|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000402_pilon:52195..57644+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_019569 ID=XLOC_019569|Name=XLOC_019569|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5450bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000402_pilon:52195..57644+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggctttgattctttgtttgtttttattgtcaTCTATTACAGGTAAATa
gcaatttgaatttttgtttttgaatttattattttatttagaaaatttgt
tttttctctctgcggaattttcattttctataggGGTTAAATCACGACTG
GGTTCGAAAATTAtatgaaattaactttttaCACTATTCAGTTTAGATTA
AATAGAGAAAGtccaatttttgtcaaaaatatttccttcttcCaaaaaaa
TGCACCTTGAGCATTGAAATTATTTGCCAGATATTActtagaaattttca
ttctgGCTGATATTGATTTCCTTAATTCTGTTCAACCAATAGACCTATGA
TTTTATATAATGCAATATTGACTGATAAATTATTTCCAAATTAAAAAGTG
GTTATCACACTATATAAAAATAGGGGCAACGTTTTTAAAGTAACAATATC
TAAAACTAATCAGAATTAATCATGTTCAATTTAACTGttattgttgataa
atttgataGCATAATGTTCTAAACCGAGATACTATTACGTTTTCCGGAGG
CTGCTGTCCGATGTCGGAAATTTTGGGTCAAAATTCCAggaaaaaaatgt
cgaaaaaacCTTTTTAGGGACAAAAATCAGGATTTTTCTTGCTAAATTGT
TgaagttttttaaactttacaaCCCTTTAGGGTTTTGATGATTCAAAAAT
GCATTGTTTTATTGTTCTCGGTAAAGATTTTTCGTACAAGTTAACATCTA
AAAATGGGGAGCATGACAAATTATCAAACTtacacgttctttttataaga
actaactatataagaacataaggcttcgatggctaaaatactaaaaacat
gttaagaacattttaaggctttgctctaaaaaattgacaaaaatactcaa
aaaacggtgaaaataagaacatgttaaagctcaaaaagttaagaacatcc
gaaggcttcgaaaattttggatgttcttataaaaaacgtgtatctgatCA
TCTGTAGGGTATGGAAATCCTTTAAACACATTACAAGCACTAAAAAAGGT
ACCTCCAATTATATAAGGCATCATTGGAGCATGGAAATTATCTCGTAAAT
AACATTTCGATAAACTGTACGACATGAAAAAAGGaagtaaaaatataatt
tccatGCTAAGATTAGCCttttttttCATTCGTCGCGAGGCTATAGATTA
TGAGAGTGATAACACAACCGTTAAGTCATAATGACTAGAGTTATCAGGTC
TGACTTTGTTCTATACTTTGATGAAACTTCTTCTAGCCCCGGTgagaatc
ttttcaaaaatgcgAATGAAAGTTTCTATCGAAATCTCGATAGGAATAGC
AATTTCATTTTACCtgagtaaaaaaattcagtgaggatggTTTTCATGTG
CAATTTTTCCCTTGGCATTGTAGGGtaatttttccaccggggacggaatt
tttgcaaagttttccaGTGAGGCGGAGGTCCCAGCGGGTCTTTGACAAGA
GGGTGTGATCCCCAAATAAAAAGTGTGATAAAACTTTCGGCGTTTTGCCC
TACTGTATTCTGCTGAGTCTTTTTCTACTGCACCCCCGTCTCACAGATCC
GCACAGTGGGGATGaacatttctatcaaaatcccaatggggatagcaaTA
ATATCGTTCTCAGTTCCAAAAATTCAGTGAGATGAAACTCTTTGAAAACA
AAGTCAGTTCTGTTTACCGGAATTTTACTAATATCATAGCTGTTTAGAAT
GCTATCTAATTTGGTCTTTACTTGATGTGTCTCTGATTGGAATGCATCAG
AAGTGATCAatgaacaaaagaaattaattgATCACCCAAGAAGGTAGACA
TTCATAAATCATCAAAAATGTTTACATTTCATTTTAATTAggaaatttag
tttaaaaaacACACGCATTATTTCcgaaaagttaaatatttttggtaatt
GAATTGTATCGAAAGTTCACCACCTATGATAGGgtgttttcaaaattatt
ttatggaattttgaaatagtAAGACGTGCgtgcgcccccccccccccccc
aagtcGACCCTCAAATCATGTATTCACGCGCTAAAAaatccaattcacgt
attcacaaTAGAAAAAAGGCTCATTCACGTGTCATGCCAGCCCCGAGGGG
AGCCCCTAAAACGTTTGTGCGTATCATTGACTGCTTGCGCTGAGCTATCT
TTGGATAACATCAGATTGTTATATTCTTGTCAGTAAACTTTAGAACGAGG
TATTAGGTTTGTCAGGAGGGGTTGAGGATTTGCTCGACCTTTGAAAATTG
AGCATTTATTGGGTCAAAAAGTGATGTAAAAAGAGGGTCTTTACCGAAAT
GTGGATTTTAAGAcgcaaaaatctaaatttctacatcctttagagagact
gaatttaaGGTTAGTATGAtcgtcaaaattgaattttgcaGGCATTTTGC
GCGAAATCTGAAATGAATTTTGGGCCCATTGGGCCTCTTTTACTGTATAC
CGGGTGGAGGGGGGTACTCAGGcgaaaatgggtgctgggtatgtgcggac
ggtaagaaGGGTCGgatttttcacctttcaaagtctcacAAAGGGTCGGA
ACATccacgatttttaggaaattcttttgatttcgagagaaaaaatagta
aataattCTCTCTAAGGAaagggtaggattttttcaaaaatcgaagaaaa
tctttcaaaaaagtctATCTTAGGGTAGGTGACAATaattactttattag
taaagaccccctggatatccactcttaaaaatatgctcaatcCCCTgaat
atcctctcttataaagatgcctACCCCtggatattgtattttttgcttga
aaagacaccttaacccctggatatccgctcccttgtagatttTTTAACCC
cttggatatccacttttgaaaaaagatcGTTAACCTCTGGATATCCGATA
GCCTCgacagagggggggggggcacggactatttctggaaaagcccattt
cgagaccttaagggctacttagactacacaatatattgacgaacaatatt
cgacaatatggtttgcggaccgtaatgtacgaagtaaacaactggtactc
tattataaaaaggaattttctttctgtaaacaatccccctttattgttgg
aatattgcaaatcgagctgacaatatattgcggacaccttttcaatatat
tgtcgacattcagcaatatatcatcaatatattgcctgacaatatattgt
gtagtgtatgtagccctttagtCCTACTAAGTAATCCAACCTTAGTTCTA
CACCCTAACtaaaaatagttatttgaaataagctaaaaatattttcaaaa
attaataaataaaggGTCCTGATAAGGtctggggggttggaaaaatttgg
aaaaatcaaaaaactgaGAAGCGGGGGAGGCGTTGATtaggcacctaaga
gtaagctgAACAAGATGAACGTCCACCTGTTCATTTTTGGTCAGAAAATA
TCTTCTAGAGAGGAGGAGCTAGGGGGTTCTCAAAAATCTCATGTCTTTAG
GGGGTTCTATATTTGGTGGGGGGAGGgtgccaaaaatattttgactcaAG
AGGGGCTTGAAATTTttgaggatatccagggggatttggaaattttgaaa
atatcctccacctcACCCTACACAGGCGATTTCAAGACAATAGaacaagt
acgtcggaaacatgcgaaggagtgcaacgcttcttaaaagacaatgacaa
atatctcttcttctgataagtttgacatggtctaaaaccgcctatgccct
agtagatactttctgaccactcccttagcgccaaataaacgttgaaacaa
tgttttttaGCACTTGGGAGATTGGATGAAAGACAGACCCTCCTTTGTCA
TTTCATGTTCGCACGTAACGGTTCtatttcgctccgaaacgaaaaaGAAG
CCATTATATTGGTTAGAATTGACGTAAAtcttgaatttaaccaatagaat
ggcttcatttcgtttcggagcgaaacggaaccccGTAGTGTGTGAACGGT
CTTATTCTAAGCAAAGCATTTATTATCAGGatattttcttaatattttct
gGTTGCTAAAGGTTTTTAAATGATTAATTACTGGttcattaaatttgatt
acAAAGTCAGGACTTCATCTATTTTTTGCATAATGGACAAATTATGATTT
AGGTCTTCGGTATGCTAATGGGACTATTTAGAGTTTAGGCAATTATTTTA
TCGAAGCTAAGAGTTGAACAAAGTAACCAGGTCAGCGTACTATATCctag
gatagggaaatcacTGCGCTTTCCTGAGTCTGTTAACTCGTGCTCCCGAA
ACACATAGCTACTGGTGTATAGTAGCTTTACTTGAAAGACGTCAGACATC
CTCGCATGGTCGAACCTGACAAGCGACCACATCACAGTGGTAGGCATATC
TCCCTGTAGGTAACCAAGCCTCCTCACTATGGCGAAGTCATATTAATTTG
CCGAGTGACTACCCTACTTCATCTATCAAAACTAATCGATGACCTACAcg
tcttttattttttaagaaacacacttttaagaaacatgaggctcagaatg
cctaaaaactaagaaacatctaagaaacatgctgaggctgagaatgagaa
aataacattttttaattcggttttttataagaaccttccaatcaaggcta
attatgtcaaaaagttagaaacatgtaagaaacatttaaggctcaaaagg
ccgatttctttagaaacattgaggctgcttggtaaaactagtttcttaaa
aaaaaaagacgtgtaatgTAACTTGAATCTCAGGGGAAGTTTTGGGGGTT
CAGCACaaaaaaaTCAGGAGACCTGGTACCACTTATCGGGGCTTTTGGAT
CATTTAAGGGTGGACATTTAGAATGGttaagaaaattcagaaaatttatc
aattaactGGAAAACTCTTATATattataaatctttttcaaaattgattt
ctttttataGATCTTGCCCTGGCAAAAATCCACGTTATCCCTGTTACAAA
CGAAaatgaccaatcaaattgcAGCTCGCTACCGAAACCATAccgagttt
ttgaaaaaatgcttgaTAGTGACGTCATTCAAGATGGCGATACGATTCAC
TTTGAATGTAATGCTATGGATCATTTCTTTGTTCCGGATACATTGAAAAT
CAAACAGAAATCGTTGACAATTAAGATGGTAAATCATCAAGACACTAAAC
AAGCCTTGAACACTATTACAGGACTTGATTGTCTTAATAACAAACCATTA
GTCGAATTTATTGGTAACAAAAGCACCGATCACagagaaataaaatttat
tgGAATAAGATTTGATAACGTaacattgtttcaaaacatttcgcATAATG
TCAAACTGAACTTTGAAAATTGCGTATTCACAGGGTCTCGAAATCTATTC
Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000402_pilon:52195..57644+ >XLOC_019569 ID=XLOC_019569|Name=XLOC_019569|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=966bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000402_pilon:52195..57644+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggctttgattctttgtttgtttttattgtcaTCTATTACAGatggctt
tgattctttgtttgtttttattgtcaTCTATTACAGATCTTGCCCTGGCA
AAAATCCACGTTATCCCTGTTACAAACGAAaatgaccaatcaaattgcAG
CTCGCTACCGAAACCATAccgagtttttgaaaaaatgcttgaTAGTGACG
TCATTCAAGATGGCGATACGATTCACTTTGAATGTAATGCTATGGATCAT
TTCTTTGTTCCGGATACATTGAAAATCAAACAGAAATCGTTGACAATTAA
GATGGTAAATCATCAAGACACTAAACAAGCCTTGAACACTATTACAGGAC
TTGATTGTCTTAATAACAAACCATTAGTCGAATTTATTGGTAACAAAAGC
ACCGATCACagagaaataaaatttattgGAATAAGATTTGATAACGTaac
attgtttcaaaacatttcgcATAATGTCAAACTGAACTTTGAAAATTGCG
TATTCACAGGGTCTCGAAATCTATTCATCTTGCCCTGGCAAAAATCCACG
TTATCCCTGTTACAAACGAAaatgaccaatcaaattgcAGCTCGCTACCG
AAACCATAccgagtttttgaaaaaatgcttgaTAGTGACGTCATTCAAGA
TGGCGATACGATTCACTTTGAATGTAATGCTATGGATCATTTCTTTGTTC
CGGATACATTGAAAATCAAACAGAAATCGTTGACAATTAAGATGGTAAAT
CATCAAGACACTAAACAAGCCTTGAACACTATTACAGGACTTGATTGTCT
TAATAACAAACCATTAGTCGAATTTATTGGTAACAAAAGCACCGATCACa
gagaaataaaatttattgGAATAAGATTTGATAACGTaacattgtttcaa
aacatttcgcATAATGTCAAACTGAACTTTGAAAATTGCGTATTCACAGG
GTCTCGAAATCTATTC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000402_pilon | genome | sc0000402_pilon:52195..57644 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 46-483:5013 |
| Aaloc | 1-42:1 |
|
