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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:386710..391456+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_019007 ID=XLOC_019007|Name=XLOC_019007|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4747bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:386710..391456+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAACATCCCTGGTCTAGTCAGTGTCATTGTTTTTGTCCTGTCGTT
CCTCATATTAGCCGTATGGTCGACACGTCGTAAAAGAATCGCCGACAAAT
ACAGTTCCATCCCTAAAGATGAACGATTTTTATTGGCTAGTCGTGACATC
GGCTGGTTGTTTGGTTTCTGTTCAATGACAGGTTAGTGCACTGTGTTCTC
TTGGATATTAGCGAGTATATGTATTATATGTATTTTTGGGCGACAGAGAC
GGTAAGCTTCTTATGTTTCTActtcctgactgactgaggacgacggtaat
tcaacaattttaccatcctcgattttgcgggtcagaactgcgggtttttc
caaattgcTTCAGTTGTTCCGCCTTCCACGAATttacaaatacataaact
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GCTCCATGCGAAATCTGTAGCTGTCTATCAAAGAGTCGTTATAGATAATT
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TTTCTATTGATCTCTGATTTCTCTTCCATTTGTAGCAACGTTTGTTTGTG
GGCTGTTTGTCAATTCAACCACTCGATCCATATACCATGAAAACTTTGCT
TCCACTAAAACCCCATGGGCTCTCTCTTTCAGTCTTTTGATTGGTAAGTA
TGATATAGCTTGTATATGTCTTTATCTTTTTATATAGCCTTTCTTTGGCC
TATGAGATATTTTGGTGTCTTATATAATTATATTCTGGAAAAATTTAGTA
TTGCAAGTCAAGCAAGCAATAAGATTAAATATTGAAGGGGAGCTAAAAAT
TAAGATAATCTTAacgaaattttagaaatatagGGAAGAACAAAGAATGC
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TTCACAGGTGGACTGCTTTTCGCCAAGAAAATCCGTAAATCAGGCTACGT
TACTATGCTAGACCCTTTACAAGAGAGATATGGCAAATTTGTGGGCGGCA
TTCTCTTTCTACCCGCCCTTCTTGGTGAAGTTCTATGGGTGGCCGCCATG
GTTGGAATGCTTGGCCAAATGTTTCAGGTATGCCGTGTTTTTAAAAGATA
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ATGTGTGCTCCCGCGGCAAGAGAGGGGAAGAAAGCATTGTTTTTTATACA
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CACTAGAATCGATTACACttttttggctagccttaattttaaggttttaa
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CATTCTAGGTGATCTTTGGTAACGAACATATGAGTTTGTTGGTCATTTTG
GTTGTCTGTGTGGTTGTTTTGAACACAGTATTCGGTGGTTTGTACTCTGT
TGTCATACTCAATGCTGTGCAATTACTATGTTTGGTGATTGGAATTGTAA
GTTGATTTGCAATGTATTTTTATCAATCGAAGCTGTTGTTATATTGTAAC
TGTTCGTTTACCTTGGCTACGACACTAGCTACGAGGTAGCTGCAAAGGCC
AATAATAAATcaactttattatttaaaggttttatttttacataagtgtt
cccgtttcataccagacgcatatttcatatcaggatagtgtcttcctatt
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tcggcctcgcgtgagcatcgctctcccagtgtcgttcgagtgtcatggta
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agggctcatatctatctatctattatgctgatataagcaaaaaaactatt
tttcttttcctctttctgaccaacctTGCTTCACATCTGTGTCGATTcga
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actcttatttaaaaacaagctTTTAAACCGTCGGGTTTTGTCAGGCTTTT
GACTGATTTCTAATAATTCATTTCGTTACAGTGGATCGCCATCCCATTCG
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TGGGAGGGGGGCTAAAATTTTGTGACACCGCTAAAGGCCCAGCTTGgatt
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ACACGAGCCCAACATAAATCAACCATCGTAAGGTGACTCAGTCTGAGCCA
AATTAGAACCAATGCGAATTCAACCCCTAATCTTCAATGTAggtaaaata
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GTCGCCAAAAGCACAGGTATCTAGATTTTTATTGTTGCTGTTTTTAAGCT
TTCTCGACAACATTTTATATTGCAACCACCTTTGGTGAATCTGGACGGAA
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ACGTCTAGGAAGCCATGTatgttttttgaggttgaagtttgaaaatttct
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acagtttgaaacgtcataacgacttataattagcaattaagtagaagaat
ctgactctcacagaaaagttttaagtctcttatGGGAATtagatgagtga
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ggcaaaaatctgttacttgtatattcAGTGTATAATATATCCGTGTTGAC
AGAAAGCTTGAAAGCGAAAATATATTAAGTCCAATTGACTTCTTACTACG
AAGGACCCAATTGACATTTGTCAATGAACTTTCTCATTACCcgtcttaaa
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TCCACCACTGGCACTCATCTCAACGACATGGGTAACCTGGAAACGGATGG
TATCCTACCAATCACATTGAAGTATTTGACACCATCTTGGGTGATGTTCA
TCACACTGTGCGGTTTGATTGGTGCGATGATGTCTTCTGCTTCGTCAGCG
TTTTTATCTTCCGCTTCCATGTTCTCAAGGAACATCTACAAAGCGAGTAA
AAAGACGGTAAGTCATTGATTTTTATCCTTACCGTGAACTGAACTTAAGT
TTCTCTAAGCTTTCTCTAAGATTTAACATGTGAGGACGGACAAAAAGAAT
TTTACCGCGCCTGTCTCAATCACATTGCACTATGATGATACACTATGATA
CTCGCGGCAGAAGTAAGATAAGAGATAACGATGAAATTTCGTTCAGTAAT
CATCTTGAGTATGTGCCCTTCTATTTCAGATATCAGCTAATGagacttta
aattttgatatttaggGCTTGGACactagTttttttttgttttctacaat
tgggcctataaatgatttgaagccactgaagttgagcccagtgcgttgcg
cacctTCGACTATTTTTAAATATGTGGTGCTCTTCTATTTCAGACATCTG
CAAATGAGACGTTATGGGTTGTTCGATTCGCTACCATCATCATCGCTTCC
ATGGCAACGGTCCTCGGTCTGACACTtggcactttcactttcgatttatG
GATCTTATCATGTGATTGTATATATGTCGTGCTTTTCCCGCAGCTCTTAT
GTGCTGTTTACGTTAAGTGGGTGAACGTTTACGGTGCTTTCCCGGCAATC
ATGGTTGGTTCCGCATTACGGATATGCGGTGGTATCCGGGAATTCGGTGT
ACCGGCTTGGATTAAATTTCCGTTTTATGATATGGAAAATGAGAGACAAG
TTTTCCCGTTTAGAACATTAGCAATGGGATGTTCATTGCTCGTTTTGGTG
CTTGGCTCGCTCATCGCTAGGAGAATAGAGGAAAGATTCGGTGCCAATCT
ATCACAGGATGAAATAGACATTTTGAAGATCAGTTACAAAGAACCTGAAA
TTGGTGAATTTACTTCCTTTTCCAAGATAACACGCTGGTCGGGTAGTTAT
AATAACATTACAGCTAGTGCACTTGAGTTGCGCAACAAGGGGAGAGAGGA
CAAGTCGCTTTTGAAAGCGACGCTCGGCCGTAACACGTCCGCTTGTTCGA
ATCGACCGACAATCGAAGCGTGCGAAGAGGAAAAATTGGAGTTTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:386710..391456+ >XLOC_019007 ID=XLOC_019007|Name=XLOC_019007|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3522bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:386710..391456+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAAACATCCCTGGTCTAGTCAGTGTCATTGTTTTTGTCCTGTCGTT
CCTCATATTAGCCGTATGGTCGACACGTCGTAAAAGAATCGCCGACAAAT
ACAGTTCCATCCCTAAAGATGAACGATTTTTATTGGCTAGTCGTGACATC
GGCTGGTTGTTTGGTTTCTGTTCAATGACAGATGGAAAACATCCCTGGTC
TAGTCAGTGTCATTGTTTTTGTCCTGTCGTTCCTCATATTAGCCGTATGG
TCGACACGTCGTAAAAGAATCGCCGACAAATACAGTTCCATCCCTAAAGA
TGAACGATTTTTATTGGCTAGTCGTGACATCGGCTGGTTGTTTGGTTTCT
GTTCAATGACAGCAACGTTTGTTTGTGGGCTGTTTGTCAATTCAACCACT
CGATCCATATACCATGAAAACTTTGCTTCCACTAAAACCCCATGGGCTCT
CTCTTTCAGTCTTTTGATTGCAACGTTTGTTTGTGGGCTGTTTGTCAATT
CAACCACTCGATCCATATACCATGAAAACTTTGCTTCCACTAAAACCCCA
TGGGCTCTCTCTTTCAGTCTTTTGATTGGTGGACTGCTTTTCGCCAAGAA
AATCCGTAAATCAGGCTACGTTACTATGCTAGACCCTTTACAAGAGAGAT
ATGGCAAATTTGTGGGCGGCATTCTCTTTCTACCCGCCCTTCTTGGTGAA
GTTCTATGGGTGGCCGCCATGGTTGGAATGCTTGGCCAAATGTTTCAGGT
GGACTGCTTTTCGCCAAGAAAATCCGTAAATCAGGCTACGTTACTATGCT
AGACCCTTTACAAGAGAGATATGGCAAATTTGTGGGCGGCATTCTCTTTC
TACCCGCCCTTCTTGGTGAAGTTCTATGGGTGGCCGCCATGGTTGGAATG
CTTGGCCAAATGTTTCAGGTGATCTTTGGTAACGAACATATGAGTTTGTT
GGTCATTTTGGTTGTCTGTGTGGTTGTTTTGAACACAGTATTCGGTGGTT
TGTACTCTGTTGTCATACTCAATGCTGTGCAATTACTATGTTTGGTGATT
GGAATTGTGATCTTTGGTAACGAACATATGAGTTTGTTGGTCATTTTGGT
TGTCTGTGTGGTTGTTTTGAACACAGTATTCGGTGGTTTGTACTCTGTTG
TCATACTCAATGCTGTGCAATTACTATGTTTGGTGATTGGAATTTGGATC
GCCATCCCATTCGCTTTAACACATGATCACGTGATGTCCATAAGCAATAC
AACCGACCAATGGGTGGGAAGCTTTGTAGCGGAAAACACTGGTGAACGAT
TAGACCATGCTTTGTTCATGTGGATCGCCATCCCATTCGCTTTAACACAT
GATCACGTGATGTCCATAAGCAATACAACCGACCAATGGGTGGGAAGCTT
TGTAGCGGAAAACACTGGTGAACGATTAGACCATGCTTTGTTCATGATTG
TCGGTGGTATACCATGGCAAGTGTACTTCCAACACATCATTTCCATGAAG
GATGTTCAGCAAGCACGAGCGATCAGTTGTATCAGTGCTTTTGGTTGTCT
GGTGATGGCTTGTCCTGCTATCATCCTTGGTGCTGTCGCCAAAAGCACAG
ATTGTCGGTGGTATACCATGGCAAGTGTACTTCCAACACATCATTTCCAT
GAAGGATGTTCAGCAAGCACGAGCGATCAGTTGTATCAGTGCTTTTGGTT
GTCTGGTGATGGCTTGTCCTGCTATCATCCTTGGTGCTGTCGCCAAAAGC
ACAGATTGGGAATCTGTTTTCGGTAACTCCACCACTGGCACTCATCTCAA
CGACATGGGTAACCTGGAAACGGATGGTATCCTACCAATCACATTGAAGT
ATTTGACACCATCTTGGGTGATGTTCATCACACTGTGCGGTTTGATTGGT
GCGATGATGTCTTCTGCTTCGTCAGCGTTTTTATCTTCCGCTTCCATGTT
CTCAAGGAACATCTACAAAGCGAGTAAAAAGACGATTGGGAATCTGTTTT
CGGTAACTCCACCACTGGCACTCATCTCAACGACATGGGTAACCTGGAAA
CGGATGGTATCCTACCAATCACATTGAAGTATTTGACACCATCTTGGGTG
ATGTTCATCACACTGTGCGGTTTGATTGGTGCGATGATGTCTTCTGCTTC
GTCAGCGTTTTTATCTTCCGCTTCCATGTTCTCAAGGAACATCTACAAAG
CGAGTAAAAAGACGACATCTGCAAATGAGACGTTATGGGTTGTTCGATTC
GCTACCATCATCATCGCTTCCATGGCAACGGTCCTCGGTCTGACACTtgg
cactttcactttcgatttatGGATCTTATCATGTGATTGTATATATGTCG
TGCTTTTCCCGCAGCTCTTATGTGCTGTTTACGTTAAGTGGGTGAACGTT
TACGGTGCTTTCCCGGCAATCATGGTTGGTTCCGCATTACGGATATGCGG
TGGTATCCGGGAATTCGGTGTACCGGCTTGGATTAAATTTCCGTTTTATG
ATATGGAAAATGAGAGACAAGTTTTCCCGTTTAGAACATTAGCAATGGGA
TGTTCATTGCTCGTTTTGGTGCTTGGCTCGCTCATCGCTAGGAGAATAGA
GGAAAGATTCGGTGCCAATCTATCACAGGATGAAATAGACATTTTGAAGA
TCAGTTACAAAGAACCTGAAATTGGTGAATTTACTTCCTTTTCCAAGATA
ACACGCTGGTCGGGTAGTTATAATAACATTACAGCTAGTGCACTTGAGTT
GCGCAACAAGGGGAGAGAGGACAAGTCGCTTTTGAAAGCGACGCTCGGCC
GTAACACGTCCGCTTGTTCGAATCGACCGACAATCGAAGCGTGCGAAGAG
GAAAAATTGGAGTTTTGAACATCTGCAAATGAGACGTTATGGGTTGTTCG
ATTCGCTACCATCATCATCGCTTCCATGGCAACGGTCCTCGGTCTGACAC
TtggcactttcactttcgatttatGGATCTTATCATGTGATTGTATATAT
GTCGTGCTTTTCCCGCAGCTCTTATGTGCTGTTTACGTTAAGTGGGTGAA
CGTTTACGGTGCTTTCCCGGCAATCATGGTTGGTTCCGCATTACGGATAT
GCGGTGGTATCCGGGAATTCGGTGTACCGGCTTGGATTAAATTTCCGTTT
TATGATATGGAAAATGAGAGACAAGTTTTCCCGTTTAGAACATTAGCAAT
GGGATGTTCATTGCTCGTTTTGGTGCTTGGCTCGCTCATCGCTAGGAGAA
TAGAGGAAAGATTCGGTGCCAATCTATCACAGGATGAAATAGACATTTTG
AAGATCAGTTACAAAGAACCTGAAATTGGTGAATTTACTTCCTTTTCCAA
GATAACACGCTGGTCGGGTAGTTATAATAACATTACAGCTAGTGCACTTG
AGTTGCGCAACAAGGGGAGAGAGGACAAGTCGCTTTTGAAAGCGACGCTC
GGCCGTAACACGTCCGCTTGTTCGAATCGACCGACAATCGAAGCGTGCGA
AGAGGAAAAATTGGAGTTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:386710..391456 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1108-1761:4094 |
| Aaloc | 880-1107:3480 |
| Aaloc | 724-876:2713 |
| Aaloc | 598-723:2232 |
| Aaloc | 460-597:1459 |
| Aaloc | 292-459:960 |
| Aaloc | 184-288:588 |
| Aaloc | 1-180:1 |
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