAATAAATTCACCTGTTCTGGCAGAAAAAGGACATG
TTGTGATTTGGGAAGAAGAATTGTATAATCCTTTGTTTTTTCGAATGTTG
ATCGATCAAATGAATATTGCTTTATGtggggaaaattgattttatgtAAA
ACTTTCTGTCACTTATTCGATGTCAAATTCATCTGTTTTGAAAGAGAAAA
GACATTATGAGACTGTTTATCTAACGAGGAGAACATAATTTATGGTTTGG
GAAGAAGATTTGTATAATCCTTTGTTTTTTCGAATGCTGGTCGATCAAAT
GAATGTTGCTTTATGTGGGGAAAATTGATTTCTGTAAAACTTTCTGTTAT
TTATTCGATGTCAAATTCATCTGTTTTGAAAGAGAAAAGACATTATGAGA
CTGTTTATCTAACGAGGAGAACATATTTATGGTTTGAAAGAAGATTTGTT
TGATTCTTTGTTTTTTCGAATGATGGTCGATCAAATGAATATTGCTTTAT
GTGGGGAAAATTGATTTATGTAAAACTTTCTGTTATTTATTCGATGTCAA
ATTCACCTGTTTTGAAAGAGGAAAGACATTATGAGACTGTTTATCTAACG
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TTCGAATGATGGTCGATCAAATGAATATTGCTTTATGTGGGGAAAATTGA
TTTATGTAAAACTTTCTGTCATTGATTCGATGTCaaatttatggaaaatt
tgAGACTTCGAGAAACCAAGCGAGAACACTCTTTCTTACTaggacaattt
tataagaacatgaagcttattttttggtaaaaacctaagaacaaaatTAA
GTAAGAACATCCCAGCCATAGATTTCAGAAATGGCTaaaaaaaGTTGACT
TTCCTTTTGCCTAGAAATTCGAGAAAACCAACTGAACTCGTGTTACCATT
AGGAAAAGCATGTTTTCGAATCTTCACTGAGTTTTTTGTActgtaaacaa
tagaattttaaacCCCCTGGACCTGTCACAATTGAGGCTTTTTCCATCTC
CATTGGCATTTAGCCAATCTTCCATTTGATCCAAACTGTGTCAAGAATTC
TAACGATTCATTGAGATAGAGGTCGGAAATTGAAATCAGCCCAGCGTTGT
CatttagatttaattttgattttaaaagttgatttaattttttgtaaCAG
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tgattttaaaagctgatttcattttttgtaacagCCCAGCGTTGTCATTT
AAattcagttttgattttaaaaattgatttcattttttatagcaGCCCAG
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gtaacaaGCTCAGTGTTGTCATTTAAAACTTGGTACTcacttgtgcaaaa
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GTTGGGTCTTAATTCATGCTTTCctattaaaatcatttttctagTCTGTA
CAATAAATAGCTCCCCGGCTTTTATAGGTTTTACGCTCGAGAGAAACGCT
AGCTTTTttatatacagtatatggcccccaaaacggagacggccctcaaa
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tagacgatttttagtttactttgaaagaatgatggtcattcttaaaaatg
agcatgtttttgatggtttgagacagattcaaaataacatatttgcgtct
gaaggaaatttttcaacaccaaaatgagataaaaattgcatataactcac
tctagctcttTGGATAGTGAagataagttatgaaaatgggatataggaaa
atgcagatacatctgtgacttttgGAGGAAGggtaaaagatgaaaaagaa
aaaccgaaaattctaactatgagaaacagcaaaaaatcttgaaattccat
tcctatcagcttgagttaatagtttataacaaaaaattaacattatatat
aaaaattttcgctgaatcagcaaaaacggcaaattctgtcattttttttc
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caaaatcttcagtttggactttgcaagatcgaaaatcttgaaatatatta
caaaaatgataaattttacatccatcgggtcgtaaaaacacaaatatgtt
catagtttctccccctattaccactgggtttaataatttgattttaacta
cacctacgttttaGGGGCCCAAAACatgcgttttgacaaccaggggttta
ctgtaaaaattttatcagacaaatttatgcccaaaagcctctaaatcaca
tttccaaactatggtcaaaattttgtattcatatcttaaagatattttga
gaaatcgctaaaattgcattagaaaaaagctacctatctttaagcgattg
aaaaatattgttgaaattgaaaatttcgaaaaagaactATTTATTTTTCC
GGGAAATAAAGATGTTAtatagagatgttaaagtttttcatgcagcaaaa
atttttgtaaaacctcttttcctctcgatttgagaaaaactttaaatttg
atcgacgttttgggggccacatactgtaaaaagtttaaaattatttCCCC
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TATAATAACAGCTTAAACTCTATTATTGTTACAGACTTAACATAAACATG
CAATAcacttcaaaatggaaacacAAACACAAAAAGGTGATTTGACCCTA
ACTATAAATGGATGGGTCttataaaatgaatgaaaaagacTGCAAGAATG
ACATGTGTGAAAGTAGGATCAGATTGCATGCTGAGGTTGTGATGGTTTCA
GCTCATCCATGACATTCTGTGGTAGCATTAGTATGTGAAAATTACACACA
ACTAGTCTGCCATCTTTTTGTCATCAATTACGTGAAAATCATACATAACT
GGGTCTGGTACTGGGAACATCAAGAAGCTAATCTTCATTACATACAAGAA
CAGTGAGTTTATTTTCACATTTATTCGCACCCCTTTCTCGCAGACCCGGT
AGGTGGGGATGAGCCAGTAGGGATGAAGATAACGGACTCAAACTCGATAG
GGAttaatattcccatatttttcatggctggggatttcaattcttttgtt
ttgaagtaagaaaattcagtggggatgggaaaaatagtaaatattttttg
ctgtggggacaaaaattgaaggctaattttccactggggacgatattttg
gccaatttttccagtgtgtctgtgagaagggggtgtttatttggTCTCTG
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TACTTAGCTAAACCAATACTTGACCACcgctctcaaaaaaaaaattattg
cacCTTATCAAATGTGGATAAATGGTATGGGGAAAATGAGCTTACACTTC
CCGCCAttttctcgatcgggaagatacgttcgattttcaaggggaataga
cctttttataaattacgtcacgaaagCCCAGCGTCATTTTGATCGAAGTC
TCATAATGTTCTAAAGTCTCATAATGTTCtaaagtttgttctttaaaaaa
aacgtgttttcaaaaacattacaaAAGACTAAGAAGAAAATGCCATCtgg
atactctcgggtacctaatagccgtccccccccccgctaattaatttttc
aaaaaatttccacccaggacatttttattccaaacccccccccgcttatt
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cTATTAGATACCCAAGagtaaatagcctgatttttgttttgaaaagtcgt
tatggattttttatcttttatttcttttatattgacattttagttgctaa
cagacatttatatttccattttGGTTGCTAACAGACTGAAAAGCACCATG
TGAACAAGGTTTTCAAGAATAAATAATACGCGACTCTTGAAATCTCTTTG
ACGGTCATATTGAATCTTTTATGCCTTTAATTGTTTTCGGTTtggttgat
ctttttttttgatattatgattacacactttttttataagaatggtgttt
tttcattttgtgatggatattctttaacttttttgggaaaatcatcttaa
aataattcttacagcattcttactGTTCTTAGGGACTTCTtaagttagga
tcctaattcagacttgatttaacatttagtacatgcGTCTCAAGCATAAA
TGGCATTTCTGTGAAagaagtgagccttacttgggggtaattggccactt
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TCTAAATAAAACAGACTTTCCCCGAATCTTGCTCCAATCAAAACCTGAAA
AGACGATTTAAATGTGGACTTAAATGATGACtattcatgttttgtttttg
cctttCATTTTTCGTTATGGTGATTGTTGTCATTCACTCatctaaataaa
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ATTATTAATATAAGAGAAATACAAATGTTGGTCACATCCTGTTCAACAAA
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TTTGCTCTTAGTCACATTTCATTTTACTGAAAATTGATGAAGTATATACT
TACACATTTGGGAAATGAATGATGTTTTTCTTGtctttgttgatttttca
tTCGATTTTATTAATTGAAGCCTCTGGTCAAAAACAGAACACTAAttgtt
tgaaaacaagaaatgtGACCATAATTCTTGACCTTGGCAGCCGTTGGAAC
CTCATTGGTTACAGTTACGACCCGACCTACTTATACCAGCTTTCCTCACA
GTTACTGCGAATACCATGTACAGATGTTTGGATGTATTCACACCTTAGAA
AAAGATCGATCCAACTCAAAGAGAATGACCTTATGTTAGATTTAGCAAAT
GAAATAGCTACGTTGACAAGTATCGAGATTAGTGATTTTCTTGCATTTAT
ATCAAGACTTCATTCAGGCAATGGGGCTATCAAACAAACTATCGTTTATC
TACACTACGACTTACTTGTGATGGCAGGCACTTATCGTGAGAGTATAAAT
GACGAGGAAAAGAGAGCAAATGCATTAGAAGAACTGCAGAATGAAAAACA
TTATAACATTATATTACATTGTAATGGAAAACGTACTCCTTACAGTACTA
TATCTCAAAGCTATTTTTGCTCACTTTTAAAAGCCTTTGTgccaaaacaa
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GCTAGATTTGGTGAAAAATGTAAACTATAAAGAGATCGAATATTTCGGTC
GTTTTAAACATCAGTGTTTGAATGATAATACcacattaaaaataattttt
acttcGAGAGATGTCTATACTGACACGATAATTAACCTTTTCACTAACGT
TGTGAACTCACTGCAATGGTGTTTCAATGCTGCTTTGGATTTGAACGGGT
TGATCACCACTTGG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000515_pilon:7753..14816+ >XLOC_019747 ID=XLOC_019747|Name=XLOC_019747|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1722bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000515_pilon:7753..14816+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGATGTTTTTCTTGtctttgttgatttttcatTCGATTTTATTAATTGA
AGCCTCTGGTCAAAAACAGAACACTAAttgtttgaaaacaagaaatgtGA
CCATAATTCTTGACTTCACCTTATTCGGATTCATCACAAAATATCGGTAC
GATATTGATCACTACGACCCGACCTACTTATACCAGCTTTCCTCACAGAT
GATGTTTTTCTTGtctttgttgatttttcatTCGATTTTATTAATTGAAG
CCTCTGGTCAAAAACAGAACACTAAttgtttgaaaacaagaaatgtGACC
ATAATTCTTGACTTCACCTTATTCGGATTCATCACAAAATATCGGTACGA
TATTGATCACTACGACCCGACCTACTTATACCAGCTTTCCTCACAGTTAC
TGCGAATACCATGTACAGATGTTTGGATGTATTCACACCTTAGAAAAAGA
TCGATCCAACTCAAAGAGAATGACCTTATGTTAGATTTAGCAAATGAAAT
AGCTACGTTGACAAGTATCGAGATTAGTGATTTTCTTGCATTTATATCAA
GACTTCATTCAGGCAATGGGGCTATCAAACAAACTATCGTTTATCTACAC
TACGACTTACTTGTGATGGCAGGCACTTATCGTGAGAGTATAAATGACGA
GGAAAAGAGAGCAAATGCATTAGAAGAACTGCAGAATGAAAAACATTATA
ACATTATATTACATTGTAATGGAAAACGTACTCCTTACAGTACTATATCT
CAAAGCTATTTTTGCTCACTTTTAAAAGCCTTTGTgccaaaacaacaatt
tttacaCGCAAGGCTACTTTCAAATAAATACCTAATGAAAGTCATGCTAG
ATTTGGTGAAAAATGTAAACTATAAAGAGATCGAATATTTCGGTCGTTTT
AAACATCAGTGTTTGAATGATAATACcacattaaaaataatttttacttc
GAGAGATGTCTATACTGACACGATAATTAACCTTTTCACTAACGTTGTGA
ACTCACTGCAATGGTGTTTCAATGCTGCTTTGGATTTGAACGGGTTGATC
ACCACTTGGTTACTGCGAATACCATGTACAGATGTTTGGATGTATTCACA
CCTTAGAAAAAGATCGATCCAACTCAAAGAGAATGACCTTATGTTAGATT
TAGCAAATGAAATAGCTACGTTGACAAGTATCGAGATTAGTGATTTTCTT
GCATTTATATCAAGACTTCATTCAGGCAATGGGGCTATCAAACAAACTAT
CGTTTATCTACACTACGACTTACTTGTGATGGCAGGCACTTATCGTGAGA
GTATAAATGACGAGGAAAAGAGAGCAAATGCATTAGAAGAACTGCAGAAT
GAAAAACATTATAACATTATATTACATTGTAATGGAAAACGTACTCCTTA
CAGTACTATATCTCAAAGCTATTTTTGCTCACTTTTAAAAGCCTTTGTgc
caaaacaacaatttttacaCGCAAGGCTACTTTCAAATAAATACCTAATG
AAAGTCATGCTAGATTTGGTGAAAAATGTAAACTATAAAGAGATCGAATA
TTTCGGTCGTTTTAAACATCAGTGTTTGAATGATAATACcacattaaaaa
taatttttacttcGAGAGATGTCTATACTGACACGATAATTAACCTTTTC
ACTAACGTTGTGAACTCACTGCAATGGTGTTTCAATGCTGCTTTGGATTT
GAACGGGTTGATCACCACTTGG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000515_pilon | genome | sc0000515_pilon:7753..14816 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 199-861:6402 |
| Aaloc | 1-198:1 |
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