XLOC_018054 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_018054
Unique NameXLOC_018054
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:312095..324011-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_018054 ID=XLOC_018054|Name=XLOC_018054|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11917bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:312095..324011- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AAGAATAATATGCCAAAAATTTGATATTTATTACGATTTCGAGGTGTTAT AGATTTCCAAACTTTTTGAGAATTTTTCGCGAATTGCCCTGTTAAGAATT TTTAAATACATTTACTTTCGCGAAAAAGGCCAAAATTCGCGAAAATCGTG AAAGTTTCTGCTTCCGAAAGTTTGTACGCTTAAAGTAAAGTTATTTCATT TTTTATGGAATATGTTAATTTCTTGACTTTCTTTCTCTGATGATTTGCAA TTTTCTTTGTTCCAGCTTTGTAAAAGAACCATATGCATCATTAGAAACAG AAAGACATAATATGCAACGTAGGGTTTTTTTAATTTTCAAAACAACAAAT TGTGCCCTATTAGTCCAATGGCCACCTTAGTTCACCTTGACATCGAGTAC ATATGGGTTTTTATTGCATTTCCTATTACTATGGTATATACTAAGTCTAA AAAGCCAAACTTGCCCTCCCCAAGTCTTGGGGAAATTTTTTTACACGGTT TTTAAGGAATGACATAAAAAATGTTAAAAATCGTGAAAAACAAAACAAAA GATGGTCCAAACTTAGTCAAGTTTATACTCGTTTGAAAGATATTTTCATG TAGATTGCGAAAATAATGATCCTAAAAGTTTCCGTATATATAAATTTTGA AATATTTCGAAAATACTGGAAAAAAGTGTTAAAAATTAAGAAATTCCAAA TGTGACAATGCAATGAGATATCAGAATCTCAAGTAATTATTGGCTGGTAA ATGATACAGCACAAAAAATAATTGTCATTTTCATCATCTTCATCGCTATA ACTACTATCCAAATGCTCTTTGTCATTTTCACCATTGTTTAACATTTTAA AATCAGACTCTTTATGGTTCTCGCATTCTTTACAACCACAAAATTCAGTG CAGTCAACTTCAGCTTCTTTACAGGGGCATTTCTTGTTAATACATGTTGA 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TACCCTTAAATGTACGACCCGATAGATGTAAAATTTATGATTTTTATGAA ATATTTCAAGATTTTCGATATTGCAAAGTCCAAACTGAAAATTTAGAAGT TTTTAAAATGACAATTTAGACTTAACAACGTCTTAATCAAGTTTCTGAAA ATCAACGTCTTTTGAAAATAGTTCCATTCATGTATGGAAAAAGCTGTGAA AATTTGAGAAGAAAAGCTTAGCTGAAACTGAAAATATTAAGCTTTAAAGG TATTTTTCTCCTATATTTTGCAAAAAAATGACAGAATTTGCCATTTTTGC TGATTCAGCGAAAATTTTTATATATAATGTTAATTTTTTGTTATAAGCTA TTAACTCAAGGTGAAAGGAATAGAATTCCAAGATTTTTTGCTTTTTCTCA TATTTAGAATTTTCGGTTTTATCAATGCTGATTCTAGGGTCCCAAAATAC TGGTTGACCTTTAAGATGCTATATCTTTTACCCATCCTCTAAAGTCACAT ATGTATCTGCATTTTATGAACGGCATTAGAAAGTTTCCTATACCCCATTT TCATAACTTATTTTCAATATCCAAGGAGCTAGAGTGAGTTATATGCAATT TTTATCTAATTTTGGTGTTAAAATATCTCCTTCATACGCAAATATGTTAT TTTGAATCTGTCTCAAACCATCAAAAACATGCTCATTTTTTAGTATAACC ATCATTCTTTCTAAATAAACAAAAATCGTTTAATTCTGATAAATCTACAA GTCAGAATCCTCATTTTAATGACAACCTCCGTTTTGGGGGCCGTCCCCGT TTTGGGGGCCATATACTGTATCCATTTTTTCATTCTTTCTCTTTGACTGT TTGTCGATCACAGATTGCATGAGTATCAATGCTTTGAGCTGATAGTGGCT CTAAACAAATCCGGAAGATCTTTTCGAAGGTGATCATCTACTTCTCACCA ATCTCGCGAGCCTTATGGACATTTATAGAAGAGTCAGATTCTCCACTGTA GATGTTGACGAGTGTATTAGAGGCATGGGTGTGAATTTGAAGTGGGTGGA TGAATTTCTCTAGAGCTTTTCTGATTTTCATACGATCGTTGTTATCTAAT TTGATTCTTCCATTTCCTTCTTCCTTGTATTTGTCATTGTCTGGTTGCCT TTTATCCCTTTGTTCACCAAGCTTTGTCACGAGCTCTCCACAGATATGAT GACTATTTATTTGCCCAGATTGCCACTGTCCTACCAATGTTAAACTTATC AACGGATAAATAGGTTGACCAGCCTAGCCTGAATCAGCAACATCTGAAAA TATGGTAACAAGAATTTGAGATACTTACTAAACTGTACCAAATCAGATTC GTGCAGTTTATGATGTTTGAAATAAAAATGCTTTTACCTTTTCCTACTTG CATGTAGGTTGATTCGATTGCCATATCACTCCATATACCATTGAATCTTC CATCTTTGAGTCTTACCACATTCTCTCCCTTCATAAAGTGTTTCAGTAGA TCGCTTGGCATCTTGTGCATTGATCTGAGGTAGACGATTCCATCACGGGC ATAGTTCAGATGGCCAGCAGCGAAGAAGTACGGGATCATCGTTTGACAGC AGTGTAAATGCAATCCAAATTCTCCTTCTCTCTCTGCACGTAGATATTTC ATCATGAGGAACACTGGATCAATGAGATTCGTTATCCAATGTTGTGAAAT TACATAAATATACGTATAGAAGAATAACACCCATCGTGTCTATTTTTTAT TTGCTTTGATTCAAATCTTTATTTGAGCCATTTCAATCACTTCAGGGAAA AAAAGTAAGACGGCACTGTAAGGGTATTCAACTTGGCGAAAAATGCACTG TAAGGGTGTATTTTTCGGGAAAAACCACTGCACTGTAAGGGTACAATTTT GGGCGCCAATTTTTAGCCCGCACATACCGTCAGTCCAAAATCCGACTCCC CCCCGGGTGCCCCGGGTGAACACAGTTACCTTCTGACCTGCTTTGTTGGA AACACTTTCCACATCACACATGGCTGTTAGAATCGTGGATGGATCTGAAG ATGGTGTCTTGTTGATTGATGGTTTGTACTTCACTGCTGTCATTCTTTTT GGATACTCCATTTTCTCTCATCTGCTTTGTATTATATCCTTCAAAGTCGG GAATATTTGGATTTGTTAATGTATCTTTCATGAAATCAAAATCTTTGACA TCACTTCTCGAAGACGTTAAGAGCTGATTATATAACAACATCAGTAGAGC TTCCTTGTTGCTAAGTTATTTGGCTTTTGGTCTTCTTTGAAGATTTGGGT TTTTGGTTCTTAGATCTGTACTAAAATTTCTAAAGGCCTACTCTTAGGTT CCAAATAAACGGGGGGGGGGTTCGAATAAACAGGGGGGTTGGAAAAATTT CTAGATATTTATAAACGAAGGGGACATAATTGCTGGGGGGTTGGAAATTG TACTTCTGAAACACAAAAATAAGGTAAAAATAGACTAAAATCAGGCTATT TAGAGCAAAATACGGGGCCTTCTCTTTGACAGCTGAAAATATTCTTAGAG ATTAATAAACGGGGGGTCCTAATAAGGTCCGGGAGGGTTGGAAAATTTTC GAAAAATTAACAAGCGGGGGGGGGGCGTTTATTTAACCTAAGATTATGAA CTTTTCCTTGTACTAAGATATTTATATATACGGAAACCCCTAGGATTATC ATTTTCACAATCTACATAAAAATATCTTTCAAACGAGTATAAACTTGACT ATGTTTAGACAATTTTTCAATTTTTTTTCACGATTTTTTGACAATTTTCA TGTCATTCCTTAAAAACCGTGTAAAAAATTTTCCCCAAAATTTGGTGAGG GCAAGTTTGGCTTTTTAGACTCAGTATATACCATAGTAATAGGAAATGCA ATAAAAACCCATATGTACTCGATGTCAAGGTGGCCTTTAAAATTGCTACT TGGCCATTGGACTATATTCGATGAGAATTTGTTAGAATTCCAGTTTTTCA CAAACCTCGATCTGTTTTTTTTTTTTGACGATTCTTTAAATTTAGGTATT TGGGTAAACAAACAAATTGTGGCTAACTCGTATATTGAACAGACACTAAA TGACTAATGTTTTGTACATGCCATTTCACGATCGAAAGGAATAATGGGTA ATTAGGACAACCGCGCTTTGATAACGACTTAAGATTTTTGAGGTTTCTAA CCAACGGGAAGCTGTGATGGGGGCGCAATCACTCCTGATTACCCATGATT TATTTCGACCGTGAAATGGTCTATCTGAAAACGTACTTTTAGATGTAATT TTCCTCAACTTTAGCACGTCCATGGTTACGTGATGATATGGAACAATGGA AATGTAGAATGAAAAACGACAAACCTCACCAAAAAGTCGTCATATTTGTC GACAAAAGTGGCGTCGATATCGTACTGGGTGTCTTTCCGTTCGCGAGACA TCTTTTATCACGAGGTTCAAAGGTGAATGAATTTTTCTATGATTTTCGTT TCAATAATGGAAAAAAACTTGCGTAGTAGGAGAACTTTCATCTCTTCAGT TTTGTCAATGTATAGTAATTTACTCTTTTTGTTCAGTTTACGCCGAAAGC AAAAAAATCTCCTGCATGCCAGTTATTTACCCCTCTTTTACAGGTTATAT TGGCAGCAAACACAGGATACGCTCGTAACGATATCTTGCATGATGAACTG GTTGTGCTGGCGGACAAAGTGGCTGAAATGTGCCCCATTATCAAGTAAGG AACTTTACGAATCTTCTTTCTCTATGAGGTATGCGAGAATAACTACTAAC AGGTCTGCAGATGTCTATGTAGATAAAGCATTTTTATCTTGTCTGCACTA TTGACAACCAGAAATTCCTTTATAACGATTGATCTGGGACACTCCCTTTA TATATATCCCTGGACCAAGTTACTCAATGCCGGCCAAAAAATATTTTATG ATCGAGTTTTTTTTTGAAATTGGCACCCGCGGAGAGAGCGCTATATCTAG TTTTGCTTGTACACTAATGATATAGCGCCGTTTGTCGTTAGGCAAAGTTT CAAACACTGTACAGTGGCTTCTTTGCGGCTACCAACTTTCAAAAAAACTT CGATCAAAGATGGTGGATATAGCTTGGTGCAGGGATATATAAGGGTCAGT GATCTGGGAGGGTTCTGAAAACTTTTTGATCAAACCAAACAACATTGTAA ACTCCACCGTACTACAAGGTTACGTATATTGTTGAAGTTTTTTTACCAAG GTATTTAACGGTTGTGATGAATATCTATTTTTTTTTCTCTATGGTAGTAA ATCATTAATGATGGGAGATTTGAAGATCATGGAAACTGGTTCATGCTCAC AAAGTCTACAACTAAGGTAAGAAACACTAATTTACCCTTAGAATACCTTA TTACCTCAGATTTATGTAAAGCCTTAAGGGCCACATGGAGTGCCTTAAAC TTGTCCAAGAAAAAAATGAACATTACAAAAAATATTGTTGCTATTGTTTT CCAAAATCAGCAAAGCTTCTGATTGATCAAGCGCTGAAATTCTATTATAA TGTCACGTGACCTAGGTATGATTGCTTACTTAACCACAGCGCTTCGGGCT TTACATTAATCTGTGCTTATTACACGAAAATCTACTTACTTTGAGTTGAA AAGAATGGCATGTCTTTTTTTGTTATTCTTTCAGGGTGATCGAGAACCGG TTGGTGAAGGCCATGCAGAATGTAGATCTTGTCGTTCTCGTTGGTGTCGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:312095..324011-

>XLOC_018054 ID=XLOC_018054|Name=XLOC_018054|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2934bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:312095..324011- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GAAAAGTTTCGACCACAAGACATCGCCAAGGCTCTACTGCGCATGATCAG
TAATGATATCGGACAGGAAAAGTTTCGACCACAAGACATCGCCAAGGCTC
TACTGCGCATGATCAGTAATGATATCGGACAGATTTCTTCACTTTACGCA
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TCATCCAGTGACCATGCAAACTATGTCATATGCTGTCAAATATTTCTCCA
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ACAGCAAGCCCTATTCTTACGTCACGAGGGATATCTTGGGGCAATCGGTG
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AAGCTATAAAATTCTTCGATTAATGGCAGTGTCCATTGGAATGAGAATTT
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ATAAAATTTACGACTACGATACGTTCGAGTTGGATCGTGTGGAACATTCC
TTCGATAGATGCCCTTTATTAGTGTCCTTGCAACGCACCCATTCTGATCT
CGTCAATCTGGGTGCAAACAAAGAAGCAAGACAATACTGGTTGGAAAAAC
TCGAAAACGAGGCTGATAACTACGACTACGATACGTTCGAGTTGGATCGT
GTGGAACATTCCTTCGATAGATGCCCTTTATTAGTGTCCTTGCAACGCAC
CCATTCTGATCTCGTCAATCTGGGTGCAAACAAAGAAGCAAGACAATACT
GGTTGGAAAAACTCGAAAACGAGGCTGATAACTTTATGTGGCAAGCAGTT
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AGACGCATTCTTGAGACGCTTGAATCATCTGAAAAAATTTCCATACGCTC
TTGGTAAATTGACCATACACTCATTGCTGGAGTTGAGGAATCAATATTTG
AATTTATACGAATTCAACGACTCTTATTTACAGTTTATGTGGCAAGCAGT
TGAGAGCCAAGCTGAAAAGAAAGACTCGCAAATTCGAGGCGAACAGATGA
AAGACGCATTCTTGAGACGCTTGAATCATCTGAAAAAATTTCCATACGCT
CTTGGTAAATTGACCATACACTCATTGCTGGAGTTGAGGAATCAATATTT
GAATTTATACGAATTCAACGACTCTTATTTACAGCTCCGCCAATTGGGAA
CGGAATCGTCTCTTAGTGTTCTTAATAAACATTTAAATCATATTGATTCA
CTTGATCCACCCCACAAAGATGAGGAAATAATAAAAAACTTGTTGGCTGC
TAACTGCTTCCAAATGACTGGCCAAAACTGCTCCAGCTCCGCCAATTGGG
AACGGAATCGTCTCTTAGTGTTCTTAATAAACATTTAAATCATATTGATT
CACTTGATCCACCCCACAAAGATGAGGAAATAATAAAAAACTTGTTGGCT
GCTAACTGCTTCCAAATGACTGGCCAAAACTGCTCCAGCTTTGTAAAAGA
ACCATATGCATCATTAGAAACAGAAAGACATAATATGCAACCTTTGTAAA
AGAACCATATGCATCATTAGAAACAGAAAGACATAATATGCAACCACGTC
CATGGTTACGTGATGATATGGAACAATGGAAATGTAGAATGAAAAACGAC
AAACCTCACCAAAAAGTCGTCATATTTGTCGACAAAAGTGGCGTCGATAT
CGTACTGGGTGTCTTTCCGTTCGCGAGACATCTTTTATCACGAGGTTCAA
AGCACGTCCATGGTTACGTGATGATATGGAACAATGGAAATGTAGAATGA
AAAACGACAAACCTCACCAAAAAGTCGTCATATTTGTCGACAAAAGTGGC
GTCGATATCGTACTGGGTGTCTTTCCGTTCGCGAGACATCTTTTATCACG
AGGTTCAAAGGTTATATTGGCAGCAAACACAGGATACGCTCGTAACGATA
TCTTGCATGATGAACTGGTTGTGCTGGCGGACAAAGTGGCTGAAATGTGC
CCCATTATCAAGTTATATTGGCAGCAAACACAGGATACGCTCGTAACGAT
ATCTTGCATGATGAACTGGTTGTGCTGGCGGACAAAGTGGCTGAAATGTG
CCCCATTATCAATAAATCATTAATGATGGGAGATTTGAAGATCATGGAAA
CTGGTTCATGCTCACAAAGTCTACAACTAAGTAAATCATTAATGATGGGA
GATTTGAAGATCATGGAAACTGGTTCATGCTCACAAAGTCTACAACTAAG
GGTGATCGAGAACCGGTTGGTGAAGGCCATGCAGAATGTAGATCTTGTCG
TTCTCGTTGGTGTCGATAGGGTGATCGAGAACCGGTTGGTGAAGGCCATG
CAGAATGTAGATCTTGTCGTTCTCGTTGGTGTCGATAGGGCAATTTATAC
AAACTTCGAAGAGGAATTTACTTGTGAATCGATACACTGTGCTATCATCA
AAGATCCTTGGCTTGCTAATCATCTGGGTGGCCAGGTCAATGATGTTGTT
TTTAAATATCAGCAACCTTGTGGAAAGAGGAAGTGAGGCAATTTATACAA
ACTTCGAAGAGGAATTTACTTGTGAATCGATACACTGTGCTATCATCAAA
GATCCTTGGCTTGCTAATCATCTGGGTGGCCAGGTCAATGATGTTGTTTT
TAAATATCAGCAACCTTGTGGAAAGAGGAAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_018054XLOC_018054-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:312095..324011 -
Properties
Property NameValue
Aaloc1321-1467:148
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