XLOC_018053 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_018053
Unique NameXLOC_018053
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000078_pilon:326647..339207-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_018053 ID=XLOC_018053|Name=XLOC_018053|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12561bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:326647..339207- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TAAAGTTTTCATCAGTTCCCACTCATCTTTTAGCAGACCTTTTCTGCCAT CTGCTGGCACTGCAGAGAACAAACGTGATAGTCAACATGCAAAAATGTCA GAATCTTGAGTCAATCGTCGTTGCATCGGCAACCTGTACTTGGATATTGG ACGGTGTTGTTAACAGCATTTCACAAAGAACTGAAAGAATATGATAACTC CCCTGAAAATATATAAAATGGAAATCTGTATATGAAATTACCCTACTGTA ATCCATTAAATACAAAAAATGTGAAGTCCATGGACTAAATAATATTTTGA ATGTAAAAGTACCAAAGCTGGCAGCTTCTGAGTCATAATCCATTAACTGG TCAAAATCATGGCCCTTCAGGTAATTCACAATTTATAAATATCACATGTC AAAGTTATTTTTTTAGAGATATTTTTGTTAATGTTGAAACTTGAAATTTC CAACCCAAAAGTCAATGGTTTCCCTAGATAAAGCTAAAAGTACCACAGAG GAAATCAAGTATACTTACTGAATCTCAATTCCATTACCATGGAGGAAGTT TTTCTAAGATTACACTATTTTTTTCATCTAAAATACGAAAAAAACAACAA AACTTTCAATCGATTTTGCCCATCTTAAATCAAAATGCCGAGAAGTTGTA AAGAGTGCCCTGGAAAACTAAGGTATAGGTGGTCACAATCAACCTTCCTA CTACCCATAAAAATTATGTCTGCAACACAAAAAATTCATTCAGTGCAATA CAAGCCAGAAAGAAATTAGTCCCAATTTTTCAAAATTTCAAGCATGCCTC ATATCCGCCATCTTTACTCCCAGAATATAGAATGAATTTCCTCGATTTTC TCAGGGTAAACCCCTAAAAGATCAAAGATTCACTCCCCAGTCTCTTTTTC AAAAACAACTAACTGGAAATCTTTATTCAAGGACTTCTTTCTTGAACATT GGTTAACCTGTACGTAACGCCATTTTGTTTCGGCCTTCCTTCTTGCTCAA CTATTCTACAGCCTTGCTTCTTCAAAGGGTGCCGAATTCAAAGGGAAAGA ATAGGAAAACAGCGAGCGGCAGCGGCGTTTCTTATCCTCTTTTCCCAAAT CTCTGTTTTAACTATTTAAAAATTTAGCTTTTAGGAACAACCATTATCCT TTGTATCATCGCTAAGGTGATATTTTTTAGATATTTTATTTTTTACATGT ACATAGAACCAAAGCCCAAAAGGGCTGACTTGTGTACATAGACATATTTG GGAAACTTATTAGAAAAGAAATCATGTCATCATATATCATATCATATTTC TGTGAGTTTTTGGTGACATGGCATAAAATGGCGCAGGTGCTTCTGCTAGT CCGAGCGACAACGATGTATCGTCTAGTCCAACATCAGAATAGTCCAAATC AAGACAAAATGGAATCAGTGCAGAAGAATGTTTACTCAGACTACCGTAGA GTCATTTAATATCGACATGCGTCTTGTTATTTCGACATAGCTGTAGGCTG GTCTTCGAAATAAAAAATCAAACATAAACAAATACATACCAAAGTTATCA ATCCATCACTAAATTGTACTCTCCCTATCACGTTACAGATTGTTGAAATG TAAGAAACGTGAAGTGGGTTTTTTTCGATAAGAAAACTTTAATGATGTAG TCACTAAAAACTAATTAGCATGCTTTCATTCAACGGAACGAAGATATCCA AATCGCGCCAACCAGACTGAACCATACCAGACAGCCAAACACGGCAGAAT GCTGTCATTCACAAATACTTATAGCACCTAATTTACAGACCTTATTTAGC AAAGCTCCCAACCCTACTACTGATGCTCCCACAAGAATCCCTTTTAGTGG GGTCGTTTAGCATAATTTACGGGAAAACAATAAGATCTAGCTGAAACTTT CTCCAGACCTTCTCTATAGGATGGTTATGCCTCAGGAAAAATTCCCCTAA AATCCCACTGGTGGAACATCCCTTTTTTGGGACATTTCTTTTTTCCCCAG GCAAAACCCTAAGGGCGAAATTTTTTGAAAATTTCAAACTTATTTTCAGA CATTATCAAGTATACCATTCGAAAGCTCTCGAAAAACTATATAGAAGACT TTTAAACGGGTATAGCCGATTTCATTACCTAACTCAAGATAATTCACGCA GAAGATGCTATTTATGGTCAATTTTTACCAAAGTTTGGCGAAAAGTGGAA CTTGCGTGGGTGCTTGAGATATGGCTTTTGAAAAATTACTACCGTCAACT GCTCTAACTCTAACGATTGGTCGAAACATGGGACTGGTTGTTATCTGGCC TGTATTTTCACTTACTATTAAATCTCTTTGACAACAAATTTGTTTTGATA ACTCCACCAAGTTTATCAATCATACTTCTTCGTTCCTCGTAGAGTGCACA GACACTCGCGTGTGTTCCACTACGGATTTTTTTCATATTTTGATTTAAAA GCCTACTTAGTGCGAAAGAGAAATTGTGTATTTTTTAATACGCCGTTCAT TAACTCAAATCAAATGACTTTGGAGGTTCGGTGAAATGGTGGCCGAATTG CTGTCCCATGTTTTGTTAGAGCAGTTGACGGTAACCTGATAAGACCCTTT CTACATGATACGGAAACAAAATTTCAAAATGTATTCAGGGCTTTAACGCT TTGAAATTTCCTAACTAGGATGGGCTCCGCCCATTAGATTTCATATTTTT CATAGATCAATTTTGACTTACTAAAACTAATAGTCATGCTAAGAACCTGC GATTATGAAGTGATTAGGAGAGAAGGTAACTTTTTTAAGCACTTTCCTAA TTTGGAAAGTTTTCTTTTCTAATTAGGAAAGCCTTTCCTAATTAGGAAAG TCAGGAAAATCATAAAAAACTTTCCTAATTAGGCAAAAACTCCTGACTGT CTCAGGGTACGATACGAATGCCCCTAAGAATAAATATATAAACTTTTTCG CCTTTGCATCCGCCATCTTGAATTGTATGCAAAAATAGAGGAACGAAAAA GCCGTGGTTAGATTTAGCTGGAAAATATGCAAAACATATGCGATAAAAAT AGTATTGAATATTATTAACTTATTTATTTAAGTATTTTTGAGCGCAAATT TAAATATATGTCTAAATAAAAAGCATTTGATGGCAGTTCTATTTTTTCCT CGAACCCCTGGGAAAAGGTTTTTTGCCAACTTAGCTATTTTACAAATCTC ACAAAACAACTCCCATAAAAATTCCGATACCTAACCTGATTTTGGAACGG CTTCAAGAAAGTCATAATGGCAGATAATTTAAAAGTTTCTGATGAGGTGT TGATGGCTTGTTGATTCTGTAAAGAGAAAAGAAAACAGGTATAGCTTTTT CTAACCATGGAATATCAAAGTTCCAGCTGCACTGCCATCCGAGCCAGTTG GTCACACTAGTGTCCTGCCGAAATGAGTATCAAAGATTAATGCTGCGGAA GCGCTATATCGTTTACTTGGCTTGCAGGCAAAATAATGCGCCGCAAATCT TTTAAAGGGATCCATAAAAAATTTGACCGACGCTTTTTAATGAAATAAAC ATTTTCAAAAACTAGGGAAAATTACCTAAATTTTGAGCCATAGATGAAAA AATTTGGACAAAGCCAACCTTAAAAAATAATTTTAAGAGCAACTTCCCAA GAAAAAGGAACCTTTAAACTTTTGCGTATGATCAAGGCTTAACAAATTGA AGCGCCTATCTTGGGAATTGAATGACAAATTTGGTTGCTTGATTCTGGCG GCTGCACGTTTTAGCAATCAGTCATTTTGTTTCAAGTTTTCAAATTTTAA TTGATTGTCTTGGAATCTTGAACTTGATTCAGGTAACTCTCATCCTTGTT GTTTCAAATACATCCTGTATATAGATGACTGATGCTGTTTTTTCTGAAAT CTTGATTTGCTAGTGTTTCTAACTGCTAGCTAAAGCTCTAAAAGGAGCAG GTCAATATGCTGTTGGAGGGAAATAGTAGTCGTCCATTAATGTGCCAACT TACCAGTTGGGCTCAACTGCCATGGTAAGCTAAAAAATGGTAATTGGAAC TAACTACTGTAACACCAAAAATCGGCTGAGTTGTCTTTCTGCAAAACATA TGCAGGTCAGGCTTTAAACTTCCGTATTCCAAACCTTTCAGATGTTGAAA ATTTTCCTGACCTTTAAATCTTTAGCCTGTAGGAAGAAAATTACATATCA AAACATCAGTCATATTAATAATTAAAACTCTGCCATCAGCAATTTGTTTA GAAATAAACCTGTGTTTTCATTTTCATTTTTTTTCATTTTTTATGCCAAG TCAGTATTTTCCAAAAAACCTCCAAAAATTCTGCTCAGTGACTGGGTGCG TATTGACCAATAAGATGCACTGGCAAATGCAGGGAAAAATTCCTCTGCAA ACAAATTAGTTGGACCAGACTGTAAACAAGAGACAAGATTATAAAAAACT ATTCAGGCTAACATCCACTGCTTTCTGCTGTTGGTGTAAGTCTTCTAGCA CTGTGTATAATACTATACAATAAACTAAAAGGGTTTATCATTCTGGTTTT CCAACAAATCATCCCAAAACCTTTAAATTGTTTGAAGAAATTTTCTTTGT TTCCTGTTCTTTGGGTGACGATAAGAAGAAAATCATGTTTGTGTGCTATA AAGTCTACCATTTTTAATGTTTATGAATTTGGATCTAAATTCAAAAATTG ATAACAAAAGCTGAAATAATAAATTGTAAACAAAATTTTGAAAAGGTTAA AATGTACAAGAAAAAGTGGCCTGCTGGTGGACTGGAAAGATTTATTTTCG ATAACATCAGCCTTCATTATTACTCAAAATTATTTTGTGATAGCTTATAT ACTGATTTTTTGTATTATATGTAATTTTTCAATGATATTTACCATTGTTT TTTTTTGTATCTTTTCTTGTCATTGTTTTTCGCTTTCGTTCTTTGGGCTC ACTTGTTGACAAATTTATTTTAGGAAGGTGAATATGATCTTTATCTTTAT CAATAGATCTGTATTATTTTTTTATATATATCATAAACATAACCCTGCTC ATTTTCCACTGCTTCACCGAAACGGATGCAGCAAGTACAAGTATGTATTT TCAGGGACCTCAATGCTAAAACTTTGCCTCGTGGGTTATTGACATGTATC ATCAGTTTATTCAGCAGCCTTAAGTTTTTTATTTAAGTTATTTTTTCCTT TTTTAGGATAATATTAGAAATAAAAATGACATTCAATGGGCTGGATAATT TAGAATATGCAAAAGGAATCAACCTTCCTAGCTATGATGATTTCAAAAAT TTGAAAAGTGCCAAAAAGCTTGCTATTGATATTGGTATGCTGTTATTCTA TGATTTTTTTAAAATTTCAACACTAAAGTGTTCTTCAATAATTTTTTCAA GATTTGTAAATCAAAAATTTGTAATCAGAAACAAATTCACCACCACACTT CTTTTGTCCACAAACTTTTGCAAACGTTTCTTATTTTTTACAGGAGGTTC ACTGGTAAAAATAGTGTACCTTTCTGAAGTTGAATACAGACGTAAAAGAT TGAACAGCTTAACATCATTGGATGTGCCACCTCTAACTAAAGAACAAGAA GATACCAACCAAGCTAACCAGGTGCTTGTTTATTGCCTTTCAAGAATGTT TGAATTGTGAGGCCATTTTTGAGATATTAAAATGACATGACAAATCTGTG ATATAAAAGTGTGAGCCTTCGGTGTTGCAGAGCAGTTATTAAAGAAGTTG GACTGACTGATTGGAGGACTTACTGAGCTTAATAACCTAGTTCAGAGTAT GAGGCCACCTCCTCTTGGCGTTTATCTGTACCAGAGCTAACCCTGACATT AAAATTACACATTCACCCTGAGCTAATGAATAATATCCAATCCAATGTGA ATAAATCACTTTTCATTTCTTTTTCAGTCATTATTTTCAGTTGAAGAGAA GGAACTTTCTGAGGAACGTCTTTATTTCAAGAAATTTGAAACAAAATACA TTGATGATGGTTTAAAATTCATCAAGGAGAACCTCTTGTCTTATGGAAGT GACCGATCCAATAAAGTGCTTCATGCAACTGGTTTGTTCCTCTTTTACTT TACACCCTCCCACGAAAGTCCCAGTTTCAAATACCATTTTGACTGCGAGG CACATTTCATAAGATAGTATAGTACAACCACTAACACCCAGATAATCTTT AATGTCGACTTTCAAGTGGGAACCTTCTCCTAATAAGATTTTGGTTATAA CTCAGAAAGTTCAAATCACTTCACAATATCTTTCGTTGAGGTACATAAAA AAACAGCAGCGCGATGAAATACTCCAATTGCTATCGGTAGGAGCTATTTC AGGTCTAACTCCTGGTGGGACTTAGGTTTATATTTCTGTGTATCAATTTT ATTTCCAGGTGGAGGTTCTATCAAGTATAAAGACCTCATCGAATCAACCT TGGATGTTAAGTAGGTCATTCATTATATTAATATGAAATGTAACAAAATC TACTTTGGATTGTTTATTTTTTTAAATTTACAAAATAGAAAACATGATTG AAAAATACCTGCAACCTAAGCATCAGGCTTTTTTACACACTAATCTCTAA TGTTTTTGCTCTTGAATTTCTGTTTTTTAATAATGTTTCTTGCACATTAA GGGTGGAGAAAGAAGACGAGATAGAATCATTGATCAATGGATGTAATTTC CTGTTGAAAACACTTCCCAATGAAAGTTTCACTTTCCATTTGAAAGAAGA TGATGAGAGTTCACCGGAGCTGAAATTCCAAGATTTATCTCATGAAGAGT TCTTCCCCTATCTTTTGGTCAACATCGGATCTGGTGTATCCATCATCAAA GTAAGTGAGTTCTTTTTTCAAGTGTTTGAAACTAGAAAAAATCCGAGTAT TTTTTTGTTGTTTTTCTTTTGTTTTAATTGTCTTTTATTAGAAGATCTCT CAGATTCTTTATAAAATACTCTTCAATTCTATGACATTTTGAAGTCCTCA AAATGTGAACTTTTTTCAAACTCAACTGTTGTTGTTTTTGTTGTTGTCGA AACTTATAAGGATTCAAAGGTTCCTGTTTCAAAGAAGTTTTTCGATTTTA ATTAATGCAGTACCTATATCATTTGTCTTTTTGTCTTTTTGAAGAATCAT CGATAACATAATTGAATGTTCAATCGGTGGATATTTATTTGGAAAGTCAG CTTCCTTGCTGATGAAGATGTTTTCAGCACTGTACATATGGTATCGGTGT GACCTCATTGGACAGATACAGCCCAGCGTCTTCGAAAGGGAGGACATTTT TAAAAAGCAATTTTAACTGTGAACAGGGACATATAAGCTTCAACAACACT CCATAAGATTTTTTACAGCATTACATAAATTTAATTCTGTATTTTCTACC CTTTCAGGTTGAAGGCGTCGACAAATATGAACGTATAGGTGGCACCAGTA CTGGTGGCGGTACTTTTTGGGGTCTTGGCTCCTTACTGACCGACGCCAAG GTAATAAAAATCATGTCCTCTATTGTGTCATAATTTTTCCATAAAATGTC TCATTTTGTAGGATATACCTACATTATATAATGTTTATTTTCAATGTATT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000078_pilon:326647..339207-

>XLOC_018053 ID=XLOC_018053|Name=XLOC_018053|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1728bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000078_pilon:326647..339207- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
GCAGACTGGGAAAGCTCAGTTGTCAGTGGGAAAAGCAAAAAAAATGAATA
TAACAGGCAGACTGGGAAAGCTCAGTTGTCAGTGGGAAAAGCAAAAAAAA
TGAATATAACAGGATAATATTAGAAATAAAAATGACATTCAATGGGCTGG
ATAATTTAGAATATGCAAAAGGAATCAACCTTCCTAGCTATGATGATTTC
AAAAATTTGAAAAGTGCCAAAAAGCTTGCTATTGATATTGGATAATATTA
GAAATAAAAATGACATTCAATGGGCTGGATAATTTAGAATATGCAAAAGG
AATCAACCTTCCTAGCTATGATGATTTCAAAAATTTGAAAAGTGCCAAAA
AGCTTGCTATTGATATTGGAGGTTCACTGGTAAAAATAGTGTACCTTTCT
GAAGTTGAATACAGACGTAAAAGATTGAACAGCTTAACATCATTGGATGT
GCCACCTCTAACTAAAGAACAAGAAGATACCAACCAAGCTAACCAGGAGG
TTCACTGGTAAAAATAGTGTACCTTTCTGAAGTTGAATACAGACGTAAAA
GATTGAACAGCTTAACATCATTGGATGTGCCACCTCTAACTAAAGAACAA
GAAGATACCAACCAAGCTAACCAGTCATTATTTTCAGTTGAAGAGAAGGA
ACTTTCTGAGGAACGTCTTTATTTCAAGAAATTTGAAACAAAATACATTG
ATGATGGTTTAAAATTCATCAAGGAGAACCTCTTGTCTTATGGAAGTGAC
CGATCCAATAAAGTGCTTCATGCAACTGTCATTATTTTCAGTTGAAGAGA
AGGAACTTTCTGAGGAACGTCTTTATTTCAAGAAATTTGAAACAAAATAC
ATTGATGATGGTTTAAAATTCATCAAGGAGAACCTCTTGTCTTATGGAAG
TGACCGATCCAATAAAGTGCTTCATGCAACTGGTGGAGGTTCTATCAAGT
ATAAAGACCTCATCGAATCAACCTTGGATGTTAAGTGGAGGTTCTATCAA
GTATAAAGACCTCATCGAATCAACCTTGGATGTTAAGGTGGAGAAAGAAG
ACGAGATAGAATCATTGATCAATGGATGTAATTTCCTGTTGAAAACACTT
CCCAATGAAAGTTTCACTTTCCATTTGAAAGAAGATGATGAGAGTTCACC
GGAGCTGAAATTCCAAGATTTATCTCATGAAGAGTTCTTCCCCTATCTTT
TGGTCAACATCGGATCTGGTGTATCCATCATCAAAGGTGGAGAAAGAAGA
CGAGATAGAATCATTGATCAATGGATGTAATTTCCTGTTGAAAACACTTC
CCAATGAAAGTTTCACTTTCCATTTGAAAGAAGATGATGAGAGTTCACCG
GAGCTGAAATTCCAAGATTTATCTCATGAAGAGTTCTTCCCCTATCTTTT
GGTCAACATCGGATCTGGTGTATCCATCATCAAAGTTGAAGGCGTCGACA
AATATGAACGTATAGGTGGCACCAGTACTGGTGGCGGTACTTTTTGGGGT
CTTGGCTCCTTACTGACCGACGCCAAGGTTGAAGGCGTCGACAAATATGA
ACGTATAGGTGGCACCAGTACTGGTGGCGGTACTTTTTGGGGTCTTGGCT
CCTTACTGACCGACGCCAAGGGTTTCGATGAACTCTTAGAAATGGCTATT
GATGGTAAAACTAAAAATGTCGACGGTTTCGATGAACTCTTAGAAATGGC
TATTGATGGTAAAACTAAAAATGTCGAC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_018053XLOC_018053-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000078_pilongenomesc0000078_pilon:326647..339207 -
Properties
Property NameValue
Aaloc811-864:55
Aaloc718-810:405
Aaloc520-717:1160
Aaloc469-516:1402
Aaloc313-465:1885
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